2A5SA

Crystal structure of the nr2a ligand binding core in complex with glutamate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
278
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport,membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR2A subunit
total genus 82
structure length 278
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5sA02
1RYOA 2V25A 4DE8A 1H44A 3PD8A 2OK2A 4XXUA 4LZ5A 2QRYA 3UN6A 1O7TA 1IXGA 4GF8A 5JTYB 5JTYA 2DE2A 3IR1A 3UORA 2PYYA 1WDNA 4M4GA 1IXIA 4IO2A 4O3BA 4ELPA 1XOCA 2D21A 3OENA 2HAUA 4OERA 3KOTA 5CBSA 3O97A 4QRZA 4RA1A 3S9LC 1MM7A 2F7CA 2H5YA 1MY4A 4R9GA 3G3IA 2QL3A 4H1XA 4ZEBA 1IQ7A 5H8NB 1B3LA 3S4UA 3I6VA 1N7XA 1B1HA 2OJTA 3M3LA 3DP4A 2E1SA 2PX1A 2H99A 3TQWA 1LAXA 4C0RA 4LATA 4F3GA 1TT1A 1DPEA 3KJTA 4XKPA 3CI8A 4NF8B 1DTZA 2E0SA 4MLVA 3OO9A 4LONB 3G3JA 1US4A 1AOVA 5I2NA 3H6TA 1DTGA 3ILUB 1LLSA 2ZNUA 2XXXA 1JW1A 4RPNA 1FW0A 2XXQA 3MBPA 3K01A 2OZZA 1FTLA 3VXCA 3WAFA 2AYSA 1MXWA 2HXWA 3PMVA 3SEXA 3K6WA 3O28A 4MBPA 4UACA 3M3KA 4NF6B 4OMBA 4NF6A 1B7UA 4JWOA 5CMKA 3OO7A 3DP6A 4KQPA 4F1UA 1B40A 4RJZA 4H5GA 4BDRA 4FE8A 4TLLB 4Z0IA 5CBRA 1OIBA 4LZ7A 2DE4A 3RUMA 3U92A 1IEJA 4XKRA 2RF1A 5I59B 4YB6A 2QS4A 1M5DA 1P1OA 5I59A 4DIGA 2O51A 3MVZA 3BFUA 2O69A 4G68C 4G2ZA 2Q2AA 1Q1KA 5TP9A 1VSOA 4F29A 4PE5B 3K1NA 3KZGA 3CSBA 3GBBA 5ICTA 1B3FA 1MH4A 1DPPA 2V3UA 4R72A 3TTNA 2OLBA 2Q8JA 2IEEA 3TTMA 3PUXE 3S9MC 2VD3A 2M8CA 1D3KA 2ONKE 2ZYNA 2Q89A 3OELA 4R74A 2XD2A 4N07A 1B7ZA 4HCWA 2CMOA 1MY1A 2ABHA 4F3SA 3K2DA 3UGWA 5ITOA 3PPRA 1AIVA 3Q29A 1TFDA 3VXBA 4ESXA 2I49A 3KEIA 1USYH 1O64A 2I6EA 3PPNA 1H3DA 4ELOA 4R6HA 1ZJLA 2O6AA 2PT1A 3FZVA 3PUVE 4NWCA 3C35A 3Q27A 4IO4A 1N3WA 4PETA 4PFYA 