2BAAA

The refined crystal structure of an endochitinase from hordeum vulgare l. seeds to 1.8 angstroms resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
243
structure length
243
Chain Sequence
SVSSIVSRAQFDRMLLHRNDGACQAKGFYTYDAFVAAAAAFPGFGTTGSADAQKREVAAFLAQTSHETTGGWATAPDGAFAWGYCFKQERGASSDYCTPSAQWPCAPGKRYYGRGPIQLSHNYNYGPAGRAIGVDLLANPDLVATDATVGFKTAIWFWMTAQPPKPSSHAVIAGQWSPSGADRAAGRVPGFGVITNIINGGIECGHGQDSRVADRIGFYKRYCDILGVGYGNNLDCYSQRPFA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords ENDOCHITINASE (26 KD)
publication title The refined crystal structure of an endochitinase from Hordeum vulgare L. seeds at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 87
structure length 243
sequence length 243
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 1995-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2baaA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 2baaA02
1VAUA 1LSAA 1QDTA 1VDSA 4GN5C 4QEQA 1A4VA 3N9AA 1J1PY 5DLAA 2DBTA 1RJCB 2DKVA 3M3UA 4Z98A 1NWGA 4RDSA 1WQRA 1I1ZA 5C6JA 3WVXA 1LZAA 1LYYA 1XGRC 1D0KA 1LHJA 2H9JA 1IP2A 5B1FA 3A34A 4XJDA 1JKAA 1LSPA 2HEFA 3TXDA 1GEVA 2G4PA 1KXWA 1LSGA 1IR9A 1GB0A 1GBOA 1QUTA 3D9AC 4O34A 4W94A 4OW1A 3AZ5A 1FBIX 1GB2A 2BQAA 4Z46A 2WARA 4N0JA 1BB7A 1YAMA 4H94A 1XGQC 1HFYA 3HFMY 3LYMA 3P66A 4I8SA 4LT0A 4MR1A 4R6CA 1LZ5A 1REMA 2DQFC 1OUAA 3W3EA 1E8LA 5LA5A 1LZ8A 1UCOA 4H8YA 4NY5A 3P4ZA 5LA8A 2LYMA 1LKSA 4RW1A 2ZILA 1B7SA 4LFPA 1OUCA 1C7PA 4WM2A 3WYHA 4NG1A 5LVGA 1IWUA 1JJ1A 1BB6A 3CT1A 4DYGA 1GB5A 4N1CC 1JKCA 5KXSA 1TEWA 1UIGA 1YL0X 3J4GA 4H9IA 2A7FA 1LZCA 1LSZA 3LZ2A 5D5FA 3W6DA 5L3IA 1A2YC 5EBHA 4A7DA 1JPOA 1H6MA 1F6SA 2BLXA 2MEGA 4YENA 3WUAA 2BQGA 1FN5A 1KIRC 3B6LA 4H9HA 1GFHA 4XJIA 2FYCA 1YL1X 4M6DA 1NMMA 3WULA 5LYMA 3AW6A 1LSDA 3N9CA 4G49A 3WPLA 1HEPA 5KXZA 5ILCA 3T6UA 1GE3A 1FLUA 2PC2A 4ETCA 5IELA 4M4OA 1LJFA 7LYZA 1IY4A 5DM9A 1ZVHL 4CHXA 3EMSA 2DQJY 5KXTA 3OK0A 1KXXA 1RFPA 1HEMA 2Z19A 4IATA 1YAQA 2H9KA 4FJRA 4H93A 4HJYA 1GFUA 1LCNA 4XJGA 5DN4A 1I56A 4NGIA 4DT3A 1NHEA 1QSAA 1GF0A 2N5ZA 2Z2EA 3EBAB 5DN5A 1GF7A 1AKIA 1Z55A 4WLXA 1LSFA 5KY1A 1XEIA 5LAFA 1LMTA 5B05A 5AMYA 3TMWA 1GAYA 2MEDA 