2AL5A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fluoro-willardiine and aniracetam
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
b'NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of positive allosteric modulators acting on AMPA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2al5A02
4YAHX 4F2OA 2DVZA 2I3WA 2RCBA 1AIVA 2I58A 4BDOA 3EHUA 3Q29A 5I58A 5AE4A 3S9NC 1DMBA 1MXVA 2A5TA 4Z0IA 4R73A 2O7IA 4GOTA 4FEBA 3K02A 3K1PA 4F2QA 2ZYOA 3S9LC 2IA4A 1PEBA 3PUVE 2UVJA 1URSA 2DE2A 3K2DA 4O3AA 2DS9A 3MUQA 4YB6A 3RT8A 4QFOA 1B40A 3K1MA 3P7IA 4ISUA 1A99A 5CBRA 1MY0A 1MY4A 4KI0E 4FECA 2NOOA 4WEPA 5A5XA 4UACA 3KSJA 4F31B 3LC8A 4EQ9A 1B4ZA 2H25A 2DXYA 3T96B 2ONSA 1JQFA 1MH3A 3SEWA 1MQIA 1NMUA 4YKIA 5AA2B 1SQYA 5L9OA 5TPAA 3UP9A 1PBQA 5AA2D 3TAJA 4BDLA 4M1VA 1LBBA 2F8DA 4H1XA 4I62A 2B65A 3O2AA 1MPBA 3KJTA 4GRKA 3UIFA 3IR1A 4H67A 4TLMB 3L6HA 1IZ1A 2X26A 3N6TA 3PUXE 4N07A 1FTOA 4F18A 3S9EA 1Z7ME 3CIJA 2I6EA 4EXLA 3T9VA 1BKAA 4DZ1A 1AMFA 5I58B 3CFLA 2QS2A 3EN3A 4HCYA 3S2VA 4F3BA 3A3UA 4FORA 1OVBA 4C1UA 2XXPA 4P0GA 3PD9A 2Z22A 4MBPA 4DIGA 1QKBA 1RYOA 5CMBA 1WDNA 1R1NA 1IXGA 1S50A 2QMWA 4F22A 1DTGA 4X9TA 1A7LA 3WAFA 4BDQA 4OFJA 1D9YA 3TEPA 3IOTA 4KCCA 4O3CA 2Y7PA 1YCJA 3OSRA 1OLAA 1LSTA 2Y7WA 1OLCA 5A5XB 1O63A 3M8UA 4I1DA 2PVUA 2FYIA 1LBCA 2UVHA 3UORA 4IO2A 3RQTA 1EU8A 4PFWA 3PPNA 5TPAB 1MQHA 1DTZA 4RA1A 4G2ZA 4BDNA 2PT1A 3IK6B 2YJPA 4GQOA 1B1HA 1US4A 2Z8EA 2R6GE 2XXHA 3MWBA 4XKNA 4EF1A 1LAGE 3VLUA 1XT8A 3FJGA 1ZJLA 3MZ1A 2V3UA 2QS3A 3QSLA 3LSXA 4EQBA 3VVEA 2H9BA 1B5IA 2O1LA 3M3FA 1B3EA 4O3BA 2H5YA 2NXOA 1M5EA 1XOCA 4JB7A 3CFXA 2P1SA 4X1BA 1N7WA 4YMAA 3H6TA 4G8HA 2I0BA 2E1SA 1MDP1 3PPQA 3N6UA 1MY3A 1IEJA 2Q2CA 1H43A 1ZKBA 2I0CA 2OJTA 3MQ9A 3M3LA 3TFLA 3VDFA 1NNKA 5H8QA 2P0SA 2DE4A 1TFAA 3IORA 1A54A 1N3WA 2R71A 2VHAA 2XXIA 4OFLA 3IJOB 2XX9A 4H0WA 2F97A 3OXNA 3T9XB 3O97A 1PB8A 1NH8A 4ZZEA 1I6BA 