256LA

Bacteriophage t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEILRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title A mutant T4 lysozyme displays five different crystal conformations.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 256lA00
103LA 109LA 1L25A 4K5YA 2O4WA 3CDRA 1QT3A 1C6DA 1SWZA 1P7SA 3DN2A 1L21A 3V2YA 1DYBA 1P56A 125LA 1L07A 1CV4A 1SSWA 4W51A 235LA 1PQMA 4EJ4A 3HT6A 2F47A 119LA 3G3WA 1L15A 224LA 1L14A 152LA 3G3VA 2L78A 2B74A 1L86A 1DYEA 3CDOA 4YX7C 2Z6BA 257LA 1QT5A 225LA 1CU6A 220LA 1L27A 3DN4A 146LA 1L29A 189LA 1B6IA 1LYHA 7LZMA 1SSYA 1L73A 211LA 2LZMA 2NTGA 191LA 1P46A 2F2QA 126LA 144LA 3DN1A 196LA 1QT4A 1L08A 3DN3A 1LI2A 1L67A 3L64A 2B6WA 1C6BA 3VW7A 1QTZA 2ANVA 3UONA 2IGCA 253LA 1T97A 1LYEA 2F32A 1PQJA 1L70A 226LA 1CX7A 1CU0A 1DYDA 2HULA 3DMZA 4I7LA 1CV1A 3ODUA 1L82A 1C6FA 3QAKA 1L94A 223LA 3C81A 1L71A 4I7OA 3G3XA 1L10A 173LA 3C7ZA 3HUKA 242LA 1CTWA 183LA 187LA 1L53A 170LA 3SN6R 1P3NA 1G0LA 197LA 4W58A 1L50A 6LZMA 177LA 1PQKA 139LA 2NTHA 1L09A 236LA 104LA 195LA 115LA 1D3JA 2RH1A 142LA 1C6HA 231LA 201LA 1LGXA 1L37A 1L66A 4EPIA 1C67A 1QSBA 3SB9A 222LA 260LA 1CX6A 3SB5A 150LA 1L01A 1L90A 127LA 172LA 1L17A 2HUKA 4ARQA 1L76A 1L38A 2OU9A 2Q9EA 1QUGA 1ZWNA 1L40A 2OTYX 3FI5A 206LA 112LA 1CUQA 2B6YA 1SX7A 1L79A 163LA 219LA 1L54A 4ZPUA 123LA 160LA 1G0KA 1QTDA 3HTGA 4ARMA 4I7PA 1OWYA 2B6XA 3FADA 114LA 182LA 1L81A 4LDLA 1QS9A 138LA 169LA 1L52A 1L19A 1LGWA 122LA 1QTHA 240LA 1KY1A 4W56A 1OWZA 4I7SA 1LPYA 228LA 2RAYX 1L26A 1L72A 252LA 3HT7A 168LA 159LA 3SB8A 1C61A 1CU3A 181LA 188LA 1C6MA 230LA 2B75A 1OVKA 1QS5A 3GUPA 256LA 162LA 1XJUA 1CU2A 244LA 1L93A 1L16A 200LA 3DMXA 1OVJA 3C8RA 216LA 113LA 2B70A 180LA 4OO9A 1G0MA 4W54A 1OV5A 1D9WA 2OE9X 2Q9DA 3HH3A 145LA 246LA 1LYDA 1D2WA 1L74A 3F8VA 5I14A 4DKLA 1CV3A 1L05A 3HDEA 259LA 3NY9A 1L60A 1I6SA 1L57A 1C6QA 213LA 149LA 143LA 4W57A 165LA 1L80A 4S0WA 3SB6A 130LA 1C6AA 3HUAA 1OVHA 1C60A 1KW5A 1L43A 3C8SA 4EPFA 185LA 158LA 164LA 4LDEA 1D3FA 3DMVA 3NYAA 1L91A 237LA 3RZEA 1C6EA 1L87A 1G0PA 4PJZA 1L63A 2A4TA 1L85A 1QTCA 1LI6A 4ARMB 218LA 