230LA

T4 lysozyme mutant m6l
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFELLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 230lA00
1C67A 252LA 1T8AA 260LA 4I7OA 2RAZX 1C6CA 1QT8A 3C7WA 3HH4A 1L34A 1L67A 3NY8A 1G1VA 151LA 1OYUA 206LA 3HTBA 210LA 197LA 1SSWA 3HTDA 1PQMA 1L53A 1L0JA 1G0PA 3HUQA 3CDTA 3HDFA 2RBNA 1L94A 235LA 159LA 1P2LA 2B6TA 1KNIA 1C69A 148LE 1L20A 1CU0A 1T8GA 1L62A 2LC9A 2ANXA 2RBPA 3F9LA 3HH6A 1C6NA 1L45A 4YX7C 3CDRA 129LA 1C6AA 1L96A 3EMLA 1L69A 224LA 3FA0A 3CDOA 3C7ZA 120LA 1ZWNA 1G07A 161LA 2OU0X 2Z6BA 103LA 1L98A 4ARLA 1L24A 1C6EA 3C81A 4I7KA 1L47A 1L25A 1P36A 4I7NA 2A4TA 2OTYX 1C6FA 3DMXA 220LA 1P5CA 1C6JA 254LA 1JQUA 2RB0X 2RB1X 4DAJA 1QTDA 3C8SA 200LA 2RBQA 4EPIA 3GUKA 3SB8A 1XEPA 3HT7A 113LA 1L59A 150LA 1L48A 1L38A 1L82A 250LA 1QT3A 3DN4A 2B7XA 1L12A 4I7RA 1C6QA 1L73A 1L21A 1L26A 187LA 107LA 4AQNA 4EKPA 255LA 1L28A 3JR6A 192LA 209LA 7LZMA 1L40A 4PJZA 1L10A 3G3VA 3HUKA 3HU9A 1L0KA 1P2RA 1PQJA 3UONA 1QUHA 1T97A 1QSQA 168LA 1QSBA 3OE0A 1G0QA 1LYEA 1CV3A 2OEAX 4W52A 1LGXA 1L87A 2RAYX 4I7LA 1L79A 1CU6A 126LA 1P46A 211LA 2RB2X 2OU9A 2B72A 240LA 218LA 1XJUA 1L30A 1L55A 1L32A 1CV5A 1L42A 1C6BA 186LA 212LA 1SX2A 162LA 4GBRB 1LYHA 1C63A 170LA 149LA 222LA 4I7JA 1B6IA 3DMVA 4ARQB 1LGWA 1L37A 259LA 3C82A 164LA 1L44A 184LA 2RH1A 4I7SA 166LA 1KY1A 3HT8A 1OVKA 1L09A 1L11A 256LA 4ARQA 125LA 3SN6R 1L50A 1L04A 3OE8A 1L57A 2L78A 4W53A 1G0GA 261LA 2LCBA 1QT5A 1D2WA 173LA 231LA 1QT4A 4ARPA 4LDEA 3QAKA 1KS3A 1LPYA 3GULA 1T6HA 1C6HA 2B74A 234LA 1P56A 1QUDA 2NTGA 2Q9DA 4W54A 3GUJA 1C6KA 1DYEA 3GUPA 1L70A 1C6MA 140LA 3DN6A 4W59A 1SWZA 2HULA 171LA 1KY0A 2HUMA 1LYIA 1D3NA 1QUOA 5LZMA 177LA 236LA 1CUPA 1L75A 4YXCA 205LA 1L58A 2F2QA 3C7YA 143LA 139LA 3HH5A 1LI3A 215LA 3DN1A 4EKRA 160LA 1D3JA 1LLHA 1D9WA 2HUKA 138LA 3HT6A 247LA 3RUNA 1CU3A 1L08A 3DNAA 3HU8A 243LA 1L61A 1L22A 1LYGA 4W58A 3HUAA 2B70A 1QS9A 3G3WA 257LA 1C68A 128LA 2LZMA 3C8RA 1EPYA 1PQIA 1L49A 1L66A 3D4SA 1G0KA 5I14A 108LA 2ANVA 1L71A 3L2XA 1L43A 1L60A 2OE7X 1CX7A 3CDQA 146LA 1P37A 1D2YA 229LA 2F32A 1KW5A 