2B65A

Crystal structure of the complex of c-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5a resolution
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the complex of C-lobe of bovine lactoferrin with maltose at 1.5A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 117
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2b65A02
4O3AA 4FJPA 3N6UA 1B0HA 1IXIA 3OELA 2O1MA 3TYHA 5ICTA 1B7HA 3O2AA 2GH9A 2O7UA 2ZNSA 3KGCA 4YB6A 2YPNA 4I62A 4F19A 3FXRA 2A5TB 1QKBA 1IXHA 4UA8A 3TAJA 4MLQA 3IOWA 4FORA 5BWJA 1USYH 2AIXA 2XXPA 2F6GA 3KN3A 5DTBA 4ONYA 3KFMA 3O29A 2O1LA 3MJNA 1NFTA 1ZBMA 2PYYA 1TFDA 2QSXA 3KN8A 3N6TA 4KYDA 1JW4A 4DCXA 4JXIA 1MXZA 4KQPA 2FA7A 3MC2A 4KCDA 5TP9A 4GIZA 4QF9A 1FQBA 2Z8FA 4HS7A 2Y7KA 2W7YA 3G3IA 3RT6B 4KCCA 1NH8A 1IXGA 1Y3QA 3E3KA 2DXYA 1TWYA 3OO9A 1Y9UA 3FIRA 1FQEA 2V3UA 2HXWA 3SDFA 1LFIA 1Y4TA 4WKMA 1M5BA 2F7AA 3B6WA 5DEXB 2RC8A 1B3FA 4QFNA 3S2VA 2ANJA 1PDAA 3ECRA 1MH3A 3CG1A 4LQ5A 4EF1A 4U2RA 1B9JA 1SI0A 5KDTB 2IEEA 2ZNUA 1B51A 4YAHX 5JTYA 3IOUA 4LUBA 1I6AA 1FTLA 1SW2A 2DWJA 1UTHB 1URDA 3K1PA 4GVOA 1VE4A 5DVFA 3SEYA 4DIGA 2D3IA 1IUDA 2E0SA 4GFRA 5M2VA 1N3WA 3U72A 2QL3A 1PBQA 1Z7ME 1A55A 3RTFB 3C4MA 4LONB 1MY2A 2G29A 5I57A 4RPNA 3IB0A 4G8NA 4GWOA 1XC1A 1EZPA 1PBPA 4G8HA 3VLWA 2O7IA 2ONKE 2OK2A 1P1OA 2Z22A 3H6WA 4KI0E 3SERA 3TTKA 4G77A 3JZJA 2QPQA 3DP8A 3OSRA 4R73A 3TTMA 2HZKA 1XVXA 5KCJB 4L17A 2GRVA 2XHDA 1ELJA 4OERA 4OHNA 3QAXA 1H76A 2ABHA 1SQYA 4OXVA 3WAFA 2XXWA 3D4CA 3USDA 3BFTA 1Y3NA 3EHUA 4F18A 1EZOA 2VD2A 1XVYA 3FZVA 3S9NC 4EXLA 1YCJA 3LSLA 3DLNA 1B1HA 2V93A 3OEMA 3PUYE 3C32A 3IB1A 3IAZA 3IOVA 4FE8A 1ANFA 2P1SA 1B52A 3O97A 4NWCA 3CFXA 3LBSA 4U21A 3TCFA 3VV5A 