256LA

Bacteriophage t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEILRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title A mutant T4 lysozyme displays five different crystal conformations.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 256lA00
221LA 1L0KA 1CU2A 1LI6A 3HH3A 1G0QA 1G0JA 2RBRA 2LC9A 242LA 2RBNA 3GUJA 1L04A 1LGXA 3HTBA 4LZMA 1L24A 3HT9A 3D4SA 1L34A 1LYEA 4W57A 1T97A 1LYHA 175LA 4PJZA 1PQIA 120LA 3HUKA 140LA 1L63A 1L27A 1QSBA 1SSWA 3K2RA 4ARJA 2LZMA 3HT7A 1L32A 1L98A 2B6XA 1L02A 213LA 1L01A 1CX6A 1CVKA 3C83A 3G3WA 1G0PA 1L22A 205LA 1C60A 1L30A 4W59A 181LA 1P2LA 1L92A 2O79A 3SBAA 4W55A 1JQUA 1L69A 1OWZA 1SX2A 1OVJA 1L80A 2OU9A 2A4TA 138LA 127LA 3DMVA 1L76A 1LWGA 2O7AA 3SB5A 2OU0X 168LA 3DKEX 220LA 1L86A 3GUPA 4AQNA 4EKRA 2RBOA 1KY0A 1QT5A 1LWKA 3C81A 1L85A 232LA 1L20A 3JR6A 1G1WA 1CTWA 160LA 1D2YA 1CV0A 1L06A 1L66A 3C8QA 1OWYA 1P37A 4W53A 114LA 3GUNA 3QAKA 130LA 4W51A 5LZMA 3DN0A 4S0WA 1L47A 1L79A 1PQJA 260LA 200LA 217LA 4YXCA 3C8SA 1C65A 173LA 1L62A 1L08A 1L49A 128LA 1L28A 104LA 4LDOA 198LA 1C66A 139LA 2B7XA 3L2XA 1P56A 1L87A 4I7PA 2IGCA 1C6MA 3SB6A 191LA 1L19A 1QS9A 1P7SA 195LA 3GUMA 1DYGA 1L70A 3HDFA 1PQMA 1QT7A 4ARQB 230LA 189LA 3SN6R 257LA 1QT3A 1LGUA 246LA 103LA 1L71A 1XEPA 3DMZA 1CV1A 3F8VA 2B72A 169LA 1L68A 4K5YA 1L07A 1QUHA 1L52A 129LA 4DJHA 2ANXA 1C6TA 3C80A 155LA 3HDEA 126LA 125LA 146LA 241LA 1LYFA 131LA 1L56A 255LA 143LA 1L16A 3ODUA 223LA 2QB0B 3DN3A 1OVKA 1QTHA 165LA 1DYBA 3HTDA 3HWLA 119LA 3HT6A 224LA 148LE 4W56A 3CDQA 2QARC 3VW7A 4I7LA 3PBLA 1L39A 147LA 6LZMA 1CUQA 1L09A 3HTGA 144LA 1C63A 107LA 1L15A 1L26A 1L60A 1L91A 182LA 1L33A 1SSYA 1L10A 1L88A 3SB9A 1L75A 4YX7C 1L38A 3CDOA 159LA 2F2QA 4IAPA 1JTNA 1PQOA 1LGWA 1LI3A 3HTFA 1C64A 3DN6A 4I7NA 1LYDA 1LYIA 3GULA 1L93A 196LA 1L58A 1ZWNA 4EJ4A 1L43A 2B74A 2RAZX 1L23A 215LA 237LA 1D3FA 5I14A 1QT8A 4DAJA 3C82A 3CDRA 109LA 