2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
4QN4A 3ZYRA 1SBEA 1USXA 2F24A 2HU4A 2SLIA 1KRIA 1O4ZA 2ZMKA 1W21A 5LK5A 3NV4A 1EUSA 1F9KA 1F8CA 2WT2A 3V0BA 1SLLA 1N1SA 1RIRA 3R05A 2ZBJA 1UZYA 3WCSA 4GXLA 1AXZA 5EYXA 1F5FA 4FQ4A 2DURA 1W6OB 3WUDA 1WW7A 1LOGA 2QWJA 1IKPA 1W0OA 4GB1A 1DQ5A 4GA9A 4BM8A 1NN2A 1FV3A 3BEQA 4ZKTB 1LGBA 1WW4A 4FPKA 1INYA 2HTUA 3UJOA 1VLNA 4PF5A 5CB7A 4YGEA 1NMCA 3HMYA 4MJVA 3WUCA 1SBDA 2A6XA 4HANA 5B2DA 2E51A 1O4YA 3AZZA 4UF7A 1W6PB 1LCLA 4YGDA 5GALA 5KXDA 1WCSA 1SACA 3IKWA 4WA4A 2D6OX 4MWJA 1FNYA 3AXEA 1BKZA 5T50A 4DFSA 2DU1A 3DGTA 3IPVA 3N7JA 1KDKA 3CNAA 3K37A 4AGRA 2X9MA 2WNEA 1GV9A 2A6VA 4Q1PA 3WOGA 1QNYA 4NN9A 2P37A 2QWAA 1V6KA 1GNZA 1KDMA 5HUKA 1LGNA 3CYEA 1SNTA 3ZSKA 2ZGPA 5KXEA 4MX0A 4HL0A 4ATFA 2SIMA 3OBTA 4NOTA 3WDWA 1E8TA 5H9QA 1MACA 2A6WA 1HLCA 1MS9A 1S0EA 2D7FA 3N7KA 1S0CA 2ZMNA 2A7AA 2R16A 2F0ZA 4FPLA 5EWSA 4AVVA 3H71A 2A3YA 2YA6A 1V0EA 2F11A 3AYDA 4M00A 3PVNA 4CPZA 3INAA 2W68A 2YA8A 2HT5A 3M3CA 1AVBA 3SLIA 1ULGA 2EXKA 3GVKA 4QN7A 1IS4A 4X49A 3FLPA 4H53A 2QWKA 1IS6A 3NN9A 2CTVA 2ZGUA 3POWA 1W6NA 2ZA9A 3ALWA 2PELA 3BODA 4K1KA 5GLWA 4H55A 3V0AB 4HZVA 1INXA 2QWIA 3TICA 2YA4A 3AXDA 2ERFA 4Y26A 3IM0A 2E53A 5GLVA 3WNXA 5IK7A 2VW0A 2VY0A 2UU8A 2VUAA 1USRA 1LOBA 3D11A 1I3HA 1Z4YA 1VALA 4DGRA 1HQLA 4QN5A 2P2KA 3INBA 1GZWB 4FVKA 4UW4A 3BIWE 4LBJA 4JC1A 2HT7A 4XXPA 1WLDA 4CZSA 4FJ6A 3PJQA 4BQ1A 1ENRA 1PZ9A 5H9SA 1N3PA 1FYUA 2R49A 2C4AA 1WD4A 3AP6A 5T54A 1XOGA 4AGGA 2ZGNA 4UW5A 1DILA 4L8QA 5EXOA 2P3JA 2F25A 4PBOA 4DPNA 3CKZA 1V3DA 1ULDA 2HYKA 2NN8A 1IKQA 4NC5A 1C4RA 1JW6A 4P9WA 1APNA 2VSKA 1SO7A 1D0HA 1W6MB 2CWSA 3ALXA 2A6YA 1DYKA 3N36A 3H72A 3FLRA 2D3RA 1I1EA 1GANA 1AXKA 4X4AA 2VVZA 1JBCA 3SH4A 2I2SA 2P3KA 3TI6A 2PHWA 1QNWA 1YIFA 1N47A 3SALA 4HZXA 3H6JA 4QNPA 1QOTA 1ONAA 5DZEA 1DZQA 3WG3A 2WQZC 4Q1RA 5CA6A 3VKMA 4M4UA 4AYUA 1Q8PA 1VAVA 4GZOA 1W8NA 3FFZA 1V0ZA 2QWFA 4F83A 4K1JA 2GMEA 2A71A 4C1XA 4K3YA 4Q6KA 4WVWA 4KS5A 4WA3A 2KM2A 3WG2A 3ZSLA 3OY8B 4GZSA 1AX2A 2ZHNA 3M3QA 