206LA

Phage t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNASKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Energetic cost and structural consequences of burying a hydroxyl group within the core of a protein determined from Ala-->Ser and Val-->Thr substitutions in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 206lA00
137LA 1LYGA 2OU9A 1QT3A 259LA 4W58A 1L80A 1L61A 1QTHA 4I7OA 1C6FA 1DYGA 243LA 2L78A 3C7WA 1L26A 1L87A 178LA 3NY8A 2Z6BA 3OE0A 249LA 4ARLA 1C6KA 1C67A 4I7PA 1P46A 1CTWA 2QB0B 2Q9DA 1QUOA 2HULA 1L60A 176LA 1NHBA 1CU3A 4ARQB 3EMLA 1T6HA 235LA 3HUQA 1L0JA 3CDTA 145LA 2B6WA 2RBQA 4W55A 252LA 1KW5A 4LDEA 246LA 3SBBC 180LA 167LA 4EKRA 1QS5A 1CU2A 1C6EA 164LA 1CUPA 2RB2X 1L99A 2RBNA 2B6TA 1L15A 3ODUA 177LA 1CV1A 1OV5A 1DYEA 1P36A 2B74A 1L81A 3DNAA 109LA 1CV4A 1DYBA 3GUJA 1L93A 155LA 187LA 3CDQA 3GUKA 1C6CA 3HU8A 147LA 186LA 1LI3A 4K5YA 1L13A 212LA 1KS3A 156LA 1L77A 1L91A 2RAZX 2LZMA 1OVJA 253LA 1C62A 2B6ZA 1L11A 200LA 3HH3A 1XJTA 209LA 3DMVA 1T8AA 1T8GA 1QUHA 4DAJA 2F47A 1CUQA 1D3JA 3GUPA 160LA 3RUNA 1L47A 238LA 1QT6A 1CX7A 3PDSA 3UONA 4ARQA 4I7LA 4ZPUA 2B70A 1XJUA 1C66A 1L71A 1L33A 3C81A 1PQKA 1L84A 3OE8A 4I7KA 3SB7A 1KNIA 182LA 196LA 2Q9EA 139LA 4ARMB 254LA 1L57A 1L52A 1QTZA 3V2WA 1L01A 142LA 128LA 1SX7A 4E97A 4GBRB 4PJZA 4GRVA 162LA 4IAPA 2ANXA 2CUUA 3SB9A 233LA 191LA 1L55A 3DMZA 4YXCA 1C6MA 1L88A 4I7MA 4DJHA 1LGXA 2LC9A 2RBRA 3HDEA 3HDFA 1G0LA 3GUMA 1L12A 1C6HA 2OE9X 4I7QA 141LA 3CDOA 3QAKA 1L67A 1DYAA 216LA 3LZMA 1QUDA 4W53A 1P5CA 1L85A 1OVKA 1QS9A 1L0KA 114LA 210LA 1L23A 4EKSA 3HT8A 1L79A 245LA 1P37A 2OE7X 3K2RA 126LA 1C65A 140LA 236LA 183LA 1L96A 1C6IA 1L16A 161LA 1LW9A 2RBPA 1ZWNA 1L48A 240LA 2RB1X 2RBSA 3SB5A 7LZMA 3GULA 219LA 1L54A 4LDOA 1L17A 1L34A 3C8QA 211LA 3DN1A 150LA 3FADA 1C64A 3HT6A 2B75A 1C6LA 4I7SA 1ZYTA 104LA 149LA 1C63A 1C6DA 239LA 221LA 3HT7A 247LA 262LA 3HH6A 3NYAA 