1L50A 1L37A 3SB7A 1EPYA 170LA 3G3VA 3L64A 1C6PA 253LA 3DN8A 1L65A 228LA 2Q9DA 235LA 3HU9A 256LA 1QSQA 2RB1X 1L53A 167LA 197LA 1ZYTA 4E97A 1C6GA 2NTHA 1G06A 1DYDA 2B6TA 2OU8A 1KY1A 1DYEA 1QS5A 1D3MA 190LA 239LA 113LA 123LA 1P2RA 1L90A 1L51A 3OE9A 4DKLA 1I6SA 1SWYA 158LA 1C6CA 2NTGA 1L44A 238LA 2F47A 2B6WA 3GUOA 184LA 2OE9X 3F9LA 1L41A 1C6BA 1L45A 166LA 1C6EA 1C6FA 2RBPA 3RZEA 1QUDA 240LA 174LA 3DN4A 251LA 1C6NA 1QT4A 1DYCA 1G0GA 1NHBA 1L57A 1KW7A 1L94A 2O4WA 111LA 1QT6A 162LA 3LZMA 1L25A 2F32A 102LA 229LA 1CUPA 178LA 1L54A 183LA 216LA 2HULA 4I7SA 1C6KA 250LA 2ANVA 1T6HA 2RBQA 4ARPA 1L46A 1SX7A 1T8GA 3FADA 4LDEA 231LA 4ARQA 177LA 7LZMA 4I7RA 3DN2A 1QUOA 1C6IA 1C68A 1LPYA 1L42A 185LA 3DMXA 1L64A 1OV7A 1SWZA 1XJTA 176LA 2Q9EA 1B6IA 1L67A 4I7KA 1G0LA 115LA 211LA 3PDSA 1L12A 3UONA 1KS3A 2LCBA 3GUIA 112LA 163LA 3SBBC 4ZPUA 3NY8A 1CU6A 161LA 2RH1A 1XJUA 212LA 4I7QA 219LA 192LA 1CV5A 1DYFA 1PQKA 243LA 254LA 4W58A 142LA 1L13A 1C6JA 187LA 2RB0X 141LA 244LA 261LA 137LA 1L81A 2B75A 1C6HA 180LA 1C62A 206LA 248LA 1L55A 1P64A 233LA 172LA 1T8AA 1P3NA 3HH6A 3HUQA 4W54A 156LA 1D3NA 2B70A 1CV4A 227LA 1L99A 1LYJA 1L35A 1D3JA 247LA 1L00A 1QTVA 3HT8A 4I7JA 3CDVA 152LA 4EKSA 4EXMA 1JTMA 2B6ZA 1L72A 3V2WA 4EKQA 4I7MA 1LLHA 1L95A 1KW5A 1L97A 150LA 110LA 3V2YA 1G0KA 4OO9A 1LYGA 1P6YA 2OE7X 1L36A 4W52A 222LA 226LA 1P46A 188LA 1DYAA 1L03A 1D2WA 209LA 1L77A 2OTYX 4EKPA 4EPIA 262LA 1CV3A 1QUGA 2HUMA 108LA 3DNAA 3HUAA 1CV6A 252LA 3HH5A 3C8RA 1C69A 3GUKA 2RAYX 118LA 1L17A 199LA 2RBSA 1L11A 3FA0A 1QTBA 1OVHA 145LA 1L89A 249LA 3G3XA 2RB2X 1L96A 258LA 1C6AA 1ZURA 1L82A 2B6YA 210LA 1LI2A 3OE6A 1L59A 1P36A 1C6QA 151LA 1C6LA 1OV5A 4GBRB 1L61A 164LA 1OYUA 2B73A 1C61A 214LA 201LA 3EMLA 1LW9A 1L48A 1C67A 3SB8A 1L74A 2HUKA 4YXAC 234LA 1L84A 259LA 1L31A 4I7TA 122LA 1G07A 225LA 3NYAA 3HU8A 2OE4X 171LA 1CU0A 2OTZX 3RUNA 1C6DA 157LA 1T8FA 4ARMB 1L29A 3C7YA 3NY9A 