The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
GSCASCPNNCENGLCTNSCDFEDLLSNCESLKTSAGCKHELLKTKCQATCLCEDKIH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The cysteine-rich secretory protein domain of Tpx-1 is related to ion channel toxins and regulates ryanodine receptor Ca2+ signaling.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
6
|
| structure length |
57
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| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF08562 | Crisp | Crisp |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GIZ A; 1XTA A; 2DDB A; 2EPF A; 2CQ7 A; 2A05 A; 3MZ8 A; 1RC9 A; 1WVR A; 1XX5 A; 2DDA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3LSR A; 1YI2 I; 2OD5 A; 2ZB9 A; 2CYY A; 2E7X A; 3ZQ7 A; 1ETY A; 2EA2 A; 2MD5 A; 2ISZ A; 3M8F A; 3KE2 A; 3JSP A; 1YW7 A; 3QP6 A; 1G3S A; 2P7V B; 3H0D A; 1MBH A; 2O03 A; 3F3X A; 4A5M A; 3I4N J; 4MNU A; 4WXH A; 1X19 A; 2DFI A; 3DCF A; 4KDP A; 3GO5 A; 2DA3 A; 4YFK F; 2DT5 A; 3OR2 C; 1R23 A; 4E7H A; 4A3D J; 2R4G A; 4NC8 A; 4UB6 C; 3ESW B; 5BPI A; 4M6V A; 2A6H F; 3BWG A; 1F9N A; 1XG1 A; 4HZF A; 2JVH A; 3PO3 J; 1DU0 A; 4ZH4 F; 3HKZ A; 1Z21 A; 3LST A; 3C2H A; 2STT A; 3BLY A; 3BJ6 A; 3H1C A; 3FM5 A; 3LSJ A; 4N9H A; 3H5R A; 2VC0 A; 1V54 H; 2FSW A; 1IN7 A; 1OJL A; 1O57 A; 3QWL A; 1SFK A; 5IT9 Z; 3B02 A; 4RM3 A; 1TWA J; 3N4M A; 1IRF A; 1A04 A; 4LB6 B; 1FOW A; 5L3G A; 2M8G X; 2KRF A; 3BR1 A; 5GTI C; 1SEU A; 2GLO A; 2XSD C; 3H3V K; 1TWG J; 5EGO A; 4G7H F; 2WV0 A; 1X1C A; 3ZN1 A; 3PNV A; 1YLF A; 2HTJ A; 2D1V A; 3BG6 A; 1K7A A; 4N9I A; 2BVL A; 2QQB A; 2P0W A; 5FRO A; 5HOO A; 4M71 A; 5D5W B; 4IQJ A; 5D5X B; 5A2Q K; 2VPR A; 2H27 A; 2XHK A; 1O3S A; 2OTJ I; 1LFU P; 3BR5 A; 4EM0 B; 4UV9 A; 3M1C A; 2DPD A; 2V9V A; 2KP6 A; 3RQI A; 4HDV A; 1F4K A; 2WWY A; 3ASO H; 2WAD A; 3FWE A; 2X1C A; 2XIG A; 2ZBK A; 3EQL F; 3KYC B; 4DJA A; 3JSO A; 2JJ7 A; 4JBA A; 1V5F A; 3KZY A; 5JLX A; 3DKW A; 2XAF A; 3FMS A; 3RCO A; 3HHH A; 4A6D A; 1YG2 A; 2QKL B; 4DW6 A; 2NNY A; 4LG3 A; 3U1K A; 3G4S I; 2KJC A; 5LHI A; 2E35 A; 2XSJ C; 1W0U A; 2NAZ A; 2R7T A; 3L2Q A; 3G2B A; 2L02 A; 3MZH A; 2K9L A; 2PMU A; 3HTU A; 3J80 Z; 3G3Z A; 2GXB A; 3BTL