The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
b'MEAIAKHDFSATADDELSFRKTQILKILNMEDDSNWYRAELDGKEGLIPSNYIEMKNHD'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Comparison of the Unstable drkN SH3 Domain and a Stable Mutant
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2-SH3 adapter protein drk
|
| source organism |
Drosophila melanogaster
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-09-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSQ A; 2DBK A; 1JXM A; 2D0N A; 1SRM A; 2DL8 A; 4IIM A; 4KRT A; 2RPN A; 5FWB A; 2EKH A; 2DX1 A; 1QKW A; 4LUE A; 3IQL A; 1U06 A; 2JM9 A; 2DL7 A; 2LMJ A; 2QDL A; 2L2P A; 2LNH B; 2K7A A; 2KBT A; 2F2X A; 1UUE A; 2FO0 A; 2L3Q A; 2YUN A; 2LJ3 A; 4CC4 B; 1SEM A; 1WI7 A; 1T0H A; 2VKN A; 2BZX A; 2FPF A; 2EPD A; 3SEM A; 1T0J A; 2YT6 A; 1UGV A; 2LQN A; 5HCK A; 2LZ6 B; 4HVW A; 2EYW A; 2A37 A; 4AFS C; 3A98 A; 3VRY A; 1AZE A; 1SSH A; 2X3X D; 3O5Z A; 4Z8A A; 4J9B A; 1U5S A; 2DNU A; 1QLY A; 1ZSG A; 3KFV A; 1MV0 B; 4ESR A; 4FSS A; 1ABO A; 4F16 A; 2DL3 A; 1GCQ A; 1K0S A; 1ZX6 A; 1ZLM A; 2A28 A; 1RLQ C; 1JU5 C; 1AWX A; 1EFN A; 1NYF A; 2JS0 A; 2RQR A; 1X6B A; 2RQT A; 2JTE A; 2BTT A; 3M0R A; 3TSW A; 2CUD A; 3VS3 A; 3RNJ A; 1GL5 A; 1YCS B; 3PVL A; 1G83 A; 1X6G A; 4GBQ A; 2BZ8 A; 2DE0 X; 1NEG A; 1UG1 A; 1WA7 A; 2MCN A; 2M0Y A; 2YUP A; 1WXB A; 3H0H A; 1WFW A; 1NEB A; 5IHK A; 4AFQ C; 2KXC A; 1M3A A; 2OAW A; 1WX6 A; 1UFF A; 2K6D A; 2FPE A; 3GBQ A; 3NPF A; 2AZV A; 3I9Q A; 1AOJ A; 2KT1 A; 1X27 A; 2CT4 A; 2SRC A; 2D8H A; 1ABQ A; 2FPD A; 3NGP A; 1VYV A; 4ORZ A; 2DJQ A; 1H8K A; 3ULR B; 1GFC A; 1AVZ C; 2CSI A; 2IIM A; 2V1Q A; 4JJB A; 2CRE A; 1TUD A; 1SRL A; 4OMQ A; 4J9E A; 4CC2 A; 2K3B A; 3H41 A; 2C0T A; 4M4Z A; 1E7O A; 2FG0 A; 2CH4 W; 3UF4 A; 2GGR A; 1BB9 A; 3VS2 A; 2EGA A; 2ED1 A; 1QWF