4ZEIA 2XXQA 3W9WA 1A8EA 2DWIA 3K6VA 5DT6A 3IOUA 3KEIA 4DE8A 3CG3A 2PBWA 4TQUQ 3RNNA 3VVDA 4Q0CA 1OQHA 3C34A 1B52A 1LFGA 3VXBA 2B3FA 3DP4A 1B3HA 3RPWA 3BFUA 4OHNA 4LQ2A 1LAHE 1B3GA 4P11A 4F29A 4NWCA 1KWHA 4RXLA 1I69A 2V3QA 2G29A 1M5DA 5KZTA 4UA8A 5AA3A 1B2HA 1SI1A 2O84X 1Y3NA 4ZE8A 2UXAA 2UVGA 2PMSA 5H8QB 4DCYA 3B7DA 2R9JA 4THIA 3FV2A 5DVJA 4OEUA 5H8HA 4LQ5A 5I2KA 3LBSA 1MM7A 3U92A 3TMGA 5H8SA 2PYYA 3FZVA 4ZDMA 3MZBA 3TKDA 3CSGA 3SDFA 4XKPA 4KYSA 3C4MA 3IJXB 2YPNA 1N84A 4LATA 3T22A 3MPLA 3V83A 3U72A 1LFHA 2UYEA 1P1WA 1J1NA 3IOWA 1B51A 2ONRA 3L6GA 3R6UA 3PD8A 3BFTA 4ECFA 3V5AA 3O6HA 3Q25A 2ZNUA 4X1DA 1NH7A 3E4RA 4R2FA 3IB2A 2YLNA 3CRBA 2QPQA 1UIVA 3JYRA 1MXXA 3MJNA 1Y4TA 3OEKA 3PUWE 1OMPA 3HHGA 3QIMA 1FW0A 3RTWB 3U1OA 4GD5A 4HCWA 2ZXTA 3KOSA 4OWDA 1TWYA 4EUOA 4F3GA 1R9QA 3FXQA 3OELA 3VLVA 1JW1A 4WEDA 1ZBMA 3B6WA 3GZGA 3C32A 1H44A 2DXRA 3M3KA 1B7ZA 2NUVA 1NL5A 4R6YA 3WAEA 2OWTA 1VFDA 3UGWA 3TODA 1MQJA 1B1XA 4RPNA 3PMVA 3OEMA 3B6TA 2XD2A 2Y7IA 4OFOA 2O51A 1R6ZA 5H8HB 1QVSA 1MY2A 1H76A 1MH4A 2DWJA 5I2KB 1S7YA 2QMXA 5I59A 3RTFB 3LR1A 3IL1B 4RY1A 4U23A 1URGA 3TCFA 4FJPA 4YICA 3MP1A 4OESA 3TELA 2F7BA 5ICTA 4F1VA 2Y84A 1D9VA 4QHQA 3I5OA 4K3FA 1SW4A 4ZS9A 4RYAA 5L8DA 1ANFA 2XXWA 3E9XA 4DLDA 3F11A 5CMCA 5DTBA 3K01A 2I4BA 2QS4A 1DOTA 1POTA 2GHAA 1BTJA 4H5GA 2B3BA 4GXSB 3R26A 4YB7A 3PPOA 1B32A 2GFEA 3LSFB 1LCTA 5HBCA 1BIYA 4NMYA 4G68A 3VFJA 3G7WA 3G3IA 1Y9UA 1YTVA 1PC3A 1JEVA 1T0KA 1SYHA 3OD7A 3K0VA 2I48A 5ITOA 4KPTA 1Z7NE 1Y3PA 5B70A 5B7DA 3QYTA 4AB6A 1Y3QA 1SW2A 1S9TA 1BLFA 4RJZA 4G8MA 4LA9A 4NF5A 3C33A 3OENA 1ZIUA 5I59B 4N6PA 3D4CA 1MM6A 4U1OA 4KYEA 3MP8A 4QFNA 3VVFA 4G68C 4NF4A 3FXRA 3C31A 4F1YA 4IO3A 4KD5A 4OMBA 3OSQA 3MW0A 1ATGA 3HCQA 4BDRA 1DPPA 3EQ1A 4KFQA 1IUDA 1EZOA 4U2RA 4AQ4A 1P1QA 1USYE 1JW4A 3ODBA 2PT2A 3O6GA 1SI0A 4R75A 3U8QA 4YKPA 1MXWA 3SEUA 1MPDA 4BDMA 2OBGA 2RKMA 1NNFA 4GL0A 3KN3A 4HS7A 4LUBA 