1G0PA 3F9LA 1EPYA 1L64A 2OU8A 3HUKA 119LA 260LA 4W59A 4ARJA 4PK0A 1L45A 1I6SA 3C8RA 1QTDA 3G3XA 1L73A 1C6JA 4YXAC 1P56A 3D4SA 108LA 1L83A 3DN4A 1B6IA 2B6YA 1L63A 244LA 2NTGA 1G0JA 1L22A 111LA 1L43A 131LA 1CU6A 1L49A 257LA 138LA 171LA 166LA 1DYFA 1CU0A 1P3NA 1L27A 1L04A 4S0WA 1L75A 1L56A 1L41A 1L07A 2HUKA 214LA 1LYFA 1SWZA 1P2RA 1P64A 2RH1A 3F8VA 1SSWA 1L19A 227LA 2F2QA 1L09A 2O4WA 215LA 5I14A 197LA 1L50A 1G0GA 255LA 3SB8A 1C6TA 1L72A 1PQMA 1PQIA 2RBOA 2IGCA 205LA 130LA 1G1VA 170LA 4EPFA 1LLHA 232LA 3C7YA 1L25A 1L21A 3HUAA 1L32A 230LA 237LA 174LA 1LWKA 1L92A 2F32A 3GUNA 3VW7A 1D3MA 1G0QA 2NTHA 3C83A 3SB6A 1L89A 3JR6A 3C80A 127LA 3RZEA 1D3NA 2ANVA 1L08A 251LA 118LA 1L14A 3GUIA 1L39A 1TLAA 261LA 1C69A 250LA 3GUOA 1L35A 2OE4X 1LGUA 146LA 206LA 3SBAA 1CVKA 1QTVA 195LA 4I7NA 3HTGA 3HT9A 110LA 1L02A 1L59A 1LYDA 1D3FA 2B73A 3HTBA 120LA 4DKLA 1L90A 1K28A 1SWYA 1G0KA 1C6NA 1CV3A 1L24A 1XEPA 241LA 2OTZX 1L40A 1L06A 3NY9A 1L20A 223LA 1LWGA 1PQDA 184LA 3HWLA 231LA 1JTNA 1OWZA 175LA 1L95A 224LA 103LA 1L03A 125LA 256LA 1KY1A 188LA 3CDRA 3HTDA 1P2LA 3C7ZA 201LA 1C61A 4ARMA 168LA 1LPYA 1L66A 234LA 2B6XA 4W52A 1CV5A 218LA 6LZMA 4EKQA 185LA 151LA 222LA 1C60A 1CU5A 1T8FA 1CV6A 1T97A 158LA 228LA 1QTCA 1QT8A 2B7XA 1L98A 1L36A 1OYUA 3HH5A 1C6GA 1L18A 1L68A 157LA 1L29A 1L30A 102LA 3HU9A 192LA 1CV0A 148LE 3DN0A 165LA 242LA 1L82A 220LA 213LA 172LA 2QARC 3DN6A 3DN3A 4W57A 4EKPA 4EJ4A 169LA 1LYIA 1L58A 217LA 190LA 1P7SA 163LA 4LDLA 5LZMA 4LZMA 1OV7A 3HH4A 3OE9A 1L51A 4I7RA 1KY0A 1C68A 181LA 1G0MA 3L2XA 1OVHA 3C8SA 2OEAX 1LI2A 2O79A 1C6PA 1L31A 1L74A 226LA 1LYEA 1CX6A 2B72A 143LA 1DYCA 1L42A 4EXMA 199LA 3DN2A 1QUGA 2OU0X 3FA0A 3C82A 4W51A 1G06A 4OO9A 113LA 1L69A 1L37A 4EPIA 152LA 122LA 1L05A 1L10A 1QSBA 1QSQA 3FI5A 1D9WA 4YX7C 189LA 1D2YA 3CDVA 1C6AA 1G1WA 3DN8A 4W56A 3DKEX 2O7AA 1PQJA 229LA 1L00A 129LA 112LA 1L53A 1QT7A 3G3WA 1L62A 1QTBA 1LYHA 1SSYA 