2A5TA

Crystal structure of the nr1/nr2a ligand-binding cores complex
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
284
structure length
271
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR1-4a subunit
publication title Subunit arrangement and function in NMDA receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Metal transport,membrane protein
total genus 79
structure length 271
sequence length 284
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2a5tA02
4RXLA 3FVNA 2P2AA 2XD2A 4ZEKA 2G29A 1B3HA 3G3IA 4JDFA 1NH7A 4G4PA 5KZTA 2I3VA 3IJOB 1GV8A 2Q9TA 2DQVA 1GGGA 4RPNA 3TYHA 1AL3A 2V93A 4BDQA 5KCJA 4IO6A 2DVCA 2ZNTA 3U93A 3QK6A 3EHSA 2ONRA 2XXQA 1B7UA 3VLVA 1EU8A 1P99A 4YKPA 3SEVA 1VFEA 2VD3A 4XXUA 3K1PA 3RGYA 4NF6B 3A09A 4QSEA 3GXAA 5CMBA 5I84A 1N0TA 5J1DA 3T9UA 1A99A 2F97A 3T9XB 3MZ9A 5FTHA 2RF1A 4LZ7A 4JWYA 2V25A 5ITOA 3OSRA 4NF4B 2NXOA 1B05A 3LSFB 4QF9A 5ELVA 1MPDA 4HS7A 2F6GA 4BDNA 1B51A 4QRZA 1Y4CA 3TCGA 2PMSA 1JETA 4F2OA 4U4SA 3ZKKA 2AL4A 5F1QA 5HM4B 1SBPA 3QXMA 3TTKA 5IAIA 4R9GA 4IO7A 3G7WA 3O6GA 4R75A 4TOZA 1O7TA 1A8EA 1ZBMA 2OCUA 3E9XA 1MM7A 2ZYKA 3TEPA 3MP1A 2Q88A 1MH4A 3TTRA 2UVJA 1DPEA 3DP8A 2B3BA 5I57B 3VE1B 2QRYA 5A5XA 1N76A 2F34A 4BDRA 2UXAA 4KR5A 4F1UA 3K6VA 1LBCA 4U23A 1B7HA 5TP9B 2A5SA 1IQ7A 4ECFA 3UP9A 5BUUA 4KPTA 4DLDA 4NF5A 1OLCA 2V3UA 4H8IA 3R6UA 2ZNUA 1N7WA 2V84A 2YJPA 3UIFA 1A54A 1IZ1A 3KBRA 4GQOA 3SDFA 4FIMA 1LFIA 4FEDA 4YAHX 2OBGA 4R6HA 1FQDA 5AA2D 2XXRA 1EZ9A 1US4A 1MM6A 4R2BA 5L9SA 1XVYA 3VXCA 3TODA 5CI5A 4X48A 5I2NA 4RA1A 1SVXB 4ZE8A 2XD3A 1FCKA 2F36A 2PYYA 2FA7A 4KYSA 4LP2B 2NOOA 2ZYMA 3TCHA 3IX1A 3S9MC 3VDFA 5CMCA 1Q1KA 5DEXA 3K0VA 2H9BA 3IB2A 3R26A 1VE4A 1HSEA 3C33A 1FTLA 5JTYA 