1L36A 109LA 262LA 1C6TA 196LA 118LA 1CV1A 1L93A 1L68A 1L77A 1TLAA 2B6ZA 3CDVA 4DJHA 181LA 1T8FA 4ZPUA 4PK0A 232LA 163LA 3PBLA 1C60A 3OE9A 2B6XA 1L03A 4LDLA 3HTFA 1LI6A 142LA 115LA 1L01A 1PQDA 1QS5A 3DN3A 189LA 3NY9A 3DN0A 3OE6A 1OV7A 1CTWA 1CV6A 144LA 1L15A 1L92A 223LA 1L51A 2RBSA 1C61A 4GRVA 1G0JA 2RBRA 174LA 1L33A 119LA 1L91A 1ZURA 201LA 3HDEA 1LWKA 244LA 176LA 4EKQA 2O7AA 3GUMA 4I7MA 1L65A 1OWYA 1L88A 245LA 1L80A 147LA 1QUGA 188LA 1LGUA 1L56A 3VW7A 1L63A 3L64A 1C64A 4IAPA 1C6PA 1D3FA 1XJTA 1ZYTA 172LA 4E97A 4LZMA 141LA 3GUOA 3PDSA 3F8VA 3FADA 3DN2A 1PQOA 1L39A 2B6WA 1D3MA 1L13A 1OWZA 1OVHA 1L31A 1CU5A 122LA 1SX7A 1L90A 237LA 1DYFA 2OE4X 214LA 3GUNA 1L83A 185LA 1L99A 1L19A 1P3NA 1DYDA 1L06A 1L41A 112LA 1L54A 1L18A 1L05A 1CV4A 1L84A 1L85A 1LW9A 4W56A 1QTBA 1PQKA 190LA 2F47A 3DKEX 3DN8A 183LA 4I7TA 3C80A 1CVKA 1L74A 130LA 1L72A 195LA 1SWYA 1L95A 1G0MA 227LA 253LA 2O4WA 1OV5A 104LA 221LA 2O79A 4LDOA 199LA 1C6LA 191LA 182LA 1DYGA 4K5YA 1CUQA 3HWLA 230LA 4OO9A 3HT9A 2RBOA 3ODUA 1SSYA 1LYJA 238LA 1NHBA 226LA 1KW7A 1L23A 1L76A 1LYFA 1L35A 246LA 4DKLA 4W57A 2Q9EA 3SB9A 4W51A 1QTVA 102LA 1G0LA 248LA 225LA 1DYBA 3C8QA 1L14A 3NYAA 4W55A 1L16A 216LA 4I7QA 158LA 155LA 1I6SA 1L97A 1C6DA 1CU2A 1L86A 1QTCA 3K2RA 4S0WA 1CV0A 3HTGA 1WTHA 137LA 1QTHA 217LA 4YXAC 1C65A 3SB6A 1C66A 1L00A 1L27A 1JTMA 1P64A 2QARC 4ARMB 3FI5A 169LA 110LA 3SBAA 1G1WA 3RZEA 4I7PA 1L64A 114LA 1QTZA 1C6IA 198LA 3C83A 2OE9X 4ARMA 251LA 249LA 131LA 1L29A 1P6YA 239LA 3V2YA 157LA 1G06A 1OVJA 3G3XA 1CX6A 3LZMA 2CUUA 1L02A 1L46A 178LA 4EJ4A 1C62A 1QT7A 6LZMA 228LA 2OU8A 4EPFA 3V2WA 3SB5A 1P7SA 145LA 1K28A 1L52A 1L07A 167LA 4EKSA 1C6GA 1L17A 2B73A 1DYCA 258LA 213LA 1LYDA 123LA 3GUIA 165LA 156LA 175LA 3SB7A 1L89A 4EXMA 2B6YA 2QB0B 1LI2A 180LA 219LA 1LWGA 2IGCA 3HH3A 4ARJA 2NTHA 1L81A 233LA 1DYAA 1QT6A 2OTZX 2B75A 152LA 242LA 127LA 111LA 1JTNA 3SBBC 3DMZA 241LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GD6A 4D9ZA 1G7MC 260LA 2RAZX 1C6CA 5APFA 5APEA 5KKIA 5K7OA 4HP0A 151LA 206LA 1NQIA 1PQMA 1L53A 1YKZX 5LVJA 1MELL 1L94A 