2B65A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 117
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A02
3UORA 1CB6A 1LFGA 1XHYA 3U1OA 3TAJA 3CR9A 4LVQA 5IKBA 3OOAA 3DP8A 4YB5A 3T9HB 4OFOA 4OYVA 3FGSA 4R74A 4ONYA 1J1NA 3U92A 1ANFA 2UXAA 4I1DA 4IO2A 2GFEA 3THIA 1EZ9A 5HM4B 1MPCA 5F7VA 2NUVA 1SYHA 4TLMB 2O51A 4OFLA 2XXTA 4OESA 1JETA 3O66A 4OVJA 5I57B 4FORA 4O3CA 5DVIA 2A5SA 5I59B 4QHQA 3VFJA 3QK6A 2M8CA 4BLAA 3PD9A 5HPQA 2Y7IA 5JK4A 3W15C 4YB6A 4GXSB 4I62A 4LZ8A 2DQVA 4X1BA 1PB7A 1MRPA 5H8QB 1MG1A 3ONMA 4FE8A 1IXHA 4ELOA 4U4SA 4ESXA 4R6KA 5ICQA 4E0WA 2F6GA 3T9UA 1LAXA 1JEVA 1NNTA 1Y4TA 4OWDA 1D3KA 2UYEA 3H03A 2FNCA 2R6GE 4KCCA 2B3FA 1PEBA 3MBPA 3FUZA 5DVJA 4XKRA 1POY1 2V3TA 1FQCA 2FYIA 4TOZA 4DE8A 2HQ0A 2RC8A 3VXCA 5I59A 3IJOB 3S9MC 4RPOA 2HZKA 1MS7A 2PVUA 4F2OA 4ZEIA 1Y1ZA 2PT2A 3C35A 4N13A 1DOTA 1JVYA 2F35A 1LCTA 3E4RA 4TQUQ 1UIVA 1MY4A 1P1QA 4XKNA 2NVUB 5CMBA 4ESWA 1II5A 1ZLQA 3PUYE 4PFTA 4XTCQ 4LUBA 2F7BA 4GXAA 1NL5A 2O69A 2OK2A 3B6TA 3TZAA 3IR1A 4BDQA 1LGBC 1SW2A 3WAEA 4PFYA 1QKBA 3TDJA 2DXYA 4KYEA 3QAXA 4H65A 1RYOA 3CG1A 3OENA 3PD8A 4U1OA 3AXFA 3PMVA 2QS2A 4RJZA 4U2RA 1JW4A 1A54A 3C9HA 3O97A 3Q26A 1URGA 4POWA 5JTYB 2IEEA 1IIWA 2GHAA 3CSGA 1BTJA 1MDP1 3GLBA 4P11A 3TQWA 2F34A 3C34A 4KQPA 4YZZA 2VOZA 4JXIA 2I3VA 3Q29A 3H7MA 3OO8A 4RXLA 1CE2A 3EPEA 3DLNA 4NF6B 1LBCA 3K02A 3MP1A 1NKXA 4RK2A 4O3AA 2OLBA 1Y9UA 3H6VA 3VVDA 1MH3A 1HSJA 3FXUA 4GVOA 2DP8A 5I58B 3FATA 5AA2A 2Z23A 1N7WA 1VE4A 4QFKA 3TTNA 3H06B 1XC1A 3OMBA 1B0LA 5ITOA 3A3UA 1Y20A 2VP1A 4LZ5A 4ZEKA 4OZ9A 1M5EA 2Q2AA 5FTIA 3M8UA 3OXNA 2DWIA 1SI1A 1B1HA 5CBSA 3MVXA 3L6GA 1FTJA 4HCYA 4NF6A 2PYYA 3FXQA 4QSEA 3KN7A 3B6WA 5BWJA 1QKAA 1YPNA 4IO4A 3LSWA 3ILTB 4LQ2A 4PQJA 5HBCA 1ZKBA 1N84A 4YKPA 3UP9A 2QL3A 1GTKA 1F9BA 2HXWA 4G8NA 2Q8JA 3Q25A 4GL0A 1B52A 3V8XB 4EF1A 3GBAA 5KCJB 3HSTA 3OELA 3S9EA 2DS9A 