1DKKA 3FE0A 1BWIA 1IOQA 1ZMYL 1IOTA 1NQIA 4KT3A 3TXGA 3P68A 4E3UA 1BWHA 3LYZA 1IWWA 3TXJA 4LYBA 2DQEY 1HF4A 2HEBA 2HTXA 3EXDA 5HNLA 1D0MA 1UIEA 5HMJA 1GBSA 3WW6A 3N9EA 4OWCA 3TMVA 4DD7A 1IWYA 1GXXA 1LKRA 3A6BY 2Z2FA 4NSIA 3WPJA 4H9BA 1GFJA 4N8ZA 1WQOA 1GBWA 3WH1A 4WG1A 3QE8A 3WPKA 2CJLA 1BB3A 1LMOA 1OUGA 3IJUA 4HSFA 4LT1A 4WM1A 3B72A 1GB6A 2MEIA 1F6RA 4L41A 1CKGA 4B0DA 4GCEA 2FYDA 3B0OA 6LYTA 4IASA 4PJ2C 4J1BA 5APFA 4WM3A 3RW8A 1OUHA 3B0IA 1G7IC 2BQFA 3WU8A 4H9AA 3AYQA 4HV1A 4WMGA 1DXJA 5FEKA 5FSTA 4B4EA 1CKDA 3CSZA 1B7RA 4OWAA 3F6ZA 1HEQA 4YEOA 4W96A 3EO5A 4GLVA 2DQAA 1YAOA 1LSBA 3G3BB 1YKZX 4IJ4A 193LA 1IP6A 1LSNA 2BQEA 3A3QA 1B0DA 3A6CY 4HP0A 4HTKA 4QDNA 5C6IA 2BQBA 1IY3A 3A91A 5E9RA 4BAFA 2C8PA 2W1XA 2I25L 1GBZA 1DKJA 4AXTA 1YAPA 4NG8A 4QY9A 1LJHA 4XENA 1LJ3A 1B9OA 4J7VA 2EQLA 1IORA 2YBLA 1OQMA 1NDMC 2YBNA 5A3EA 2HEEA 3RZ4A 2CWIA 1QTEA 4LYZA 1GDXA 1HENA 1LHLA 1UICA 1IWZA 4U3XB 1VDPA 5KXWA 4KXIA 1LHIA 2MECA 4HPEA 1HMLA 1TAYA 1GFTA 5LVIA 4UWVA 4Z3MA 1LZEA 4ET8A 4N9RA 1OUIA 1V7TA 1GF5A 1GFEA 1GBYA 3HBEX 4G9SA 4DD3A 1LHMA 1IC7Y 5KXYA 3A93A 5T3FA 4DD9A 2BQIA 3WU9A 1NBYC 1B2KA 5JENB 4LT3A 1XEJA 4WM6A 5IDDA 1UIAA 1UIDA 4MCKA 2EIZC 4RLNA 2C8OA 4HV2A 1C08C 2BQDA 5I4YA 5FELA 4ML7A 4ZFPA 5LINA 4B1AA 3AJNA 3ATOA 9LYZA 1G7HC 1LSYA 1T6VL 2FBBA 3CT5A 1CKFA 2W1LA 1LPIA 2XBRA 2YBIA 2ZQ3A 3RU5A 3AZ7A 1LHKA 4UWNA 1UUZC 1XSFA 2HECA 3LZTA 1LZGA 1NBZC 1UACY 2BLYA 2LYZA 3D3DA 4HPIA 3WMKA 5A3ZA 4G4HA 1CJ7A 3M18B 1IR7A 5C6LA 1TDYA 1GF6A 4H8XA 4N1EI 1LYSA 4G4BA 4XYYA 1CJ8A 2F4GA 2LYOA 1YANA 2XTHA 2MEEA 4ZIXA 3SP3A 3CT0A 3QNGA 1BB5A 1D6PA 1NF5A 3ZVQB 2NWDX 5B59A 1G7JC 2MEAA 1B5UA 2Y8PA 1REZA 4GLAA 4D9ZA 4TSBA 1REXA 4NHIA 1GB9A 1XGPC 4PRQA 5HQ1A 5F9XA 1LAAA 1FLYA 1HFXA 2MEFA 4DDAA 1ZV5L 1LOZA 2DQCY 3LHMA 1GAZA 4NGWA 1QIOA 1TBYA 1YROA 1DPXA 3AGGG 4CJ2A 2LHMA 4WM4A 3ZVQA 4TX7A 1LHHA 4G4CA 5M1YA 1HSXA 3KAMA 1GEZA 4R0FA 1JKBA 4B4IA 1AM7A 1O23A 5APEA 3E3DA 3TXEA 1IX0A 5ILFA 1MLCE 1B7OA 1JIYA 5LYZA 1LYZA 1OP9B 3W6FA 1DZBX 1LJKA 2DQHY 4YM8A 2ZIKA 1IVMA 1LJJA 1IOSA 4YOPA 1GFKA 132LA 1DI4A 4H9FA 3TMUA 3WL2A 4GN3A 1LJNA 2Z37A 2ZNWY 2HU3A 4XADA 4XJHA 1I20A 1J1XY 1QSWA 3WVYA 1QTKA 