209LA

Protein structure plasticity exemplified by insertion and deletion mutants in t4 lysozyme
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAAAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein structural plasticity exemplified by insertion and deletion mutants in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 54
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 209lA00
1OVHA 196LA 3CDTA 3SB6A 1LYDA 176LA 4IAPA 1P37A 1L65A 2HUMA 1QTHA 227LA 3GUOA 214LA 216LA 1L64A 1PQMA 261LA 1L27A 4ARLA 1LI6A 1ZWNA 1L59A 3OE8A 1L31A 1CU3A 2IGCA 1LGXA 1P56A 1SWYA 1L18A 1L20A 1L62A 4EKPA 1QT6A 1L58A 228LA 1OWZA 3DN6A 1CU2A 1SSYA 1L03A 1CUQA 1L57A 2Z6BA 1L36A 1QT5A 1T6HA 2OU9A 3DN3A 3DMXA 1L87A 1EPYA 4I7LA 1L71A 223LA 3CDQA 4I7PA 1JQUA 4EPIA 2RBPA 1C6IA 3DN4A 149LA 1PQDA 205LA 1QSQA 246LA 2B75A 225LA 3C81A 4EKRA 4ARMA 1L83A 1D3MA 3HU8A 3SB7A 137LA 4LDOA 1OYUA 3C7WA 236LA 1C6HA 1SX7A 1PQKA 1C6GA 1C6QA 200LA 144LA 2NTHA 1CU6A 104LA 178LA 3G3WA 1D2WA 2OU8A 1L42A 145LA 158LA 184LA 1QTBA 3DN1A 1DYGA 113LA 1DYEA 2F2QA 3DN2A 4W57A 166LA 3DMZA 3NY8A 219LA 1LYHA 3FADA 1L25A 1L92A 142LA 211LA 3SBAA 1CU5A 1L93A 198LA 4ARPA 1KW5A 1L07A 3HTFA 1LWKA 1QTZA 2RB2X 1QUOA 1LGWA 146LA 1L50A 183LA 1OVKA 3FI5A 4W53A 160LA 2RAZX 3HUQA 138LA 247LA 4ARMB 1L10A 4YXCA 1L19A 1L89A 3UONA 1L15A 1P46A 1L76A 1OV5A 4W59A 2HUKA 2LC9A 1QSBA 140LA 2B6TA 123LA 1QUDA 119LA 3GUJA 1L40A 3HTBA 4DAJA 1C66A 3GULA 1L82A 1C6FA 1L79A 3OE9A 4I7KA 120LA 130LA 189LA 4I7SA 1L63A 3C80A 1NHBA 108LA 3DKEX 1C61A 188LA 1L91A 118LA 1P6YA 1QT4A 2LCBA 235LA 2LZMA 3C8RA 6LZMA 254LA 241LA 1L43A 1L52A 141LA 3K2RA 3CDVA 197LA 1QT3A 1CV0A 3C8QA 1QT7A 1T8FA 2B6WA 2B6XA 1L98A 258LA 171LA 1OVJA 1T8GA 1C6JA 260LA 1QUHA 3LZMA 238LA 1L30A 4W55A 172LA 1D2YA 1L23A 233LA 1KS3A 1P3NA 2RBQA 4W52A 1CV3A 4W58A 159LA 2QB0B 3HH4A 1LYFA 4W51A 255LA 157LA 151LA 1L08A 1L75A 7LZMA 251LA 256LA 1L51A 1L81A 209LA 3HUAA 1CX7A 3C7YA 163LA 3RUNA 109LA 1LWGA 2B74A 2F32A 226LA 173LA 1QS5A 2RBSA 2F47A 1L48A 2RAYX 210LA 3C8SA 1B6IA 1T8AA 252LA 1JTMA 215LA 3HH6A 143LA 150LA 2RBOA 3HTDA 1L77A 1L94A 1OWYA 1G0KA 3G3VA 181LA 1D3FA 