1D9WA 1PQDA 1CU3A 245LA 3C7WA 1CX7A 186LA 1L05A 3DN1A 1K28A 4I7OA 3OE8A 1P5CA 3CDTA 1G0MA 1L73A 3HH4A 218LA 1L21A 1L40A 4PK0A 2L78A 3OE0A 4ARMA 1QTCA 4GRVA 4LDLA 1KNIA 2CUUA 1L0JA 1L83A 1TLAA 3FI5A 2OEAX 3C7ZA 1L14A 2Z6BA 4ARLA 1QTZA 1WTHA 236LA 149LA 1L18A 4EPFA 1QTDA 1CU5A 1G1VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
221LA 1CU2A 1LSNA 1IX0A 1G0JA 1LGXA 3HTBA 1LJHA 4NSHA 1LYSA 6LYTA 1LSCA 1LZRA 3D4SA 1LJFA 5E9RA 1OQMA 1T97A 175LA 3WUNA 120LA 2BAAA 4WM3A 3HUKA 2BQKA 1L27A 2FYDA 2H9KA 4XJIA 3M18B 1L02A 1L01A 3GXKA 3WUAA 4NGWA 1CVKA 1DPWA 7LYZA 1QQYA 1L30A 4W59A 4H9FA 1NWGA 4KPMA 5F14A 4G4BA 1L69A 138LA 4Z98A 1L76A 3SB5A 220LA 3GUPA 4DD2A 2RBOA 4GCEA 1QT5A 3C81A 4NHTA 9LYZA 232LA 1L20A 1IP1A 3J6KA 4WM5A 3C8QA 1P37A 2ZYCA 3GUNA 1GHLA 130LA 4H9BA 4S0WA 1GF8A 1LHIA 3AZ4A 2DQAA 4WL6A 173LA 3N9EA 1L08A 1SQ2L 3EXDA 3L2XA 1B0DA 2IGCA 4N8ZA 1QS9A 1P7SA 4YEOA 3GUMA 1LZ8A 1L70A 5A3ZA 1LHLA 1WTMA 1QT7A 3TXJA 4ARQB 4XJBA 3AB6A 257LA 4UWNA 1LGUA 4LYBA 1XEPA 1L71A 2BQNA 2BQDA 1D0KA 3F8VA 2B72A 1L68A 1QUHA 2LZTA 1FLYA 4IATA 3HDEA 2HEDA 3LYMA 3QNGA 5L9JA 1LYFA 1L16A 223LA 2DQFC 2QB0B 1QTHA 1VFBC 3HT6A 4PPOA 2EQLA 224LA 2Z2FA 1OUAA 3CSZA 3RNXA 4ETBA 2F2NA 5LXWA 1XFPL 1LMPA 6LZMA 5IELA 4H92A 1CJ8A 3HTGA 5FEKA 1GB7A 3AZ5A 4J1AA 2LHMA 2XTHA 4R0FA 3A3QA 1L60A 5HMJA 1L75A 1L38A 1ZV5L 3CDOA 1YROA 4IAPA 1LI3A 4I7NA 4H9AA 1L58A 4B49A 2CDSA 3A6CY 4WLXA 4EJ4A 3B72A 1G7IC 1L43A 3TMXA 1D3FA 5I14A 1QT8A 1ZVYB 2W1LA 4RW1A 2ZNXY 1DPXA 5I54A 1QSAA 4GN3A 3A96A 2EPEA 2FBDA 2Y8PA 3G3VA 4NSIA 1C6PA 3WL2A 1F10A 5B59A 235LA 4ZIXA 4NWHA 4OWHA 167LA 2XBRA 4MCKA 2B6TA 1NKHA 1DYEA 1QS5A 2BQFA 1UIHA 190LA 1YKZX 1GE3A 1HEPA 3LZ2A 1MELL 1L51A 1OUCA 4DKLA 1ZVHL 4HTNA 4DYGA 238LA 1B9OA 2B6WA 184LA 1J1OY 1C6EA 2RBPA 4B4EA 1HERA 2BLXA 1KXYA 5LYTA 1QT4A 1KXXA 1L57A 1KW7A 1L94A 1REXA 2O4WA 1LJ4A 1QT6A 162LA 1UUZC 1GF5A 3FI7A 1IWTA 102LA 5KXYA 1CUPA 