1IP3A 1KNIA 1T8GA 2LC9A 1IR7A 1LOZA 1L45A 1LMCA 3CDRA 1L96A 3N9EA 1L69A 1QQYA 3FA0A 3LZ2A 3CDOA 5LVHA 1WQMA 1G07A 1GBSA 2CJLA 161LA 4ARLA 5FSTA 4YEOA 3T36A 3A3QA 2HTXA 220LA 4LYOA 1IOTA 1IP2A 4DAJA 2RBQA 1F6SA 4EPIA 1G7JC 1XGQC 3WW6A 1BWHA 3E3DA 1L12A 6LYZA 1AZFA 5IDDA 3WXUA 4N5RA 1ZMYL 4NEBA 4NSHA 2DQAA 1NWGA 3JR6A 4DD3A 1BWIA 4XJFA 1LSZA 1LMNA 3CT1A 1QSQA 3OE0A 5LYTA 1QSWA 4L41A 1NBZC 1IWUA 4I7LA 1OUJA 4LYZA 126LA 1HEWA 2MEDA 2OU9A 4J7VA 4C5FA 1B2KA 3AZ6A 1C6BA 4GN3A 1SX2A 2Z2FA 5DN4A 1ALCA 149LA 1B0DA 4NGYA 1QUSA 1WVVA 1LGWA 4DD2A 4NGLA 5E9RA 164LA 4OWHA 5D5CA 2RH1A 4I7SA 3HT8A 1L09A 5C6LA 4ARQA 3LYMA 1GBZA 125LA 1I1ZA 1L50A 1LTMA 1GB3A 1LZEA 1G0GA 1JTOL 173LA 5B1GA 5ILCA 1QIOA 4NSGA 3GULA 5I4WA 1C6HA 4YEMA 1JEFA 4GN5C 2NTGA 3GUJA 4LYCA 1L70A 2B5ZA 1LSCA 1KY0A 2HUMA 1LYIA 5F81A 1LSPA 2HU1A 3A3RX 4QDNA 177LA 1UIGA 4YXCA 1LJFA 3WH1A 4DDAA 5HLLA 3HH5A 1KXYA 1LZ5A 3DN1A 4HV2A 4NY5A 2HUKA 1LLHA 1D9WA 138LA 1YANA 1CU3A 3ATNA 3DNAA 3HU8A 5DL9A 1L22A 3W6AA 1QS9A 2LZMA 4WG1A 1B7OA 3C8RA 3D4SA 6LYTA 1L60A 2OE7X 1GBWA 1P37A 2DKVA 1GDWA 109LA 4GCEA 118LA 4WM6A 1L68A 5II3A 4G49A 181LA 1OUHA 232LA 3W6FA 1JITA 2B6XA 4LDLA 3HTFA 4PHIA 2HEDA 1LI6A 1F0WA 3TMVA 1GEZA 1L01A 3DN3A 4LT1A 189LA 3NY9A 3DN0A 4CHXA 1RI8B 9LYZA 1L92A 223LA 1OUIA 4NHTA 4G4BA 1L51A 1C61A 4GRVA 1DPXA 3HDEA 1IY4A 4EKQA 1IC5Y 1L65A 1LCNA 1L63A 4IAPA 1LZ8A 4W94A 3LHMA 1XJTA 1ZYTA 4M4OA 4E97A 4LZMA 3PDSA 4NWEA 1GFVA 1OUDA 4WLDA 3P64A 4H9IA 1JIYA 3QNGA 5L3IA 3TMWA 1GB6A 122LA 3OJPA 4DD1A 2BQBA 5T3FA 3CB7A 1LZNA 4LYBA 4TSBA 1L85A 4W56A 4DD7A 2W1LA 1IIZA 1LSYA 4YF2A 2F4GA 1CVKA 130LA 1G0MA 1JSFA 1N4FA 2O79A 4LDOA 199LA 4II8A 191LA 1QTKA 2MEIA 1REXA 1GFAA 4HTQA 2RBOA 5LA8A 4HSFA 4DQ7A 1LYJA 238LA 1NHBA 3ZVQA 4B4JA 3IJVA 1LMPA 3W3EA 1YKXX 1LYFA 4W57A 4CJ2A 4UWUA 1BB5A 1G0LA 1DYBA 2YSSC 3C8QA 3NYAA 1L16A 4H94A 1L97A 3K2RA 5KXSA 1BVKC 5FCPA 5HNLA 217LA 4YXAC 5APCA 1FLUA 1C66A 1IWVA 4WLTA 2QARC 3FI5A 169LA 4NHIA 4DT3A 4I7PA 114LA 1AKIA 251LA 1EL1A 1LJHA 1GFTA 1LAAA 2I6ZA 1L46A 1JTPL 6LZMA 228LA 3A6BY 1CKHA 4EPFA 3V2WA 207LA 5KY1A 4NSJA 