2B7XA

Sequential reorganization of beta-sheet topology by insertion of a single strand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
168
structure length
157
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGYTSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Sequential reorganization of beta-sheet topology by insertion of a single strand.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 42
structure length 157
sequence length 168
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2b7xA00
1C6DA 1G0LA 3GUJA 3V2WA 1C6IA 1C6JA 2RAZX 3CDOA 3FI5A 3G3VA 1L13A 4W59A 1CV5A 129LA 3D4SA 1CUQA 1PQIA 1L67A 2IGCA 149LA 183LA 151LA 1G0MA 1KY0A 3HDFA 1D3MA 1L30A 1L39A 118LA 1G0QA 4EKQA 1L40A 1ZURA 2B6WA 2O79A 157LA 1T8GA 143LA 3DKEX 1LGUA 140LA 3HT6A 4ZPUA 1L86A 4I7QA 1L05A 3VW7A 2RB0X 5I14A 1LYEA 192LA 5LZMA 4EPIA 1LGWA 152LA 2B6XA 1KW5A 1L37A 4I7RA 1QTCA 1QUOA 1C6PA 251LA 2RBQA 1C6AA 1D3JA 3NY9A 214LA 1L68A 2RBSA 4IAPA 4W58A 1T6HA 259LA 1CU3A 144LA 4W57A 2L78A 2B73A 4W53A 180LA 172LA 1L63A 1OVJA 3OE9A 1G0GA 241LA 4LDEA 3JR6A 1PQMA 1P3NA 2ANXA 4AQNA 1C63A 200LA 3SB7A 1L96A 150LA 1QSBA 4YXCA 1L34A 1L50A 3UONA 238LA 228LA 1C6MA 1EPYA 131LA 3CDVA 3GUNA 1QTBA 1L0KA 4ARQB 196LA 1L70A 3PDSA 2B6YA 1CVKA 1C69A 1L69A 159LA 1PQJA 1L10A 4K5YA 1CV4A 156LA 3HT8A 1L72A 1C66A 1L76A 125LA 3ODUA 1LWKA 2QARC 1L64A 1QT6A 2RB2X 4E97A 3F9LA 239LA 4DJHA 1L07A 1L60A 186LA 3C8QA 1L77A 4I7JA 3FADA 1C6CA 108LA 1QUDA 256LA 4OO9A 1P56A 1QS9A 3C80A 2O4WA 1T97A 2HUKA 1D3NA 1QT8A 188LA 1KW7A 2Q9DA 1L44A 3L64A 2F47A 1CTWA 2OU9A 1G06A 1L74A 1TLAA 3GUPA 2B72A 1DYAA 2RBNA 1L46A 4I7OA 1C64A 1L93A 4S0WA 168LA 1L20A 1L32A 2RBOA 3HH4A 2ANVA 4I7LA 6LZMA 1QS5A 1L22A 1L41A 1DYDA 1L56A 3V2YA 1L54A 246LA 3HUKA 1L27A 3HTBA 1D3FA 4I7PA 1L51A 3C81A 1L66A 2Q9EA 1QTVA 1QTHA 1C6BA 4PJZA 163LA 1L95A 139LA 205LA 1L19A 1CV0A 4ARJA 2F32A 1D9WA 3DN8A 2B7XA 1C68A 162LA 252LA 2A4TA 4W56A 1L33A 243LA 1SSYA 255LA 2OU8A 4W54A 1LYDA 1QT4A 210LA 4EXMA 199LA 103LA 148LE 1KY1A 1T8FA 1ZYTA 3OE0A 1OWZA 226LA 4EKSA 3C82A 245LA 178LA 3CDRA 1L89A 1ZWNA 1SSWA 2OTZX 1LWGA 112LA 1L12A 164LA 3HWLA 1L26A 1OVKA 1P6YA 240LA 3GUIA 4LDLA 