255LA

Hydrolase
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKNTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title A relationship between protein stability and protein function.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1997-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 255lA00
1QUHA 1QT6A 210LA 1L40A 2RAZX 1L38A 4W56A 119LA 1L0JA 2B6ZA 1L67A 1L84A 2Q9EA 3SN6R 3V2WA 1ZYTA 3GUJA 258LA 2A4TA 1L16A 1L33A 3UONA 2O7AA 175LA 1QSQA 103LA 1G1VA 158LA 191LA 3CDRA 1CV1A 2HUKA 225LA 1L51A 1C63A 2OU0X 1P3NA 4W59A 3C7YA 2B72A 1LYGA 3OE9A 4ARLA 1L11A 1QTZA 163LA 4EKPA 3HUQA 4GBRB 149LA 4LDEA 171LA 1JQUA 232LA 1P6YA 236LA 1L03A 1L45A 1LLHA 129LA 213LA 3OE6A 215LA 1C64A 4ZPUA 1P36A 228LA 197LA 1L97A 131LA 195LA 3SB6A 1LYHA 3HTFA 169LA 252LA 1L08A 2B70A 1L14A 1LI2A 1QSBA 201LA 1L60A 2OTZX 4EPFA 4AQNA 1L22A 1L77A 227LA 1L42A 1P64A 3HDFA 3OE0A 2B6TA 1L59A 1G0KA 1L19A 3HT7A 3CDTA 4DJHA 1L18A 234LA 115LA 3CDVA 189LA 1L52A 1L00A 1CU5A 1L63A 1QUDA 2LCBA 1QUOA 1CV4A 3SB7A 186LA 4W53A 1L05A 1PQDA 1DYBA 1L32A 1QTCA 1G07A 1L76A 1L39A 1L37A 4I7OA 170LA 2OE9X 147LA 1C68A 1L04A 1L74A 3HDEA 1QUGA 1L30A 4EXMA 1LYDA 235LA 2LC9A 219LA 112LA 4S0WA 1P2RA 3GUNA 1L26A 164LA 113LA 2HUMA 1CX7A 143LA 1WTHA 261LA 2L78A 4LZMA 3RUNA 1P5CA 3RZEA 245LA 3DMVA 1ZURA 3DKEX 3G3WA 1QTBA 125LA 4I7QA 3HUKA 1LI3A 4LDLA 2RH1A 151LA 3DN2A 3JR6A 1QTVA 1XEPA 1OYUA 1CU3A 1CX6A 167LA 1QTHA 255LA 2RBPA 7LZMA 1I6SA 1K28A 248LA 205LA 1QTDA 4EPIA 1B6IA 220LA 3GUPA 1L47A 1G0QA 1L58A 230LA 2NTGA 1C6KA 172LA 1C6BA 1EPYA 1JTMA 1L50A 3K2RA 2OU8A 1L80A 1C67A 168LA 1XJUA 1LI6A 4W52A 254LA 1L46A 1KNIA 1LWKA 1KY1A 1L89A 1L95A 209LA 3HT6A 1L99A 3GUIA 237LA 3SB8A 3DMXA 2CUUA 3HT9A 3NYAA 1L41A 1QT5A 1L98A 152LA 1DYCA 242LA 1SSYA 196LA 3GULA 2F2QA 157LA 3DN1A 1G1WA 1L28A 126LA 114LA 3HWLA 4I7TA 4I7RA 165LA 1DYFA 1C62A 212LA 2RBQA 127LA 3ODUA 1L87A 1C6EA 1G06A 1L15A 1L56A 4YX7C 120LA 123LA 1L12A 1PQIA 142LA 3F8VA 1C6AA 3HUAA 1D2YA 148LE 3DN3A 140LA 1L90A 1P56A 3C80A 2HULA 1T97A 156LA 3GUOA 3HTBA 1G0LA 174LA 3D4SA 3L64A 139LA 3PBLA 1L72A 3LZMA 184LA 1OWZA 226LA 