232LA

T4 lysozyme mutant m120k
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRKLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Context-dependent protein stabilization by methionine-to-leucine substitution shown in T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 232lA00
2OEAX 3C7WA 1C6AA 1NHBA 1SWZA 1XJTA 3DN1A 1C6FA 2OU9A 4EXMA 109LA 129LA 158LA 2RBNA 1L95A 1T8FA 1T97A 220LA 1L50A 2OU8A 1JTMA 3V2WA 5LZMA 1L19A 1SX2A 1KY0A 3NY8A 1L92A 1C6CA 2OE4X 1G1WA 1L44A 3K2RA 2B6YA 1QT7A 3HTGA 1T8GA 1B6IA 159LA 1L79A 2RB0X 230LA 247LA 1L85A 1L88A 219LA 161LA 197LA 2NTGA 139LA 1LI2A 1ZYTA 1LYDA 2F2QA 3HT9A 1G0GA 2IGCA 4W54A 4EPFA 111LA 1L90A 169LA 1C63A 131LA 5I14A 1L89A 1G0LA 2RBPA 1L66A 198LA 1KW5A 1PQKA 254LA 2B6XA 2OE7X 3GUIA 1KNIA 4LDLA 200LA 3SN6R 1L46A 1L13A 3GUJA 1L65A 4LDEA 1LWKA 3C7ZA 2A4TA 224LA 3ODUA 1LI6A 3VW7A 1L36A 1D3FA 1OV7A 2OU0X 1C6LA 214LA 1CX7A 1OYUA 228LA 2Q9DA 156LA 3HH4A 1P46A 3C8QA 1CU6A 1L03A 1L02A 2CUUA 1L96A 4W57A 146LA 1QTZA 216LA 1L20A 251LA 4I7KA 1P5CA 4I7OA 1DYCA 1L0JA 3OE0A 1L81A 171LA 1LYEA 110LA 120LA 201LA 1SSYA 3RUNA 1L14A 232LA 1QUHA 3DN8A 2B7XA 1C6KA 1XEPA 6LZMA 4W56A 241LA 1PQOA 1QUDA 1C6BA 3CDRA 4E97A 3DMZA 1L07A 140LA 1D2WA 1XJUA 2OTYX 235LA 1LYGA 223LA 1CUPA 1L45A 1LGXA 1SSWA 1P7SA 1G07A 2O79A 3GUKA 3QAKA 213LA 192LA 1L70A 250LA 1QS9A 122LA 1LYJA 145LA 1C69A 1L93A 3DN0A 182LA 261LA 3OE6A 1QTVA 174LA 1L32A 1P64A 188LA 1P37A 1C65A 218LA 1L25A 2O4WA 1LYFA 4GRVA 183LA 3OE9A 1QTHA 1JTNA 3HT8A 125LA 149LA 157LA 3CDTA 4EJ4A 4S0WA 4YXCA 1L31A 1L05A 150LA 178LA 1PQJA 1G06A 137LA 1CV6A 2ANVA 4W53A 112LA 1L76A 1QUGA 1C6TA 4PJZA 1EPYA 4AQNA 1OVHA 1PQMA 184LA 1G1VA 3HUKA 1OV5A 1QSQA 3DKEX 240LA 4W55A 1L91A 2ANXA 2QARC 1L30A 4K5YA 1L40A 1L51A 2RBSA 2LCBA 1C61A 242LA 3G3XA 4ZPUA 1QS5A 167LA 177LA 1L86A 1C6QA 113LA 1L75A 4ARPA 2RB1X 1L62A 1L73A 1L41A 3HTFA 1L94A 2QB0B 1L52A 1L56A 1C6HA 195LA 1DYAA 1L99A 1LYIA 1OVJA 1L60A 175LA 3OE8A 3D4SA 4LDOA 1L57A 170LA 142LA 3HU9A 1D9WA 3C82A 173LA 252LA 190LA 1G0MA 1TLAA 3C8RA 3DN6A 108LA 4I7SA 3HDEA 3HUAA 1C66A 2Q9EA 3SB6A 3HTBA 1L49A 3HT7A 