3ATGA 4YZ2A 3ZPYA 4FPJA 2E7TA 1NSBA 4CPLA 4R9DA 3W58A 5T5LA 2CNAA 1S0DA 4YW3A 4TZDA 2C4LA 3USUA 1HKDA 1LGCA 4XJRA 2QWCA 1KJRA 3WLUA 5DG1A 3V0BB 1CR7A 2D3PA 2A75A 1KJLA 4FZHA 1V6IA 2XZJA 3AZVA 5E8AA 3CL0A 4M3CA 1NCAN 1Z4ZA 1V3BA 1S0GA 4M4NA 4NCSA 1V0FA 4GZXA 2VSMA 5HUMA 4Q8KA 3OJBA 1GBGA 3RMYA 2R0HA 2GMMA 2D6PA 3WG4A 3MEPA 5JOZA 4HZZA 4ASMB 3GVJA 4X6KA 3M1HA 3L2YA 3AZXA 1INGA 2WT0A 3POSA 2VW2A 1IVBA 4MC7A 3MPPG 4WV8A 4P9YA 4BBWA 3SILA 2YROA 2LTNA 2YDPA 1AZDA 3TI5A 3LCPA 1VIWB 3M3OA 4XJ9A 1FAYA 1IVGA 4PBPA 5HCFA 4YW5A 4BOWA 2W08A 1SLCA 4BLIA 1IVFA 4LBKA 4YZ3A 1JXNA 1INFA 3T2TA 1LESA 1A8DA 3WCRA 1XOEA 2P34A 3IPVB 4K1ZA 2RHPA 4XIOA 5DUVA 2D6MA 2OUJA 3OBRA 5GZGA 4SLIA 1TEIA 4GEZA 4D69A 2AGSA 1GLHA 1LHVA 1IVCA 1VCUA 4FOYA 4XILA 5E88A 3WDVA 2XZIA 4M3CE 1NCDN 2EF6A 4YLZA 6NN9A 1V3EA 1W0PA 1N1TA 2ARXA 2NM1A 2XCYA 2DUPA 3SANA 5M1ZA 2NYYA 3JUUA 2YXSA 3TIAA 3TIBA 1SBFA 4DQAA 4B7NA 1MR5A 1A4GA 1C57A 1EURA 2VU9A 3RSJA 1VCJA 1MS4A 4AVSA 2WSVA 4KS1A 2AR6A 1AF9A 4XJQA 1UZZA 2ZB5A 4K20A 2DYCA 2A5ZA 2VXRA 3AZYA 1C1FA 1JYIA 1CONA 1CIWA 3D5OA 3ILNA 1QDCA 1W6QA 1A14N 1ULFA 1HQWA 1S0IA 2ZMLA 2EIGA 2F27A 2YZ4A 2WT1A 4Y1ZA 5GLZA 4FP2A 5HUGA 2AH2A 4LBLA 2YA5A 2JKBA 4XHXA 2YV8A 5SV8A 1L7FA 3D12A 3B69A 5DXDA 2E7QA 4I00A 3T1LA 2ZGRA 5L73A 4Y20A 1E8VA 4K21A 5F5QA 4XOGA 1XQNA 2C9AA 4XMAA 4GZPA 3TI3A 3R4UA 1V6LA 2DU0A 1DQ1A 2WJSA 1G9CA 1INHA 3SISA 2DVAA 2DWRA 1PZ8A 4M3MA 1FX5A 3AX4A 4DS0A 4DRRA 1LU2A 1S0BA 2F29A 4FPEA 1F8DA 2HTWA 1N3OA 1MS1A 3N3HA 4M4VA 2GNDA 3WDTA 4YZ4A 2F10A 4KS3A 4MWYA 1QOSA 4D8SA 4UW3A 2BATA 4C1WA 2GN7A 1W6OA 4WVVA 1JOJA 1L7HA 2DUQA 4RA0A 1LECA 3HN1A 1G7YA 1A3KA 5EYYA 2ZACA 1UPSA 5CNAA 2ZGQA 5HUNA 4M3CF 4MWRA 1V2IA 4YM3A 1U0AA 2ZB6A 4W65A 3SITA 2D44A 1NSDA 1FV2A 2D6KA 1KITA 2FMDA 3B9CA 2W5OA 2ES3A 2SBAA 1G9DA 2A3XA 4Q26A 1HDKA 3D6EA 2PHXA 1LHNA 3O0XA 1EUUA 2B7YA 5DG2A 3RQ0A 4GWNA 4BPZA 3CL2A 4K1HA 3UL2A 1G9FA 1YXWA 4FQZA 3RS6A 3VKFC 2GNTA 4X47A 1RINA 3USUB 1LU1A 1WUVA 3UJQA 1WBLA 2TEPA 2GNBA 4GZWA 4AWDA 2VK6A 1Q8VA 2ZGTA 