The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
AMATAVALYNFAGEQPGDLAFKKGDVITILKKSDSQNDWWTGRTNGKEGIFPANYVRVS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
3-D proteome of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical 41.8 kDa protein in SPO13-ARG4 intergenic regio
|
| molecule tags |
Protein binding
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
10
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9B A; 1Z9Z A; 1SSH A; 1UE9 A; 3REB B; 5L23 A; 2J06 A; 1CKA A; 1WXB A; 2A36 A; 2EPD A; 4LN2 A; 3VS1 A; 1K9A A; 2JTE A; 1U5S A; 1M3A A; 2L3Q A; 4ZNX A; 3FJ5 A; 3NMZ C; 1QLY A; 3VS2 A; 2DBM A; 2EYW A; 4RTW A; 1CKB A; 1YWO A; 2CDT A; 2O2O A; 2F2V A; 1NLP C; 2EKH A; 3SHW A; 1AEY A; 2DF6 A; 4GLM A; 4F17 A; 3NPF A; 2RQT A; 1E7O A; 2X3W D; 2OAW A; 1Y57 A; 4RTV A; 3RBB B; 4HXJ A; 1ZUK A; 1M3B A; 4J9F A; 4RTY A; 2J6O A; 1RLP C; 1K0S A; 1UEC A; 2LNH B; 3H41 A; 1ZBJ A; 2FEI A; 1QWE A; 2MCN A; 1GBQ A; 3VS6 A; 4RTX A; 1W1F A; 1LCK A; 1E6H A; 4OML A; 4D8D A; 2LJ1 A; 1SRL A; 1ZX6 A; 1YNZ A; 1FMK A; 1YCS B; 3EG1 A; 1PWT A; 3A98 A; 2W10 A; 3VS0 A; 4OMM A; 2LJ3 A; 3QWY A; 1RUW A; 2FPE A; 3I5S A; 2CRE A; 2CSQ A; 1PHT A; 2HDA A; 2MOX A; 2CH4 W; 1OPK A; 2EBP A; 1ZSG A; 1NEB A; 1TG0 A; 2VVK A; 2AZS A; 4F14 A; 1SPK A; 4JZ3 A; 4AFS C; 4J9H A; 1N5Z A; 2JMC A; 2KR3 A; 3ZL7 C; 4OMQ A; 1UTI A; 2IIM A; 2BZ8 A; 2LJ0 A; 4OMP A; 2KRO A; 4FSS A; 2VWF A; 2J05 A; 3U23 A; 1UJY A; 2ED0 A; 4E6R A; 2O31 A; 2NWM A; 1K4U S; 1IO6 A; 3PVQ A; 3TSW A; 2GNC A; 2AK5 A; 3VS4 A; 2YUQ A; 2DBK A; 1JEG A; 1H8K A; 1T3L A; 1UHC A; 2DM1 A; 3VS5 A; 1B07 A; 4CC2 A; 2NUZ A; 2PTK A; 2DRM A; 2DYB A; 2DX1 A; 1K0X A; 4J9G A; 1K76 A; 2B86 A; 2V1Q A; 1TUD A; 4HVV A; 4CC4 B; 1ABO A; 2K3B A; 3TSZ A; 1GBR A; 4A63 B; 2AKK A; 2JMA A; 1WIE A; 1TUC A; 1XOV A; 2GTO A; 1EFN A; 5IHK A; 1NG2 A; 1Z9Q A; 2CT4 A; 3RNJ A; 3NHN A; 1T3S A; 2A37 A; 4J9C A; 4EIK A; 3JV3 A; 1OEB A; 4JJB A; 4LE9 A; 5IHI A; 2KNB B; 4QT7 A; 3EHR A; 1AZG B; 1ZLM A; 2DJQ A; 2L2P A; 1X6G A; 4GBQ A; 1AWX A; 2JXB A; 5EC7 A; 2KBT A; 4AFQ C; 2DLP A; 2ECZ A; 1J3T A; 3H0I A; 1U06 A; 2JM8 A; 4RTZ A; 1AWO A; 2KGT A; 2DA9 A; 2FPD A; 1NYG A; 2DL7 A; 2W0Z A; 2YSQ A; 3SEM A; 2J7I A; 2JM9 A; 1AWJ A; 3LH5 A; 2DE0 X; 3CQT A; 2LX7 A; 2LMJ A; 2YUN A; 1RLQ C; 2D8H A; 2G6F X; 1H3H A; 1KFZ A; 1GCP A; 3PVL A; 1QCF A; 2KEA A; 4RTU A; 4HVW A; 4F16 A; 2XMF A; 2EGA A; 4Y92 A; 2K79 A; 1KIK A; 4X1V A; 4AG2 C; 1GCQ A; 1GL5 A; 1YWP A; 3EG2 A; 1M8M A; 1MV3 A; 1X2K A; 1JXM A; 1HJD A; 4D8K A; 1X2Q A; 2DNU A; 5IHN A; 4Z89 A; 3EG0 A; 1JQQ A; 1OOT A; 1UHF A; 2RMO A; 1AD5 A; 1NYF A; 4K11 A; 2DL3 A; 2RN8 A; 2EYY A; 4IIM A; 3M0S A; 2DRK A; 2EGC A; 2LZ6 B; 2YUP A; 1X43 A; 1VYU A; 2V1R A; 2O9V A; 1WXU A; 3UA6 A; 2D8J A; 2EW3 A; 1JXO A; 2OI3 A; 2KE9 A; 4LUE A; 2HEQ A; 4OMO A; 1PKT A; 1QKX A; 2RF0 A; 2ABL A; 1G2B A; 2AZV A; 2DMO A; 2RQR A; 4J9I A; 2YDL A; 2CUD A; 5IXB A; 2BZY A; 4RTT A; 1PRL C; 2JT4 A; 1VYV A; 2HBW A; 4CC3 A; 3THK A; 2DL8 A; 1MUZ A; 1QWF A; 2QDL A; 3EGU A; 2K9G A; 1CSK A; 1SHF A; 2EVR A; 2RQW A; 4JJD A; 4R0K A; 1G83 A; 1VA7 A; 2C0T A; 1JO8 A; 5FW9 A; 2SEM A; 2DL4 A; 4CC7 A; 3C0C A; 2CT3 A; 2GGR A; 2HCK A; 3H0F A; 4Z8A A; 1QKW A; 1K1Z A; 2ESW A; 2MIO A; 2ED1 A; 3REA B; 4ORZ A; 3IQL A; 1HSQ A; 1OV3 A; 2O88 A; 1SHG A; 1SRM A; 2LCS A; 1UGV A; 2L0A A; 3R6N A; 1BBZ A; 2F2X A; 1BB9 A; 3PE0 A; 1PRM C; 1ABQ A; 2RQU A; 2CSI A; 1GFD A; 4JJC A; 1UG1 A; 2AKL A; 1WYX A; 2LQN A; 2RPN A; 2HSP A; 3UAT A; 3VS7 A; 3EG3 A; 1X6B A; 2RQV A; 1UFF A; 2KT8 A; 2KYB A; 2LP5 A; 1X27 A; 2K6D A; 2P4R A; 1WI7 A; 4AFZ C; 2C0O A; 2J6K A; 3EHQ A; 2BTT A; 1KSW A; 1X69 A; 1W6X A; 3VRZ A; 1W70 A; 5I11 A; 2GTJ A; 1WDX A; 4LNP A; 2ENM A; 3TVT A; 1I0C A; 2EYX A; 2L3S A; 2O9S A; 1M3C A; 1PKS A; 2JS2 A; 4J9E A; 4WCI A; 3I5R A; 1B3Q A; 3QWX X; 4JZ4 A; 2K2M A; 2ROL A; 2KT1 A; 5IXF A; 1YN8 A; 1WFW A; 1VYT A; 1I07 A; 1JU5 C; 2FRW A; 2F2W A; 5HCK A; 2JW4 A; 2FG0 A; 2I0N A; 2CH4 A; 1AVZ C; 2DVJ A; 2DL5 A; 4AFU C; 3I9Q A; 2LQW A; 3ULR B; 5I22 A; 1BK2 A; 5FWB A; 3VS3 A; 2GQI A; 2H8H A; 1A0N B; 1OPL A; 3NGP A; 1Y0M A; 4KRT A; 1ARK A; 1NEG A; 4AG1 C; 4HVU A; 3UA7 A; 1WXT A; 2FPF A; 2X3X D; 2BZX A; 1KJW A; 2ROT A; 1PNJ A; 4J9D A; 2KXC A; 1RI9 A; 4DEX A; 1T0J A; 1GFC A; 1SEM A; 1NM7 A; 2VKN A; 5GJW B; 1HD3 A; 2M51 A; 1E6G A; 2KYM A; 3M0U A; 3GBQ A; 