2A3ZA

Ternary complex of the wh2 domain of wasp with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 120
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a3zA04
3BP8A 1V4TA 2HF4A 2NRHA 1XC3A 4FPAA 3FLCO 2OANA 3MN5A 3FZFA 4CD3A 3M1FA 3U9ZA 4MLEA 5EXWA 3EKSA 1WOQA 4JHDA 4GNIA 2UYTA 4K42A 3ZETB 1QQOA 4BRAA 1JCGA 3DXMB 4FL9A 5BPLA 2ZF5O 3MMVA 3CETA 4FWOA 3VGLA 1D4XA 1RDWX 1GLLO 2ZGYA 3ZETA 3G25A 4BVPA 3KZBA 4BRDA 3UKRB 5ADXA 3D7EO 1GLCG 1BA0A 3LDOA 4ISGA 3BEXA 1GLEG 5AQZA 3H3NO 4FWLA 4BROA 5AQLA 4CBUA 5AQIA 3BUZB 3AARA 3O1WA 3U8XA 3I33A 4IJAA 3SMSA 2CH5A 2NZTA 3QBXA 4B1XB 1NGBA 3QMLA 3QICA 2VYPA 5F0XA 2ZWHA 2FSKA 4M63C 5AQRA 1BUPA 3ZEUB 3CJCA 2E2PA 2FF3B 1K8KB 5JICA 1GLAG 3CJBA 2VCPA 4H0OA 5EVZA 3HBTA 4CZMA 5AQNA 4ISFA 1MA9B 4CD1A 3DXMA 3R6MA 4CZKA 2GWKA 4Y0WA 1NGGA 4CZGA 4YDUA 4WQ5A 1H1VA 3ID8A 3I8BA 3UKRA 1HKGA 2FSNA 4EHUA 4QS7A 3M6GA 4CZIA 1QZ6A 4A2AA 1GLFO 4BR2A 4XEIA 2CGLA 2VWBA 3GOIA 2A3ZA 3CJAA 3VENA 2D4WA 2GEMA 4FSVA 5AR0A 5AZIA 2F9TA 2Q31A 2P9IA 3D2FA 3C0BA 4JNEA 3FE1A 4BRKA 4BR7A 3CJ1A 3UE5A 3A5MC 3VERA 4EAHD 4H5RA 1RFQA 3D2EB 2A5XA 2P9PB 2QWMA 1SQKA 4A62A 4PL7A 3LDQA 3LM9A 1X3MA 2F9WA 1U2VA 2D1KA 1IG8A 4O5FA 3UKUB 3QDKA 3O8MA 3LDLA 3FFKB 4FWPA 4XH4A 3FZHA 4NO7A 1ZBSA 3O80A 1V4SA 1QZ5A 3WXLA 5FPEA 1HX1A 3CQYA 2V7ZA 1HJOA 4B1VA 1NWKA 1NGDA 3MN7A 3A5OC 3UKUA 4FWNA 1QQMA 4IO8A 5LY3A 4XH5A 2P9KB 3A8YA 2YI1A 3R9PA 4EIAA 4F9OA 4M7XA 5BPMA 2QXLA 3CJ7A 2GUPA 1DEJA 3AY9A 4BRGA 4B1YB 2AA4A 2ASMA 4BRLA 4K25A 1ATNA 3MN6A 1KXPA 3DAWA 2IVPA 3S41A 3VGKA 3U9DA 3LM2A 3LDNA 5AQWA 3H6EA 1WUAA 3EKUA 1BOTO 2V7YA 4PKHA 2ZGZA 2PBDA 4H0VB 3B8AX 3O1BA 2YCHA 1NMDA 5FPMA 3HSCA 5AQSA 4IWVA 3VEOA 4A61A 4CZHA 5AQPA 4H03B 4I6MA 4BC2A 5BPNA 2QWOA 3RSEB 3C7NB 1BA1A 5F2RA 5F1XA 5KQDA 1TYQB 3CI5A 4CZEA 2GELA 2QW9A 2YHYA 4JHDB 3UB5A 4BRIA 3ATVA 1NLVA 3TPQA 4RWTA 4DHYA 4BREA 5AQFA 4K41A 2W40A 4BGAA 3LDPA 1GLJO 3A0IX 4WQ5C 3H3OB 3WXKA 1BU6O 