A; 4OMP A; 5ECA A; 2HBW A; 1GBR A; 4LNP A; 1RUW A; 1K0X A; 1KFZ A; 1PNJ A; 2YUQ A; 1NM7 A; 1X43 A; 1H92 A; 1M3C A; 1E6H A; 2CDT A; 1YWO A; 2D8J A; 2OI3 A; 2VWF A; 5IXB A; 1NLP C; 3CQT A; 3NMZ C; 1SHG A; 2KRM A; 1BK2 A; 1A0N B; 1HJD A; 1MUZ A; 5FW9 A; 2YUO A; 4RTT A; 1VYT A; 1Z9Q A; 4JJC A; 4OMM A; 4ZNX A; 1PKT A; 2RF0 A; 2PNI A; 2EYY A; 1CKA A; 3M0U A; 4A63 B; 1WDX A; 2FEI A; 2DM1 A; 2I0N A; 4HCK A; 1X2K A; 3VRZ A; 2GTJ A; 1TG0 A; 3EG1 A; 1VA7 A; 1AWO A; 1YN8 A; 2DYB A; 4R0K A; 4RTZ A; 1I1J A; 3I35 A; 4GLM A; 1AD5 A; 2K79 A; 4OMO A; 2J05 A; 1ARK A; 4AG1 C; 2K2M A; 1LCK A; 2LQW A; 2KYB A; 1SHF A; 2AKL A; 1WXT A; 2F2W A; 2ED0 A; 2P4R A; 1G2B A; 2DLP A; 1YP5 A; 2MIO A; 3M0S A; 3EG0 A; 2DL4 A; 2LP5 A; 3EGU A; 4AFU C; 2C0O A; 2XMF A; 3NHN A; 2B86 A; 3LH5 A; 2MOX A; 2KGT A; 1K4U S; 2DL5 A; 2L3S A; 3PVQ A; 4AFZ C; 2EBP A; 2W0Z A; 1Y0M A; 3PE0 A; 2O9V A; 1JXO A; 3R6N A; 4J9D A; 2JM8 A; 2NWM A; 2ROT A; 2HEQ A; 2YSQ A; 1ZBJ A; 1I0C A; 1RLP C; 1Z9Z A; 1B3Q A; 1W1F A; 3QWY A; 4WCI A; 1M30 A; 5IH2 A; 1RI9 A; 4Z88 A; 2ESW A; 2GBQ A; 2E5K A; 3H0I A; 4RUG A; 4J9C A; 1JEG A; 1KSW A; 4LUD A; 1JQQ A; 2ENM A; 1UEC A; 1KJW A; 3UA7 A; 1TUC A; 5L23 A; 4RTV A; 2CH4 A; 3VS7 A; 4JPB W; 4J9I A; 1I07 A; 4F14 A; 4LN2 A; 2KR3 A; 1PRL C; 1WYX A; 4DEY A; 1QCF A; 3EG2 A; 5FWC A; 2D1X A; 1N5Z A; 2DRM A; 2AKK A; 1T3L A; 2J6K A; 2GTO A; 4Y92 A; 3EG3 A; 4QT7 A; 1FMK A; 2JMA A; 2G6F X; 3VS1 A; 2ABL A; 5I22 A; 1PRM C; 4CC7 A; 2DBM A; 1YNZ A; 2HDA A; 2OJ2 A; 2JT4 A; 3JV3 A; 4J9F A; 4LE9 A; 3UAT A; 1XOV A; 2YDL A; 5GJW B; 4EIK A; 5IHN A; 4RTW A; 2M51 A; 2PTK A; 2BZY A; 3SHW A; 1W70 A; 1GBQ A; 1PHT A; 2KRN A; 1QKX A; 1GCQ C; 2EGE A; 4K11 A; 3ZL7 C; 1OV3 A; 2H8H A; 1K1Z A; 3I5S A; 2LCS A; 1HD3 A; 2J6F A; 5EC7 A; 1CSK A; 2HCK A; 2KEA A; 1UTI A; 1M8M A; 1U3O