3GUMA 2RB1X 102LA 3OE8A 1L0KA 4W57A 1L43A 1C65A 1D9WA 251LA 1L49A 1PQOA 211LA 1L61A 173LA 1CU0A 1L35A 1SWZA 3C81A 1L31A 4YXAC 1CV0A 1L75A 1QS5A 1L48A 2ANXA 5LZMA 256LA 214LA 257LA 180LA 1D3MA 2RBOA 1DYEA 2RBNA 229LA 2RB2X 3DMZA 3L2XA 4I7PA 1L79A 1T8FA 200LA 1G0JA 1L17A 1ZWNA 1CTWA 3HH6A 247LA 104LA 1L68A 3QAKA 3FA0A 1L29A 1LW9A 2B74A 1PQKA 2B6WA 240LA 1C6GA 1L96A 1L70A 1L01A 161LA 2OEAX 1L65A 3F9LA 1CV5A 1C6TA 1C6MA 1QT4A 1P7SA 1G0MA 1LYJA 1L27A 2QB0B 3C8RA 4ARJA 199LA 1CV6A 130LA 221LA 4ARQB 1QS9A 185LA 190LA 2Z6BA 3EMLA 4I7LA 1D3NA 2RBRA 4LDOA 181LA 4EKSA 1L88A 1L36A 1NHBA 122LA 145LA 4YXCA 260LA 3CDOA 3SB9A 1XJTA 2B7XA 4I7SA 1LWGA 2IGCA 1SWYA 1L71A 1L55A 1CV3A 1C66A 144LA 1SX7A 4PJZA 1L86A 3SB5A 3CDQA 128LA 4PK0A 206LA 1C6PA 1C6FA 3HTDA 1LYFA 1CU6A 253LA 2B6XA 1OVJA 4ARMB 4IAPA 1KS3A 1QT8A 243LA 1D3FA 1KW7A 4W51A 1L13A 183LA 1DYGA 3C82A 1L34A 1L82A 178LA 1L54A 1L06A 160LA 1T6HA 107LA 231LA 3HT8A 4W54A 1L81A 2RB0X 109LA 1C60A 1T8AA 3C7WA 3C8SA 1C6CA 1L93A 246LA 1OV5A 1L09A 1L66A 3DNAA 1L07A 1L23A 155LA 2LZMA 4DKLA 176LA 3DN0A 4GRVA 1LPYA 6LZMA 224LA 1LGUA 1D2WA 1L21A 1QT7A 2OU9A 3C83A 2RAYX 3PDSA 4DAJA 3HH4A 1PQMA 166LA 1PQJA 1L92A 4ARPA 2OE4X 1C69A 1L64A 4OO9A 118LA 3HU8A 2B6YA 1L94A 1P46A 3DN6A 4I7NA 3C7ZA 1DYAA 1L44A 182LA 1L24A 110LA 1CU2A 1D3JA 244LA 4I7MA 162LA 1L57A 4I7KA 1SX2A 3C8QA 259LA 2OE7X 217LA 1L91A 1OVHA 137LA 1JTNA 1QT3A 3SBBC 4E97A 3HTGA 3G3XA 222LA 249LA 2B75A 238LA 2B73A 150LA 216LA 192LA 1L02A 1L53A 1L10A 3HU9A 4EKQA 1LYIA 2F32A 3DN8A 3G3VA 4K5YA 3NY8A 1C61A 1P37A 241LA 262LA 2Q9DA 111LA 1KY0A 1C6NA 1CVKA 4EKRA 1CUPA 4EJ4A 1SSWA 1C6DA 4ARQA 177LA 1C6QA 1G0PA 5I14A 250LA 1TLAA 1KW5A 1P2LA 1LYEA 1C6LA 2OTYX 239LA 3FADA 3HH3A 2ANVA 1DYDA 3GUKA 2RBSA 3FI5A 1L69A 1C6JA 3V2YA 188LA 187LA 2NTHA 3SBAA 1LGXA 3NY9A 1OV7A 1G0GA 3DN4A 4W55A 1OVKA 3HH5A 1C6IA 2F47A 1L83A 159LA 233LA 223LA 138LA 1L73A 1T8GA 2O4WA 1OWYA 4ARMA 108LA 1CUQA 218LA 198LA 146LA 141LA 1L25A 4I7JA 4W58A 1L20A 2QARC 1C6HA 1L85A 1L62A 3VW7A 2O79A 1LGWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QT6A 1IC7Y 5I4YA 2RAZX 1BQLY 1L38A 