178LA 1GWDA 2HULA 4I7SA 1B7PA 1GB6A 1SX7A 1BWHA 5J7CA 4ARQA 177LA 3WW5A 1LKSA 1LPYA 3W6DA 1B5UA 185LA 1XJTA 1LSZA 1O23A 4GN4A 115LA 2YVBA 3PDSA 4WOAA 3UONA 3WXTA 4H9EA 2LCBA 5I4YA 3K3TA 4NGOA 4L41A 2WARA 5FDJA 2RH1A 4I7QA 3P66A 219LA 192LA 1J1XY 1IY3A 1TAYA 3FE0A 254LA 4PHIA 3WU9A 2HU1A 3N9AA 4N0JA 2RB0X 5JENB 4TTDA 1HEWA 137LA 1C7PA 1L55A 1YL0X 4XJFA 1D3NA 1CV4A 227LA 1L99A 4RLMA 1D3JA 3E3DA 4I7JA 5KXXA 4EKSA 4EXMA 1BQLY 1HFYA 1F6SA 1JTTL 1L72A 4I7MA 1L95A 1XGUC 150LA 1DQJC 110LA 3A94A 3V2YA 1LYGA 3TXEA 4W52A 222LA 3WU7A 4WM2A 4II8A 1QTEA 4EOFA 1P46A 1D2WA 2FBBA 3T36A 262LA 3HUAA 1YIKA 3HH5A 5LVJA 4WO6A 1GXV2 5APDA 1L11A 2A7FA 1RCMA 1QTBA 1VDQA 4DD7A 3MGWA 1JEFA 4XADA 2RB2X 4DD3A 3OK0A 4I0CA 1ZURA 4NIJA 1UICA 2DQHY 5KXKA 4OOTA 4HPEA 1FKQA 4NG1A 3P4ZA 1L48A 1XSFA 4M6DA 3HU8A 2OE4X 171LA 4NY5A 4WM6A 1W6ZA 1LZ1A 5KXSA 4ARMB 1L29A 5B1GA 1LMQA 4BS7A 3C7WA 4LYCA 186LA 1FLQA 4ML7A 1PS5A 1P5CA 1HSXA 1G7LC 5E4PA 5EBHA 5KJ9A 4WO9A 2X0AA 4PK0A 1LZ9A 1T6VL 1QDTA 2BQMA 193LA 4FJRA 1J1PY 1L18A 2EIZC 1SWYA 4ET8A 1DKJA 8LYZA 3HT9A 1LYEA 4W57A 2RSCA 1GFKA 3P65A 1YAOA 1UIFA 1XGTC 4H9HA 140LA 1QSBA 6LYZA 1LSBA 1SSWA 3ULRA 3K2RA 1B7RA 1LHKA 1LZTA 3HT7A 1L98A 3QE8A 213LA 1VDPA 1CX6A 3W3EA 3C83A 4PRUA 1G0PA 1BWJA 1P2CC 1NBZC 3WPKA 4J0LA 5KXWA 2G4QA 4J7VA 1L80A 1C46A 2C8PA 127LA 1G7MC 1IWXA 3D9AC 1TBYA 4LGKA 1L86A 4AQNA 1KY0A 1BB4A 3JR6A 1IR8A 1LSPA 1OUEA 1AT6A 1QUSA 4J1BA 3W6EA 1IY4A 4W51A 3DN0A 4LYMA 4WLYA 260LA 200LA 4GCFA 3AW6A 3CB7A 3AGHA 1LHMA 1L28A 1C66A 139LA 2B7XA 1G7HC 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1QUOA 4G49A 1C68A 2MEBA 1BB6A 4LZTA 2Q9EA 1OV7A 176LA 1GEVA 4HTKA 211LA 5I4WA 1L12A 3IWRA 1GBWA 2DKVA 3SBBC 1IP3A 1WQQA 3CT5A 1JKDA 4HJYA 3KAMA 3AZ7A 3ATOA 142LA 2Z12A 1L81A 1C6HA 180LA 3WVXA 2BQEA 2BQOA 1JUGA 3HUQA 156LA 1NHEA 2I25L 1L35A 2MEFA 1GFAA 3HT8A 1GDWA 2HECA 3CDVA 2MEHA 1GDXA 4MSTA 5II3A 4EKQA 2XBSA 