231LA

T4 lysozyme mutant m106k
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQKGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 231lA00
109LA 3HDEA 122LA 1L25A 1L42A 2ANVA 4I7SA 1L28A 4EPIA 4ARPA 1CU6A 1C6MA 1L03A 3DNAA 1L13A 1OWZA 229LA 3GULA 1D3JA 126LA 252LA 1DYDA 2LCBA 1T6HA 247LA 1SX7A 1L06A 1L22A 3G3XA 175LA 1CUQA 1OV7A 3SB9A 1L32A 2HULA 220LA 1P64A 1KY0A 1L11A 2QB0B 149LA 1L18A 4W57A 1L73A 1L86A 3SN6R 140LA 3HH6A 1C68A 3DKEX 4I7JA 257LA 1C62A 1CUPA 5LZMA 262LA 3CDTA 148LE 1C6AA 1C65A 1K28A 1G0MA 173LA 195LA 1L99A 2O79A 1CU2A 1L30A 1KY1A 3HTDA 131LA 4LDEA 1P2RA 1LWKA 3HH5A 1SSYA 1L14A 4W59A 171LA 129LA 2OEAX 1L62A 143LA 4EPFA 166LA 1L44A 1C6PA 1PQDA 186LA 1JTMA 3CDRA 1L48A 2NTGA 2RAYX 3DN2A 250LA 201LA 2RAZX 3C7WA 260LA 1L87A 4I7LA 3NYAA 1SSWA 1L53A 1L66A 1OV5A 240LA 1L35A 1QSBA 4EKQA 1QT4A 1C69A 1LI6A 189LA 1L10A 1G07A 120LA 130LA 1L09A 235LA 3F9LA 4LZMA 1L56A 4ARMA 1QTZA 1L95A 1C6EA 2IGCA 161LA 1L34A 1XEPA 1D9WA 1C60A 1C6DA 1L91A 209LA 1L24A 223LA 1L43A 4OO9A 156LA 2CUUA 1CVKA 1L38A 1T8FA 2B75A 152LA 1CU3A 1L75A 1OVKA 1C6CA 1L58A 234LA 3SB7A 1G06A 1L88A 224LA 3DN1A 205LA 1L52A 1L67A 3ODUA 1L83A 191LA 1LI2A 3QAKA 3CDQA 1QT5A 3HT9A 114LA 1L77A 3V2YA 3C8RA 1L97A 1L39A 147LA 1PQKA 1C67A 1D3FA 248LA 1C63A 1T97A 3SB6A 1C64A 123LA 1CTWA 151LA 222LA 155LA 1L01A 1CV5A 211LA 2B6XA 3FI5A 4I7NA 1C6JA 1C6QA 2B73A 4W51A 1EPYA 3C83A 4LDLA 1QT6A 1L0KA 2RB1X 1L96A 1L93A 3DN0A 1LI3A 1G0JA 4ZPUA 1LYIA 184LA 2LZMA 258LA 1L45A 1ZYTA 2OTYX 3GUMA 182LA 1L69A 2OE4X 1QT8A 1SWZA 1ZWNA 3OE9A 1P56A 2RBQA 2OTZX 1L79A 1NHBA 1CX7A 4ARLA 3K2RA 212LA 3DN3A 127LA 1P7SA 150LA 1JTNA 4I7RA 2LC9A 1C6NA 218LA 1L17A 199LA 1P2LA 4I7MA 103LA 1L81A 2O4WA 244LA 3HTFA 1L02A 118LA 188LA 1LGUA 1P3NA 2RBRA 2OE7X 181LA 239LA 2RBNA 1C6TA 1P36A 228LA 1D2WA 3G3VA 108LA 174LA 1DYCA 119LA 4I7OA 3RUNA 1KW5A 1LGWA 3HDFA 1CU5A 3C8SA 168LA 2O7AA 138LA 1LYEA 1C6HA 216LA 1DYBA 1L37A 1L76A 251LA 1QUOA 4GRVA 1L85A 1T8GA 1KS3A 226LA 3PDSA 4W56A 3DMZA 3HU9A 1L23A 1L40A 145LA 2F32A 1L51A 112LA 2OU0X 1L98A 3DN8A 190LA 1CV1A 