4EDPA 4PFUA 4I1DA 5LOMA 2A5SA 2OCUA 2QRYA 2E1SA 4GOTA 3HO7A 3MUQA 3M3KA 3VE1B 1F9BA 1LSTA 2KLFA 3IX1A 3ODBA 3RPWA 4NWDA 4G68A 4F3GA 3G3JA 2AYSA 1DSNA 3CIJA 3T9HB 4E0XA 4KPTA 1OVBA 5I59A 3V83A 2Q89A 1AMFA 3TQWA 3IOTA 5A5XB 5I57B 2ZYMA 4F29A 2Q2CA 4F3SA 3LSWA 1CB6A 3IK6B 3FATA 4THIA 2HAVA 5BUUA 1MXVA 3G3HA 3C31A 4NE4A 5I2KA 4OESA 5AA2B 4BDLA 1D3KA 1P1WA 1NKXA 4TQUQ 1SYHA 3HPIA 1FCKA 3IJOB 1URGA 3OXNA 3TZAA 5I56A 4LQ2A 1MQDA 3FASA 2QS4A 3FVGA 3H4ZA 3OO7A 3MP6A 1NMUA 4NF4A 4ZDMA 2Q88A 5AA4A 1LAXA 1M5CA 3S9EA 4C0RA 2OBGA 5HBCA 3SEVA 1MPCA 1R9LA 1FQDA 1DPEA 3EF7A 3PUWE 1FQAA 2F7BA 4GL0A 3VVFA 1ZU0A 4R6HA 3U92A 3TEPA 1B6HA 2B3FA 2OLBA 3CRBA 3GBBA 2QJEA 4M1VA 1ZLQA 3EHTA 4X1DA 3SETA 5H8QB 3TMGA 1R6ZA 4AB6A 3GXAA 3O6HA 4WEPA 4Z0IA 1MQJA 3OMBA 4Z7EA 4DDDA 1I6QA 3MZ9A 3K01A 1MS7A 1MPBA 2Y7WA 4FEBA 3MVZA 4C1TA 1HSJA 3Q26A 2V3QA 2NWJA 2QS1A 1N7WA 2F36A 2G93A 3QSLA 1B58A 3D4GA 1JW5A 1BTJA 3FXUA 1B4HA 4JDFA 4R72A 5F7VA 4ELRA 4F1UA 5J1DA 3IL1B 4JB7A 4AB5A 4F22A 1A8FA 4LA9A 4JSDA 4U4XA 1QVSA 3VDFA 1Q1KA 1LCFA 2HFBA 1BIYA 4G4PA 4EQBA 1DTZA 4X48A 3G7WA 1LAHE 1BP5A 4OTEA 4XTCQ 5H8NA 3K0VA 4FECA 2RINA 5AA2A 3P7IA 1A8EA 2OZZA 3I3VA 3N94A 1SW1A 4JWYA 2NUVA 3O6IA 4I9DA 1B5IA 5KDTA 1NNPA 3KJ7A 4PQJA 3JV9A 2DVZA 1B4ZA 3Q25A 3O9PA 3TCHA 4EQ9A 2UXAA 4F39A 5CC2A 2UVJA 5I59B 4H67A 5I2NA 2V84A 1O7TA 2YJPA 1DOTA 2R6GE 3A09A 3FUZA 2QMWA 1B2HA 4U22A 4QRZA 2DQVA 4IY6A 3CSGA 4OYVA 4F3BA 5DVJA 3SEUA 4E0WA 2RKMA 3U8QA 4Q8RA 3C35A 4RJZA 1NNTA 2NXOA 1IITA 3DP6A 5HPQA 3PUZE 4P0IA 1MY4A 1D9YA 1I6BA 2DXRA 3ZS6A 4ZS9A 4F31B 3KG2A 3MAMA 2I49A 1UIVA 2QS2A 1SBPA 5I58A 3ZSFA 1IQ7A 5FTHA 5TPAA 3FVKA 3TTNA 2ZNTA 4R74A 4EXKA 3H06B 1CE2A 1PC3A 4LATA 5A5XA 