1OIBA 2GH9A 4MLVA 4F3SA 2D3IA 4AQ4A 2DWJA 4KI0E 1MXUA 4KD5A 5CC2A 3WAFA 1IXCA 5DEXB 3O6HA 2DOJA 1DSNA 1LCFA 1N3XA 3DP6A 3RT8A 2P2AA 5L9MA 2OCUA 2XXPA 4F3BA 1USYH 1TFDA 3E9XA 1PBPA 3PPNA 5JEIA 3T66A 4R6HA 4FIMA 3A3CA 2O84X 4ELPA 4F39A 4WKMA 4OQOA 4ZEBA 4BDLA 5CMMA 1IZ1A 1MQIA 2R9JA 1P99A 4KYDA 1QVSA 5TU0A 1FW0A 2X7PA 2QSXA 1TWYA 3USDA 3TFLA 2I0BA 4H5FA 1H3DA 4WXJA 2P0SA 4THIA 1YTVA 3HHGA 3K6VA 4BDMA 4O3BA 4HS7A 1Y3PA 3QYTA 1S9TA 3LSFB 3IOWA 1MY1A 3FASA 4JSDA 4JBZA 2CZLA 1AMFA 1VSOA 3G3GA 3KZGA 4DCYA 4FAJA 1M5FA 3MWBA 4LATA 3PMWA 2QS1A 5TPAA 3KG2A 4FECA 2DE4A 1N76A 3OO7A 2DSFA 4JWXA 3H4ZA 2O1LA 2G29A 3PUXE 3L6HA 2CMOA 1B7ZA 1D9YA 2REJA 5AA3A 4HW8A 2ABHA 2O6AA 3IB1A 1NMUA 4OEVA 2PBWA 2F78A 2UVGA 3ECRA 1VFEA 3RY3A 1A55A 3FIRA 1S7YA 3S4UA 2V25A 5BUUA 3PPQA 3MPKA 3RNNA 3TCFA 2XXUA 3V89B 1EH3A 2X7QA 3MJNA 1FTLA 4H67A 3PV0E 2VHAA 4ECFA 3OSQA 3TTRA 5I84A 4C1TA 4GRKA 4ZE8A 3RT6B 3KEIA 4PETA 4RPNA 1Y3NA 5TP9B 1OLAA 3N6TA 3C31A 1FTKA 3MP6A 2OWSA 3RLFE 2REGA 4JSOA 5CMKA 4RK9A 3CSBA 4KR5A 3A09A 1A40A 4U21A 4R2FA 3KJTA 3IO4A 1IUDA 1MDQA 1NFTA 4DDDA 3LSLA 2G93A 3IX1A 3O2AA 1HSLA 3U72A 1RKMA 3MUQA 3TMGA 5H8SA 1DPPA 1UIUA 2NXOA 3QSLA 1B40A 1MXZA 3MZBA 3TEPA 1RYXA 1B5JA 1M5CA 1TT1A 2OJTA 4R9GA 1JW1A 4R75A 1H45A 4WEDA 1NNFA 3O6GA 1PB8A 4R6YA 2DYXA 4QFNA 1H44A 2Y7WA 2VGQA 1MM7A 1LLSA 4JWOA 2F36A 3IOVA 3OO9A 1MPBA 4YB7A 3IOTA 3PUWE 2P1SA 1TFAA 4TLLB 5TP9A 3LSXA 3R6UA 1DTZA 4QF9A 1UQWA 3MVWA 3G3KA 3T9XB 3T93B 4F29A 1SW5A 1B32A 1FQDA 2AYSA 4QFPA 2DVCA 1P1NA 1MY3A 1LSTA 3O28A 2PMSA 4LQ5A 4G68A 5DT6A 1LAGE 1B7HA 5ISUA 2NOOA 5H8HB 3ILUB 1FQFA 3FVNA 3FVKA 1B4ZA 1B7UA 2W7YA 4MBPA 1GV8A 2ALUA 3D4GA 4K3FA 2V3QA 4YAHX 2Q88A 3TELA 1WODA 3GXAA 4PFWA 4FEBA 3TTMA 2F8DA 3TCGA 3FXRA 5DVFA 3SERA 2XD3A 3K00A 4MFIA 2XX8A 3LBSA 4QFLA 1H43A 4H0WA 3ZKKA 3SESA 1JQFA 3K4UA 4ZZEA 3PUVE 1WDNA 4DXBA 3ZKLA 