4OENA 3S9LC 1OIBA 1USYH 3PD9A 1VFDA 3VV5A 1PB8A 5I2KA 1MQIA 2ZMBA 3HV1A 1D4NA 4ELOA 1LSTA 4F31B 2H4IA 3HHFA 3MPLA 4ELQA 2HZKA 5H8FB 1Y9UA 2VOZA 4XKQA 4HCWA 3T22A 3K1MA 2P0SA 1XS5A 3Q25A 1ATGA 1TFDA 3A3UA 5AA4A 1ZJLA 1NKXA 4OFLA 3H6TA 1SYIA 4LA9A 4HW8A 1SDXA 2I58A 2F35A 3IB1A 1Y20A 4ZEBA 2QJEA 3IL1B 1DTZA 1POTA 3WAFA 1IITA 3MVYA 3MAMA 2THIA 3IO6A 2B3FA 2B65A 2DWIA 2F7BA 1GTKA 2F8DA 4TLLB 2Z8DA 3OO9A 3GBBA 3C31A 1UIUA 2QMWA 5ITPA 5DT6A 3FJGA 2PBWA 1XT8A 2XXTA 1A8FA 4R6YA 5CM6A 3HCQA 3D4GA 2QS3A 3N5LA 1MY0A 1Y1MA 2XHDA 3M3KA 1N04A 3FATA 3CRBA 3RT6B 3N6TA 2FYIA 3KJTA 2OJTA 1KWHA 3LSLA 4I1DA 2UYFA 1B32A 3CFLA 2XXVA 3PUXE 1IEJA 1B6HA 3FJMA 1AH5A 1B5JA 3G3FA 1H3DA 5HPQA 4PP0A 3FVGA 4F22A 4R73A 1MXWA 4F3BA 1BLFA 4NF6A 4LONB 3JV9A 2O1LA 2QS2A 1QJMA 3BFUA 1H43A 1BTJA 1F9BA 1Y4TA 3LR1A 2YLNA 4ZECA 4R9FA 3HPIA 5BWJA 1MXYA 4ZS9A 2I4CA 3ZSFA 1ZU0A 4NF4A 2QSXA 4EUOA 2XXUA 5M2VA 4MLVA 1SD3A 2XXYA 2HQ0A 3BKIB 1A55A 1I6AA 3K6WA 3MVWA 4MFIA 3KGCA 1HSJA 4GXSB 1PB9A 1B52A 4GVOA 2I49A 3EN3A 4H67A 3F11A 1YAEA 2I0BA 5KDTA 4JBZA 1LCFA 4YB6A 1LAFE 1O63A 2HCAA 4DCYA 1B46A 2QMXA 1SQYA 1MDQA 3B6TA 1USYE 4XIGQ 4I9DA 2V3QA 3HN0A 3PU5A 3SEXA 1B5HA 3IAZA 1SW2A 4YMAA 3SEUA 1JVYA 5I57A 4GFRA 3RQTA 5I59B 1Y3QA 4EDPA 3ONMA 3W15C 1SW4A 4Q0CA 1LB9A 1FQEA 5I56A 1NH8A 3FIRA 1ZIUA 2F6PA 5DVIA 1DPPA 4KFQA 3ZS6A 1B0HA 4OERA 1UTBB 4WKMA 4X9TA 1I69A 1AMFA 4E0WA 4RY1A 4TQUQ 2R6GE 4DIGA 2P1SA 3C34A 3MUQA 1OVBA 4F3SA 1MXUA 1IXGA 4GXAA 1OQGA 4H1XA 3OSQA 2NVUB 1IIWA 3IOVA 4U1OA 2R9JA 3ECRA 1DOTA 4H6DA 4YB5A 3O2AA 4ZZAA 4IO4A 3KEIA 1D9YA 1N7XA 2XXHA 2D21A 3OO7A 4POWA 4AB6A 4EQ7A 3G3GA 1N84A 3FXRA 2QS4A 2DE3A 4F2QA 4U22A 2CMOA 4GF8A 2R71A 3QYTA 5CBRA 5HBCA 3ILUB 3KN8A 2Y7RA 