The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
b'VEAIVEFDYQAQHDDELTISVGEIITNIRKEDGGWWEGQINGRRGLFPDNFVREIK'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cbl Promotes Clustering of Endocytic Adaptor Proteins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH3-DOMAIN KINASE BINDING PROTEIN 1
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LCK A; 1NLP C; 2CSI A; 2ED0 A; 4J9B A; 2KRO A; 1T0J A; 1VYV A; 3EHR A; 4ESR A; 1KIK A; 4ORZ A; 1JEG A; 3H0H A; 4HVU A; 2ECZ A; 3NMZ C; 2DIL A; 4HVW A; 5IHN A; 1H92 A; 1B07 A; 1NG2 A; 2OAW A; 2ESW A; 1AVZ C; 1QKW A; 4Z88 A; 3PVQ A; 2CSQ A; 2JMA A; 4LUD A; 2L3P A; 1HSQ A; 1W1F A; 2M0Y A; 2CDT A; 1V1C A; 1K4U S; 1QWF A; 1G83 A; 2EYY A; 1K76 A; 5GJV B; 2IIM A; 2YUN A; 4AFQ C; 3H0F A; 2JM8 A; 2KNB B; 4JZ4 A; 1I07 A; 2EKH A; 3O5Z A; 4RTT A; 4HVV A; 2K79 A; 2DVJ A; 2YUQ A; 2FEI A; 3UA6 A; 3FJ5 A; 2J6F A; 3A98 A; 2P4R A; 2BTT A; 2C0T A; 1JO8 A; 1FYN A; 1ZSG A; 2JS0 A; 2LMJ A; 2K3B A; 3M0U A; 2VWF A; 2K7A A; 1SPK A; 1SHF A; 1X27 A; 4DEX A; 2LQN A; 1H3H A; 1UHF A; 1ZX6 A; 2DM1 A; 3LH5 A; 1B3Q A; 1VA7 A; 4JJC A; 2V1Q A; 3KFV A; 1OPK A; 3M0R A; 2ROL A; 4Z8A A; 1Z9Q A; 5FW9 A; 3REB B; 1SRM A; 4JZ3 A; 2RPN A; 1JQQ A; 4J9C A; 2EBP A; 2PZ1 A; 1WXT A; 3UAT A; 1I0C A; 2W0Z A; 2DL8 A; 2JXB A; 2LCS A; 5IHI A; 1AD5 A; 4GBQ A; 1PHT A; 1VYU A; 1MV0 B; 1SHG A; 1BB9 A; 2C0O A; 1WI7 A; 2FO0 A; 3I5S A; 1W6X A; 4ZNX A; 1PRM C; 1AWJ A; 2DA9 A; 2KE9 A; 2RQW A; 1GFC A; 2EYX A; 2W10 A; 1BU1 A; 2L3S A; 2EGE A; 2HBW A; 2O9V A; 4HXJ A; 2RQT A; 2DL5 A; 1M3C A; 2D8J A; 2KEA A; 1PNJ A; 2G6F X; 2D1X A; 3VS3 A; 2GTJ A; 3NGP A; 1UGV A; 1UJ0 A; 4CC2 A; 4DEY A; 1AZG B; 2CUB A; 1J3T A; 3C0C A; 3TSZ A; 1CKB A; 1ZUK A; 2YUP A; 3I35 A; 1RLP C; 1WFW A; 5FWB A; 4A63 B; 2DX1 A; 2KT8 A; 5HCK A; 2KRS A; 2K2M A; 3VS0 A; 4OMO A; 1OV3 A; 2GBQ A; 1NLO