1CV0A 1L70A 4K5YA 163LA 2HUMA 146LA 1L72A 1SX2A 1G0PA 3UONA 3HWLA 1L07A 1L08A 4AQNA 1OYUA 2RBSA 1ZURA 2RH1A 172LA 3HTBA 1C61A 4DKLA 206LA 1L61A 214LA 176LA 1LYFA 219LA 2B74A 4PJZA 4W52A 167LA 3DN4A 1PQOA 6LZMA 1L82A 111LA 2RB2X 187LA 1L63A 3GUPA 3C81A 1P46A 2RBPA 1L59A 3SB5A 1L55A 1KNIA 1LLHA 1DYGA 1L89A 1I6SA 2QARC 1L00A 1DYAA 1L68A 1QUDA 241LA 1QUHA 3OE0A 4W53A 237LA 1L71A 137LA 3G3WA 1C6GA 1D3MA 113LA 1L04A 144LA 230LA 1L20A 1SWYA 3OE8A 2L78A 1QTDA 1L15A 1L80A 4DJHA 180LA 192LA 3DN6A 1L33A 185LA 256LA 4ARQA 3L64A 2Q9DA 1JQUA 1CV6A 3SB8A 1G0GA 246LA 1P37A 3GUNA 1TLAA 2ANXA 3GUOA 2OU9A 1G1VA 3HT7A 3HUQA 3C7YA 3HT8A 1QS5A 3OE6A 213LA 217LA 3F8VA 1B6IA 3HH4A 139LA 1LYDA 3C7ZA 125LA 1PQJA 1DYFA 1QT7A 3FA0A 3GUJA 3GUKA 1LW9A 4EXMA 1L29A 128LA 1L94A 236LA 164LA 4DAJA 1L16A 1CU0A 1L19A 1L57A 1LYJA 242LA 1G0KA 1OVJA 225LA 2F2QA 4W54A 4ARMB 110LA 1L26A 4ARJA 1LYGA 198LA 259LA 7LZMA 1C6FA 231LA 2B6ZA 142LA 197LA 4W55A 2NTHA 3D4SA 2B7XA 3HT6A 1L47A 1T8AA 1L54A 3CDVA 141LA 1P6YA 4YX7C 1DYEA 1L46A 1KW7A 1QS9A 2B72A 1G1WA 2Z6BA 3EMLA 232LA 178LA 3FADA 1L31A 1LPYA 254LA 3HH3A 1C66A 104LA 3C8QA 1L92A 1OWYA 1QTVA 261LA 4GBRB 1G0QA 1XJUA 3HUAA 1QUGA 1QSQA 238LA 2RB0X 1L21A 4ARQB 1XJTA 158LA 1CV4A 1QTCA 3C80A 3CDOA 3HTGA 4I7TA 169LA 1OVHA 2OU8A 1D3NA 1L64A 1QTHA 3VW7A 4EKRA 4YXCA 1L12A 255LA 2B6YA 3DMVA 227LA 3NY8A 2OE9X 3DMXA 1L90A 1WTHA 3SBBC 1L50A 170LA 5I14A 1L65A 1LGXA 3NY9A 215LA 4IAPA 4EKSA 102LA 1L49A 200LA 1LWGA 4I7KA 1G0LA 3LZMA 165LA 1PQMA 1PQIA 1CX6A 3HUKA 1L0JA 4EKPA 196LA 4LDOA 160LA 4PK0A 1LYHA 2RBOA 1L36A 177LA 1L60A 1L41A 107LA 2B6WA 115LA 4S0WA 4YXAC 3HU8A 4E97A 162LA 1QT3A 157LA 2A4TA 1D2YA 245LA 3RZEA 221LA 159LA 3GUIA 2Q9EA 243LA 249LA 183LA 2B70A 3PBLA 4I7PA 3C82A 3V2WA 1L05A 3L2XA 4EJ4A 1L74A 1L27A 1P5CA 233LA 1C6IA 3SBAA 1C6KA 1C6LA 1QTBA 3JR6A 210LA 2F47A 1C6BA 1CV3A 4I7QA 2B6TA 1L84A 4W58A 253LA 2HUKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQIA 4WO9A 4LYCA 5HQ1A 122LA 1LTMA 3W6AA 1C6MA 1L03A 2H9KA 1JSEA 1ZMYL 1D3JA 2LCBA 1L06A 1UIBA 4H9EA 153LA 1OV7A 3SB9A 