5B05A 1L97A 1LJGA 2H9JA 2BQLA 1G0KA 3RZ4A 2ZILA 2F4AA 1IOSA 3B6LA 1DYAA 1L03A 4EPIA 1CV3A 2BQCA 2HUMA 3DNAA 4OWCA 3GUKA 1WVUA 199LA 2RBSA 145LA 3G3XA 5C6IA 4LT3A 2YDGA 3AZ6A 2B6YA 1LI2A 3OE6A 1L59A 4H8XA 1C6QA 151LA 1OV5A 4OWEA 1L61A 3TXKA 164LA 2HEEA 1GD6A 1I1ZA 1LMCA 201LA 2BQIA 3EMLA 1CKDA 5FHWA 1IORA 259LA 1L84A 4HP0A 3B0KA 3P68A 5DN4A 3RUNA 2MEAA 157LA 1IOCA 1BWIA 4LT2A 2MEEA 1D9WA 5DLAA 1IP5A 4N9RA 1CX7A 5B07A 3GXRA 3OE8A 4Z3MA 4UWVA 1GFRA 4M4OA 2LZ2A 4NGZA 1AZFA 2L78A 3OE0A 1LZEA 4HPIA 1L83A 1TLAA 2Z19A 3BKHA 2OEAX 3N9CA 1YAPA 1L14A 3J4GA 4ARLA 1QTZA 1FDLY 1WTHA 236LA 1UIEA 149LA 1CJ6A 1QSWA 1LCNA 134LA 1L0KA 2RBRA 242LA 1UIBA 2LYZA 5M1YA 1L24A 3P64A 3CT1A 1BB3A 3LYTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 221L A;  1CU2 A;  1LSN A;  1IX0 A;  1G0J A;  1LGX A;  3HTB A;  1LJH A;  4NSH A;  1LYS A;  6LYT A;  1LSC A;  1LZR A;  3D4S A;  1LJF A;  5E9R A;  1OQM A;  1T97 A;  175L A;  3WUN A;  120L A;  2BAA A;  4WM3 A;  3HUK A;  2BQK A;  1L27 A;  2FYD A;  2H9K A;  4XJI A;  3M18 B;  1L02 A;  1L01 A;  3GXK A;  3WUA A;  4NGW A;  1CVK A;  1DPW A;  7LYZ A;  1QQY A;  1L30 A;  4W59 A;  4H9F A;  1NWG A;  4KPM A;  5F14 A;  4G4B A;  1L69 A;  138L A;  4Z98 A;  1L76 A;  3SB5 A;  220L A;  3GUP A;  4DD2 A;  2RBO A;  4GCE A;  1QT5 A;  3C81 A;  4NHT A;  9LYZ A;  232L A;  1L20 A;  1IP1 A;  3J6K A;  4WM5 A;  3C8Q A;  1P37 A;  2ZYC A;  3GUN A;  1GHL A;  130L A;  4H9B A;  4S0W A;  1GF8 A;  1LHI A;  3AZ4 A;  2DQA A;  4WL6 A;  173L A;  3N9E A;  1L08 A;  1SQ2 L;  3EXD A;  3L2X A;  1B0D A;  2IGC A;  4N8Z A;  1QS9 A;  1P7S A;  4YEO A;  3GUM A;  1LZ8 A;  1L70 A;  5A3Z A;  1LHL A;  1WTM A;  1QT7 A;  3TXJ A;  4ARQ B;  4XJB A;  3AB6 A;  257L A;  4UWN A;  1LGU A;  4LYB A;  1XEP A;  1L71 A;  2BQN A;  2BQD A;  1D0K A;  3F8V A;  2B72 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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