2HAVA 4AB5A 1B3FA 3KN3A 2ZYMA 3G3FA 1B1XA 5H8HA 5AA2B 4GD5A 3TYHA 3P7IA 1B46A 2DE3A 1A8FA 3C36A 3T22A 2X26A 1XOCA 1EZPA 4Q8RA 1ZIUA 1T0KA 1I6QA 1QUJA 1XVXA 1US5A 1MPDA 3IO6A 4N07A 3RTWB 1B05A 4IGTA 3CFZA 4BDNA 4M4GA 4IO3A 4GOTA 1B51A 4X9TA 1M5DA 5L9OA 4XIGQ 4XKQA 3FJGA 5CMCA 2QRYA 2B65A 3EHTA 2BJJX 1MM6A 2OWTA 2LAOA 1ZBMA 4NMYA 2ZYKA 3C4MA 2R71A 5H8FA 1FTOA 2ZXTA 4QSCA 1GR2A 1UTHA 2F5XA 4G8HA 3TODA 2XXVA 4LZ7A 4F22A 3I5OA 2Z8FA 5FHMA 1POTA 1XT8A 1NNKA 3TPAA 2NWJA 4F1UA 5IAIA 4MF3A 1OQHA 1USYE 4L17A 4EQ7A 2I3WA 4DLDA 2UYFA 3FJMA 4NE4A 5AE4A 3K6UA 1OLCA 1Y4CA 3GZGA 2B3BA 4OETA 3PPPA 3IAZA 1OVTA 1QUKA 4IO7A 3KBRA 2QMWA 5CI5A 2QS3A 1B0HA 4PFUA 4EUOA 5I2NB 3C33A 2Y7PA 3K1NA 1GGGA 5I2KA 4XXUA 4RYAA 1QULA 4DZ1A 2Y7RA 3DELB 1EU8A 3H6UA 2Y7KA 2AL4A 4MH5A 1SYIA 5L8DA 3CG3A 3T9VA 5A5XB 1ELJA 2XX7A 4ELQA 4H8IA 4N6PA 3PMXA 3VVEA 4ZDMA 3B7DA 3JV9A 5TPAB 1DPEA 2I58A 1ZU0A 3VVFA 2QS4A 3M3KA 2RF1A 3QUJA 3OEKA 2HEUA 2HAUA 1Z7NE 4OFJA 4IO6A 1MXWA 2ONKE 3FZVA 1JEUA 4IB2A 1H76A 2H99A 1P1UA 1FTMA 5DTBA 2DWHA 3SEXA 1Y3QA 1MQGA 5I2NA 1LBBA 2XXRA 2YLNA 3MVZA 4PE5B 2QMXA 3OSRA 3H3GA 4ZEFA 3PPRA 2GHBA 4FJPA 2UVIA 4UACA 5A5XA 3FV2A 1URSA 4NTLA 3K6WA 1MXXA 2F7CA 3N26A 4KFQA 4Q5TA 3KOTA 4KPTA 2ZYOA 4ISUA 4R9FA 3RUMA 4H1XA 2XXYA 3R7XA 2H4IA 1YCJA 5AA2D 3LR1A 4AB6A 1SVXB 3PU5A 3VDFA 4JWYA 1M5BA 1MH4A 3SKPA 2Q89A 3UK4A 4FATA 5CM6A 2XD2A 5H8NB 3K0VA 2XXQA 1B6HA 3UA8A 1O64A 3MC2A 1FQEA 1Q1KA 5AA4B 1LB8A 2ZYNA 1SW4A 1IQ7A 2XHDA 4YMBA 3K1PA 2FA7A 3DM0A 4OXVA 3G3IA 1ATGA 3OD7A 5ITPA 2YPNA 5DYHA 2YJPA 3RTFB 3C32A 3K6XA 1IEJA 4R73A 2PX1A 3VLVA 3O6IA 5LOMA 1P1OA 3G3HA 2D5WA 3RPWA 3IORA 4BDRA 3SEVA 3EHUA 1I6BA 3OO6A 1MQHA 2ONSA 3TTKA 2ZNTA 2ESNA 3EQ1A 4P0GA 4NWDA 1BLFA 2O1MA 1FCKA 2DWAA 4IO5A 1QUIA 2A5TB 5KZTA 4EQ9A 1Y1MA 3CVGA 4F1VA 3H6WA 1LAHE 2I48A 4KHZE 3G7WA 3QIMA 4GL8A 4DIGA 5H8NA 5AA1A 1VFDA 1SI0A 