5T5PA 4AGVA 4M3CB 7NN9A 3PMEA 1AX1A 4U36A 3LSEA 2YDTA 3KQRA 4XTPA 1IS5A 2DV9A 5IT6A 2P3IA 2UWBA 5HCBA 1YO8A 5JYYA 2CL2A 5DZGA 1RITA 4YG6A 1GICA 3K3AA 4LBQA 2RKCA 4QN3A 4YM2A 5JOYA 4J9TA 4ZXKA 2GALA 2EALA 3DUIA 2GDFA 3B00A 4U2AA 1N1VA 1DQ4A 4XJ8A 5DUXA 1SLIA 3A0KA 1NLSA 1S0FA 2Z42A 2HTVA 4HZWA 3SH5A 1W1XA 3OYWA 3AP5A 5IK4A 3V0AA 4XJUA 1G9BA 4XJZA 1H9WA 1UX6A 2AEPA 4XIKA 4CRQA 1A4QA 2ZGMA 1MVQA 4ISQA 4CPNA 4K1IA 3AK0A 1MS0A 3OGGA 4GDIA 3RG0A 2F28A 1AJKA 1MZ6A 2D43A 1LOFC 1SCSA 2CYFA 1N1YA 2R1DA 4XBNA 1CPMA 1MZ5A 4XHBA 4AVTA 2AYHA 4HZYA 5KXBA 3B3QE 1UKGA 2FHRA 4FP3A 5F9TA 4IQPA 1DGLA 2B8HA 4XBLA 2CWMA 3FUOA 2OVUA 1WCQA 1FNZA 1V6MA 3T1MA 4WZFA 1X50A 1AXYA 2HTRA 1ZA4A 1PZ7A 3APBA 2UURA 1ZM1A 1CPNA 1YI7A 1H30A 4Y22A 1DYPA 3KM5A 4PQ9A 1G86A 4BMBA 1G9AA 3B01A 4YM1A 1EUTA 1MS5A 3VKLA 2F26A 4XYXA 3ZXJA 1EPWA 1ENQA 1SLAA 3WDUA 1W6QB 1ENSA 2AREA 5T5JA 2JE9A 4XTMA 5GJ6A 2R0FA 1QGLA 3SH3A 2ZHLA 2W38A 1YRZA 2JE7A 4YGCA 1F31A 1DQ0A 2HTYA 1V3CA 1DFQA 2NMNA 3JU9A 3K36A 1Y7BA 2D6LX 3AP7A 1B9SA 2UWCA 3C2UA 1WW5A 2ZGOA 3VV1A 2AUYA 5T52A 3PVOA 1ULEA 4Y20B 1NNCA 1Z0HA 2PHFA 1CQ9A 1URXA 3MW3A 3O9KA 3NV1A 5GZEA 4FOQA 2JECA 4RL7A 5GZCA 3ZXKA 3WG1A 1LHWA 1WD3A 1SLTA 2V73A 3OY8A 2AEQA 2ENRA 4LBOA 2YA7A 4H52A 1CJPA 4Y1YA 2BZDA 3A72A 2AENA 4FPCA 4YZ1A 4P14A 5GZDA 2R1BA 1B09A 3K38A 5IUQA 1S0JA 1QOOA 3IN9A 1N3QA 1UN1A 3TI4A 3JU4A 3M3EA 3A0NA 5GLUA 2CMLA 3UK9A 2F12A 2QWDA 1DQ6A 2UWAA 2WLQA 3O0WA 1Q56A 5AVAA 1INWA 2QWEA 3GALA 3N7LA 3POYA 1W6NB 3SNMA 1V00A 2DUOA 4GDJA 4R9CA 3ZSJA 4JF7A 2XG3A 4GKYA 5BYNA 2VK5A 2ZHKA 3NSSA 2V5YA 1BYHA 2HU0A 3TB0A 2WKKA 1JUIA 4LBNA 1LOCA 2ARBA 5JDBA 4Y24A 3MW2A 1LEMA 1Q8QA 1JHNA 1LOAA 1DHKB 1Q8OA 3FBYA 1H9PA 2C5DA 2E6VA 4ISRA 1GZ9A 1GKBA 4B7RA 1DBNA 1LENA 1NXD1 4NO4A 1IS3A 3WHTA 5KXCA 1V6JA 1OFSA 3R4SA 4WEGA 1Z4WA 3AYEA 1Z50A 1QMJA 1V6NA 1CESA 4YG3A 2XB6C 3B7EA 1B9VA 3BOPA 3TI8A 1WW6A 1LOEA 1DQ2A 2DVBA 2ZKNA 1W8OA 4GZTA 4B7MA 4Z8BA 1UAIA 2ZZJA 5HX0A 1Z4VA 3T1EA 5IK5A 4FPOB 2GN3A 4GWMA 1JN2P 3V64A 4FPYA 4XBQA 