2A4VA

Crystal structure of a truncated mutant of yeast nuclear thiol peroxidase
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
DVNELEIGDPIPDLSLLNEDNDSISLKKITENNRVVVFFVYPRASTPGSTRQASGFRDNYQELKEYAAVFGLSADSVTSQKKFQSKQNLPYHLLSDPKREFIGLLGAKKTPLSGSIRSHFIFVDGKLKFKRVKISPEVSVNDAKKEVLEVAEKFKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the C107S/C112S mutant of yeast nuclear 2-Cys peroxiredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin DOT5
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 57
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2a4vA01
2N5BA 2IMDA 2PN8A 3IA1A 1DE1A 2GVPA 2L4CA 2HYXA 2WRTA 2WS2A 1FVKA 4WBRD 3GUSA 1GSDA 5AN1A 5H5RA 5F0GA 4MK3A 2VL2C 1MDIA 2RUEA 2HZFA 4MZCA 2X8GA 4YQMA 2B7KA 3SBCA 1F2EA 3L9UA 3TKPA 3DEXA 1YF0A 2BJXA 2H66A 2YWOA 12GSA 1YEPA 3HVSA 4AF2A 4EKZA 1AW9A 3O76A 1ERWA 4V1Ag 4KDUA 1R4WA 2VAFA 2OACA 3MNGA 2O89A 3D4TA 4YQUA 3ZZXA 3A2XA 5G2ZA 3ZITA 5KN0A 3PH9A 1F3BA 3VURA 5INYA 3ZRDA 1QQ2A 3LSZA 2RM5A 1QMVA 4F03A 3CTGA 3APQA 5G1LA 8GSSA 2OADA 5ECQB 3G7IA 5A4VA 3GSTA 3ZTLA 3E9JB 3EMXA 2GS3A 1A2MA 4WR4A 4K6XA 2XBIA 3FZ9A 1HD2A 1M99A 1FHEA 4F9ZA 1PQNA 6GSVA 1B4PA 2JSZA 4BPYA 4EE0A 2VLTA 2LTKA 1N2AA 2DMMA 1TK5B 2H1AA 3UAPA 3UEMA 4RI6A 5DQYA 4OFNA 2A2SA 2MBTA 2IMIA 4G19A 1NSWA 3MAKA 2YZUA 1T4ZA 1O6JA 3P7XA 2K6VA 3ZMKA 2AJQB 1JLVA 1K0NA 5IIZA 1XW9A 1TRWA 5CYYA 1K0MA 3FY7A 13GSA 3HY2A 1J08A 2VCZA 2CQ9A 3GKNA 1VRSD 2GSRA 2LKUA 4K0NA 5JCWA 1I5GA 5DDLA 4GSSA 4ZBDA 5ECNB 4LL1B 1Z6NA 6GSWA 1U3AA 4K7OA 2NPBA 3TOUA 2L5LA 4IW9A 4MPGA 2L5OA 1U88A 4PQ1A 2MYGA 2H01A 5DJMA 3GV1A 2XBQA 3L78A 3M3MA 1GSUA 4HUAA 2YJ7A 1ZYQB 2VL9A 2E7PA 4NWYA 4QL7A 2H6XA 1BX9A 2GQKA 2A4VA 1B9XC 1TI3A 2GQLA 4ZILA 2LV3A 3KIJA 3TJFA 5JCGA 3KH9A 5ECIB 3IRAA 4IKHA 4KX4A 4IJ3A 4MZBA 5EL8A 2YCDA 5CRWA 4XS1A 4POKA 2J9HA 3LYPA 3KP8A 1X5DA 3NZNA 2HSHA 3TGZA 4IP1A 2CT6A 1ZGNA 1XWCA 4KH7A 2VM2A 4PGTA 1XZOA 2QKEA 1M7TA 1WMJA 3H1NA 3AY8A 1BAYA 4I8BA 1OAZA 3GTUA 4ZL9A 2WGRA 3KCMA 4HJMA 3D4MA 3VPQA 