208LA

Mutant human lysozyme c77a
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNAAHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A role of PDI in the reductive cleavage of mixed disulfides.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Complex (hydrolase (o-glycosyl)/cys)
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 208lA00
1C7PA 3TXHA 4PGJB 3B0OA 1LMOA 4DYGA 1JTTL 4NGIA 1YKYX 1LSMA 4N9RA 135LA 1AZFA 1KIQC 4NGZA 5DN5A 2BQGA 5LAFA 4CFOA 1JHLA 1MLCE 1GF9A 4R6CA 1B5WA 4WG7A 1LAAA 3CT1A 4CJ2A 5C6JA 3ZEKA 1NMMA 1GF3A 1G7MC 1I56A 1FLWA 3HBDA 3TXIA 1LZDA 4ETDA 1B7NA 1D6PA 4TX7A 1JJ1A 1MELL 2H9JA 1IWTA 4LFPA 2MECA 4MCKA 3WUNA 4II8A 4AGAA 3AJNA 1LMAA 4GLAA 4H9BA 1LSFA 4N1CC 4RLNA 3AW7A 2Q0MX 1CKHA 3N9AA 3HBHA 2BQNA 3EO5A 1GEVA 1JEFA 2C8PA 1HFZA 1GE2A 1GXXA 4XJIA 4EOFA 5F14A 3LYOA 1LKRA 4FJRA 2HU3A 2NWDX 4NGYA 1UIHA 1LMCA 1YAQA 4H9AA 1HF4A 1YANA 1P2CC 4HTNA 1LZ9A 3WU9A 4ETAA 1WVUA 5KXXA 4H9CA 4AXTA 1UIAA 3CSZA 1EQ5A 4NEBA 4GCBA 1GD6A 1QSAA 3EXDA 4HJZA 4OWAA 1C08C 1YL0X 3FI7A 2X0AA 2DQCY 3J6KA 1JJ0A 3A92A 1XGPC 2HUBA 2HU1A 4L41A 4TSBA 1G7HC 1EQEA 4NGKA 4GCCA 1UCOA 5KXZA 5ILCA 1B2KA 1IY4A 1HSXA 4ML7A 5DM9A 1FKQA 1GB2A 1HEWA 5F81A 4H92A 2DQFC 1QTEA 1G7IC 4IATA 5D5CA 1LYYA 1BVKC 1GF4A 2C8OA 2Z19A 1LSYA 1LZ4A 4YM8A 1HC0A 1CKFA 4H94A 5HMVA 1ZMYL 3ZVQB 1KXXA 2BQMA 2D4JA 4H8ZA 4DWXA 3P68A 5HQ1A 1IWXA 1TEWA 3A34A 4G4BA 4NGOA 1CKDA 4B4JA 3MGWA 1RJCB 1GB5A 3BKVA 4WG1A 3ULRA 4CFPA 1LTMA 5FEKA 2Y8PA 3P66A 4G9SA 3WPKA 4YOPA 3KAMA 3GXRA 1QIOA 1LJ3A 3SP3A 2FBBA 1T3PA 1N4FA 1XEJA 4YEOA 3TMXA 3A94A 1TDYA 207LA 4BS7A 5KXKA 5KJ9A 4J7VA 2YBNA 1OUIA 5KXLA 1WQMA 1WQQA 193LA 1NDGC 3ATNA 3M3UA 4H90A 4H8YA 5F9XA 1GEZA 4M4OA 208LA 4X3BA 4G49A 1DPWA 1UIEA 3A3QA 2BQLA 4XADA 1QTKA 4H8XA 1LJFA 3M18B 3TXKA 4PRQA 5LA8A 5B05A 4YEMA 5B06A 1RFPA 1DI4A 