2AL5A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fluoro-willardiine and aniracetam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A02
1M5FA 1Y3PA 1ZBMA 1P1QA 4RY1A 4K3FA 3IOVA 4U1OA 1SYHA 2UVGA 2DVZA 3TTNA 3MPLA 5CBSA 4I62A 2UVJA 1DOTA 2XX8A 3CSGA 4H65A 2I4CA 4PQJA 1MDP1 1PBQA 3IO4A 3N6TA 5JTYB 4H8IA 5HPQA 3TCFA 1ATGA 3K1NA 4R74A 3A3UA 3OOAA 3OO8A 4YU0A 3VXCA 5BUUA 4XXUA 2ONKE 4HCWA 3HO7A 4BDNA 3SESA 4O3BA 1US4A 3TTKA 2DE2A 1UTBB 4DIGA 4KCDA 4RNSA 2O68A 5CI5A 3G3HA 3OMBA 1AIVA 3H6WA 2WKYA 4H0WA 4RPOA 3GBAA 4TOZA 3RLFE 4C0RA 3S9NC 3UP9A 2ZNUA 3GLBA 3PUYE 5CRYA 3CSBA 2GFEA 1H43A 3DLNA 3FXQA 4NWCA 4O3AA 3V89B 5L9OA 5CMKA 5CMMA 3PMXA 4KI0E 2DVCA 4I9DA 4GWOA 3K6UA 1EZOA 2O6AA 2RF1A 4OEVA 1B05A 1R6ZA 4FORA 1B52A 3O6HA 1N76A 1OLAA 1P1NA 1NMUA 3K00A 3KG2A 1B5HA 2AL4A 5AA3A 4DDDA 4PFTA 1JW5A 2DSFA 3VXBA 3WAEA 3GXAA 3N26A 1F9BA 3B7DA 3N6UA 1VE4A 4JBZA 3T9HB 3K2DA 3LSLA 1ZKBA 1VFDA 3MJNA 5H8SA 2HEUA 1MQIA 1D3KA 2UVIA 4LZ8A 1MXWA 2XXYA 5KDTB 2RC9A 3RQTA 3B6WA 4ZDMA 1Z7ME 1QUJA 1SDXA 2O7UA 3FXUA 3OEMA 2A5TA 3TCGA 3UA8A 3VE1B 4OQOA 3CFXA 3MQ9A 2NUVA 3FUZA 1OIBA 4LZ7A 3VLVA 1HSJA 3PPNA 4HTGA 4BLAA 4IB2A 2D3IA 4YAHX 2VGQA 1BTJA 4G68A 3LR1A 3HCQA 1AOVA 4MLVA 3LSXA 3RT8A 4ZEBA 1B7HA 4R73A 1LBBA 1YAEA 3PU5A 4QFNA 4X48A 4Z7EA 4XKRA 1LB9A 4Q5TA 1BLFA 3O66A 1LAGE 2PYYA 5TP9B 2QMXA 1FQBA 1FW0A 1P99A 2F8DA 2BJJX 2ZYKA 3SEUA 4ZEDA 2ZYOA 3PUVE 3W9VA 4N13A 3IK6B 4PFWA 5DT6A 4R9FA 1EU8A 1YTVA 3OXNA 4ELQA 4Q0CA 1RKMA 3VV5A 1FTKA 1MPDA 1QULA 1URSA 3MVZA 1JQFA 1SI0A 3TDJA 1OVTA 2Y7PA 5EHMA 3G3KA 5I59A 2OK2A 5DEXB 3RT6B 5B7DA 4JWXA 2QRYA 3WAFA 4YZZA 2FNCA 1ELJA 1TFAA 1LCFA 1JVXA 5H8FB 4FAJA 3C4MA 1H3DA 1Y4CA 3Q28A 1OQGA 3IOUA 4OHNA 1BP5A 3PPRA 1GTKA 1H76A 1DMBA 1ZMGA 3IOTA 3TFLA 3RPWA 2F7AA 2V3TA 2DWIA 1B0HA 3VVDA 3SEXA 4H5FA 5AA2D 1I69A 3UORA 4GOTA 1MXUA 3TEPA 2PMSA 3D4GA 4H8JA 1QW0A 2P0SA 2F5XA 1MXXA 3ZS6A 1MH3A 4LATA 1B3FA 1Y4TA 5JEIA 1I6AA 3QYTA 2A5SA 3RUMA 1XVXA 2QS3A 2GHAA 1GV8A 2H25A 2OBGA 1XS5A 3C34A 1PB9A 1FQAA 4F1VA 1ZJLA 2ONSA 5DTBA 3ZKKA 4EUOA 4FIMA 4Q8RA 