2B4MA

Crystal structure of the binding protein opuac in complex with proline betaine
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
SAAEQVNKTIIGIDPGSGIMSLTDKAMKDYDLNDWTLISASSAAMTATLKKSYDRKKPIIITGWTPHWMFSRYKLKYLDDPKQSYGSAEEIHTITRKGFSKEQPNAAKLLSQFKWTQDEMGEIMIKVEEGEKPAKVAAEYVNKHKDQIAEWTKGVQKVKGDKINLAYVAWDSEIASTNVIGKVLEDLGYEVTLTQVEAGPMWTAIATGSADASLSAWLPNTHKAYAAKYKGKYDDIGTSMTGVKMGLVVPQYMKNVNSIEDLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glycine betaine-binding protein
publication title Molecular Determinants for Substrate Specificity of the Ligand-binding Protein OpuAC from Bacillus subtilis for the Compatible Solutes Glycine Betaine and Proline Betaine.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 87
structure length 264
sequence length 264
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 2b4mA02
3.40.190.230 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2b4mA01
4FAJA 3DRHA 3MVXA 3MZBA 3TCHA 4OEUA 4ZEDA 4PFWA 3M8UA 4OFJA 1VR5A 1B0HA 4PFUA 3MVZA 5F1QA 2WOKA 4QFKA 1B3HA 3T66A 2D5WA 3DRGA 2OLBA 4ONYA 4QFLA 4OFLA 3RYBA 2B4LA 5L8DA 2RKMA 3DRKA 1ZU0A 1OLAA 4I8CA 1B1HA 3CHGA 3DRIA 1B2HA 1B3GA 3MVYA 3DRFA 3O9PA 1UIUA 3ZS6A 4QFNA 3RYAA 3RQTA 2O7IA 3MVWA 1RKMA 3TPAA 5ISUA 2WOPA 4GL8A 1QKBA 1B4HA 1JEUA 4ZE9A 5ICQA 1B32A 1XOCA 1B46A 5KZTA 4ZEBA 3TCGA 4ZEIA 3PAMA 4ZEKA 1B6HA 4PFYA 4XKRA 4DCYA 4OETA 3DRJA 1B5IA 1JEVA 4RA1A 4QFPA 4XKQA 1DPPA 3FTOA 4OFOA 4JSOA 3E3KA 4OEVA 4OERA 3RY3A 1B5HA 1B52A 1ZTYA 1QKAA 2B4MA 3MW0A 1B3FA 4OESA 1OLCA 1DPEA 2GRVA 4XKPA 2Z23A 3I5OA 2WOLA 1B51A 3LVUA 1B05A 3TCFA 1UIVA 5HM4B 4TOZA 1JETA 1ZLQA 4GF8A 3O6PA 4XKNA 1B3LA 4DCXA 2NOOA 4I9DA 1B58A 4QFOA 1B4ZA 1B7HA 1B40A 4ZE8A 4GFRA 1UQWA 1B9JA 4JSDA 3QIMA 1B5JA 4PFTA 4WEDA 4ZECA 3MZ9A 3DP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FAJA 3D4GA 3MZ1A 4I40A 5I59A 2ZYNA 3E78A 2I3VA 1I69A 3OD7A 2D3IA 1DMBA 1XVYA 1LB8A 5IKBA 3FXBA 2DE3A 5DEXA 1FPBA 4R6HA 3H6UA 2B65A 1MPBA 4NE4A 2UVGA 5IZZA 2KQZA 1MQIA 2RF1A 1IXHA 2RCBA 5IZ1A 