2A5SA

Crystal structure of the nr2a ligand binding core in complex with glutamate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
279
structure length
278
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR2A subunit
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Metal transport,membrane protein
total genus 82
structure length 278
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5sA02
4NF8A 3T9HB 1Y3NA 2Z8DA 2ZMBA 4U2RA 1D4NA 1B9JA 3ZKLA 1T0KA 1MY3A 5BWJA 4GRKA 2QPQA 4FEDA 1LGBC 4QFLA 1MS7A 1A8EA 3KOSA 3SERA 3K02A 1IEJA 3MC2A 5JTYA 1B51A 1SYHA 4RJZA 1MQDA 2DE3A 2XX7A 3THIA 2V3QA 4JWOA 4GL0A 4ONYA 3TDJA 4Q8RA 1AL3A 4JSOA 2OWSA 1URDA 1B5HA 2XX8A 4R75A 3PV0E 1MXWA 4F18A 1JVXA 4OFOA 4X1DA 2W7YA 2NXOA 1SI1A 2QL3A 2PVUA 2UYEA 1Z7ME 3H3GA 4M1VA 2VD3A 2OJTA 3BFTA 3IOVA 4Q0CA 4UA8A 1XVXA 4ECFA 1SVXB 1PB7A 4TLMB 4O3CA 3K6XA 2D5WA 4XTCQ 1MY4A 3VV5A 5I58B 2PT1A 1RYXA 2Q2AA 3IJOB 1AH5A 5CRYA 3UGWA 2B3FA 2B3BA 4Q30B 2AL4A 3L6HA 3SEUA 3TCHA 5J1DA 1MQGA 3K0VA 4TQUQ 1LAXA 1B7UA 1M5BA 1NNFA 4F29A 2F36A 2D3IA 4ELRA 4GLIA 3HV1A 4NE4A 5AA1A 4FAJA 2BJJX 2REJA 2DP8A 3IX1A 5H8HB 2V84A 2Q9TA 3MPKA 2QSXA 4EXLA 4F22A 1TWYA 5DEXA 4RA1A 3N94A 3S9LC 2XXWA 1JQFA 1DPPA 3H6UA 3T9XB 3DLNA 3TTLA 4NF5B 3KG2A 3OXNA 3RN8A 1B1HA 1PB9A 4P0IA 4C1UA 5FTHA 2RC9A 3K2DA 4LP2B 5L8DA 4NF8B 2XD3A 1NH7A 1Q35A 2UYFA 4OXVA 1DSNA 4I62A 2F34A 2ALUA 4OESA 4QHQA 3O6GA 3B6TA 3MVZA 2A5TA 3Q27A 5EHSA 1P1WA 3UN6A 4QFPA 2F6GA 5JTYB 4ZZEA 4WXJA 5ICQA 3N6TA 2E1SA 4Z0IA 3O28A 2H9BA 5AA4A 1H43A 1QUKA 1VSOA 4JDFA 4F1YA 1B4ZA 3MP8A 1AIVA 1US5A 4DLDA 1LB8A 3S2VA 1R1NA 4ZE9A 3RGYA 3IB1A 2VHAA 4I8CA 5ITOA 1WVJA 1EH3A 4F1UA 3V83A 1FW0A 1IITA 4PE5B 2DE4A 1FTKA 4GL8A 