1A7LA 4YKIA 1OVTA 3G3KA 4YKKA 3LSFB 4TLMB 3R26A 4JWOA 2RC7A 3MW0A 4QSEA 4UACA 4PE5B 3FGSA 1EU8A 3HSTA 3C36A 3Q27A 2A5TA 2Q2AA 2ZMBA 3HHGA 3I5OA 3K4UA 2P2AA 2O51A 2RF1A 3KN7A 3R7XA 3W15C 4HTGA 1GVCA 4Q0CA 3T9XB 5I56B 1LB9A 5H8HA 3CFZA 3JYRA 1BLFA 3VLUA 5CI5A 3PUXE 3M3FA 4X1BA 1IXCA 1R9QA 5CMMA 1DPPA 4RK2A 3IJXB 3MP1A 2BJJX 3PMXA 2DVCA 4HW8A 2X26A 3VXCA 4MF3A 3OD7A 2WKYA 3M3LA 3KBRA 5F1QA 1MQIA 1WVJA 1AH5A 1M5FA 2F8DA 3KJTA 4H0WA 4JBZA 4ZZEA 3B6QA 1B40A 4GF8A 3RTWB 4G68C 4R2BA 4C1UA 4LZ7A 4OQOA 4TOZA 4F1VA 1XHYA 2VGQA 2NOOA 2DE4A 3EQ1A 1MG1A 1P1UA 4N07A 5ELVA 2ZYOA 4ZEIA 3KSXA 3UP9A 1JEUA 2Y7RA 1LAGE 3ZKKA 5I2NB 2Y7IA 3LUYA 3ZKLA 5I84A 1L5TA 3CR9A 1MY3A 2D5WA 1NNKA 2F97A 1PB8A 2HEUA 2UVIA 5TP9B 3TCGA 2I48A 2B3BA 5FHMA 2ONRA 3K1MA 3QUFA 2OJTA 4KHZE 4GXSB 1XS5A 4ZEBA 3VLVA 4GLIA 3MZBA 4ZEFA 1BKAA 2ZYNA 1B32A 5AA2D 3O66A 4R9FA 3FVNA 4RNSA 3V89B 1N7XA 2GHBA 3Q29A 5DEXA 3PUVE 1A54A 5AA3A 5AE4A 3S9LC 5EHMA 3HCQA 2YLNA 4QFLA 2DOJA 2XXYA 2H4IA 2I4CA 3A3UA 4BDRA 5CMBA 1B3EA 1ZIUA 4WXJA 1H44A 1GV8A 4WEDA 1WODA 4BDMA 1Y20A 4BDOA 3ILTB 2H9BA 4QHQA 3QUJA 4GRKA 5EHSA 3K6VA 1B05A 5CMKA 3G3GA 5H8NB 2PVUA 4RA1A 2AL4A 1FTKA 4N13A 2OWTA 3PU5A 1A99A 3IORA 1QUKA 1MXUA 2Y84A 1B3LA 1SI1A 4GXAA 1B3GA 4IO2A 1VFDA 2PMSA 1MPDA 1UIUA 4H1XA 3QXMA 4O3CA 5CMCA 3RLFE 4IO6A 3U1OA 5I58B 1PEBA 4P0GA 4OEUA 1T0KA 3MPLA 2F7CA 3OOAA 3MPKA 1PB9A 4HCYA 1JVYA 2QMXA 2DE2A 3E9XA 1TFAA 3CFLA 3DM0A 1MM7A 4XKRA 3PPOA 4ELPA 1DMBA 4KYEA 2DWIA 3B6TA 3C34A 3K2DA 1N3XA 3UIFA 3FJ7A 3PD9A 4DXUA 4ELQA 3CG3A 3T96B 1XOCA 2ALUA 4H8IA 2RC9A 4YKPA 3RNNA 1P1NA 3G3FA 5H8FB 1IEJA 4H6DA 1B46A 5DT6A 1WDNA 1QUJA 3I6VA 3MWBA 4OFLA 5I2KB 3FVOA 5ISUA 1LFHA 1UQWA 1O64A 