1UC0A 1L32A 2HULA 3G3AB 4NHIA 1J1XY 1L11A 149LA 2HU3A 4J7VA 4OOTA 5KXXA 2DQJY 4H9CA 5B1FA 140LA 1C68A 2BPUA 5FELA 1C62A 5LZMA 2CWIA 1K28A 1L99A 1REXA 2DQIY 2O79A 1CU2A 1L30A 1JJ1A 5K7OA 1LWKA 2DKVA 1YIKA 1YKYX 1QDRA 129LA 3WXTA 1YAOA 2YBLA 1DI4A 1L44A 1PQDA 4H9HA 1AKIA 3CDRA 1L48A 2NTGA 3DN2A 201LA 1QUTA 3C7WA 3NYAA 3TXDA 1LZCA 1QT4A 1C69A 3RW8A 5ILCA 1F6SA 4QDNA 1L10A 1HFXA 130LA 1L09A 1QTZA 4Z3MA 3CT5A 2IGCA 1C60A 1L91A 1L43A 1YKXX 3P64A 1L38A 1T8FA 4DD3A 2DQGY 1GFEA 1L75A 1DI5A 2ZIJA 1L88A 1DXJA 1XGUC 1NMMA 2W1LA 9LYZA 4YEOA 1LI2A 3LYTA 3HT9A 3C8RA 1L97A 5APDA 2IFFY 147LA 1IWZA 1T97A 1LZBA 1C10A 4ETCA 1IP2A 1CV5A 3FI5A 5KKJA 4I7NA 2W1XA 1C6QA 1LJ4A 2B73A 4ET8A 1GF5A 1DQJC 1BWHA 5KXLA 1QT6A 4KPMA 5KXMA 1LMQA 1D0MA 1G0JA 1GFJA 1GEVA 3GUMA 2HECA 182LA 2OE4X 4LFPA 1IOQA 1IWYA 1BQLY 1BB7A 1UICA 1ALCA 2A7DA 5KXYA 4YM8A 4I7MA 1L81A 4BAFA 4AXTA 5HLLA 1L02A 2DQAA 2OE7X 5FDJA 1KIRC 1D2WA 5HNCA 3T6UA 4WLDA 174LA 1I1ZA 4G4CA 3RUNA 4RLMA 1LGWA 168LA 138LA 216LA 1L37A 1GE3A 2MECA 5APEA 1LMAA 2XBRA 3DMZA 1EQ4A 112LA 1L98A 1CV0A 146LA 1LKRA 1GBZA 1G0PA 1SX2A 3HWLA 1ZURA 4XJHA 154LA 3A6CY 4DKLA 4LT2A 5B07A 2WARA 206LA 2EQLA 2ZILA 1LZYA 3HFMY 2HEEA 4W52A 4NGKA 1JKDA 4H9BA 2Z2EA 2BAAA 2BQLA 3CB7A 1GBSA 2RB2X 3GUPA 1JKCA 1AM7A 1L59A 3SB5A 1JSFA 4WLYA 3CQLA 4ZIXA 1IC7Y 1W08A 1QUDA 4KT3A 1WTNA 1WQOA 2GV0A 4NGOA 1JHLA 137LA 3EXDA 1C6GA 1HMKA 1L04A 2BQJA 2Y8PA 1IP6A 4M4OA 1L20A 1SWYA 1UA6Y 1QTDA 4N1CC 1DKJA 5T3FA 1CV6A 4N8ZA 3SB8A 133LA 1P37A 1OUDA 3GUNA 4H91A 5DLAA 3HT7A 2I25L 3TMVA 4EMNA 4ZFPA 3C7YA 1LMOA 8LYZA 1LJNA 217LA 3M18B 4PRQA 2HU1A 132LA 4WO6A 3W6FA 125LA 1PQJA 1DYFA 5II3A 4WOAA 4EXMA 4H8XA 3J4GA 1FLWA 3ZEKA 193LA 1OVJA 3WU9A 1GXXA 4QEQA 1C6FA 4FDYA 1LHIA 2B6ZA 4G4HA 1HEWA 2IHLA 3ZVQA 4WM4A 1IP7A 1DYEA 1B7MA 2VB1A 4R0FA 3TXEA 3CSQA 2PC2A 1XEKA 232LA 178LA 1C08C 1G7MC 3HH3A 2DQCY 4CFOA 4NG1A 1YAQA 3ATOA 1XJUA 3HUAA 135LA 4FJRA 1OUCA 1QSQA 2DQHY 4O34A 1CV4A 6LYTA 3C80A 1LMPA 1IC4Y 1V7TA 4CHXA 5F81A 4YXCA 255LA 3TMXA 1GB5A 2FBDA 3DMVA 1GFUA 5IHGA 3FI7A 1IIZA 1GF3A 1HF4A 1OUHA 1RE2A 4EKSA 1GF4A 