1OQGA 2GHAA 5FTIA 3LSWA 3TTMA 1YPNA 4AB5A 4DDDA 4RPNA 3VVDA 1IXIA 4Z7EA 2NVUB 4ND9A 4ELQA 2XXRA 1QKBA 2R6GE 3M3LA 2UVJA 2AIXA 4U4SA 2D21A 3ZKKA 2XX9A 3TAJA 5EHMA 2RCBA 2DOJA 5I2KA 2ONKE 3SETA 1ZTYA 3U94A 4UACA 4RNSA 4ELPA 5FHMA 2X26A 3HSTA 2XXPA 3PUYE 4U22A 5H8QA 4MF3A 2Q8JA 3IO6A 4U1OA 3PPPA 4QRZA 2X7PA 4YKJA 3DM0A 2GRVA 2Q88A 4XKQA 1FQDA 5DEXB 3AXFA 4LATA 1N04A 3S9NC 1PC3A 4KFQA 3MP6A 3RPWA 2F97A 2ZYOA 2HFBA 5I84A 3PD8A 2ABHA 1EZOA 1XHYA 4L17A 4KR5A 1MXXA 2FA7A 1B5JA 1N3WA 4X1BA 2M8CA 2DQVA 3QSLA 1Y4TA 2PYYA 1B4HA 2O7UA 2YJPA 3SEVA 2I0CA 5JK4A 1ZLQA 4NF6A 2A5TB 2Z23A 3T96B 4ZEDA 3SEWA 5HBCA 2I3WA 2NUVA 4POXA 2RCAA 3CSBA 5L9OA 5DTBA 1IXCA 2ESNA 4R72A 3A3CA 4H5GA 5AA4B 4FATA 4F3GA 4FJPA 3CG1A 5DVJA 4XKPA 4E0WA 1SYIA 4H8JA 3MWBA 3K6UA 1DTGA 4EQ9A 2UVHA 3FVGA 4U1ZA 3O6IA 4MFIA 4LZ5A 3LSLA 1O7TA 2I58A 4YB5A 3C4MA 2DYXA 4ZDMA 4H67A 4IO7A 3SESA 1QUIA 4OVJA 3CVGA 4YKIA 1SW1A 1B52A 4U23A 5AE4A 1MG1A 3C35A 4C0RA 1H44A 3GBAA 1P1UA 2NOOA 1SI0A 2XHDA 3OO8A 1LFGA 4EQ7A 4BDLA 1FQEA 2HAVA 5I2KB 3OSRA 5DVIA 3N5LA 5CMCA 4OENA 4F3BA 5H8QB 2HZLA 3KEIA 5ICTA 5ITPA 4C1TA 1PBPA 2PX1A 3OENA 2QMXA 4OFJA 4BDRA 1N76A 3OO6A 4OZ9A 3DP4A 1H45A 3T9VA 1GR2A 3W15C 1PBQA 3TELA 1M5EA 4EF1A 1IUDA 1VFDA 3EHTA 3FGSA 3VLWA 4NMYA 3B6WA 5AA2A 1DMBA 2DXYA 3MVWA 1GVCA 1BKAA 1SQYA 2XXIA 3K1NA 2GFEA 4ZECA 4XXUA 4NF6B 4X9TA 4KYDA 2I6EA 4R2BA 4IGRA 1R9LA 5IAIA 4GIZA 3IL1B 3N6UA 3Q29A 1MXZA 1ANFA 2PMSA 1ZIUA 1QVSA 4HCWA 3KSJA 3C31A 4YAHX 1MQHA 2IA4A 3GXAA 4G68A 3MQ9A 4MH5A 5IKBA 3OO7A 3G3JA 5F7VA 4IO6A 2O1MA 2IEEA 5I59A 4KPTA 2FNCA 1B40A 4GOTA 4JWXA 3B7DA 3RTWB 2O69A 1N7WA 3C33A 1FCKA 1B6HA 1XC1A 1FQAA 3MBPA 1YCJA 3PPQA 3K00A 3FVNA 2QS2A 4OEUA 1II5A 3FUZA 