A; 2KYM A; 2L0A A; 2KXD A; 2W10 A; 3M0Q A; 2RN8 A; 1J3T A; 1VYU A; 4IIO A; 2KE9 A; 2GQI A; 3EHR A; 1OPK A; 1FYN A; 4OMN A; 2RQU A; 1WXU A; 4HVU A; 2FRY A; 1OPL A; 1SPK A; 1WLP B; 1T3S A; 3I5R A; 3VS5 A; 4DEX A; 3C0C A; 1BBZ A; 1OEB A; 4JJD A; 4JZ3 A; 4RTU A; 5GJV B; 2JW4 A; 4RTY A; 2PZ1 A; 1B07 A; 2K9G A; 5I11 A; 1OOT A; 4D8K A; 2DIL A; 2AK5 A; 1K76 A; 2KRS A; 2SEM A; 2RMO A; 1UJY A; 1CKB A; 1M27 C; 1Y57 A; 3H0F A; 4HVV A; 4D8D A; 2DMO A; 3VS6 A; 2EVR A; 3TSZ A; 2KT8 A; 4OML A; 4X1V A; 3U23 A; 2RQW A; 1QWE A; 2F2V A; 2LJ1 A; 4AG2 C; 1W6X A; 1K9A A; 3REB B; 1V1C A; 2DA9 A; 1IO6 A; 1X2Q A; 4Z89 A; 2DVJ A; 4E6R A; 1UDL A; 4RTX A; 1GRI A; 1E6G A; 1MV3 A; 1YWP A; 2NUZ A; 2CUB A; 1NLO C; 2J7I A; 2AZS A; 1PWT A; 2LJ0 A; 3VS0 A; 2JS2 A; 2RNA A; 4J9G A; 1ZUK A; 5IHI A; 1S1N A; 1AWJ A; 2ROL A; 2EQI A; 3THK A; 4CC3 A; 2KRO A; 3QWX X; 1NG2 A; 2DF6 A; 2L3P A; 2A08 A; 3M0P A; 2VVK A; 4JZ4 A; 1AWW A; 1UE9 A; 1X69 A; 1KIK A; 2O31 A; 1UJ0 A; 2GNC A; 3EHQ A; 1AEY A; 2CT3 A; 4J9H A; 2EGC A; 1PKS A; 3FJ5 A; 2KNB B; 2HSP A; 2LX7 A; 2C0I A; 3VS4 A; 2A36 A; 2EYX A; 2O88 A; 2EW3 A; 2J06 A; 1NYG A; 1GFD A; 2JMC A; 1AZG B; 1UHC A; 1UHF A; 2JXB A; 1HSQ A; 2O2O A; 2FRW A; 1H3H A; 3M0T A; 1JO8 A; 3RBB B; 1GCP A; 4F17 A; 1BU1 A; 1ZUY A; 2DRK A; 4HXJ A; 2X3W D; 1M3B A; 1ZUU A; 1WIE A; 3REA B; 2RQV A; 2V1R A; 3TVT A; 2EYZ A; 5IXF A; 2ECZ A; 2J6O A; 3UA6 A; 2O9S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CSQ A; 2DBK A; 2DL8 A; 1V76 A; 5FU7 C; 2IPO B; 3QYH B; 4JRI A; 3EG9 B; 1QKW A; 1U06 A; 2JM9 A; 1VQN Q; 2L2P A; 2L5Q A; 3CMA Q; 4PJO E; 1UUE A; 2FO0 A; 2L3Q A; 2X51 A; 1QVF P; 1VUB A; 3OYB A; 2YUN A; 2LJ3 A; 1SEM A; 1WI7 A; 3CME T; 1MND A; 1LJO A; 3UT1 A; 2OTL T; 4C92 F; 3CC4 Q; 2GQV A; 3GP8 A; 3JB9 D; 5HCK A; 5LJ5 g; 4HVW A; 5A2Q E; 2A37 