5IMZA 2REMA 3VWWA 4GCIA 4RI7A 5ENUA 1FAAA 1Z5YE 2B7JA 3M9KA 4ZB8A 3GTUB 1DUGA 4OWYA 3F9UA 5D96A 5FWGA 4N30A 2NBSA 2B1KA 4NV2A 4NHWA 6GSSA 5GZZB 2B5XA 1SJIA 1WJKA 2PWJA 3L4NA 2F3MA 3QCPA 1M2AA 4JBBA 4V1Ap 2LRTA 1GSEA 4KAEA 4O5RA 1PX7A 2H71A 2X64A 1XW6A 3EYTA 3K8NA 4DSSA 1F37A 2HRNA 2YOIA 3UVHA 5G5EA 2HNLA 3GKMA 1YDKA 3LGCA 5IM9A 5AIXA 4MP4A 3CXGA 4P3YB 2MMOA 4DSSB 2YV9A 4JR6A 1GUHA 3N5OA 4AGSA 2C3NA 1SL1B 1J9BA 1OKTA 4L0WA 5L71A 1XWBA 3TJGA 3EMPA 3DGQA 3G7JA 5B6MA 5E4WA 2C3TA 2FD3A 2GSTA 4JZQA 3HXSA 2VUPA 1Q4JA 3D6IA 2AV4A 4I6XA 2YZHA 1B9YC 4IBPA 5COHA 1DBYA 1R5AA 4KNDA 1JZRA 1SK2A 1AAZA 5LD0A 4ECCA 5J41A 1H4OA 2XPEA 4RUVA 3TKSC 3L9VA 14GSA 2PPTA 3QR6A 1K0CA 3BBYA 4TN8A 4NHZA 2LS5A 1SENA 5CP1A 6GSXA 3DVXA 3BD2A 3L9SA 3PGTA 2VCXA 1QUWA 3UBLA 1M2BA 3VWUA 7GSSA 4IP6A 3D0ZA 3TJJA 2RIIA 2IMEA 1SJZA 2CVDA 1GRXA 1XFLA 2KOKA 3GL5A 3CRTA 2H0GA 3US3A 1SKRB 3E0UA 4ECJA 1SK1A 1Z7RA 1GL8A 5JWQB 1TDIA 5H5SA 5EPFA 4WF5A 4EO3A 2DJ2A 1TTZA 2PUKC 1MDKA 2K9FA 5KN3A 1LU4A 2VCWA 5ECOB 2DJ1A 4PUAA 1OC3A 4ZXGA 1PSQA 2YP6A 5B7CA 2A2RA 2XPDA 3D21A 1N8JA 4GXZA 2E2GA 3TOTA 3C7MA 4TVEA 2FA4A 2O7KA 5G5FA 3ZIJA 2C0EA 2K8SA 1ERVA 2H0HA 2KLXA 1K0DA 1SKWB 5LNKe 1B4QA 4TR0A 3QAGA 3GRXA 1EEJA 2IFQA 2YWNA 5KN1A 1TK0B 3DD3A 5CREA 3H79A 1TRUA 4HOJA 4MJEA 2VD1A 3N9JA 1GUMA 3ZVJA 17GSA 1TOFA 2CX3A 4HQSA 4LMVA 2FUG2 2LQQA 1BG5A 1GSFA 1K0AA 4OCFA 4XRAA 3C73A 4MH2A 2MMNA 3FYGA 2JZSA 4KUNA 3UVTA 5A5KA 3ZIVA 2FWHA 2V32A 1EEMA 3I9V2 3ZL5A 5ID2B 4KCEA 2TIRA 5ABRA 4GLTA 3J7Yb 4NXIA 5HFKA 2VLUA 2VLVA 4DSRA 5DCGA 4HEA2 1A2LA 3KMNA 1QFNA 1W89A 2O8VB 1PN9A 4OO5A 3WT1A 5DAKA 2C0FA 4HZ2A 1G7OA 5G1KA 1UVZA 1F9MA 3TRXA 4IVFA 1PMTA 2H8LA 3IBHA 1U87A 4HI7A 3A2WA 5HR2A 1WRYA 5E59A 4BVXA 1TRVA 3E3EA 3IHQA 2YJHA 5DAKB 1B8XA 3TKRA 1DSBA 5D9XA 1YY7A 3KGKA 3RPNA 1GSYA 4Z7XA 5C04A 4TR3A 4PNFA 4YAVA 1O81A 1TKDB 2K18A 1XVWA 2H1BA 2O85A 3EE2A 1GTAA 3BJ5A 5J3RA 3GH6A 4RQRA 2G0FA 1S3AA 5AGYA 4NV5A 3DMLA 2CVBA 1HNAA 3HZ8A 3P8WA 5HR3A 4CW9A 3I43A 2B5EA 3FZ4A 3EWLA 2J23A 