The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
New approaches to high-throughput structure characterization of SH3 complexes: the example of Myosin-3 and Myosin-5 SH3 domains from S. cerevisiae.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOSIN-3 ISOFORM
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| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
13
|
| structure length |
69
|
| sequence length |
69
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1A0N B; 1WXU A; 1E6H A; 2OAW A; 4WCI A; 4J9B A; 2O88 A; 2AKL A; 1AZE A; 1QCF A; 2DE0 X; 4IIM A; 2EYY A; 4CC7 A; 3NPF A; 3REA B; 1JO8 A; 1ARK A; 4RTW A; 1GRI A; 1RUW A; 1UJY A; 1QLY A; 1W70 A; 1UHC A; 4F17 A; 4LUD A; 2L3Q A; 4RTX A; 1X27 A; 2YUQ A; 1SPK A; 1XOV A; 4DEX A; 1X2K A; 2DL4 A; 2LP5 A; 2B86 A; 1CSK A; 2YT6 A; 2FRY A; 3REB B; 3EGU A; 1UTI A; 3TSW A; 4X1V A; 3A98 A; 2LQN A; 1NEG A; 2KBT A; 5ECA A; 2DLP A; 2CSQ A; 1PRL C; 2RF0 A; 1UE9 A; 1AWW A; 1KIK A; 2BTT A; 2XMF A; 4Y92 A; 1J3T A; 4CC3 A; 2FO0 A; 1PNJ A; 2DRM A; 3EG3 A; 2DBK A; 3RBB B; 2KNB B; 1QWE A; 1UG1 A; 2HSP A; 1WYX A; 2EYW A; 2O2O A; 1NG2 A; 4HVU A; 2KT8 A; 1X43 A; 4JJC A; 4LN2 A; 2AZS A; 3H0F A; 1ABQ A; 1N5Z A; 1ZX6 A; 2GQI A; 4GLM A; 4RUG A; 2O9S A; 4JJD A; 5IHK A; 2DVJ A; 3EHQ A; 2LZ6 B; 2BZY A; 3IQL A; 2J7I A; 4ESR A; 1JXM A; 4HXJ A; 3UF4 A; 2VVK A; 1Z9Z A; 2M0Y A; 1W1F A; 3THK A; 3ZL7 C; 4RTZ A; 1T0H A; 2A08 A; 4JPB W; 2EYZ A; 2JMA A; 2C0T A; 4E6R A; 3I9Q A; 1I0C A; 4IIO A; 1BB9 A; 3CQT A; 2JM9 A; 1OEB A; 4ZNX A; 5FW9 A; 2FPE A; 3VS3 A; 5I22 A; 2ED0 A; 2X3X D; 1UDL A; 1ZSG A; 1TUC A; 2DL8 A; 2YUN A; 3TVT A; 2FG0 A; 2GBQ A; 2EBP A; 3ULR B; 2CH4 W; 2KRS A; 4J9F A; 2KGT A; 2KRO A; 1E7O A; 1LCK A; 2DJQ A; 2DRK A; 2M51 A; 3FJ5 A; 2KXD A; 1OPL A; 1Z9Q A; 1M27 C; 1RI9 A; 2JS2 A; 4RTY A; 5HCK A; 3SEM A; 1PHT A; 3VS4 A; 4QT7 A; 2FRW A; 1GCQ A; 1RLQ C; 2HCK A; 2JTE A; 2HEQ A; 2QDL A; 2DL5 A; 2GTO A; 1S1N A; 4J9C A; 1GBQ A; 1GCP A; 2YUP A; 1YN8 A; 2LJ3 A; 2PNI A; 1FMK A; 2RQV A; 2CH4 A; 2O31 A; 2RMO A; 4JZ3 A; 2LJ1 A; 1YNZ A; 2OJ2 A; 3KFV A; 2YSQ A; 2W0Z A; 2D8H A; 2AZV A; 4FSS A; 1JXO A; 2LCS A; 1MV3 A; 2FPD A; 1U5S A; 