The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
54
|
structure length |
54
|
Chain Sequence |
GAMEAIYAYEAQGDDEISIDPGDIITVIRGDDGSGWTYGECDGLKGLFPTSYCK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BZZ1 protein
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
14
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| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FO0 A; 2EKH A; 2KT1 A; 2DM1 A; 2CRE A; 1UTI A; 2C0I A; 2EVR A; 1OOT A; 1X6G A; 2HBW A; 1A0N B; 1SRM A; 2YUN A; 1WFW A; 1ZSG A; 3M0T A; 4ORZ A; 1FMK A; 2JMC A; 1VYV A; 1MV0 B; 3NHN A; 1AVZ C; 4CC2 A; 3KFV A; 1H92 A; 2JW4 A; 1QKX A; 4K11 A; 2EBP A; 3SEM A; 1U5S A; 4J9I A; 2RMO A; 2A28 A; 2KEA A; 1PKT A; 2DBM A; 1JQQ A; 3ULR B; 2LJ3 A; 3H0F A; 1VYU A; 1ABO A; 4GBQ A; 1CSK A; 3I9Q A; 2RQV A; 4IIO A; 2ECZ A; 1YNZ A; 2HSP A; 3EHQ A; 1HJD A; 3QWX X; 5IXB A; 2A36 A; 2DBK A; 3VS4 A; 5HCK A; 1PKS A; 1K4U S; 1SRL A; 5GJW B; 1ARK A; 2CDT A; 4ESR A; 1LCK A; 2KYM A; 2YUP A; 2OI3 A; 5IH2 A; 2DJQ A; 2L3Q A; 2DL7 A; 4R0K A; 5FWB A; 3EGU A; 2DLP A; 2LCS A; 3UF4 A; 2JS0 A; 1U06 A; 1SHF A; 2HCK A; 1V1C A; 1X27 A; 1X2Q A; 3EG3 A; 4D8D A; 3PVL A; 1AWW A; 2E5K A; 2YT6 A; 1AWX A; 2V1Q A; 4J9H A; 4JJD A; 1AZG B; 1M8M A; 4HVV A; 2BTT A; 1UJY A; 4RTU A; 2ED1 A; 2I0N A; 2BZY A; 1X2K A; 4IIM A; 1M27 C; 2CT3 A; 1I1J A; 4HXJ A; 2W0Z A; 1M3A A; 2ESW A; 2SRC A; 3FJ5 A; 4RTZ A; 2DL3 A; 2L0A A; 2O9V A; 2LQW A; 1JEG A; 4EIK A; 2RNA A; 2RN8 A; 1YCS B; 2X3X D; 2FRY A; 3VS1 A; 4AG2 C; 2JT4 A; 3TVT A; 2GTJ A; 4DEY A; 1GBQ A; 4Z8A A; 2DRK A; 2C0O A; 2KRS A; 2LZ6 B; 2GBQ A; 3TSW A; 1QKW A; 2O9S A; 2JM8 A; 3IQL A; 1X69 A; 1I07 A; 1WXT A; 4DEX A; 1PHT A; 1CKA A; 1UGV A; 1IO6 A; 1GCP A; 2RQR A; 1M3C A; 2F2W A; 1K0X A; 2YDL A; 1ZUY A; 3VS7 A; 3EG2 A; 2KYB A; 4OMO A; 1OPK A; 2A37 A; 1JO8 A; 4F17 A; 2GTO A; 1K1Z A; 2X3W D; 4CC4 B; 1WXB A; 1YN8 A; 2K7A A; 2EGE A; 1AOJ A; 3O5Z A; 2VVK A; 1SHG A; 2KE9 A; 2EYX A; 1PRL C; 5IHN A; 2C0T A; 1MV3 A; 3ZL7 C; 1AWO A; 4J9F A; 3RBB B; 4A63 B; 4AFQ C; 1E7O A; 1S1N A; 1UDL A; 1JXM A; 1WX6 A; 2EYW A; 4OMM A; 2EW3 A; 3I5S A; 1ZBJ A; 1W6X A; 1ZX6 A; 3VS3 A; 1GRI A; 2DL8 A; 3LH5 