1POY1 4NF8A 3OO6A 5AA1A 2HAUA 4BDOA 2XXXA 4KCDA 3MZBA 3H7MA 1OLAA 2UVIA 4QHQA 2DSFA 4RK2A 4JWXA 2I0CA 2H99A 4QSCA 1PB7A 2V3TA 4Q8RA 4YKJA 4DDDA 4F29A 2QPQA 1M5DA 2DYXA 3EPEA 2O51A 4ZEDA 1H76A 2QL3A 2DWJA 3KJ7A 1M5FA 4QFKA 3LC8A 4ZDMA 4IO5A 1EZPA 2Q8JA 5ICQA 1B7ZA 3SEYA 2E0SA 1EH3A 4RNSA 1URDA 1BIYA 5EHMA 2OWSA 4YZZA 1QULA 1SI1A 1ZLQA 2A5TB 4OYVA 3V5AA 1VR5A 5L8DA 2AL5A 5AA2B 3CG3A 4LQ2A 1LCTA 3V83A 1MY4A 3B6QA 2UVHA 2XX7A 5TPAA 3PMXA 5FTIA 3O28A 3EHTA 2CZLA 3PMVA 2ZYOA 4KD5A 3E4RA 1XOCA 3Q29A 1D9VA 1JEVA 5H8NA 2Q2CA 5DVFA 3IR1A 3UA8A 1MXXA 2HAVA 4IO3A 1YTVA 4F1VA 3O6HA 5ICTA 1MH3A 3C4MA 4BDLA 5CBSA 3TTLA 3PV0E 1IXIA 2M8CA 2E1SA 3MWBA 4G77A 3W9VA 1JW5A 5CMKA 2Z8EA 5FHMA 1B2HA 1YCJA 2HZLA 1LGBC 3O66A 4KI0E 3SERA 1XC1A 3PPQA 3PPPA 3K2DA 2RC7A 4YKKA 4OZ9A 3K6UA 3FZVA 4GLIA 5CC2A 4XKRA 3VLWA 4WEPA 4QSDA 4PETA 3LSXA 2W7YA 4FAJA 2DXRA 4G2ZA 2I48A 2H25A 5F7VA 1A7LA 3Q26A 2XXWA 1B3EA 4DXCA 2WKYA 3RTWB 2ZNSA 3UN6A 3TELA 4FEBA 4MBPA 5KCJB 1QUIA 3OMBA 3CVGA 3C36A 3K02A 3LUYA 3C32A 5I59A 3QUJA 1NMUA 5K2YA 1D3KA 5I58A 3G3JA 1P1NA 4RPOA 4QFNA 1WDNA 3CI8A 1M5EA 1RKMA 3DLNA 4H5FA 1URSA 1LB8A 3CSBA 2VHAA 2X7PA 5H8HA 4KCCA 4O3AA 4OESA 4PFYA 1B4ZA 4JXIA 3THIA 3CFZA 4OFJA 2O84X 2NUVA 3Q27A 1FTJA 1MPBA 4WXJA 3IK6B 4NEDA 4R72A 4ZE9A 4EXKA 1R9QA 4AQ4A 3KN7A 3TQWA 1PBPA 2REJA 4MLQA 2ZXTA 2ZYNA 3C9HA 3K01A 3FGSA 5EHSA 1MRPA 4R74A 2PX1A 1P1QA 1VSOA 3K1NA 2KLFA 1B1HA 3FJ7A 2VGQA 2OWTA 1CE2A 4X1BA 3TQLA 1AOVA 3JYRA 1PC3A 1US5A 2Y84A 2F7CA 4LZ5A 3MC2A 3VVEA 1FTKA 5H8QB 3MP8A 2Y7IA 1TT1A 4OFOA 3M3LA 1H44A 4LUBA 1NNPA 4NF5B 3PUVE 3EF7A 3T9HB 2GHBA 1UTHB 4FECA 4C1UA 2Q2AA 1OQHA 3RPWA 3KZGA 4PFTA 2Z23A 3OOAA 1FQAA 2XXPA 4GOTA 3OELA 1M5BA 1QW0A 4JSOA 4OWDA 3E13X 