2MZCA 1SKSB 1PKWA 4PUFC 3HCZA 5IO2A 1GWCA 3P2AA 2VCTA 2GSQA 5CRHA 3IK7A 1TK8B 4EC0A 3H8QA 3M9JA 2DIYA 5JWRB 4L0UA 2I9HA 1AIUA 4KB3A 1E2YA 5KN2A 3OR5A 3HYPA 4G2EA 2DC5A 5B8BA 2DLXA 5HR0A 5FHIA 2WZ9A 2H73A 3IV4A 3HJPA 4MDCA 1ZMAA 1KTEA 4WXTA 3QOUA 1KNGA 2LRCA 4MJCA 1BJXA 2KP1A 3Q74A 2CZ3A 3J7Yk 2H70A 2RUFA 3I69A 4ML1A 4ZL8A 3M1GA 4KCAA 1VF1A 2YN1A 1Z3EA 3ZYWA 3LYKA 2FHEA 4NAXA 5CNWA 2M80A 5ELAA 1A8YA 3BCKA 3ME7A 5D73A 2N5AA 3RPPA 3GURA 4EUYA 1HYUA 2VL3A 4WETA 4HS1A 1VF2A 3Q6OA 1OC9A 3I6AA 5FT3A 1VF4A 4F0BA 4AJ7A 1M9BA 4Q5RA 1ZOFA 1J0FA 4IJIA 1QGVA 1GTBA 3RHCA 1OC9B 2IJYA 3Q19A 4MA9A 2C0GA 3RHBA 3FHKA 3RBTA 3FRCA 22GSA 2M72A 2K8VA 2LEGA 3HJOA 5F05A 2EC4A 5JWOB 5IQYA 1QK8A 2WDUA 3G7YA 2IMFA 1A2JA 1PGTA 3VPTA 1SJ6A 2PVQA 2QGVA 1O85A 1SK0A 1AQWA 2V2GA 2LUSA 2I81A 4FYCA 1ACVA 1R26A 3W8SA 1PL2A 2OBKA 3KM6A 1YEXA 1SD9A 1ABAA 1H75A 2C0DA 2ZCTA 4EDYA 4BWSA 2H1DA 3IC4A 4G9HA 4PXOA 2BTOT 2DIZA 4TXOA 3GKKA 5DALA 4MJBA 3KD0A 5HQPA 2FGXA 4WBJA 3GMFA 1GTUA 2E2MA 3TUEA 3APOA 1O7UA 4V2NA 4J2FA 5D9WA 4EXJA 2X99A 1ST9A 4ECIA 1FW1A 4OMVA 4TXOB 5DALB 1KBNA 2LNSA 2C4JA 4PQIA 1U3IA 2LJAA 9GSSA 3F4RA 4GSTA 1SL2B 2NVLA 3WGXA 2H74A 1JZDA 19GSA 2CVKA 2OE0A 2ZNMA 1ON4A 4N11A 1GNEA 5AIVA 3ERGA 4HZ4A 1JZOA 1XWGA 1S3DA 1C72A 2R4VA 4POBA 2OE1A 3GHAA 4G10A 3F63A 1G6YA 4ULXA 1TJDA 4TKYA 1FOVA 2FCHA 3APSA 4L5LA 4V2LA 2I1UA 1WIKA 1K0OA 2VO4A 4TXVA 4XHMA 4HU7A 1T7PB 3C1RA 2LQOA 3HA9A 1FB6A 2GZZA 3PR8A 1SYXA 1EV9A 1M0UA 3GH9A 1QXHA 3Q18A 2RM6A 1XIYA 4MPFA 1NM3A 1EV4A 1U6TA 3GX8A 1S3CA 3IAM2 3P90A 5D93A 6GSYA 4PQHA 3GKXA 2X8HA 1T4YA 4JU5A 3S9FA 1SU9A 3HJMA 2VIMA 1AUCA 5ECRB 4FYUA 3CRUA 4OFTA 3ME8A 3KH7A 4MF5A 3FR3A 2ZUPA 3LQ7A 1ERUA 3KP9A 4KSMA 4N10A 3ZMLA 1TXXA 3KEBA 2JACA 4F82A 1PD21 1TRSA 4MMMA 1FG4A 4PURA 3EU3A 3TB2A 4IS0A 4E8HA 1JFUA 3G9BA 1T00A 5KEJA 4YAPA 2DJ3A 3ISOA 2FNOA 4ISDA 4O7HA 3UBKA 3GIXA 3EINA 4H86A 4IHUA 3IPZA 2OJLA 4Q5FA 4MJAA 3LEFA 5DCHA 1HNBA 4N0ZA 2FWEA 3KXOA 4Q5NA 1WWJA 3QD9A 4XIHA 2H76A 2YWMA 5AISA 3GNJA 1GP1A 