3NYAA 175LA 185LA 3GUIA 1L67A 1P2LA 199LA 3L64A 1D9WA 259LA 1LPYA 1G0JA 1CUPA 2OE7X 4LDLA 3JR6A 1L70A 2RB1X 1L73A 1C64A 2RH1A 3GUNA 1LYEA 3PDSA 4ARQA 103LA 1DYFA 240LA 1QS9A 5LZMA 1G1WA 1L95A 244LA 1L90A 1T97A 2ANVA 2B70A 1G07A 3SBBC 1KW7A 3HT6A 1L12A 1QT8A 2OEAX 1L69A 1SWZA 4W54A 2B6ZA 3F8VA 1D3NA 177LA 126LA 1LYJA 1C62A 3GUKA 234LA 4EKQA 5I14A 4PK0A 3HTGA 3SB5A 131LA 1L16A 3VW7A 152LA 4I7NA 2B72A 128LA 243LA 1CV6A 192LA 1P7SA 1L33A 1C67A 3D4SA 3HH3A 1SSWA 186LA 242LA 1L22A 4ARQB 1ZYTA 2O79A 1LYIA 4GBRB 4ARJA 2OE4X 3C7ZA 1L06A 3G3XA 1L53A 2HULA 111LA 4I7MA 1ZURA 169LA 1LLHA 1KY0A 1L86A 4S0WA 1L04A 1L46A 213LA 1L34A 1PQJA 1L0JA 1C6MA 3CDOA 1C6TA 2RBNA 1SX2A 1CU0A 1QTCA 1C6LA 3C83A 1C65A 1L17A 191LA 3HT9A 1G0PA 1DYAA 1L80A 110LA 1L45A 1L56A 230LA 1L61A 3OE0A 250LA 1K28A 1L28A 129LA 1DYBA 2RBRA 2NTGA 1C69A 187LA 4K5YA 1L88A 1LW9A 168LA 2L78A 1L29A 1OV7A 1WTHA 2A4TA 1L21A 229LA 231LA 1C60A 1L35A 182LA 224LA 3HU9A 4I7QA 239LA 1G0MA 1C6BA 206LA 2B73A 4YX7C 4EPFA 1L11A 2O7AA 3C82A 1CV4A 3ODUA 1P2RA 4I7JA 3SN6R 1XJTA 3V2WA 1C6KA 1CTWA 4E97A 1L0KA 180LA 167LA 3L2XA 3SB9A 1C6EA 1LGUA 1L47A 170LA 3HT7A 4ZPUA 257LA 127LA 4LDEA 3HDFA 2B6YA 190LA 249LA 222LA 1L01A 165LA 1L99A 1LYGA 4EJ4A 112LA 1L85A 1PQOA 4I7TA 3FA0A 2CUUA 1L13A 2B7XA 1XEPA 1LI3A 3QAKA 212LA 1CV5A 3EMLA 3GUPA 4DJHA 1QUGA 1QTDA 122LA 1L60A 4LZMA 2OTYX 1L32A 3V2YA 3HH5A 162LA 102LA 3SB8A 1D3JA 4W56A 221LA 248LA 1G0QA 3HDEA 220LA 1G0LA 1L54A 164LA 2RB0X 217LA 1G06A 161LA 3GUMA 1L84A 253LA 1TLAA 3HUKA 156LA 3DN8A 1C6PA 1L44A 1C68A 1I6SA 1L74A 3DMVA 1KY1A 232LA 115LA 1XJUA 1L00A 3F9LA 3NY9A 4YXAC 2OE9X 1L68A 1CV1A 1L72A 3DN0A 4I7OA 1G0GA 1G1VA 1KNIA 139LA 2QARC 4EXMA 4EKSA 1L37A 1LI2A 1L97A 1L66A 1L96A 114LA 3DNAA 1P36A 3CDRA 3HWLA 107LA 147LA 2O4WA 1C6CA 1L09A 4GRVA 262LA 2OU0X 125LA 1L14A 174LA 1L24A 3PBLA 1L38A 195LA 1DYCA 1DYDA 1CX6A 1L26A 2ANXA 1L55A 1L41A 1P64A 237LA 3OE6A 3HT8A 1C6AA 3RZEA 148LE 1JTNA 1P5CA 1L49A 155LA 1QTVA 201LA 218LA 4DKLA 1PQIA 1C6DA 2Q9EA 4I7RA 1L05A 2Q9DA 1C6NA 1C63A 4PJZA 4AQNA 4OO9A 245LA 1L39A 2OTZX 1L02A 1CVKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NGWA 