2DVZA 2I6EA 4XKNA 4DXUA 3O6IA 4OTEA 2D5WA 3K6XA 5I2NB 3N94A 3O29A 5L9OA 4Q5TA 1WVJA 1ZKBA 3I5OA 1LBBA 3HSTA 3PPRA 1ZTYA 4IGRA 4F39A 1IUDA 1BP5A 1GR2A 3CR9A 1O64A 4O3BA 3CIJA 3KSXA 4G68B 2HEUA 3OXNA 1TWYA 1L5TA 2I4BA 3TTNA 3MVXA 5AA2A 3RTFB 3BFTA 3L6GA 3MQ9A 3OENA 5JTYB 4N07A 3TUSA 5I2KB 4FJPA 1URGA 1Y3NA 3O97A 4ELRA 2GRVA 3EQ1A 4EQ9A 4LQ5A 4P0GA 1LLSA 4JB7A 4NTLA 5TP9A 2D3IA 2GH9A 3DP6A 3UGWA 1EZOA 1ELJA 2AIXA 3U8QA 5JEIA 1CB6A 3H4ZA 3KN3A 4YB7A 4Z7EA 2DWAA 3RT8A 2DXYA 3TCFA 1MY3A 5ISUA 4QFOA 2OLBA 1B3FA 3MZ1A 4JSDA 3UORA 3PPNA 1LAHE 2VD2A 4QFPA 3G3KA 1N3XA 3OD7A 3P7IA 2HXWA 1MDP1 2QS1A 1RYXA 3IORA 3K00A 4LVQA 4N6PA 2PT2A 3FXUA 3QSLA 3TFLA 3FD3A 3RY3A 1NNTA 3BBRA 2H98A 4E0XA 3SEWA 3LBSA 2ONSA 1P1OA 1LAGE 1HSLA 4TLMB 4XTCQ 1TXFA 4XKPA 3A3CA 4F3GA 4G68C 3PUWE 3HO7A 2AYSA 1Z7NE 1YPNA 2YPNA 4NE4A 2X7QA 2O68A 5FHOA 2ABHA 4IB2A 4ND9A 5AA3A 2OK2A 1MQGA 5H8FA 1PDAA 4NWDA 2VP1A 3KFMA 1FQCA 3QUFA 2RINA 4OVJA 3IO4A 2DE2A 3OEKA 1P1UA 3FVKA 3H6UA 3CFXA 5H8SA 3UK4A 4P11A 4KYEA 3RLFE 4ESXA 3O9PA 3KOSA 2O7UA 1MS7A 4RYAA 2DE4A 3MVZA 4FE8A 3C35A 1S9TA 1ZMGA 3TMGA 3T96B 5DTBA 4RK9A 3TAJA 4PFWA 1MG1A 3S2VA 2PVUA 3VXBA 2RCAA 3D4CA 4YICA 1J1NA 2IEEA 4F18A 1IXCA 4ISUA 4HTGA 4LATA 3SESA 4R2FA 1P1WA 4ELPA 1QUJA 3MP6A 3IOTA 3H03A 1DSNA 4GIZA 2UVGA 4K3FA 2HFBA 2F78A 3N26A 3ILTB 3PUZE 4NWCA 2ESNA 1B40A 1XVXA 4ZZEA 1DTGA 3U92A 1MPCA 3I3VA 3PMWA 5KDTB 4OETA 1S50A 2G93A 1FTOA 3RUMA 4Z0IA 1MXVA 3T9VA 3TPAA 3QIMA 4O3CA 3SKPA 4GL8A 3H06B 1B3LA 1LAXA 2O7IA 2ALUA 3AXFA 4ESWA 3FVOA 5H8QA 4MF3A 1Y1ZA 2O69A 3S4UA 2GHAA 4U21A 5CRYA 2RC9A 3MPKA 3MJNA 5I56B 1Q35A 1UTHA 4H8JA 4DCXA 3KOTA 4HCYA 3VVFA 3MBPA 3B7DA 4PQJA 4FORA 4U1ZA 3T93B 5DYHA 1B5IA 4NMYA 1B3GA 1FTMA 2ANJA 