1DLLA 4FPGA 2SILA 1LODA 3NV3A 2ZAAA 4Q27A 4K1YA 2CY6A 3A71A 3PVEA 4MWVA 4YFWA 1GNHA 4LBQB 2VW1A 1GSLA 1LOFA 3N35A 5H9RA 2QWHA 1NCBN 1S1AA 1L7GA 2EAKA 1LHUA 1W20A 4R9AA 5HCAA 4CPMA 1INVA 2DVDA 2OUHA 2D3SA 2G4IA 4YW4A 4FOVA 4MWWA 3AJZA 1E8UA 1OKQA 4YGBA 4YFZA 3OYWB 4XZPA 4ITCA 2PHTA 2PHRA 1MVEA 4JRAA 3MW4A 3FUQA 4YG0A 1NMAN 1LTEA 1Z4XA 3O12A 2W5NA 2ZGSA 2DVGA 2VWDA 4YM0A 1W6PA 2JJ6A 1MS8A 5CAZA 3W09A 4MZAA 3ZXLA 4Q8LA 1DIWA 3OPZA 5GLTA 2BF6A 3NV2A 2NMOA 4YW1A 5IK8A 1UMZA 4CPYA 5B2CA 3I8TA 2A6ZA 1B9TA 4TYSA 4P9XA 4XJWA 2A3WA 1WLCA 2EXHA 2JD4A 4Y1UA 4GKXA 1LJ7A 3H73A 1LHOA 3W59A 3HR9A 1LEDA 1G8WA 1WBFA 4GALA 4Y22B 4YZ5A 2EXIA 3ZYPA 1CVNA 1FATA 1ULCA 1IVDA 1BJIA 3N7MA 4CPOA 3A4UA 3IMNA 4GZQA 3ZVXA 2QWBA 5T55A 1D2SA 1BXHA 3I4IA 2NP0A 4M01A 3TAYA 1BQPA 2LALA 5E89A 5NN9A 1SFYA 1WLWA 2DTYA 2XZKA 4HIZA 2ZHMA 4BLJA 3AP9A 4MZEA 4FPHA 4KS4A 3WVJA 3AJYA 4BMEA 4Y1VA 4FPFA 1NCCN 2VK7A 1KQRA 2DVFA 1R1ZA 1DIMA 2ZGLA 3WHUA 1QU0A 4DRVA 3O5SA 3WZ1A 2HTQA 3ZSMA 4QN6A 4GJTA 3FLTA 4LBQD 4UW6A 1IVEA 2EXJA 1LULA 1NNAA 2GMPA 4MWUA 3QCWA 4ATEA 5DZFA 4FVVA 2ZGKA 4WA5A 4MWLA 1OQ1A 2QWGA 4OZXA 1GZWA 4Q2FA 5GM0A 3ZXEA 1SCRA 1C1LA 3ILRA 5T5OA 1Q8SA 3GNEA 1NSCA 1NMBN 2NZ9A 4XE9A 1AX0A 5JVVA 2HT8A 1JYCA 1UL9A 3H0OA 4XMIA 3WDXA 3VUOA 2VH9A 4B7JA 5JOWA 3AP4A 1NNBA 3NWKA 5DUWA 4B7QA 5GZFA 1V6OA 1YYNA 3ASIA 4KBBA 5FRAA 3M2MA 3VKOA 5JLVA 2W39A 4MYEA 1QKQA 4FOWA 1QF3A 4LBMA 3BTAA 3RRDA 1GZCA 4MJUA 4R9BA 3ZXFA 2W52A 2YY1A 5H9PA 3D4KA 1Z78A 1MWEA 1AJOA 2Q5TA 2W20A 4XXAA 2YMZA 4YW2A 3AYCA 5CBLA 1BZWA 1W6MA 4KS2A 3RMXA 2JDZA 2D6NA 2WSUA 3AFKA 1SLBA 1BJQA 1VAMA 2OW4A 3K39A 2PHUA 2F13A 3Q9OA 4MWQA 1F8BA 1GYKA 3ILFA 5DUUA 3O0VA 3O9JA 5JMCA 1CN1A 3AYAA 2BQPA 1IOAA 3WV6A 1MS3A 4XDQA 4WEFA 1J1TA 2BERA 4CTEA 4XJAA 2A70A 3QLQA 3V65A 3ENRA 1F8EA 3WDYA 2DTWA 4I30A 3GVLA 4JCKA 3VKNA 3LSDA 2GNMA 1QDOA 4MWXA 4Y1XA 1A78A 3AZWA 2H0BA 4PCRA 2ZABA 5FREA 3U4XA 5JOXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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