5I5QA 4H94A 4G9SA 1LYDA 3CT0A 176LA 1P37A 1W6ZA 1OP9B 1QTHA 1GFRA 1JEFA 1LZCA 1L64A 1OUBA 261LA 2PC2A 1OUAA 3A8ZA 4H9BA 1OUDA 4H9FA 1BVKC 1B2KA 6LYTA 4WM3A 4FDYA 4DD9A 4HTNA 4NG8A 1BB5A 1CU2A 1N4FA 4YOPA 1CUQA 1L36A 4NGJA 1LHMA 3DN3A 4PRUA 1L71A 223LA 1LKSA 4NGOA 1J1OY 3IWRA 1C6IA 4GN3A 1CKHA 205LA 3FI7A 4LFXA 3SB7A 137LA 5II3A 1C6GA 3LZTA 1JKDA 1C6QA 200LA 144LA 1LSEA 104LA 1GF6A 1L42A 2BQJA 1QTBA 4IATA 4NGZA 2F2NA 1DYEA 4H9IA 219LA 193LA 1LZBA 3P66A 1CU5A 2MEHA 1LWKA 1QUOA 1LGWA 3ULRA 4XADA 2BQBA 2RAZX 5KXXA 1C45A 3A92A 2EIZC 1L89A 3UONA 1L15A 2ZIJA 1OV5A 1LMQA 8LYZA 1LMPA 5LVHA 1GFJA 2BQLA 3WU7A 2B6TA 5E9RA 1C66A 1FLQA 1C6FA 4TSBA 130LA 4I7SA 1JHLA 3C80A 1GBSA 1NHBA 1GXXA 4ML7A 2MEIA 188LA 1L91A 118LA 2LCBA 1RCMA 2LZMA 4B1AA 3WVXA 1LZAA 1JSEA 1QT3A 3C8QA 1YL0X 3CSZA 4WOAA 1OVJA 1T8GA 1GFGA 3AGGG 1GFUA 1L30A 4LYZA 172LA 1IY3A 1L23A 1P3NA 4XJHA 1AT6A 4W52A 1CV3A 4W58A 255LA 1B5WA 151LA 7LZMA 3CQLA 1WQNA 163LA 3RUNA 3IJVA 5LVIA 1GXV2 5I54A 5B59A 173LA 1LJNA 1DZBX 2BQHA 3HH6A 1OWYA 2N5ZA 1B0DA 3G3VA 153LA 3NYAA 4N1CC 1B7OA 4QDNA 4BS7A 1P2LA 1B5UA 1D9WA 1KXXA 1H6MA 259LA 135LA 1LPYA 3W6CA 2RB1X 1L73A 1C64A 3A6BY 2DQFC 1FBIX 1ZMYL 4IASA 4ARQA 2DQAA 4EOFA 1QS9A 3CT1A 5LA5A 1T97A 2B70A 1G07A 1FLUA 1QT8A 2OEAX 1L69A 1GE2A 2B6ZA 3RU5A 126LA 4RW1A 2ZIKA 1UC0A 3HTGA 5HNCA 1L16A 5KXZA 1IIZA 3A67Y 128LA 4NHTA 1CV6A 1IOSA 4YENA 4DDAA 1P7SA 1LJHA 3D4SA 3HH3A 186LA 1LSDA 2DQGY 1LYIA 1E8LA 2OE4X 2HTXA 1NDGC 3RW8A 2NWDX 2HULA 111LA 4I7MA 1B9OA 5E4PA 3WXUA 1YAQA 5C6IA 1L04A 213LA 2D4IA 1PQJA 4II8A 3TXBA 4HV1A 1NDMC 2FBBA 191LA 1WQOA 1MLCE 1DYAA 1L61A 4OWBA 1DYBA 5APCA 4OWHA 187LA 207LA 1IWUA 1IP7A 1L88A 2L78A 2XTHA 2A4TA 5I4YA 1V7SA 1GF8A 4CHXA 1G0MA 1QDRA 1C6BA 1I1ZA 2A7DA 3ODUA 2HEDA 1AZFA 3SN6R 1XJTA 1L0KA 2EQLA 167LA 4I8SA 4AGAA 5LAFA 1HFZA 4DC4A 4ZPUA 1QDTA 2BQCA 1LSFA 5I4XA 4TTDA 5I53A 1JISA 2HUBA 222LA 1L01A 165LA 1L99A 2G4NA 4LT1A 4EJ4A 1PQOA 1F6RA 1XEPA 2DQIY 4PPOA 3QAKA 3WUAA 4B49A 3EMLA 4WG7A 4EMNA 4WL6A 4WLTA 1WQPA 3V2YA 3TXHA 1PZYA 220LA 3WYHA 1G0LA 217LA 1G06A 1UIGA 3HUKA 1B7QA 1J1PY 2G4PA 1CJ7A 1L74A 3CB7A 1KY1A 4H9CA 5KKJA 2CWIA 