2LAOA 3SEYA 4PETA 3DELB 3FXUA 4JWXA 3UN6A 3AXFA 3G3GA 3T9HB 3EPEA 1POY1 1H3DA 1WODA 4G68B 2VD3A 4ZEDA 2GH9A 4ZE9A 4TOZA 5FTIA 3SKPA 3N26A 4KYDA 3TTRA 1LB8A 1Q35A 3OO7A 4P0IA 4LP2B 3I6VA 2XXTA 5BWJA 3QUFA 3IO6A 1MY1A 2O1MA 5CMMA 1FQAA 1N76A 4NF5B 1NNPA 3MAMA 3Q26A 3LUYA 4FATA 3MVYA 1LFIA 3MVZA 3QXMA 2F36A 3C36A 3ILUB 2DYXA 1P1NA 4KCDA 2Z8FA 4NF4B 5BUUA 1N7XA 2Q2AA 1B5HA 4C1TA 4NE4A 1MXUA 3QK6A 5I56A 1D4NA 3PMXA 3H4ZA 2REJA 3IAZA 1B0LA 2HAVA 4IY6A 3A3CA 1WVJA 5F1QA 1CB6A 1FQBA 1TFDA 4R2BA 1O64A 5I84A 3N5LA 4IGRA 4I9DA 1JVYA 4PP0A 1IQ7A 1FTKA 4OQOA 4YU0A 3TTMA 1LLSA 3DP8A 3TYHA 4OETA 1MDQA 2ANJA 3H7MA 5I2NA 2ZNSA 4QSDA 5KDTA 1SW5A 2OCUA 5ISUA 3THIA 1N0TA 4HTGA 4LONB 2VGQA 3MPKA 3FVOA 1NKXA 2QJEA 2QSXA 2WKYA 1JVXA 1B6HA 1B3FA 4DXCA 3G3HA 2H98A 1QKAA 1Y1MA 2RC9A 2RCAA 5CRYA 1HSEA 1ZLQA 1VE4A 2G93A 5DVIA 1JW5A 3BBRA 1US5A 5H8FB 1B4HA 1Q1KA 3U94A 1GV8A 1HSJA 1EZPA 3E13X 4PFUA 4YZZA 5HM4B 3FASA 4RK9A 1UQWA 1CE2A 3FIRA 3RLFE 3HSTA 1MQGA 4XKRA 2REGA 2XHDA 5FHMA 4QSCA 5I56B 3OO6A 3MZ9A 1IXHA 2AIXA 3K4UA 1IXCA 1MG1A 1ZU0A 3OMBA 3GXAA 2O7UA 1B46A 4EDPA 3ZSFA 3H06B 2ONKE 2OZZA 3SEVA 1SBPA 1H45A 3RUMA 5I2NB 2XD3A 1B7HA 1TXFA 5KDTB 5L9SA 2UYFA 4JXIA 1UTBA 3SEXA 1I6AA 1LAXA 1N04A 1SDXA 2XX7A 5L9MA 2P2AA 1B58A 2H99A 1PB9A 3O29A 4JWOA 1EH3A 4NF6A 4QRZA 4EF2A 5LOMA 4H65A 3PPPA 4ZEKA 1M5CA 3CFZA 3FGSA 4N13A 4XXUA 3KBRA 3TCHA 4F19A 5FHOA 2D5WA 4LVQA 1JETA 2Q88A 3IOVA 3FUZA 4PFYA 2RINA 1UTHA 1IITA 2XXRA 4POXA 4XKQA 3KZGA 4ELOA 5J1DA 2ESNA 2GRVA 4OENA 3BKIB 4FIMA 4XIGQ 5F7VA 4NF8B 3LSLA 4OVJA 5K2YA 5HPQA 1LB9A 2HZLA 2X7PA 1A40A 4WKMA 3V89B 4KHZE 1XVXA 2BJJX 2F7CA 1Y20A 2OLBA 1QJMA 3U93A 4MFIA 3JZJA 5CBSA 5CC2A 3G3FA 4IO7A 2ALUA 4YB5A 4LZ8A 4ZEBA 1MQDA 3W15C 4QFLA 1SW1A 4F3SA 1XC1A 3K6WA 3USDA 1JEUA 3VXCA 2FA7A 1UTBB 1Y4CA 3GBAA 2OK2A 5AA1A 4NF6B 3CG1A 4R72A 3TPAA 4C0RA 2D3IA 3MVXA 3ILTB 2VD2A 3FVGA 3GBBA 1XS5A 2HQ0A 3TQWA 