2B74A

T4 lysozyme mutant l99a at 100 mpa
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b74A00
1ZWNA 1C65A 1L81A 1SSWA 2OTYX 112LA 2OE4X 3HH3A 1C64A 1LYIA 214LA 4EKPA 113LA 241LA 1C6NA 1DYCA 139LA 3HTBA 159LA 3DNAA 1D2YA 3CDRA 1L20A 1G0JA 2ANVA 1LGUA 200LA 1T6HA 1L56A 222LA 2RB2X 211LA 3F8VA 3L64A 6LZMA 1PQIA 1P64A 1L57A 175LA 5LZMA 1L98A 184LA 4EXMA 3DN0A 2O79A 250LA 170LA 109LA 1L63A 1C63A 1L47A 1JTMA 2L78A 126LA 1L58A 2Q9DA 246LA 114LA 1C6CA 1SWZA 224LA 1C6JA 164LA 1PQDA 115LA 3OE9A 3SB7A 1L01A 4DKLA 1LYEA 253LA 1L50A 198LA 2Z6BA 3GUNA 4YX7C 1B6IA 3C80A 149LA 1L62A 233LA 148LE 2OU8A 245LA 1ZYTA 1L86A 1QS5A 3GUPA 192LA 1QUDA 1OYUA 1C60A 1G0PA 1L49A 191LA 1L02A 3DN2A 146LA 1CTWA 1P36A 3HTFA 4I7MA 1L36A 1SX7A 212LA 2LC9A 2RBNA 2RB0X 2NTGA 3GUMA 261LA 2B7XA 3C8RA 107LA 3HH4A 1L46A 4ARPA 181LA 1QUGA 252LA 1L80A 259LA 3DN6A 1C62A 1CV0A 1L06A 1L21A 1L48A 4DAJA 2HULA 1CU2A 1G0GA 2IGCA 183LA 3C8SA 1L24A 1P3NA 145LA 1DYAA 180LA 2F2QA 1L15A 166LA 2NTHA 240LA 1P56A 4I7NA 162LA 1L79A 1G1VA 1PQKA 1KNIA 1C6EA 1L95A 2OU9A 185LA 3CDVA 3D4SA 3RUNA 219LA 1WTHA 1C6LA 3SB9A 1SWYA 2CUUA 2A4TA 3DN3A 1C6IA 4W54A 247LA 1SSYA 1L45A 2B70A 1LYFA 201LA 4ARQB 1C6HA 156LA 205LA 1D3FA 1L00A 1L73A 1P7SA 1L88A 123LA 1CU3A 1CVKA 1QTZA 238LA 1LYJA 3SBBC 1L0KA 4LDLA 178LA 1CU0A 1XJUA 1L70A 1L13A 1L67A 1L34A 1L40A 4W52A 1PQOA 251LA 2LZMA 3HDFA 1L61A 3K2RA 1NHBA 4E97A 119LA 1L14A 1L83A 254LA 176LA 260LA 243LA 1CV5A 1LWKA 4I7QA 199LA 3C83A 3CDOA 1L30A 1C6BA 3C7YA 4DJHA 1L16A 1LWGA 232LA 1G0LA 3SN6R 128LA 1LI6A 4I7PA 1LLHA 5I14A 1L93A 3DN4A 138LA 1DYFA 221LA 1QUHA 1L54A 157LA 1G0KA 210LA 257LA 118LA 3EMLA 3G3WA 1L90A 1QT3A 1L75A 1L85A 1QSQA 2B6XA 1CV1A 1L22A 1LW9A 1QT5A 3HU9A 1C6AA 1JQUA 3ODUA 4I7KA 1L35A 177LA 237LA 1T97A 4EPIA 3SB6A 2OTZX 218LA 7LZMA 3OE8A 1L71A 160LA 1CUPA 4YXCA 110LA 147LA 1L25A 3C8QA 1C6MA 1G07A 1L74A 244LA 1DYEA 1LYGA 4ARLA 2B73A 3HH5A 3GULA 4ARMA 1QT7A 1L52A 1K28A 167LA 1OV7A 1OWYA 1C69A 2B75A 2RBQA 2RBRA 4I7SA 4I7JA 1L87A 1L17A 1T8AA 3HH6A 2HUMA 2HUKA 3HT7A 1PQJA 1L89A 3QAKA 