1REMA 4W56A 2F4AA 119LA 1IWYA 4CGEA 1L67A 1GB6A 2X0AA 1AZFA 3J4GA 3J6KA 4M4OA 3B6LA 2D4IA 4LGKA 1IO5A 175LA 103LA 1G1VA 3HBHA 1CV1A 4DWXA 1DZBX 2OU0X 3LZTA 4KXIA 3TXEA 3C7YA 1LMAA 1LYGA 4ARLA 154LA 4HPEA 1LZ1A 4NHPA 1BB5A 2ZYCA 3AJNA 4E3UA 1HSXA 1P6YA 4WM5A 1JKBA 3RNXA 1G7MC 4CHXA 1UIDA 3OJPA 1VATA 1C64A 1MELL 1L97A 195LA 1YIKA 1LYHA 4XJBA 1GAYA 1BVXA 4H9EA 1L08A 2MEBA 4H94A 2B70A 4RW2A 1L14A 1WQRA 1L60A 2ZIKA 2YBIA 3M18B 5C6JA 1L59A 4XYYA 1B5XA 2ZILA 3HT7A 5FDJA 3CDTA 234LA 2D4JA 189LA 4H9BA 5HMVA 5JENB 1GFGA 4YEMA 3AZ7A 1PQDA 4QDNA 1L76A 1L39A 1OP9B 2HU3A 4KL7A 2YSSC 1L30A 4EXMA 1IWUA 1LJ4A 2LC9A 3BKHA 1L26A 164LA 3ZVQB 1P5CA 3RZEA 2G4NA 4LYCA 125LA 4NHTA 1REXA 2GV0A 2DQJY 3JR6A 3ULRA 4LYTA 1GE2A 1GE1A 2DQDY 4PGJB 4HTQA 3TXKA 248LA 1QTDA 4EPIA 1B6IA 3WVXA 4IATA 4WM6A 1GFEA 230LA 2NTGA 4GLVA 172LA 1C6BA 1EPYA 5ILCA 3WU8A 1L80A 1C67A 2DBTA 168LA 1LI6A 1KNIA 2MEDA 1KY1A 1L95A 209LA 4PPOA 2EIZC 5LA8A 5DN5A 1WQPA 237LA 2VB1A 1L41A 2CGIA 1F6SA 2G4PA 4MR1A 208LA 1IR7A 3HWLA 1DYFA 1C62A 4ETAA 212LA 5F81A 1LJIA 1QTEA 1L87A 3T6UA 1FLYA 1LJKA 4G4CA 1LJJA 4HV1A 148LE 140LA 1L90A 3LYOA 3HTBA 1GHLA 2HECA 3A67Y 139LA 3M3UA 3WU7A 3GUMA 2RB1X 3OE8A 1L0KA 5LVGA 3SP3A 1B7MA 1XEIA 1TAYA 173LA 1CU0A 1L35A 4HJYA 4DD0A 1L31A 1J1PY 1HF4A 4LT1A 1UACY 1L75A 1L48A 3GXRA 2ANXA 256LA 257LA 1D3MA 1QSWA 1HMLA 2RBNA 2RB2X 4I7PA 5LYMA 1L79A 200LA 4TUNA 1CTWA 1GF7A 3CB7A 104LA 3QAKA 3FA0A 4WG1A 4R0FA 1B5UA 4LYMA 1PQKA 1LSAA 5KKIA 1LHIA 1L96A 1L70A 1KIRC 3A96A 1L65A 1C6TA 1YL1X 1NBZC 4H9AA 1LYJA 4NGLA 5ILFA 221LA 4IJ4A 4ARQB 1QS9A 190LA 2Z6BA 4ANRA 3A3RX 1T6VL 1D3NA 1IWXA 1NHBA 4LYZA 5F9XA 4H1PA 4YXCA 4NSHA 5LA5A 4ZIXA 1BWJA 1SX7A 4PJZA 1IP5A 1CU6A 4NGYA 1OVJA 3LYZA 5M1YA 1ZVHL 1D3FA 4W51A 1HHLA 1L34A 4AXTA 4H93A 1HC0A 4II8A 107LA 1LZEA 3HT8A 109LA 1T8AA 3C8SA 1UUZC 5LVKA 4ET9A 4H8ZA 1L09A 1SLYA 2PC2A 1L07A 1LCNA 176LA 1GB8A 1GB5A 1EQ5A 4LYOA 1LSDA 4OWHA 2AUBA 3AGIA 3PDSA 3HH4A 1IWTA 166LA 1HEMA 5LVJA 5KXOA 1IOCA 3A93A 4OO9A 118LA 3HU8A 4PRQA 3TXJA 1JISA 5A3ZA 1CU2A 244LA 1LYOA 4Z41A 1L57A 4I7KA 1HNLA 1HEPA 5LAGA 217LA 2BLXA 1GF4A 1OVHA 1QUSA 2YBNA 1FLWA 