3KOTA 2CMOA 1II5A 1EZ9A 3C9HA 3DM0A 3RN8A 5CMKA 1LAFE 2HEUA 1MS7A 1DPEA 1P1OA 2F78A 1SYIA 3KFMA 1UTHB 2DVCA 3I3VA 1PB7A 5KCJA 3SESA 1GR2A 3TTLA 3EHSA 3S9MC 3FV1A 5JTYA 2Z23A 4ELRA 3H3GA 4ND9A 4DDDA 4H5FA 2DWAA 1B9JA 3K00A 2Q9TA 1QUIA 3O6IA 5EHSA 3PU5A 3S4UA 5EHMA 1B7UA 5DVFA 5CI5A 3ZKKA 2ZNTA 3O28A 1XHYA 3FJMA 4Q30B 4QFPA 1UIUA 2D21A 4QFKA 2QRYA 3VE1B 3TZAA 1OQGA 4R9FA 3JV9A 5JEIA 3ONMA 2X7QA 1AOVA 2GHBA 4FE8A 1FTLA 3RT6B 2UVIA 4IB2A 1AH5A 1B0HA 4NEDA 2V93A 4H8IA 4OXVA 1MXZA 4JSOA 3K6XA 4Q8RA 4MLQA 3PPRA 4HW8A 4ESXA 2I4CA 1VSOA 3TUSA 4OEVA 2Q89A 2DWHA 3EF7A 5ITPA 5ICQA 2H4IA 4BLAA 4GWOA 4JWYA 1XVYA 1DSNA 4PE5B 3H6VA 4G8NA 3T66A 3ECRA 2F34A 4I8CA 3ZKLA 1FTJA 5K2XA 1PBPA 2HXWA 4EXKA 3N94A 1FQCA 4G77A 3B6QA 2ABHA 5KCJB 3VLWA 2A5TB 4G4PA 5JTYB 4JSDA 3MBPA 1JNFA 2ZYNA 2Z8DA 4MF3A 4F3PA 2Y7RA 4E0WA 3OO9A 3EHTA 3LSWA 3HHFA 3K6UA 4GIZA 3HO7A 3KJ7A 3MVWA 3K1NA 1Y1ZA 1B3LA 1FQFA 1B5JA 3Q27A 3ZS6A 1ZMGA 1VFEA 1B05A 2VOZA 3IX1A 1I6QA 2ZYMA 4ZECA 5JK4A 1QW0A 3H6WA 5M2VA 1M5BA 1FQDA 2Q8JA 1TT1A 2AL5A 4U1ZA 3O66A 4IO4A 1QUJA 4YKJA 3CR9A 2V25A 2V84A 4PQJA 2RF1A 2RC7A 4L17A 4AB5A 4QF9A 5H8FA 3IO4A 3T9UA 1O7TA 3FJ7A 1QULA 1GGGA 2Y7KA 4XTCQ 2DOJA 1A8FA 3IB0A 3G3JA 3UK4A 3PGFA 4QSEA 3HPIA 3GLBA 2DE3A 4YMBA 4ONYA 4OYVA 2QL3A 1IIWA 2V3TA 4OERA 3CSBA 3OO8A 2KLFA 4GLIA 5TU0A 2XXYA 1PDAA 3MP6A 5H8NA 4OZ9A 1ZTYA 2ZYKA 3R7XA 3TDJA 1MPCA 2RC8A 1R9LA 4F1UA 4NWDA 3SETA 3PUZE 3HV1A 2FNCA 5I57A 2VP1A 3TQLA 4R6HA 1F9BA 3V8XB 4R74A 3CI8A 1FTMA 4U21A 4EQ7A 3PMWA 2NWJA 3O9PA 4TLLB 3VV5A 1OVTA 2M8CA 1A55A 5FHNA 2AYSA 4OTEA 1FQEA 3KG2A 3KGCA 4ELQA 1MXYA 3C35A 2F35A 1M5FA 1URDA 1NFTA 3KN7A 1OIBA 5AA4A 4ELPA 4U22A 5DYHA 1SVXB 2F7AA 4IY5A 2PX1A 4NF8A 4Z7EA 2QS1A 4F39A 4U4SA 1P99A 2O69A 3FVNA 3PUYE 3G3KA 4LZ5A 4U4XA 4DXUA 3UA8A 3TTKA 4GF8A 2DSFA 3PV0E 2F6GA 3RY3A 3TCGA 5ELVA 4ZZAA 1MRPA 5TP9A 2CZLA 3DLNA 4GFRA 3T93B 5H8NB 4DXBA 1GTKA 3FD3A 