3KFMA 4G68B 4IGRA 3U8QA 1N0TA 4YMAA 3K2DA 4Q0CA 3SDFA 3SEUA 4WEPA 3CRBA 1BIYA 4IY6A 3K01A 4G2ZA 5AA4A 5FTHA 4EF2A 3KOSA 4MLQA 3MAMA 3BFTA 2XXWA 5J1DA 3I3VA 1R9LA 3VE1B 3UGWA 4P0IA 2DXRA 4GIZA 4QFOA 1B4HA 2VD3A 3I6VA 4NF4A 3CFXA 1OQGA 4XKPA 3FD3A 3IOUA 3W9WA 2XXIA 3EN3A 2AIXA 2RCAA 3RN8A 3N5LA 3LUYA 1FQBA 4F1YA 1B58A 2ZNUA 3MZ9A 4U22A 1LFIA 2A5TA 3FJ7A 4HCWA 1B3EA 4G77A 4NF5B 2WKYA 2Y84A 1MY0A 2VD2A 4H8JA 3E13X 2I0CA 2RCBA 2XXXA 2ANJA 4POXA 3N94A 4G4PA 2ZMBA 2I6EA 3SETA 5KDTB 2ZNSA 1URDA 2V84A 3QUFA 1IXIA 5I57A 1D4NA 3JYRA 1WVJA 4I8CA 2IA4A 2H5YA 3VLUA 4YKJA 3O9PA 5FHNA 5ELVA 3HHFA 4PP0A 2E0SA 4JDFA 2OZZA 3HV1A 3S2VA 2OBGA 1LB9A 1D9VA 1JNFA 3BKIB 1PC3A 4C1UA 1SQYA 4ZS9A 1OVBA 1O7TA 3VXBA 5K2XA 1N3WA 3CIJA 2THIA 3MVYA 3DP4A 3PUZE 4NF5A 4NF8B 5B70A 1MQDA 5H8QA 5H8FB 3G3JA 3IK6B 2ONRA 3CFLA 5EYFA 1N04A 4OERA 1UTHB 3IL1B 1YAEA 1A7LA 2HFBA 2Q9TA 5KDTA 1VR5A 3F11A 1IXGA 1SDXA 3ZSFA 1OMPA 4KYSA 1AIVA 4QRZA 2E1SA 3M3LA 4JB7A 4C0RA 1UTBB 4YKKA 5ICTA 3V5AA 3VV5A 3FV1A 2QJEA 1Z7ME 2D21A 1P1WA 5B7DA 3E3KA 4EXKA 4RNSA 1B3LA 3GBBA 1SW1A 4R2BA 3KJ7A 1GVCA 3KSJA 1AH5A 4H5GA 1TXFA 4ZZAA 4EQBA 1HSEA 1EZOA 4NF8A 5I2KB 3S9NC 4M1VA 3N6UA 2Z8DA 3PGFA 3TCHA 1B9JA 2F7AA 2RC7A 1MXVA 4DCXA 2Z8EA 5M2VA 2I4BA 3FVGA 4YU0A 1SD3A 2UVHA 1MXYA 2UVJA 5FHOA 4ZECA 4GFRA 1R1NA 4F31B 4GWOA 1QW0A 2V93A 4OEUA 1O63A 4NEDA 5EHMA 4HTGA 1LAFE 2RC9A 1UTBA 3TUSA 3ODBA 3MP8A 3D4CA 3IB0A 4F2QA 3RGYA 4Z0IA 2H98A 2HCAA 1NH7A 4LA9A 5JTYA 3OEMA 1PDAA 1NNPA 2AL5A 2I49A 2DE2A 3TQLA 3V83A 2Z22A 3VLWA 4OHNA 2RKMA 4DXUA 3MQ9A 5L9SA 4EXLA 2QPQA 1ZTYA 4H6DA 1Q35A 2V3UA 1I69A 1PB9A 5K2YA 4GQOA 2RINA 4F18A 3UIFA 4NWCA 1ZJLA 4F3GA 2I4CA 1B5HA 2GRVA 4QSDA 1N7XA 1IITA 1XS5A 3MZ1A 2DVZA 3PPOA 1US4A 3SEYA 1R6ZA 1MQJA 3JZJA 5I58A 4U4XA 3HCQA 3U94A 4RA1A 3BFUA 3B6QA 4E0XA 1JVXA 2HZLA 3Q27A 4EDPA 1A8EA 2XX9A 3HPIA 4YKIA 3KN8A 4RY1A 