4W52A 3NY8A 1LYIA 260LA 1LGXA 3HTGA 110LA 216LA 1L43A 1L81A 3C7YA 1QT3A 1XJTA 1KNIA 1C6FA 209LA 2LZMA 3SBAA 4ARPA 1L98A 1L59A 3C8SA 198LA 3F8VA 261LA 1NHBA 1C62A 3DN4A 4DKLA 1CV1A 2QB0B 231LA 1QUHA 247LA 182LA 3GUMA 146LA 2OU0X 1JTMA 3DN3A 1CV6A 1P2LA 1LPYA 3DN0A 4LDOA 3CDQA 1L55A 1QT5A 211LA 4DAJA 1G0PA 1P7SA 1CU5A 3FA0A 1G0KA 250LA 223LA 173LA 1DYBA 142LA 222LA 4I7KA 3HUAA 1L14A 1L91A 4EPFA 1L61A 1T8AA 3GUKA 1P2RA 126LA 1OWYA 3RUNA 1CUPA 187LA 167LA 1D2WA 257LA 2NTGA 3GUOA 1P64A 1L80A 1PQKA 1L94A 1K28A 3HU8A 1L03A 227LA 1G1WA 197LA 1L24A 1L52A 3HUQA 107LA 253LA 1C6HA 221LA 1C6LA 2LC9A 1QTDA 155LA 1L09A 1P46A 3QAKA 242LA 1L73A 3GULA 1C6NA 1G0JA 161LA 1L90A 128LA 1L48A 1L08A 3PBLA 145LA 1L71A 1OV5A 3HT7A 191LA 2HULA 1XEPA 177LA 2B6TA 237LA 3OE6A 1C60A 1L57A 104LA 3HTFA 1C65A 1OYUA 174LA 2OE7X 1LYGA 1LI2A 3C8RA 4YX7C 2O7AA 1L92A 1PQDA 3OE8A 3NYAA 3G3WA 232LA 1C67A 1L00A 3DN2A 1L84A 1LI6A 2B70A 236LA 1C6EA 4ARLA 165LA 2F2QA 3SN6R 120LA 220LA 1PQOA 2LCBA 219LA 1L16A 4EKPA 3HT9A 4YXAC 7LZMA 2B6ZA 1C6TA 189LA 1CU0A 3SB9A 2HUMA 141LA 1L82A 1L11A 3LZMA 4W55A 1P37A 1CU6A 1L15A 3SB8A 3G3XA 3HH6A 3HU9A 3SB6A 235LA 262LA 1C6QA 2RAYX 3C83A 1LYFA 1QTZA 1L35A 1L36A 4I7MA 1XJUA 1SWZA 1L99A 4I7NA 249LA 212LA 1JQUA 185LA 1LYHA 1DYGA 2OTYX 1LLHA 3L2XA 1B6IA 123LA 2RB1X 1QSQA 4EJ4A 166LA 3SBBC 102LA 3HH3A 1L65A 119LA 1LI3A 1DYEA 1OVHA 3DNAA 190LA 3DMVA 4PK0A 1L79A 213LA 1QT7A 244LA 1P36A 3CDTA 4ARMA 1CV3A 1L21A 122LA 2Z6BA 1L83A 127LA 171LA 1C61A 1L29A 1L49A 2OE9X 1L53A 2OEAX 1C6GA 1L18A 2RH1A 218LA 2B75A 160LA 3HDEA 1L62A 147LA 2CUUA 1D2YA 1L85A 3DN6A 4I7SA 1JTNA 233LA 3C7ZA 4ARMB 1DYCA 130LA 225LA 4GRVA 2RBPA 4I7TA 4ARQA 2RBRA 3HTDA 234LA 3DMZA 158LA 1L47A 1CU2A 3SB5A 1CX6A 1L17A 1L06A 1G1VA 4LZMA 111LA 229LA 1OV7A 1DYFA 215LA 1L75A 258LA 230LA 1P5CA 248LA 170LA 1KS3A 4EKRA 1L25A 4W51A 1L23A 1L97A 1CX7A 3C7WA 169LA 195LA 217LA 224LA 1L31A 1LYJA 3EMLA 137LA 3HH5A 1L0JA 1QUGA 3DMXA 1C6KA 1L01A 184LA 206LA 201LA 1WTHA 1L38A 1L87A 1L42A 1L02A 138LA 175LA 1SX7A 1G07A 1L45A 109LA 1I6SA 1L88A 2B74A 3DN1A 1LW9A 3K2RA 254LA 1L28A 114LA 115LA 1L04A 1SWYA 2NTHA 1SX2A 176LA 2OE4X 181LA 3RZEA 4GBRB 