C; 2L2P A; 5IXB A; 3H0I A; 5I11 A; 1MV3 A; 2DL7 A; 2L3Q A; 2BZ8 A; 1UHC A; 4JJB A; 4F17 A; 1RI9 A; 1ARK A; 3VS7 A; 2JM9 A; 4J9D A; 1AOJ A; 2X3X D; 1GCQ C; 3REA B; 2DBK A; 2KBT A; 3RNJ A; 2QDL A; 3RBB B; 1UEC A; 1AWX A; 1ZUU A; 3M0P A; 3VS2 A; 1TUD A; 1PWT A; 4J9F A; 2EYZ A; 1UG1 A; 2DRM A; 3GBQ A; 1QWE A; 2YUO A; 3EGU A; 2A28 A; 2LJ3 A; 3SHW A; 4EIK A; 5IH2 A; 1AEY A; 2FPE A; 4CC7 A; 1YWP A; 2JT4 A; 2KXD A; 3ULR B; 5IHK A; 4R0K A; 1BK2 A; 1EFN A; 1ABO A; 1Y57 A; 2HDA A; 1UUE A; 3VS4 A; 1TG0 A; 4RUG A; 1M27 C; 1T0H A; 2O31 A; 1Y0M A; 2DL4 A; 1KJW A; 2FRY A; 2F2V A; 2EPD A; 1SEM A; 2J06 A; 2RNA A; 1Z9Z A; 2BZX A; 2CRE A; 3QWY A; 2NUZ A; 2O9S A; 1JXO A; 2VKN A; 2CUD A; 2MOX A; 1OEB A; 1UE9 A; 4RTW A; 3VRZ A; 2AKL A; 4OMQ A; 1PKS A; 3ZL7 C; 1AWO A; 2J6O A; 2RQV A; 4AFS C; 2LP5 A; 1M3A A; 2CH4 A; 2RQU A; 2KXC A; 2DRK A; 4CC4 B; 4J9I A; 2YSQ A; 2CT3 A; 5GJW B; 1MUZ A; 1E6G A; 1NYF A; 2GGR A; 2I0N A; 2MIO A; 3TSW A; 1AWW A; 1K9A A; 3PVL A; 2EW3 A; 4RTU A; 1VYT A; 4OMN A; 2RN8 A; 1YN8 A; 3CQT A; 1KSW A; 1GBR A; 2FPD A; 1E6H A; 1XOV A; 2LNH B; 1UDL A; 1AZE A; 4Z89 A; 1ZBJ A; 1NM7 A; 2YT6 A; 1WDX A; 1X2K A; 3EG2 A; 2YDL A; 4LNP A; 4GLM A; 4WCI A; 4AFU C; 2EYW A; 1X6B A; 3EHQ A; 2A37 A; 2RQR A; 1W70 A; 2AZS A; 5ECA A; 5FWC A; 4J9G A; 3VRY A; 2GTO A; 4D8D A; 1U3O A; 2GQI A; 1ZUY A; 2BZY A; 2LX7 A; 4OMP A; 3I9Q A; 4AG2 C; 3R6N A; 3I5R A; 1SRL A; 1A0N B; 4RTZ A; 4E6R A; 1YWO A; 2B86 A; 2A36 A; 3QWX X; 1M30 A; 3NPF A; 2HCK A; 2JW4 A; 2ENM A; 1U06 A; 1H8K A; 1CKA A; 1OPL A; 2JMC A; 3EG0 A; 2FG0 A; 1S1N A; 1FMK A; 2A08 A; 2J05 A; 2DMO A; 3TVT A; 2F2W A; 1GBQ A; 3M0S A; 4OMM A; 4F14 A; 2DBM A; 3SEM A; 2CH4 W; 1UTI A; 2K9G A; 2DNU A; 4FSS A; 1GFD A; 1NYG A; 2V1R A; 1ABQ A; 3VS5 A; 3UA7 A; 5L23 A; 3JV3 A; 1PKT A; 1X43 A; 2KT1 A; 2AZV A; 2NWM A; 5IXF A; 2EGC A; 3PE0 A; 