3GG4A 3AAPA 3LL3A 2P9NB 4AM7A 1P8ZA 1MWMA 2Q0UA 2J4RA 2V51B 5ADXH 4BRNA 4O8KA 5TKYA 2D0PA 4B1ZA 5EOYA 5KPTA 3CQXA 3MDQA 3C7NA 2Q2RA 3VEYA 1BG3A 2CH6A 2QWQA 1DKGD 5AZIB 2Q97A 4FOIA 1T6CA 4FPBA 1NGAA 1YAGA 5KPRA 2E2QA 1S22A 4J8FA 4WYBA 2HMPA 3L4IA 4BRPA 2FXUA 4BVOA 4BR0A 2D0OA 4BRCA 3F9MA 4BG9A 1TUUA 1MWKA 3VEXA 3O4WA 5LJVA 1NGJA 3ZX3A 5BREA 5BN8A 1LOTB 2QWPA 4BQZA 1ZXOA 2AP1A 4BRFA 1BO5O 4PKIA 3GDQA 2I7PA 5FPNA 1NGIA 4B1WB 1KAZA 3FZKA 1X9JA 2QWNA 4FWMA 1LCUA 5AQXA 1XQSC 3W0LA 2HF3A 3HZ6A 3O08A 1YUWA 3R8EA 3A5LC 3ZEUA 4CZFA 3EN9A 3HI0A 5AQOA 2I7NA 3ZX0A 1NM1A 2FF6A 3SMPA 2CGKA 3VEZA 4HWIA 3P4IA 2P9UB 2E2OA 5BRFA 3MCPA 3H46O 1E4FT 1JCFA 3ENHA 3CERA 2E88A 3GE1A 2NLXA 2Q36A 2Q1NA 1T6DA 3H45C 4BGBA 2QWLA 4H5NA 3ATUA 2P9IB 1T44A 4CBXA 2CGJA 4IJNA 5AFUH 2FSJA 5AQTA 5AQGA 4CJ7A 5AZJB 4H5VA 1NBWA 1HKCA 3VGMA 1U6ZA 4CZJA 2BTFA 3OHRA 4MO4A 4C23A 1U2VB 1JCEA 4BR4A 4GY2B 3EZWA 1RGIA 1MDUB 3KHYA 4JN4A 2E2NA 4B1UB 3DXKA 1GLDG 4BRMA 2YJFA 3A5NC 3QBWA 1HLUA 3SLCA 5JMVA 4B9QA 3H1VX 2A41A 2IIRA 4FOEA 3QB0A 2ASPA 3DJCA 5I9EB 3FZLA 3MK6A 1C0FA 1C0GA 4BR5A 1E4GT 4DQ8A 3WEEB 3J8AA 5BN9A 3ZX2A 1BWFO 1Q18A 4EHTA 1HPMA 2ITMA 5AQKA 4CI6A 2H3GX 5E84A 3HTVA 1HUXA 3BF3A 4RTFD 3WQUA 3FZMA 2A42A 1OKJA 2IVOA 2PAVA 3VEWA 3RSEA 2P9LA 1YXQA 4IZ9A 5AQJA 3ULEA 4PKGA 1EQYA 3O6WA 3H1QA 5E26A 1Z6RA 2E1ZA 3KVGA 2YJEA 3GBTA 1QHAA 2HOEA 5AFUA 3DXKB 5JLFA 3VEVA 1NGHA 4H0XB 1SAZA 5AQQA 4DCHA 4WQ4A 2KHOA 2FLOA 2DPNA 2BUPA 2E1YA 2QWRA 3SK3A 3ENOA 5KQ8A 1Y64A 4PL8A 4FWRA 4XH1A 4CZLA 5AQUA 1XUPO 3EO3A 4Z94A 5AQVA 4L3QA 3VF2A 4BC4A 3CIPA 5FPDA 1BDGA 3IFRA 2GTDA 3IMXA 3JXUA 4NB4A 4BC5A 4FWQA 3ULEB 1G99A 4IXCA 1Z05A 2P9SA 4JD2A 5AQMA 1CZAN 4BG8A 2EWSA 5AZJA 4FO0A 5BRHA 3D2EA 4AM6A 2E8AA 2GWJA 3BF1A 4WQ4C 1NGFA 3O5BA 1KAXA 5EX5A 5BR9A 2A6AA 2YHXA 4BRHA 1ESVA 4HTLA 4FWKA 1DGKN 3W3DA 3D2FB 2P9LB 3SJHA 3WUHA 1SZ2A 3VETA 2V52B 3FGUA 1X3NA 4CBWA 3QFPA 4YDUC 4K43A 1ATSA 2ASOA 