2ALD | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of human muscle aldolase complexed with fructose 1,6-bisphosphate: mechanistic implications. pubmed rcsb
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
molecule tags	Lyase
total genus	138
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1998-10-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2aldA00

3O8AA 4Z0JA 1G4PA 1VYPX 1QFEA 3KRUA 4NNAA 3KVKA 3BGJA 5G1TA 1SPQA 3STEA 2JKEA 3OA3A 3KHJA 5K2ZA 2FPVA 4NNBA 2QJIA 5AC7A 5DCEA 1MEHA 2VOMA 4GUHA 3C8FA 3PC0A 2J9YA 3E49A 1UBSA 4LY8A 3UXAA 3GKFA 2ATMA 5G5IA 4LWWA 3W70A 3QZEA 2QCHA 1W31A 1K7FA 3NQVA 1K7XA 1TPFA 2NV1A 2Y63A 3P82A 3TQKA 1W3NA 3DZ1A 2UV8G 1Y0EA 3W7QA 1P0NA 5CZJA 4IPIA 3DI0A 5I3JA 1XFBA 1GG0A 1OK4A 1P1XA 3PBYA 3E0IA 1H5YA 5EKYA 1JRBA 2EF9A 3IGUA 5K9DA 2J9ZA 3W2UA 5AC8A 5H91A 2KZHA 3QEZA 4X2RA 3E9AA 3T78A 3I68A 4AVFA 3G3DA 4I7UA 4O11A 1ME8A 1Z41A 3THAA 1F7BA 1EEPA 3TW6A 3CU2A 1VH7A 1B57A 3AO0A 3QF0A 1YPFA 5AYXA 4HSOA 5HR6A 4CNPA 3S0CA 2Q8ZA 5BMWA 5A5WA 2DZTA 4PL1A 4EOUA 1PHWA 3MI3A 2OX1A 3CHVA 4JDYA 5EA9A 1GPWA 2DJLA 4X3ZA 1G67A 3NVTA 4GUIA 3TV8A 1OFPA 8TIMA 1GTHA 4M7TA 1GG1A 1OFBA 1C29A 1KW1A 1PCKA 1SW7A 1VRDA 4WXYA 4YL2A 1O4UA 3HBLA 2C15A 1TPC1 3A22A 3LV5A 3ZWSA 1M5WA 1YTEA 4MZ1A 3S1VA 1QPQA 1VZWA 1JQXA 4ZZ9A 3NQ6A 4ZVJA 4UFKA 4BWLC 5LNWA 2FFCA 1F2JA 4N9DA 3W7DA 2TSYA 3G1XA 1A53A 4GC4A 2OJPA 4TO8A 2V0TA 3NZRA 1TYGA 4FNPA 5F2LA 3BW3A 1MEIA 2I1OA 2DZUA 2JKAA 3PUEA 4IJBA 3DI1A 5BMXA 3BARA 3TJXA 4Q33A 1FWRA 2VFFA 3MW7A 3TR2A 1DL3A 4UTKA 4GBUA 1KM2A 1XDLA 5C54A 1R2TA 4IGHA 5SWUA 3FLUA 2C6QA 3WFAA 1ADOA 4AF0B 1VPXA 3RLUA 4GWEA 1DBTA 3W7GA 1H7NA 3LCWA 3M6YA 3LCFA 3P84A 4RCXA 1TREA 4XWUA 1NF0A 4Z1BA 2GJLA 5FF0A 3KOFA 2Y6ZA 3PVFA 1QDSA 3HIJA 4KFNA 3EWXA 4ICNA 3UPWA 5CZ0A 3WJWA 1K8XA 1VR6A 4CNOA 5FF4A 3GAYA 3E96A 4S2BA 4UTWC 4AMAA 2GVLA 3P8JA 1XXXA 1SUXA 4OBTA 3HGSA 1W3TA 3UWVA 1WOBA 4E38A 2BXVA 3VFLA 3HB9A 4Y8FA 