A; 2M51 A; 2W10 A; 2PTK A; 4RTY A; 4HVW A; 3H0H A; 1T0J A; 2DNU A; 2ROL A; 2EYY A; 2FEI A; 2CSQ A; 2GQI A; 1WDX A; 1PNJ A; 4CC7 A; 2B86 A; 1NYF A; 2L3S A; 2D8H A; 1K0S A; 1WIE A; 4J9D A; 4OMN A; 4OMP A; 2VWF A; 2O31 A; 2JM9 A; 2LMJ A; 2QDL A; 3H41 A; 2DA9 A; 1TUD A; 4HCK A; 2EYZ A; 1Y57 A; 2GNC A; 1KFZ A; 2RQT A; 1H8K A; 1YWP A; 4D8K A; 1WYX A; 2SEM A; 1UG1 A; 2O2O A; 2K2M A; 1GCQ A; 1NEB A; 1NM7 A; 4F16 A; 4LUE A; 3REA B; 2JTE A; 4RTT A; 1KSW A; 4WCI A; 1QLY A; 2MCN A; 2DVJ A; 1NYG A; 1NLP C; 2FPF A; 2MOX A; 2RQU A; 2K9G A; 1GBR A; 2J06 A; 1ZUU A; 4J9E A; 2ED0 A; 4J9G A; 4JZ3 A; 2YUQ A; 1B07 A; 3M0P A; 1WLP B; 1M3B A; 2M0Y A; 2KR3 A; 5GJV B; 1YWO A; 1KJW A; 1J3T A; 2F2V A; 3NMZ C; 2AK5 A; 4Y92 A; 3R6N A; 1BK2 A; 1E6H A; 3NPF A; 2G6F X; 4JJB A; 2VKN A; 3UA7 A; 2D0N A; 2ABL A; 2CH4 W; 1QCF A; 4QT7 A; 2EQI A; 1B3Q A; 1G83 A; 2KRN A; 2DL5 A; 2KXC A; 2OJ2 A; 4LE9 A; 3EG0 A; 1RLP C; 5ECA A; 1GCQ C; 2YUO A; 1HSQ A; 2DRM A; 2DL4 A; 1T3L A; 2J6O A; 1GFD A; 1Z9Z A; 3CQT A; 3PE0 A; 1WA7 A; 1QWE A; 4Z89 A; 1AWJ A; 1AD5 A; 1UHC A; 4CC3 A; 2LNH B; 4X1V A; 2NWM A; 1EFN A; 1BU1 A; 1N5Z A; 2KRO A; 4J9B A; 2FRW A; 4ZNX A; 1SSH A; 5EC7 A; 4E6R A; 5I22 A; 1PRM C; 1AZE A; 1UUE A; 3M0R A; 3REB B; 5I11 A; 2OAW A; 3VRY A; 2J05 A; 3M0S A; 2H8H A; 1RLQ C; 2CH4 A; 1W70 A; 1Y0M A; 4J9C A; 4KRT A; 1OPL A; 1WI7 A; 1ZLM A; 1SPK A; 3UA6 A; 4RTW A; 3VS0 A; 4AFU C; 5IXF A; 2D1X A; 2AZV A; 2ENM A; 2HEQ A; 2RPN A; 1VYT A; 2ROT A; 2JMA A; 2KBT A; 1RI9 A; 2AKL A; 2P4R A; 1QWF A; 1TG0 A; 2KXD A; 5IHI A; 2O88 A; 1SEM A; 2DF6 A; 4RTV A; 4Z88 A; 2F2X A; 2FPE A; 3VRZ A; 1K9A A; 2KGT A; 1MUZ A; 1E6G A; 3C0C A; 2LX7 A; 2L2P A; 2K6D A; 4AFZ C; 1T3S A; 4JJC A; 3VS6 A; 2AKK A; 1JU5 C; 2LQN A; 4JPB W; 1I0C A; 4AFS C; 2EGC A; 2J6F A; 4JZ4 A; 4F14 A; 1H3H A; 2AZS A; 5FW9 A; 1W1F A; 2IIM A; 3UAT A; 3THK A; 3PVQ A; 1UFF A; 3QWY A; 2LJ0 A; 1UEC A; 5IHK A; 2KRM A; 1X43 A; 1Z9Q A; 5FWC A; 1NLO C; 2CT4 A; 2HDA A; 2YSQ A; 2FPD A; 1AEY A; 3GBQ A; 2DIL A; 2JXB A; 3M0Q A; 1FYN A; 3JV3 A; 1YP5 A; 1RUW A; 2K79 A; 3EHR A; 2DE0 X; 3TSZ A; 3EG1 A; 2PNI A; 1CKB A; 2GGR A; 2CUB A; 2K3B A; 4AG1 C; 2V1R A; 