A; 1PM3 A; 5FRO A; 3ER0 A; 4BAC A; 1WHK A; 3BFM A; 1QLY A; 4J6X A; 3RMQ A; 4HCZ A; 1HK9 A; 1MV0 B; 4ESR A; 1KD1 U; 4M7A D; 2B8A A; 2E4H A; 1K0S A; 1ZX6 A; 1IXD A; 2E41 A; 1AWX A; 1NYF A; 1PD0 A; 4M7D B; 1SF9 A; 2DEQ A; 5GMK h; 3RKW A; 3VS3 A; 4Z02 A; 3PGG A; 1NJI R; 4C0F A; 2V8J A; 2GCX A; 2BZ8 A; 3KXT A; 1Q86 R; 1WA7 A; 2M0Y A; 2YUP A; 1VQ4 Q; 1YCY A; 4HA8 A; 4AFQ C; 2OAW A; 1QVG P; 3M5A A; 4BDY A; 1WX6 A; 1UB4 A; 2K6D A; 3HHT B; 5GAM h; 5J26 A; 2X4X A; 4OMF B; 3JCM f; 3NTK A; 2D8H A; 2MK5 A; 3NGP A; 3ZEH A; 3FIF A; 4XU3 A; 1VYV A; 2RO0 A; 2CSI A; 2IIM A; 4XTZ A; 1YIJ T; 2QGG A; 4OMQ A; 2QTV A; 1M5Q 1; 4BI3 A; 1WJQ A; 4PKC C; 2XG8 D; 1JBM A; 2PUK B; 4DQ2 A; 4FYY B; 2IVW A; 1WGS A; 2EGA A; 2X35 A; 4A4E A; 2L8D A; 4E47 A; 4C0G A; 1WHL A; 3HRU A; 1U8R A; 5GAN 6; 4C8Q F; 4AMC A; 2JNG A; 4OMP A; 1EZZ B; 3EFS A; 5ECA A; 1GBR A; 4XU1 A; 1K0X A; 3CCU Q; 1YJW T; 5FU6 C; 1PNJ A; 4GLK A; 1KQS A; 3FB9 A; 2DTI A; 4WTO B; 2K5I A; 2KK4 A; 3CCJ A; 4BE1 A; 1D1C A; 2OI3 A; 2ATC B; 1G3Y A; 4PJM A; 2K57 A; 2NLU A; 3HFO A; 3OW2 P; 1QVP A; 3CQT A; 3NMZ C; 1BK2 A; 3VUZ A; 1VQM Q; 1VYT A; 2RK2 A; 2CGH A; 4C92 E; 1LPL A; 1Q7Y R; 2EYY A; 3M56 A; 1CKA A; 3MET A; 1D0X A; 1OUL A; 2MMP A; 2LQK A; 1X2K A; 3C4S A; 2GTJ A; 1ZA2 B; 4BD3 A; 2OAU A; 1YN8 A; 2EQM A; 1I1J A; 3OYJ A; 2VGN A; 1Y96 B; 5LJ5 f; 2J05 A; 1YBY A; 2ZPE B; 2K2M A; 1SHF A; 2AKL A; 1K8A R; 1BI2 A; 4KH1 B; 4M75 C; 2ED0 A; 2D0Q B; 2VV5 A; 2P4R A; 3GNG A; 1M9S A; 1YP5 A; 2DYI A; 3WXM B; 3QSU A; 2DL4 A; 3EGU A; 4AFU C; 1VQ7 T; 3JCM b; 1K4U S; 4XTU A; 3LGL A; 2MI6 A; 2L3S A; 3CMA T; 5D6Y A; 1U1S A; 4C5G A; 5GAM d; 2DXC A; 3P8D A; 1VQN A; 3MHX A; 3R6N A; 1BYM A; 4J9D A; 5GAO n; 3I55 Q; 3LGF A; 2ZGW A; 2HEQ A; 2YSQ A; 4M78 F; 1B3Q A; 3CCM T; 2AT1 B; 5IH2 A; 4PJO G; 3CC4 A; 2RJE A; 2GBQ A; 4MZM A; 3N5B B; 1JEG A; 3OMC A; 1M1F A; 2FZG B; 1N9R A; 3TU4 K; 5D6X A; 1TUC A; 2CH4 A; 1VIE A; 1ZSZ B; 4YTL A; 2MPX C; 4LN2 A; 1PRL C; 3EG2 A; 4JLI A; 2YLB A; 3MJX A; 1N5Z A; 4ZN1 A; 1T3L A; 2J6K A; 3OBY A; 4Y92 A; 2XK0 A; 4A4K A; 4C8Q E; 3LYI A; 2JMA A; 2H3E B; 5IAY A; 3LW5 E; 2Y4Y A; 4XQ3 A; 2OJ2 A; 1K73 U; 3UAT A; 4LE9 A; 1VQK A; 4EIK A; 5IHN A; 2M51 A; 2BZY A; 4XU2 A; 1VQ4 A; 2BE7 D; 3CCL Q; 1W70 A; 2NUT B; 5IT9 E; 4C5E A; 1GBQ A; 1IRX A; 3SD4 A; 3M54 A; 5D6W A; 5GAO r; 1QKX A; 1GCQ C; 1QQJ A; 1D1A A; 1VQP A; 2YXY A; 1K1Z A; 3I5S A; 2EIF A; 2LCS A; 5EC7 A; 3M9Q A; 2KEA A; 4FU6 A; 2L0A A; 2YRD A; 4M7D A; 3OYD A; 5CKE A; 1N8R C; 3PNW C; 4IIO A; 2GQI A; 1OPK A; 2RJC A; 3DB3 A; 2QYZ A; 4Q5W A; 1WXU A; 5KCO A; 1MMA A; 3EH1 A; 1QP2 A; 1X6O A; 4DEX A; 3OSV A; 5KE2 A; 1SSF A; 3CCU T; 4IUQ A; 4FM4 B; 1RAB B; 1B07 A; 1QCO A; 1IZ6 A; 4PLI A; 5I11 A; 4D8K A; 2VB6 A; 2P0Q A; 2RMO A; 1B34 B; 3QXE B; 1CKB A; 2QK0 A; 3H0F A; 4Y28 E; 6AT1 B; 2QA4 A; 1BIA A; 1TUG B; 3U23 A; 2MYS A; 1QWE A; 1R8O B; 3L42 A; 3OYM A; 1C1A A; 4O5V A; 2KI7 A; 1M90 C; 4X9C A; 4M78 B; 4PFZ A; 4RTX A; 3CC7 T; 3J80 E; 4OGE A; 4M75 D; 5DLQ E; 4XTY A; 4J83 A; 2K3Y A; 2CUB A; 1PWT A; 3BW1 A; 1VQM A; 1RAF B; 2X9H A; 2E70 A; 5IHI A; 2IG0 A; 1K9M C; 2QAS A; 2X4W A; 3GLX A; 4KGV B; 3FLG A; 2EQI A; 3THK A; 8AT1 B; 1VQ9 T; 2XU8 A; 1KQ1 A; 1U1T A; 2X4Y A; 4JZ4 A; 3H6Z A; 5FU7 B; 4C92 G; 3RMS A; 3QO3 A; 2PVO B; 1AEY A; 3V7S A; 3QG1 A; 2CS7 A; 4DBQ A; 1KC8 C; 1OI1 A; 2XDP A; 3CC2 T; 4J7I A; 1JJ2 A; 3CME Q; 2A36 A; 2EYX A; 1IGU A; 2EQK A; 1NYG A; 1GFD A; 2OTL Q; 1IRE B; 4BUG A; 1TS9 A; 1UHC A; 1UHF A; 3A1P A; 2YHT A; 1HSQ A; 4MZP A; 5CKF A; 4FW2 A; 2F5K A; 4DBR A; 3A8O B; 1H3H A; 3RIR A; 4LDW A; 3NFC A; 1VQL T; 1GCP A; 5LL6 S; 2EYZ A; 1TWB A; 5IXF A; 5CCA A; 1Y96 