1HSJA 1UQWA 1J1NA 3DELB 1B0LA 4M4GA 3DP8A 4XKNA 5K2YA 2R71A 3IOUA 3ECRA 3O97A 3CG3A 4QSCA 2DS9A 1B3GA 3IO4A 3TYHA 4YB6A 3SEXA 4N07A 3MW0A 3QUFA 1MXYA 3TPAA 3TODA 1FTJA 1Y9UA 4FECA 2RC7A 1LSTA 3C9HA 3S4UA 4G68C 1NFTA 3ZS6A 3B6QA 4HW8A 1A7LA 3EN3A 2ZNTA 1N0TA 1H76A 5AA3A 4DIGA 3O66A 2Y7RA 3PU5A 4OETA 3A09A 4ESXA 5AA2B 2OLBA 3K1MA 2XD2A 4PFYA 1A55A 2V25A 1URGA 3D4CA 2YPNA 1N84A 1M5CA 1P1NA 1GV8A 3QXMA 1B3FA 4GF8A 1HSLA 2I0BA 3FATA 4N13A 2XXYA 2UVIA 1JEVA 3IOTA 2PBWA 3FXRA 3R6UA 4P0GA 4XIGQ 4JSDA 3VDFA 3H6VA 4BDQA 1FQBA 4LQ2A 5CBSA 3TTRA 2VP1A 4H1XA 4GWOA 1P1OA 5I2NA 2WKYA 4OFLA 3IORA 1JEUA 3UORA 3JYRA 4F3SA 1F9BA 1QUJA 4G68B 3TUSA 5I56A 4GD5A 4NF4A 2A5SA 3CFZA 5F1QA 1BIYA 3C32A 2F7BA 3HHGA 5LOMA 5I59B 5TU0A 2XXQA 3S9EA 3OEMA 1WDNA 4EUOA 4NWCA 1MDQA 3HN0A 3M3KA 3ODBA 2QRYA 1EU8A 4HCYA 2XXHA 4LVQA 4DXUA 2P0SA 3MVXA 2DWAA 3EPEA 4KYSA 2VOZA 4AQ4A 1MPCA 2E0SA 2CMOA 1MQJA 1N7XA 4QFOA 4DE8A 2H4IA 3K01A 3OO9A 3RT6B 2DXRA 3TMGA 4R73A 3KOTA 4YKKA 3MZBA 3W9WA 2Z8EA 3OD7A 2HQ0A 1B1XA 3P7IA 3PPRA 4OHNA 4IO3A 3E3KA 3KSXA 1MH4A 3MPLA 3IJXB 2DVZA 3KN8A 2OBGA 3Q25A 3QAXA 4H0WA 4GVOA 1PEBA 3KZGA 3RLFE 1EZ9A 3BBRA 4LA9A 2P1SA 1OQHA 1OLAA 4RXLA 3CFXA 1B3LA 2CZLA 4LQ5A 1FTLA 3KBRA 3O2AA 4KHZE 1I6QA 3ZSFA 1A54A 2HCAA 4ESWA 2F5XA 3U1OA 3IAZA 1A40A 3T22A 1FQCA 4YMAA 3V5AA 1PB8A 5TP9A 1IXGA 1Q1KA 4X48A 4IB2A 2QJEA 2I48A 3VLUA 3H4ZA 4OYVA 1BLFA 4G2ZA 2F7CA 1MM7A 4DXBA 1MDP1 1I69A 3VVFA 1Y3PA 4ZZAA 3FV2A 3QIMA 3GLBA 4AB6A 4RY1A 4U21A 1LCFA 3OEKA 5I2NB 5JEIA 4F39A 2F8DA 3R26A 3LSXA 3KJTA 5I56B 4BDMA 2DE2A 4NF4B 5CMMA 5DT6A 3QUJA 4G8HA 4N6PA 1POTA 2ZXTA 2I4CA 3OSQA 1P99A 3ONMA 5HM4B 2OK2A 1AOVA 2QMWA 2XXTA 2NWJA 5AA2D 3FIRA 3CRBA 3RT8A 2DWIA 