2KRM A; 4HCK A; 2FO0 A; 2PNI A; 4IIO A; 5ECA A; 2EYZ A; 5FWC A; 1UDL A; 1V1C A; 2PZ1 A; 2YT6 A; 3M0P A; 2A08 A; 1WX6 A; 1H92 A; 4RUG A; 1NLO C; 1T0H A; 2JS0 A; 2EQI A; 5GJV B; 3VRY A; 2KXD A; 4OMN A; 2GBQ A; 2OJ2 A; 1GRI A; 4Z88 A; 2EGE A; 1GCQ C; 3M0R A; 1AOJ A; 1WLP B; 2J6F A; 2DIL A; 4M4Z A; 1AWW A; 4JPB W; 2FRY A; 1I1J A; 1WA7 A; 1U3O A; 2KRS A; 2KRN A; 2YUO A; 3H0H A; 3M0Q A; 2E5K A; 1UJ0 A; 2L3P A; 2D0N A; 1M30 A; 3UF4 A; 1M27 C; 1FYN A; 1S1N A; 1ZUU A; 3M0T A; 2RNA A; 1YP5 A; 1UUE A; 2D1X A; 1AZE A; 3KFV A; 2K7A A; 2C0I A; 5IH2 A; 1MV0 B; 4LUD A; 2M0Y A; 4DEY A; 2SRC A; 3I35 A; 4ESR A; 1BU1 A; 3O5Z A; 2CUB A; 1ZUY A; 2A28 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KE2 A; 4J9B A; 3REB B; 5L23 A; 5CQY A; 4NL3 A; 1BCO A; 3E2U A; 4TVR A; 2K5L A; 2A36 A; 2EPD A; 3VS1 A; 1K9A A; 3I56 A; 4ZNX A; 1QLY A; 4FL6 A; 5KYU A; 3EH1 A; 2EYW A; 3CBM A; 1WJQ A; 5FRO A; 5C6S A; 4PJO C; 4M77 G; 1OYX A; 2O2O A; 2F2V A; 3INZ A; 3M9Q A; 3M53 A; 3GP8 A; 3CC4 Q; 3QUI A; 2QG9 B; 1AEY A; 4CI0 C; 4F17 A; 1B34 A; 4NS5 A; 1E7O A; 2X3W D; 2HQE A; 3EG9 B; 3MP1 A; 1Y57 A; 2EJF A; 4ZGJ B; 5GAN e; 5KYW B; 1M3B A; 3PFS A; 4J9F A; 4OGC A; 2VUB A; 4C92 F; 2J6O A; 3Q1J A; 2CP5 A; 2FZK B; 2WSF E; 1YJW Q; 2LNH B; 4M78 B; 2FEI A; 1QWE A; 2MCN A; 3V7S A; 3NTK A; 2A7Y A; 3CCJ Q; 4OML A; 3A5Z B; 2JOY A; 1D3B A; 3CCL A; 1FMK A; 1YCS B; 2IVW A; 4RCB A; 2W10 A; 3VS0 A; 2YRV A; 2QK0 A; 3GLX A; 5FU7 C; 4OMM A; 2X4J A; 1YJ9 T; 1PHT A; 2RJD A; 1RAA B; 1YHQ A; 4M77 C; 2CH4 W; 2EBP A; 1WQ7 A; 4EDU A; 2HD0 A; 2AZS A; 3V8L A; 3I56 T; 2CGH A; 5I21 A; 4J9H A; 2KR3 A; 5LJ3 j; 4OMQ A; 3CXC S; 2IIM A; 2X4X A; 2X9H A; 4FSS A; 9ATC B; 2JZ2 A; 4MZP A; 2QTV A; 1TWB A; 4E6R A; 3ME9 A; 3PVQ A; 2WAC A; 3TSW A; 5GAN 3; 3JB9 D; 1QCO A; 2V8I A; 2OTL A; 2EKO A; 3P8D A; 3VS5 A; 1ACM B; 1YJ9 Q; 1UGR B; 4CC2 A; 4DA4 A; 4C5G A; 2DX1 A; 3BDU A; 4J9G A; 2RD1 A; 1OX9 A; 2P84 A; 2MYS A; 4OB1 B; 2KK4 A; 1GBR A; 2DXT A; 4A63 B; 2AKK A; 1WIE A; 4GLK A; 1K8A R; 1X6O A; 1TUC A; 3CCL T; 1U1T A; 2DIG A; 3V8K A; 5IHK A; 1NG2 A; 3PIP A; 3FEO A; 3NHN A; 4J6W A; 1T3S A; 3RDV A; 3S6W A; 5GAN j; 3OYG A; 4EIK A; 1YI2 Q; 2RHY A; 