2DBCA 3M8NA 1ZYEA 1AC1A 4MCUA 4QL9A 2B6MA 3FK8A 2DJKA 2JL4A 3TKSE 4KE3A 1XW5A 2PERA 5J4UA 4L5OA 1FVJA 4WEYA 5ECMB 5CRGA 2F51A 3VLNA 3ZFLA 3O6TA 1X0RA 4JEDA 1JHBA 2IMKA 10GSA 1V57A 4X1UA 3UARA 4XS4A 5ELGA 2WJUA 5IPHA 4TW5A 1IYIA 4D73A 4WKWA 3UJ1A 1BYEA 1B48A 5IOWA 2HSYA 3DYRA 1OE8A 1Z7PA 4BA7A 3GYKA 4O32A 2B3SA 4CHSA 2V6OA 5GAPD 3EU4A 4J56E 3QFBC 4XS4B 2ON7A 1UA5A 1YKAA 3H93A 4HJ2A 4D73B 2H72A 4X0XA 3U5RE 4DEJA 1GSQA 5DBQA 2GZYA 4HQZA 2IFQB 2KP2A 3UL3A 1Q98A 2KHPA 1OYJA 4TOPA 2H6YA 2MMAA 3HD5A 3WYWA 2YPMA 2FLSA 3F4TA 3KJYA 3ERFA 1YF1A 1I9DA 1W4VA 2C3QA 1F6MC 2CX4A 5ECSA 3F4SA 3F3QA 2AB6A 5H5QA 5A4UA 3HKRA 5D9TA 4KA0A 3VK9A 1UN2A 1UC7A 1XOAA 1MDJA 1MD4A 1T3BA 1G7EA 2PMTA 2VCVA 3PINA 4ZL7A 11GSA 2Z9SA 1OE7A 3D22A 2F9SA 2WCIA 1M9AA 1FB0A 5HFIA 2HFDA 1A0RP 3RAZA 2F8FA 2H6ZA 2WFCA 1R7HA 1GH2A 5F07A 1XVQA 4TR4A 2OE3A 2OA7A 3KTBA 5EVOA 2B1LA 3QMXA 2VCQA 1GUKA 3IE3A 4NPBA 2GGTA 1M2DA 4DVCA 2YANA 3LXTA 2NDOA 2I4AA 1EGRA 3TDGA 1Y6EA 2GZPA 5J9BA 1CQGA 1XWKA 1NHOA 3NIVA 3LXZA 3BCIA 3ERWA 5CRDA 2GQMA 3LFLA 1ZZYA 2H19A 1OC8A 1HNCA 2E0QA 3JCML 4RQXA 1ZL9A 3CMIA 3IXRA 3TKQA 3CSHA 1SD8A 3DWVA 4I2UA 1RK4A 3MSZA 3ZFBA 1V40A 4K7IA 4GTUA 3LJRA 1OVNA 4EF0A 1JLWA 2L6DA 2BMXA 3C1SA 2HRFA 4GSNA 2DJJA 5IOXA 1URMA 6GSUA 3ZVJD 4I5QA 2PGTA 3QAWA 2HZEA 3GX0A 1A24A 4MLYA 2PVOC 1EP7A 4K2DA 3LG6A 3DVWA 1PA3A 1TW9A 4FH8A 2R37A 4MF6A 4EDZA 1JZWA 1YZXA 3HDCA 4KGIA 4F2IA 3CBUA 2HZEB 2LSTA 2DSAA 2GT5A 3IOSA 2DJ0A 3GN3A 5IMDA 2YV7A 1OKDA 4XTSA 4ID0A 2PU9C 2R6KA 1V58A 2C1YA 2LRNA 5IO0A 1SYRA 3ED3A 4YQVA 3FR6A 2M46A 2P5RA 4K0GA 5GSSA 1EOGA 4XRDA 4GWRA 2AUVA 4IELA 1K3OA 1YJ6A 2IPAA 1XXUA 4IGJA 1NW2A 2QSIA 3FZAA 5J5NA 1TI1A 1EZKA 2LJKA 5HR1A 3FEUA 4BWQA 1A8LA 3GFKA 5G31A 1ZCPA 1R5PA 3D5JA 2L4QA 5B8AA 5JCUA 2FWGA 1K3LA 4F0CA 1XOBA 2V1MA 3FZ5A 3TRPA 5IMVA 4WF4A 5F8BA 16GSA 5ECHB 1THXA 3BOAA 3DKSA 2X8CA 4ZBAA 3UIWA 1AQXA 4WR5A 1GTIA 3KMOA 2O87A 3NOFA 4OD7A 2PBJA 3F8UA 5J9CA 5GSTA 2L6CA 2R2JA 3CYNA 2AAWA 5IPGA 3QFAC 1E6BA 4CDOA 4LLRA 1WP0A 4POLA 