2A4VA

Crystal structure of a truncated mutant of yeast nuclear thiol peroxidase
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
156
structure length
156
Chain Sequence
DVNELEIGDPIPDLSLLNEDNDSISLKKITENNRVVVFFVYPRASTPGSTRQASGFRDNYQELKEYAAVFGLSADSVTSQKKFQSKQNLPYHLLSDPKREFIGLLGAKKTPLSGSIRSHFIFVDGKLKFKRVKISPEVSVNDAKKEVLEVAEKFKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Crystal structure of the C107S/C112S mutant of yeast nuclear 2-Cys peroxiredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin DOT5
total genus 57
structure length 156
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2a4vA01
4POKA 7GSSA 1FHEA 5KN1A 4AJ6A 1YKAA 1GTBA 2VL2C 4TR1A 4DSQA 4XS6A 4OFNA 3FR9A 2H19A 3SWLA 4MLYA 5CRGA 2JADA 5ECSA 2L5OA 1YZXA 3KTBA 2HI7A 1J0FA 3G7JA 2YWOA 2P31A 2HLSA 2QC7A 2YP6A 5DDLA 2BMXA 1QK8A 3NOFA 1AAZA 3I43A 3ZZXA 2P5QA 5GAND 5ID2A 2F8FA 4GQCA 2DMLA 1SD9A 4FYUA 4HS1A 3WYWA 3G9BA 2M80A 2B3SA 2JU5A 4O7HA 4PUAA 3F6DA 4PURA 3JCML 1R7HA 4EUYA 3HJPA 3ZFLA 4DSSA 3VWUA 3LFLA 3IPZA 4HUAA 4E8HA 3GKKA 4YH2A 3L78A 4TW5A 1A0RP 3TRXA 2PVOC 1EEMA 2O89A 22GSA 1SYXA 3UIWA 5DAKA 5D9TA 2H30A 2NTOA 2DJ0A 2OBIA 1XFLA 2GTUA 3M0FA 4GQFA 1U3AA 5EVOA 2GLRA 1SU9A 5CAXA 4N10A 2H1DA 2VLVA 2OJLA 3D4MA 1X9SB 1XW6A 4JEDA 1Y6EA 1KNGA 1K0DA 3LWAA 4YQUA 3GURA 3QAGA 4IKHA 1GNWA 2O87A 2H74A 3W6GA 1V9WA 5J9BA 4D73B 5G5FA 2P5RA 3GUSA 2J23A 2V32A 2WZ9A 2LV3A 1CQHA 3GKNA 3GSTA 4IN0A 6GSWA 1N2AA 2AV4A 2MBTA 1TP9A 3ZLPA 3KXOA 4IELA 3GNJA 4LMVA 4ECJA 2D2ZA 4F82A 4PNGA 4HJMA 16GSA 3N9JA 4IHUA 2H70A 3TJFA 4TRXA 3PH9A 1SK1A 2OADA 1OKTA 2OE1A 3GH9A 3UMAA 1Q4JA 5IPHA 1TI1A 2JZSA 5G1LA 1A2LA 3O76A 1K0AA 3H93A 2GZPA 4E8EA 2C0GA 1JHBA 1TU8A 2KUCA 1UA5A 1G7OA 5B8BA 4L0UA 1OVNA 4HJ2A 3ED3A 2C3TA 3FHKA 3VURA 1YF1A 4JRRA 3C7MA 3ZIJA 2WS2A 3APQA 2YN1A 1GSEA 3NZNA 1TK0B 1BG5A 5F07A 3DEXA 2LTKA 5JWQB 5CNWA 2N5FA 1O6JA 5GSSA 4LL4B 5ECHB 2B5XA 3TUEA 3J7Yb 1FB6A 2LQOA 2XBQA 2R4VA 3HZ4A 1XVWA 1EOHA 1SL0B 3TB2A 3IK7A 2JL4A 1JLWA 2GSQA 1BQ7A 1ZOFA 1XWCA 