4W53A 3C7YA 1DYFA 120LA 248LA 171LA 261LA 1L77A 2B6TA 2QB0B 3CDVA 1L89A 131LA 1L0KA 1L96A 1NHBA 3FA0A 4I7QA 1KW7A 4EKPA 192LA 1L13A 1LI3A 227LA 3HH5A 1LYGA 2OTZX 3HH6A 247LA 3OE6A 3HT9A 3HUQA 140LA 2HUMA 156LA 1L30A 1ZYTA 1L98A 2LC9A 3HTBA 4GRVA 3NY8A 250LA 1L49A 1C6CA 1L06A 3HTFA 3CDTA 1QSQA 3GUJA 1LWKA 4EKSA 1L92A 3DKEX 2LCBA 155LA 233LA 1OV7A 3C83A 107LA 3GUNA 1L62A 1G06A 3OE8A 1QT7A 212LA 3C7WA 1LYIA 1L0JA 3PBLA 3GUMA 3HWLA 1CU5A 1L88A 2RB0X 1C63A 1EPYA 1L00A 1D3MA 3RUNA 1T8AA 111LA 3CDQA 176LA 1WTHA 2OE4X 166LA 254LA 4ARLA 2B73A 2RBPA 1LW9A 1JTNA 1K28A 1KS3A 1L28A 3D4SA 3PDSA 1T6HA 1L69A 1L23A 3DN6A 1L20A 1L45A 1L58A 151LA 110LA 1L47A 1L95A 1P2RA 3LZMA 1XEPA 3EMLA 1L61A 1LWGA 3HT8A 1QUDA 234LA 1L64A 2B72A 118LA 1L55A 4YXCA 4DJHA 249LA 2OEAX 4I7NA 238LA 4YXAC 199LA 3SBBC 1L59A 1C64A 262LA 4IAPA 1PQIA 245LA 210LA 1L75A 1PQOA 4W52A 1SWYA 3OE9A 1ZURA 1L36A 4I7TA 3DN8A 186LA 3JR6A 184LA 2CUUA 243LA 1C65A 3GULA 1T8FA 157LA 3GUKA 1L03A 221LA 2RBNA 3SB7A 1OYUA 1DYAA 1G0GA 1P37A 190LA 2QARC 4GBRB 174LA 1L32A 255LA 1LYJA 1L56A 1L68A 147LA 4LDOA 3SBAA 205LA 5LZMA 4ARQB 1QT6A 1P6YA 3K2RA 1C6TA 2RBSA 3GUOA 1C68A 3HU9A 1L51A 2RB1X 4AQNA 4DAJA 4E97A 1C66A 3HU8A 2RBQA 4I7MA 209LA 3L2XA 2O7AA 1CUPA 1P5CA 2OU0X 1L35A 1G1VA 3V2WA 102LA 1L65A 3C8QA 2O79A 178LA 1C6NA 3DNAA 4I7RA 1L12A 1CVKA 1L11A 1G0JA 3DN0A 1L44A 2RBRA 2RB2X 241LA 3HH4A 2OU8A 3C82A 1LLHA 251LA 239LA 1KY0A 1L84A 1T8GA 137LA 1C6GA 141LA 4W55A 4I7KA 128LA 1C6PA 4LZMA 1C6IA 4EKQA 1G07A 1LYFA 2RBOA 3GUIA 1TLAA 1L31A 1QUHA 1CV5A 1C6JA 214LA 3C80A 1QT8A 1CV6A 1QUOA 108LA 1L24A 1L34A 1DYGA 1L22A 1P36A 2RAZX 1QTVA 1SX2A 217LA 215LA 4EXMA 3F9LA 1L18A 1L99A 4I7JA 4W59A 3HDFA 1L42A 1L39A 1L41A 161LA 1D2YA 1C6LA 1JTMA 1L83A 167LA 1LGUA 1L46A 4ARJA 1CV0A 1QTBA 1C69A 1G1WA 1JQUA 198LA 1D3NA 175LA 4PK0A 3OE0A 2ANXA 1L33A 1DYCA 3HTDA 4ARPA 1L48A 258LA 148LE 1L97A 1PQDA 232LA 2B7XA 4EKRA 1L02A 1P2LA 1P64A 1L04A 1C62A 1XJTA 1C6KA 1KNIA 2OE7X 1G0QA 229LA 2B6ZA 129LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