1JKAA 3WH1A 1KNIA 139LA 2QARC 3G3BB 1LI2A 2ZNWY 3M18B 2BQNA 1GFTA 4H90A 1L96A 2BLXA 114LA 3DNAA 1P36A 3CDRA 1IEEA 3HWLA 3W6EA 1LZ1A 3WXTA 1JJ0A 1WQRA 1REMA 1LJGA 1GF3A 1TDYA 3TXIA 125LA 1GEVA 4HV2A 1L14A 3VWOA 4Z46A 3PBLA 2BQFA 1L38A 195LA 4NY5A 2HEFA 1L41A 1P64A 3OE6A 1JTOL 1LZ5A 1XEJA 4OW1A 4PRQA 3LYOA 5B1FA 1HERA 1BWIA 201LA 4CGEA 4OWAA 1PQIA 1C6DA 2Q9EA 5HLLA 4PJZA 1VDSA 1LMAA 2LHMA 1DKKA 4H91A 3A3RX 2EPEA 1L02A 1DQJC 2W1YA 1QUTA 3CDTA 4NWHA 1G7LC 2XQOA 5B07A 3AGHA 4DD3A 1L65A 2WARA 3GUOA 4LGKA 4AXTA 1PQMA 1LJKA 1YILA 1LI6A 1ZWNA 4CJ2A 1LMCA 1B5XA 2YBNA 3OE8A 1YKXX 1CU3A 5B1GA 1SWYA 5LVGA 5AMYA 4IJ4A 2IHLA 1L20A 1IP3A 1LZ4A 1OWZA 5D5CA 2HEEA 3AJNA 1L87A 1EPYA 3RZ4A 1JQUA 3DN4A 3HBDA 5IHGA 1GB7A 1LZSA 246LA 225LA 4G49A 1VAUA 2ZQ3A 4ZEEA 4H9AA 4ET9A 1D3MA 1OYUA 236LA 4B4EA 3WMKA 1VDTA 3N9CA 5FHWA 178LA 2B5ZA 5EBHA 4NGIA 4LYCA 3DN1A 4GCFA 1DYGA 4N5RA 113LA 4TUNA 3W6AA 2F2QA 3DMZA 5FEKA 1LYHA 2DQJY 211LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4NGW A;  5I5Q A;  4H94 A;  4G9S A;  1LYD A;  3CT0 A;  176L A;  1P37 A;  1W6Z A;  1OP9 B;  1QTH A;  1GFR A;  1JEF A;  1LZC A;  1L64 A;  1OUB A;  261L A;  2PC2 A;  1OUA A;  3A8Z A;  4H9B A;  1OUD A;  4H9F A;  1BVK C;  1B2K A;  6LYT A;  4WM3 A;  4FDY A;  4DD9 A;  4HTN A;  4NG8 A;  1BB5 A;  1CU2 A;  1N4F A;  4YOP A;  1CUQ A;  1L36 A;  4NGJ A;  1LHM A;  3DN3 A;  4PRU A;  1L71 A;  223L A;  1LKS A;  4NGO A;  1J1O Y;  3IWR A;  1C6I A;  4GN3 A;  1CKH A;  205L A;  3FI7 A;  4LFX A;  3SB7 A;  137L A;  5II3 A;  1C6G A;  3LZT A;  1JKD A;  1C6Q A;  200L A;  144L A;  1LSE A;  104L A;  1GF6 A;  1L42 A;  2BQJ A;  1QTB A;  4IAT A;  4NGZ A;  2F2N A;  1DYE A;  4H9I A;  219L A;  193L A;  1LZB A;  3P66 A;  1CU5 A;  2MEH A;  1LWK A;  1QUO A;  1LGW A;  3ULR A;  4XAD A;  2BQB A;  2RAZ X;  5KXX A;  1C45 A;  3A92 A;  2EIZ C;  1L89 A;  3UON A;  1L15 A;  2ZIJ A;  1OV5 A;  1LMQ A;  8LYZ A;  1LMP A;  5LVH A;  1GFJ A;  2BQL A;  3WU7 A;  2B6T A;  5E9R A;  1C66 A;  1FLQ A;  1C6F A;  4TSB A;  130L A;  4I7S A;  1JHL A;  3C80 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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