1BB9 A; 1ZUK A; 2D8J A; 4LNP A; 1VA7 A; 3RNJ A; 1XOV A; 1OEB A; 3I35 A; 2DYB A; 3NGP A; 4RTX A; 1KIK A; 3VS2 A; 2JS2 A; 1OV3 A; 1UE9 A; 4RUG A; 1BBZ A; 1JXO A; 3SHW A; 2J6K A; 3H0I A; 1M30 A; 1TUC A; 2A08 A; 1K76 A; 1U3O A; 1UJ0 A; 4OML A; 2EPD A; 2MIO A; 2FG0 A; 1GL5 A; 1X6B A; 3A98 A; 1HD3 A; 2CSI A; 1PWT A; 4LN2 A; 1T0H A; 4OMQ A; 4GLM A; 2BZ8 A; 3I5R A; 1WXU A; 4M4Z A; 1NG2 A; 1ABQ A; 1NEG A; 4HVU A; 2L3P A; 2LJ1 A; 2LP5 A; 3M0U A; 2CUD A; 2PZ1 A; 3U23 A; 2BZX A; 1GFC A; 2DX1 A; 4FSS A; 2KT8 A; 1G2B A; 2RF0 A; 1UHF A; 2DMO A; 2RQW A; 2NUZ A; 2EGA A; 3VS5 A; 4LUD A; 2J7I A; 2KNB B; 5L23 A; 2XMF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FO0 A; 2DD4 A; 2EKH A; 3S3N A; 2D6F A; 4RCB A; 3RIR A; 1Q82 R; 2XI9 A; 1OYX A; 1X75 C; 1ZSG A; 2X9H A; 2JMC A; 1VYV A; 3ZBD A; 2LCL A; 1M90 U; 1H92 A; 3JCM g; 5KYX B; 3JCM e; 3CME T; 1M2V B; 1OZ2 A; 3SEM A; 1TU0 B; 4ELY C; 1JJ2 A; 2DBM A; 1RAB B; 5I2S A; 3HHT B; 2DXB A; 1M8V A; 1VYU A; 1ABO A; 1M2O A; 3OYJ A; 4N4I A; 1K8A R; 1EZZ B; 3I9Q A; 1YJW Q; 1YNZ A; 5KYY A; 5IXB A; 2RHI A; 5KE3 A; 2FL7 A; 2QG9 B; 3RKX A; 2HNI A; 1S72 Q; 1K4U S; 3CCV A; 5AYF A; 2F1L A; 2I2L A; 4M77 C; 1LCK A; 2KYM A; 2YUP A; 2OI3 A; 2L3Q A; 4M77 G; 3TCJ A; 3HFO A; 1VQ8 A; 2E1H A; 2E12 A; 3CD6 Q; 3MP1 A; 2QAS A; 2XID A; 2WAC A; 3ER0 A; 4XU2 A; 2CP5 A; 1IHW A; 3PVL A; 2F69 A; 3G6E A; 1AWW A; 1XTD A; 3HSB A; 4DA4 A; 2YT6 A; 1AWX A; 1UGR B; 2V1Q A; 1WJS A; 4J9H A; 2X4J A; 4FU6 A; 3UWN A; 3MKD A; 3N5B B; 5GAN 7; 1YJ9 A; 2E64 A; 3C95 A; 1M8M A; 4M75 F; 4C0G A; 1NE8 A; 4RTU A; 2ED1 A; 2I0N A; 2HMA A; 2OAU A; 2EQM A; 3PMI A; 2BZY A; 2KMT A; 2CP0 A; 3SD4 A; 2DFU A; 4B6M A; 2ZPI B; 3L2W A; 1YI2 T; 1WHH A; 2C06 A; 3VUB A; 4KUL A; 4R56 A; 2WSE E; 2SRC A; 3LLR A; 1I5L A; 1JEG A; 1I8F A; 4Z02 A; 2YXY A; 3RUX A; 4EIK A; 4M7A D; 2OX7 A; 4AG2 C; 1X01 A; 4DEY A; 1GBQ A; 2E41 A; 2C0O A; 3G71 Q; 2ZPB B; 4JJN K; 2O9S A; 2JM8 A; 1H64 1; 3CD6 A; 4C5G A; 2LNV A; 3CCS T; 3RR6 A; 4DEX A; 1PHT A; 4Y91 A; 2DK3 A; 4MML A; 1GCP A; 2RQR A; 3FC3 A; 3A1P A; 3M5A A; 2F2W A; 3TRE A; 1IGQ A; 5CQX A; 3VS7 A; 1OPK A; 4F17 A; 4A54 A; 3EH1 A; 1ZHI A; 2VXF A; 4XU0 