4EKZA 3KJYA 3TJKA 1XCCA 1OAZA 4K7IA 1G0TA 3IE3A 3ISOA 1SJ6A 4POMA 4NHWA 5D9XA 3QPMA 3VWVA 2MMZA 2YJ7A 3KMOA 2L57A 5JCGA 3FKFA 1RW1A 3G7YA 3IAS2 1EP7A 1TRVA 4LLRA 2B1KA 1FW1A 2G2QA 3O3TA 2O85A 3LXZA 1M0UA 3KTLA 4POLA 2B5YA 4DSRA 2B7KA 5INYA 2TIRA 1HNAA 2YWMA 3C8EA 3HYPA 5IOXA 4YQMA 3BD2A 4H86A 1GLPA 4I8BA 1AXDA 1PD21 1MDJA 4F0CA 4K8MA 2MYGA 4RQXA 3QMXA 2DLXA 2E0QA 4POBA 1X5CA 2L59A 2IMEA 3Q6OA 1DE1A 4DVCA 3UAPA 1JLVA 4ECCA 1YQ1A 2IMFA 1TRWA 5C00A 1EZKA 5FHIA 3A3TA 1F3BA 2H76A 3WT2A 1JZOA 2VL2A 3I9V2 1EP8A 1GSFA 2AHEA 3ZYWA 2I81A 4D73A 2HZFA 4L8EA 4KGIA 4PGTA 1XXUA 4XTSA 2AUVA 5DCHA 3QAVA 3HVSA 4TVEA 1K0NA 3OR5A 3ZITA 3Q19A 1PMTA 1THOA 2L6CA 2N5AA 3O6TA 3DVXA 1RQMA 3TOUA 4Q5QA 3CTFA 1XWBA 4GSTA 4O32A 4MF7A 2R2JA 2X64A 1A23A 13GSA 4KDYA 3H8QA 3HJOA 3A5WA 1UVZA 3S9FA 4MABA 4TXOB 1TK8B 2OKAA 4V1Ap 1UC7A 3J7Yk 2R5GA 2I1UA 2H6XA 5IMAA 2VOCA 4ZBAA 5B7CA 2C1YA 4KDXA 4N0ZA 2O7KA 5A5KA 4WBRD 4IW9A 3LORA 4MPFA 1WJKA 2LUSA 1Z7RA 5ECKB 1DUGA 1LU4A 3U5RE 1TKDB 11GSA 2H0IA 2PN8A 2R37A 1EEJA 1S3CA 4J2FA 4F2IA 2ZCTA 3KH7A 4K7NA 3FZ9A 5ECRB 3TKSE 4MDCA 4PQIA 1A24A 2VCVA 5KN2A 5HFIA 1TOFA 4ACSA 1JFUA 4AGSA 3GYKA 2RLIA 4NXIA 4NPBA 2MZCA 4KSMA 1SK0A 5J3RA 4YQVA 1RK4A 5CRDA 5ECLB 2V6KA 5IMDA 2CVBA 2PERA 5GSTA 1BEDA 2JSZA 2MMOA 3TKRA 4RI7A 1YEXA 2WDUA 3ZMLA 3L0HA 4DEJA 1ON4A 2DC5A 3I6AA 2H0GA 1F2EA 4OD7A 2VM1A 2HSHA 3DVWA 4OFMA 1OE7A 2FNOA 3FW2A 2I3YA 4XS1A 1BYEA 5A4WA 2JACA 4K1FA 3ZIVA 1WP0A 4G19A 4MA9A 2ON7A 2XPDA 3GL5A 4MMMA 1T8EB 3L4NA 1K0BA 4AF2A 4EVMA 4LL1B 2CX3A 1TXXA 2FWFA 1THXA 3DYRA 3ZREA 2O8VB 1AIUA 4ZL9A 2YNXA 3GMFA 4AJ8A 1ERUA 4GCIA 3TKQA 3KZQA 2FA4A 3ERFA 4ZBBA 3EC3A 4EC0A 3GA4A 1PX7A 4HEA2 5FWGA 4O5RA 1PL2A 3TOTA 3US3A 2M72A 1IYIA 1FO5A 2N5BA 1HNBA 4RI6A 4IJIA 3CRUA 3UVHA 2NDOA 2TRXA 2I4AA 1R4WA 3TGZA 2IL3A 5ECMB 2H1AA 2PBJA 5HQPA 2H71A 2V41A 1C72A 2YANA 3MAKA 4F0BA 4WF5A 4V2LA 1QGVA 3UARA 1E2YA 3RDWA 2HNLA 2KOKA 4J57E 2OA7A 4GSSA 1SENA 5HFGA 1ZZYA 4ZL8A 4MJAA 4OO5A 4MZBA 3RBTA 4TXOA 1WMJA 4ZILA 5A4VA 3HY2A 2CA8A 