A; 2L7K A; 5LGT A; 4OIN F; 4YIF A; 1P4W A; 1YE9 A; 1LFP A; 5E8I A; 1ULY A; 4HOB A; 4V2G A; 5M3F J; 1JT0 A; 3PL8 A; 2OUM A; 4XBF A; 4P55 A; 1KU9 A; 4E7L A; 1ODD A; 2UV1 A; 1ZH5 A; 3H9G A; 4BS9 A; 2IVM A; 3H35 A; 1IV8 A; 1MMG A; 3ZQQ A; 1R5G A; 2R7U A; 3GTJ J; 1V5G A; 1G59 A; 3P5J A; 1FOK A; 3CMM A; 4AM3 A; 1Z7U A; 3AL0 B; 3S14 J; 4M6Y A; 2X0L A; 4OAY A; 4LIU A; 2ZFU A; 4RS8 A; 3I0T A; 1K4S A; 4RGU A; 2OCE A; 5EJC A; 1Y39 A; 1K83 J; 3TQN A; 1XGS A; 4BHB A; 3SJM A; 4J01 A; 4DIQ A; 3L2U A; 3TO7 A; 3K4M A; 4DYQ A; 3ZMU A; 3V42 A; 3OYE A; 5FLX K; 5HNF A; 4A3L J; 4HST A; 3SZT A; 3FXM A; 3FMQ A; 2JMW A; 2OQR A; 5J1R A; 3WTY C; 4BEH B; 3WTV C; 2CSO A; 2BZT A; 3ZCO A; 4IOC F; 2VKV A; 2Y0S A; 4JX6 A; 1RRJ A; 4CHU A; 2RDP A; 4R8H A; 2ZME B; 4AIK A; 4BDZ A; 4A3G J; 2DOF A; 2K4J A; 2I5U A; 4KYW A; 1JUS A; 2LYC A; 3C2G A; 4IHS A; 2P8T A; 1AWC A; 2Q1Z B; 1GDT A; 3ZMV A; 1VI0 A; 2VBZ A; 2E1M C; 3SFI A; 4A2U A; 3FZV A; 1W36 C; 3I4M J; 2Z1D A; 4CUG A; 1T39 A; 2QEX I; 1XGO A; 4XLC A; 4ZYG A; 3NAR A; 2ZXI A; 2H1K A; 3TDU C; 2KLO A; 1B6A A; 1Y0N A; 2ECB A; 3ZMD A; 5F1R A; 3E6M A; 3N97 A; 2EFW A; 5AON A; 3GXO A; 2V26 A; 2H1L A; 3OIQ A; 2E7W A; 2K3P A; 1DDN A; 1N78 A; 5D4S A; 2LY1 A; 4Y17 A; 3J81 K; 4KIF A; 5JHU A; 2EB7 A; 5CVU A; 4UVB A; 1F43 A; 5GPA A; 3QAH A; 2CV0 A; 4B09 A; 4G9Y A; 1JGG A; 5AIP A; 4FCY A; 2LRE A; 4PGH A; 3TDZ C; 1YS6 A; 2XVC A; 3IUO A; 2DMU A; 3E6B A; 4XRM A; 1U5T B; 3WGH A; 2JZY A; 1B1B A; 3KP6 A; 4M73 A; 1ZRD A; 3IP4 B; 5LHH A; 3AG2 H; 3DF8 A; 2Y48 A; 1Z9C A; 2M5W A; 1K78 A; 2ECC A; 1V5E A; 2K02 A; 2XC7 A; 1ZR2 A; 4IXA A; 4BHP A; 3HEF A; 2GQQ A; 5IYD J; 3TGN A; 2VXD A; 4KIS A; 2L9R A; 1UHS A; 1Z3X A; 5D5U B; 2M4G A; 2JRM A; 2QWW A; 1GV2 A; 2A5W A; 2M7A A; 1LPQ A; 3E1S A; 1ETW A; 4FE7 A; 2ZJQ F; 2QBY A; 2QSG X; 4AD9 A; 1LNW A; 3TP0 A; 2DT6 A; 2ZCW A; 5D4R A; 1BOA A; 1VQ9 I; 4R1H A; 4S05 A; 2KDO A; 2JPB A; 2IA0 A; 1XTA A; 3TW6 A; 1FWZ A; 1E0E A; 5JHF A; 1U78 A; 4NQW A; 2XKP A; 1PUE E; 1BR2 A; 2NVT J; 3KFW X; 2BV6 A; 3L2C A; 1TZL A; 4HX8 A; 1J0R A; 1FYL A; 2EPF A; 3CUQ C; 1HST A; 1JKQ C; 5DCM B; 1O3R A; 2EFO A; 4D5F A; 1HW2 A; 4C2U A; 4CYC A; 1GUU A; 1GT0 C; 3KP2 A; 1ZGW A; 1ZN2 