255LA

Hydrolase
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A relationship between protein stability and protein function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 255lA00
1OVKA 1P56A 113LA 2HUKA 3C80A 4ARMB 220LA 1LWGA 2OTZX 1L51A 3V2YA 3V2WA 1EPYA 2QB0B 3F8VA 1KY0A 1KNIA 1P3NA 191LA 4S0WA 189LA 1QUGA 2B75A 3HH5A 166LA 1OWZA 1LWKA 1P7SA 1C6LA 2OU0X 1L13A 3DN6A 146LA 1SX2A 1L91A 1QUHA 1L32A 192LA 2F2QA 3CDVA 1CV4A 1SX7A 1PQIA 4I7LA 1L41A 1P36A 3L2XA 1C6FA 142LA 2O7AA 251LA 1L80A 2HULA 4IAPA 230LA 1QTVA 1P2LA 1QT6A 1CU3A 138LA 209LA 3D4SA 3SB5A 1L08A 3OE8A 114LA 1CU0A 3ODUA 1L22A 1OYUA 3GUJA 2OU9A 1L96A 3C8QA 4LDOA 1L94A 171LA 255LA 151LA 3SN6R 1L68A 1C6HA 222LA 156LA 1D2WA 1L77A 1C6QA 3HTDA 2OU8A 2B6XA 180LA 3HH4A 2ANXA 1LYGA 1CX7A 3C81A 2B6YA 1L38A 242LA 2RH1A 3HT8A 1G07A 1C6TA 3HT6A 1KS3A 1L93A 184LA 1PQOA 4W59A 253LA 1L83A 1L90A 4EKPA 1CV0A 199LA 175LA 1LW9A 3DN3A 211LA 201LA 3DN4A 2B72A 4GRVA 1C64A 1G1VA 1L74A 1L92A 1WTHA 5I14A 172LA 213LA 1D3JA 1LI6A 1L02A 4PJZA 131LA 150LA 1L69A 181LA 1QT7A 1L00A 2O79A 1SSWA 3DN8A 3GUKA 2Z6BA 1TLAA 1L11A 1LYJA 1JTMA 3DN2A 260LA 1C68A 3G3VA 1C6CA 252LA 1L12A 1C61A 2Q9DA 3SB9A 1L07A 178LA 3GUPA 244LA 2RBSA 1C6NA 160LA 169LA 119LA 1DYAA 228LA 3OE9A 1L46A 4EXMA 1L28A 4I7NA 219LA 1L72A 2B73A 2NTHA 1JTNA 1T8GA 1PQMA 2B6ZA 225LA 243LA 1LYDA 177LA 218LA 186LA 4LDEA 1L34A 2LC9A 137LA 1OV7A 1QS9A 4I7PA 1L45A 3DN0A 3DMZA 3DN1A 1QTDA 1XJTA 3GUOA 1DYFA 2IGCA 1L36A 4EKQA 2RBRA 1L42A 1L54A 1LGUA 4W57A 4ARLA 246LA 1L67A 1T6HA 1SWYA 102LA 4ARQB 1G06A 1L88A 4AQNA 4LZMA 1C69A 1SWZA 1P6YA 115LA 162LA 122LA 4YXCA 226LA 233LA 1L20A 1QUDA 1P2RA 1CVKA 1D9WA 1L73A 2RBOA 110LA 1OV5A 221LA 1C6AA 258LA 1L35A 148LE 2OTYX 195LA 1L25A 2RBPA 161LA 174LA 2OE9X 3SBAA 2RBQA 3DKEX 1L39A 236LA 1KY1A 1P5CA 1L27A 1G0JA 1L64A 240LA 1CTWA 1L60A 147LA 3C82A 4W55A 1L43A 128LA 4GBRB 1C6KA 3SB7A 5LZMA 1L85A 183LA 3NY9A 3DNAA 249LA 3C7WA 1L21A 1L01A 1L56A 196LA 2L78A 3JR6A 2RB2X 1L87A 1LGWA 1G0QA 1L31A 215LA 1LYEA 1L18A 187LA 1CU6A 1LI3A 143LA 3GUNA 1G1WA 1L66A 1OWYA 3C7ZA 