4LGKA 4QGZA 4NG1A 2W1YA 4TTDA 4DD0A 3J4GA 1J1PY 2Z12A 4NGLA 1JSFA 3B0KA 4WM2A 3A8ZA 1ALCA 1D0LA 2B5ZA 3IWRA 4MSTA 3LZTA 3CSQA 4GCEA 4WLYA 3WYHA 3LYMA 4R0FA 5LYZA 1B7OA 1GBOA 4U3XB 3T6UA 4BAPA 5LYTA 4GN5C 4B49A 5LVHA 1JITA 1GF6A 3CQLA 1BWHA 1F6RA 2F30A 1BVXA 5HLLA 2BQAA 2Z37A 1VDTA 1IP4A 1JIYA 1SLYA 2XBRA 1IWVA 1LHLA 194LA 1REYA 2F2NA 2IFFY 3P65A 4OOTA 1REZA 2FBDA 2DQAA 3AGIA 5EBHA 4OWEA 5F16A 5K7OA 2WARA 2BQJA 3IJVA 4OW1A 2MEGA 1XGUC 1AT6A 1GWDA 4C5FA 1FBIX 1LJIA 5KXTA 3B0IA 4NHIA 3WVYA 1LMTA 4DC4A 1IP5A 1RI8B 4BADA 1HMLA 5LVIA 3QNGA 2YBLA 4WM5A 1VAUA 1BB6A 4XJDA 2EKSC 2DQHY 1XEKA 4B4EA 5LVGA 1IVMA 1JWRA 4HTKA 3BKHA 1B7LA 1YAPA 3CT5A 3N9EA 1FLUA 133LA 4UWNA 1BWJA 4EMNA 6LYZA 4NGJA 1OUJA 1LJGA 1GFUA 1YKZX 1PZYA 1LYSA 1DZBX 4WO6A 5B1GA 3D3DA 5E4PA 2EPEA 1B7QA 1VDPA 1HERA 3A95A 3TXDA 2YBMA 5FELA 4KPMA 2I25L 4NFVA 1YIKA 3CT0A 4NWHA 1XGTC 1GXV2 1LZNA 1NWGA 1KXWA 2HEFA 5KY1A 3QE8A 4LYCA 1GB3A 1DI3A 4J0LA 4MR1A 3TXBA 1WTMA 1GB9A 2BQCA 1YKXX 4XN6A 4CGEA 5KXWA 2DQDY 1XGQC 3D9AC 2Z2FA 1IOQA 4WLXA 3W3EA 1B5ZA 4FDYA 1DKKA 1LSNA 1IOTA 1T6VL 2F4GA 1LMQA 1LYZA 4XJBA 1B5VA 1B5XA 1LJKA 2IHLA 4LT0A 1GF0A 4GLVA 2D4KA 5I53A 1I1ZA 4NWEA 1VEDA 2DKVA 3AGHA 1H6MA 1HEPA 4WL7A 1LOZA 4WM3A 1IIZA 3AZ6A 2D6BA 1F0WA 3TMVA 1LSGA 1QUTA 1H87A 4HTQA 3TMUA 2ZIKA 4HP0A 5LIOA 2XBSA 4PJ2C 1YAOA 4N8ZA 1OUCA 1GFAA 1OUHA 1LMPA 4NHQA 1XEIA 4ETCA 1B7PA 1OUFA 2BQIA 3A67Y 5HMJA 2H9KA 1OUGA 2I26L 4GN3A 4LT3A 4NSIA 1IP3A 4XJHA 1V7TA 1QSWA 2YSSC 1HENA 2Z38A 4HV1A 5KXYA 1LZRA 2DQGY 1IOSA 3LN2A 4HJYA 4NHPA 1IR9A 4XYYA 5I5QA 3WPJA 3WVXA 5IELA 4C3WA 1J1XY 3RU5A 3AZ4A 1UIFA 1GF7A 1LZSA 3LYZA 1LJEA 3A6CY 5B59A 3LYTA 1WQRA 1FLYA 1KIRC 1IO5A 4KXIA 1LZ6A 4HJVA 2MEEA 2G4QA 4I8SA 1LZ1A 1LJ4A 4GCFA 1B5UA 1E8LA 4WLDA 2VB1A 4OWCA 1GFTA 3RNXA 5FCPA 1IY3A 3A3RX 1YQVY 3WUAA 4G4HA 1B5YA 4B0DA 4B1AA 