227LA 3GUPA 143LA 3L2XA 1QT8A 1L37A 255LA 3NYAA 1L58A 1CV0A 4I7PA 1PQDA 1OWYA 4EKRA 196LA 1L09A 1C60A 1L67A 1L83A 246LA 1P36A 1L11A 229LA 233LA 3F8VA 1D2YA 2B6WA 2B75A 249LA 1D3NA 186LA 1C6PA 4YXAC 2RB2X 3FI5A 4ARJA 4PK0A 1P6YA 1C62A 7LZMA 3DN3A 3CDQA 1LYHA 258LA 1LWGA 1LLHA 1JQUA 199LA 126LA 2HULA 1C6DA 2Z6BA 123LA 1C6JA 239LA 1QT3A 172LA 1WTHA 4DKLA 4ARLA 1C6MA 2L78A 151LA 1KS3A 1DYFA 1L87A 1QT6A 1G0QA 1L47A 1L04A 2HUMA 189LA 1C6NA 1C6IA 138LA 1L01A 3GUNA 3SBAA 1CU5A 234LA 3SB9A 1SX7A 4IAPA 2B72A 3HH3A 4ARMB 168LA 1CU3A 3C8SA 166LA 4I7QA 4GBRB 4I7JA 4EKQA 244LA 1DYBA 2RH1A 1P56A 1CU2A 1L69A 2LC9A 4I7LA 1CV1A 1L55A 259LA 1DYEA 3CDVA 1KW7A 1L61A 3SB8A 1CU0A 210LA 3UONA 222LA 1L38A 1L22A 2OE9X 262LA 1LW9A 1D3MA 217LA 4EPIA 1P2LA 2HUKA 3HH5A 3SB7A 2B70A 1L24A 3G3VA 4YX7C 147LA 1P2RA 2RAZX 1L59A 1QT5A 103LA 205LA 1CV4A 2RBOA 1DYGA 236LA 152LA 1L84A 1PQIA 1L08A 3RZEA 3GUMA 1P3NA 3HUQA 1OWZA 1L72A 4DAJA 1C68A 128LA 1C6EA 209LA 260LA 1L71A 1L43A 3DN2A 3PBLA 1L12A 1L18A 1LPYA 1QTDA 237LA 1G0JA 4OO9A 119LA 3G3WA 4ARMA 1L21A 1LI3A 1L42A 4W51A 3C81A 3DNAA 1QUOA 248LA 4W52A 1L27A 148LE 1QTCA 3CDOA 1L77A 2LZMA 1QSBA 3C7YA 1L64A 3V2YA 1L33A 3HTDA 4I7NA 3NY9A 1L98A 1ZWNA 1L16A 1L80A 3PDSA 1K28A 3HT6A 2F47A 3FA0A 1D3JA 211LA 1G0PA 144LA 1LGWA 1ZURA 155LA 4I7TA 231LA 3JR6A 2B74A 1LGUA 238LA 4ARQA 1L26A 176LA 2NTHA 141LA 2RAYX 1L39A 1L10A 130LA 1L68A 1L82A 225LA 2OTZX 1CVKA 245LA 1C6GA 1C64A 1L00A 1L17A 1KY1A 2RBQA 1QT4A 3GULA 1L29A 1L74A 3DMVA 1L15A 4I7MA 2O7AA 102LA 1CX6A 215LA 163LA 1OVKA 2B6TA 2RBRA 4I7RA 1L97A 185LA 1T6HA 3LZMA 1L06A 164LA 206LA 3C80A 4DJHA 3SBBC 1L63A 2B73A 3L64A 256LA 257LA 3DMXA 160LA 3SB5A 107LA 1DYDA 3GUOA 4LZMA 114LA 2B6ZA 162LA 1L34A 1C67A 4EKPA 118LA 1QTBA 1CTWA 180LA 243LA 4W59A 1L0KA 2F32A 165LA 3C83A 115LA 3FADA 1SWYA 1L35A 1T8AA 1L53A 1CUQA 1L48A 4EKSA 3HU8A 191LA 127LA 221LA 226LA 3DN4A 181LA 3HH6A 104LA 187LA 3HWLA 1I6SA 1L28A 1L54A 212LA 1CV3A 3EMLA 1L23A 4W58A 1G0KA 3HDFA 253LA 1CV5A 3F9LA 4ARQB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZVQB 1JKBA 3G3BB 3N9AA 3WXUA 1EL1A 2OU8A 1L50A 