2HAVA 3Q26A 3Q28A 5H8HB 3ZKKA 3S9NC 5H8HA 1L5TA 4MF3A 4GL0A 1ZMGA 1XHYA 4NTLA 1OQGA 2X7QA 1IZ1A 1LAGE 2F35A 4H6DA 1Q35A 2I4CA 3HHFA 3FV2A 3FXRA 3CG3A 2ANJA 2X26A 3FJMA 2FA7A 4YAHX 4GIZA 1S7YA 1QUIA 4R73A 5AA3A 2XXPA 5KZTA 4YKIA 3RY3A 5DEXB 4N6PA 3K1MA 3VVFA 3PMWA 1MQGA 1HSEA 2QS2A 1ANFA 2Z8FA 4GFRA 3IO4A 2VOZA 1FQBA 3VLWA 1NMUA 3UK4A 3IB2A 3MWBA 4JDFA 3O66A 3Q25A 3U94A 5CMBA 1MH3A 1MQIA 1JNFA 3PMXA 1SW1A 3L6HA 1DMBA 3PD9A 4HCYA 4KCDA 4IGTA 2O7UA 2B3BA 3FVKA 3WAEA 3H03A 2DXYA 2WKYA 4RYAA 4ESWA 1Y1MA 1SYHA 1YTVA 2UVHA 1EH3A 4FJPA 1XVYA 3T96B 2DOJA 1P1WA 5A5XB 2Z22A 5A5XA 3U93A 1BP5A 3N6UA 3ECRA 2VGQA 5HPQA 2H4IA 4P0IA 1MQDA 3MPLA 2YPNA 3W9VA 1XVXA 2H9BA 2Z8DA 2QSXA 4KCCA 1A8EA 1NNFA 1DOTA 3OSQA 1A7LA 4KR5A 4ZEDA 1P1NA 2DWIA 5FHNA 2OCUA 4MFIA 3KBRA 3L6GA 3JZJA 2KLFA 3TDJA 4H65A 2Z23A 3TODA 4F3BA 1SYIA 1JETA 2XXYA 4OWDA 1MPBA 3T9UA 3CFXA 1PB8A 4BDNA 3UIFA 3W9WA 5DVFA 2I0BA 4E0XA 4XKQA 4KHZE 5CMMA 5TPAB 3K1PA 5TPAA 3IOVA 4F19A 1MXVA 1B3EA 1GV8A 1I6AA 3FV1A 3FXQA 3EHSA 5I57B 4X9TA 3UA8A 5I57A 1A99A 3TTKA 3FASA 1B58A 4NF4A 1MG1A 1IIWA 4KFQA 4PFWA 3PUWE 4G4PA 1D4NA 3KN8A 3DLNA 1B5IA 3MP1A 4F18A 2I3WA 2RC9A 1US5A 3PUYE 5HBCA 3GZGA 4OXVA 1JEVA 2XHDA 3RQTA 5B7DA 1Z7ME 1H45A 3IOWA 4ZDMA 1HSJA 1MY2A 1P1QA 1N76A 2FYIA 2GHAA 5H8QB 1N84A 1AL3A 1MS7A 1B05A 4RXLA 3O6IA 2R6GE 3UP9A 3M8UA 1FQCA 4MLQA 2REJA 3CG1A 4IO7A 2F97A 2QS1A 4QSDA 4JXIA 2F8DA 3QUJA 2B3FA 4Q0CA 1GTKA 1UQWA 4AB6A 1URDA 1MRPA 1O63A 3IB0A 3LSLA 3VE1B 2ZYMA 3V8XB 1MXZA 5AA1A 2DSFA 3OO6A 1USYE 3PPOA 1POY1 3SEYA 4ELQA 3MW0A 2QPQA 4DDDA 1Y3NA 3HO7A 3RGYA 2RC8A 1SVXB 2F36A 3RLFE 3S2VA 3IB1A 1CB6A 4IB2A 5TU0A 1OVBA 4YMBA 1SD3A 3TCGA 2THIA 5B70A 5ISUA 3PU5A 1M5EA 