2A3ZA

Ternary complex of the wh2 domain of wasp with actin-dnase i
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 120
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a3zA04
2E8AA 3LM2A 3QFPA 4FWOA 1Q18A 2IVOA 4IJAA 1ZBSA 1HKBA 3EN9A 1HKGA 3L0QA 3IFRA 1GLEG 4MO5A 2YJEA 2W41A 3O5BA 3WXJA 3D2FA 3JS6A 3IMXA 5AQYA 1JCGA 2EWSA 3ID8A 2QXLA 2PBDA 4PL8A 3R9PA 1YUWA 1GLBG 3UB5A 4PL7A 3I33A 1HLUA 3CQXA 2FSNA 2CH5A 2GUPA 3IUCA 4FWQA 5CE3A 4FPAA 3HBTA 1NGBA 2IVPA 3HSCA 1T6CA 4MO4A 3TPQA 1Y64A 1NGDA 3CJBA 5BRFA 4O5FA 1E4GT 4FWMA 4H0VB 3C7NB 1MDUB 1BU6O 4B1UB 1LCUA 4I6MA 4H0TB 2BTFA 4FWNA 4BRAA 3W3DA 1NGAA 3GBTA 3DXKA 4ISEA 2CGLA 3HI0A 4CZKA 1NMDA 2J4RA 4H5NA 4BC3A 4BR5A 1U2VA 4WQ5A 5AZJB 2ITMA 3VEYA 3QMLA 3ZX3A 3H3OB 3KZBA 4BRLA 4CBUA 5EOYA 5FPNA 1H1VA 3IDHA 4BREA 4JD2B 1GLDG 4A2AA 1U6ZA 1E4FT 4B1XB 4BRGA 3DWLA 3R6MA 5AFUH 1BUPA 2F9TA 3H45C 4H5TA 1HJOA 4CI6A 2AP1A 5EX5A 1T6DA 2QWPA 2QW9A 3WQTA 2YCHA 4FWSA 1HPMA 4CZLA 3A5MC 2D4WA 2FSKA 3VF2A 4BVPA 4BRPA 1YAGA 1Z05A 5F0XA 4HTLA 2V7YA 2VWBA 4DQ8A 4WYBA 2FLOA 4CZJA 1NM1A 2ZGZA 4CBWA 4E1JA 3CHWA 1XC3A 4BGBA 1QZ6A 1P8ZA 2A41A 2Q0UA 3DXKB 1ZXOA 2W40A 4CJ7A 2ASPA 3BUZB 1KAZA 2E1ZA 1U2VB 2QWQA 3MN7A 2P9UA 2OANA 3SJHA 4K41A 5BPNA 3EL2A 1J6ZA 3CQYA 2CGKA 4RTFD 1QQMA 3VPZA 3BF3A 3QFUA 1D4XA 4FWRA 4JN4A 1X3NA 4FPBA 2P9PA 4WQ4A 1RFQA 4QS9A 2VCPA 4IZ9A 2I7NA 2HF3A 2E2NA 1ATNA 5AZIA 3EKUA 3GG4A 3U9ZA 4DB3A 5AQSA 1C0GA 3KHYA 1SZ2A 3I8BA 4B1ZA 4A61A 4PKGA 3LDOA 2A6AA 1BOTO 3H1QA 1X9JA 5FPMA 3ZX2A 1TYQA 2YI1A 3VETA 2P9NB 3ZEUB 5JICA 3GDQA 4FWPA 2P9UB 3B8AX 3O8MA 4F9OA 2P9LB 4H0PA 3LDLA 4CD1A 1BG3A 2ZF5O 3L4IA 5BRDA 1CZAN 4JHDB 5AQIA 3D2EA 3F9MA 3GOIA 4CBXA 3FZLA 4IO8A 3O4WA 3A0IX 3LDQA 3DXMB 1GLCG 2YHWA 1IG8A 4EHTA 1QQNA 5LJWA 4BC5A 2NZTA 3VF6A 4FOEA 3WQUA 4J8FA 3A5OC 4BRIA 4EFHA 2F9WA 2QWMA 5JMVA 1C0FA 4BQLA 4H5WA 2GEMA 5AQNA 5FPDA 2ASOA 3KVGA 3ULEB 4IXCA 3S41A 3UKRA 5AQMA 4NO7A 3LM9A 2Q2RA 