2AL5A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fluoro-willardiine and aniracetam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A02
4LQ2A 3SEUA 3FASA 1M5BA 4IGRA 2QSXA 2OBGA 4KYDA 4NF6B 4I9DA 5FHMA 2HCAA 2D21A 3ODBA 4H67A 1FQBA 1A7LA 1LAXA 1LFGA 4NF4A 3DP4A 2ONRA 1NNTA 1NFTA 2XD3A 4IO6A 3T22A 1I69A 4MLQA 4F3SA 1PBPA 4FECA 1HSEA 4RNSA 3C9HA 3MC2A 4L17A 4F19A 5HBCA 3EF7A 3K6UA 2HFBA 1B46A 2ANJA 3VVFA 3KN8A 2PVUA 2G29A 3H06B 3PUXE 4H1XA 2OWTA 3M3LA 4X48A 4GXSB 4F29A 4H6DA 4YB5A 5AA1A 4R6KA 2RF1A 2F35A 1PB8A 4OVJA 2XXTA 3MUQA 1IEJA 2O84X 4QFNA 1FQEA 1FQAA 4YB6A 5CMCA 1D3KA 4ONYA 3RPWA 1XT8A 2I0BA 5FTHA 2ZYMA 3V5AA 2XXPA 3FJGA 3K0VA 3U8QA 4NEDA 1IXGA 1P99A 3H4ZA 1AH5A 4DDDA 4N07A 2QMXA 3QAXA 5H8SA 1IQ7A 1IXCA 5I58B 5CRYA 3UORA 3TDJA 4MFIA 5I2NB 2UVGA 1LBCA 5I56A 3E13X 4XTCQ 2GHAA 1LAGE 5F1QA 5L9MA 5HPQA 4YKKA 3FZVA 1DPEA 3O2AA 3V83A 3N6UA 5FHOA 4U21A 5H8HA 5BUUA 2AIXA 5KZTA 4LZ5A 3K6VA 4KI0E 3Q27A 3USDA 3N26A 3K01A 3FXQA 1LCTA 5HM4B 1QJMA 4M1VA 2F7BA 4FORA 2QS1A 5TP9A 1DPPA 2ZYNA 4GL0A 4GL8A 2LAOA 4P0IA 3HHFA 2XXUA 3I6VA 3VXCA 3ZKKA 2X7QA 3CSGA 2RCAA 4FJPA 4POWA 3FVKA 3THIA 5CC2A 1Y3PA 1XVXA 3TELA 4KD5A 1JW4A 5CBRA 3ZKLA 3UIFA 4BDQA 3H6TA 3H6VA 5K2XA 1BIYA 2H5YA 3TMGA 1UTHB 3KOSA 1OLAA 1OQGA 4H8JA 4E0WA 3UP9A 2R71A 3C33A 1QUIA 2DVZA 4G4PA 5JTYB 3PPOA 4BDNA 2IA4A 1DSNA 1ATGA 3MP1A 3U94A 1F9BA 3VVDA 3OOAA 4XKQA 1IZ1A 4GWOA 4X1BA 2XXXA 5CBSA 1AL3A 3L6GA 1MQJA 3PUVE 1QVSA 4KYEA 5I57A 4KYSA 3QSLA 3MVWA 3L6HA 4ZEBA 4GQOA 3W9VA 4JSDA 2HAVA 4NF4B 4FAJA 2F36A 1NMUA 4NF5A 3RLFE 3TYHA 1B4HA 1H43A 4R2FA 1ZLQA 1NKXA 1Y1ZA 3PMWA 4K3FA 2YLNA 3CRBA 3N94A 1B32A 5TPAA 4KCDA 3KGCA 1P1OA 2CZLA 3CFXA 5LOMA 4ND9A 3TPAA 3IO4A 2I4CA 2GHBA 2X26A 2GH9A 2VD3A 1KWHA 1B2HA 4DXBA 1LBBA 1PBQA 1QW0A 3S9EA 5BWJA 3DLNA 3B6WA 3K00A 4IGTA 1SW1A 2H99A 3PUYE 4EQBA 1SDXA 4DIGA 3RTWB 3ILUB 4Q8RA 