2ZYKA 1SW4A 1OMPA 1ATGA 1O64A 1Y3QA 5CC2A 5TPAA 2RKMA 4HTGA 3VVEA 4F19A 4R9FA 3LR1A 3USDA 3FASA 3D4GA 3LC8A 3KGCA 3TCFA 4POWA 3OMBA 3IB2A 2F7AA 4JXIA 3MZ9A 3FJGA 1LFHA 4I1DA 2THIA 1SD3A 1NMUA 4OEVA 4R6YA 2Y7WA 1QULA 4H65A 3G3GA 4DCYA 3C36A 3E4RA 2V3TA 1LAGE 4BLAA 3PD9A 1NL5A 1AMFA 3U72A 2I3VA 1UTBB 3HPIA 3PMXA 3G7WA 1I6BA 3SEYA 2Z8FA 1ZKBA 3O29A 3L6GA 4LZ8A 4H5FA 2RC8A 1SW2A 1S50A 4OMBA 4KI0E 4YKPA 1NNKA 3TZAA 4RPOA 5EYFA 2F78A 3PPOA 5TP9B 1IIWA 3H06B 2V93A 1USYE 4JBZA 4NWDA 1TT1A 1R9QA 4R2FA 4TOZA 2QS1A 3FXQA 4GXAA 5H8NB 1D9VA 4OQOA 4G8MA 2ZNSA 3K6VA 4IO5A 4ZEKA 5K2XA 3E9XA 1RKMA 1BTJA 3U8QA 1B58A 2OZZA 4F2OA 1FTMA 2DSFA 4R6HA 1IXHA 4YICA 1UIVA 4G4PA 2VD2A 1S9TA 4O3AA 1EZPA 2FYIA 2I49A 1ZJLA 1FTOA 2HAUA 1Z7NE 1OVBA 1S7YA 3LSFB 1L5TA 3BKIB 2Z22A 2ONSA 4GXSB 5TPAB 1Y20A 1XVYA 4PFWA 4FE8A 2O1LA 2OWTA 2O6AA 4YB7A 3KN7A 1XOCA 2UVGA 5FHNA 1US4A 4F3PA 2V3UA 4KCCA 1MRPA 2XXUA 1TFAA 2ZYNA 1B5IA 3RUMA 1LBCA 1WODA 5BUUA 5KDTA 1LBBA 3U93A 3H03A 4RK9A 4IGTA 1MY1A 2DVCA 4BDOA 2Y7PA 3S9MC 4THIA 3N26A 3ILUB 1P1QA 3VXCA 1B32A 1QKAA 3BFUA 4R74A 1B3HA 4O3BA 3TCGA 1LFIA 3HCQA 3VFJA 1GGGA 5CMKA 1UIUA 2X7QA 1MY2A 1PDAA 3GZGA 4LONB 3CI8A 3MJNA 4QSEA 4QFKA 3FJ7A 4WEPA 2QS4A 2HZKA 1SDXA 3CIJA 3TKDA 4BDNA 2G93A 2AL5A 3HO7A 4MBPA 1MM6A 1M5DA 1A99A 4K3FA 3LBSA 4EDPA 4MLVA 3OELA 4GFRA 1MXVA 2REGA 4FORA 1JNFA 3RTFB 3IOWA 4PQJA 2KLFA 5DVFA 2ONRA 1MPDA 3M3FA 1MXUA 3V8XB 4LZ7A 1ELJA 5CMBA 5I57A 1D3KA 3PMWA 5L9SA 1YTVA 3F11A 3FD3A 3K6WA 4ZEBA 4PFTA 3I6VA 1LAHE 4I9DA 3FZVA 3O9PA 1ZBMA 3SKPA 3H7MA 4R6KA 1KWHA 1MQIA 3FJMA 2ZNUA 1M5FA 5H8FA 1B3EA 2G29A 1TFDA 4U4XA 1VR5A 4DXCA 4JWYA 4ZS9A 3O6HA 2ZYMA 5L9MA 3PUVE 4WEDA 1B46A 1XT8A 3MVYA 1HSEA 1LLSA 1CB6A 