1PB9A 3H06B 1LB9A 3JYRA 1BTJA 4JB7A 1YPNA 4F2OA 3RT6B 5FHOA 5I2NB 5AA2D 4O3AA 3T66A 4I62A 4NF5B 3OXNA 3MZ9A 3QSLA 4NF5A 1FCKA 4TLMB 2OWSA 2Y84A 3EHTA 1ZKBA 4WXJA 4M1VA 3FD3A 5AE4A 1MPDA 5I84A 1ZBMA 2DXRA 4ELRA 1AMFA 1MDQA 1NFTA 5KCJB 3R7XA 2GHBA 5KCJA 4Q30B 2VHAA 3ONMA 2NUVA 5DYHA 2RC7A 1N0TA 5I56B 1B52A 4ZEKA 5I56A 2CZLA 2DWHA 4QFPA 3E3KA 2Y7RA 1XT8A 5DVJA 3KFMA 4BLAA 3TELA 1I69A 5L9SA 1N7WA 1BKAA 5EYFA 4RY1A 3ZSFA 1TFAA 4ZECA 1Y3QA 2RINA 2Y7WA 4FIMA 3PGFA 3IOUA 3OO8A 5TP9B 1FQDA 4C1TA 3RTWB 3G7WA 5F7VA 3OSRA 4N13A 1LGBC 2P1SA 4F22A 3CFZA 4G77A 2F7BA 4TQUQ 4ZS9A 2GRVA 1IITA 5FHMA 2ZNSA 4HTGA 4UA8A 4OQOA 3TPAA 1OLAA 3B6WA 4QFKA 3MC2A 2G93A 2HFBA 4ZE8A 3D4CA 2HEUA 3SKPA 4G68A 3B6QA 1Y9UA 2F6GA 4EDPA 3PUZE 4F39A 5M2VA 3CRBA 2PVUA 1QUKA 4POXA 3O2AA 1J1NA 1OMPA 3KN7A 3H4ZA 1PBPA 1LBBA 1IUDA 1D9VA 4EQ7A 3O9PA 3OD7A 1QW0A 2QS3A 3K6VA 2O1LA 2OBGA 2B65A 2Q2CA 2Y7IA 4FAJA 2X7PA 4G8NA 3U72A 3VFJA 4PQJA 3RNNA 4F3PA 3K6XA 2ZYOA 1D9YA 3LSFB 3EPEA 2R9JA 2DVZA 1UTBA 2FNCA 5H8FA 4EF1A 4OZ9A 4F1YA 1I6BA 4QF9A 5I58B 3GXAA 4GXSB 5I58A 1B0LA 3HCQA 1QVSA 3FVGA 3G3FA 1HSLA 3RPWA 2F6PA 4OETA 4OHNA 4LP2B 1NNKA 4X1DA 1NH8A 3HPIA 3N94A 4AQ4A 3K6UA 1IXCA 4LQ5A 5IKBA 4F31B 1LFGA 3V5AA 2QMWA 4LUBA 2I48A 1FTMA 1PDAA 1MY0A 2I4BA 4WEPA 4OESA 4H0WA 2XXHA 1H43A 4KPTA 2ONRA 4QHQA 2UVJA 4ISUA 5FTHA 5BWJA 1UIUA 4ND9A 3IX1A 3H6WA 1RYXA 2PMSA 2F34A 1B6HA 1B1XA 4R75A 2QJEA 3ZKLA 4POWA 5CC2A 3BBRA 5F1QA 4GOTA 1A8FA 1R9LA 2I3VA 5EHSA 3G3HA 3U1OA 4GWOA 4NEDA 1T0KA 3OMBA 4FATA 4NMYA 3ZS6A 3CR9A 1VFEA 3OEKA 3H3GA 3K02A 4OEUA 2XXRA 1SI1A 1SDXA 1FQAA 2D3IA 1TXFA 4XKNA 3CSGA 3QIMA 4F1VA 1EZOA 2UXAA 4YB7A 2XXWA 2DP8A 1PB7A 4IGRA 1P99A 4H8JA 3OEMA 