3VS1 A; 5IHI A; 2JM8 A; 2ECZ A; 3PVL A; 1OOT A; 4CC2 A; 3M0R A; 2HBW A; 1SHG A; 2OI3 A; 1YWO A; 2J05 A; 1GFD A; 1ZUY A; 3UA6 A; 1OPK A; 2RQR A; 1PWT A; 1X69 A; 1ZUK A; 1X2Q A; 3EG1 A; 2KXC A; 1JEG A; 1AEY A; 1TG0 A; 1WX6 A; 2EW3 A; 2SEM A; 1AWJ A; 2EPD A; 1BBZ A; 2YUO A; 1PRM C; 5GJW B; 1JQQ A; 1PKT A; 3EG2 A; 4J9G A; 3VS0 A; 1I07 A; 4Z8A A; 1T3L A; 2AKK A; 4LNP A; 3TSZ A; 1UGV A; 2D8J A; 4J9H A; 1IO6 A; 3PE0 A; 4OML A; 1GFC A; 1FYN A; 2NUZ A; 2DX1 A; 2ESW A; 2F2X A; 2GTJ A; 1VYU A; 2RQW A; 4OMO A; 1AZG B; 2DYB A; 1K4U S; 2KRM A; 4HVW A; 1GL5 A; 2A28 A; 2KYM A; 2LNH B; 4J9I A; 4AFU C; 1K0S A; 1G2B A; 3NHN A; 1GBR A; 1ZUU A; 3M0Q A; 2EQI A; 1YCS B; 1MV0 B; 3LH5 A; 3NMZ C; 1U06 A; 2RPN A; 2W10 A; 4AG1 C; 2ROT A; 1WFW A; 2JT4 A; 1X6B A; 3VS5 A; 2P4R A; 4M4Z A; 3I5R A; 2LJ0 A; 3U23 A; 3EHR A; 2HDA A; 4A63 B; 1UHF A; 1K9A A; 1B07 A; 1VA7 A; 1YP5 A; 5IXB A; 2ABL A; 1PKS A; 2JXB A; 2K7A A; 2K9G A; 4Z89 A; 2JMC A; 1K1Z A; 3H41 A; 2A37 A; 4KRT A; 2V1R A; 2CRE A; 3SHW A; 2MCN A; 2EGA A; 1UJ0 A; 2L0A A; 2DBM A; 4R0K A; 3VRZ A; 3VS2 A; 2A36 A; 5EC7 A; 1HD3 A; 4K11 A; 2KR3 A; 4DEY A; 4J9D A; 1ZBJ A; 1GCQ C; 2BZX A; 1RLP C; 2EYX A; 1TUD A; 1T0J A; 1BU1 A; 3VS7 A; 4RTU A; 2RNA A; 2V1Q A; 2KEA A; 4D8K A; 2L3S A; 4OMP A; 2KT1 A; 4RTV A; 1E6G A; 5GJV B; 1WIE A; 1KSW A; 1WDX A; 1UEC A; 2D0N A; 2I0N A; 1AWX A; 5IXF A; 2CT4 A; 2K6D A; 1NLO C; 1M3B A; 2KRN A; 3QWY A; 1M3C A; 1AVZ C; 1MUZ A; 1NLP C; 1HSQ A; 2FEI A; 4OMQ A; 2O9V A; 2K2M A; 5I11 A; 1H3H A; 4OMN A; 3EG0 A; 1OV3 A; 3VRY A; 2EVR A; 1NYF A; 3VS6 A; 2VWF A; 1G83 A; 1K76 A; 1AD5 A; 1WI7 A; 2LX7 A; 3GBQ A; 2IIM A; 4AG2 C; 1QWF A; 2JS0 A; 3I5S A; 1T3S A; 4F16 A; 2CUD A; 2LMJ A; 2RQT A; 3M0P A; 2E5K A; 4AFZ C; 2DM1 A; 2DIL A; 4JJB A; 1V1C A; 1M8M A; 4HCK A; 2DMO A; 1B3Q A; 2BZ8 A; 1AOJ A; 1M3A A; 1QKW A; 2DNU A; 1H8K A; 2JW4 A; 1ZLM A; 1EFN A; 2PZ1 A; 2J6F A; 2CSI A; 1NEB A; 4CC4 B; 5FWC A; 2K79 A; 2MIO A; 1UUE A; 3JV3 A; 4LE9 A; 1VYT A; 1BK2 A; 1NM7 A; 3R6N A; 2L2P A; 1HJD A; 4ORZ A; 2F2W A; 2J6O A; 3I35 A; 2ROL A; 4RTT A; 5FWB A; 1QKX A; 1SHF A; 1SSH A; 2KYB A; 2EGC A; 1Y57 A; 3RNJ A; 3M0T A; 3UAT A; 1NYG A; 5IHN A; 1SRM A; 2CT3 