1PB7A 4JSOA 4TLLB 5ITPA 3CVGA 5FHNA 1IIWA 1YTVA 2H98A 3V5AA 4DXBA 4OVJA 3UORA 1POY1 2RCBA 4M4GA 1FQCA 4NF6A 1OLCA 2Z23A 1SDXA 1TT1A 3E4RA 4KYSA 4O3BA 5L9SA 2P0SA 3ONMA 2H5YA 1Y4CA 4XKNA 4YB7A 3PD8A 3QIMA 4H8JA 2UYEA 1MRPA 4IO3A 3C9HA 2AL5A 3SEXA 3FJMA 4KFQA 3N26A 1JEVA 1LFGA 1LLSA 1MY0A 3MQ9A 1D4NA 4OENA 3UA8A 1MXWA 2VP1A 1B3HA 2UVHA 1ATGA 2XXXA 1USYE 3MVYA 2NVUB 3WAEA 3IB2A 4LZ5A 2XXTA 5TU0A 2O84X 4OWDA 4U1ZA 1FW0A 4LZ8A 1AIVA 3CSBA 1SD3A 1HSEA 1NL5A 2DP8A 3MZ1A 1UTBA 4IO5A 3T66A 4QFKA 3FV1A 3EN3A 3GLBA 3K6WA 5IAIA 1IZ1A 1LCTA 1LBCA 4RY1A 3RT8A 2RCAA 3VFJA 3LSXA 4K3FA 4YMAA 1H43A 4N6PA 1MY1A 4QFPA 4KD5A 4EF2A 3PGFA 1ZTYA 2V25A 1FTJA 3OSQA 1B1XA 5DYHA 2PX1A 3PMVA 1EH3A 4G2ZA 5K2XA 4OETA 4U1OA 4MBPA 3KZGA 3T93B 2I0CA 4PFYA 4YB5A 4YZZA 2I58A 3DP4A 1MDQA 2XX9A 4NF5B 4Q5TA 3KSJA 4YU0A 2R9JA 3RY3A 3TPAA 3MVXA 1ZKBA 2XXUA 4OMBA 3RGYA 4ZEDA 4OFOA 1J1NA 2GFEA 3H6TA 2I6EA 5L9OA 2CMOA 3K6UA 4F2QA 1I69A 4NTLA 3FJGA 4XIGQ 2DYXA 1II5A 3KEIA 4PFWA 1JETA 2B65A 2F78A 1RKMA 2X7QA 4R9GA 1Q35A 3T22A 1GR2A 1MQGA 2XD3A 3BKIB 4XKQA 3RN8A 1XT8A 4ZE8A 1POTA 1H3DA 1LAFE 1QULA 1MXXA 1UTBB 3M8UA 4U4SA 3SEWA 3THIA 3TKDA 1B0LA 2F35A 3PPNA 3FXQA 1FTMA 3E13X 2I0BA 4H5GA 5FHOA 4BLAA 1OQHA 3DELB 3KOSA 4XXUA 3IO4A 2I3VA 3VVDA 3BBRA 3K00A 3FD3A 3L6HA 4QSCA 2DWHA 1VR5A 4XKPA 1MQHA 4BDNA 2GHAA 5ICQA 1Y1MA 2O68A 3BFUA 1NH7A 4LP2B 3K02A 1S50A 2FNCA 1P99A 2LAOA 5JTYB 2HAUA 4FATA 1SW4A 2I4BA 3OENA 1QW0A 3N5LA 4IB2A 4NF6B 3QK6A 4F1YA 4NF8B 5AA1A 1FTOA 1ZMGA 4GD5A 4NMYA 2UVGA 1JQFA 4JWXA 3SESA 3W9WA 1YPNA 1VSOA 1Y1ZA 1SVXB 2DS9A 4BDQA 1TXFA 3H3GA 4MH5A 3K6XA 4ESXA 1B5JA 1OLAA 5HM4B 4EQ7A 1URSA 4PETA 4DLDA 1LB8A 4ZZAA 4IGTA 4IGRA 2PT2A 4RXLA 4FEDA 