1RQMA 1ILOA 3C8EA 2VOCA 2NTOA 2IN3A 1KEBA 2HI7A 4O92A 1PKZA 1T8EB 1X5EA 1GNWA 2LJRA 3TJKA 3TCOA 1X9WB 1ML6A 2CV4A 5GAND 3FW2A 5DJLA 4ML6A 5EY6A 3GSSA 1EGOA 4OFMA 2GDRA 3HVXA 1PRXA 1T1VA 3QDNA 2V6KA 4GRFA 3VWVA 2H0IA 3MDKA 1HQOA 5DVBA 3M0FA 3HHVA 3HVVA 1YQ1A 1F3AA 4ZBBA 2IWTA 2ALBA 2JSYA 4PNGA 4N0VA 4ZB6A 1K3YA 1G0TA 3TKSA 3U6VA 2HLSA 3TRQA 4XCSA 18GSA 2WULA 4K1FA 4ACSA 2GT6A 1A0FA 5IMCA 1GLQA 4GQFA 3CSJA 2V41A 2GTUA 2P31A 3GA4A 4J57E 3WT2A 1GSSA 5DQSA 4KSOA 4GF0A 4JR4A 2XC2A 3W8JA 2XHFA 3R2QA 4DSQA 5A4WA 1MTCA 4K8MA 4EL1A 1XWAA 1WE0A 1VF3A 4V2MA 5C00A 4KDYA 1FO5A 1SL0B 3O3TA 4K9ZA 1MEKA 2FWFA 2FY6A 4ECBA 1X9MB 3FR9A 4X43A 2WB9A 1V98A 2D2ZA 1TU8A 1BQ7A 4LMWA 3DIEA 3TJBA 3QPMA 2JADA 3SWLA 4I97A 4EVMA 4L8EA 4PX1A 4IQAA 3F6DA 4JRRA 2HE3A 6GSTA 2H75A 5CAXA 5B6NA 20GSA 1Z6MA 3WD6A 1O73A 1EOHA 3EC3A 2H30A 5IMFA 3DXBA 4MH3A 3CTFA 4TRXA 3ZLPA 4XS6A 2IL3A 2AHEA 5ECKB 3WGEA 5ECPB 1TU7A 5G30A 1K0BA 3L0HA 3UMAA 1X9SB 2P5QA 2H1GA 2DMLA 3F0IA 2CA8A 3CSIA 3LWAA 4MABA 5HFGA 2TRXA 1EWXA 3VI7A 3VFIA 2JU5A 3VWXA 1NHYA 2F8AA 1GULA 3EURA 1DE2A 5LCZA 5D9VA 2JZRA 2R3XA 4HU9A 4E8EA 2VD0A 2GLRA 3F3RA 1AXDA 1O8WA 1EP8A 2QC7A 2TRCP 3FKFA 4TR1A 1XCCA 2B5YA 4I2TA 4AJ8A 4IQ1A 3QAVA 4POMA 1YKCA 1O8XA 4JE1A 4IN0A 1BEDA 1RW1A 2C80A 2JZTA 2EIQA 1Y25A 2VM1A 2R5GA 2CAQA 3MWHA 2HXKA 1MD3A 3W6GA 3GL3A 2ON5A 4TR1B 3WGDA 3C71A 4KDXA 4ZB9A 1XBSA 5ECLB 2P0GA 2GSSA 1AQVA 2C8UA 2VL2A 3V1WA 1WPIA 3H4KA 1THOA 3A3TA 3RDWA 4AJ6A 5D8IA 2FA8A 5IMAA 1X5CA 4FO5A 2AYTA 4HDEA 2L59A 4FYBA 2CAIA 2OBIA 2YWIA 2RLIA 3A5WA 2KUCA 4K7NA 2N5FA 2MMZA 4QQ7A 1GLPA 4ILFA 2LNTA 1VGLA 4MF7A 4Q5QA 1ERTA 3F6FA 4ZIJA 3ZREA 5CO3A 1CQHA 3KZQA 3IR4A 1Z9HA 4GQCA 1WOUA 1IYHA 5ID2A 4FIWA 4NMUA 1TP9A 2YNXA 3HZ4A 5F06A 4BVYA 1A23A 1PX6A 2HT9A 4YH2A 4OCEA 2OKAA 1G6WA 2G2QA 1V2AA 2I3YA 3DRNA 4LL4B 3A2VA 4MZWA 2ES7A 3IAS2 1XPVA 2EIOA 1V9WA 2CZ2A 4KW6A 4OO4A 2L57A 3IK9A 1LBKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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