2ZNWY 3B72A 1GE1A 1AM7A 1D9UA 1GFVA 1WVVA 2FYCA 4A7DA 8LYZA 3A90A 4J1AA 1NDMC 3HFMY 5A3EA 2LZTA 4LYOA 2LHMA 3CB7A 5II3A 1LZ8A 4N5RA 4LZTA 5D5FA 3WXUA 1QDRA 4WO9A 4WL6A 1B7RA 2EIZC 4QDNA 1XFPL 2LYOA 1IEEA 4WM6A 1EL1A 1VFBC 4Z98A 3WUMA 5LAGA 154LA 2HEDA 4O34A 4RW1A 1GAZA 1CJ9A 1BWIA 1LZTA 5DL9A 1DQJC 1HEQA 4NHTA 3TMWA 4H9HA 4ETEA 1AKIA 1GBXA 1BGIA 132LA 2A7FA 2I6ZA 2YVBA 2ZQ4A 4NG8A 5DN4A 1GDWA 5T3FA 4DDCA 5HNCA 4KL7A 1KXYA 4DDBA 3WW6A 5I54A 153LA 1GBSA 4HSFA 3LZ2A 3W6DA 5I4XA 1RE2A 5AMYA 9LYZA 1BB3A 1UIDA 5F9UA 3W6BA 1JJ3A 2ZIJA 3AZ7A 1VATA 5L3HA 5FHWA 4H1PA 4HPIA 3WMKA 4YENA 2BPUA 1LYOA 2G4PA 1DKJA 5E9RA 5LYMA 2W1MA 2MEHA 5HNLA 2EQLA 4Z46A 5KXOA 2HECA 3RT5X 5LXWA 1LSCA 4H91A 4NGWA 5ILFA 1IR7A 1NF5A 1UA6Y 1LSEA 1OUDA 3AYQA 1NKHA 5KXRA 5IDDA 1LSDA 1CJ8A 5KXNA 4ANRA 1GE4A 2BQKA 1REXA 4GN4A 2ZYPA 1UBZA 1IP1A 1GAYA 1OP9B 1NBZC 1WQPA 1CJ7A 1GFKA 1UC0A 5APCA 1BB7A 1GHLA 1HHLA 1LHIA 1VDSA 1YL1X 1JSEA 2Z18A 2W1LA 3EMSA 4WM4A 4DD9A 3A96A 3QY4A 4GCDA 1NHEA 4E3UA 4RLMA 1Z55A 1LHKA 1TCYA 3FE0A 2YBHA 4RW2A 1JTPL 2PC2A 1GF5A 4NSJA 4TSCA 4WLTA 5APDA 1C10A 4DD1A 4LYZA 1HFYA 1CKGA 4B4IA 2AUBA 1A4VA 1JPOA 3P64A 3TXFA 3CSRA 4QY9A 1BQLY 5FSTA 5I4YA 3N9CA 1TAYA 1YAMA 1LCNA 2HEEA 7LYZA 1DPXA 4IJ4A 2GV0A 4UWUA 1IWUA 5KXPA 3WPLA 4XJGA 4WM1A 3OK0A 4J1BA 2BQOA 4LT1A 3TXGA 3W6CA 1IX0A 1LSPA 1UUZC 3A91A 4DD3A 1LJJA 1JUGA 2BLXA 5DLAA 4W94A 1EQ4A 2BQEA 4IASA 3W6EA 4KT3A 1D6QA 1GB7A 1C46A 2LZ2A 4P2EA 3VWOA 2BQFA 2CWIA 5LA5A 4LFXA 1GFGA 5IHGA 1LJHA 3EBAB 1D0MA 1NBYC 5L9JA 5KKIA 1IC7Y 1OUEA 1UIBA 1GFRA 3ZVQA 2MEBA 4DD2A 1LHMA 4PHIA 1HSWA 1LMNA 1LZCA 4Z41A 1GDXA 3HBEX 5APEA 2Z39A 2BLYA 4LYBA 1C45A 1GFJA 1A2YC 1ZV5L 2DQIY 4Z3MA 1IP7A 4UWVA 5B07A 3K3TA 2D4IA 2LYZA 5LVJA 1LZEA 3WXTA 3GXKA 1XGRC 3G3AB 4LYTA 1F6SA 1KIPC 4OWBA 4DDAA 4ET8A 2YDGA 3A6BY 3WU8A 2XJWA 1GBWA 4H93A 