2ZYPA 5B07A 4P2EA 1IP3A 2W1MA 3A3RX 1OUFA 5B06A 1D9UA 1LMNA 4NGOA 3WUMA 1RI8B 1WQQA 2BQJA 4C5FA 2YDGA 1JHLA 1WQMA 4NGKA 6LYZA 3K3TA 1HSWA 2YSSC 5KJ9A 1FDLY 1GE2A 1F0WA 1YKXX 1PS5A 3AZ6A 4PHIA 1IWXA 2EPEA 1NKHA 1QUSA 3P64A 1GPQC 4J1AA 1JTTL 5F9UA 1VDQA 1EQ5A 2YBMA 2Z12A 1YKYX 1UIHA 4GCBA 5DL9A 4DWXA 1VDTA 1BQLY 1CNSA 2D4KA 3CB7A 2I26L 1B7PA 1LMCA 4H91A 4OWHA 3CSRA 4YEMA 4LGKA 1B5VA 3RT5X 4NEBA 1HEOA 2BQMA 4NHTA 1OUEA 4LFXA 2G4NA 1C46A 5B1GA 4WLDA 1KXYA 2BAAA 2BQNA 4N5RA 4NGZA 4DDBA 1JTPL 1XFPL 3OJPA 4J0LA 1HNLA 2LZTA 1WTNA 1JKDA 3W6CA 3TXKA 4Z41A 1LSMA 1JEFA 4H9CA 4WL6A 1GF3A 3IWRA 4WM5A 1IWTA 4OOTA 1KIPC 1GBXA 3B0KA 5I4XA 1DQJC 1T3PA 4PGJB 8LYZA 1CKCA 1FLWA 1B7MA 1OUBA 4NSGA 4LYOA 2XJWA 4FDYA 4YF2A 2YBJA 5J7CA 5I54A 1V7SA 4DD2A 2I6ZA 1XGTC 1LSCA 3W6BA 2AUBA 1GE0A 2MEHA 4NIJA 5I4WA 1WQNA 1AZFA 5LVKA 5LVHA 1UIBA 1B5WA 2D4IA 135LA 1FKVA 3P65A 1IP5A 4TSCA 2Z18A 2IHLA 1GHLA 1J1OY 1SQ2L 1PZYA 1QQYA 3FI7A 4NHPA 1LZ9A 4ETAA 5LYTA 2D6BA 1LZ6A 2EKSC 3AZ4A 3WUNA 4CFOA 3QY4A 5L9JA 1GFRA 1IO5A 2DQDY 3W6AA 1GF8A 4XJBA 1GB8A 4WG7A 1JITA 5FCPA 1BGIA 2CGIA 2F2NA 3A94A 2G4QA 4NSHA 2ZQ4A 1WTMA 1W6ZA 3AGHA 4HJVA 1HERA 1GWDA 2HUBA 1JJ0A 5E4PA 5F81A 3TXIA 1LJEA 1LZBA 4ETBA 3HBDA 1B5XA 1REYA 1NDGC 5APCA 4WLYA 2LZ2A 3WXTA 1B7QA 1HFZA 4AGAA 3TXFA 4ETEA 1BB4A 1EQEA 2X0AA 1SLYA 4NHQA 2YVBA 1W08A 1IOCA 3HBHA 4GCFA 1OUJA 4H92A 1IC5Y 4UWUA 4NGYA 1KIQC 5HLLA 3TXBA 3T36A 1B7LA 3A92A 3LYTA 1BVKC 2ZWBA 3A95A 4MSTA 1D6QA 4PPOA 4BS7A 2BQCA 1ZVYB 5I53A 2BQKA 4GCDA 4HTNA 4QGZA 4RLMA 4DC4A 5K7OA 4NWEA 4XN6A 1VEDA 133LA 4WO6A 1GXV2 1LMAA 1LJGA 4PRUA 3TMXA 1G7MC 1VFBC 3WU7A 1JTOL 2Z39A 3RNXA 1BHZA 1C43A 5FDJA 1LZSA 3CQLA 2HEDA 1GB3A 4OOOA 4XJFA 1BWJA 4LYTA 2BPUA 5KXNA 1LTMA 1AT6A 5KKJA 2FBDA 1LZNA 2F4AA 1XGUC 1WQPA 1LYOA 1RCMA 1UA6Y 1GDWA 1WVVA 2W1YA 1LZDA 4WOAA 1YIKA 207LA 5F16A 1LZRA 1JUGA 3TXHA 3W6EA 1DPWA 1IIZA 2Z38A 4RW2A 5LXWA 4I0CA 5II3A 4WLTA 1F10A 5KXOA 1IEEA 4KPMA 1LZ4A 2MEBA 4C3WA 3J6KA 194LA 3A90A 4WO9A 1DI5A 5KXPA 1C10A 2XBSA 1CJ6A 3BKHA 1UC0A 4NHSA 4B4JA 1ALCA 1P2CC 153LA 1LJIA 1LJ4A 1HHLA 5KXXA 1GFAA 4NWHA 3GXRA 1FKQA 5LVJA 4H9EA 1HELA 3VWOA 4BADA 1IP1A 208LA 1EL1A 4TWSA 3ULRA 