2B75A

T4 lysozyme mutant l99a at 150 mpa
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Cooperative water filling of a nonpolar protein cavity observed by high-pressure crystallography and simulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b75A00
1CU2A 1C62A 4W55A 3C82A 1QUGA 246LA 1LW9A 166LA 2RBNA 1PQMA 2NTHA 1G0PA 1OWYA 252LA 3SB9A 1DYCA 139LA 4DJHA 111LA 2HULA 3G3VA 1G06A 1NHBA 235LA 3HT9A 1CV4A 3CDOA 1L76A 231LA 7LZMA 205LA 4ARLA 1C67A 259LA 4ARMB 255LA 195LA 226LA 258LA 141LA 170LA 2OU0X 2ANVA 1G0GA 2Q9EA 4YX7C 1L39A 168LA 1QSQA 192LA 1XEPA 3SN6R 1L21A 2B75A 3CDQA 1C68A 3G3WA 1P5CA 140LA 2HUMA 1D2YA 1L90A 178LA 2RB1X 1QTZA 3DMVA 174LA 1L48A 3DMXA 1L61A 3C81A 220LA 160LA 1C61A 175LA 1DYDA 1OVHA 3PDSA 4EPIA 1C6EA 1SSWA 239LA 2QB0B 4W52A 1L08A 1L14A 1DYEA 2B6WA 1L40A 3HU8A 1L62A 2OE9X 1CU0A 1P64A 4ZPUA 4I7PA 3GUJA 1L25A 161LA 1QUOA 1OVJA 1L00A 1G0LA 1L0JA 112LA 1L56A 1OVKA 2O7AA 2O79A 3C7YA 1LYEA 3C8SA 1L88A 232LA 243LA 1QT6A 128LA 3CDRA 1L30A 1L67A 182LA 145LA 1L96A 2B7XA 4I7TA 1DYBA 1L83A 1KW5A 1P2LA 2O4WA 1LPYA 1P56A 3LZMA 237LA 4S0WA 1QS9A 244LA 4LDOA 1DYFA 2B74A 1QTVA 1G0QA 156LA 222LA 1L22A 1L26A 1C6JA 3HDFA 1C66A 1L70A 3DKEX 3DN4A 1QTBA 1C6FA 3C80A 1P46A 1ZURA 1L35A 1SWZA 3GULA 1LI6A 165LA 3C8RA 1L66A 2B6YA 3EMLA 4YXAC 236LA 1PQDA 2OTZX 1C6HA 1P36A 1L04A 177LA 1C6GA 159LA 3RUNA 104LA 3GUKA 4EJ4A 1T8GA 1C64A 2RB2X 1L34A 3DN2A 3GUOA 1L82A 3HT7A 212LA 1L60A 162LA 176LA 151LA 4W59A 148LE 1C6CA 3FI5A 142LA 1CU6A 181LA 2A4TA 1L89A 225LA 1LI2A 3D4SA 2RAYX 4K5YA 1ZYTA 214LA 102LA 1B6IA 1OYUA 144LA 171LA 4GRVA 1CV6A 1G1WA 261LA 2B72A 2F47A 1QT5A 1L03A 4I7KA 172LA 1L17A 2F32A 3K2RA 1C63A 4PJZA 3HH5A 1C65A 1L23A 254LA 2Q9DA 1QTHA 1LYJA 1L28A 1L81A 1CV3A 211LA 1LYIA 3DMZA 4ARQB 129LA 1P2RA 4ARMA 1OWZA 1L20A 1L52A 1L64A 1L87A 1L75A 2F2QA 3SB7A 3L2XA 1QT4A 1XJTA 2ANXA 1L57A 1LYDA 224LA 1L24A 1L86A 230LA 241LA 180LA 1L95A 242LA 1L77A 2B6ZA 3PBLA 1P37A 1JQUA 1PQJA 3SB8A 218LA 1L02A 2RAZX 1L0KA 1L79A 189LA 201LA 3GUIA 4EKQA 3G3XA 1I6SA 2LC9A 1L65A 1JTMA 3DN0A 4W57A 2HUKA 3OE9A 1L49A 1L98A 115LA 4LDEA 