5K2YA 1SW5A 1FQEA 2Y7PA 4XTCQ 1OLCA 3E9XA 4ZZAA 4FECA 1WVJA 3TUSA 4WEDA 4GRKA 1MXYA 3FXUA 3DM0A 1B32A 4IO6A 3H7MA 4LVQA 3MVWA 4U21A 4G8MA 3TTRA 4O3CA 1BLFA 1QJMA 3K0VA 3HHGA 5IAIA 4IO3A 4GXAA 3IAZA 3P7IA 3AXFA 3T22A 3OOAA 5DT6A 1B4ZA 4NF4B 4LQ2A 4QFOA 4EF2A 1LFIA 4OYVA 3LUYA 2ZMBA 4DCYA 4QSEA 4EQ9A 4YZZA 3SERA 5CI5A 1B51A 2D5WA 3TYHA 3PV0E 4FEBA 3M3FA 1SW2A 2UVGA 1VR5A 4JSOA 4HW8A 3MQ9A 3H6VA 1NKXA 5K2XA 1Y4CA 5EHMA 3TZAA 4LA9A 2R71A 1XS5A 1R9QA 2W7YA 3VLUA 3G3KA 1RKMA 4THIA 1UTHA 1TWYA 4YKPA 2RCAA 3D4GA 2ALUA 4YKJA 3TTLA 3SDFA 3R6UA 3T9HB 1Y4TA 2PBWA 3C4MA 1MXXA 2DS9A 4PP0A 4BDQA 3FJ7A 3ILTB 5I2KB 5I2KA 1F9BA 1JEUA 4U1ZA 3RT8A 1SBPA 4IY5A 3ODBA 3MVYA 5CM6A 2DVCA 3I5OA 4KD5A 2NOOA 3HSTA 3T93B 3VVDA 3A3UA 5ELVA 3V89B 4QFNA 1NL5A 2HCAA 4H8IA 1B2HA 4YICA 1NNPA 4DXCA 1JQFA 3TCFA 4P0GA 4P11A 3IO6A 3O6GA 2H25A 1AH5A 3T9XB 1P1UA 5H8NA 3RTFB 2IA4A 3EF7A 4K3FA 3T9VA 3IOTA 1B4HA 3MP8A 3O6HA 2REGA 3IJOB 2DYXA 1H76A 1PC3A 2O7IA 3IK6B 1POTA 2G29A 3VVEA 4IY6A 2ZNTA 4DXBA 4MH5A 3FATA 1CE2A 2GFEA 1R1NA 3FUZA 2XX7A 1B5JA 3QXMA 3USDA 4NF8A 1UIVA 1MXUA 4YU0A 3IJXB 3BFTA 4EQBA 1LCFA 2P0SA 4H5FA 3EN3A 4HS7A 2DE3A 3LC8A 1ZU0A 2NXOA 4ZEIA 4GD5A 4OTEA 2O1MA 2F78A 4QSCA 1PEBA 5JEIA 3MVXA 3MZBA 5LOMA 1A40A 1YCJA 3C34A 2V3TA 4RK9A 1KWHA 2XX8A 3LSWA 4R9FA 1R6ZA 4NWDA 3IL1B 3TEPA 3MJNA 4DLDA 1M5FA 1NNTA 4GVOA 1MPCA 1EZ9A 2F7AA 3QAXA 1EU8A 3VLVA 1JW4A 1JVXA 3SESA 3GLBA 3TMGA 1IXHA 1B7HA 4OFLA 3C36A 1DSNA 2Y7KA 5L8DA 1N3XA 4U23A 4H67A 2Z8EA 4BDLA 2YJPA 4PFUA 2RCBA 4TOZA 3R26A 1GGGA 3DELB 4QFLA 5H8SA 3C33A 2UYFA 3IORA 1S50A 1MDP1 1M5BA 4ONYA 4YB5A 1LFHA 5AA2B 5AA2A 4DCXA 3MPKA 4G68B 2VD2A 2BJJX 3QYTA 3BKIB 4F2QA 2HZLA 3KSXA 4I1DA 3SEUA 