5KXKA 4GN4A 1GF4A 4B49A 3A67Y 4NGJA 5F14A 3A96A 1B5YA 1IC4Y 1VATA 3LYOA 4EMNA 2Q0MX 3AB6A 5L3HA 3AGIA 4TTDA 4TUNA 4H8ZA 3CSQA 3MGWA 4OWEA 1HEWA 5HNCA 2DQIY 5KXRA 1INUA 2BQHA 4LZTA 1GFGA 1LZYA 5LIOA 4CFPA 154LA 3G3AB 2A7DA 1CJ9A 1IP7A 1LSEA 1EQ4A 1GE1A 1D0LA 2RSCA 1IWVA 4X3BA 1JSEA 2ZYCA 1HMKA 2HEAA 4KL7A 1RE2A 2YBHA 1C45A 4DDCA 1IP4A 1WVUA 1DI3A 5HMVA 3WW5A 134LA 2BQLA 1GD6A 2F30A 2IFFY 4WL7A 3A8ZA 4ANRA 4ETDA 4ZEEA 1GF9A 1AT5A 3AW7A 1JWRA 3IJVA 4GCCA 4NSJA 4EOFA 2D4JA 1BVXA 4ET9A 1LZTA 1JJ3A 5I5QA 4LT2A 1QDRA 4DD0A 1FLQA 5IHGA 1UBZA 1YQVY 1LMQA 1JSFA 4LYMA 4NFVA 4CGEA 1GFVA 3ZEKA 5KXLA 1OUDA 1G7LC 1YILA 3GXKA 5LAGA 5KKIA 2ZIJA 5D5CA 2H5ZA 3BKVA 1LMPA 4H90A 4H1PA 1JISA 4BAPA 1HC0A 1CKHA 4HTQA 1LZ1A 5APDA 4NGLA 2D91A 1GE4A 1N4FA 1MELL 2ZNXY 1B5ZA 4DD1A 2GV0A 1IR8A 2VB1A 3WXUA 5KXMA 3ATNA 5FHWA 2B5ZA 4NGVA 1H87A 4HJZA 3LN2A 4LYCA 2BQOA 1UIFA 4II8A 1B7NA 1XEKA 2CDSA 1TCYA 2HU1A 4OWBA 1GB7A 2DQGY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L82A 4QEQA 2NTHA 1D3FA 1J1PY 1RJCB 241LA 1NWGA 205LA 4DQ5A 1LYYA 1JKAA 2CUUA 1GEVA 2G4PA 1L48A 2RB0X 3NYAA 1DYBA 198LA 1YAMA 1HFYA 3LYMA 4R6CA 1E8LA 2DQFC 1UCOA 1L69A 5LA8A 1C69A 1LKSA 4I7KA 4RW1A 3WYHA 4NG1A 2RBSA 3FADA 1L80A 3CT1A 1L71A 110LA 4DYGA 3SB7A 1QUDA 1L98A 5KXSA 1UIGA 1L17A 4H9IA 2A7FA 1LZCA 5D5FA 3HTGA 2BQGA 1CV5A 3HUAA 225LA 4H9HA 2LZMA 2FYCA 146LA 1L85A 3HH3A 1K28A 103LA 1L24A 1L41A 1L54A 1RFPA 4NGLA 5DN4A 1GFUA 4XJGA 4NGIA 2OE9X 3DN1A 5KY1A 4I7LA 1LMTA 3C7ZA 1P46A 7LZMA 1DKKA 1ZMYL 4KT3A 1NQIA 1L96A 1IWWA 2Q9EA 1L91A 5HNLA 215LA 1L64A 1L95A 224LA 3TMVA 1IWYA 4N8ZA 3QE8A 3HTDA 4HSFA 1CUPA 259LA 1QSBA 1F6RA 2FYDA 6LYTA 2RBRA 4PJ2C 5APFA 236LA 3DN2A 4ARLA 216LA 4H9AA 1DXJA 1CKDA 3CSZA 1B7RA 3F6ZA 1HEQA 3EO5A 4E97A 1L05A 1LSBA 1LSNA 3A3QA 4HP0A 5C6IA 2C8PA 1DKJA 4AXTA 4QY9A 3OE8A 1CV3A 2EQLA 2RH1A 1L55A 2Z6BA 4W55A 4AQNA 2YBNA 5A3EA 2CWIA 4LYZA 1G1WA 1IWZA 5KXWA 1TAYA 1L89A 4UWVA 1LZEA 4N9RA 1OUIA 1V7TA 4G9SA 1LHMA 5T3FA 1QTZA 1L16A 251LA 2B6ZA 4WM6A 1UIAA 4MCKA 4RLNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VAU A;  1LSA A;  1QDT A;  1VDS A;  4GN5 C;  4QEQ A;  1A4V A;  3N9A A;  1J1P Y;  5DLA