A; 2YDL A; 3C0C A; 4D8D A; 4EIK A; 3O5Z A; 5IH2 A; 4OMM A; 2SRC A; 1W6X A; 4Z88 A; 2D1X A; 1X6G A; 4GBQ A; 2GGR A; 2C0O A; 2RQU A; 4AFQ C; 1CKA A; 1I1J A; 2F2V A; 2J06 A; 1VYV A; 1WLP B; 1CKB A; 3M0U A; 4HVV A; 1M30 A; 2CUB A; 2DF6 A; 1KJW A; 2EKH A; 2ENM A; 1WA7 A; 1WXT A; 2DL3 A; 1H92 A; 4F14 A; 2VKN A; 2L3P A; 1YWP A; 2RN8 A; 2NWM A; 1KFZ A; 2CDT A; 1ABO A; 3M0S A; 2J6K A; 3QWX X; 2PTK A; 2LQW A; 2DA9 A; 3H0I A; 3PVQ A; 2X3W D; 1AWO A; 2G6F X; 4LUE A; 2K3B A; 3UA7 A; 2EGE A; 4AFS C; 1K0X A; 1Y0M A; 2KE9 A; 3NGP A; 5L23 A; 1U3O A; 1SRL A; 1WXB A; 1SEM A; 1JU5 C; 4J9E A; 2AK5 A; 4JZ4 A; 2MOX A; 2DL7 A; 3H0H A; 2ED1 A; 2FPF A; 2GNC A; 2C0I A; 1UFF A; 2H8H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QTV A; 2ZPI B; 4WCI A; 3OB9 A; 4J9B A; 2O88 A; 2AKL A; 1AZE A; 3JCM c; 3SWN C; 3N5B B; 1ZA1 B; 5LJ5 e; 1G3S A; 2L3R A; 2RK1 A; 1RUW A; 2RHU A; 3QYH B; 4HT8 A; 4LUD A; 2L3Q A; 5GMK e; 4BI3 A; 1Q95 G; 2V8J A; 4IUV A; 1RAH B; 5KYN A; 4FL6 A; 2IVW A; 2LC4 A; 1UTI A; 3CBO A; 1NPR A; 2LQN A; 1BIB A; 4OB0 B; 4N0A C; 4JLG A; 4M77 C; 2QYZ A; 4LDV A; 3PT9 A; 2BTT A; 2XMF A; 1VQM Q; 4CC3 A; 2HL3 A; 1W2B P; 1K8A R; 1B7T A; 3RR6 A; 4FYX B; 3OYA A; 1WYX A; 1VQ7 Q; 5KH6 A; 3G6E Q; 2XHC A; 4HVU A; 4X9D A; 2A0F B; 1Q7Y U; 4HCB A; 2GFA A; 1N5Z A; 1S72 Q; 2GQI A; 1Q82 U; 1VIE A; 4C92 F; 5IHK A; 5GAN 3; 3J7A F; 3GF5 A; 4II1 A; 2FZK B; 2XD0 A; 2LZ6 B; 2BZY A; 3CXC S; 1MHN A; 4GY5 A; 4MML A; 4FM4 B; 1JXM A; 1N9R A; 4Z02 A; 1IGU A; 3C4S A; 4R55 A; 3MEV A; 1C1A A; 3ZL7 C; 2A3L A; 4JPB W; 5FU6 B; 4L59 A; 1S72 A; 2RM4 A; 2JMA A; 1TWB A; 2C0T A; 2B8A A; 2ZZD A; 1BB9 A; 5KYY A; 2JM9 A; 4ZNX A; 5KYW A; 1VQK Q; 3VS3 A; 2AHJ B; 1N27 A; 2WSC E; 3CCL Q; 1WJR A; 1OQK A; 5LJ3 j; 3DLL A; 2COZ A; 1I4K 1; 4J9F A; 3JCM h; 3MHX A; 2K5F A; 2DJQ A; 3BE3 A; 4C5E A; 1OPL A; 1LVK A; 5CAI A; 1RI9 A; 1PC0 A; 1VQK A; 3QPH A; 5HCK A; 3SEM A; 1PHT A; 4C0D B; 4M7D A; 3CCL A; 4QT7 A; 4BE1 A; 1WGS A; 2ZAE A; 1OU8 A; 2GTO A; 3BW1 A; 2HQE A; 1YN8 A; 2PNI A; 2CKK A; 2O31 A; 2RMO A; 2OJ2 A; 4L6V 5; 2W0Z A; 3Q1J A; 3CEY A; 4YTL A; 3HRT A; 2VB6 A; 4PL6 A; 1X01 A; 1W2B S; 2ECZ A; 3OYF A; 3M0R A; 4QQD A; 2DXU A; 3CCU