1L04A 1L03A 237LA 1SSYA 2F32A 2HUMA 227LA 4I7OA 3HH3A 1L24A 1OVHA 1LLHA 4I7TA 1L55A 1L48A 182LA 1CV5A 1L26A 164LA 1L44A 216LA 224LA 3HTFA 3K2RA 1C6GA 4W52A 238LA 3L64A 1L29A 1LYHA 126LA 1C6DA 3C8RA 4ZPUA 1KW7A 7LZMA 167LA 157LA 4EKSA 3GUIA 1L52A 190LA 1L84A 4ARQA 1G0PA 4ARJA 1C6IA 212LA 4I7RA 2LZMA 254LA 1OVJA 250LA 141LA 3HUKA 3GUMA 3FADA 2RB1X 235LA 223LA 1C65A 2B6TA 1D3FA 3NYAA 4W58A 3RZEA 1QSBA 1QSQA 4I7QA 144LA 1L59A 4OO9A 1L63A 3HH6A 1L19A 205LA 1QT5A 1QTBA 1D2YA 120LA 1L50A 4EPIA 1L61A 1CU2A 245LA 3FI5A 111LA 1L16A 1DYDA 2Q9EA 1L0JA 3PBLA 3OE6A 1I6SA 1L10A 3DMVA 3C8SA 4I7MA 4E97A 1C60A 3HU9A 3QAKA 1NHBA 1G0MA 1L06A 3DMXA 159LA 1L82A 1CV1A 1L0KA 1L49A 188LA 1L79A 104LA 1L89A 1L71A 130LA 2OE4X 1L40A 2F47A 140LA 3VW7A 3F9LA 1L75A 1CUPA 2A4TA 2B74A 1L98A 241LA 2B7XA 1T8FA 1P46A 1ZWNA 257LA 3CDRA 103LA 1LYIA 1L47A 127LA 1C66A 261LA 3RUNA 1D3MA 256LA 3EMLA 4W56A 1LYFA 4W53A 4DKLA 1C62A 3G3WA 1C6PA 1CU5A 2B70A 232LA 1L23A 2CUUA 1JQUA 1PQJA 4I7SA 248LA 3CDOA 1G0KA 139LA 1L53A 1QTHA 112LA 108LA 198LA 158LA 165LA 3HDFA 3UONA 1ZYTA 4I7KA 1DYEA 3HWLA 1L95A 217LA 4K5YA 1DYCA 1CV3A 1C6EA 1QT3A 1QTZA 1XJUA 3HUQA 1L05A 1D3NA 1L09A 1L15A 1L81A 3HTBA 185LA 1PQKA 234LA 200LA 4YXAC 1L76A 109LA 3PDSA 239LA 4DJHA 1L33A 1C6JA 210LA 3SBBC 1DYBA 4W51A 1L65A 1LI2A 6LZMA 197LA 262LA 173LA 3C83A 125LA 3GULA 1C6BA 1C63A 2OEAX 1CUQA 3HU8A 1L17A 1PQDA 4EJ4A 2NTGA 3HTGA 129LA 214LA 170LA 1L97A 3NY8A 3CDTA 247LA 145LA 2QARC 1QUOA 2ANVA 1L57A 1T8AA 3SB6A 149LA 1G0LA 107LA 2B6WA 3C7YA 3HT7A 4ARMA 155LA 176LA 1T97A 1B6IA 1CV6A 3LZMA 2RAYX 1L70A 1L58A 1K28A 1QS5A 231LA 4W54A 1C67A 4DAJA 118LA 1QT4A 2LCBA 1L86A 3HDEA 4LDLA 1KW5A 1ZURA 3CDQA 168LA 3SB8A 3HUAA 2OE7X 229LA 1L14A 2O4WA 1L30A 3G3XA 2RBNA 3FA0A 163LA 1QTCA 1XEPA 4ARPA 4EKRA 1LGXA 2RAZX 1CX6A 1G0GA 1C6MA 1QT8A 2RB0X 4PK0A 3OE0A 259LA 4YX7C 1L37A 1LPYA 152LA 123LA 4I7JA 3HT9A 206LA 4EPFA 1L62A 1DYGA 1L99A 1P37A 1P64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PRUA 2Z39A 1LZ9A 113LA 3A67Y 2HUKA 4ARMB 1OUGA 4B1AA 4MSTA 4AXTA 1RFPA 4HJYA 1LJNA 1P3NA 191LA 