1IXIA 4R6KA 1NNTA 4JBZA 2HCAA 4RNSA 4RPOA 1ELJA 1QUKA 1RKMA 4IGTA 5I57B 5CM6A 3OOAA 5DEXA 5EYFA 2I3VA 1YPNA 2ZMBA 3A09A 5IAIA 2THIA 3KSXA 4MLVA 2OWSA 2DP8A 4ESWA 2E0SA 4GL8A 1YAEA 4H8JA 2IEEA 3Q28A 2HAUA 4YKKA 4IO6A 1FCKA 4MH5A 4NTLA 5AA4B 4Q5TA 3H03A 4GXAA 4X48A 4LZ7A 4PFTA 3IB1A 1HSLA 2HZKA 2O68A 4WXJA 3H6UA 2XX8A 4FEDA 5FTHA 3DP6A 3HN0A 4H6DA 1D3KA 1L5TA 3CVGA 4RK2A 1SD3A 4GVOA 3QUJA 2AL4A 2DQVA 2I49A 2NVUB 4POWA 2F5XA 2A5SA 3FATA 1LCFA 4KQPA 3TTNA 4DCXA 3KN8A 5TP9B 2O6AA 4KR5A 4E0XA 3RGYA 3W9VA 3E3KA 2W7YA 2XXUA 4M4GA 1N3XA 1BP5A 4ZEFA 1GVCA 5AA2A 2HFBA 4IO5A 3QAXA 4R9GA 1USYH 5DEXB 1AL3A 3SERA 4FAJA 3D4GA 1RYXA 5IKBA 4JDFA 1LGBC 2F6PA 2XXXA 3FVKA 3MC2A 1VR5A 1P1UA 2XXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YAHX 4F2OA 2DVZA 2I3WA 2RCBA 1AIVA 2I58A 4BDOA 3EHUA 3Q29A 5I58A 5AE4A 3S9NC 1DMBA 1MXVA 2A5TA 4NN3A 4Z0IA 4R73A 2O7IA 4GOTA 4FEBA 5LDZA 3K02A 3K1PA 4F2QA 2ZYOA 3S9LC 2IA4A 1PEBA 3PUVE 2UVJA 1URSA 3HFUA 2DE2A 3K2DA 4O3AA 2DS9A 3MUQA 4YB6A 3RT8A 4QFOA 1B40A 3K1MA 3P7IA 4ISUA 1A99A 5CBRA 1MY0A 4NAPA 1MY4A 4KI0E 4MHFA 4FECA 4NHBA 4OVQA 2NOOA 4WEPA 5A5XA 4UACA 3KSJA 4F31B 3LC8A 3U65A 4EQ9A 1B4ZA 2H25A 1IMCA 2DXYA 3T96B 2ONSA 3T0JA 1JQFA 1MH3A 3SEWA 1MQIA 3MYUA 1NMUA 4YKIA 1FRPA 5AA2B 4PTKA 1SQYA 5L9OA 5TPAA 3UP9A 1PBQA 5AA2D 3TAJA 4BDLA 4M1VA 1LBBA 2F8DA 4H1XA 4I62A 2OWZA 2B65A 2VPNA 3O2AA 1MPBA 2CEYA 2WX9A 3MSTA 3KJTA 4GRKA 3UIFA 3IR1A 4H67A 4NX1A 4TLMB 3L6HA 1IZ1A 2X26A 3N6TA 3PUXE 4N07A 1FTOA 4F18A 3S9EA 1Z7ME 3CIJA 2I6EA 4EXLA 3T9VA 1BKAA 4NQ8A 4DI3D 4DZ1A 1AMFA 4N6KA 5I58B 3CFLA 2QS2A 3EN3A 4HCYA 3IFCA 3S2VA 4F3BA 3A3UA 4HE1A 4FORA 1OVBA 4C1UA 2XXPA 4P0GA 3PD9A 2Z22A 2JJKA 4MBPA 4DIGA 1QKBA 1RYOA 5CMBA 1WDNA 1R1NA 1IXGA 4NF0A 1S50A 2QMWA 5EQ7A 4F22A 1DTGA 4X9TA 1A7LA 3WAFA 4BDQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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