1L58A 113LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A7DA 3GUJA 1C6IA 3TXFA 1JTTL 1ALCA 4HPIA 1GB7A 129LA 3D4SA 4I8SA 4NGVA 1YL0X 1J1XY 1IP6A 1B5ZA 151LA 3T36A 1KY0A 3HDFA 4NSJA 4W94A 1D3MA 1G7IC 4YM8A 4LYZA 1T8GA 143LA 2BQCA 3W6AA 3DKEX 5LYTA 140LA 1GFEA 1KW5A 3NY9A 4W58A 1BB7A 4ETBA 4W57A 4H9EA 2L78A 1B7LA 1G0GA 2ZIJA 4Z41A 5KY1A 1P3NA 5E4PA 1GPQC 3WUNA 5KXOA 5LINA 5LA5A 4AQNA 4MR1A 1TBYA 150LA 1VAUA 1IWVA 5KXZA 4N8ZA 1LSGA 5DL9A 1VDTA 3GUNA 1QTBA 1LHHA 3WYHA 5FEKA 1CVKA 159LA 1L10A 2VB1A 1GFHA 1BVXA 1LMQA 5IDDA 1L76A 2BQEA 239LA 186LA 1L77A 1LZEA 3T6UA 3FADA 108LA 5APFA 1P56A 3WULA 4NY5A 1LJGA 1HF4A 1LZ1A 2LYZA 1YAOA 2F47A 5ILFA 2B72A 1L32A 4I7LA 1B7MA 1YROA 1QSWA 1QS5A 4NGOA 1L56A 3HUKA 4IJ4A 1IIZA 1WQMA 4FDYA 1L51A 5L3IA 5F9XA 1C6BA 3W6DA 1YKZX 4PGJB 205LA 2XQOA 5I53A 2F32A 3OK0A 1C68A 154LA 1L33A 1C7PA 255LA 1IWYA 2OU8A 4W54A 1LYDA 210LA 1KY1A 1T8FA 1GFAA 1JSFA 1ZYTA 3OE0A 1OWZA 226LA 3CDRA 5KXYA 1L89A 2OTZX 3TMWA 1LWGA 2HTXA 164LA 1P6YA 1JEFA 1LYIA 1LGXA 2BQJA 3SP3A 4GLVA 3A95A 209LA 4LT1A 1L98A 3C8SA 198LA 4DKLA 2QB0B 3LYZA 4KPMA 3B72A 4GN3A 1JTMA 3B0IA 2MEIA 1B5UA 1A4VA 3CDQA 1JIYA 211LA 2BQGA 1FDLY 1JTPL 1KIPC 2IHLA 4HV1A 4CJ2A 173LA 1ZMYL 4I7KA 4EPFA 1L61A 1T8AA 1P2RA 1FLQA 2HUBA 5KJ9A 1CUPA 187LA 5K7OA 1LJIA 1YKXX 3GUOA 1L80A 5I5QA 3HU8A 1L03A 1LZYA 1UICA 5E9RA 1L24A 4LT0A 3HUQA 4NWEA 1XGUC 155LA 4C3WA 1HEWA 5LAGA 3GULA 3WXTA 4H1PA 2DBTA 1FN5A 128LA 1CJ7A 3PBLA 145LA 191LA 2HULA 3RZ4A 2DQGY 3AGGG 1L57A 3FE0A 4ZEEA 1LZBA 4Z46A 4NGYA 3ZVQB 4H9HA 1LZ6A 4YX7C 1PQDA 1J1OY 1L00A 1REMA 1D0MA 1LI6A 3LYMA 5ILCA 2RSCA 1IX0A 1V7TA 4DD1A 153LA 220LA 4RLNA 3HT9A 5F14A 4E3UA 193LA 3LHMA 4J1AA 3SB9A 4RDSA 2H5ZA 1T6VL 3TMUA 1IC7Y 1B7QA 4WM3A 1P37A 2FYDA 3AJNA 3A92A 4EOFA 1GDWA 3G3XA 4H8XA 1L35A 1L36A 4I7MA 3TXGA 1NQIA 1MELL 4DD3A 123LA 5L9JA 1QSQA 5KKJA 1TDYA 2DQAA 3TXIA 2D4JA 3SBBC 3D9AC 3HH3A 1XFPL 119LA 1LI3A 1UIDA 2MEEA 4TSCA 1NMMA 3DNAA 2XTHA 4PK0A 4WOAA 1LMOA 1JITA 4OW1A 5B05A 1GBYA 1L83A 1L18A 4HJYA 4G4CA 218LA 160LA 1GEVA 233LA 130LA 4GRVA 2RBPA 1TCYA 4TSBA 2BPUA 2W1YA 1L17A 2F4GA 2HEFA 4LZMA 3A8ZA 229LA 1JUGA 4B49A 1L75A 4LFXA 1P5CA 3GXKA 1L25A 2HU3A 