1FLQA 1BVKC 3WU7A 3WU8A 3HH5A 3LZ2A 1CKFA 1OWZA 5APFA 1LWKA 1P7SA 2H9KA 1C6LA 2Q0MX 1L91A 1LZ4A 1OUDA 4O34A 2EQLA 3LYOA 2MEIA 4I7LA 1L41A 3L2XA 1NQIA 2B5ZA 142LA 1OUJA 1GF6A 2O7AA 1LZTA 1P2LA 1QT6A 4E3UA 3A93A 4WOAA 1L08A 3N9EA 3ODUA 1L22A 2MEBA 194LA 3RZ4A 1XEJA 4HJVA 171LA 255LA 4GCEA 5I53A 5A3ZA 4WLYA 3OK0A 3TMXA 1D2WA 2B6XA 180LA 4TWSA 1LHIA 1L38A 1INUA 3HT8A 4LZTA 1VFBC 1LSDA 184LA 1WQQA 4XYYA 1DXJA 253LA 1L90A 5LIOA 1B7SA 199LA 1LW9A 1IC5Y 3DN3A 201LA 3DN4A 1YAPA 1CNSA 1IWYA 5E4PA 5I14A 2BQEA 1JTOL 3CT5A 1LJHA 2DKVA 4PJZA 4G4BA 4Z98A 2O79A 3GUKA 2Z6BA 1GFGA 1LZ1A 5LVIA 1UCOA 4H94A 1GF4A 260LA 1C68A 3RW8A 1TDYA 1TCYA 252LA 2C8OA 2Q9DA 1L07A 3GUPA 5KXKA 3AGIA 3OE9A 3TMWA 1DPWA 4WG1A 3CSZA 1B9OA 225LA 243LA 1LYDA 4NWHA 5KXOA 1C10A 1LZSA 4LYOA 4YM8A 186LA 1O23A 4DT3A 4ML7A 1OV7A 4G9SA 1IP7A 3DMZA 5E9RA 3DN1A 1QTDA 3P64A 1XJTA 2RBRA 1L42A 4XN6A 1V7TA 1JPOA 1ZV5L 1NDMC 4NGZA 1LMTA 1L88A 1OP9B 4XJBA 4LZMA 1IR7A 5LVJA 1C69A 3D3DA 1GFVA 4NHQA 4WM3A 1HSXA 5ILCA 3HBHA 2FBDA 2NWDX 3A90A 226LA 233LA 1L20A 4D9ZA 2FYCA 1LZ6A 5M1YA 3AZ4A 2HECA 2D6BA 1C45A 258LA 1BB3A 195LA 1L25A 2RBPA 161LA 174LA 3TXDA 3W6DA 1W08A 4ZIXA 1L39A 1IWXA 236LA 1REZA 2HEEA 1DPXA 1L27A 1B7MA 147LA 1L43A 4GBRB 183LA 3AZ7A 1LYOA 3C7WA 1B5ZA 4N0JA 2RB2X 1L87A 3MGWA 1G0QA 1L18A 2HEDA 1CJ6A 1CU6A 1GEVA 4CHXA 4BS7A 1L04A 1UIAA 3TXHA 1YILA 227LA 2DQIY 3P65A 4TTDA 1IY4A 1LLHA 1B5YA 1L44A 3HTFA 3WUNA 4H9IA 1B2KA 5KXWA 1DZBX 1C6DA 1JJ3A 4EKSA 2DQCY 3GUIA 1C6IA 1F10A 3AZ5A 4NHIA 4HTNA 2XBRA 235LA 1REYA 1YKXX 1C65A 2B6TA 2PC2A 3NYAA 1QSBA 1IR9A 3W3EA 3HH6A 205LA 1QT5A 3P4ZA 4LYTA 1LZNA 120LA 4EPIA 4ETAA 5DN5A 3FI5A 1L16A 2I6ZA 1GE4A 1LSAA 4DD9A 5LYMA 1UUZC 1QSAA 4GLAA 4I7MA 4YF2A 2G4PA 4E97A 5KKJA 1JKCA 159LA 1E8LA 1GDXA 1XFPL 1PS5A 3VWOA 188LA 2H9JA 2F30A 1L40A 3VW7A 2DBTA 2A4TA 1L98A 1XGQC 1P46A 1WVVA 1ZWNA 4NHSA 3T36A 4B4JA 1P2CC 5APDA 4H8YA 5B1GA 1LYFA 1KIRC 4H91A 4HP0A 3WUMA 2CUUA 2XQOA 1GFJA 248LA 4I7SA 4G4HA 3A91A 1UC0A 139LA 1CJ7A 3TXGA 4C5FA 1BB6A 4YENA 1DYCA 1QT3A 4WLXA 1A4VA 1LSFA 4NGKA 1GBZA 3WULA 1L05A 2MEDA 4CJ2A 3LYMA 185LA 1IR8A 200LA 3A92A 2BLYA 3ZVQA 3SBBC 3F6ZA 1LSZA 3LZTA 4DQ5A 4ETCA 2Z12A 197LA 2LYZA 3EO5A 125LA 1LMOA 5II3A 1CUQA 1LZDA 2EIZC 1JTTL 2FBBA 4EJ4A 2NTGA 1G7JC 4LFPA 1LYYA 5B05A 3AB6A 4HV2A 5ILFA 3CDTA 1RJCB 145LA 1GPQC 4NGVA 1L57A 1LYZA 5KKIA 3AW7A 1UIFA 149LA 2B6WA 2DQEY 3HT7A 4TSBA 4XJFA 1B6IA 3WPKA 1L58A 1K28A 1N4FA 4N1CC 1HC0A 5FELA 1WQRA 3EBAB 1QDRA 1ZURA 1AM7A 1LZEA 3HUAA 4J7VA 3OJPA 4KPMA 4NG8A 3WL2A 3HFMY 4N1EI 3WU9A 163LA 3AJNA 1LTMA 1GB5A 4NG1A 1CX6A 4OWBA 1C6MA 1GF9A 2RB0X 3B0KA 4PK0A 4YX7C 1DKJA 2YVBA 3AGGG 4L41A 3B0OA 3IWRA 4GCDA 3TXJA 1P64A 1OVKA 1P56A 4AGAA 3C80A 1ALCA 1GE2A 1XGPC 1EPYA 5C6IA 1QUSA 1KY0A 1FKVA 1LMQA 1KNIA 1Z55A 1VDTA 3P68A 1QUGA 4H9AA 2I25L 2OU0X 3DN6A 4GN4A 1L32A 192LA 4NIJA 1LZAA 3CDVA 2Y8PA 1CV4A 1G7MC 4ET9A 1LHKA 1PQIA 4R0FA 1GXV2 2ZQ3A 1C6FA 5KXMA 2X0AA 4G4CA 1GFTA 4WM1A 1QTVA 1EQ4A 3TXIA 5F81A 208LA 4H9BA 3SB5A 2ZYCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PRU A;  2Z39 A;  1LZ9 A;  113L A;  3A67 Y;  2HUK A;  4ARM B;  1OUG A;  4B1A A;  4MST A;  4AXT A;  1RFP A;  4HJY A;  1LJN A;  1P3N A;  191L A;  1FLQ A;  1BVK C;  3WU7 A;  3WU8 A;  3HH5 A;  3LZ2 A;  1CKF A;  1OWZ A;  5APF A;  1LWK A;  1P7S A;  2H9K A;  1C6L A;  2Q0M X;  1L91 A;  1LZ4 A;  1OUD A;  4O34 A;  2EQL A;  3LYO A;  2MEI A;  4I7L A;  1L41 A;  3L2X A;  1NQI A;  2B5Z A;  142L A;  1OUJ A;  1GF6 A;  2O7A A;  1LZT A;  1P2L A;  1QT6 A;  4E3U A;  3A93 A;  4WOA A;  1L08 A;  3N9E A;  3ODU A;  1L22 A;  2MEB A;  194L A;  3RZ4 A;  1XEJ A;  4HJV A;  171L A;  255L A;  4GCE A;  5I53 A;  5A3Z A;  4WLY A;  3OK0 A;  3TMX A;  1D2W A;  2B6X A;  180L A;  4TWS A;  1LHI A;  1L38 A;  1INU A;  3HT8 A;  4LZT A;  1VFB C;  1LSD A;  184L A;  1WQQ A;  4XYY A;  1DXJ A;  253L A;  1L90 A;  5LIO A;  1B7S A;  199L A;  1LW9 A;  1IC5 Y;  3DN3 A;  201L A;  3DN4 A;  1YAP A;  1CNS A;  1IWY A;  5E4P A;  5I14 A;  2BQE A;  1JTO L;  3CT5 A;  1LJH A;  2DKV A;  4PJZ A;  4G4B A;  4Z98 A;  2O79 A;  3GUK A;  2Z6B A;  1GFG A;  1LZ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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