4ZZEA 1MQDA 3FV2A 4OQOA 1LLSA 4FE8A 4DCYA 2NUVA 3SKPA 1B6HA 4YU0A 2XXYA 3O6GA 2V3UA 3ILTB 4R9FA 1XS5A 3PD9A 1O7TA 2XHDA 5ISUA 4N6PA 3LSLA 1QUKA 1MY4A 1R1NA 1YPNA 4G68A 4HCYA 4UACA 2B65A 3T66A 3ONMA 3KSJA 5I56B 5KCJA 1XHYA 2DWJA 1PB9A 4JXIA 4LP2B 3IJOB 2XXQA 3Q25A 3PMVA 3O6IA 5EYFA 4ELPA 2Q9TA 5H8HB 2DE2A 4U4SA 1B40A 1RYXA 4DE8A 3PUZE 5FHNA 1H76A 3FIRA 3SEXA 3VXBA 3TODA 1VFEA 3S9NC 2VD2A 4LA9A 1B5HA 4KQPA 4NWCA 5ELVA 4PFUA 5TP9B 3TUSA 4ZEFA 5F7VA 1B58A 1B1HA 2G93A 1LB9A 3HSTA 1BTJA 4O3BA 3PV0E 5DEXA 2QS4A 4OERA 4EF1A 3HN0A 4JSOA 4BDRA 2B3BA 1SW2A 1MRPA 2Q2AA 4ZEIA 2F6GA 2I6EA 4G2ZA 3RN8A 1B3LA 2Q2CA 3OO9A 5CMKA 3FVGA 4BLAA 1GR2A 3HO7A 3VLWA 4NF8A 1N7XA 2NOOA 1MDQA 3DP6A 4Z0IA 5AE4A 1LAFE 4ZZAA 4G68C 3A3UA 4OHNA 1DOTA 4WXJA 4YKIA 1ZMGA 1EH3A 2ONSA 2DOJA 5ICQA 3R7XA 3LSXA 3QIMA 3I3VA 5CI5A 3C31A 4NWDA 5KDTA 3G3FA 3C32A 3LUYA 3K1NA 1M5FA 5H8FA 4LZ7A 1LGBC 4QFLA 4FATA 5I57B 1FTKA 4E0XA 4EXLA 1QULA 4MBPA 4PFTA 2FNCA 3RQTA 3WAFA 4F2OA 1N7WA 3OELA 1LFHA 4F39A 2UVJA 4OXVA 3OD7A 3TTNA 3EHTA 3MZBA 2UXAA 4EDPA 1MM6A 4JDFA 4ESXA 4RA1A 1Z7ME 2DYXA 3H3GA 1SW5A 5TPAB 1MM7A 1MS7A 1FQFA 3TQLA 3QXMA 1GV8A 1SYHA 2ZXTA 3T93B 1MH4A 3M3FA 1H3DA 3TFLA 1JW5A 5ITPA 2XX8A 4R74A 2QRYA 3CI8A 1UTBA 2Y7PA 3CR9A 1CB6A 4WEPA 3UGWA 3FD3A 4ELQA 1JQFA 1BLFA 1SD3A 1II5A 4R9GA 1I6AA 3SEYA 3DM0A 3IK6B 4XIGQ 1S7YA 2P2AA 1N3XA 2X7PA 1H44A 1B4ZA 1Y1MA 3O29A 1IXIA 4HTGA 5L9OA 1OLCA 1J1NA 4F3PA 4G68B 2FA7A 1FTOA 3U72A 3QK6A 2UYEA 4O3CA 3SEWA 3UA8A 2HZLA 5KCJB 4MH5A 3RGYA 4HCWA 3IR1A 2V25A 1M5EA 3U92A 4ZEKA 2AL5A 4F22A 1P1QA 1MY3A 2UVIA 4QSCA 3FUZA 4OETA 3A09A 4IO5A 3KN3A 1JNFA 4NMYA 3VE1B 4YZZA 1JW1A 4XXUA 2XXVA 1D4NA 2XXRA 2DE4A 3HCQA 3VV5A 2HZKA 3FXRA 3KEIA 4GLIA 1IITA 4U23A 3KOTA 4LVQA 4EQ7A 2O51A 1O63A 3KFMA 2HQ0A 5AA3A 1LSTA 4RPNA 3U93A 4R72A 1MG1A 1MXWA 2O68A 5DEXB 3O9PA 3K1PA 1H45A 3G7WA 3LR1A 1Q35A 3P7IA 