1O23A 1LMCA 1LJFA 1LZ4A 1UACY 3C7WA 224LA 3N9CA 1YILA 1LTMA 2Z2EA 1LYJA 2CWIA 1B7RA 3CSZA 206LA 1UIGA 1B5WA 3IJVA 3N9EA 1L87A 1LYOA 138LA 1KIQC 1L45A 1I6SA 2BQMA 2F2NA 254LA 3AZ7A 4NEBA 2LZTA 3A91A 115LA 1IC5Y 2OE4X 4H90A 5B59A 1Z55A 113LA 1C6JA 2MEBA 3CDOA 3FI5A 3G3VA 1HMLA 1LHIA 3EBAB 3P64A 5F16A 4TWSA 3TXBA 1LZAA 5D5CA 1LMNA 1HFZA 3ATOA 4PHIA 5D5FA 4N9RA 1L39A 118LA 4EKQA 1L40A 2B6WA 1CKCA 4C5FA 1GE2A 4XJHA 1LGUA 2ZILA 3A3RX 1L05A 2YSSC 1LYEA 192LA 4EPIA 152LA 1L37A 4I7RA 2LZ2A 1QTCA 4WM1A 5LYMA 1BWHA 1C6AA 1VDPA 4XENA 1T6HA 259LA 1CU3A 2B73A 5C6IA 4W53A 5HLLA 1XEJA 4YF2A 4KL7A 1L63A 5HMJA 3CT5A 4J0LA 2ZQ3A 4LDEA 1RI8B 4YEMA 1W6ZA 3QNGA 4QGZA 1LOZA 1P2CC 200LA 1L96A 1QSBA 1LAAA 4GCEA 1L34A 1L50A 4G4HA 6LYTA 1LYYA 1CJ9A 238LA 5F9UA 1YANA 228LA 1HEMA 4HTQA 1OUJA 3AB6A 1GFVA 5T3FA 3WU9A 1L0KA 1LSDA 4ARQB 3IJUA 1L70A 4WM2A 5FCPA 1C69A 5FSTA 5KXLA 1GBWA 3WW5A 4Z98A 4H9IA 2RB2X 4DJHA 1LHJA 4OWBA 3C8QA 1VATA 4I7JA 1C6CA 1JHLA 1QUDA 4OO9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4A7D A;  3GUJ A;  1C6I A;  3TXF A;  1JTT L;  1ALC A;  4HPI A;  1GB7 A;  129L A;  3D4S A;  4I8S A;  4NGV A;  1YL0 X;  1J1X Y;  1IP6 A;  1B5Z A;  151L A;  3T36 A;  1KY0 A;  3HDF A;  4NSJ A;  4W94 A;  1D3M A;  1G7I C;  4YM8 A;  4LYZ A;  1T8G A;  143L A;  2BQC A;  3W6A A;  3DKE X;  5LYT A;  140L A;  1GFE A;  1KW5 A;  3NY9 A;  4W58 A;  1BB7 A;  4ETB A;  4W57 A;  4H9E A;  2L78 A;  1B7L A;  1G0G A;  2ZIJ A;  4Z41 A;  5KY1 A;  1P3N A;  5E4P A;  1GPQ C;  3WUN A;  5KXO A;  5LIN A;  5LA5 A;  4AQN A;  4MR1 A;  1TBY A;  150L A;  1VAU A;  1IWV A;  5KXZ A;  4N8Z A;  1LSG A;  5DL9 A;  1VDT A;  3GUN A;  1QTB A;  1LHH A;  3WYH A;  5FEK A;  1CVK A;  159L A;  1L10 A;  2VB1 A;  1GFH A;  1BVX A;  1LMQ A;  5IDD A;  1L76 A;  2BQE A;  239L A;  186L A;  1L77 A;  1LZE A;  3T6U A;  3FAD A;  108L A;  5APF A;  1P56 A;  3WUL A;  4NY5 A;  1LJG A;  1HF4 A;  1LZ1 A;  2LYZ A;  1YAO A;  2F47 A;  5ILF A;  2B72 A;  1L32 A;  4I7L A;  1B7M A;  1YRO A;  1QSW A;  1QS5 A;  4NGO A;  1L56 A;  3HUK A;  4IJ4 A;  1IIZ A;  1WQM A;  4FDY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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