A; 1TSF A; 2EJG A; 1FMW A; 1O75 A; 1WXB A; 1VQP A; 5IAY A; 2RD1 A; 3O5Z A; 4C8Q C; 1WHM A; 4C0D B; 1PRL C; 1WPY A; 4X9D A; 4M7A A; 5IHN A; 4C8Q G; 1AWO A; 3ZL7 C; 2FYK A; 2YHT A; 1N6A A; 1Y7X A; 3M9Q A; 2K4Y A; 3OYC A; 2L5Q A; 4A63 B; 4M75 E; 3QII A; 1S1N A; 3BE3 A; 4BI4 A; 3CXC P; 1WX6 A; 3BW1 A; 2ZAE A; 4PJO A; 3GNF B; 2EW3 A; 5DLQ E; 3I5S A; 2LQK A; 4MZP A; 4PLI A; 3CMA T; 4E7K A; 2PTK A; 4E7J A; 1YIT A; 4M78 C; 3HL8 A; 3CC4 T; 2DNU A; 2EYY A; 2GQI A; 2FZG B; 5J26 A; 4CC7 A; 3SB2 A; 4M78 G; 3C94 A; 5KE2 A; 3V7R A; 4OMP A; 2VWF A; 2QA4 Q; 1TWB A; 4OB3 B; 3OQ5 A; 5FU7 C; 1KK7 A; 1BKB A; 2DA9 A; 1TUD A; 5KYN A; 4HA8 A; 2LX9 A; 4MZM A; 1Y57 A; 4F7U A; 3CXC A; 1KFZ A; 3JCM V; 2RQT A; 1H8K A; 3OW2 S; 4D8K A; 1KC8 R; 1UG1 A; 2CZ7 B; 1MND A; 3CC2 Q; 1YHQ Q; 3I56 Q; 3DKM A; 4JRP A; 3REA B; 3RKW A; 1B34 B; 1D0X A; 1KSW A; 1NJI U; 2DXU A; 4WCI A; 3JB9 F; 3P8H A; 4MDW A; 2MCN A; 6AT1 B; 2DVJ A; 1BI1 A; 2FPF A; 1KQS S; 2K9G A; 3G4S A; 3V7C A; 3TEE A; 4J9G A; 5CQY A; 1B07 A; 1VQ6 A; 1WLP B; 2M0Y A; 2KR3 A; 2L3R A; 3OS1 A; 3HRU A; 4N0A A; 4B9W A; 5A0D A; 3A8O B; 3LWH A; 3R6N A; 4FCY A; 3QDF A; 3VJP A; 1SF9 A; 2G6F X; 2VKN A; 2VYT A; 2P0P A; 2ABL A; 2O4X A; 2E6Z A; 2E10 A; 2EQI A; 1B3Q A; 9ATC B; 1G83 A; 3CCR A; 1LVK A; 1VQN Q; 8ATC B; 2KXC A; 1RL2 A; 2OJ2 A; 1N8R C; 2H3E B; 3WVE B; 4J7I A; 5ECA A; 2YUO A; 1HSQ A; 1GFD A; 1WA7 A; 4BY6 C; 1UHC A; 2LNH B; 1YIJ Q; 4X1V A; 2MPX C; 1ZSZ C; 4ZN3 A; 3CPW P; 1YJN T; 2CKK A; 4RG8 A; 2DD5 A; 4LXC A; 1BU1 A; 1N5Z A; 1ACM B; 2FRW A; 4BUG A; 3CME A; 1SSH A; 2QTX A; 1WQ7 A; 2P84 A; 2X4Y A; 4MMK A; 3M0R A; 3REB B; 2OAW A; 3VKI A; 3A8G B; 4N4G A; 1RLQ C; 3X25 B; 3GOX A; 4J9C A; 4KRT A; 1ZLM A; 2DPP B; 2MMP A; 3UA6 A; 4RTW A; 4AFU C; 5IXF A; 2HEQ A; 2RPN A; 4OB1 B; 3V7S A; 2E3H A; 2CP2 A; 4DOV A; 4J6W A; 1OZ3 A; 5LJ3 f; 2LT1 A; 1QWF A; 2ZPE B; 1Q86 R; 2AT1 B; 4IUT A; 4L6V 5; 3X28 B; 3J81 E; 2DF6 A; 1N27 A; 2XHC A; 4BDY A; 2QXF A; 2LX7 A; 1EIF A; 5KYU B; 2YRC A; 3BDU A; 1T3S A; 1M90 C; 5GAN 2; 2H3J A; 1LOJ A; 3VV0 A; 2DZC A; 2EGC A; 3M55 A; 5FW9 A; 2XDB A; 2IIM A; 3EH2 A; 3UAT A; 1VQ7 T; 3THK A; 3X24 B; 2QDY B; 2QEX T; 