A; 1XB4 A; 2N8G A; 5E1W A; 2DYR H; 1IF1 A; 3DPU A; 4C30 A; 1SVM A; 2BBY A; 4A3B J; 2ZSH B; 3TOA A; 3OS2 A; 1R22 A; 3FXJ A; 4PJN A; 3FK6 A; 3JAM Z; 2VT2 A; 3H36 A; 1WI9 A; 4YII A; 4A0Z A; 3BR6 A; 2TCT A; 1IZ1 A; 1JHH A; 2UWM A; 4IRH A; 3CC2 I; 1UG2 A; 3AFH A; 1MH3 A; 3OMY A; 4RGX A; 1OCT C; 3GUD A; 1MGT A; 3PQK A; 4I02 A; 3GTO J; 4OOI A; 4A93 J; 2O5R A; 4LK1 F; 2CFO A; 2JSP A; 3DLL F; 2VBX A; 2VAS A; 2CUJ A; 2HOE A; 1RNL A; 2Y0M A; 4ENJ A; 4YEJ A; 2L7Z A; 2YR2 A; 2XPW A; 2DQL A; 1OQY A; 3BG9 A; 1IRZ A; 2GAU A; 3RPU D; 3S1Q J; 1OIS A; 3FXK A; 3RKX A; 1T56 A; 3VSK A; 2LKX A; 1HC8 A; 2Z16 A; 1SFX A; 2ACJ A; 1OLT A; 3W6K B; 1OKR A; 1RES A; 3HL2 A; 2EFN A; 4BL0 B; 5CVI A; 1MSF C; 4HV6 A; 3A0B C; 2VI6 A; 3KCC A; 1B59 A; 1GVJ A; 3WHB A; 3TL4 X; 3PJR A; 2DI3 A; 4N4O B; 5KCM A; 5FD6 A; 2FF4 A; 1U8R A; 2IJL A; 1IXC A; 5HLG A; 5E3L A; 2QYO A; 1JKP C; 1BW5 A; 5FLM J; 4C2M J; 3VYS B; 2LBF B; 2JWT A; 2X85 A; 3MWM A; 1MNM C; 1K61 A; 1SFE A; 3U21 A; 2VBW A; 4XLA A; 1U9O A; 1EV7 A; 2HDD A; 4OIP F; 2L2O A; 3T8T A; 1D1B A; 5L3C A; 1FSH A; 1HCR A; 3HUG A; 3JRF A; 4AWX B; 1YTY A; 4MQV A; 1ZKG A; 2A05 A; 1IXS B; 1QPI A; 1I6X A; 4CZC A; 3H3U A; 4UY8 I; 4P9U A; 3DTI A; 1SAX A; 2X6O A; 2DYS H; 2IAI A; 5J8C A; 4BNC A; 4L0Z B; 4HYE A; 2R93 J; 3CLO A; 1A35 A; 1ENH A; 2G7U A; 2VB6 A; 2HXO A; 1R5I D; 2CU7 A; 5IT3 A; 1XN7 A; 5FFZ A; 1YRN A; 1E17 A; 3FBN B; 2X1D A; 2M4K A; 1ON2 A; 2LMD A; 3QPL A; 1NG6 A; 4G6T B; 3RQ4 A; 4QPO A; 4XLH A; 1IN6 A; 3OR1 C; 2NS0 A; 2EZI A; 1FMV A; 1ON1 A; 3S3O A; 3LQR A; 5DS9 A; 4XRS G; 1JTX A; 2VPL A; 4M9S A; 1IJW C; 5F0H A; 3CCS I; 3NQO A; 2YUS A; 3OOP A; 1TNT A; 4XRS A; 2FU4 A; 1HDP A; 4KIG A; 4HQM A; 3WTS C; 4FET A; 5EYR A; 3WTX C; 2B9S A; 3K4L A; 2V6E A; 1YW9 A; 1BI0 A; 1VF9 A; 4XKB A; 3J7A Y; 4L9V A; 2CH0 A; 5F0C A; 1YFH A; 4KMU X; 1G3W A; 1B9M A; 1MJA A; 3A01 A; 2FOW A; 2RAE A; 1UHM A; 5IPA A; 3OS0 A; 1WJD A; 2VE8 A; 3I58 A; 1IUY A; 3HIF A; 1XCB A; 4C9Y A; 1YYV A; 2HEO A; 3CJQ B; 3U9G A; 4LGW A; 5DDG A; 2HQN A; 5FGM A; 1TBX A; 1E3O C; 3LSM A; 3F21 A; 1Z3Y A; 2V9K A; 4IHT A; 3LA7 A; 4XON A; 5LLQ A; 3ML6 A; 2ME0 A; 3FF5 A; 3KZI C; 1AOY A; 2K9N A; 3M4O J; 5CQG A; 2PBI A; 2XAH