1P3NA 1G0KA 2B6XA 1G07A 188LA 150LA 3OE8A 4I7RA 3DN3A 2RH1A 1DYGA 2B73A 3SB5A 1D3FA 152LA 1KS3A 1C60A 4LDLA 1L42A 221LA 240LA 5I14A 4E97A 1LYHA 217LA 1L54A 173LA 250LA 4GBRB 131LA 2LCBA 3HUAA 4IAPA 1L45A 3FADA 1L09A 4I7QA 1LGXA 3OE0A 3V2WA 1L59A 1PQIA 3C8QA 1CX7A 3CDTA 1K28A 1LGWA 1T8AA 3VW7A 1LGUA 1PQOA 1L15A 2CUUA 3NY8A 2RBOA 1L11A 199LA 4I7MA 4EKSA 3NY9A 1L92A 213LA 1KY1A 3F9LA 4EKRA 245LA 1L99A 2L78A 1L47A 196LA 1L46A 1CX6A 1L10A 4DAJA 2RBPA 4YXCA 238LA 247LA 1L71A 1C6DA 1CU5A 2OE7X 3RZEA 1OV7A 1L73A 1L94A 1L53A 3HWLA 1L58A 234LA 1JTNA 3GUPA 1LYGA 1L55A 123LA 1T8FA 1D3MA 114LA 1G1VA 228LA 126LA 260LA 4W51A 1L50A 1L16A 3GUNA 233LA 1C6BA 3L64A 1L27A 130LA 3HUQA 1CV5A 1PQKA 1QTCA 1G0JA 3JR6A 4W58A 2RBRA 4EPFA 1KY0A 1CUQA 1TLAA 2RBSA 4I7NA 3SB6A 158LA 4AQNA 1D3JA 1QUDA 1T6HA 1LWGA 1L44A 2OU9A 1L43A 1L69A 1L85A 127LA 197LA 4ARQA 1L37A 1L05A 3FA0A 4W56A 1CV1A 2NTGA 1L74A 3DN1A 1EPYA 125LA 1L31A 1L41A 223LA 3SBBC 2B70A 4LZMA 1C6QA 3DN6A 2RB0X 163LA 1QSBA 4W53A 4PK0A 2RBQA 3V2YA 248LA 1L13A 3QAKA 3HT8A 4I7LA 187LA 109LA 1L36A 1DYAA 1SX2A 229LA 1LYFA 1CU3A 167LA 1L06A 147LA 257LA 1L93A 1T97A 4EKPA 1C6TA 1L80A 3HH6A 1D2WA 1L29A 1D9WA 186LA 262LA 1P7SA 164LA 3DNAA 1KW7A 1XJUA 4OO9A 249LA 191LA 1L18A 1L68A 1QT7A 216LA 4EXMA 4I7OA 1SSYA 2LZMA 107LA 1L72A 2OE4X 4DKLA 1L07A 3HH4A 251LA 122LA 1SWYA 4I7SA 113LA 1QUHA 3F8VA 3HDEA 155LA 1P6YA 3NYAA 215LA 3HT6A 6LZMA 1D3NA 1CVKA 143LA 2OEAX 1C6NA 1C69A 1LLHA 3HU9A 2B6TA 3DN8A 3HTBA 2QARC 1L33A 190LA 1CV0A 1C6PA 2OTYX 1QTDA 2IGCA 4ARPA 110LA 3HTFA 146LA 137LA 3HH3A 108LA 5LZMA 210LA 206LA 3SBAA 1QT3A 1SX7A 1OV5A 1LWKA 3C83A 1KNIA 3GUMA 4I7JA 1QS5A 185LA 256LA 198LA 1L91A 209LA 1L32A 253LA 3OE6A 169LA 4W54A 2OU8A 157LA 1L97A 1C6AA 1WTHA 1L63A 227LA 138LA 183LA 120LA 118LA 1L19A 3ODUA 219LA 4ARJA 1L51A 149LA 1C6KA 1CTWA 1CUPA 1C6MA 1L84A 1C6IA 1G0MA 1ZWNA 1QT8A 1C6LA 103LA 1LI3A 184LA 1L12A 1L38A 3CDVA 3C7ZA 1L01A 200LA 2Z6BA 3HUKA 3HTDA 119LA 3HTGA 3C7WA 3UONA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JWRA 5IELA 1IC7Y 1GFKA 1HEWA 1LW9A 1HEMA 2NTHA 252LA 5I4WA 1O23A 