5LZMA 1D6QA 1L19A 1SX2A 3NY8A 3AW7A 1IR9A 3LHMA 1G1WA 5FHWA 4ETCA 4G4BA 3HTGA 1T8GA 4RLMA 159LA 1HMKA 1LZCA 1NKHA 3WH1A 2BQJA 1C7PA 3WW5A 4Z41A 197LA 3WUNA 139LA 1LYDA 1LZ1A 3A93A 1LJ4A 1NBYC 4EPFA 1YKXX 169LA 5DM9A 2CDSA 1G0LA 1JJ3A 4NHSA 4N1EI 4LGKA 2B6XA 4NGOA 4LYTA 4BADA 4A7DA 2MEAA 200LA 4PJ2C 1LMPA 4GN3A 4LDEA 3C7ZA 1CKFA 5B1GA 3ODUA 1LI6A 1B5VA 3AZ5A 1IY4A 2OU0X 4J1BA 1TEWA 214LA 1CX7A 2D91A 2HEFA 1WQOA 4G4HA 1LMAA 4W57A 1JHLA 1KIQC 4I7KA 1P5CA 4DQ5A 2HTXA 4NGWA 1AM7A 1L81A 1SSYA 4H93A 1L14A 1UIHA 2MEDA 3DN8A 1C6KA 1XEPA 6LZMA 4W56A 2W1MA 4WLYA 1QUDA 1C6BA 3CDRA 4OOOA 3P4ZA 140LA 1D0MA 1W08A 1XGUC 1L45A 3P64A 2Z2FA 1LYSA 2Z19A 4QGZA 3QAKA 3AGGG 3CQLA 3TMUA 145LA 2Z38A 1L93A 1LSPA 4DD2A 3AB6A 261LA 3OE6A 5LYZA 1FLYA 1P64A 3ATNA 4HV2A 8LYZA 2O4WA 1LYFA 2G4PA 4GRVA 1LKRA 3OE9A 1QTHA 125LA 149LA 1RCMA 1LHJA 1L31A 1AT5A 150LA 2YBLA 178LA 1GF6A 5HNCA 2HEAA 1LOZA 1JPOA 1QUGA 1C6TA 4AQNA 4XJFA 4YEMA 1QSQA 1XEIA 3DKEX 240LA 1OP9B 1VATA 1GAZA 2ANXA 1JJ1A 4K5YA 1B5YA 4HJZA 3G3XA 5LIOA 1C6QA 4ARPA 3W3EA 1NQIA 1IP1A 1L52A 1L56A 1L99A 1LZAA 1GXV2 1OVJA 1L60A 5I4WA 170LA 1D9WA 1B5UA 108LA 1REYA 1F6SA 1VEDA 2Q9EA 1UIBA 3HTBA 4YF2A 1L37A 255LA 4OOTA 2Z18A 3B0IA 4NHIA 3IJUA 3W6BA 1GXXA 1C60A 246LA 4H9HA 5LVJA 1D0KA 233LA 1IWZA 1IX0A 4D9ZA 1D2YA 5ILCA 4UWUA 1HF4A 1JTOL 4LT2A 3WVXA 1B9OA 2RB2X 3G3AB 4TSCA 5F9XA 1LJIA 1C62A 1DKJA 4OWBA 3J6KA 2DQDY 4ET8A 1WQMA 2FBDA 123LA 2HEEA 172LA 4B1AA 1VDPA 4HTNA 1DYFA 1QT6A 1REMA 4RLNA 4G4CA 2BQDA 2HU3A 4BS7A 138LA 1L01A 2LYMA 3SB9A 4IAPA 1B7MA 1GHLA 5LXWA 4ARMB 168LA 166LA 5KXKA 5LVHA 4DQJA 4H94A 1P56A 1REZA 4HV1A 1RI8B 2IFFY 1L69A 3WU7A 2BPUA 259LA 3CDVA 1GPQC 1L61A 4NGJA 1LCNA 1L38A 3N9EA 4H8YA 4Z46A 2D4JA 217LA 5LYTA 4EPIA 1LYOA 4WM4A 1LMQA 2ZIJA 1FDLY 1HELA 1LHMA 1GFKA 1L59A 1QT5A 1EQ4A 1F10A 1CV4A 236LA 1CJ6A 1HC0A 4C5FA 2DQIY 1LZ5A 1L43A 3PBLA 3TXBA 3B0KA 1L12A 1G0JA 2DQAA 2PC2A 3LYZA 1QTCA 4DDCA 1L77A 1QSWA 1NF5A 4HPIA 3V2YA 1KXXA 4IATA 1L16A 1K28A 2FYDA 1G0PA 1EQEA 4TTDA 4LYZA 1IVMA 2X0AA 1DI4A 3MGWA 5KXOA 3WU9A 4ARQA 4O34A 4M4OA 4DYGA 1L39A 1L10A 225LA 2OTZX 1OUGA 3WPJA 1C64A 1L17A 