1D9VA 4LATA 4QSCA 3CG3A 3MVYA 3FV1A 4H6DA 4EF2A 3HO7A 1NV1A 3N26A 4GXAA 4RJZA 4M4GA 3IO6A 1NUZA 4N07A 5TPAA 4QXDA 1H45A 3PUXE 2O69A 5DVIA 5AA4A 4UA8A 3K6XA 5EQ7A 1INPA 4ZEKA 4F3GA 1YPNA 3DRJA 1B5IA 4XKQA 4OERA 4HCWA 2AIXA 4XIGQ 2O1MA 1FTKA 4TLMB 4L17A 4OESA 3K1PA 5DTBA 5I5PA 3TCFA 2Q88A 1RYOA 4THIA 5I84A 4N6KA 4PAKA 1MY3A 4IB2A 3S4UA 4OZ9A 2QVUA 1MXYA 3T1BA 4H67A 4GFRA 3QXMA 3TODA 3QIMA 4WEDA 4O7MA 5ITPA 4HE2A 2V3UA 3G7WA 3KSXA 1CB6A 5CM6A 3G3HA 4OVJA 5LTCA 1NV2A 4QRZA 2F36A 4YMAA 1NH8A 3TELA 3IOVA 2QPQA 2PT2A 1ZBMA 1NKXA 1OMPA 2A5SA 2QMWA 2RC7A 5BUUA 3JYRA 4EXKA 4KR5A 3KN7A 3CSGA 4X04A 1ZKBA 4DXCA 4Q0CA 3RLFE 1II5A 4YB5A 3DRFA 4POXA 1GV8A 2M8CA 3B8BA 1EZPA 5H8HB 4EQ7A 1URDA 1P1NA 3KEIA 3MPKA 3S2VA 3UN6A 3KSJA 2PFYA 1NFTA 4PFBA 3IB0A 1URSA 4JB7A 3K4UA 4NEDA 4RPOA 4GWUA 3KJTA 2QS1A 1Y20A 1LB9A 2CZKA 4I1DA 1Y9UA 3LV0A 4R9GA 1A8FA 4NN3A 3W15C 4ECFA 3QUFA 3GBBA 3GXAA 1XS5A 5HBCA 2GHAA 2XXWA 3EKIA 3QMFA 3LUYA 4NGUA 1FQBA 2Y7IA 3TTMA 1MXUA 4R2FA 4OQOA 2REJA 1UQWA 2XX8A 5DYHA 3HHFA 3MZ9A 3B7DA 2V25A 4GWWA 2Q2AA 3PPNA 2ZMBA 3VVEA 4N6DA 4H5FA 3UP9A 2L5VA 3MWBA 5H8HA 3UK4A 3R7XA 3RYBA 4R75A 3IJOB 1N76A 4U4SA 4PBQA 1AOVA 3V5AA 5DVJA 5EQ9A 3CSBA 1FQAA 3OO7A 3DM0A 4AQ4A 1B1HA 3RNNA 4YKIA 3N6TA 1YYZA 2F78A 1POTA 3M3LA 4MNCA 3CFZA 4KXPA 3JV9A 1MRPA 5F7VA 4FORA 3N94A 3TTKA 2F35A 3WAFA 2ZZXA 5EQAA 2F7BA 3MPLA 2I48A 2WBBA 3TFLA 4ZEBA 2Y7RA 3IB1A 3OMBA 4K3FA 4NTLA 4EDPA 4LN5A 4OETA 2FIXA 1B52A 2CEXA 1QKAA 2I49A 2LAOA 2ABHA 4MNPA 2Z23A 3LSFB 5ET8A 3VVFA 1FQEA 1OVBA 3FIRA 4EUOA 2PFZA 3LSLA 1NL5A 3SETA 3FUZA 4GWYA 4KYSA 4LQ5A 1UTBB 4MIJA 4NMYA 4U2RA 3FXRA 5I57B 1K9ZA 1B4ZA 1DBZA 4F3PA 3EF7A 3IX1A 3MJNA 3MYUA 2O51A 2Y7KA 2F6GA 2VGQA 2P2AA 3VDFA 4MEVA 1B3HA 3T66A 2QSXA 1G0HA 2FNCA 2HHMA 2WYPA 5I3SA 4BDMA 2O1LA 1NNPA 1ZU0A 3WAEA 4MNIA 5FTIA 4IO2A 3CHGA 4HS7A 1US5A 1SI0A 1FPEA 2ONKE 2E0SA 1Y1MA 3LSWA 5AA1A 4X1BA 1H76A 4ISUA 2PCRA 3K01A 4WKMA 4P0GA 3PMVA 3HPIA 4LZ8A 1J1NA 1PB9A 2BJIA 1LEVA 3LBSA 3TCGA 4YKPA 1UTBA 4YAHX 4PCDA 5I57A 1NH7A 1FQCA 2O68A 