1B9JA 4YMBA 1B4HA 4MH5A 1WODA 4ONYA 5AE4A 1Z7ME 1IXHA 5B7DA 2I3WA 3PUYE 1MQHA 5FHNA 4GD5A 4OEUA 2REGA 2DP8A 1R1NA 4G68A 4EQBA 1TFAA 3S9NC 2XXIA 1FQFA 4GWOA 4PE5B 2H5YA 1R6ZA 4YU0A 4BLAA 4OMBA 1N3WA 2Z8FA 3IB0A 4FATA 1DMBA 4DXBA 3IOUA 4UA8A 4F1YA 3GZGA 4NF8B 5K2XA 1QUKA 4EF1A 4ZEIA 1MY1A 5DVJA 3IOWA 4X1DA 3TTMA 1MY2A 4N13A 1S7YA 3U94A 3U1OA 3TZAA 3PD8A 2Y7PA 4OXVA 4IGTA 5EYFA 3LSWA 2X26A 3GBAA 4H65A 3CSGA 3VVDA 1UTBA 1T0KA 3OO8A 3FXQA 4KHZE 3MW0A 3U72A 3M3FA 4KYDA 2FNCA 2Y7WA 1MQJA 4KQPA 4R6KA 4BDMA 2RCBA 2DWHA 5LOMA 4EF2A 5L9MA 3H3GA 1OMPA 3RNNA 2GFEA 3KSJA 2BJJX 3EHUA 3I6VA 1NL5A 4C1TA 4IO2A 1QKBA 1H45A 1OVTA 3VLUA 2O6AA 1SYHA 5CMMA 3H6WA 4JWOA 5TPAB 1JVXA 2F7AA 3FV2A 2UYEA 3V89B 3WAEA 5A5XB 1RYOA 2XX9A 4DZ1A 4OEVA 2XX8A 1AIVA 4YKIA 2ONKE 1NNFA 4GRKA 3VFJA 5H8NB 2F5XA 4WEDA 2PT1A 1II5A 4M4GA 4POXA 3M8UA 3Q28A 4L17A 1JEUA 2DOJA 4EXLA 4Q30B 3HHGA 3JZJA 1I6BA 1NNKA 3T66A 1FQBA 4THIA 1BKAA 2Q89A 4IY5A 4OHNA 4G8NA 3N6UA 2DS9A 1B0LA 3SETA 1PEBA 1ANFA 3K4UA 5JK4A 4UACA 4LZ8A 4ZEFA 1SW5A 4F19A 3DM0A 2RC8A 3E3KA 4RJZA 3B6WA 1QKAA 4GL0A 4F3PA 3V8XB 5DEXB 1PBQA 2A5TA 3FASA 3USDA 5TU0A 2IA4A 3ODBA 1MQDA 4I62A 1SI0A 3FV1A 4DE8A 1FW0A 3L6HA 3W9WA 4P0IA 2LAOA 1I6QA 4U4XA 4PFUA 1B58A 3H6VA 3R7XA 3TKDA 5B70A 1GVCA 1A40A 3TDJA 1LFGA 1LFHA 3ZKLA 1B1XA 1SW1A 2OZZA 1MXZA 2Z22A 5I58B 3QAXA 4C0RA 1JNFA 3DP4A 4QFLA 3GLBA 4H0WA 3G3HA 1UIVA 5AA4B 4U2RA 3PGFA 2NWJA 3OEMA 4IY6A 1M5CA 4G8MA 4OQOA 5IKBA 2Y7KA 1XHYA 1Y3PA 1JW1A 3DELB 1JQFA 4H5GA 2O1MA 3FUZA 4AB5A 1JW4A 3PPOA 5H8HB 3CG1A 1R9LA 3KG2A 1NFTA 1QVSA 1UQWA 2RKMA 3S9EA 3IJXB 4I8CA 4M1VA 3RN8A 4G8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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