2Q9TA 2NWJA 2UVIA 4I8CA 3FIRA 4RPOA 4ZZEA 4X48A 1B0HA 1LSTA 4EXKA 2LAOA 3PPPA 1URGA 1LAFE 3C32A 3C9HA 1QKAA 2XD3A 1FTOA 1B3HA 1I6QA 3FJGA 4YKKA 4KI0E 2HQ0A 3MAMA 4JWYA 4LZ8A 3KGCA 4GQOA 1WODA 1VFDA 1OVTA 3HN0A 1SW4A 4NE4A 5DVIA 4DZ1A 2I58A 1JW5A 3KN3A 4GLIA 3SEWA 1Z7NE 2YLNA 3GBAA 4FORA 4IO5A 5CMCA 2XXIA 1MQJA 1UTBB 4GL8A 4EUOA 3TFLA 3FVOA 1MM6A 5H8FB 2AL5A 3LBSA 1PBQA 4OFJA 2PT2A 2Q88A 4KYEA 1FQFA 1Y3PA 3N5LA 4KYDA 2A5TB 4X1BA 2A5TA 1Y20A 1B5HA 3B6TA 2HZKA 2XXTA 4OFOA 3K00A 2VP1A 5L9OA 4FEDA 3TKDA 3F11A 1MY3A 3QK6A 3TCHA 1B9JA 3RN8A 1XC1A 3PPQA 2ONSA 1ATGA 1Y1ZA 4OVJA 2OWTA 2A5SA 3K4UA 5BUUA 1N04A 2O84X 5DEXA 1JVYA 2AL4A 2ZYKA 3TAJA 4BDMA 3QUFA 3LSXA 1LCTA 4R6YA 2DWJA 3EHUA 1B46A 2NVUB 3O29A 4Q8RA 4EXLA 4KYSA 3KSJA 5ICQA 3MZ1A 3KJ7A 3JV9A 2QMXA 3KOSA 2O68A 4ECFA 2F5XA 4DXUA 4JSDA 4RNSA 1B3GA 3DP8A 1GVCA 4U4XA 1S9TA 4I9DA 1EZPA 2V84A 5KDTB 1QUJA 3CIJA 5KDTA 2DQVA 4Q5TA 3SETA 1ZIUA 2H98A 3N6TA 3EQ1A 5CRYA 1QKBA 4OENA 4R6KA 3MP6A 1A55A 5JK4A 4RK2A 4ZE9A 5HM4B 3W15C 3CFLA 3U8QA 4AB5A 2RKMA 4JWXA 1ZLQA 4JBZA 3SEVA 1II5A 3LR1A 4C1UA 1LAHE 4PFTA 1VE4A 1LBCA 5DTBA 1ELJA 2DWAA 4R2BA 2P2AA 3S9EA 3FGSA 4ZEFA 3A09A 4Z7EA 2ESNA 1SI0A 5FTIA 3H6UA 2ZXTA 4L17A 4WKMA 3VDFA 4U1OA 1MQHA 2V93A 2XX9A 4OEVA 1LB8A 1BIYA 4G8HA 2AIXA 3HV1A 4R2FA 4U22A 4U2RA 2I0CA 3CVGA 2XXVA 3THIA 2UYEA 4XIGQ 1SQYA 5J1DA 3FVNA 3C31A 3VV5A 5AA4B 5L9MA 3TQLA 5AA4A 2XXUA 4U4SA 2GH9A 1A54A 1QULA 4E0WA 3E13X 1M5CA 1NH7A 3N26A 3A3CA 3KG2A 3E4RA 4BDOA 3I3VA 3MUQA 1OQHA 1FTJA 5ITPA 1URSA 4YMAA 1UTHB 1YAEA 1GR2A 1ZTYA 3V83A 3G3GA 3B7DA 5H8QA 1FTKA 2V3QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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