2OTYX 4AQNA 1JQUA 1P6YA 1LGWA 159LA 1PQOA 3L64A 4I7TA 115LA 2LCBA 1QT4A 3V2YA 248LA 1ZURA 144LA 2RAYX 1L94A 2RB0X 3OE6A 107LA 1C6QA 1L44A 198LA 173LA 1LYJA 123LA 1DYDA 1L46A 1L97A 1OWYA 1KW7A 1L38A 1G07A 225LA 1L65A 1JTMA 4I7JA 3SN6R 1L86A 2HUMA 4W54A 258LA 3HTFA 1L28A 1SX2A 1WTHA 3G3VA 1C6BA 1L70A 1LI6A 4ARPA 3DMXA 2A4TA 1L76A 3PBLA 1QT5A 1D2WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HSWA 1TAYA 1I20A 1NDMC 1UIHA 5I53A 4XJHA 1GXV2 4GCEA 3N9EA 1GBOA 3C7WA 2LYOA 1MLCE 5LINA 1L26A 1JIYA 5AMYA 1QTEA 4NY5A 2C8PA 4XADA 2B5ZA 1T3PA 1RFPA 3P66A 4XJIA 1JISA 1C6KA 3TXJA 1LZEA 2Q9DA 3HUQA 1L0JA 4KT3A 4TTDA 5LVIA 5HLLA 4LDEA 4BAFA 1C6EA 164LA 4LFXA 1L15A 1GXXA 3ODUA 1B7RA 3CDQA 3GUKA 5KXOA 1C6CA 5B05A 3HU8A 147LA 1HMLA 1L13A 5IHGA 1IP5A 1IWWA 4NSJA 212LA 2EKSC 4NGWA 156LA 4XN6A 4J0LA 3W3EA 1L11A 1GB9A 1I1ZA 200LA 3B72A 2I25L 1XJTA 1T8GA 1KXXA 1QUHA 4Z41A 3GUPA 1GF3A 4HPIA 160LA 5B06A 3PDSA 5FEKA 1IOQA 1LZ5A 1PQKA 4XYYA 3OE8A 3SB7A 1ALCA 1KNIA 182LA 196LA 4I0CA 1L57A 1QTZA 1SX7A 1B5XA 3B0IA 1HELA 4OWHA 4GRVA 162LA 3LHMA 4H9AA 4IAPA 2ANXA 2CUUA 3WPKA 1LYOA 4H94A 3DMZA 1F6RA 1C43A 2I6ZA 3HDEA 8LYZA 1B2KA 1OUEA 1XEKA 4I7QA 1IR9A 1LZNA 4GLVA 1IOSA 1L67A 1JTPL 2F30A 3LZMA 1QUDA 3WVYA 4XJGA 1L85A 1F10A 1LZSA 1NKHA 1L23A 4EKSA 1AT5A 207LA 3TXIA 4NGJA 2XBSA 1L96A 161LA 2RBPA 1I56A 1L48A 219LA 1L34A 3M3UA 1LCNA 3FADA 4ETAA 5ILCA 3HFMY 193LA 1GFGA 3HT7A 5B59A 247LA 4G49A 3RZ4A 3F9LA 1IO5A 5FDJA 4ZEEA 1EPYA 2DQIY 1LSDA 4PK0A 5HNCA 3C8RA 1QTDA 1FLYA 3WU7A 108LA 5HMVA 1GF8A 1L22A 4HPEA 1LJKA 257LA 4ETDA 2HEAA 1JPOA 2HEDA 1B7MA 2MECA 1GBWA 1L56A 5L9JA 214LA 1HEWA 4NFVA 1LYFA 1SWZA 4XENA 2RH1A 4KXIA 3WW6A 1LJ3A 3F8VA 1GWDA 1SSWA 2F2QA 2MEGA 3TXDA 2DQEY 3A94A 1L72A 2YDGA 1PQIA 2RBOA 2IGCA 1WQQA 232LA 5KY1A 1L21A 2Z18A 3HUAA 4NHTA 4MR1A 4LFPA 1L92A 1GAYA 4NGIA 4ET9A 1G0QA 4G9SA 3C83A 1L89A 1UUZC 3RZEA 3J6KA 4N1EI 5FCPA 3WL2A 1L39A 2CGIA 