2BQKA 4BADA 2MEGA 1C08C 249LA 1UBZA 4N9RA 1RI8B 1RCMA 3DN8A 1IIZA 4OOTA 1XGUC 1MLCE 1QTKA 5LVHA 1GDWA 2ZNWY 1NWGA 4WOAA 2OTYX 4TSBA 2D4KA 1GBZA 2HEBA 5B06A 1GXV2 3WH1A 1LZ5A 1DPXA 4NGZA 1REZA 3HFMY 1ZMYL 3V2YA 188LA 5IHGA 187LA 1GBOA 2NTHA 3SBAA 1LGXA 3NY9A 1G0GA 1JUGA 1OVKA 4YM8A 4M6DA 1BB4A 1C6IA 4LFXA 223LA 233LA 1REYA 2N5ZA 1FKQA 1W08A 2BAAA 1IX0A 5J7CA 3TMXA 4NGOA 2QARC 1QIOA 5APEA 1C6HA 3VW7A 2O79A 1LGWA 1QUHA 4Z98A 1L40A 1GB0A 1RFPA 5DN4A 1B7RA 1GF0A 1L84A 2Q9EA 2Z2FA 1OUEA 3KAMA 2W1YA 3B0OA 3V2WA 3GUJA 1IWVA 258LA 1L16A 3E3DA 1IC5Y 9LYZA 3UONA 2LYZA 2W1LA 2O7AA 3HBEX 1LZ4A 1BB7A 4B0DA 2HUKA 1ZV5L 4WLDA 1L51A 4XADA 4R6CA 5HQ1A 5HLLA 1CJ7A 5KKJA 1L11A 163LA 4EKPA 4LDEA 232LA 236LA 3WUAA 4DD1A 1Z55A 1L45A 1LLHA 2DQIY 2F4GA 4KT3A 1D6QA 215LA 4ZPUA 1LJHA 1P36A 4I0CA 3VWOA 4NSIA 3HTFA 1LJEA 3AZ6A 3TXHA 4I8SA 1LHHA 3D3DA 1QSBA 1VFBC 4DD3A 5K7OA 2EQLA 2OTZX 2Q0MX 1KIQC 4AQNA 1VDQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QT6 A;  1IC7 Y;  5I4Y A;  2RAZ X;  1BQL Y;  1L38 A;  1REM A;  4W56 A;  2F4A A;  119L A;  1IWY A;  4CGE A;  1L67 A;  1GB6 A;  2X0A A;  1AZF A;  3J4G A;  3J6K A;  4M4O A;  3B6L A;  2D4I A;  4LGK A;  1IO5 A;  175L A;  103L A;  1G1V A;  3HBH A;  1CV1 A;  4DWX A;  1DZB X;  2OU0 X;  3LZT A;  4KXI A;  3TXE A;  3C7Y A;  1LMA A;  1LYG A;  4ARL A;  154L A;  4HPE A;  1LZ1 A;  4NHP A;  1BB5 A;  2ZYC A;  3AJN A;  4E3U A;  1HSX A;  1P6Y A;  4WM5 A;  1JKB A;  3RNX A;  1G7M C;  4CHX A;  1UID A;  3OJP A;  1VAT A;  1C64 A;  1MEL L;  1L97 A;  195L A;  1YIK A;  1LYH A;  4XJB A;  1GAY A;  1BVX A;  4H9E A;  1L08 A;  2MEB A;  4H94 A;  2B70 A;  4RW2 A;  1L14 A;  1WQR A;  1L60 A;  2ZIK A;  2YBI A;  3M18 B;  5C6J A;  1L59 A;  4XYY A;  1B5X A;  2ZIL A;  3HT7 A;  5FDJ A;  3CDT A;  234L A;  2D4J A;  189L A;  4H9B A;  5HMV A;  5JEN B;  1GFG A;  4YEM A;  3AZ7 A;  1PQD A;  4QDN A;  1L76 A;  1L39 A;  1OP9 B;  2HU3 A;  4KL7 A;  2YSS C;  1L30 A;  4EXM A;  1IWU A;  1LJ4 A;  2LC9 A;  3BKH A;  1L26 A;  164L A;  3ZVQ B;  1P5C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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