4WKMA 3BBRA 4O3AA 4AB6A 3T9XB 1XVYA 3EHUA 4PP0A 2RCBA 2VHAA 2RC9A 4F1YA 1A40A 1Y4CA 5ITOA 3MWBA 4NF8B 2DS9A 3DELB 4QHQA 3VFJA 1PC3A 3MP8A 3VLUA 5L9SA 3S4UA 4Q30B 2Z23A 4QSEA 1AOVA 3G3JA 3DP8A 1M5CA 4YKPA 1SYIA 1M5DA 1MY2A 3GXAA 4HW8A 2NWJA 2Z8EA 5KDTB 1MXVA 4X9TA 5H8FB 3LSWA 4C1TA 2H4IA 2PT2A 2V3QA 2DXYA 2REGA 2I3WA 4IY5A 5JK4A 4PETA 3MQ9A 1R9LA 3IJXB 1TFAA 4FEBA 4U2RA 2M8CA 3UK4A 3RT8A 4QSDA 4JBZA 2Z8DA 4OZ9A 1HSJA 1NNKA 5M2VA 3ECRA 1B9JA 4YKJA 4ZECA 3ZS6A 1URGA 3AXFA 3MVXA 1JVYA 3TAJA 3OXNA 2P0SA 2DVCA 3TCFA 4QF9A 2HXWA 4RJZA 4AQ4A 4XKNA 3FVOA 4TQUQ 4OFJA 3CFZA 4LATA 1A99A 1OMPA 1UIUA 2DWAA 3KG2A 1N3WA 4IO7A 1UTBB 3KZGA 1B7ZA 1JVXA 4IB2A 3G3KA 3OENA 3A3CA 5DYHA 1EZ9A 1SVXB 3B6TA 2OJTA 5I2KA 2DQVA 3LSFB 3IB2A 2VOZA 1N84A 4QFOA 2I49A 1RKMA 1URSA 4G8MA 5DVFA 2D3IA 3LBSA 5I84A 3PPPA 3FV1A 2XXIA 3W9WA 3MZ1A 3M8UA 4HS7A 4U4XA 4I1DA 5AA4A 2DSFA 1VR5A 2VP1A 4X1DA 2QJEA 1VSOA 2ZNSA 1IUDA 4IO3A 4LONB 1MPCA 3KJ7A 1S50A 4XKPA 4DZ1A 3CSBA 3KJTA 4M4GA 1HSLA 5H8QA 2QPQA 1FTLA 4ESWA 3MBPA 3EQ1A 1Y20A 2Y7WA 4OENA 4G77A 1LAHE 4ZS9A 1ZTYA 2H25A 4U22A 3FJMA 3PUWE 2Y7KA 5EHMA 4F2QA 4UA8A 3T9UA 4GFRA 1VE4A 3SERA 4OEVA 4F1UA 2I58A 1JETA 3SESA 3T9VA 1ELJA 3S9MC 2I3VA 5A5XA 1POTA 2P1SA 1FQCA 4RYAA 4QFPA 4DXCA 4RK9A 5J1DA 3MJNA 1PB7A 4G8NA 4ISUA 2H9BA 5I59A 3WAEA 4Q5TA 4FIMA 1US4A 4WEDA 4N13A 3VLVA 2KLFA 1B05A 3C36A 3IB0A 1GVCA 4KHZE 2RC8A 3LC8A 3TTMA 1TFDA 4KCCA 2Y84A 4F3BA 4OFLA 1MXYA 4YMBA 3O28A 4R6YA 3OO7A 3Q29A 3VDFA 3PMXA 4QFKA 2OWSA 4H5FA 5CM6A 4OMBA 2UYFA 1Y9UA 2ESNA 3EHSA 5DVIA 3TEPA 3RT6B 1WDNA 3TZAA 1MXXA 2PMSA 2OCUA 5ICTA 1GTKA 5B70A 2ONKE 1T0KA 4F1VA 4OWDA 1YTVA 4C1UA 2ZYOA 1BKAA 4BDOA 4H5GA 2I0CA 3IORA 1ZU0A 2ALUA 3FATA 2THIA 1B7HA 3QUFA 4NF5B 2O6AA 1Y4TA 3TTKA 1B52A 1Q1KA 2GRVA 1TXFA 3PD8A 1IXHA 5I2KB 3MW0A 3R26A 1P1WA 5AA2A 3SEVA 3D4CA 1O64A 1DTGA 3MZ9A 4ZDMA 1EZOA 4H0WA 4PFWA 