1DPWA 250LA 3KAMA 9LYZA 3SBAA 4Z3MA 4YOPA 4I7NA 3EMSA 1LYDA 120LA 1L90A 1CV3A 1IY3A 1REXA 1L40A 1YANA 2BQFA 3VWOA 3NY9A 1L20A 4NHSA 2YVBA 3HWLA 1OWZA 3SP3A 1VDTA 1UC0A 1QQYA 1IWYA 3IWRA 103LA 1CKGA 1L03A 4YF2A 1JEFA 2H5ZA 1XEJA 194LA 4FDYA 188LA 4C5FA 201LA 1L66A 2B6XA 1DPXA 4W52A 4EKQA 4OWBA 1CKFA 151LA 5I54A 1C60A 2W1LA 1T8FA 1T97A 2C8OA 5B1FA 5APCA 1P2CC 1ZVYB 2B7XA 1L36A 3AJNA 1YL0X 102LA 3WUNA 2ZWBA 4PJ2C 4C3WA 4DD2A 2QARC 3DN3A 4G4HA 2Z37A 2YBJA 2Z2EA 4IASA 4EJ4A 169LA 190LA 4DD7A 1P7SA 1HENA 4LDLA 5LZMA 1B7NA 2MEAA 4LZMA 4H1PA 1IWXA 3QY4A 4I7RA 4ZIXA 1KY0A 5KXYA 181LA 1G0MA 4W96A 2X0AA 4CGEA 2O79A 2XTHA 4HTNA 1QTKA 2VB1A 4OWCA 1L42A 2IFFY 1REZA 3DN2A 1QUGA 2OU0X 3C82A 4QEQA 4W51A 113LA 1L69A 1LMQA 1LZGA 5F14A 1HFZA 4R6CA 3K3TA 1GFJA 4LT3A 1LHKA 4YX7C 1D2YA 3TMWA 1CJ8A 1E8LA 3DKEX 4G4BA 229LA 1LMOA 1LSCA 1L00A 112LA 1QT7A 1QTBA 4N5RA 4GN4A 4HTQA 2XQOA 1LGWA 1HERA 4I7TA 2DQGY 3V2YA 248LA 1W6ZA 2RB0X 3HBDA 3EBAB 3OE6A 1UIBA 1BB4A 4AGAA 1AZFA 1L46A 1L97A 4PRQA 225LA 1QUSA 1B5YA 5LYMA 133LA 5DN4A 3QNGA 4H9EA 1JTMA 1VDPA 258LA 3EXDA 3HTFA 1L28A 2DBTA 1A2YC 1SX2A 1C6BA 4PRUA 1L70A 1LI6A 4ARPA 2A4TA 5LA8A 1QT3A 1IP4A 1LMAA 1L80A 4D9ZA 3MGWA 1QTHA 4ML7A 5IELA 4AXTA 4TSCA 2BQHA 2HTXA 1LPIA 4B4EA 1NF5A 1GB7A 178LA 3OK0A 3NY8A 4NHQA 249LA 3GXKA 1JSEA 2D6BA 5KXTA 1QUOA 1L60A 1YIKA 1G7IC 1CU3A 1GB5A 4ET8A 3CDTA 2B6WA 2RBQA 4W55A 1KW5A 3A93A 3CB7A 246LA 3SBBC 4EKRA 1TBYA 3FE0A 2HU1A 2RB2X 2RBNA 2ZQ4A 2B6TA 5KXNA 5FSTA 3D9AC 2LZ2A 4O34A 4LZTA 177LA 4W57A 1OV5A 4DDBA 155LA 1IP1A 1C10A 1CKCA 1HSXA 1VEDA 1B9OA 1L91A 1OUDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HSW A;  1TAY A;  1I20 A;  1NDM C;  1UIH A;  5I53 A;  4XJH A;  1GXV 2;  4GCE A;  3N9E A;  1GBO A;  3C7W A;  2LYO A;  1MLC E;  5LIN A;  1L26 A;  1JIY A;  5AMY A;  1QTE A;  4NY5 A;  2C8P A;  4XAD A;  2B5Z A;  1T3P A;  1RFP A;  3P66 A;  4XJI A;  1JIS A;  1C6K A;  3TXJ A;  1LZE A;  2Q9D A;  3HUQ A;  1L0J A;  4KT3 A;  4TTD A;  5LVI A;  5HLL A;  4LDE A;  4BAF A;  1C6E A;  164L A;  4LFX A;  1L15 A;  1GXX A;  3ODU A;  1B7R A;  3CDQ A;  3GUK A;  5KXO A;  1C6C A;  5B05 A;  3HU8 A;  147L A;  1HML A;  1L13 A;  5IHG A;  1IP5 A;  1IWW A;  4NSJ A;  212L A;  2EKS C;  4NGW A;  156L A;  4XN6 A;  4J0L A;  3W3E A;  1L11 A;  1GB9 A;  1I1Z A;  200L A;  3B72 A;  2I25 L;  1XJT A;  1T8G A;  1KXX A;  1QUH A;  4Z41 A;  3GUP A;  1GF3 A;  4HPI A;  160L A;  5B06 A;  3PDS A;  5FEK A;  1IOQ A;  1LZ5 A;  1PQK A;  4XYY A;  3OE8 A;  3SB7 A;  1ALC A;  1KNI A;  182L A;  196L A;  4I0C A;  1L57 A;  1QTZ A;  1SX7 A;  1B5X A;  3B0I A;  1HEL A;  4OWH A;  4GRV A;  162L A;  3LHM A;  4H9A A;  4IAP A;  2ANX A;  2CUU A;  3WPK A;  1LYO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1HSW A;  1TAY A;  1I20 A;  1NDM C;  1UIH A;  5I53 A;  4XJH A;  1GXV 2;  4GCE A;  3N9E A;  1GBO A;  3C7W A;  2LYO A;  1MLC E;  5LIN A;  1L26 A;  1JIY A;  5AMY A;  1QTE A;  4NY5 A;  2C8P A;  4XAD A;  2B5Z A;  1T3P A;  1RFP A;  3P66 A;  4XJI A;  1JIS A;  1C6K A;  3TXJ A;  1LZE A;  2Q9D A;  3HUQ A;  1L0J A;  4KT3 A;  4TTD A;  5LVI A;  5HLL A;  4LDE A;  4BAF A;  1C6E A;  164L A;  4LFX A;  1L15 A;  1GXX A;  3ODU A;  1B7R A;  3CDQ A;  3GUK A;  5KXO A;  1C6C A;  5B05 A;  3HU8 A;  147L A;  1HML A;  1L13 A;  5IHG A;  1IP5 A;  1IWW A;  4NSJ A;  212L A;  2EKS C;  4NGW A;  156L A;  4XN6 A;  4J0L A;  3W3E A;  1L11 A;  1GB9 A;  1I1Z A;  200L A;  3B72 A;  2I25 L;  1XJT A;  1T8G A;  1KXX A;  1QUH A;  4Z41 A;  3GUP A;  1GF3 A;  4HPI A;  160L A;  5B06 A;  3PDS A;  5FEK A;  1IOQ A;  1LZ5 A;  1PQK A;  4XYY A;  3OE8 A;  3SB7 A;  1ALC A;  1KNI A;  182L A;  196L A;  4I0C A;  1L57 A;  1QTZ A;  1SX7 A;  1B5X A;  3B0I A;  1HEL A;  4OWH A;  4GRV A;  162L A;  3LHM A;  4H9A A;  4IAP A;  2ANX A;  2CUU A;  3WPK A;  1LYO A; 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