3SB2 A; 1OEB A; 3UT1 A; 3EHR A; 3EAE A; 1ZLM A; 1X6G A; 2JXB A; 5EC7 A; 2KBT A; 1J3T A; 2ECZ A; 3H0I A; 2JM8 A; 4MDX A; 4RTZ A; 1AWO A; 2KGT A; 5FRN A; 2W0Z A; 2YSQ A; 3SEM A; 2J7I A; 2JM9 A; 2RK1 A; 3CQT A; 2DXU A; 5LJ3 f; 3L2R A; 2YUN A; 1ZQ1 A; 1H3H A; 1N27 A; 1QCF A; 5M9O A; 2OX7 A; 5LJ3 d; 2E70 A; 2XMF A; 1YIT Q; 3LX7 A; 4LDV A; 4F04 B; 1Y96 B; 1QP2 A; 3CCV Q; 2CZ1 B; 2D9T A; 1YWP A; 3CCL Q; 3EG2 A; 3RER A; 2CZ0 B; 2OTL T; 1X2K A; 4PFP A; 4D8K A; 2E41 A; 3SD4 A; 3JCM P; 1JQQ A; 1UHF A; 5L8R E; 5EG2 A; 4M7D C; 1YHQ Q; 3QYH B; 2QQR A; 1W2B S; 1YFN A; 2DER A; 4QW2 A; 3QDF A; 2VYT A; 2DRK A; 2EGC A; 2LZ6 B; 2YUP A; 2KAF A; 4M78 G; 4OGE A; 5FU6 B; 3UA6 A; 2D8J A; 3OBY A; 2EW3 A; 1JXO A; 3BDL A; 5GAN f; 1M90 R; 2KE9 A; 4C0D B; 1QKX A; 1TH7 A; 2AZV A; 2RQR A; 4M75 A; 5GAN d; 1AHJ B; 4C92 D; 4LDW A; 5A2Q E; 3JB9 I; 1LOJ A; 2HBW A; 4CC3 A; 4JRP A; 4R56 A; 1QWF A; 2LT4 A; 1P92 A; 3QPH A; 2K9G A; 3UPU A; 1SHF A; 3M56 A; 2OTL Q; 1VQ4 T; 2PQW A; 4JJD A; 4X9D A; 4KGZ B; 4WF2 A; 4L59 A; 4V2S A; 4CC7 A; 2QA4 A; 1K8A U; 3EGX A; 2CT3 A; 4E7H A; 2E12 A; 2HCK A; 4PJO E; 4L5G A; 1M8V A; 1XNI A; 2ESW A; 4BAC A; 2ZPG B; 5GAO r; 2K5I A; 2RB6 A; 3REA B; 5IT9 E; 3IQL A; 4MZM A; 5GAM g; 4E7I A; 2X4W A; 2O88 A; 1SHG A; 5IN1 A; 3JB9 G; 2LCS A; 1UGV A; 1HK9 A; 4VUB A; 2F2X A; 1VQL A; 3LW5 E; 1ABQ A; 3HTR A; 4JJC A; 1EX4 A; 1UG1 A; 2Y4X A; 1OU9 A; 1QVF A; 8ATC B; 3VS7 A; 3UAT A; 3CD6 A; 4KUI A; 2XD0 A; 2RQV A; 1UFF A; 1G5V A; 4XU2 A; 2PUK B; 1WI7 A; 1QVG A; 2LQK A; 1KSW A; 4JS5 A; 1X69 A; 4FT2 A; 2GTJ A; 4IKF A; 2LVM A; 4PJJ A; 3M55 A; 4F7U F; 4M77 A; 1KC8 R; 3VYG A; 2O9S A; 3X24 B; 1M3C A; 1PKS A; 2MAM A; 2YXY A; 2BE7 D; 3MEA A; 4WCI A; 3QWX X; 1QCN A; 2K2M A; 2Y90 A; 3QJ6 A; 3QZ9 B; 2MF2 A; 3CCR T; 4HT8 A; 2F2W A; 3MJX A; 3GNF B; 2QA4 T; 4XTX A; 2DK3 A; 3JCM W; 2DVJ A; 5GAO q; 2DKG A; 5DLQ E; 3I9Q A; 1FWZ A; 3HHT B; 2LQW A; 1M2O A; 4JRQ A; 2H8H A; 1M90 U; 1A0N B; 1RAH B; 5KYY A; 1N8R R; 4KRT A; 1NEG A; 4LXC A; 4AG1 C; 3UA7 A; 4RCC A; 4OVA A; 4BI8 B; 3CXC P; 2FPF A; 4JLG A; 4ZTJ A; 1JBM A; 1BIB A; 4UC4 A; 1VQL T; 2ROT A; 1I81 A; 4DEX A; 2KI7 A; 1NBE B; 3PMI A; 2QQB A; 3BY7 