3U4LA 1QQNA 4I6MB 2P9PA 5ELZA 5B8HA 1NGEA 1GLBG 3VOVA 4BRQA 1YVNA 5BRDA 2IVNA 1TUYA 3WEEA 3L6QA 3AAQA 4BQLA 3IUCA 3VPZA 2YHWA 1TYQA 2P9NA 3TU5A 3QFUA 4DB3A 2P9UA 1HKBA 4FWSA 4ISEA 1KAYA 1K8KA 5AQHA 3VF4A 3WQTA 4E1JA 4H0YB 3DWLA 1R59O 3M3ZA 1ATRA 2Q0RA 3VF6A 5CE3A 4H5WA 2A40A 1S3XA 3WT0A 4EFHA 5AQYA 3IDHA 4A2BA 4H5TA 2QM1A 5KPZA 4LC9B 4MLHA 3WXJA 4H0TB 3GL1A 5LJWA 3CJ9A 3MN9A 1NGCA 3CHWA 2P9SB 4H0PA 4JD2B 2WUSA 4RCHA 2W41A 5EY4A 3JS6A 4M7YA 1ZC6A 4JAXA 4QS8A 4QS9A 1J6ZA 4KBOA 4BR9A 3L0QA 3EL2A 1IJJA 2P9KA 3FR0A 5JLHA 3WXIA 3HM8A 2E20A 3VESA 4BC3A 4MO5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YT3A 1TAQA 4BEBA 4FPAA 3FLCO 1KVAA 3IS9A 4DTMA 3DOKA 1RILA 4O5BA 5M1FA 1WOQA 4V19S 3LANA 1VQ4N 5LMUK 2UYTA 4K42A 3EY1A 4LSLA 4E89A 1S5JA 2ZF5O 3L2VA 1VQNN 3MMVA 3E9LA 1XHXA 3ZETA 3LP3A 3CQ8A 3CCQN 3G25A 4BVPA 1BIZA 1ITGA 2FBVA 3P31A 4XIUA 1GLCG 4LF6K 1BA0A 4X64K 3V9WA 1J5OA 1GLEG 4OKJA 2NRZA 2X6SA 3I33A 4B9NA 4OGEA 3VMFB 3IAYA 2QEXN 3DLGA 1NGBA 2Y1JA 2P1JA 3QMLA 1ZBUA 4M3UA 2GX9A 4HUGA 5JICA 1FKOA 2FF3B 4DFMA 2F4VK 2GV9A 4E7LA 3CJBA 3OYBA 4CZMA 4MDAA 4CJPA 3LAKA 4CZKA 4Y0WA 1XI1A 4FM0A 3UKRA 5FDLA 4ID1A 4EHUA 2G8HA 2YX6A 3HRGA 3CCLN 1WNSA 3TAQA 3MXIA 2Q31A 4KV8A 3NFAA 3EEQA 1HYVA 3ZT3A 3FE1A 4BRKA 4BR7A 4C8OA 3VERA 1RFQA 3ENBA 3D2EB 2A5XA 1YJ9N 1YTAA 4CFCA 4A62A 1OH7A 1RBUA 3F9KA 1NNEA 4BDZA 4O5FA 3BGRA 3HYFA 3PX6A 3LDLA 3T3FA 1BISA 1NJXA 1ZBSA 5C10A 4DS4A 4GKKK 3K5LA 3TAMA 4B1VA 3PO4A 3MN7A 3J80O 3MXMA 3HK2A 1CXUA 4IO8A 4ILJA 3MEGA 3RVCA 4B3SK 3R9PA 1D9FA 3B6OA 1WSEA 2HMIA 3AY9A 1RDDA 4B1YB 5CZ1A 2BANA 4BRLA 4YOYA 2OTLN 1ATNA 4U67L 2WOMA 2DFEA 5CY4A 4DTSA 3S41A 1UWBA 3THYB 5TKWA 2RN2A 3LM2A 3K0SA 1SUQA 3H6EA 1WUAA 4PKHA 3L8BA 2PBDA 3OYEA 4H0VB 1NK5A 5GIOA 2NRTA 5AQPA 4I6MA 4Z4IA 2QWOA 4YOUA 4YOWA 3TANA 3CI5A 4CZEA 2FBTA 1REVA 5HROA 1JLCA 3OYAA 1NLVA 3TPQA 4LH5A 4RWTA 4F3TA 4MQ3A 4BGAA 3C6HA 3LDPA 1GOAA 1LWFA 4R79A 2F96A 