1B7QA 167LA 1LYDA 165LA 4QY9A 132LA 3WL2A 1XGUC 1XGRC 2BQEA 4TWSA 5A3ZA 2IGCA 4ARJA 1LMQA 4I8SA 233LA 2Z39A 2B75A 1HMKA 127LA 3DMZA 1UIBA 3IWRA 5KXMA 2MEBA 2BAAA 1C67A 5IELA 252LA 1T8AA 2HECA 4I7OA 4H91A 2EQLA 3C7WA 1GB7A 1L67A 4LT2A 2D6BA 197LA 3HTDA 1DPWA 4ZEEA 2YBLA 2RBNA 3WUMA 4OWEA 235LA 1C69A 2A7DA 1YKYX 4R0FA 1HSWA 2RBPA 3F9LA 1C6NA 2BQKA 129LA 1D0LA 1V7TA 3LN2A 3AYQA 1LSEA 4ETDA 1L98A 1L24A 1CKFA 1DI4A 1JWRA 4U3XB 3C81A 4I7KA 4A7DA 4I7NA 2A4TA 1JHLA 1HMLA 5L9JA 1C10A 1C6JA 1B7LA 1WQNA 1GF0A 1C45A 2RB0X 2RB1X 4LGKA 1GF5A 4HJYA 3SB8A 3HT7A 113LA 1L59A 2H5ZA 1L48A 2YBJA 1L82A 250LA 5FHWA 1L73A 1XFPL 1L26A 107LA 4EKPA 2CGIA 3AW7A 1L28A 5KXYA 1G7IC 1HHLA 2NWDX 1IC7Y 209LA 4HV1A 5F9XA 2GV0A 4LT3A 3HUKA 2D4JA 4HTNA 4NG1A 1PQJA 3P4ZA 4Z3MA 1QUHA 1JKAA 3EXDA 1T97A 4LZTA 3WU9A 1G0QA 1CV3A 1GF3A 4ZIXA 1HNLA 4AXTA 4H9FA 4H8ZA 4WOAA 4B4EA 1B9OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GD6 A;  4D9Z A;  1G7M C;  260L A;  2RAZ X;  1C6C A;  5APF A;  5APE A;  5KKI A;  5K7O A;  4HP0 A;  151L A;  206L A;  1NQI A;  1PQM A;  1L53 A;  1YKZ X;  5LVJ A;  1MEL L;  1L94 A;  1IP3 A;  1KNI A;  1T8G A;  2LC9 A;  1IR7 A;  1LOZ A;  1L45 A;  1LMC A;  3CDR A;  1L96 A;  3N9E A;  1L69 A;  1QQY A;  3FA0 A;  3LZ2 A;  3CDO A;  5LVH A;  1WQM A;  1G07 A;  1GBS A;  2CJL A;  161L A;  4ARL A;  5FST A;  4YEO A;  3T36 A;  3A3Q A;  2HTX A;  220L A;  4LYO A;  1IOT A;  1IP2 A;  4DAJ A;  2RBQ A;  1F6S A;  4EPI A;  1G7J C;  1XGQ C;  3WW6 A;  1BWH A;  3E3D A;  1L12 A;  6LYZ A;  1AZF A;  5IDD A;  3WXU A;  4N5R A;  1ZMY L;  4NEB A;  4NSH A;  2DQA A;  1NWG A;  3JR6 A;  4DD3 A;  1BWI A;  4XJF A;  1LSZ A;  1LMN A;  3CT1 A;  1QSQ A;  3OE0 A;  5LYT A;  1QSW A;  4L41 A;  1NBZ C;  1IWU A;  4I7L A;  1OUJ A;  4LYZ A;  126L A;  1HEW A;  2MED A;  2OU9 A;  4J7V A;  4C5F A;  1B2K A;  3AZ6 A;  1C6B A;  4GN3 A;  1SX2 A;  2Z2F A;  5DN4 A;  1ALC A;  149L A;  1B0D A;  4NGY A;  1QUS A;  1WVV A;  1LGW A;  4DD2 A;  4NGL A;  5E9R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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