3PGFA 3RN8A 1H3DA 4MF3A 1P99A 3FASA 1JP4A 1MM7A 3O6HA 4P0IA 1RDZA 4N6PA 4OHNA 2WOLA 4PE5B 1JW5A 1NMUA 3G3KA 3D4CA 4E0XA 4LZ7A 4H8IA 4ZZEA 2VD3A 2THIA 1CNQA 3K0VA 4I9DA 3K1NA 3OEKA 2F5XA 2QS3A 5ET7A 3ISPA 1FPKA 5T3JA 3EHTA 4P1LA 3G3GA 1H43A 3L6HA 2P0SA 1MQGA 3EQ1A 1LAHE 4PFWA 1SDXA 5EYFA 1SBPA 2HFBA 1IMCA 4OFJA 4PFUA 3C31A 3SEXA 3B6WA 3FV2A 1HSJA 4GBVA 4QFLA 1NV3A 3B6TA 1USYE 2KLFA 3A3CA 4RNSA 4H8JA 3TAJA 1NV0A 4I3YA 4JDFA 5FHNA 2Q89A 4QSEA 2XHDA 5AE4A 4I8CA 5CMBA 4KCCA 1B2HA 4PBHA 3PUYE 1SQYA 1S9TA 2I4CA 3IAZA 3U94A 4HW8A 1QUJA 3FD3A 3CI8A 4YKJA 4P3LA 4F1YA 5JTYB 3VLUA 3QYTA 2Z8DA 2HZKA 2QRYA 3V83A 1QJMA 3H3GA 4OTEA 4GRKA 3K6UA 5ITOA 1VSOA 5I7IA 3PAMA 1P1WA 4FEDA 1IXGA 4QFPA 3C33A 1FBCA 4NF0A 4G61A 3Q25A 1YZ0A 4FE8A 5DEXB 2GRVA 2AL5A 2PVUA 1WDNA 1QUIA 3MP8A 4HE0A 1N7XA 2A5TB 1UTHA 3OO8A 1QUKA 4GOTA 3E13X 3E4RA 3BIHA 3T93B 3KG2A 5ESYA 4XKNA 4DCXA 2VHAA 4NF5B 1M5CA 3EHSA 3O6IA 5TPAB 3IJXB 1WODA 1A54A 3KC1A 5I2NA 3H03A 5ICTA 4NF4B 3BBRA 1MH4A 4UACA 4QHQA 1FBFA 1DK4A 3GBAA 5L9MA 1MQDA 4R74A 2KR0A 3P7IA 3RPLB 5JTYA 3MSTA 1OIBA 4G8MA 3KFMA 4N8GA 3PPOA 1AIVA 4F29A 3FVOA 5AA2B 2Q9TA 1KZ8A 1TFDA 3A29A 3FATA 4OYVA 4PP0A 4KCDA 4GX4A 4G4PA 2RCAA 1PDAA 2RINA 2WOPA 3FVNA 3H6TA 5TU0A 3K2DA 4R6YA 3TKDA 4PFRA 2A5TA 4DIGA 1NNKA 5K2YA 3OOAA 4AS5A 3OELA 3KZGA 4NF5A 2XWOA 1EU8A 1DPPA 1RDXA 4BLAA 3E3KA 5H8QB 5ET6A 2HCAA 3MW0A 3E79A 1NI9A 4JBZA 3RYDA 4OXVA 4O3CA 2Q74A 2ZNSA 4N81A 3I5OA 4PFIA 5I56B 1SYHA 4G2ZA 4GVOA 1UIVA 3JZJA 1ZLQA 2XWIA 4NF4A 3FJMA 3UGWA 1B7HA 3RPLA 1B40A 3OSRA 1NV4A 3HN0A 2IA4A 1N04A 3SEYA 1N0TA 4FIMA 1MQHA 5IGAA 1LBWA 3RGYA 5AA2A 4KI0E 4FECA 1B0HA 2OWZA 2DVZA 5TP9B 3UORA 2B4LA 3BFTA 3SZPA 3M3KA 2ZNUA 1OVTA 4O7IA 2CMOA 2XXKA 4R72A 2DWIA 4NAPA 4NWCA 2GFEA 5B7DA 3PUVE 5CC2A 3CIJA 3ZS6A 4QFNA 2HZLA 4KQPA 5H8QA 2AL4A 3U65A 4MLQA 2O7IA 5JEIA 3T9HB 4DXBA 2HAVA 4F3BA 2ZXTA 1JEUA 3MBPA 4ZE9A 5I56A 1AMFA 3RTWB 1FW0A 4LONB 3O28A 5KZTA 2GQ1A 4KPTA 4X9TA 3O29A 3PV0E 3T0JA 1B5HA 3FGSA 1VDWA 2ALUA 4LZ5A 3KN3A 1SYIA 4F39A 2XXPA 1M5FA 4IY6A 2QL3A 