4K42A 4BQZA 2E2QA 4EHUA 5EVZA 4K25A 5AQQA 3CJ9A 4CD3A 2KHOA 5AQJA 3VGLA 4BR7A 3MDQA 4WQ5C 5AQVA 3FZHA 3CI5A 3CERA 1GLLO 5BN9A 5BN8A 3WUHA 4BRQA 2UYTA 3JXUA 3D2FB 3O1WA 2PAVA 1GLAG 4BR4A 1WOQA 5AQWA 4HWIA 2E20A 1GLJO 4DHYA 1BO5O 3VEZA 1NGIA 3GL1A 5AQHA 1NBWA 4PKIA 3D2EB 2D0PA 4AM7A 5F1XA 5B8HA 2P9SA 3CJAA 2GWKA 1OKJA 4BC4A 2V51B 5BPLA 3RSEA 3WXIA 3HTVA 4GY2B 4YDUA 4CZHA 1HUXA 4XH4A 5AQPA 2QWRA 4MLHA 5E84A 1NGFA 1XQSC 4NB4A 2IIRA 2YJFA 3AAPA 3MN6A 3MN9A 4I6MB 4CZFA 2ZWHA 1NGJA 5BR9A 1RDWX 4XH1A 3H46O 1BA0A 3CJ7A 5JLFA 1HKCA 4FO0A 1ZC6A 3A5NC 3VEOA 1K8KA 2H3GX 3BP8A 4FL9A 3CETA 3A5LC 3AY9A 3UKUA 3ZETA 1ESVA 2AA4A 1NGHA 3FR0A 4B9QA 5AQRA 2D1KA 2A3ZA 3WEEA 3MMVA 2YHXA 1ATRA 4WQ4C 4IJNA 2P9SB 4FSVA 1NGGA 3QBXA 1BWFO 1LOTB 1EQYA 2CGJA 1V4TA 2VYPA 3H3NO 1YVNA 3U9DA 3TU5A 4L3QA 5AQGA 5LY3A 5EY4A 4BROA 3CJ1A 5KQ8A 4BVOA 3HZ6A 3VERA 3D7EO 5KPZA 2E2OA 2E2PA 4PKHA 4BRKA 1JCEA 3LL3A 2Q31A 4MLEA 4H0OA 1MWMA 3SMPA 4Z94A 3H1VX 1ATSA 3FFKB 1G99A 2P9KA 3U8XA 4XH5A 1JCFA 1TUYA 5ADXA 4M63C 4O8KA 4RWTA 4BG8A 5E26A 1KAXA 4BRHA 5AQXA 4EIAA 3C7NA 5BRHA 5ADXH 4KBOA 4XEIA 3FZKA 2A5XA 3VF4A 1MWKA 2Q36A 5AQOA 2P9PB 3SLCA 4BRMA 5AQFA 1BDGA 3EZWA 3QBWA 4QS7A 3O1BA 3U4LA 5AZIB 4BC2A 2A40A 5AZJA 4B1VA 4BR9A 3VESA 1XUPO 5I9EB 4FWKA 3FZMA 4Y0WA 3GE1A 3WXKA 1YXQA 4CZEA 4JD2A 2IVNA 1MA9B 2P9IA 3BEXA 5AQTA 3M1FA 1S3XA 5TKYA 3UE5A 4CZMA 2ASMA 2GWJA 5JLHA 4H0YB 1TYQB 1HX1A 2P9KB 4BRDA 3VEXA 5KPRA 3QICA 3CJCA 4JAXA 2E1YA 2CH6A 4FWLA 4BRCA 3AAQA 2FF6A 1DGKN 2FSJA 2Q0RA 2QWLA 4FOIA 3ATUA 4K43A 4CZIA 5EXWA 1TUUA 3M6GA 3EO3A 1GLFO 4GNIA 4LC9B 3P4IA 5AQZA 1NGEA 3QB0A 4YDUC 3WXLA 3C0BA 1KAYA 3AARA 3LDPA 3O6WA 3G25A 5FPEA 5AFUA 3DJCA 3FLCO 1QZ5A 3VEWA 4QS8A 2P9IB 3DAWA 1BA1A 5AR0A 3UKRB 2HOEA 5KPTA 5LJVA 3VEVA 5KQDA 3ATVA 3FZFA 4A2BA 4EAHD 1RGIA 3O08A 4M7YA 1Z6RA 3R8EA 1NLVA 2WUSA 4BRFA 4H0XB 4BR2A 2HMPA 3MK6A 4JNEA 2QM1A 3ZX0A 2V7ZA 4DCHA 3OHRA 3ENOA 4H5VA 4BG9A 5BPMA 