1NLO C; 1RI0 A; 5LJ5 g; 5CAI A; 1MMN A; 2BE7 D; 2V26 A; 2YSQ A; 1TOV A; 1AEY A; 2GF7 A; 5KCH A; 4LD6 A; 3M0Q A; 1YI2 A; 5GAM j; 3WVD B; 2GQV A; 1KQS P; 3JV3 A; 4PJL A; 4PJN A; 1R0B G; 4XTV A; 2JTF A; 3CCM T; 2PNI A; 4IUU A; 2HKN A; 2GGR A; 5LJ3 e; 5GMK h; 1HK9 A; 1BB9 A; 4C8Q B; 2CS7 A; 1V29 B; 1XOV A; 2CGH A; 3I35 A; 5C0M A; 3PIO A; 3CCS A; 2RO0 A; 2E6N A; 1I81 A; 2VGM A; 1KQS A; 3TQ7 P; 1BBZ A; 3PGG A; 2F5T X; 2DTO A; 2JVV A; 1Q81 U; 1K76 A; 1W2B S; 1U3O A; 3RKY A; 2FG0 A; 4M78 B; 3A98 A; 3MEV A; 2E3I A; 2P4T A; 1YJW T; 2BZ8 A; 3I5R A; 4M4Z A; 4N4H A; 3OS2 A; 1NG2 A; 2QK0 A; 3OA6 A; 1ABQ A; 1IZ6 A; 1TH7 A; 3HKS A; 1QQJ A; 5FU7 B; 2LJ1 A; 3JRZ A; 3LW5 E; 5L8R E; 2DKG A; 1BI2 A; 1S72 T; 2BZX A; 1GFC A; 2L8D A; 2RF0 A; 2DMO A; 4Y28 E; 3BY7 A; 5L23 A; 3CMA A; 5FU6 C; 1H3Z A; 3CD6 T; 2KT1 A; 3CC4 A; 2DM1 A; 4QVZ A; 4M7A F; 4A4H A; 1UTI A; 2VB6 A; 3GNG A; 1SRM A; 3PFS A; 1AVZ C; 2RH2 A; 4PJO F; 5GAO n; 1BI0 A; 1QKX A; 4BD3 A; 2YLB A; 4XTY A; 3UT1 A; 1JQQ A; 1WQW A; 3ULR B; 2LJ3 A; 1M4Z A; 4UC4 A; 4XU1 A; 1FX7 A; 1CSK A; 1Q82 U; 2ECZ A; 2HSP A; 1HJD A; 3QWX X; 2A36 A; 4LDV A; 2KSS A; 3NTK A; 4C92 C; 4IKF A; 3G71 T; 1PKS A; 3MP6 A; 4WTO B; 4C92 G; 5GJW B; 2JN0 A; 2CDT A; 1ZA1 B; 2HL3 A; 1VQ5 Q; 5IH2 A; 2D9T A; 1ZSZ B; 5FWB A; 3EGU A; 3UDC A; 2LCS A; 2XKO C; 4CI0 C; 5GAN 4; 1U06 A; 2DZ9 A; 2HCK A; 2DIQ A; 2XIC A; 1K8A U; 3MO8 A; 5CCA A; 5FRN A; 3UPU A; 1X2Q A; 2ZCF B; 3EG3 A; 3HPW A; 2QQA A; 2KK4 A; 1OX9 A; 4JJD A; 1PD1 A; 4PFO A; 1RAF B; 4DBH A; 2LCC A; 5KYW A; 4R55 A; 1N9R A; 4M7A E; 2LQ8 A; 1Y96 B; 3O8V A; 3L2Z A; 3QBY A; 3E19 A; 4BDZ A; 2CP7 A; 1NJI C; 2Y4X A; 1D0Y A; 1X2K A; 4IIM A; 1YJN A; 1W2B P; 5GAM d; 4PJO E; 2W0Z A; 1UGP B; 3VU3 C; 3FJ5 A; 1QVG P; 4FIB A; 1YCS B; 3OS5 A; 1BI3 A; 3VS1 A; 4Z8A A; 2DRK A; 4EMK A; 4M7D C; 2LZ6 B; 1RAE B; 2DEU A; 4M7D G; 2AHJ B; 1I07 A; 1VIF A; 4KBM B; 1CKA A; 2QA4 T; 1W2B A; 1UGV A; 1IO6 A; 5GAO q; 5I2M A; 2MI6 A; 1K0X A; 1ZUY A; 2CP6 A; 4XTX A; 1JJ2 P; 3NFC A; 2HKQ B; 4M77 F; 3CC2 T; 1YHQ T; 4CC4 B; 3I56 T; 1YN8 A; 2FVU A; 2K7A A; 1D09 B; 4PFZ A; 1AOJ A; 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