A;  2DBT A;  1RJC B;  2DKV A;  3M3U A;  4Z98 A;  1NWG A;  4RDS A;  1WQR A;  1I1Z A;  5C6J A;  3WVX A;  1LZA A;  1LYY A;  1XGR C;  1D0K A;  1LHJ A;  2H9J A;  1IP2 A;  5B1F A;  3A34 A;  4XJD A;  1JKA A;  1LSP A;  2HEF A;  3TXD A;  1GEV A;  2G4P A;  1KXW A;  1LSG A;  1IR9 A;  1GB0 A;  1GBO A;  1QUT A;  3D9A C;  4O34 A;  4W94 A;  4OW1 A;  3AZ5 A;  1FBI X;  1GB2 A;  2BQA A;  4Z46 A;  2WAR A;  4N0J A;  1BB7 A;  1YAM A;  4H94 A;  1XGQ C;  1HFY A;  3HFM Y;  3LYM A;  3P66 A;  4I8S A;  4LT0 A;  4MR1 A;  4R6C A;  1LZ5 A;  1REM A;  2DQF C;  1OUA A;  3W3E A;  1E8L A;  5LA5 A;  1LZ8 A;  1UCO A;  4H8Y A;  4NY5 A;  3P4Z A;  5LA8 A;  2LYM A;  1LKS A;  4RW1 A;  2ZIL A;  1B7S A;  4LFP A;  1OUC A;  1C7P A;  4WM2 A;  3WYH A;  4NG1 A;  5LVG A;  1IWU A;  1JJ1 A;  1BB6 A;  3CT1 A;  4DYG A;  1GB5 A;  4N1C C;  1JKC A;  5KXS A;  1TEW A;  1UIG A;  1YL0 X;  3J4G A;  4H9I A;  2A7F A;  1LZC A;  1LSZ A;  3LZ2 A;  5D5F A;  3W6D A;  5L3I A; 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 4B49 A;  3A67 Y;  4NGJ A;  5F14 A;  3A96 A;  1B5Y A;  1IC4 Y;  1VAT A;  3LYO A;  4EMN A;  2Q0M X;  3AB6 A;  5L3H A;  3AGI A;  4TTD A;  4TUN A;  4H8Z A;  3CSQ A;  3MGW A;  4OWE A;  1HEW A;  5HNC A;  2DQI Y;  5KXR A;  1INU A;  2BQH A;  4LZT A;  1GFG A;  1LZY A;  5LIO A;  4CFP A;  154L A;  3G3A B;  2A7D A;  1CJ9 A;  1IP7 A;  1LSE A;  1EQ4 A;  1GE1 A;  1D0L A;  2RSC A;  1IWV A;  4X3B A;  1JSE A;  2ZYC A;  1HMK A;  2HEA A;  4KL7 A;  1RE2 A;  2YBH A;  1C45 A;  4DDC A;  1IP4 A;  1WVU A;  1DI3 A;  5HMV A;  3WW5 A;  134L A;  2BQL A;  1GD6 A;  2F30 A;  2IFF Y;  4WL7 A;  3A8Z A;  4ANR A;  4ETD A;  4ZEE A;  1GF9 A;  1AT5 A;  3AW7 A;  1JWR A;  3IJV A;  4GCC A;  4NSJ A;  4EOF A;  2D4J A;  1BVX A;  4ET9 A;  1LZT A;  1JJ3 A;  5I5Q A;  4LT2 A;  1QDR A;  4DD0 A;  1FLQ A;  5IHG A;  1UBZ A;  1YQV Y;  1LMQ A;  1JSF A;  4LYM A;  4NFV A;  4CGE A;  1GFV A;  3ZEK A;  5KXL A;  1OUD A;  1G7L C;  1YIL A;  3GXK A;  5LAG A;  5KKI A;  2ZIJ A;  5D5C A;  2H5Z A;  3BKV A;  1LMP A;  4H90 A;  4H1P A;  1JIS A;  4BAP A;  1HC0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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