1V4SA 2BUPA 3FE1A 1T44A 2E88A 1S22A 4ISGA 1QQOA 2DPNA 3H6EA 3LDNA 3WT0A 2GTDA 3SMSA 2QWNA 3VGMA 2ZGYA 3RSEB 1QHAA 2A42A 2I7PA 2P9NA 3ZEUA 2NLXA 5BREA 4CZGA 3O80A 2P9LA 1DEJA 1NWKA 3A8YA 2YHYA 4BRNA 3EKSA 1R59O 4BR0A 3ENHA 5AQKA 3HM8A 3CIPA 1SAZA 3MN5A 2GELA 4M7XA 4AM6A 4C23A 4H5RA 4JHDA 2V52B 4B1WB 5AQLA 3QDKA 4H03B 1X3MA 4IWVA 2FF3B 4B1YB 4A62A 2FXUA 1K8KB 3J8AA 4BGAA 3DXMA 2HF4A 1DKGD 3UKUB 3MCPA 3ZETB 3L6QA 3FGUA 1WUAA 2NRHA 2D0OA 1IJJA 4ISFA 5F2RA 3SK3A 3VGKA 2Q97A 3BF1A 3WEEB 1SQKA 3VOVA 3ULEA 4RCHA 2Q1NA 3VENA 1KXPA 3W0LA 1NGCA 5AQUA 3M3ZA 5ELZA 2QWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QFPA 2VQFK 4CEBA 3SPZA 4KH6A 1XWLA 4JK7A 1FJGK 5HBMA 3OYHA 4DUYK 3O9TA 3WNFA 1EX4A 1VQON 3ID8A 2NRXA 4CFAA 1YUWA 1GLBG 4PL7A 2CH5A 5M1KA 2O8DA 5CE3A 4FZYA 3F73A 1WN7A 3HPGA 5JENA 5BRFA 3OBWA 4FLZA 2Z1HA 1N34K 1NK7A 3C7NB 1A5XA 1MDUB 4Z0UA 2G8HA 4B1UB 3QETA 3CFRA 5C10A 5DM7L 4FWNA 2FBVA 3W3DA 3VN5A 3NFAA 3DLBA 4CHYA 4H5NA 1UWBA 4BC3A 1TK8A 4HTUA 3VEYA 1YTAA 3ZX3A 1HMVA 1RBVA 5EOYA 3QESA 2ZD1A 3PX4A 1HNIA 3OYLA 4CESA 1T8EA 3R6MA 5AFUH 2F9TA 3S3MA 3CCUN 4PWDA 2O8DB 1J5OA 1HJOA 4CI6A 4CGHA 2O8EA 1VSJA 4AHVA 4PA1A 2HVIA 2AP1A 5EX5A 2QWPA 5TKWA 4DV6K 2IDOA 3MECA 2FSKA 3VF2A 2G8UA 5F0XA 2PYLA 2V7YA 1QE1A 4WYBA 4RW9A 3THYA 4E1JA 4FYDA 3CHWA 3P38A 1KLMA 4MFBA 2W40A 3BUZB 3MN7A 5BPNA 5BR8K 4CF2A 4X65K 3EL2A 4DV3K 4IEIA 1VSHA 3RMBA 3C6AA 1B9DA 1QQMA 4Q0BA 2G8WA 3QFUA 3OYKA 3V9UA 1VQ8N 1X3NA 2P5GA 4BDPA 1E3MA 4QS9A 3J81O 4IZ9A 2HF3A 3G6EN 4DQIA 5K14A 5HL7L 1LW2A 2B4JA 4DB3A 4AHUA 2PFUA 1QVFM 4JKHA 4E7HA 3I8BA 4B1ZA 1W0HA 1J54A 4DV5K 1BOTO 3UIQA 1X9JA 2YHAA 3ZX2A 1S6QA 2F4VK 3C95A 3ZEUB 5I3UA 4FWPA 4FVMA 3B8AX 3CC4N 4BEBA 4B9TA 3VQ7A 2ZF5O 1B9FA 1QSSA 1CZAN 3D2EA 4DU1A 4JRQA 4M3RA 5GADP 4CBXA 3ID6A 3LDQA 1GLCG 3SYZA 2X6SA 1QQNA 2Y1JA 2NZTA 4FOEA 3WQUA 4E0DA 2QWMA 4DV4K 5FRNA 4CJ4A 3HP9A 4DS5A 1N33K 5FPDA 2B6AA 2ASOA 3WNGA 1X1PA 