3O9SA 3ZT0A 3SAHA 1T3VA 4DTOA 2VG7A 4WQ5C 2UUAK 4M41A 1IBKK 1P8ZA 1WBDA 3NF9A 2J4RA 5ADXH 1Z25A 1S1TA 1ASVA 2E5LK 4IFYA 4J2AA 5EOYA 1RBVA 4CEDA 4CF0A 3CQXA 3TR8A 3DM2A 3C7NA 3ZSRA 4WFNL 2UU9K 2CH6A 2HSTA 1DKGD 5AZIB 4FOIA 4B9SA 2O8BA 4KB1A 4FPBA 1YAGA 3Q7CA 1VRTA 1DLOA 4DR6K 1EKEA 2FXUA 3AVMA 2D0OA 1TUUA 5LJVA 5BN8A 2E6LA 1BO5O 3GDQA 4KAZA 2EX3A 2I7PA 5FPNA 3O3FA 3RWUA 4Z4GA 4JRQA 1X9JA 2QWNA 4FWMA 1BL3A 1XNQK 2BH1A 5FRNA 1YUWA 3KJVA 4CZFA 1JL1A 4KI4A 4KHPK 4W5NA 5AQOA 1ILYA 2OA8A 1NM1A 1L3TA 1HMVA 4KB0A 2KLAA 1J54A 1KLNA 4JI0K 1VSEA 5BRFA 3HJFA 3VTHA 1LWEA 1NJZA 3S5TA 1VSJA 3QO9A 4E1NA 4FLWA 2Q1NA 1HNXK 1T6DA 1W97L 3H45C 1HPZA 4CJRA 2KZMA 1RCHA 3AO3A 3AVLA 3QINA 5AQTA 2NUBA 5AZJB 2HHIA 3VQQA 4CZJA 4JI8K 5M1NA 1RGIA 3KHYA 4JN4A 2E2NA 4B1UB 4DG1A 5HRSA 2YJFA 5M1PA 2YHBA 3SUQA 2G8KA 1HLUA 4UQGA 3N4QA 1HJRA 5BR8K 1UA0A 3M5RA 5HRRA 4BE2A 3LZJA 2HHSA 5GAGP 4CHNA 2YNGA 5BN9A 4DSFA 4GVMA 5I3UA 3ZX2A 4EHTA 4HCBA 2H3GX 1Q9XA 3BF3A 5E41A 2P5GA 3NVKA 4EP4A 5C24A 2IVOA 3VEWA 3RSEA 4CFAA 3ULEA 4G1QA 4PKGA 5KRTA 1NJIO 1X1PA 4CEBA 3H1QA 3QESA 4IG0A 3KTQA 2E1ZA 3KVGA 2VG6A 5HRPA 2QA4N 3TAFA 3BZCA 3LP1A 4FCYA 3K5MA 4JK8A 2FLOA 1X9WA 2F8SA 1O1WA 2DPNA 5KQ8A 4PL8A 1XNRK 4CZLA 4GV3A 2UUCK 4FJ8A 2JGUA 4B9LA 5DK5A 4Z94A 3T1YK 3MWPA 1ZBIA 4BC4A 3PIOL 4JS4A 5FPDA 2DTUA 1UA1A 3LAMA 2GTDA 3K57A 3P39A 4FWQA 1A5XA 4X62K 1HNIA 4IXCA 4JD2A 2PY5A 1CZAN 1IH7A 2X78A 1N32K 3ZSQA 5AZJA 2G8FA 2ZQBA 2GWJA 1BI4B 3SQ0A 3CCEN 3KIOA 1KAXA 3VQ6A 4K0KK 3DRRA 1G15A 3THVA 3CPWM 4CGHA 1ESVA 1OH8A 3ZT1A 1WAFA 3C95A 3ITHA 3NHGA 1RTDA 3KD5E 3VETA 5JVGL 3DOLA 3J7AP 3NF8A 3BY5A 3QFPA 4CEQA 4DKWA 1KC8O 2WTUA 2ASOA 4FK2A 1QSLA 4M3XA 1QQNA 4CK2A 5B8HA 1NGEA 3O4NA 1JLGA 4FK0A 3WEEA 3L6QA 4BQLA 3MEDA 3LPUA 2PYJA 3SAFA 2YHWA 1RBSA 4FZZA 2P9NA 3TU5A 3QFUA 1HKBA 4ISEA 1NK7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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