4HV2A 5LVKA 2MEFA 4I0CA 3TXJA 4PPOA 5I4WA 4M6DA 1GFEA 1BB4A 3OJPA 4WMGA 1INUA 1JKBA 1GBZA 1NQIA 1LZAA 2ZILA 1HNLA 4NHSA 1WQNA 3W6FA 1YILA 1JISA 5J7CA 1FDLY 1GF8A 4OOOA 1G7JC 1LPIA 4D9ZA 3F6ZA 2RSCA 3B6LA 2MEIA 6LYTA 5JENB 4HPEA 1CKCA 1HMKA 2CDSA 3A93A 4NSGA 1GE0A 1LZBA 1O23A 1XSFA 4N1EI 3AW6A 1IWYA 2HTXA 5KXSA 1W08A 1LJNA 1G7LC 2YBJA 134LA 1IC5Y 1GB0A 4NY5A 1ZVHL 1F10A 1YROA 1DI5A 1CJ6A 2A7DA 4NSHA 3RZ4A 5LINA 1V7SA 2F4AA 2G4NA 5M1YA 4RDSA 4DD7A 4TUNA 2BQHA 1UIGA 2HEBA 2HEAA 4QEQA 2W1XA 3IJUA 4H9FA 5A3ZA 3W6AA 1HELA 2ZYCA 1LHHA 5APFA 3RW8A 1IWWA 3P4ZA 4G4CA 2H5ZA 3AGGG 1LHJA 4CHXA 4DT3A 1JKCA 1GFHA 2ZQ3A 1GPQC 2ZNXY 2LYMA 3WW5A 2N5ZA 1D0KA 4N0JA 1OQMA 3WULA 1DXJA 1IP6A 1HEMA 1BHZA 2BAAA 3ATOA 3AZ5A 1GE3A 4LT2A 5L3IA 4PRUA 1JTOL 2BQDA 4W96A 1IOCA 2ZWBA 2CJLA 4ZIXA 1UACY 1LZGA 1AT5A 1LSAA 2MEDA 1OUBA 1VDQA 4OWHA 2XTHA 4ZEEA 1RCMA 1WTNA 4WOAA 2YBIA 1TBYA 4LYMA 4NGVA 2DBTA 4NIJA 4BAFA 1IORA 1JKDA 1GBYA 1HEOA 5C6LA 1QDTA 3T36A 4ETBA 1OUAA 1LSZA 3WL2A 2DQJY 4TWSA 5KXMA 5C6IA 5KKJA 1B7SA 1LSBA 1UICA 1W6ZA 1I20A 2MEAA 4XENA 3LHMA 4H9EA 1B9OA 1B7MA 1IC4Y 1LZYA 1SQ2L 2FYDA 1BB5A 1GB6A 1FLQA 3WU7A 1LKSA 3E3DA 4YF2A 1IP2A 4H9IA 1IWZA 2DQEY 5B1FA 1ZVYB 1CNSA 1FKVA 3AB6A 3G3BB 4ET9A 4ZFPA 1GB8A 2Z2EA 1REMA 3TXEA 5FDJA 4XJFA 1WQOA 3WH1A 2D91A 2BQBA 1B0DA 1J1OY 1QUSA 1JKAA 1C43A 1HFXA 1LZ5A 1PS5A 1QQYA 2CGIA 1FN5A 1IR8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TXHA 1LMOA 1L07A 4W51A 1KIQC 1LYGA 1GF9A 1LAAA 2O7AA 3ZEKA 4TX7A 1MELL 191LA 4K5YA 4MCKA 4II8A 1L69A 1LMAA 1LSFA 4N1CC 4RLNA 2BQNA 3EO5A 131LA 233LA 1LZ9A 3HU8A 4H9CA 3SB7A 3HH5A 1GD6A 4ARMB 1SX7A 1CX6A 3J6KA 2RB0X 2HUBA 4L41A 1G7HC 1EQEA 5KXZA 1FKQA 1HEWA 5F81A 3SB9A 1LYYA 1GF4A 190LA 246LA 4H94A 1QT4A 3SB5A 1CKDA 3MGWA 1GB5A 1L70A 3DN4A 3CDTA 3ULRA 4CFPA 2Y8PA 1SSWA 3WPKA 4YOPA 5KXKA 