A; 3CD6 T; 1M1G A; 2F1L A; 5GJW B; 1SEM A; 1HD3 A; 2RHZ A; 2M51 A; 3RR6 A; 1E6G A; 1WHJ A; 3CME A; 5ECA A; 5FWC A; 2EYZ A; 3CPW S; 3HPW A; 1UDL A; 1LVK A; 2E6N A; 5LL6 S; 2A08 A; 1WX6 A; 1D1C A; 1H92 A; 1Q7Y R; 2EQI A; 5KYX B; 2KXD A; 4A54 A; 4OMN A; 1M4Z A; 2JN0 A; 2VXE A; 3ER0 A; 3SFM A; 3VU3 C; 1GCQ C; 1AOJ A; 2LRQ A; 2ZAE A; 4C92 G; 2DET A; 4BDY A; 4FYX B; 1RAG B; 2FRY A; 4PJO B; 2XDP A; 2BE9 B; 3H0H A; 4O5V A; 2EQM A; 1ZSZ A; 1UJ0 A; 1VQL Q; 1S1N A; 1FYN A; 5LJ5 d; 2RNA A; 1UUE A; 2D1X A; 2F5T X; 1XQH A; 5A0G A; 1Q81 U; 3TQ7 P; 4IUT A; 5IH2 A; 3OYE A; 4E7L A; 1M2V A; 2B8A A; 3X26 B; 1OU8 A; 3G1J A; 3I35 A; 4ESR A; 1ZUY A; 4OP0 A; 4M7D E; 5GMK h; 1RAF B; 2J06 A; 3OYA A; 2L89 A; 1NJI R; 2P4T A; 2YHT A; 4LN2 A; 3CME T; 2VGN A; 2VC8 A; 2ZPH B; 2L3Q A; 3FJ5 A; 3KBG A; 1PCX A; 4C92 C; 1N8R C; 4JRI A; 4PJN A; 2OAU A; 2R58 A; 1Y07 A; 2GFA A; 4OB2 B; 3EFO B; 3SHW A; 2DF6 A; 4GLM A; 1NPP A; 3NPF A; 2KY9 A; 1D0Z A; 2RH2 A; 4RTV A; 1IGU A; 3RBB B; 4E7K A; 1IRX A; 1WHG A; 2M9U A; 1VQO A; 4C8Q E; 3M54 A; 5C0M A; 1RAD B; 2G3R A; 1S72 A; 3H41 A; 1G8X A; 4XU1 A; 5I2M A; 3MKD A; 3MEV A; 1OUL A; 4RKU E; 3S3M A; 3QHS A; 4EMK C; 1Q7Y C; 3FDR A; 1K9M U; 4RTX A; 1W1F A; 1OI1 A; 4QQG A; 2F5K A; 2DVE A; 2LJ1 A; 3CME Q; 2K5F A; 1YNZ A; 5GAO p; 3EG1 A; 3RES A; 5CIU A; 1VQ8 A; 2KMT A; 4XTU A; 2FPE A; 2CRE A; 4IUV A; 4AMC A; 1XTD A; 3KXT A; 1JJ2 S; 3H6Z A; 1ZSG A; 2FZC B; 2WSC E; 1R8O B; 5GMK m; 3D7S B; 4JZ3 A; 4AFS C; 3JCM e; 1I8F A; 4HKE A; 2PUO B; 3M58 A; 4JLI A; 1QVG S; 1UTI A; 5CK9 A; 2BZ8 A; 2LJ0 A; 4B9X A; 2KRO A; 2XK0 A; 2A0F B; 1H64 1; 3UDC A; 2NWM A; 1MMA A; 4PKC C; 1K4U S; 2LC4 A; 3MEU A; 3VS4 A; 2WSE E; 3HFN A; 2DBK A; 1JEG A; 1UGP B; 4J5Y A; 1FMV A; 1UHC A; 2DM1 A; 5GAO l; 4A53 A; 1VQO T; 1NJI C; 5GMK i; 4KUD K; 2HL5 C; 1B07 A; 5J3B A; 3LGF A; 1S72 T; 1BI0 A; 2X35 A; 3CCS Q; 3G71 A; 1K0X A; 5CCA A; 4M7A E; 2FYK A; 1ABO A; 3SWN C; 2EYQ A; 2JMA A; 1RAI B; 2GTO A; 2I2L A; 2E1H A; 1VQ8 T; 4M7D B; 2CT4 A; 3RNJ A; 4NOY A; 3JSC A; 5HK3 A; 5GAN 5; 1OZ2 A; 1RAE B; 2E6Z A; 3GIB A; 4JJB A; 4LE9 A; 5IHI A; 1ZHI A; 2DJQ A; 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