A; 2VKD A; 3S2H J; 2CQX A; 4HX4 A; 5C3E J; 2KIU A; 2HU9 A; 3MN2 A; 1HLV A; 1ZRC A; 2CWE A; 1J2X A; 2DK5 A; 3S2D J; 2VBY A; 3A4C A; 4BDY A; 1JJ6 C; 4Q48 A; 1J7K A; 5ICE A; 1B72 B; 4HF0 A; 4E6K G; 1BI2 A; 3S2W A; 2D1H A; 4B4C A; 1WGX A; 3QYB A; 2XAS A; 2HS5 A; 3G1O A; 3D5S C; 3FIS A; 4XLE A; 2JA5 J; 1MSE C; 4EJV A; 2CGP A; 2LF8 A; 3Q0W A; 2BY3 A; 4XRF A; 5TIS C; 2UUZ A; 4KMF A; 3BRO A; 3EDP A; 3RKQ A; 1DGR M; 3DP7 A; 2VE9 A; 4Y13 A; 1SD5 A; 5LRS A; 1DP7 P; 3FX3 A; 2DN0 A; 2IGK A; 2OA4 A; 2JK3 A; 4HNT A; 1WQ2 A; 3HOW J; 3F9K A; 1G4D A; 2F4M B; 4BY1 J; 4MGR A; 2XAJ A; 4XKC A; 3BTC A; 1K6O A; 1D8K A; 4D0P A; 1UMQ A; 3IC7 A; 2YS9 A; 2JT1 A; 1XC5 A; 3GFM A; 1TTY A; 5GPC A; 2PMH A; 2CUF A; 5LEJ A; 4IRI A; 3I71 A; 1MJ9 A; 2Z9O A; 3H0G J; 5GAH J; 2BY0 A; 3W2A A; 3ZRG A; 4G7O F; 2RV8 A; 3MFK A; 2MH2 A; 3M8J A; 2HYJ A; 2PJR B; 1V4R A; 4CGZ A; 4V2F A; 1FOY A; 4UUS B; 2VJI A; 3CCU I; 2ISY A; 3CTA A; 3RYR A; 2FBH A; 4U87 A; 4GDF A; 1FYM A; 2I10 A; 5FKK A; 4FX4 A; 3ZMZ A; 4ASN A; 4Y3O A; 2GBY A; 3OYL A; 1W36 D; 1JUP A; 1W0T A; 4ESJ A; 4MHG A; 2L4A A; 4ZDP A; 1D5V A; 1FOX A; 3Q9S A; 1XDU A; 3IRR A; 3BPV A; 1FBS A; 4TV7 A; 2G0E A; 4ZYH A; 4MLO A; 4KN4 X; 4N0B A; 4QLC U; 1ITY A; 3HJE A; 3DQV C; 3LQQ A; 4BJ6 C; 3MEX A; 3ECO A; 3K4C A; 3K6G A; 4L18 B; 1LEB A; 4LG0 B; 3BZK A; 2FRH A; 1ZRF A; 2HVR A; 1PUF A; 1ZAR A; 2R3S A; 3D0S A; 3LSK A; 2K85 A; 2F5F A; 3I59 A; 4CIC A; 4LFU A; 5IP9 J; 1BC7 C; 4M74 A; 1WSU A; 1ORK A; 3CF5 F; 2WAE A; 1QHG A; 4IHW A; 3UKG A; 2VOP A; 4IJA A; 3BR2 A; 5M5X J; 4LLL A; 2KL4 A; 3E5Q A; 1FBU A; 2EIL H; 3C2B A; 5LGN A; 3HRM A; 4C2T A; 1R36 A; 5LFA A; 2ID6 A; 3WU0 A; 3I54 A; 1B8I A; 3RKW A; 4DYC A; 1BR4 A; 2VJ4 A; 4RMN A; 2KIS A; 2XUB A; 1IRX A; 2OJE D; 5IYB J; 1FY7 A; 1KYZ A; 5DD8 A; 5DV5 A; 4CA0 A; 3K4B A; 2OPT A; 3P9K A; 4GRI A; 3PSF A; 4AIJ A; 1P4X A; 3RPU A; 4IO9 F; 4BQA A; 1H88 C; 2XRN A; 3BG5 A; 2QZ8 A; 4MEX F; 4O3M A; 1WRJ A; 2L4M A; 1K79 A; 2BOL A; 5J6X A; 1I1G A; 2ZXJ A; 2J5P A; 4UB8 C; 3CME I; 3IHU A; 1D0Z A; 2XDV A; 3ZMT A; 3E5X A; 2LH9 A; 3TMO A; 3LA3 A; 3BZC A; 1IV6 A; 3Q3S A; 1ETO A; 3OSG A; 1OCP A; 3K10 A; 1MMD A; 5K7F A; 3M3Y J; 1YHQ I; 1XMX A; 3EUH A; 2V9P