4EXLA 2Z8DA 4F3GA 1MM7A 1SI1A 3PGFA 2E1SA 3MVYA 3VVFA 1I6QA 3H3GA 4OERA 1DPPA 4OXVA 1O7TA 5H8QA 4QFOA 1LSTA 3OSRA 3VVEA 4GFRA 4HS7A 4AB6A 2DYXA 2Q88A 4H5GA 4OEUA 4OFLA 4H6DA 4JWYA 4R75A 5CMBA 3TZAA 5HBCA 5DVFA 4DE8A 4RXLA 4F3SA 3TUSA 1JW4A 2B3FA 1II5A 2ZNSA 3FJMA 3CI8A 3MZ1A 2NWJA 2F6PA 3ZKLA 1N3WA 3IJOB 4BDQA 1B1HA 1WVJA 4RJZA 1DTGA 4EXKA 5I2KA 3M3FA 2F6GA 1B7ZA 1NNPA 2I48A 1LB8A 2YPNA 3ILUB 3K01A 1XOCA 3AXFA 3KOSA 3I3VA 4IO5A 1JW1A 2OWTA 4O3CA 5ITOA 4Z0IA 3QAXA 1H44A 1FQEA 3G3IA 3H03A 3TAJA 4LA9A 1IXCA 2Y7RA 5DEXA 2OCUA 1WODA 4ESWA 3W9WA 5FHNA 3T22A 1A40A 1ZU0A 2DOJA 1LAHE 2VD2A 3CG1A 4QRZA 3T96B 1WDNA 1PBPA 3MUQA 3DP6A 3M8UA 4POWA 4THIA 4DZ1A 4RK2A 5F1QA 5L9SA 4JWOA 5H8NB 2XXTA 1NH7A 2A5TB 2AYSA 3FGSA 3K6VA 2RCBA 3OEKA 4FECA 4PP0A 3PPPA 1B3EA 4PFYA 1B5JA 1D9YA 2QS1A 3H7MA 3GZGA 3IL1B 4IO4A 1URDA 4IGTA 3OELA 4G8NA 3L6HA 2G29A 4LONB 5B70A 3SEVA 1A99A 4ZEFA 2W7YA 3K0VA 2NVUB 3UGWA 1PB8A 3G3JA 2O69A 1OMPA 2YJPA 2Z8FA 4OFJA 1GVCA 1B51A 3THIA 4EQ9A 3MW0A 2I0CA 4N07A 1TWYA 4QF9A 3S2VA 1SQYA 2UYEA 2XXQA 3IORA 2ZNTA 3A09A 3KBRA 1B1XA 2HQ0A 1LAXA 2DWJA 1AH5A 4YMBA 1N84A 2X26A 4AQ4A 5KCJB 2F34A 2DWHA 2H4IA 1Y1MA 2REGA 3BFTA 3TTMA 1SVXB 1VFEA 4X1DA 1MY2A 3PD8A 4BDLA 2NXOA 1M5DA 3IB1A 2R9JA 3E9XA 4G8MA 1J1NA 3T9UA 1Z7NE 4QFKA 2QL3A 1PB7A 3IAZA 1N04A 2KLFA 3OD7A 4PETA 5H8QB 1VR5A 4G77A 4XIGQ 1FTJA 2H98A 3C9HA 2LAOA 2RINA 2UYFA 3KJ7A 3MAMA 2ANJA 3PV0E 3Q27A 4FJPA 1UIUA 4F3PA 5DYHA 2O84X 1MQGA 5I2NA 1FTLA 1JNFA 1JEVA 2I6EA 2XXUA 2Y7IA 3OO9A 2VHAA 1MPCA 2DS9A 2ZYNA 2F36A 4OTEA 4XKNA 3BBRA 3UN6A 3C35A 2X7QA 1CB6A 3MP1A 4GRKA 2Q8JA 3KEIA 2RKMA 3FASA 1LFGA 1POTA 1MG1A 2E0SA 3P7IA 4OMBA 3RNNA 4ESXA 1IEJA 4QHQA 4ONYA 4AB5A 3BKIB 2NOOA 3E4RA 1TXFA 1NKXA 2AIXA 1IQ7A 3A3CA 1AL3A 1XHYA 2HXWA 2Z22A 1MY0A 3EF7A 3FIRA 2RC7A 3K02A 3PD9A 4NF5A 1L5TA 1USYE 4R6HA 1MRPA 1AMFA 1QJMA 1A7LA 1R1NA 2HFBA 4ELPA 5KCJA 2F7BA 4KCCA 4EF1A 4ZS9A 4YKPA 3JV9A 4ECFA 3MVXA 3CRBA 3C32A 4YICA 3TYHA 3LSWA 4ZEIA 3ZSFA 1B4HA 2Q89A 4Q30B 4XTCQ 2HAUA 2V3QA 4BDOA 5AA2B 2ZYMA 5I59B 5AA1A 1IUDA 1EZ9A 4EQBA 