4IXCA 4NO7A 1U47A 4RW6A 1C0UA 1RDBA 3CJ9A 4YOWA 1VK0A 4IOAL 4AHSA 1JJ2M 4WQ5C 1WBBA 4DKWA 4ELUA 2BANA 5AQVA 1NKCA 3D2FB 3O1WA 4IFEA 3F9KA 3QINA 1YJ9N 1WOQA 4LFAK 1YTUA 1BO5O 1DT9A 1NGIA 2HBJA 1NBWA 3D2EB 4AM7A 5JS2A 5F1XA 3ZSQA 1TL1A 3CJAA 4R5PA 4IG0A 5BPLA 1NK8A 1N36K 4CJLA 3HTVA 4GY2B 5AQPA 3QEIA 4DTPA 3VQ8A 4DTSA 3AAPA 3MN6A 5HRPA 3OW2M 4I6MB 2ZWHA 2QXFA 3IS9A 1NGJA 3MXJA 2RN2A 3OYBA 5A2QO 1HQEA 2UXBK 3CJ7A 5JLFA 4JKAA 1K8KA 3A5LC 3ZETA 1ESVA 4CK3A 3P39A 2P51A 1QVGM 5FLXO 2YHXA 1ATRA 4OVLA 3ASMA 3OYMA 4PQUA 1EQYA 1V4TA 1KD1O 1KVCA 3S9HA 5EY4A 1NKEA 4RW7A 2DTUA 4C8NA 1GOBA 5KPZA 4BRKA 1VRUA 1JCEA 1RT5A 1HYVA 2Q31A 1K73O 4H0OA 1MWMA 3RMDA 4Z4HA 3VTIA 3CD6N 3SMPA 4E1NA 3TANA 3NH2A 3LALA 3HK2A 3FFKB 4I2PA 2P9KA 3K5NA 2D5RA 4ELVA 4XH5A 1I94K 1VQ7N 4FCYA 1X9MA 5CHIA 2OTJN 4OKJA 4ILGB 4FLVA 4M41A 3HXMA 1NG9A 4W5RA 1S1UA 4CIGA 1J53A 2ZE2A 5BRHA 5D3GA 3L2VA 1MWKA 3EYZA 4GVMA 3TAQA 3ZT2A 4AHCA 5AQFA 3NF8A 4QS7A 3E9LA 3QBWA 1WSJA 2KTQA 1JXEA 1S1TA 1VQ9N 1OVYA 3MXMA 4FJ8A 4DS4A 4JKCA 2O8FB 1JLQA 4CK2A 4JD2A 4CFCA 2IVNA 4IFYA 2P9IA 4DSJA 2YNGA 3KLHA 3CPWM 4UQGA 5TKYA 3UE5A 5DK5A 4CEZA 3AGKA 2P9KB 3OYNA 3TSUA 2IGIA 3I56N 4ZTFA 3CJCA 4FM1A 3CPEA 3AV9A 4JI1K 4JAXA 3RMCA 2E1YA 1O13A 4BRCA 3M8SA 2Q0RA 2FSJA 2QWLA 3KTQA 3ATUA 3S3NA 1W2BM 2OPRA 4JRPA 4IKFA 1TUUA 1GLFO 3RWUA 3P4IA 3JAMO 1NGEA 1VSIA 1TL3A 3C0BA 1KAYA 3HJFA 1S1WA 3P83D 3LDPA 1XMOK 1VAZA 5AFUA 3AO4A 4ICLA 3DJCA 3VQ4A 4FZZA 1L3TA 4PUOA 3T19A 3AVHA 4QS8A 3U6FA 2P9IB 2D0AA 3DAWA 5AR0A 5KPTA 2KZZA 4GKKK 5KQDA 3ATVA 2O4IA 3C65A 3P1GA 1RGIA 3O08A 4ID5A 3R8EA 4CECA 1NLVA 5GAGP 4BE0A 1TK0A 3VQDA 4QAGA 2HMPA 4AQYK 3MK6A 4JNEA 1IH7A 3ENOA 3OHRA 4H5VA 4BG9A 1RILA 2BUPA 4FK0A 3QIOA 4ISGA 1QQOA 3LDNA 1J5EK 4KHYA 4OPHA 4OKKA 3VGMA 5CY4A 3RSEB 1QHAA 2A42A 2ZQBA 3T1AA 4F3OA 2KLAA 3A8YA 3HT3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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