2RBPA 1LYDA 262LA 1P46A 3NYAA 3DN8A 1L65A 1L19A 4W51A 3CDTA 1CX7A 4ZPUA 1EPYA 4W58A 1L42A 137LA 3HWLA 3JR6A 1CU5A 3F9LA 1L91A 3HUQA 1QTVA 1DYGA 1L10A 4GBRB 1L82A 1L11A 103LA 3V2WA 1T8GA 256LA 141LA 1L60A 1C66A 1LGXA 3OE0A 155LA 3PBLA 220LA 3HTGA 127LA 2Q9EA 131LA 3HUKA 1L38A 3DMZA 3DN1A 1L43A 2OE7X 2RB1X 4I7OA 140LA 3HDEA 3HT6A 1D3JA 1C6QA 2B6ZA 4K5YA 1C6PA 1L12A 195LA 1L08A 3GUIA 1XEPA 3GUOA 2RH1A 1C67A 3PDSA 172LA 227LA 2O4WA 171LA 1G1WA 2RAYX 1L41A 4GRVA 4EKQA 4S0WA 3GUJA 236LA 4LDEA 1KY0A 3HT8A 1I6SA 3SB5A 3V2YA 122LA 1CV6A 1KW5A 186LA 217LA 1C6KA 3UONA 1L32A 1L84A 1L94A 1OVKA 229LA 230LA 1C68A 1QSBA 2B6YA 1P2LA 163LA 1L76A 1L07A 3C7ZA 1P6YA 143LA 1L72A 226LA 3SBAA 1D9WA 190LA 120LA 2RBSA 130LA 1SX2A 1L44A 1L05A 3DMVA 255LA 1L18A 1D2WA 3LZMA 1L29A 249LA 1L55A 3RZEA 1C61A 188LA 196LA 187LA 165LA 2RBOA 1KW7A 102LA 3FA0A 4LDOA 2B74A 1OV5A 144LA 1QTCA 239LA 1G0QA 4ARMB 3HT9A 2LCBA 152LA 1OVJA 1G06A 4IAPA 1CUQA 1QTBA 4EKRA 206LA 4W55A 1XJTA 223LA 216LA 3HTDA 108LA 1DYBA 2F32A 4OO9A 1LI2A 1OWZA 2RAZX 3L2XA 3DKEX 1P37A 2B6TA 1CX6A 4W57A 3G3VA 1QT4A 197LA 1KY1A 3VW7A 1QTDA 1L09A 4EJ4A 4YXAC 3NY8A 173LA 4EKSA 3FI5A 1L69A 1L04A 1L64A 234LA 3C82A 213LA 142LA 1LGWA 4W56A 1L66A 3NY9A 1QT8A 2B72A 1C6GA 151LA 3OE6A 1L26A 3HU8A 1L23A 4I7LA 4PK0A 2QB0B 1G0MA 3C7WA 1P2RA 1L37A 168LA 1L96A 1LYHA 3HUAA 129LA 1L28A 2ANXA 4W59A 225LA 215LA 169LA 1L39A 1D3NA 1L92A 228LA 258LA 3GUKA 1CV4A 174LA 1KS3A 1CV3A 1TLAA 104LA 4LZMA 1L31A 1D3MA 4EPFA 4I7RA 2OU0X 2OE9X 1QTHA 2QARC 189LA 3C81A 1L68A 1QT6A 1CU6A 2O7AA 1L03A 231LA 182LA 3CDQA 1LPYA 1L53A 1L0JA 161LA 1QS9A 4PJZA 1L77A 150LA 235LA 1ZURA 1JTNA 1L27A 2B6WA 158LA 1P5CA 4I7TA 1L99A 1OVHA 125LA 1QUOA 209LA 1L33A 3G3XA 1L97A 2F47A 4W53A 1DYDA 1PQMA 1C6TA 111LA 1T8FA 1C6FA 1L51A 1C6DA 2OEAX 4ARQA 4AQNA 248LA 1L59A 4ARJA 3DMXA 1LI3A 3SB8A 242LA 3FADA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZWNA 1LJJA 1LYIA 2RSCA 133LA 1LZ6A 139LA 3CDRA 5EBHA 2ANVA 5J7CA 1LGUA 1EL1A 222LA 4NGWA 4CFOA 1GF9A 3L64A 2HECA 1PQIA 1P64A 1G7HC 175LA 1HEQA 