2AYTA 1ST9A 2KP2A 3C73A 1HNCA 2LEGA 2CX4A 1GH2A 2VM2A 1SL2B 1KEBA 2ON5A 3F6FA 5E59A 4FIWA 1NW2A 5B6MA 5LD0A 3APOA 2P0GA 1QUWA 4NAXA 2C3QA 5CRHA 3ERWA 3GKXA 1YKCA 1LBKA 2V1MA 4GWRA 5HFKA 3TCOA 4PXOA 3HKRA 2ALBA 3VFIA 2C80A 1AQVA 1XPVA 3ZRDA 4MF5A 2CAIA 6GSVA 3DGQA 2IJYA 1MD4A 4BWSA 4EF0A 4HOJA 3LEFA 1SKWB 3UOMA 2H8LA 2RM6A 2F9SA 3CXGA 4K7OA 5B8AA 2BJXA 5H5SA 4K2DA 1X0RA 4BWQA 1OC8A 2PU9C 4OCFA 1AC1A 2AJQB 4MH3A 1GNEA 5J9CA 2A4VA 1NHOA 4X0XA 3DD3A 3DRNA 1VF1A 2GQLA 4TR0A 3D0ZA 3P90A 1MEKA 5F06A 3RHBA 4K6XA 3BBYA 1GSSA 2FD3A 5KEJA 1V40A 4CW9A 4L5LA 5DALB 3KGKA 2XBIA 5AIXA 2DJJA 3V1WA 2LJAA 3QR6A 4LA1A 5AISA 4V2NA 3UVTA 3ERGA 2L5LA 2YCDA 4O92A 4ILFA 3L9UA 2RUEA 3TJBA 4ZB6A 1H4OA 3WT1A 1SK2A 4KUNA 3UEMA 1W89A 1OC9B 3EMXA 3HJMA 1GSDA 2HRNA 2H01A 1NM3A 2EIOA 3IDVA 1MDKA 1GSUA 2FLSA 2FCHA 2GGTA 2NBSA 3F4SA 1FVJA 5CRWA 3EU3A 3FY7A 2JZTA 1O85A 2VL3A 1R5AA 3VI7A 2DJ1A 2VCZA 4GF0A 2VD1A 4FH8A 2F51A 3MWHA 2NVLA 5L71A 1J08A 4I97A 2C4JA 2BTOT 3HXSA 1M99A 3GL3A 4BVXA 5FT3A 1GWCA 2VD0A 2RUFA 1EV9A 3TKSC 2V6OA 1K3OA 5F0GA 2V2GA 3QCPA 2C0DA 4ZL7A 4XIHA 1G6YA 1O8XA 5D96A 1DSBA 5IOWA 3RPNA 1SJZA 2PUKC 2C0FA 1NSWA 3LG6A 4KCEA 3IXRA 1M2DA 1KTEA 5G31A 20GSA 2VL9A 1R5PA 5ECNB 2RM5A 4HU7A 5IQYA 6GSUA 4L0WA 1ZCPA 2R6KA 4EO3A 4OWYA 2K9FA 1YDKA 2GDRA 2LJKA 2EIRA 1ACVA 1ZYEA 2JSYA 2DIZA 5EY6A 2K8VA 4BL7A 3EINA 4JE1A 1V58A 4OCEA 2FGXA 3GRXA 5JCWA 4MJEA 2C8UA 3C71A 4OO4A 3GSSA 4KA0A 3D21A 1GSYA 5IMZA 4KDUA 2IMDA 1B8XA 2GZZA 1PSQA 1ILOA 4WKWA 1VGLA 3DWVA 3CTGA 2FUG2 1WWJA 4GSNA 2AB6A 3AY8A 2F3MA 3W8SA 1B4PA 3GFKA 1PX6A 4Q5NA 1YF0A 3QAWA 3P7XA 1GUMA 1GUKA 3WD6A 1F37A 4K0GA 3IA1A 1M2BA 1CQGA 3N5OA 4ML1A 4TR3A 1B48A 1Z6NA 2LQQA 5H5RA 3IOSA 5CP1A 1ML6A 2IFQA 5DALA 2K8SA 3D22A 4HZ4A 5H5QA 3IK9A 1URMA 1PL1A 3IHQA 5ENUA 5A4UA 3EVIA 1N8JA 3QFAC 4TKYA 2KLXA 1OC9A 1O73A 3CBUA 4NHZA 1TRSA 3DIEA 5JWRB 1MTCA 1USBA 1DE2A 2GVPA 2CAQA 4V1Ag 3KMNA 5GAPD 2HZEB 2VCXA 4FO5A 1HYUA 1PGTA 1SJIA 12GSA 3HHVA 1A8YA 4QQ7A 4HI7A 1M7TA 4WETA 2EIQA 3EYTA 2VIMA 3DXBA 