1B2HA 3WAFA 1LCTA 5ELVA 4OERA 3W9VA 3FVOA 3KN3A 4KCDA 5KDTB 3RNNA 3WAEA 4YMBA 1MY0A 4QSDA 3RQTA 1Y1MA 3T9UA 3PUZE 4E0XA 1N3XA 3TQWA 1B7HA 3I5OA 4HS7A 1UTHA 3Q28A 4MLQA 1CE2A 3T93B 4PETA 1OLCA 3UP9A 2HEUA 3OOAA 3R7XA 3PPNA 5ISUA 1ZMGA 3UA8A 3PUWE 3GBBA 1JW1A 4RK2A 1DTZA 1JETA 1Y1ZA 3FXUA 5H8SA 2O51A 4ZEFA 5KCJA 2R9JA 1ZU0A 3U92A 2F6PA 3KFMA 5DYHA 3CFLA 1BP5A 1UTBA 5B70A 1VE4A 4JB7A 2B65A 3MZ1A 1POY1 4R9GA 3G3IA 1JW5A 5I57B 2VGQA 3TFLA 1DPEA 3FV1A 3QK6A 4IO2A 1B7ZA 4YZZA 3RY3A 3G3FA 3MUQA 5H8NA 4F2QA 4TLLB 3MAMA 1QW0A 2O7IA 5H8FB 1VFEA 5A5XA 2O84X 1SW5A 3TTKA 1NKXA 2Q2CA 4G8NA 1A8FA 1FQFA 3TTNA 3DP6A 4KYEA 3C34A 2DWHA 3G3KA 1NNPA 3CR9A 5M2VA 3PGFA 4WKMA 3H6TA 3K4UA 4F31B 4NTLA 4IO4A 4F1VA 1XS5A 2Y7KA 4DCXA 3MP1A 1LB9A 4Q5TA 3QYTA 3K1PA 1SBPA 4EXKA 3E13X 4FEBA 1I6AA 3Q26A 4IY6A 1JW4A 2Y7IA 4QF9A 4H8IA 3VLVA 4ISUA 1UTHB 3EHSA 3M8UA 5B7DA 3G3HA 1IQ7A 3V89B 2ANJA 1JVYA 4ZEIA 4KD5A 1OVTA 3PUXE 1H3DA 3TEPA 4ZE8A 1URSA 2YLNA 1TXFA 3IR1A 2HXWA 2XXXA 1NH8A 1Y4CA 4PFUA 5KCJB 4LUBA 4P11A 4DZ1A 3SDFA 3TQLA 1MPBA 2Y84A 2QS3A 2GHBA 4EF2A 4XKRA 1LAFE 3EQ1A 2RINA 4OWDA 3H6WA 1YAEA 1USYH 4ELOA 4YU0A 1OIBA 2O68A 2OCUA 3FVKA 3UK4A 5FHOA 1D9YA 1O63A 1MH3A 5KZTA 4OTEA 3T66A 4EQBA 2UXAA 3A3UA 1QJMA 4NEDA 5CBRA 5CI5A 3EF7A 4FIMA 1R6ZA 2Q89A 1B0HA 2P2AA 3IK6B 3PMVA 4PP0A 5I58A 4QFNA 2H5YA 2XXVA 5HPQA 3I3VA 5A5XB 3LUYA 2DWJA 3JZJA 2AYSA 4H6DA 3HHFA 4GQOA 3JV9A 1GTKA 2PT2A 1NNTA 4G77A 3EHUA 4IY5A 2I4BA 2F35A 5H8HA 4KQPA 2H25A 1IZ1A 3CSGA 1RYOA 3IB0A 2LAOA 1DOTA 4NF5A 1B05A 3VXBA 2RF1A 3KJ7A 3ILTB 2H99A 3VE1B 5CM6A 2H98A 3UIFA 4RYAA 2GH9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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