1C43A 1LZRA 3DN0A 250LA 1GBYA 5A3EA 1ZMYL 1L47A 3EO5A 1L58A 5F81A 1IP4A 4ET8A 5KXRA 115LA 1L01A 4H9AA 1IC7Y 3W6AA 1IP2A 4WG7A 3IJVA 1L62A 3B0IA 1LMCA 4WM5A 1ZYTA 1L86A 1QUDA 4YM8A 1BB3A 4H92A 1C60A 2ZYPA 191LA 9LYZA 1GFAA 4NHTA 146LA 1CTWA 1J1XY 1L36A 1SX7A 2BQBA 3WYHA 2RB0X 4UWNA 1JUGA 1RJCB 3GUMA 1OUHA 261LA 3A95A 1OUBA 4X3BA 4ARPA 3DN6A 1C62A 1GEVA 4UWUA 1AKIA 1L48A 5I4YA 145LA 1GBXA 166LA 4DQJA 1IP6A 3WMKA 1GBZA 1G1VA 1PQKA 1YL0X 3WH1A 2LZ2A 3A67Y 4TWSA 185LA 1Z55A 1LMOA 3D4SA 1C6LA 5F9UA 4DDCA 5KXWA 2CUUA 4HTKA 1YAOA 1LPIA 1GE4A 1C6IA 3DN3A 1MLCE 3A3RX 1NDGC 1L45A 3WVYA 201LA 1JTPL 3TMVA 1P7SA 1CU3A 3SBBC 1UACY 5KKJA 1CU0A 1L13A 1L34A 4H9EA 5E9RA 1TDYA 2DKVA 4ETAA 1LJFA 1CKCA 4G4CA 1B5YA 4E97A 1YKZX 1L14A 1L83A 176LA 243LA 3C83A 1C6BA 4DJHA 1LI6A 5II3A 1LHLA 157LA 4DD3A 5LA5A 2XBSA 3G3WA 4W94A 1L90A 2ZILA 1QSQA 1L22A 1LW9A 1LHKA 1BWHA 1LZEA 237LA 1JHLA 3D3DA 2NWDX 4EPIA 3SB6A 110LA 1C6MA 5KXTA 1G07A 1L74A 1LYGA 2G4QA 2B73A 2F2NA 1CKGA 1NWGA 1OWYA 1LSYA 5KXXA 3GXRA 2RBQA 2RBRA 1DI5A 2EKSC 1L87A 1L17A 2MEBA 3HH6A 4NGOA 2HUKA 4LYCA 1D0KA 1KIQC 3WU7A 1GB2A 262LA 4TSCA 3DN8A 1REYA 3A34A 5IHGA 1JSEA 2YSSC 1EPYA 4H9FA 5I53A 3J4GA 1RI8B 3HWLA 1CU5A 4OWHA 3G3BB 3TXKA 1IR9A 4GBRB 1UIBA 1L60A 1UIFA 2MEDA 3HTGA 4H8YA 4LT0A 1A2YC 3OK0A 3DMZA 1LTMA 1HELA 1ZV5L 140LA 3HDEA 1JTOL 3HT6A 4NFVA 5I5QA 1GAZA 1L08A 2CGIA 1XEPA 5I4WA 2RH1A 5KXYA 5DN5A 1LYSA 4LYTA 2O4WA 1BWJA 4S0WA 1LYYA 5HMVA 4LDEA 1LSEA 4YEOA 122LA 186LA 2BLXA 3UONA 2YBLA 2BQJA 1QSBA 1P6YA 1OP9B 5I4XA 3F6ZA 1D9WA 120LA 1L44A 4WM2A 3DMVA 1XEKA 3LZMA 1HEPA 1HEWA 2DQGY 1SLYA 2DQDY 4DDAA 2ZQ4A 165LA 3A8ZA 4NGKA 2B74A 4LT2A 1OUDA 239LA 4M6DA 4LYBA 1VATA 4IAPA 1OUAA 2BQEA 4YEMA 1VDQA 1BWIA 4EKRA 206LA 216LA 3L2XA 3ZVQA 1OUFA 2B6TA 1CX6A 1QT4A 3HBHA 4OWEA 1D6PA 4EJ4A 3FI5A 4PPOA 1AT6A 1L04A 2LZTA 4RW1A 2D4JA 4NWHA 1IP7A 3NY9A 4GN3A 4PK0A 1L26A 3HU8A 4I7LA 4R6CA 2QB0B 1IWVA 3C7WA 1GF8A 5L3IA 4WLYA 1L96A 135LA 2IHLA 4NHPA 4PHIA 2HTXA 4R0FA 4YOPA 1L92A 228LA 3ATOA 1CV3A 3CSZA 104LA 1ZVYB 4EPFA 2MEAA 1L68A 4LFXA 231LA 182LA 1B5ZA 