3S9LC 1FW0A 1SQYA 3TTLA 1JEVA 1SW4A 3BFTA 2F8DA 4QRZA 3KN7A 1I6BA 4PE5B 5AA4B 1D9VA 3FJ7A 1NL5A 1P1UA 1B3EA 3V89B 3KBRA 4G8HA 1B7UA 2O1MA 4YMAA 3CG3A 3FGSA 4THIA 2OK2A 5H8QB 3K6WA 4KR5A 3T9HB 1NNPA 4R73A 1N76A 5K2YA 3PPQA 3Q26A 4ZE8A 4LZ8A 1EZPA 1TT1A 2VGQA 4I62A 1YCJA 3OEKA 1R6ZA 4GVOA 2E1SA 2REJA 4P0GA 4YB7A 2DE3A 1B3GA 3PU5A 2R6GE 2AYSA 1FTMA 1XC1A 4EF2A 2GFEA 4BDLA 3FXUA 3OEMA 3TTRA 1RYOA 3H6WA 3S2VA 3MPKA 3H7MA 1MQGA 5A5XB 2F7AA 3O6HA 2NXOA 3MP6A 1B0LA 1MQIA 4OESA 3GLBA 1USYH 4BDMA 1QKBA 4KFQA 3G3IA 2DWHA 5I59B 3TKDA 4OYVA 3JZJA 1MY0A 5EHSA 1MPBA 5FTIA 1XOCA 2XX7A 3VVEA 1OVTA 3V8XB 1PEBA 1OIBA 4Q0CA 1OVBA 2D5WA 1B3FA 3TCHA 1DMBA 3I5OA 1SI0A 2IEEA 3PPNA 3PPRA 2Y7RA 4LQ5A 1SBPA 2A5SA 2Z8FA 2CMOA 1URDA 4RPOA 4PQJA 1AIVA 4TOZA 4F18A 2R9JA 1VFDA 3HPIA 3IAZA 3EN3A 1NH7A 1LB8A 3EPEA 2RKMA 3K4UA 2F34A 2A5TA 3E3KA 2QMWA 2XD2A 4OFOA 2PT1A 2Y7IA 3K1MA 1DTZA 3B7DA 2F7CA 3G3GA 4JWOA 4DXUA 1N0TA 3IO6A 2V3TA 2F97A 4YICA 3ZSFA 3CVGA 2RINA 2DWIA 4RY1A 4GD5A 2W7YA 2YPNA 2FYIA 3HV1A 1GGGA 1AMFA 2I4BA 3C35A 3UN6A 2UVHA 3D4GA 4P11A 2ZNUA 3RNNA 3K6XA 1MQHA 4ELOA 5AA2D 2O7UA 2ZMBA 1L5TA 4DCXA 3JV9A 2O69A 1CE2A 1A8FA 5AA2B 5H8NA 3B6QA 5DVJA 1B51A 2YJPA 1FTJA 1D9YA 2HEUA 3C34A 4JB7A 1TWYA 4POXA 4F31B 2PYYA 5IKBA 2PX1A 4KPTA 3OSRA 2OLBA 1WVJA 4IY6A 1WODA 2BJJX 3IX1A 3IB1A 1USYE 1A54A 3IOVA 4ZEDA 2QS3A 4OTEA 3IOWA 2OZZA 2V84A 1BP5A 3GBBA 1OQHA 4F3GA 1S9TA 4GF8A 4PFYA 3FVNA 2QS2A 3K02A 3F11A 4NF6A 1B1XA 4ZE9A 3M3KA 3U1OA 2RC7A 4RK2A 2O1LA 4TLLB 1ZBMA 2DP8A 1UQWA 2O7IA 1MDP1 1NH8A 2AL4A 3IL1B 3BKIB 4LUBA 2PBWA 5JEIA 3BFUA 1YAEA 1I6QA 1MH3A 1QUJA 5IAIA 4R75A 4U1OA 2XXWA 4OEUA 1MY1A 3E9XA 3H6UA 4I8CA 4MF3A 3OO8A 1LFIA 2NVUB 3MVYA 4GRKA 4GXAA 2F5XA 4Z7EA 3G3HA 4NTLA 1MPDA 2XX9A 5DTBA 5L8DA 4AB5A 4NE4A 1QKAA 3PGFA 1PDAA 3O66A 4IO4A 3MAMA 1ZIUA 1LCFA 3RTFB 2WKYA 1SI1A 5CMBA 4JWXA 3GBAA 1B0HA 