1WQ5A 1GVFA 4GFSA 4FXRA 4JEQA 1UJPA 1J2WA 4N9BA 3TAOA 5CPNA 4YCPA 3NQ8A 5DBTA 1IIHA 3TFCA 3S1XA 3UQNA 4WOQA 2NWSA 2B7QA 3S5YA 4ZQMA 1TIMA 3IVUA 2PRMA 2WNNA 2ZRXA 4AAJA 5DCBA 4B5NA 4NZFA 1GTEA 1YDNA 1FWWA 3WK3A 2I9EA 3TSDA 3CIWA 3W9ZA 5LSMA 1JJKA 4LT9A 2GQ9A 2PC4A 1GQNA 4OHQA 2R94A 2GVGA 4MVAA 1VC4A 4OQVA 3VNDA 1XUUA 3HPZA 2H3DA 4J9JA 1QMLA 1U83A 5HWMA 2E6YA 1LOLA 3NNTA 4HSNA 3LX9A 1XBXA 4JTJA 4UMBA 3NG3A 4CQAA 3RFAA 5LNVA 5DY3A 3T4CA 1SO6A 4UMCA 2R91A 3G24A 1G69A 4TMCA 4WY0B 2JK2A 1B9BA 2Z6IA 2HSAA 2Y62A 3GK0A 1J5TA 2OMAA 4O1DA 4XKYA 1N8FA 4IMFA 5AOUA 4IUOA 2BTMA 1FUYA 5FF7A 1KLYA 1Q45A 2FTPA 1L2UA 2CLLA 1LROA 4A22A 3ELFA 1OFDA 3PULA 4GJ1A 1UUOA 4H6KA 1WA3A 3PBUA 1LBLA 1DJNA 3DFNA 1OX4B 1VCFA 5EL1A 4DXVA 4MOZA 4RXGA 4XZ9A 3B0UX 2ZFAA 4DF1A 5K7JA 4LW7A 2YDAA 3GDMA 1JULA 3B0PA 1XCFA 3EKZA 4AEOA 3R12A 3BLFA 4H3DA 1C8VA 1WAUA 4I7WA 4I9AA 3RNDA 3GXNA 4MFDA 1JUKA 3LCIA 3W7MA 3QH2A 4A29A 3B0VC 3OVQA 3TC6A 2VFGA 2ZZ4A 2VELA 4HKPA 4Y9AA 4E2BA 1SW0A 4PFMA 3NPWA 3NXFA 4JGDA 2QEZA 1N7KA 4NT0A 3U6WA 1H7RA 1EUNA 3EWBX 1R2RA 4LS2A 3W76A 1W5OA 2GVJA 1VCVA 2R14A 3L5LA 2EGZA 4RR4A 4UR7A 2PE4A 5LNRA 4O13A 2RH9A 3PM6A 1LLWA 3MI2A 3LLDA 3KVLA 3G1YA 4EWND 2V9DA 1M7OA 3GVGA 1FQ0A 3O06A 5KINA 3TROA 3E02A 3YPIA 3LI1A 1NSJA 1KFJA 1LRNA 2Z6JA 1OFRA 5EMUA 2WV8A 3MUXA 5C55A 2VFEA 3R2GA 1DOSA 2VFDA 2QR6A 3Q94A 4G1KA 5CPOA 5AC6A 2ZZ5A 2X16A 3S5ZA 1P4CA 3O07A 3QFEA 1FDYA 2RHGA 3DFQA 3I7SA 1Q6OA 2CLOA 4ADTA 2ZQ0A 1PS9A 1W5NA 4O28A 1TRDA 1LRQA 1FX6A 3PBVA 4IXHA 7TIMA 3TSMA 5E0KA 4UMAA 3C3NA 4AH7A 3PSVA 1KM3A 4ZQCA 4UR8A 5F2MA 1EA0A 4JY9A 4O52A 1IXQA 2DP3A 2B7PA 1VYSX 3W1LA 2DORA 1JUBA 1SZFA 2Y61A 3G8EA 1JR1A 5AHIA 1JCJA 4IMCA 1U5JA 4UFIA 4ALDA 3WK0A 5IBXC 4M7SA 2QUVA 3BG9A 1KFKA 3TSBA 3C2RA 3JR2A 1X8FA 4N02A 3RMJA 1H60A 1K03A 1KFBA 4QIUA 3LHYA 5EBUA 4YMZA 1VLWA 5KITA 5FEZA 3TNOA 2HS6A 3L21A 1OK6A 1I2QA 4O53A 2B7OA 1OYCA 3ATZA 3GXPA 4POCA 5C2XA 3QW3A 1SO5A 3O6DA 2BWGA 