A; 2OCC H; 4HW0 A; 2DMN A; 1UAA A; 4UV8 A; 2DA6 A; 3WGG A; 1MDM B; 2V1D A; 1IN4 A; 2P7C B; 5EG0 A; 2DDB A; 5B66 C; 1EF4 A; 1HW5 A; 1G6N A; 3FXQ A; 3O3K A; 2KJB A; 3LAP A; 2HWV A; 1W7P D; 3L2W A; 1H8A C; 4XK4 A; 2CFX A; 1JT6 A; 2MYS A; 3MQ0 A; 3MZY A; 4RAZ A; 4FTH A; 2M8E A; 3S1R J; 2IA2 A; 4MIM A; 1XCV A; 2FNA A; 1XDS A; 4KT6 A; 3BY6 A; 3V8K A; 4F55 A; 1MH4 A; 3JR9 A; 2DA4 A; 3CC7 I; 3LFU A; 1BN5 A; 3HSE A; 3D5L A; 4BH9 A; 4HX7 A; 4A3I J; 2L7M P; 3RZD J; 1R6R A; 2KHM A; 1E3H A; 2ESH A; 2M30 A; 2X6Y A; 1D1C A; 2HNH A; 4GYI A; 2IA1 A; 1GHC A; 4A69 C; 3L00 A; 4M3D A; 4P5O A; 3DEE A; 4YFN F; 4BXX J; 5IT9 K; 2MLG A; 1FIA A; 2JA6 J; 2YPR A; 3BCB A; 4M9Z A; 3L9F A; 2L0K A; 4AYB N; 3J7Z I; 2KIM A; 5GP9 A; 1FTZ A; 4YG2 F; 1UEL B; 3CDH A; 2KRC A; 1W1W E; 5L3F A; 4L5E A; 4OAZ A; 1J9I A; 3HGY A; 3SQN A; 1BM9 A; 1WFX A; 4G6Q A; 4FX0 A; 3GZN B; 3GVA A; 1A6Q A; 1QZY A; 2WV1 A; 3PO2 J; 2LFB A; 5JR3 A; 4O5V A; 1O3Q A; 2HQ5 A; 1SMT A; 2ELH A; 4IOA F; 3BOQ A; 3HM5 A; 2ETH A; 2F4O B; 5M5Y J; 5CVV A; 2DCE A; 1NG7 A; 2E1C A; 2RNJ A; 2ZXW H; 3P9C A; 2Y75 A; 3R60 A; 2BYV E; 2A6T A; 4MFE A; 4RB2 C; 4EM1 A; 4B1R A; 1LDJ A; 1TT0 A; 3BR0 A; 3LFK A; 4XID A; 3FXR A; 4OMY A; 3ERE D; 2IP2 A; 2FQ4 A; 2LRD A; 4IEJ A; 2A61 A; 1Z05 A; 2UXN A; 2O0Y A; 1P6R A; 3ZN0 A; 2B63 J; 1D5Y A; 1O7F A; 1X1B A; 4PDK A; 2OTL I; 3S8P A; 3V7C A; 3IV5 A; 4IHY A; 3FDY A; 3J80 K; 3TED A; 2RRE A; 1LDD A; 1BOB A; 1KYW A; 3IH2 A; 3CQZ J; 5TRD A; 4A3F J; 4I2O A; 1HDD C; 2Y9Z A; 1ETK A; 1LEA A; 3FKI J; 3ZXS A; 2HOS A; 1PJR A; 2JUG A; 4XLP F; 2K9Q A; 4A0X A; 3GTG J; 3GTP J; 2X51 A; 3IH3 A; 3HOU J; 2EV5 A; 5CVR A; 2CW7 A; 3SDB A; 5F64 A; 4FQG A; 1P4A A; 2FNP A; 1OFC X; 4D1Q A; 3TKY A; 5TGT A; 3RJP A; 4FIS A; 4XNF A; 1DUX C; 2CW8 A; 1MD0 A; 3SXY A; 3E5U A; 1VZ0 A; 1XSD A; 3ZQF A; 5E17 F; 2UZK A; 3MVP A; 4NQW B; 2B0L A; 2GIZ A; 2E5N A; 4WXD A; 3G6E I; 1XD7 A; 3D1N I; 2JA8 J; 4I98 B; 2O8K A; 4LB5 A; 1KA8 A; 2X6W A; 2XAQ A; 2H8W A; 3C1D A; 3L2V A; 1REP C; 2NXN B; 1BIB A; 4EQQ A; 1Y1V J; 3FXO A; 3ELK A; 3CJR B; 4B3X A; 2DDA A; 1H9G A; 4XKV A; 3OWT A; 4PGG A; 4RB3 C; 3KYD B; 4ESF A; 4UXN A; 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