139LA 4DJHA 3KAMA 5K7OA 1NHBA 235LA 4PPOA 231LA 1LJJA 4H9CA 1C67A 5I54A 4M4OA 4OWBA 255LA 1QIOA 226LA 1LSYA 2YBLA 1ZV5L 2BQBA 2F4AA 5B07A 192LA 1DPXA 4N1EI 4WM5A 1LMPA 3W6EA 3A90A 1L90A 178LA 2RB1X 4TTDA 1QTZA 174LA 1UC0A 3HBHA 160LA 1OVHA 2ZQ3A 3B6LA 193LA 1L14A 1DYEA 1L40A 4CFOA 1L62A 2OE9X 4NG1A 1P64A 4ZPUA 1LPIA 1YKYX 3J4GA 5C6IA 3ZVQA 4I7PA 161LA 1QUOA 1KIPC 1GE0A 1L00A 112LA 1IP4A 4GLAA 4NGOA 1L56A 194LA 2O7AA 1LYEA 5DM9A 2MEBA 5KXYA 182LA 2XQOA 1C10A 2ZQ4A 4DDBA 5E4PA 2O4WA 1LPYA 1P56A 3WL2A 237LA 2BQDA 1YAQA 3LZ2A 1QS9A 6LYTA 1IR8A 1IP1A 1DYFA 5KJ9A 2B74A 1G0QA 222LA 3LZTA 1L70A 1D9UA 3C80A 1P46A 1UUZC 4PGJB 1LSBA 2C8PA 3ATOA 1GB5A 1XFPL 4XJDA 1PQDA 5FSTA 1QDTA 1WVVA 2OTZX 1P36A 4N0JA 1VEDA 4NSJA 1LOZA 1L60A 162LA 1G7MC 5L3IA 4UWVA 142LA 3ZEKA 1CU6A 1AT5A 3TMUA 4K5YA 1IP2A 4GRVA 2ZWBA 4ZFPA 1C63A 2I26L 4IASA 254LA 1MLCE 211LA 5B06A 1B5YA 4ARQB 1P2RA 4OOOA 1L52A 3G3AB 1L64A 1L75A 1B5UA 1YAOA 2ZILA 3WPKA 208LA 3TXDA 5LVJA 1OUJA 1HSWA 5HLLA 1HF4A 242LA 1NBYC 3PBLA 1F10A 2I6ZA 2RAZX 3WU9A 189LA 3GUIA 1JJ3A 3G3XA 2LC9A 1L65A 3DN0A 1GAYA 4W57A 3P66A 3TXEA 4WLDA 1L98A 1MELL 5LYZA 1VFBC 1TDYA 3P65A 2D6BA 3A8ZA 4I7RA 3TXBA 4ETCA 2RH1A 1DYGA 5KXNA 5B05A 1CNSA 1WQRA 1LSPA 1C46A 4LDLA 1L42A 1VAUA 240LA 4OWEA 1L54A 4NWHA 131LA 1YL0X 2LCBA 1HERA 4I7QA 1LGXA 2XJWA 3N9EA 1T8AA 3VW7A 5KKIA 1RI8B 1PQOA 2CUUA 4DDAA 3NY9A 3W6FA 1YAMA 1HSXA 245LA 3W6AA 1GB0A 1L10A 2LZTA 4YXCA 207LA 1D6PA 2Z12A 4WLXA 1ZVYB 1HMLA 1HENA 2DQAA 5FDJA 4LT3A 123LA 4J7VA 4PJ2C 1D3MA 1GFRA 114LA 1L16A 1LZSA 4WO6A 4QDNA 233LA 1C6BA 3L64A 1FN5A 1CV5A 3JR6A 4W58A 1YKZX 1CUQA 1VDSA 4I7NA 1IR7A 1CJ9A 1LZDA 4XJBA 158LA 1LSGA 4CFPA 4N9RA 4ZEEA 1IWTA 3QE8A 3W6BA 2DQGY 1L69A 197LA 4NWEA 4ARQA 1CV1A 4EMNA 1XGRC 1V7SA 3WUMA 1XEIA 5I4YA 223LA 1UIFA 135LA 163LA 1QSBA 3A96A 1KIQC 4W94A 1GFEA 4XADA 4HV1A 3WYHA 1JEFA 2MEDA 4ETBA 4GN5C 1IIZA 2A7DA 1CU3A 1L06A 3W3EA 147LA 257LA 4DD7A 1D2WA 1JIYA 3WXTA 1D9WA 4Z98A 1P7SA 1GF6A 3CSQA 1HC0A 4OO9A 249LA 1QT7A 3QY4A 3OJPA 107LA 1L72A 1JJ0A 251LA 1JKAA 113LA 1QUHA 1GFTA 2AUBA 5LVKA 3HDEA 4KL7A 5KXPA 1IR9A 3IWRA 1CVKA 