2YBNA 221LA 193LA 4M4OA 208LA 3HDFA 3A3QA 5LA8A 225LA 1L29A 178LA 1C6NA 166LA 1J1PY 1JSFA 3HUKA 1D3NA 1D0LA 2OU8A 3IWRA 1C6QA 3CSQA 4GCEA 187LA 5LYZA 1B7OA 1GBOA 4U3XB 3T6UA 103LA 1L76A 5I14A 1IP4A 1SLYA 228LA 2XBRA 1IWVA 1LHLA 194LA 2F2NA 3P65A 4OOTA 2DQAA 5F16A 4OWEA 252LA 4EPFA 1GWDA 5KXTA 1LJIA 1L40A 1L18A 3DKEX 4DC4A 1IP5A 3DNAA 262LA 1L26A 2YBLA 3RZEA 1BB6A 4S0WA 1SX2A 2DQHY 3CT5A 3N9EA 4EMNA 1PQKA 1GFUA 1PZYA 1DZBX 4WO6A 5B1GA 189LA 5E4PA 1QTVA 1VDPA 4I7PA 1L48A 1HERA 1SWZA 1C6TA 4KPMA 3CT0A 1XGTC 2HEFA 4OO9A 206LA 1KXWA 3C7YA 2DQDY 1QUOA 1L19A 1L46A 108LA 1DYGA 4WLXA 4FDYA 1QT8A 1LSNA 1IOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1C7P A;  3TXH A;  4PGJ B;  3B0O A;  1LMO A;  4DYG A;  1JTT L;  4NGI A;  1YKY X;  1LSM A;  4N9R A;  135L A;  1AZF A;  1KIQ C;  4NGZ A;  5DN5 A;  2BQG A;  5LAF A;  4CFO A;  1JHL A;  1MLC E;  1GF9 A;  4R6C A;  1B5W A;  4WG7 A;  1LAA A;  3CT1 A;  4CJ2 A;  5C6J A;  3ZEK A;  1NMM A;  1GF3 A;  1G7M C;  1I56 A;  1FLW A;  3HBD A;  3TXI A;  1LZD A;  4ETD A;  1B7N A;  1D6P A;  4TX7 A;  1JJ1 A;  1MEL L;  2H9J A;  1IWT A;  4LFP A;  2MEC A;  4MCK A;  3WUN A;  4II8 A;  4AGA A;  3AJN A;  1LMA A;  4GLA A;  4H9B A;  1LSF A;  4N1C C;  4RLN A;  3AW7 A;  2Q0M X;  1CKH A;  3N9A A;  3HBH A;  2BQN A;  3EO5 A;  1GEV A;  1JEF A;  2C8P A;  1HFZ A;  1GE2 A;  1GXX A;  4XJI A;  4EOF A;  5F14 A;  3LYO A;  1LKR A;  4FJR A;  2HU3 A;  2NWD X;  4NGY A;  1UIH A;  1LMC A;  1YAQ A;  4H9A A;  1HF4 A;  1YAN A;  1P2C C;  4HTN A;  1LZ9 A;  3WU9 A;  4ETA A;  1WVU A;  5KXX A;  4H9C A;  4AXT A;  1UIA A;  3CSZ A;  1EQ5 A;  4NEB A;  4GCB A;  1GD6 A;  1QSA A;  3EXD A;  4HJZ A;  4OWA A;  1C08 C;  1YL0 X;  3FI7 A;  2X0A A;  2DQC Y;  3J6K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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