1SBPA 3BBRA 3HN0A 1LFHA 1BP5A 3LC8A 3KGCA 5I56B 1AOVA 1KWHA 3HO7A 3QXMA 1AL3A 4G8MA 3CI8A 3T96B 1MY2A 4GF8A 2F97A 3O29A 3UN6A 5CBRA 4LONB 2KLFA 3M3FA 4Q30B 4ZEDA 4U1ZA 1B2HA 3MPLA 1ZMGA 4FEDA 5EHSA 4DXCA 1B3HA 2O7IA 2PT1A 2H9BA 1DMBA 4OMBA 5KCJA 3EF7A 3U93A 4F19A 4ELRA 1DTGA 4U23A 1B5IA 1QJMA 3R26A 1NH8A 4I9DA 3TKDA 4GLIA 3SEWA 2Q2CA 1FQAA 1PBQA 4ND9A 2O68A 3S9LC 5DEXA 4UA8A 1L5TA 3W9VA 4Z7EA 4KCDA 4ZE9A 4IY5A 3EHSA 4X48A 1S50A 3Q28A 4OTEA 1XVYA 5I56A 2H25A 3IB2A 3RQTA 4R72A 2XXHA 4G68C 3TTLA 3ZS6A 4F3PA 2F6PA 4LP2B 4YICA 1R9QA 1A99A 3FVOA 3KSXA 1B3GA 1BKAA 2O7UA 3MW0A 4NF4B 4X1DA 5F1QA 4OENA 3K1MA 3IJXB 1I6AA 5CRYA 1JW5A 3H6TA 4BDOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FIEA 3UORA 1CB6A 1LFGA 1XHYA 3U1OA 3TAJA 3CR9A 4LVQA 5IKBA 3OOAA 3DP8A 1NV0A 4YB5A 3T9HB 4OFOA 4DI4B 4OYVA 3FGSA 4R74A 4ONYA 1J1NA 2CEYA 3U92A 1ANFA 2UXAA 1JP4A 4I1DA 4IO2A 2GFEA 3THIA 1EZ9A 5HM4B 1MPCA 5F7VA 2NUVA 1SYHA 4TLMB 2O51A 4OFLA 2XXTA 4OESA 2CZIA 1JETA 3O66A 4OVJA 5I57B 4MAGA 4FORA 4O3CA 5DVIA 2A5SA 5I59B 4QHQA 3VFJA 3QK6A 2M8CA 4OVQA 4BLAA 3PD9A 5HPQA 2Y7IA 5JK4A 3W15C 4YB6A 4GXSB 4I62A 4QBAA 1KA1A 4LZ8A 2DQVA 4X1BA 1PB7A 2QFLA 1MRPA 5H8QB 1MG1A 3ONMA 4FE8A 1IXHA 4ELOA 4U4SA 4ESXA 4R6KA 5ICQA 5EYHA 4E0WA 2F6GA 3T9UA 1LAXA 1JEVA 4N4UA 1NNTA 2WYPA 1Y4TA 4OWDA 1D3KA 1Q9DA 4PF6A 2UYEA 3H03A 2FNCA 2R6GE 4KCCA 2B3FA 2WBBA 1PEBA 3MBPA 3FUZA 5DVJA 4XKRA 4MNPA 1POY1 2V3TA 1FQCA 1KA0A 4PFRA 2FYIA 4TOZA 4DE8A 2HQ0A 2RC8A 3VXCA 2OX3A 5I59A 3IJOB 3S9MC 4RPOA 2HZKA 1MS7A 2PVUA 4F2OA 4ZEIA 1Y1ZA 2PT2A 3C35A 4N13A 1DOTA 1JVYA 2F35A 1LCTA 3E4RA 2WYKA 4TQUQ 1UIVA 1MY4A 1P1QA 4NGUA 4XKNA 2NVUB 5CMBA 4ESWA 1II5A 1ZLQA 3PUYE 4PFTA 4MX6A 3SZPA 4XTCQ 4LUBA 2F7BA 4GXAA 4NHBA 1NL5A 2O69A 2OK2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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