5ICQA 1B3GA 3BFUA 3H6TA 2THIA 3C36A 4GVOA 1A8EA 2HAVA 3EHTA 3U72A 4F1UA 1MQHA 1B4ZA 2V3UA 2Y84A 2H99A 3B6QA 3CFZA 3H06B 4G68B 4G68C 4YMAA 3OENA 3FVNA 1MDQA 1MY4A 4RK9A 3K4UA 1FQDA 3CG3A 4QSEA 5AA4A 2XXHA 5TP9A 4LP2B 4QSDA 1QUIA 2PX1A 4R2FA 4UA8A 4YKIA 3C33A 5JK4A 1BIYA 3U92A 1Q35A 3KOTA 1N7XA 4X1BA 3ECRA 2ESNA 4R6KA 4NEDA 5J1DA 1DTZA 1ANFA 4FATA 5I57B 3IB0A 1SW2A 3PUXE 4WKMA 5I56A 2DP8A 3CIJA 3MC2A 4GXAA 2V84A 1USYH 3LC8A 3OSQA 5TPAB 3FVGA 4E0XA 3E13X 1B0LA 1MQJA 5L9MA 4I1DA 5IKBA 3F11A 3KN3A 4GLIA 2Z8EA 2I3VA 5M2VA 3DP4A 4IGRA 3I5OA 4IO7A 1S9TA 1EZPA 4TLLB 4EDPA 1UQWA 4KD5A 4KHZE 1MM6A 4OESA 4IO2A 4BDMA 2XX7A 3DELB 3MBPA 5FHMA 4F1YA 5I2NB 4KFQA 1SW5A 4ELRA 4ZE9A 4X9TA 4F2QA 1B32A 3KN8A 2HZLA 4XKQA 1PC3A 2DQVA 2F97A 2DWAA 3VLUA 1O64A 4G8HA 3OO7A 2X7PA 3Q29A 4L17A 4P0IA 4GF8A 1NFTA 3MP8A 3TCHA 1M5CA 4U4XA 3S4UA 3E3KA 3V83A 1QKBA 3FV2A 3LUYA 1D9VA 2DXRA 2Q2CA 1FQFA 1MXZA 4OYVA 5ISUA 1US5A 1IZ1A 3EHUA 3IJXB 3QIMA 4KYEA 5H8FA 3FXRA 1UTBA 3RGYA 1MXYA 3O6IA 2RC8A 4GL8A 3G3FA 2YLNA 4I8CA 4GQOA 2CMOA 3CFLA 3PPOA 4KYSA 4C1UA 1JETA 3IO6A 2DXYA 1IITA 3K6XA 4FE8A 3PMVA 3QSLA 5FHOA 1S7YA 3KZGA 3M3KA 3MZBA 3D4CA 4QSCA 2HCAA 4F29A 4GIZA 4PFUA 4YB5A 5A5XA 1SD3A 3OO6A 4M4GA 1BKAA 1Y1ZA 1NH8A 1XT8A 3HHGA 4NF4A 4YKJA 5ELVA 3U1OA 1UTHA 5DVJA 4H1XA 4N6PA 3K1PA 3PUZE 4JB7A 3USDA 3I6VA 3T9XB 4GXSB 3TQWA 2VOZA 3QK6A 5H8NA 3TMGA 1Y20A 1Y9UA 1RYOA 5KDTA 4YB7A 2V93A 4OZ9A 5IAIA 5H8HA 5LOMA 1YCJA 4XKPA 3T66A 3RY3A 4BDRA 1CE2A 1LBCA 4LUBA 4UACA 3EHSA 2B65A 3PMWA 3Q26A 1A8FA 1N3XA 3H6UA 3KN7A 3V8XB 2IEEA 1GR2A 4OFOA 1N7WA 3EN3A 1LFIA 1EH3A 1POY1 3HV1A 3SEWA 1QKAA 1R9LA 2P1SA 4ZZAA 1P1OA 1B58A 1ZLQA 2F7CA 2PT1A 4MBPA 4G4PA 2B3BA 4OENA 1Y3NA 5TU0A 4DXCA 1KWHA 4ND9A 1P1UA 5I2KB 4F31B 3MP6A 1JVYA 4U21A 3JYRA 3QUFA 3SEYA 4F18A 5AA2A 1SW4A 3LBSA 2HZKA 1HSLA 4LQ2A 4F3BA 1QVSA 5I84A 1RYXA 3GBBA 5CBRA 4DCYA 4OVJA 4MLQA 1FCKA 4LZ5A 1DSNA 1PEBA 4NF8B 4WEDA 4IY5A 3W15C 4DXUA 3FVKA 5BWJA 5EHSA 1Y3QA 2ZXTA 1B2HA 1B5IA 3Q25A 3SERA 3TKDA 1OVBA 4U2RA 2Q9TA 3QXMA 2ONRA 5HM4B 3IB2A 1B6HA 3H4ZA 3TODA 1DPEA 2OJTA 2DE3A 4R9GA 5KZTA 1D4NA 2QJEA 4KPTA 4G2ZA 4ISUA 4U22A 4GL0A 1IXIA 4OETA 4IO3A 1B9JA 1QUKA 4QFLA 3N94A 5L8DA 4F22A 3G7WA 2PVUA 3CR9A 3S9LC 4HCYA 1UTHB 2QS2A 3G3GA 2P2AA 3O2AA 4NF4B 3UIFA 1N0TA 1MY3A 1XC1A 3TTLA 4R2BA 4OWDA 2I58A 3K6WA 1TT1A 2O51A 2QS4A 4NTLA 4ZE8A 1B3LA 3LSFB 4JSDA 3EQ1A 2I4BA 3N5LA 4M1VA 2Y7WA 3HN0A 3O6GA 2O7IA 3PPQA 4IY6A 5F7VA 3UK4A 4DLDA 4ZECA 2XXPA 4JXIA 5A5XB 3O29A 3FD3A 5AE4A 2V25A 2UXAA 4F19A 1B46A 3CVGA 1ZIUA 3KFMA 2GRVA 1B7UA 2R71A 3JZJA 1IXGA 1B40A 4RYAA 5DVIA 2DE4A 1IIWA 2R6GE 3MPKA 4NF6A 3U93A 1T0KA 3K1MA 1JEUA 3VFJA 1MXVA 1LAFE 2XD2A 3VLWA 3DM0A 2RCAA 1SBPA 2FYIA 4NF6B 2XXWA 4MH5A 4ZZEA 3MWBA 3MVWA 1HSEA 1PDAA 1YPNA 2IA4A 4IO6A 1LLSA 3V5AA 1MH4A 1FTMA 3QUJA 1XVYA 3B6TA 4YKKA 3TQLA 3U8QA 2GHBA 1P1WA 2ABHA 2OZZA 2XXVA 4ELOA 1A54A 2F78A 2VP1A 1M5BA 2XXIA 3ODBA 1I6BA 1LCTA 1LGBC 1NNTA 3KSJA 3O9PA 4NE4A 2I0BA 5K2YA 1MQDA 4NMYA 3DP8A 3FV1A 4R6YA 1MY1A 3U94A 4F2OA 2Z23A 4QFPA 2XD3A 3R6UA 2OWSA 4JDFA 3FJ7A 1A55A 1R9QA 4KR5A 5CC2A 1H45A 3ILTB 1O63A 4NF8A 2OLBA 3L6GA 4U1ZA 4KQPA 4FEDA 4ZEKA 2M8CA 3T93B 5TPAA 2D5WA 1GGGA 4GD5A 2G93A 2AL5A 3FJGA 3O97A 3ONMA 5CM6A 3R7XA 2UVHA 2F35A 2XHDA 3EPEA 3KSXA 1NNFA 1VSOA 2I3WA 4R72A 4JSOA 1FQCA 1UIVA 3TPAA 4DXBA 2D21A 3C31A 3T9VA 5I57A 3TELA 2QSXA 3SKPA 3SETA 2ALUA 3H6VA 1TFDA 4F39A 4U23A 5I58A 4FEBA 2Q2AA 4H67A 1NL5A 3FATA 5EYFA 2QPQA 4TQUQ 3FZVA 4P0GA 1NNKA 3PUWE 4PE5B 3SDFA 4E0WA 2PBWA 5I58B 1ZTYA 2REJA 3IX1A 4RPNA 4EQ7A 1URGA 4U4SA 2O1LA 5I56B 5ITPA 5K2XA 4C1TA 1LFHA 2CZLA 3S9EA 1OLCA 1MPBA 3TTRA 1B3HA 1Q1KA 1SYIA 1MS7A 2Y7KA 2ZMBA 1SW1A 3FVOA 3HSTA 1IXHA 2O1MA 5FTIA 4MF3A 3RN8A 3RTFB 3M3LA 4LVQA 3HHFA 1OQHA 4MFIA 5ICTA 4P11A 3S9MC 4EF2A 2XXXA 3KJTA 5AA4B 1S50A 2FA7A 2QMWA 5FTHA 3R26A 3IR1A 2H5YA 4YB6A 1FTOA 1M5EA 4KYDA 4POXA 4TLMB 4WEPA 4WXJA 3IOWA 3MZ9A 4NWDA 5CMCA 3VDFA 2VD3A 2PT2A 2XX9A 2XXRA 2H9BA 3HPIA 3O28A 4NF5B 5H8HB 3RTWB 4DCXA 4HW8A 2I49A 2GH9A 4RA1A 3KGCA 5JTYA 4LQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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