5B06A 3WW6A 1GAYA 1PQIA 3AW6A 2HEBA 3HUKA 4WLXA 2G4QA 1L0JA 1LSPA 4LDOA 4GCFA 3WU7A 1LYHA 1NDMC 177LA 1GFHA 3KAMA 3J6KA 1IWTA 4OWHA 1GB0A 2YBJA 1QT3A 157LA 3QY4A 1H6MA 3GUIA 1LZSA 1N4FA 1JISA 1LZ8A 3CSRA 4NGYA 1L27A 233LA 4G4BA 3A8ZA 1LSFA 1IEEA 4IASA 2F47A 1CV3A 1L84A 1RJCB 2F4GA 2HUKA 1UBZA 3HDEA 3AGIA 1YL0X 1L28A 4EPIA 5L9JA 5KXTA 3DNAA 1OWZA 126LA 1DYDA 4OW1A 2D6BA 4WLTA 1C45A 2D4JA 4CFPA 2LYMA 175LA 3A94A 3G3XA 4PPOA 3SP3A 1KY0A 5C6JA 1B5VA 1IORA 1NBYC 4GCEA 1L86A 4H9AA 5KXSA 1TCYA 1JJ3A 3HH6A 4AGAA 2XBSA 1GBOA 257LA 3WUNA 2HUBA 4WM5A 4HTQA 3CDTA 148LE 1LZ9A 2I26L 1C65A 1KXYA 4BS7A 1HFYA 1D0KA 1JPOA 173LA 4OOOA 2YSSC 131LA 1SSYA 1L14A 4W59A 1G7JC 1LZ6A 2B5ZA 5F9XA 2D91A 3WH1A 4H8ZA 2OEAX 4DD1A 4EPFA 5KXOA 5LA8A 1FLUA 3FE0A 2BQEA 4D9ZA 3P66A 1JTMA 250LA 1XEIA 2RAZX 2BQGA 1L53A 1DPXA 1L66A 1OV5A 2MEHA 240LA 2NWDX 4C3WA 4EKQA 1G07A 4NSIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BQI A;  4WO9 A;  4LYC A;  5HQ1 A;  122L A;  1LTM A;  3W6A A;  1C6M A;  1L03 A;  2H9K A;  1JSE A;  1ZMY L;  1D3J A;  2LCB A;  1L06 A;  1UIB A;  4H9E A;  153L A;  1OV7 A;  3SB9 A;  1UC0 A;  1L32 A;  2HUL A;  3G3A B;  4NHI A;  1J1X Y;  1L11 A;  149L A;  2HU3 A;  4J7V A;  4OOT A;  5KXX A;  2DQJ Y;  4H9C A;  5B1F A;  140L A;  1C68 A;  2BPU A;  5FEL A;  1C62 A;  5LZM A;  2CWI A;  1K28 A;  1L99 A;  1REX A;  2DQI Y;  2O79 A;  1CU2 A;  1L30 A;  1JJ1 A;  5K7O A;  1LWK A;  2DKV A;  1YIK A;  1YKY X;  1QDR A;  129L A;  3WXT A;  1YAO A;  2YBL A;  1DI4 A;  1L44 A;  1PQD A;  4H9H A;  1AKI A;  3CDR A;  1L48 A;  2NTG A;  3DN2 A;  201L A;  1QUT A;  3C7W A;  3NYA A;  3TXD A;  1LZC A;  1QT4 A;  1C69 A;  3RW8 A;  5ILC A;  1F6S A;  4QDN A;  1L10 A;  1HFX A;  130L A;  1L09 A;  1QTZ A;  4Z3M A;  3CT5 A;  2IGC A;  1C60 A;  1L91 A;  1L43 A;  1YKX X;  3P64 A;  1L38 A;  1T8F A;  4DD3 A;  2DQG Y;  1GFE A;  1L75 A;  1DI5 A;  2ZIJ A;  1L88 A;  1DXJ A;  1XGU C;  1NMM A;  2W1L A;  9LYZ A;  4YEO A;  1LI2 A;  3LYT A;  3HT9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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