4WMGA 1LLHA 1P2CC 1GFGA 2QARC 1L33A 3LYTA 4G4BA 1LYOA 1OUBA 1RFPA 2XBRA 1IC4Y 1NHEA 4IATA 3P68A 5F9UA 1IORA 3WVYA 1H6MA 4J0LA 108LA 4WM6A 5LZMA 1E8LA 4WOAA 206LA 4DDCA 1LZAA 1OV5A 3C83A 1KNIA 1JTPL 3CT1A 4I7JA 4LYCA 3EMSA 1HNLA 1BB6A 1XGUC 4NFVA 4DD0A 1LMAA 1LJ3A 3CT0A 4H9FA 4HV2A 1B7OA 3LHMA 3LYOA 5DN5A 4PHIA 4WM4A 1CTWA 1CUPA 1L84A 1G7IC 2CDSA 1QT8A 1LZ4A 103LA 1LI3A 2CWIA 2Z6BA 1LJIA 2LZ2A 4X3BA 1TBYA 1C62A 4FDYA 1GPQC 4RW2A 2ZNWY 4W55A 4NHPA 4XN6A 1UICA 4DD2A 1INUA 1PQMA 1G0PA 5B1FA 4BADA 2HULA 3G3VA 1G06A 2DQCY 4H9BA 2IFFY 1YAPA 1YANA 205LA 1FLYA 2BQFA 1OUAA 1BHZA 1KIRC 1G0GA 2Q9EA 1LHMA 4YX7C 2YDGA 1FKQA 4XJIA 4TSCA 2W1MA 1XEPA 1KXXA 2B75A 3CDQA 2A7FA 1ZVHL 2HUMA 3E3DA 5FELA 4LZTA 3WU8A 4NHIA 4H8XA 5L9JA 3DMXA 3C81A 2W1XA 175LA 1DYDA 3PDSA 1OP9B 1SSWA 239LA 2HEDA 2B6WA 5HNLA 1JTTL 4ML7A 4H90A 1BGIA 3GUJA 2ZIKA 4HPIA 2HEEA 4B4JA 4B49A 4TUNA 3WUNA 1OVKA 2MEFA 3C8SA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1JWR A;  5IEL A;  1IC7 Y;  1GFK A;  1HEW A;  1LW9 A;  1HEM A;  2NTH A;  252L A;  5I4W A;  1O23 A;  139L A;  4DJH A;  3KAM A;  5K7O A;  1NHB A;  235L A;  4PPO A;  231L A;  1LJJ A;  4H9C A;  1C67 A;  5I54 A;  4M4O A;  4OWB A;  255L A;  1QIO A;  226L A;  1LSY A;  2YBL A;  1ZV5 L;  2BQB A;  2F4A A;  5B07 A;  192L A;  1DPX A;  4N1E I;  4WM5 A;  1LMP A;  3W6E A;  3A90 A;  1L90 A;  178L A;  2RB1 X;  4TTD A;  1QTZ A;  174L A;  1UC0 A;  3HBH A;  160L A;  1OVH A;  2ZQ3 A;  3B6L A;  193L A;  1L14 A;  1DYE A;  1L40 A;  4CFO A;  1L62 A;  2OE9 X;  4NG1 A;  1P64 A;  4ZPU A;  1LPI A;  1YKY X;  3J4G A;  5C6I A;  3ZVQ A;  4I7P A;  161L A;  1QUO A;  1KIP C;  1GE0 A;  1L00 A;  112L A;  1IP4 A;  4GLA A;  4NGO A;  1L56 A;  194L A;  2O7A A;  1LYE A;  5DM9 A;  2MEB A;  5KXY A;  182L A;  2XQO A;  1C10 A;  2ZQ4 A;  4DDB A;  5E4P A;  2O4W A;  1LPY A;  1P56 A;  3WL2 A;  237L A;  2BQD A;  1YAQ A;  3LZ2 A;  1QS9 A;  6LYT A;  1IR8 A;  1IP1 A;  1DYF A;  5KJ9 A;  2B74 A;  1G0Q A;  222L A;  3LZT A;  1L70 A;  1D9U A;  3C80 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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