103LA 4WMGA 3CDRA 4PRUA 2BPUA 4DYGA 1LJIA 3DN2A 1DYBA 1P56A 125LA 3A92A 2LYMA 2XQOA 1DKKA 1GXV2 3N9EA 4GCEA 4ANRA 5ILCA 5LVKA 1QTEA 3HT6A 1D6PA 4ZFPA 4MR1A 4Z98A 1GEZA 4GN3A 3WU9A 1I1ZA 1JUGA 1IR9A 1G7JC 5KJ9A 1B6IA 1VAUA 4YENA 3TXHA 1LYHA 1LSAA 3J6KA 126LA 1L08A 1D6QA 1SQ2L 2D6BA 1TAYA 2BLYA 3L64A 3RNXA 1C6BA 3VW7A 1QTZA 3TXBA 253LA 1FBIX 1LZ9A 4H92A 154LA 1FKQA 4LYMA 3W6AA 1VATA 1B5YA 2Z38A 3AZ6A 1QDRA 1L94A 223LA 4HP0A 1L71A 3G3XA 2BQEA 1KXXA 4GN5C 4NHSA 1KIPC 1LYZA 1YAPA 1P3NA 3VWOA 6LZMA 1GB3A 5D5FA 1PQKA 1L09A 1NDGC 3B0KA 115LA 5APFA 1C6HA 4EPIA 1LHJA 3WUAA 3SB5A 1L01A 1L90A 3WULA 2W1MA 1LZYA 2BQGA 2OU9A 1QQYA 1GFRA 2ZYCA 1LZSA 1GE2A 2YBJA 1UACY 3LN2A 2MEHA 2B6YA 1IWWA 1SX7A 135LA 1L79A 219LA 1L54A 4LFPA 4NGLA 5DN5A 3RT5X 2A7FA 1CNSA 1IEEA 1GPQC 4NGVA 169LA 1L52A 3P66A 3W6FA 122LA 1QTHA 240LA 3WL2A 5LYMA 3TXDA 3TMWA 1LPYA 228LA 4DQ7A 5HNLA 1L72A 1HERA 132LA 1C61A 181LA 230LA 3A8ZA 1LPIA 1HC0A 1L93A 1VDSA 1OVJA 4OOOA 1IOQA 4GLVA 4AGAA 1LZTA 5LVGA 1D9WA 4XJBA 4DQ5A 145LA 1L74A 5APEA 3HDEA 259LA 1I6SA 2EQLA 2A7DA 1G7HC 1L80A 3HFMY 1IP2A 2NWDX 158LA 3SP3A 1GF4A 4W94A 1IWXA 4WG7A 1V7SA 1CKDA 1L63A 1L85A 4X3BA 3WPJA 1GAYA 4ETBA 4HJYA 2ZQ4A 1GFEA 4RW2A 3CDVA 3LYTA 4H9CA 4DD7A 2BAAA 3ZEKA 4PHIA 1I20A 1LMTA 1YL1X 1LI3A 1CKGA 3OE6A 4WG1A 1OQMA 156LA 3HTBA 1LHHA 250LA 4DDAA 1L06A 4NEBA 1GF7A 1A2YC 3A94A 1KIQC 5T3FA 1L62A 3C7WA 1WQRA 4WM2A 1B7NA 1L0JA 3HWLA 1WVUA 1J1XY 1B5WA 2IHLA 1XGTC 1IX0A 4WM4A 2B73A 2RBPA 1L28A 1L23A 1L20A 1L58A 4XN6A 4G9SA 1XEJA 1L47A 3LZMA 1LWGA 1QUDA 2LHMA 5D5CA 4C3WA 2BQJA 4DJHA 5E4PA 5KKJA 3A3QA 4IAPA 4AXTA 3AZ5A 134LA 4W52A 5KKIA 186LA 1IP4A 4N0JA 4OOTA 4TX7A 1T8FA 4M6DA 5L3HA 221LA 2GV0A 1JJ0A 3N9AA 4GBRB 1OUBA 1QUSA 2BQDA 1YROA 4IATA 1LSCA 4GLAA 4QEQA 3M18B 4ARQB 4NSHA 1QIOA 1HFYA 1LSMA 3HU9A 2RB1X 3ZVQA 1ZMYL 1LMNA 3CSQA 2I26L 2O7AA 4H93A 2OU0X 3FI7A 3KAMA 4B4EA 2O79A 3QNGA 4I7RA 2LYOA 2BQOA 5IHGA 4XYYA 251LA 1BGIA 4GCFA 4R0FA 1L84A 1T8GA 4W55A 1LJ3A 4I7KA 1Z55A 3WU7A 4LZMA 1DPXA 1C6IA 4EKQA 1GBSA 1QUHA 1RJCB 4DD2A 1IORA 1L34A 1DYGA 2Y8PA 1L22A 1P36A 3QE8A 1L42A 1LYYA 2W1LA 1L41A 161LA 1PS5A 1JTMA 1L46A 198LA 1GHLA 4B4IA 4PK0A 1UCOA 1GFHA 4TTDA 