3GULA 1L29A 2C8OA 1L74A 4NGZA 134LA 1OUJA 1UIFA 4I7MA 2O7AA 1NWGA 102LA 2DQEY 1LZDA 4GCFA 2B6TA 4KL7A 1AZFA 1XEJA 2H9KA 1UUZC 1L06A 206LA 3C80A 2A7FA 4X3BA 4ETAA 2BLXA 3SBBC 3A90A 3TMVA 1FLWA 107LA 3GUOA 4LZMA 4H9FA 5L3IA 3A94A 4MCKA 1RE2A 1LHHA 4ML7A 4XJHA 2F32A 165LA 3C83A 3FADA 2HEDA 1SWYA 3SP3A 1BB6A 1L48A 3LZ2A 1JTPL 4DWXA 4RW2A 5B06A 5LVKA 3A3RX 3HH6A 2LHMA 3W6DA 1IWWA 1DXJA 1G0KA 1GB8A 3F9LA 4ARQB 5ILFA 3AGHA 1E8LA 1C6AA 1SWZA 1LMTA 3DN1A 4EXMA 2RBNA 3B0OA 1IOTA 1T8FA 1GBWA 4H90A 3K2RA 2Y8PA 3AZ4A 3AJNA 1L79A 219LA 161LA 3HT9A 5II3A 1G0GA 5HNLA 1ZV5L 111LA 1GE3A 207LA 1LJGA 1I1ZA 4WL7A 1RJCB 1PQKA 254LA 1YKYX 1C43A 1V7TA 4OW1A 3GUIA 1VDTA 2ZILA 1OUHA 4DD1A 1GFEA 4DDBA 224LA 4OWHA 2Q9DA 156LA 1OUIA 4GCDA 3A95A 3C8QA 2F30A 2F4AA 3T36A 1B0DA 3RT5X 1QTZA 2ZWBA 5KXLA 1L20A 251LA 2EPEA 3OE0A 3RUNA 4HP0A 2FYCA 2DQFC 4W94A 1QUHA 1DZBX 3WL2A 1XGQC 241LA 1B5ZA 2ZIKA 5I4XA 1BB3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZVQ B;  1JKB A;  3G3B B;  3N9A A;  3WXU A;  1EL1 A;  2OU8 A;  1L50 A;  5LZM A;  1D6Q A;  1L19 A;  1SX2 A;  3NY8 A;  3AW7 A;  1IR9 A;  3LHM A;  1G1W A;  5FHW A;  4ETC A;  4G4B A;  3HTG A;  1T8G A;  4RLM A;  159L A;  1HMK A;  1LZC A;  1NKH A;  3WH1 A;  2BQJ A;  1C7P A;  3WW5 A;  4Z41 A;  197L A;  3WUN A;  139L A;  1LYD A;  1LZ1 A;  3A93 A;  1LJ4 A;  1NBY C;  4EPF A;  1YKX X;  169L A;  5DM9 A;  2CDS A;  1G0L A;  1JJ3 A;  4NHS A;  4N1E I;  4LGK A;  2B6X A;  4NGO A;  4LYT A;  4BAD A;  4A7D A;  2MEA A;  200L A;  4PJ2 C;  1LMP A;  4GN3 A;  4LDE A;  3C7Z A;  1CKF A;  5B1G A;  3ODU A;  1LI6 A;  1B5V A;  3AZ5 A;  1IY4 A;  2OU0 X;  4J1B A;  1TEW A;  214L A;  1CX7 A;  2D91 A;  2HEF A;  1WQO A;  4G4H A;  1LMA A;  4W57 A;  1JHL A;  1KIQ C;  4I7K A;  1P5C A;  4DQ5 A;  2HTX A;  4NGW A;  1AM7 A;  1L81 A;  1SSY A;  4H93 A;  1L14 A;  1UIH A;  2MED A;  3DN8 A;  1C6K A;  1XEP A;  6LZM A;  4W56 A;  2W1M A;  4WLY A;  1QUD A;  1C6B A;  3CDR A;  4OOO A;  3P4Z A;  140L A;  1D0M A;  1W08 A;  1XGU C;  1L45 A;  3P64 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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