4ZBDA 2NPBA 3ZFBA 5HR1A 3UBKA 1UN2A 1YJ6A 3F4RA 4IJ3A 1GTAA 2H72A 2E2GA 4BPYA 1BJXA 3FZ4A 4I6XA 5IM9A 5HR2A 3A2XA 18GSA 2CVKA 4TN8A 4YAPA 3HDCA 2YV7A 3D4TA 2HRFA 1TK5B 1O7UA 5IIZA 2CVDA 4Z7XA 5DJLA 1G7EA 4MH2A 3GTUB 1YEPA 3LYPA 4PNFA 5GZZB 1XZOA 3I69A 2PPTA 1O8WA 4ECIA 3M9KA 1F3AA 2H1BA 2VUPA 4IP6A 2CV4A 2QKEA 2H66A 3TDGA 1GUHA 1QMVA 4LMWA 4G9HA 2GT6A 3F9UA 3GV1A 1Y25A 2RIIA 5KN0A 2B6MA 1M2AA 1PQNA 2J9HA 4KH7A 1KBNA 6GSTA 1T00A 3BJ5A 4WR4A 5CYYA 3VPQA 3FRCA 2YOIA 3MDKA 1GLQA 3E3EA 4N11A 2IMIA 2MMNA 4KX4A 4EE0A 3H1NA 2XC2A 4XCSA 1TI3A 1Z3EA 3IC4A 3WGDA 4L5OA 3ME7A 4MP4A 1MDIA 2C0EA 2MBSA 3K8NA 3GIXA 3F8UA 1EGRA 3LGCA 4KNDA 3KP8A 4MZCA 2HFDA 4MCUA 4QL7A 2HE3A 3LQ7A 4ID0A 4MJCA 2B1LA 1MD3A 5DBQA 3EU4A 3TKSA 2A2SA 3BCKA 3Q18A 5C04A 4I2TA 3ZL5A 1BAYA 1GP1A 4F03A 1FB0A 3A2VA 2VLTA 3GX0A 3WGEA 4NMUA 1GTIA 3RPPA 2VCWA 1X9MB 3EE2A 2LS5A 5AIVA 2WB9A 3GHAA 5D8IA 3LXTA 3LYKA 3QD9A 1WIKA 3HA9A 3ZVJA 2YV9A 3TJJA 1SKSB 4JZQA 5D9WA 3UL3A 1OE8A 2QSIA 1XOBA 1R26A 3VI5A 4J56E 1W4VA 2VO4A 4ECBA 2AAWA 4JU5A 4JBBA 2LNSA 3EMPA 2REMA 1ERVA 5CO3A 5DVBA 1YY7A 1XBSA 3EWLA 3HD5A 5ECOB 3G7IA 4PQHA 2B5EA 3IV4A 3E0UA 1QFNA 1T7PB 2PGTA 1I9DA 1S3DA 1U3IA 2HZEA 10GSA 2GT5A 6GSXA 4Q5RA 4P3YB 1U88A 4FYCA 1AUCA 4IP1A 5IPGA 1ZMAA 5ELGA 1FOVA 4GRFA 1TRUA 4XS4B 1J9BA 3R2QA 4IVFA 2JZRA 5HR0A 4EDYA 3KM6A 3GH6A 3RAZA 2VAFA 3TRQA 5IMFA 5ECIB 1U87A 4CHSA 6GSSA 1PA3A 2L4QA 1HD2A 2KHPA 1F6MC 4ZXGA 1T4ZA 1XW5A 2LNTA 4XHMA 1TW9A 5LNKe 1Z6MA 1GL8A 5COHA 5EL8A 1QXHA 4JR4A 1XWGA 3MNGA 1SYRA 2IFQB 4ZB9A 1TJDA 5DQSA 3P8WA 2DJ3A 2CZ2A 2H0HA 3GTUA 4RQRA 3ZVJD 1ZGNA 1K0MA 1ABAA 3E9JB 3VPTA 4OFTA 4Q5FA 2IMKA 1XWAA 5E4WA 2OE3A 4N0VA 5G30A 1OKDA 3DMLA 14GSA 3KP9A 4GTUA 3H4KA 2ZUPA 2YZHA 17GSA 4K0NA 3VLNA 3HZ8A 3F63A 4MK3A 2HSYA 4PX1A 1FG4A 1GULA 1WPIA 3FK8A 2LRTA 4MZWA 2WFCA 5J41A 5DQYA 4EXJA 3U6VA 3IAM2 3IRAA 2CT6A 1ZYQB 3TJGA 1WRYA 1T1VA 3FYGA 2GSTA 5IMVA 2FA8A 5AGYA 3GN3A 1A0FA 6GSYA 1O81A 3BCIA 4GXZA 2ES7A 3F0IA 2YZUA 5IMCA 4G10A 4OMVA 4EL1A 2L6DA 4F9ZA 