1OUEA 3ZVQB 232LA 1PQDA 1L02A 1P64A 5A3EA 1IOCA 3EXDA 1YILA 2I6ZA 1KNIA 2OE7X 4NSJA 1NWGA 1ZV5L 2B6ZA 1IWTA 1KXWA 4B1AA 1A4VA 1L25A 4K5YA 2O4WA 5DN4A 1QT3A 1LJHA 3WPLA 3WW6A 4D9ZA 2F2NA 5M1YA 3AYQA 4HJZA 1L07A 2PC2A 2FBDA 2DQAA 4TSBA 1UA6Y 4U3XB 235LA 4EJ4A 1LZAA 119LA 3W6BA 1L15A 4NHQA 152LA 3CDOA 2Z6BA 257LA 1QT5A 1MELL 3DN4A 146LA 1YKXX 1B7OA 1OUCA 7LZMA 1LZ4A 2EKSC 2LZMA 2NTGA 5LVIA 5LYTA 4H9AA 1LJ4A 1ALCA 3DN3A 4J1BA 1LI2A 1GBOA 2B6WA 4GCBA 1UIHA 2MEBA 1GB5A 2ANVA 4Z41A 2IGCA 4XENA 3ATNA 1LYEA 1IC4Y 1OUHA 1LZEA 226LA 2YBIA 2MEAA 2HULA 5L9JA 1EQEA 153LA 1L82A 2ZQ3A 2HECA 4I7OA 1L10A 5LVHA 242LA 1JTOL 4XJGA 5DL9A 1B5UA 1G0LA 1B7LA 177LA 4YM8A 2YDGA 1D3JA 1HEOA 2RH1A 4ETAA 2BQKA 231LA 2G4QA 4I0CA 1L37A 1CJ6A 1L66A 1C67A 1WQQA 260LA 150LA 1F0WA 5JENB 3WVYA 2BQFA 2H5ZA 4ZEEA 1L76A 1JHLA 2Q9EA 1LMOA 2DKVA 4PPOA 2OTYX 3CB7A 4H94A 4NSGA 4NSIA 1NHEA 5F14A 4B0DA 4NGYA 2CJLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 103L A;  4WMG A;  3CDR A;  4PRU A;  2BPU A;  4DYG A;  1LJI A;  3DN2 A;  1DYB A;  1P56 A;  125L A;  3A92 A;  2LYM A;  2XQO A;  1DKK A;  1GXV 2;  3N9E A;  4GCE A;  4ANR A;  5ILC A;  5LVK A;  1QTE A;  3HT6 A;  1D6P A;  4ZFP A;  4MR1 A;  4Z98 A;  1GEZ A;  4GN3 A;  3WU9 A;  1I1Z A;  1JUG A;  1IR9 A;  1G7J C;  5KJ9 A;  1B6I A;  1VAU A;  4YEN A;  3TXH A;  1LYH A;  1LSA A;  3J6K A;  126L A;  1L08 A;  1D6Q A;  1SQ2 L;  2D6B A;  1TAY A;  2BLY A;  3L64 A;  3RNX A;  1C6B A;  3VW7 A;  1QTZ A;  3TXB A;  253L A;  1FBI X;  1LZ9 A;  4H92 A;  154L A;  1FKQ A;  4LYM A;  3W6A A;  1VAT A;  1B5Y A;  2Z38 A;  3AZ6 A;  1QDR A;  1L94 A;  223L A;  4HP0 A;  1L71 A;  3G3X A;  2BQE A;  1KXX A;  4GN5 C;  4NHS A;  1KIP C;  1LYZ A;  1YAP A;  1P3N A;  3VWO A;  6LZM A;  1GB3 A;  5D5F A;  1PQK A;  1L09 A;  1NDG C;  3B0K A;  115L A;  5APF A;  1C6H A;  4EPI A;  1LHJ A;  3WUA A;  3SB5 A;  1L01 A;  1L90 A;  3WUL A;  2W1M A;  1LZY A;  2BQG A;  2OU9 A;  1QQY A;  1GFR A;  2ZYC A;  1LZS A;  1GE2 A;  2YBJ A;  1UAC Y;  3LN2 A;  2MEH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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