A; 2HKN A; 2VC8 A; 3G6E T; 3QKJ A; 1JXM A; 5FRM A; 5CAI A; 2EKH A; 3EGX B; 5GAN g; 2DX1 A; 3A5Z B; 3IQL A; 4N0A C; 1RAD B; 3EFO A; 2QDL A; 1TXQ A; 2FZK B; 3QDF A; 4ZTF A; 3ME9 A; 2VKN A; 2COY A; 4R55 A; 2CZ1 B; 4OB2 B; 3FDR A; 4QVD A; 4AFS C; 2DIQ A; 1PCX A; 4Z8A A; 3P8B B; 3QII A; 1YHQ T; 3VV0 A; 1ZSG A; 3E2U A; 2CKK A; 3M59 A; 4FSS A; 4F16 A; 1W2B A; 5KYU B; 3RER A; 4EMK C; 4PJJ A; 2A28 A; 4E7H A; 4MDX A; 4C8Q G; 1JU5 C; 3CD6 Q; 4O6J A; 2P84 A; 2RHZ A; 2H3J A; 3M4Y A; 3CCL A; 2DO3 A; 2LQ8 A; 5DY9 A; 2JTE A; 3CCS T; 1ZSZ A; 3V7R A; 4C8Q A; 3PT9 A; 2MF2 A; 4M77 F; 1QMC A; 1YCS B; 3JCM c; 4LDY A; 3QUI A; 5GAN 3; 4IUT A; 1Q82 U; 5GAO p; 2MCN A; 1S72 A; 4DBF A; 3H0H A; 2MAM A; 4RKU E; 5IHK A; 2KXC A; 5FU6 B; 4JRP A; 2XID A; 3CPW A; 3GBQ A; 2AZV A; 1AOJ A; 2KT1 A; 4FYW B; 3NTH A; 4E7I A; 4N4H A; 4ZN3 A; 2PVD B; 4IUU A; 1ABQ A; 2E6N A; 1IHW A; 1G3S A; 5A0L A; 4ORZ A; 3ULR B; 1AVZ C; 2NUT A; 4ZGJ B; 1KHC A; 1ZHI A; 2QDY B; 2CRE A; 3E9F A; 2R57 A; 2K3B A; 3H41 A; 2C0T A; 2AIR B; 3CXC S; 2E3H A; 1KG1 A; 3X28 B; 4IUR A; 3UF4 A; 3OYK A; 3C95 A; 2GGR A; 3M58 A; 5GAN 5; 3MP8 A; 2RHY A; 7AT1 B; 3OYA A; 1MMN A; 2FL7 A; 3EGD B; 1QWF A; 5CQX A; 4LNP A; 1RUW A; 1VQ6 T; 2K5F A; 4XTX A; 3QZ5 B; 2DD5 A; 4M75 B; 1VQ7 Q; 1Q95 G; 2D8J A; 2O4X B; 2AHJ B; 1R0C B; 2JN0 A; 1KQS P; 1NLP C; 4BY6 C; 1DJ7 B; 3QZ9 B; 2YUO A; 3OSS C; 4RTT A; 4JJC A; 2F5T X; 1Y07 A; 5GAN f; 1M90 R; 3F70 A; 3OYG A; 2YLC A; 4M78 A; 2ZPG B; 4LDV A; 3CME A; 3M0U A; 3CCM Q; 1G8X A; 2OTL A; 3J7A F; 2DM1 A; 2KQW A; 3RKX A; 1RAA B; 1VQO A; 4BE2 A; 2I0N A; 2BUD A; 4HCK A; 2DJZ A; 3MP6 A; 3EG1 A; 4R0K A; 1K9M R; 3A8L B; 4RTZ A; 3I35 A; 2PVG B; 4DOW A; 2XDB A; 2OTJ T; 2FZC B; 4MMK A; 2K79 A; 4M77 B; 1X75 C; 4JDS A; 4AG1 C; 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