4N91A 4BDNA 1MXXA 5TP9A 4MH5A 2Q8JA 1DTZA 2REGA 1MY1A 1GVCA 3CVGA 1LFIA 3C4MA 5DW8A 4X48A 1FPFA 2UYFA 4DI4B 3V8XB 4YKKA 2AYSA 2VP1A 3Q26A 1B3EA 3MQ9A 4ZEDA 2HAUA 1Q1KA 1XHYA 4KHZE 1USYH 4EXLA 1LAFE 3O2AA 4GD5A 2ESNA 4H65A 5L8DA 1JNFA 2YLNA 2UYEA 5J16A 1US4A 2DS9A 1Q35A 3OENA 4RK2A 5CMMA 1FBEA 3HSTA 2XA5A 1YAEA 3TDJA 4YICA 4PQJA 1B7ZA 1MY2A 2OCUA 4N13A 4PGPA 2XXYA 1SD3A 3PPRA 2Y7WA 2R71A 2OWTA 2W7YA 4I62A 4F22A 4U22A 1PC3A 2VPOA 2Q8MA 4ZZAA 2QVVA 3SEVA 4ZEIA 3UIFA 1B6HA 2V84A 4FEBA 3USDA 4U1ZA 4MX6A 5FTHA 1FTOA 4IGTA 4X8RA 1A99A 1GGGA 4MBPA 2RC9A 5DVFA 1B51A 4O3AA 1PBPA 3C35A 1SW4A 1IQ7A 4O3BA 3TQWA 4H5GA 1MDQA 4N15A 3IOWA 3MP1A 2PT1A 4H46A 1B58A 4KYEA 3B6QA 2DQVA 5F24A 1BTJA 5CMKA 1F9BA 5H8SA 3M8UA 4OMBA 4QBAA 1IMBA 2DVCA 2DSFA 4OFLA 3IFAA 1N84A 2RKMA 3DRKA 1OLAA 4GWXA 4ESXA 4JVDA 3FVKA 1B0LA 2XX7A 1LGBC 4OA4A 1JW1A 1TWYA 2XXXA 1NUWA 1SW2A 4N17A 4GWSA 1FPIA 4PAIA 1URGA 3ECRA 3FZVA 2NWJA 5H8NB 1WVJA 4F3SA 4LA9A 4PETA 4R9FA 4GIZA 3R26A 4PDHA 4XFEA 1MY0A 3TZAA 4G68C 4GWZA 2DXRA 3VFJA 2ONRA 1IXCA 2WBDA 2PBWA 3PD8A 3FTOA 2NXOA 1ZTYA 2HQ0A 4HXVA 1FJ6A 4OANA 3Q28A 2OX3A 3IOUA 3DP6A 3QAXA 2DE4A 3U92A 5B70A 3IFCA 3IR1A 4F1VA 3M3FA 2MKZA 1B1XA 3EPEA 2PMSA 2Z8EA 4GXSB 4ELOA 1FTJA 1FPGA 1ATGA 2V3TA 1LBXA 1POY1 2ZYOA 4DXUA 4IO7A 1B9JA 4DI3D 2G29A 3KOSA 5KDTB 3O97A 3PU5A 5EHMA 5IM2A 1MXZA 3MVZA 2Q2CA 2XXVA 4GX3A 1SW5A 2F7AA 5M2VA 4P1EA 3QSLA 2OLBA 1ANFA 5EQ8A 1LLSA 1EZ9A 2HXRA 3E9XA 4O8MA 2DDKA 3PTYA 5H8NA 1R9LA 3A3UA 4OENA 3ROJA 1OQGA 4YU0A 3KC0A 4GWOA 2P3NA 3TTRA 4PAFA 1MXWA 2RC8A 2F3BA 2I3WA 5CMCA 2DWJA 1T0KA 3DRIA 4ESWA 3ZKKA 1UTHB 4RK9A 4IGRA 2H5YA 3KGCA 1GR2A 3IB2A 4C1TA 3RYAA 5JK4A 4MJOA 4LUBA 1I6QA 1QGXA 1BLFA 2PYYA 5ICQA 3UA8A 4RPNA 2FVZA 1DSNA 3THIA 3F11A 3H7MA 1QULA 2VT5A 3TEPA 2GHBA 1FRPA 2DWAA 5I2NB 1MPCA 4OEVA 1ZJLA 3RY3A 1PBQA 3FVGA 2G93A 4OVTA 1BK4A 2WKYA 5KDTA 2QFLA 3RPWA 4H45A 1MH3A 2XXRA 1IUDA 1Y4CA 4HE1A 4NQ8A 3NOHA 4N8YA 3KJ7A 4ELQA 4P8BA 2Y5KA 4ZE8A 4ELPA 1Z7ME 3ZSFA 1TXFA 1M5BA 5HPQA 3FXUA 3C34A 5AA2D 3MVXA 1MDP1 