3MVZA 1Z7NE 2Q89A 3OSQA 2DXRA 4EQ9A 2Q88A 1FCKA 3GZGA 2I48A 4ELRA 5DT6A 3N5LA 4C0RA 3CG1A 1B5JA 1ZKBA 4GIZA 5I58A 3OO6A 4U1ZA 4FEDA 1ZJLA 5I2NA 2F78A 1NNFA 1EU8A 4XKRA 1A55A 1Y3NA 3RUMA 5B7DA 4YAHX 2HAUA 4GOTA 2A5TB 1MXUA 3IOTA 2ABHA 1B5IA 2QL3A 2ZNTA 1JEUA 3OMBA 3O97A 3MPLA 4H8IA 3QYTA 1R9QA 1ANFA 4DLDA 3JYRA 2ZYKA 2Q8JA 4JWYA 2B3FA 2F6PA 4IO2A 3H03A 4EUOA 4EXKA 1P1NA 3W15C 1UIVA 2Z22A 3C4MA 4ECFA 3HHGA 1B3HA 3QUJA 3T96B 4H65A 5H8NB 3R6UA 4R2BA 3E4RA 1IIWA 1FQDA 3SETA 3Q28A 3CIJA 2V93A 3TQWA 3K2DA 3KSXA 1US5A 2XXHA 3RY3A 5TU0A 3IOUA 2H98A 4MLVA 1UTHA 3TCGA 1A8EA 1Y3QA 5CMMA 1MXZA 3CFLA 2E0SA 1N04A 4TLMB 5JTYA 3N6TA 4RXLA 4R6HA 3SDFA 1POY1
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XWOA 4LQ2A 3SEUA 4PE3A 3FASA 1M5BA 4IGRA 2HXRA 1QGXA 2QSXA 2OBGA 4KYDA 4NF6B 1LEVA 3IFCA 4I9DA 5FHMA 2HCAA 2D21A 3ODBA 3RPLB 4H67A 2WYPA 1FQBA 3IFAA 1A7LA 1LAXA 1LFGA 4NF4A 3DP4A 2ONRA 1NNTA 1NFTA 2XD3A 4IO6A 4OVRA 3T22A 1I69A 4MLQA 4F3SA 1PBPA 4FECA 1HSEA 4RNSA 3C9HA 3MC2A 4L17A 4F19A 1IMEA 5HBCA 3EF7A 4GX6A 3K6UA 2HFBA 1B46A 2ANJA 1G0HA 3VVFA 3KN8A 2PVUA 1NV5A 2G29A 3H06B 3PUXE 4H1XA 2OWTA 3M3LA 4X48A 4GXSB 4F29A 4H6DA 4YB5A 5AA1A 4R6KA 2RF1A 2F35A 2CEXA 1PB8A 2XWIA 4OVJA 2XXTA 3MUQA 1IEJA 2O84X 4QFNA 1FQEA 2MKZA 2B4LA 1FQAA 4YB6A 5CMCA 1D3KA 4ONYA 3RPWA 1XT8A 2I0BA 5FTHA 2ZYMA 3V5AA 2XXPA 3FJGA 3K0VA 4OVSA 3U8QA 4NEDA 1IXGA 1P99A 3H4ZA 1AH5A 4DDDA 4N07A 5A5LA 2QMXA 3QAXA 5H8SA 1IQ7A 1IXCA 2CZHA 5I58B 4XF5A 5CRYA 3UORA 3TDJA 4MFIA 1FJ6A 5I2NB 2UVGA 1LBCA 5I56A 3E13X 4MHFA 1NI9A 4XTCQ 2GHAA 1LAGE 5F1QA 5L9MA 5HPQA 4YKKA 3FZVA 1DPEA 3O2AA 4I3YA 3V83A 3N6UA 5FHOA 4U21A 5H8HA 5BUUA 2AIXA 2FIXA 5KZTA 4LZ5A 3K6VA 4KI0E 3Q27A 3USDA 3N26A 3K01A 1BK4A 3FXQA 1LCTA 5HM4B 1QJMA 4M1VA 3RYDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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