3W3OA 1XM3A 1ZCOA 4YWIA 1DVJA 3GZ3A 3G8RA 3B05A 3IIZA 2A5HA 4JN6A 3EWYA 1HO1A 2VEMA 4UTIA 3M1ZA 4GXMA 3GKAA 4N4QA 1W5PA 3EX1A 3Q2DA 4PA8A 2QUUA 3OBKA 1AW5A 5K9CA 3HGOA 4L4LA 1W8SA 4Y96A 4HNVA 4S1FA 3L5MA 1H51A 2XN1A 3NQ2A 4O0KA 3TIMA 2GOUA 1YDOA 1K7EA 3HQ1A 2NXHA 2X30A 4C1KA 4DO5A 2H8ZA 4JYEA 4LU0A 4LVFA 4IWWA 3W6YA 1CI1A 4BFAA 2C3ZA 3OIXA 4JTIA 1LRTA 3GR7A 3M5ZA 5DBUA 3B04A 4JTSA 4O14A 3TK7A 4IOTA 4MUZA 2VEKA 5T26A 4TR9A 3O15A 1BWKA 3M5YA 3ABRA 3GB6A 2Y7GA 5AFDA 3ZS4A 3O16A 3FIGA 1HTIA 2ZZ7A 3IRDA 3PWAA 3GDLA 3NQCA 3A24A 5LHFA 3NGJA 3BW2A 4JDBA 3ZFHA 4U4MA 3W1XA 1R2SA 2HS8A 4RK8A 4LVAA 3C61A 3G1DA 6TIMA 1O5XA 3PS7A 3TX9A 4NJKA 1CW2A 3LM7A 1XBVA 4XTIA 1TV8A 4NXKA 3M9YA 4UFHA 3W2KA 3VE7A 4FO4A 4UTHA 5KZDA 1W0MA 1K3UA 4Z0SA 2Z1BA 4HT3A 4AHQA 1ML1A 2BZNA 3V1PA 1FXPA 2GQAA 2JGQA 3BG3A 3LBMA 2E6AA 3L9CA 1F6PA 3NPVA 5J5RA 1A5BA 2J6XA 4WX2A 3OVPA 5AYYA 4O1CA 2V30A 3WK1A 1V5XA 3PSWA 2RDUA 1JCNA 1ZNNA 3GDRA 3NQMA 2YSWA 2O7SA 4ADSA 3IIPA 2CZFA 3MP3A 3SSJA 3O6CA 1O5KA 2ZA3A 4IMGA 4C1LA 5G1YA 3GXTA 3O6YX 5D33A 3WJYA 4U28A 1FXQA 3NO5A 3OHIA 1YLVA 3MMTA 1YPIA 3IGSA 2VKZG 4JR5A 3F4NA 2YFNA 4LV4A 3NPUA 2QKFA 3MBFA 1OFOA 2C16A 3SGZA 4DEFA 1NAL1 1L6YA 3SJ3A 2ZRVA 2WSQA 1G7VA 1PE1A 3G0XA 3LCGA 3BV4A 4NJGA 3C52A 2Y70A 1BKSA 3Q37A 2ZRUA 4K36A 1HG3A 2EKCA 4EVZA 3MYOA 2A1YA 1T99A 4JTGA 1KFEA 4N6FA 2CLMA 4FIRA 4DBEA 3UZJA 1S3HA 4OU1A 3PY2A 5I3IA 1H50A 3E12A 4KWVA 5KZMA 1EPXA 4AWTA 2J24A 1F76A 3FA5A 4M19A 3LDVA 4LOCA 5F1VA 1D3HA 3UY8A 1OYBA 2ZZ3A 3W1PA 4DO6A 4JYDA 4MFEA 1GYLA 4DQWA 4LS0A 2G5WA 2NV2A 1A5CA 4O4WA 3ABOA 1FCUA 1TPDA 5TBOA 2BLEA 3LCXA 3O1NA 2NUYA 3C2OA 3T44A 3SFKA 3L66A 4NX0A 4Z1AA 2GJNA 4O15A 4IQLA 1ZAHA 2CFFA 1HFBA 1ZY9A 4RX0A 1GEQA 1KM0A 3C2EA 1QOQA 1DHPA 1Z44A 3FJ6A 3NZ1A 1TPB1 1TV7A 3ANYA 1LYXA 5FF3A 3EX4A 2NX3A 2YYUA 5LKYA 5HUOA 4IX2A 3W2NA 1TPEA 1W5MA 2LLEA 3NQFA 3DKJA 4RJEA 4NXSA 2E09A 2WKJA 3OG3A 3UYCA 2B0MA 3LCLA 4AWUA 5DXYA 4PL2A 4K39A 