3VXBA 3MP6A 2H25A 4FJPA 3SKPA 1VR5A 4HTGA 4IO5A 2I4BA 4E0WA 3IL1B 3DLNA 3DRGA 1ZMGA 2I6EA 2H99A 3HHGA 3HFUA 4AS4A 3FBPA 1DOTA 1R1NA 1NUXA 1PEBA 4H0WA 1FBDA 1LBYA 3I6VA 1VFDA 1I6AA 1DTGA 2V3QA 4HCYA 4TQUQ 4U21A 4GQOA 2CZLA 4F2QA 2O84X 1KA0A 3O9PA 2HPGA 1UIUA 3K00A 3SEWA 5AA3A 3RQTA 2F7CA 1I6BA 3BIGA 5EYGA 1RDYA 3H4ZA 1K9YA 3PMWA 4Z0IA 4MCOA 2OK2A 4NG7A 3EHUA 5CI5A 2P3VA 1D9YA 2ZYMA 5A5XB 4PFYA 4XKRA 3W9WA 4JSOA 1O64A 4ELRA 3S9LC 2B4MA 3ONMA 1AH5A 2YJPA 2VPNA 3Q29A 1OLCA 4GX6A 3G3JA 1FTMA 4G68B 2X26A 1FTAA 3TMGA 3K1MA 3U8QA 3SERA 3LVUA 3H06B 1FSAA 1BKAA 3RT6B 3O6PA 1B3LA 4KD5A 2OWSA 3A09A 4G8HA 2E1SA 3CG1A 2CZIA 1R9QA 4G77A 1MM6A 1CE2A 3ILUB 1JW4A 4YZZA 3Q27A 5FBPA 1SI1A 3TCHA 4JVIA 1BIYA 4UABA 1BP5A 2X7PA 1EYIA 4QFKA 1L5TA 3IO4A 1FBHA 2ZNTA 4AB5A 2QMXA 2YPNA 4YMBA 4TLLB 4XTCQ 4DZ1A 1EYJA 2XXUA 3SDFA 3OSQA 5A5XA 2V93A 1SVXB 2DE2A 1VFEA 1FQDA 1KWHA 1QVSA 1IMAA 1AL3A 3MVWA 3CFXA 4ZEFA 2I58A 1R6ZA 4GL8A 4G68A 3PPQA 4F2OA 1MPDA 3T22A 1PB7A 4C0RA 4NHBA 2UXAA 3IK6B 5FHOA 4R6KA 4U4XA 2XXTA 3FJ7A 3LSXA 2V4CA 2XXIA 5IZ3B 3OO9A 2OBGA 1LBBA 3K6VA 2IEEA 2PX1A 1NUYA 3U72A 1LBCA 1O7TA 2I0BA 3U93A 3TUSA 4GF8A 4PF6A 1IMFA 1LAXA 3O6GA 4DLDA 3VLWA 3S9NC 1IXIA 1ZIUA 2ZZWA 3FJGA 2XD2A 3K6WA 5J1DA 3LUZA 3MZBA 2FYIA 2DYXA 4ZS9A 4U23A 2JJKA 3PPPA 4MLVA 4DE8A 2UVJA 2ZYKA 4PC9A 3IORA 5KCJB 3QUJA 1KA1A 1MG1A 1MY4A 4XF5A 2ONSA 1YTVA 3B50A 4AB6A 3KBRA 1P1UA 5I58B 1EH3A 4MAGA 5L9OA 4N4UA 1LFHA 5IZ3A 1B3GA 2F34A 1D9QA 2F6PA 1IEJA 4PDDA 3ILTB 5LOMA 4NF8B 4Q30B 3GZGA 3TPAA 4XXUA 2QS4A 1QKBA 4IR8A 4QSDA 1JQFA 1MS7A 1IZ1A 3VV5A 1XOCA 4NX1A 3SEUA 1B7UA 3LR1A 1D3KA 1DCUA 3GYYA 1ELJA 5I2KB 1XVXA 2R8TA 1MQJA 4LVQA 3W9VA 1TT1A 4PGNA 4GBWA 2FBPA 1YXIA 3G3IA 4OVQA 1N3XA 1FBPA 2FA7A 4TOZA 1JETA 2QJEA 5KCJA 4H1XA 4GL0A 4QF9A 2DOJA 3T9VA 4EQ9A 4JWOA 1Y1ZA 3DRHA 1MXVA 1FTLA 1FQFA 4MMPA 4O94A 3GLBA 4OVSA 4XEQA 3HCQA 4PE3A 5I58A 4F31B 3S9MC 3VXCA 2X7QA 3R6UA 3C32A 1XT8A 4ONYA 4POWA 4NF8A 2WEFA 1LAGE 2QS2A 4JWXA 5EYHA 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