5FELA 150LA 4QEQA 5M1YA 5DM9A 3LZ2A 1YKXX 1QUOA 209LA 2F47A 1PQMA 1C6TA 1HSWA 1B7PA 1C6DA 2MEHA 4B49A 4ETBA 3DMXA 4NY5A 1LI3A 1OQMA 3AGIA 2Y8PA 3FADA 5C6LA 3T36A 3CT5A 1IOQA 3HH3A 3W6BA 4CFPA 214LA 1REMA 4EKPA 241LA 2MECA 1C6NA 4TTDA 1J1OY 208LA 3HTBA 1B5UA 1WTMA 3DNAA 1D2YA 4NSHA 1L20A 4WL7A 1YQVY 211LA 4HTQA 4M4OA 1BGIA 1FN5A 1FLYA 5LZMA 4OWAA 1WQPA 2O79A 3ZVQB 3FE0A 2L78A 1HFYA 5KKIA 126LA 5B07A 4PRQA 1GB6A 3A6CY 1SWZA 3OE9A 5FSTA 4ETEA 4NGJA 1BB7A 1LYEA 1IY3A 4EOFA 2EPEA 1B7SA 198LA 1B5XA 1I20A 3M3UA 148LE 2YBJA 2XQOA 1EQ4A 4BS7A 1NHEA 1DZBX 3W3EA 192LA 2A7FA 1GF7A 4CHXA 1LZGA 1HERA 4I7MA 1LJ4A 3HTFA 1GDXA 1NMMA 4NSGA 1XEJA 4NHQA 2ZQ3A 1CJ9A 181LA 1GB3A 3K3TA 259LA 1UC0A 1MELL 1L21A 4J7VA 1B7LA 2HU1A 3TMXA 1CU2A 1JKDA 2F2QA 1GFRA 4OWBA 2NTHA 3EMSA 2PC2A 2HU3A 1KNIA 3AGGG 4WOAA 1C6EA 2VB1A 4Z98A 1REXA 1SWYA 1QSAA 4B4IA 1YL1X 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZWN A;  1LJJ A;  1LYI A;  2RSC A;  133L A;  1LZ6 A;  139L A;  3CDR A;  5EBH A;  2ANV A;  5J7C A;  1LGU A;  1EL1 A;  222L A;  4NGW A;  4CFO A;  1GF9 A;  3L64 A;  2HEC A;  1PQI A;  1P64 A;  1G7H C;  175L A;  1HEQ A;  1C43 A;  1LZR A;  3DN0 A;  250L A;  1GBY A;  5A3E A;  1ZMY L;  1L47 A;  3EO5 A;  1L58 A;  5F81 A;  1IP4 A;  4ET8 A;  5KXR A;  115L A;  1L01 A;  4H9A A;  1IC7 Y;  3W6A A;  1IP2 A;  4WG7 A;  3IJV A;  1L62 A;  3B0I A;  1LMC A;  4WM5 A;  1ZYT A;  1L86 A;  1QUD A;  4YM8 A;  1BB3 A;  4H92 A;  1C60 A;  2ZYP A;  191L A;  9LYZ A;  1GFA A;  4NHT A;  146L A;  1CTW A;  1J1X Y;  1L36 A;  1SX7 A;  2BQB A;  3WYH A;  2RB0 X;  4UWN A;  1JUG A;  1RJC B;  3GUM A;  1OUH A;  261L A;  3A95 A;  1OUB A;  4X3B A;  4ARP A;  3DN6 A;  1C62 A;  1GEV A;  4UWU A;  1AKI A;  1L48 A;  5I4Y A;  145L A;  1GBX A;  166L A;  4DQJ A;  1IP6 A;  3WMK A;  1GBZ A;  1G1V A;  1PQK A;  1YL0 X;  3WH1 A;  2LZ2 A;  3A67 Y;  4TWS A;  185L A;  1Z55 A;  1LMO A;  3D4S A;  1C6L A;  5F9U A;  4DDC A;  5KXW A;  2CUU A;  4HTK A;  1YAO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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