3P74A 1DQWA 4MY1A 2E5CA 1SU5A 3PAJA 3NL5A 4NQ1A 1I2OA 3UWYA 5HQEA 4BI6A 1KM1A 4HN4A 2X2GA 3CC1A 4UNKA 4O10A 3S6DA 2QCMA 1RQHA 1SZEA 3LTPA 3C4UA 3CEPA 4LVBA 1RQBA 4KKXA 4ORIA 5ABTA 1G4TA 2XFWA 3KRZA 2V2CA 1NVMA 4HPXA 2CLKA 3B4UA 3TQ0A 3FS2A 2ZZ2A 1XKYA 4HHPA 3S9YA 4JS3A 4Q4KA 3DHDA 3GR8A 4WOZA 1A5AA 4PODA 3ABQA 1LZOA 5HNRA 5K4ZA 5E1QA 3S5NA 1HUVA 3LRLA 3LGEA 1PVNA 4FHAA 1GWJA 1CX9A 1SSGA 2IQTA 1MSSA 1BWLA 4CQ9A 2YZRA 3O63A 3TAKA 1Q6RA 3EX6A 2H90A 1W54A 4DF0A 1K02A 3NM3A 1VQTA 3LRKA 1YDVA 3SGUA 3EXTA 3IVTA 1D3GA 4WY0F 5G4WA 2EPHA 3TU9A 3EWZA 3N73A 1YXDA 2QCDA 4N2YA 1B3OA 5FEPA 3B8DA 5HULA 2V8ZA 3IIXA 3TH6A 3MI6A 2FIQA 5EYWA 1KBIA 1OHLA 4JIQA 3HJZA 4CNNA 3GDKA 1DQXA 2B4GA 3QSRA 4TX9A 2W79A 2GUUA 4BF9A 2YR1A 3W2JA 1YADA 2ISVA 2A2IA 4BI7A 4KWWA 3M41A 4WUIA 4D2JA 4XKYB 1F74A 2O7QA 2VENA 1ME7A 1GVSA 1H7OA 3HG3A 3HG5A 3A23A 1TB3A 1QO5A 3T55A 1Z42A 3NL2A 1H1YA 4W9TA 4TIMA 4DBDA 1EP1A 4QSHA 1AK5A 2Y88A 1LCOA 4UTTA 3W7PA 1SQ7A 3HO8A 2E6DA 3MHUA 1W5QA 2TMDA 3WK2A 3DFSA 3W1RA 2XN2A 2C18A 3A9IA 1PHQA 4O17A 1UCWA 3UWWA 1VLIA 1QPNA 2XN0A 3LHVA 4GRSA 1TV5A 3LOTA 4JTHA 3TUUA 5AHMA 5K3VA 4UUIA 3LXAA 1KLZA 1GZGA 4LRTA 1FBAA 3JRKA 2CWNA 4ZMGA 1GVOA 2NLIA 2ATSA 4FX7A 2ISSA 3NAVA 2Q3RA 3LXCA 4WZHA 3DFOA 2TRSA 1KV8A 4HPJA 3LRMA 1X1ZA 3C2FA 1QCWA 3EKLA 3FYPA 1R47A 4P61A 4UCGA 1HO4A 3WJZA 4L4MA 2ZRZA 5FF2A 5FEXA 3VI2A 3DU0A 1LLZA 1ICSA 1QOPA 2CLHA 5CZTA 2ZA1A 4KFPA 3C56A 5FEWA 4O19A 1MEWA 3FYOA 2H8XA 3QPYA 2PRLA 2E5BA 1PCWA 4NJIA 5F4SA 2AAMA 3QMSA 1NF7A 2WJZA 2R8WA 4NZJA 3DBPA 2C19A 4K7YA 2YGYA 3GNNA 4CCCA 3STFA 3HMJG 1X7FA 4M6QA 3IV3A 3S5OA 1YTDA 4M6PA 1ZALA 3P60A 2QAFA 1WBJA 3H53A 3W2LA 4YCOA 1I2NA 1W37A 4GE8A 3VE9A 4MZYA 4FNTA 2P0OA 3USBA 2NX9A 3EXSA 3BO9A 4N9EA 2C13A 4UFJA 3LHTA 1P5BA 3G1SA 3P62A 1W3IA 4PH6A 3V75A 2I14A 1AG1O 4JTFA 5U7SA 2OT0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2ALDA

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