Q; 1C0M A; 4B9W A; 3UA6 A; 1VQP A; 2QEX T; 4LDW A; 1NE8 A; 2X4X A; 1OPK A; 2E4H A; 2RQR A; 1X69 A; 4J7I A; 1X2Q A; 4BE0 A; 2EW3 A; 1G3W A; 4C0G A; 2M02 A; 2O4X A; 3QDF A; 2EPD A; 1YJ9 Q; 2YUO A; 1BCO A; 2COW A; 5GAM h; 1IHW A; 1D0Y A; 1LOJ A; 1UGV A; 5KCO A; 1IO6 A; 4QW2 A; 1FYN A; 2NUT B; 2F2X A; 1VYU A; 3EFR A; 2GF7 A; 4EMK B; 4BDY A; 1K4U S; 3DB4 A; 3QJ6 A; 2KYM A; 2LNH B; 3FDR A; 3OMG A; 1G2B A; 3NHN A; 4JRQ A; 1X75 C; 4XTY A; 2EJ9 A; 2EKO A; 2YRD A; 5KYU B; 1YCS B; 1MV0 B; 2QGG A; 2LCC A; 3QYG B; 2MI6 A; 3RER A; 3MET A; 1UGP B; 3OYN A; 2PUO B; 4AG1 C; 4C8Q B; 1LPL A; 2JT4 A; 3VS5 A; 2P4R A; 4M4Z A; 2QQR A; 1SF9 A; 4KH1 B; 5GMK l; 1YP5 A; 4M75 A; 4C5H A; 5IXB A; 5GAN j; 9ATC B; 2JMC A; 2PUK B; 2V1R A; 1VQ8 A; 1G3Y A; 2HKN A; 1Q81 U; 2L0A A; 3VRZ A; 3CCV T; 1JBM A; 1D3B A; 1Y71 A; 1RAC B; 3PIO A; 1C6V X; 3X28 B; 1M8V A; 1MNE A; 4J9D A; 4JRI A; 2MK5 A; 1ZBJ A; 2JN0 A; 2LQ8 A; 1YHQ A; 1ZHI A; 4KBM B; 1FWZ A; 1G8X A; 4D8K A; 2L3S A; 4OMP A; 2DYI A; 3S6W A; 1E6G A; 4FSX A; 1TU0 B; 2I0N A; 3CC2 Q; 2RI3 A; 5IXF A; 3LX7 A; 3GP8 A; 3ZEH A; 5KYX A; 3A8L B; 3M9Q A; 1M1F A; 1MUZ A; 4A53 A; 1K73 R; 4E7J A; 1VQP T; 3HL8 A; 2DJZ A; 4OMQ A; 3SWN A; 3JCM f; 5I11 A; 3OBW A; 3HP9 A; 4OMN A; 4XAX B; 1OV3 A; 3TU4 K; 1R0B G; 3X24 B; 1M2O A; 3CXC A; 3CC2 A; 1UGS B; 3EFO A; 1AD5 A; 2LX7 A; 3GBQ A; 4C8Q D; 1V29 B; 1VQ6 T; 2QA4 A; 5LJ5 j; 3OYI A; 1OZ2 A; 2M9U A; 4IUU A; 3CCQ Q; 4C8Q G; 2KVQ G; 3A8G B; 2HQH A; 4N0A A; 1YIT Q; 2QDY B; 2LTO A; 1QKW A; 2OTJ Q; 4M77 A; 3GNG A; 1H8K A; 5HKC A; 1TOV A; 2E1H A; 2F69 A; 2J6F A; 1NEB A; 5FWC A; 5CIU A; 1U1S A; 2MIO A; 1QCO A; 1YIJ Q; 3JV3 A; 4IKF A; 1NM7 A; 4OF1 A; 2OAU A; 3M56 A; 3JCM J; 1WQW A; 2J6O A; 1YIT A; 1VQN A; 3CCR Q; 1QKX A; 2OTJ A; 3VUZ A; 1N8R R; 2EGC A; 3QSU A; 1Y57 A; 3RNJ A; 3M0T A; 4E47 A; 5IN1 A; 1NYG A; 5LJ3 e; 5IHN A; 4AMC A; 2CT3 A; 2YDL A; 3C0C A; 4D8D A; 4EIK A; 3M4G A; 1YIJ A; 3O5Z A; 5IH2 A; 3H8Z A; 2SRC A; 4Z88 A; 1NPP A; 2GGR A; 1VQ8 T; 2CYZ B; 5GAO q; 2RQU A; 1QCN A; 3GOX A; 2FL7 A; 1CKA A; 1WLP B; 3M0U A; 4HVV A; 3CCR A; 4HCZ A; 2CUB A; 2DF6 A; 4F7U F; 1KJW A; 2EKH A; 1N9S A; 2K57 A; 1IRX A; 5LJ3 g; 1W2B A; 1KFZ A; 3E19 A; 4PFO A; 3M0S A; 2D0Q B; 2V26 A; 3JCM V; 4BE2 A; 3JB9 F; 3X26 B; 1YBY A; 2X3W D; 1D1C A; 1YHQ T; 1QVF S; 1G5V A; 3X20 B; 4PJO E; 2GQV A; 2QG9 B; 1RL2 A; 4PJM A; 8ATC B; 4XU3 A; 3CC7 T; 2AK5 A; 2E6Z A; 1D1A A; 2MOX A; 2ED1 A; 3LH0 A; 1TTH B; 2RHX A; 4WTO B; 2M0O A; 5GAN 5; 1ZSZ C; 2H8H A; 1ACM B; 1A0N B; 4C5I A; 1VQO T; 3CD6 Q; 4M7A D; 4M78 B; 2YWW A; 1FX7 A; 2E6N A; 1QCF A; 2DE0 X; 1IB8 A; 2EYY A; 2RJE A; 3V8J A; 3H9N A; 1Q86 C; 3REA B; 2QA4 T; 2DXC A; 5DLQ E; 1JB0 E; 2EAY A; 1ARK A; 1GRI A; 1VQ4 A; 1VQL Q; 1QLY A; 1UB4 A; 4F17 A; 3CD6 A; 5L8R E; 4RTX A; 6AT1 B; 3RKW A; 4A4E A; 2ATC B; 2HKQ B; 1X2K A; 3OQ5 A; 5GAO p; 1B34 B; 2B86 A; 1CSK A; 2MYS A; 2COY A; 2FRY A; 2VGN A; 4NS5 A; 3V8L A; 1ZBX A; 3A98 A; 2RHI A; 4JRK A; 1KQ2 A; 1NEG A; 3P8B B; 4EMK C; 2CSQ A; 1PRL C; 1VQL A; 3RES A; 3CCS T; 3H6Z A; 2ZPH B; 5CCA A; 2FO0 A; 2NLU A; 3L2Q A; 2DRM A; 4OGE A; 2DAQ A; 5D6X A; 1VQN T; 2DBK A; 3RBB B; 2KNB B; 4JLI A; 5DY9 A; 4JJC A; 3CPW S; 3JSC A; 2AT1 B; 4BB7 A; 3PIP A; 5HK3 A; 4GLM A; 4C92 B; 1HK9 A; 2VGM A; 3LYI A; 4E7I A; 4FCY A; 4EMH A; 4M7A F; 1W4S A; 4JJD A; 3TEE A; 1YFN A; 2EQK A; 1TS9 A; 4ESR A; 1YJW T; 3GLX A; 4A4H A; 4HXJ A; 3UF4 A; 3SD4 A; 1SSF A; 1W1F A; 2LT1 A; 1PSF A; 5GMK h; 4RTZ A; 4JS5 A; 3NTI A; 1T0H A; 4ZTF A; 4M78 G; 5GAN g; 4E6R A; 3CMA Q; 3J80 E; 5FRN A; 3ASK A; 3OYL A; 4IIO A; 4M78 E; 1K8A C; 4KUD K; 3CXC P; 2FPE A; 5CKE A; 1YJN Q; 2ED0 A; 1M5Q 1; 1UDL A; 2R5A A; 4IUT A; 1TUC A; 2YUN A; 3TVT A; 3VYG A; 1IHV A; 2GBQ A; 1MMN A; 2RO0 A; 2EBP A; 3GPL A; 3NTH A; 3P8H A; 2CH4 W; 1VUB A; 4PFZ A; 1E7O A; 5J26 A; 3HRU A; 2DRK A; 2M16 A; 4XU1 A; 2JS2 A; 1YJN A; 3CME T; 3M57 A; 4QQG A; 4HCC A; 3AT1 B; 3CCM T; 1YI2 Q; 1LJO A; 5CKH A; 2HEQ A; 2QDL A; 2DL5 A; 4PJL A; 3ZBD A; 2ZPF B; 1AT1 B; 2YUP A; 2LJ3 A; 1FMK A; 4PKC C; 4JZ3 A; 4A54 A; 4BDZ A; 2LJ1 A; 2IG0 A; 5I2M A; 2DZ9 A; 1VQ5 T; 2D8H A; 4XTZ A; 5GAO n; 1EZZ B; 1JXO A; 3O8V A; 5GAO l; 1KC8 U; 2FPD A; 3LWI A; 3FC3 A; 3ZFJ A; 2JM8 A; 3PVL A; 1OOT A; 2NUP A; 2DXB A; 3JB9 J; 4XTU A; 3HRS A; 1GFD A; 5LJ5 g; 4M7A C; 1ZUY A; 3RDV A; 2DTO A; 4ELY C; 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