3A2WA 2WRTA 4IS0A 1XWKA 1QQ2A 2QGVA 4I5QA 5D93A 2ZNMA 3BOAA 2VCQA 9GSSA 1GTUA 5EPFA 4IGJA 4JR6A 2H73A 4TR4A 3ME8A 4KB3A 1A8LA 4KSOA 4MF6A 5CREA 3RHCA 2YJHA 4RUVA 4HQSA 3D5JA 2GS3A 3D6IA 2LRCA 2M46A 1M9BA 1GSQA 1E6BA 3UBLA 3M1GA 1SL1B 2YPMA 3FZAA 3KD0A 2DJKA 5J5NA 2TRCP 4ZIJA 2FWHA 3L9SA 3IR4A 5ECQB 1VRSD 4WR5A 4V2MA 3WGXA 4NV5A 1EWXA 3F3QA 1XW9A 2MMAA 1Z9HA 1FVKA 1OC3A 5DJMA 2LRNA 1V2AA 1EOGA 3TRPA 1F9MA 3NIVA 2DIYA 4X43A 5IO2A 4KE3A 1VF2A 1VF4A 4NV2A 3KIJA 4MPGA 2X8CA 3CSHA 2H6YA 5AN1A 2R3XA 3QDNA 2HT9A 2WULA 2Z9SA 4HU9A 1PKZA 5HR3A 1JZRA 3HVVA 1DBYA 4ISDA 2F8AA 2FWEA 2GSRA 1V98A 5KN3A 4PUFC 3W8JA 1Q98A 4XS4A 3MSZA 4WXTA 1BX9A 2G0FA 3L9VA 2X8GA 2LKUA 4GLTA 3TKPA 2L4CA 4TR1B 3CSIA 1XOAA 2X8HA 3PR8A 4KAEA 2IN3A 2XPEA 3UJ1A 1WE0A 4G2EA 2IWTA 5G2ZA 4IQ1A 4IBPA 1Z5YE 4X1UA 4CDOA 3VWXA 3H79A 3GKMA 5IO0A 1LJRA 1NHYA 2VCTA 5DCGA 1X9WB 5LCZA 1X5EA 3QFBC 5D73A 3APSA 1A2JA 2LSTA 2E2MA 3M3MA 2EC4A 5ID2B 2H6ZA 1HQOA 1B9XC 2C3NA 4MJBA 1I5GA 1FAAA 3C1SA 4HDEA 5J4UA 4AJ7A 5ECPB 3CMIA 4EDZA 2HYXA 4TXVA 1XVQA 1TU7A 2B7JA 1U6TA 4WEYA 4DSSB 2A2RA 3FEUA 3M9JA 3ZMKA 1TDIA 1XIYA 3SBCA 3PINA 3KCMA 5JCUA 2IPAA 2LJRA 2OACA 4ML6A 2FHEA 1AQWA 2OBKA 5ABRA 2GQKA 2PVQA 3KEBA 2H1GA 3CYNA 2WJUA 2IIYA 1AW9A 1T3BA 2GZYA 5DAKB 3LSZA 4QL9A 2E7PA 4XRDA 1PKWA 4ULXA 1TTZA 3Q74A 5B6NA 1S3AA 1GRXA 5G1KA 3LJRA 1PRXA 1Z7PA 2FY6A 5ELAA 1AQXA 4ZB8A 1ZL9A 4NWYA 1K0CA 3FR3A 1T4YA 4K9ZA 3EURA 3F3RA 1X5DA 1VF3A 2XHFA 4HQZA 2PWJA 3IBHA 3PGTA 4N30A 2CZ3A 3GX8A 4FYBA 1SD8A 2OE0A 2CQ9A 1V57A 3HCZA 2WCIA 8GSSA 3CRTA 3FZ5A 1SKRB 1JZWA 1H75A 19GSA 2K6VA 5D9VA 3KH9A 1A2MA 1M9AA 1OYJA 2H75A 4WF4A 3DKSA 4PQ1A 5G5EA 2WGRA 3HVXA 3ZTLA 1IYHA 2HXKA 1K3LA 2GQMA 4KCAA 3CSJA 3C1RA 3VK9A 4IQAA 1ERWA 2I9HA 1PN9A 1WOUA 1EGOA 2K18A 3QOUA 4BVYA 2DMMA 3M8NA 4YAVA 1ERTA 2YWNA 2X99A 2YWIA 1B9YC 1JZDA 1K3YA 2DBCA 2FWGA 1G6WA 4XRAA 5F05A 4HZ2A 1K0OA 4TOPA 3VWWA 2DJ2A 3P2AA 2PMTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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