2PT1A 2XXRA 2REGA 3O6GA 3Q28A 1RYXA 4HCWA 3UK4A 4DE8A 4FAJA 3H6VA 1P1QA 3B7DA 4G8MA 5H8FA 3AXFA 1Z7NE 2DWAA 1N76A 1KWHA 2Y7PA 1M5EA 3PV0E 1AOVA 2XX8A 1OIBA 1QKAA 1US4A 2D21A 2THIA 4IO4A 3U93A 4ISUA 2O6AA 3CI8A 4G68B 4POXA 4P11A 4ZEKA 1YAEA 5ITOA 2X7PA 2Q9TA 3H03A 4U23A 1JVXA 2R71A 2M8CA 1GGGA 3ILUB 3PPRA 2O69A 4ZE9A 3HN0A 2ONSA 3O28A 3U94A 4F2OA 1EZ9A 2ZXTA 2Z8EA 2FYIA 1OQGA 3GZGA 3MBPA 4LVQA 4POWA 3PPQA 4DZ1A 4ZECA 3TUSA 2XX7A 4RK9A 2H99A 3LR1A 3TELA 2HCAA 4MFIA 1H45A 2HQ0A 4PP0A 3IO6A 4R75A 2VOZA 4YKJA 1SW5A 4H65A 3S4UA 1R1NA 4R6YA 1US5A 2V3TA 2Z8DA 3QYTA 4RPOA 4X9TA 4AQ4A 5B7DA 5FTIA 5JEIA 1S9TA 1JNFA 5KZTA 1N0TA 1QJMA 3RUMA 3H6UA 2ESNA 1AL3A 3A3CA 3W9VA 1SYIA 1RYOA 4QFOA 5H8QA 3TQLA 1Y3PA 4I8CA 2XXQA 1HSLA 3SKPA 4FIMA 5CBSA 3C33A 2IA4A 3IR1A 4OEVA 1NNFA 3LC8A 2REJA 2VD3A 2XD2A 3VVEA 5L9MA 3TDJA 2DSFA 4OFJA 1N84A 2XXIA 3K1NA 3PMWA 3TODA 3L6GA 4YICA 3EPEA 1GTKA 3MVWA 3HHFA 1UTHA 1O63A 5H8SA 5K2YA 3T9UA 2F6PA 1B7UA 1D9VA 1MXYA 4H5FA 4R2FA 4ECFA 4MLVA 3TTLA 4ELOA 5CRYA 1MDP1 4GL8A 4PFTA 3GBAA 4DXCA 4Q30B 5B70A 2ZYKA 5CM6A 4IO7A 2QS3A 4F3PA 2UYFA 3H7MA 3HV1A 1B7ZA 4YMBA 5IKBA 2F34A 3V8XB 5TPAB 4NF5A 4RYAA 5EYFA 2Q8JA 3OO6A 3S9MC 2XXVA 4ND9A 4ESWA 4NF4B 4OZ9A 2F5XA 2XXHA 3VXBA 1MM6A 1M5DA 3RQTA 2I3WA 1ZJLA 4DCYA 5JK4A 4QSDA 5KCJA 3TFLA 1N04A 3OO8A 3KOTA 1VFEA 4NEDA 3UN6A 3PPPA 1DTGA 5L8DA 2OWSA 4IY5A 5AA4B 2HZLA 3MP8A 5CBRA 4EUOA 1LBBA 3EHSA 3TTRA 1A40A 2DE3A 1QUIA 1JW1A 1B5HA 3OEKA 5H8HB 3T9VA 4NF8A 1LGBC 1S7YA 2VHAA 1FQFA 2PBWA 4KR5A 3F11A 4R6KA 5DVIA 3UGWA 3FV2A 2H25A 1OMPA 4GQOA 2CZLA 1MH4A 3R6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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