2KRM A; 2J6K A; 1IO6 A; 1X6G A; 2SEM A; 2KYB A; 2PTK A; 2XMF A; 2J7I A; 1N5Z A; 1GCP A; 1WX6 A; 4F16 A; 1K0X A; 1GL5 A; 4J9H A; 5I22 A; 1WA7 A; 1KFZ A; 2MCN A; 2RF0 A; 4IIO A; 3IQL A; 1CSK A; 2K6D A; 3M0Q A; 2EQI A; 1YP5 A; 4LN2 A; 3THK A; 4KRT A; 1HD3 A; 2L0A A; 4OML A; 4RTV A; 4X1V A; 2ED1 A; 4D8K A; 4LE9 A; 1WLP B; 3U23 A; 1JXM A; 4HCK A; 4CC3 A; 3UF4 A; 4K11 A; 4RTY A; 2DF6 A; 2F2X A; 2EVR A; 2H8H A; 2HEQ A; 1RLQ C; 2O88 A; 1E7O A; 1M8M A; 2FRW A; 1YNZ A; 2D0N A; 2ROT A; 1T3L A; 2D8H A; 1WXU A; 1WYX A; 4J9E A; 2E5K A; 3H41 A; 2GNC A; 2ABL A; 4AFZ C; 1UFF A; 1BBZ A; 2SRC A; 4JJD A; 1GCQ A; 2DE0 X; 1QLY A; 1G2B A; 2AK5 A; 1YCS B; 1M3B A; 1RUW A; 1X2Q A; 1X69 A; 1WIE A; 2LQW A; 2DL3 A; 2JS2 A; 2AKK A; 2KGT A; 2VVK A; 2DLP A; 4RTX A; 2OJ2 A; 1SSH A; 2FPF A; 1HJD A; 1PRL C; 1NEB A; 1QCF A; 4QT7 A; 2HSP A; 1K1Z A; 1TUC A; 2RMO A; 2M51 A; 2CT4 A; 1JU5 C; 2DJQ A; 2LJ1 A; 5EC7 A; 2LJ0 A; 2O2O A; 3VS6 A; 4AG1 C; 3EG1 A; 4Y92 A; 1WXB A; 2KRN A; 3EG3 A; 2JTE A; 1QKX A; 2DYB A; 2X3W D; 2EGA A; 3NHN A; 1UJY A; 1NEG A; 1T3S A; 2OI3 A; 4IIM A; 4JPB W; 1OOT A; 2KR3 A; 2LZ6 B; 4LUE A; 1K0S A; 4M4Z A; 1U5S A; 1ZLM A; 2KYM A; 3VS1 A; 2PNI A; 3M0T A; 1GRI A; 2C0I A; 1I1J A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3L42 A; 4LDU A; 3SDZ A; 1HYO A; 4JDS A; 3OYE A; 4A4H A; 3G7Z A; 4CI0 C; 1VYV A; 3LGL A; 1OQK A; 3MEU A; 5J26 A; 3OS5 A; 4JJN K; 1ZSZ B; 3CCL A; 3NMZ C; 4HVW A; 3CC2 A; 3TRE A; 1B07 A; 2CZ7 B; 1QKW A; 2QTX A; 3MHX A; 4PNO A; 1VQ6 A; 3QPH A; 2QG9 B; 1HSQ A; 2VAS A; 3H8Z A; 4CRI A; 2FZC B; 3CCJ T; 1V1C A; 3CCV Q; 1KC8 C; 1GXI E; 1MND A; 2QGF B; 5GJV B; 1KK7 A; 2IIM A; 3I56 Q; 3SWN B; 4PFO A; 2KNB B; 4JZ4 A; 1RAH B; 4HVV A; 1N27 A; 1JJ2 S; 3UA6 A; 3I55 A; 2F5T X; 4LDX A; 2DZ9 A; 5KYU B; 3CCM Q; 4KGZ B; 3G6E Q; 4BE1 A; 1FYN A; 1VQ5 T; 1VQL T; 4ELZ C; 4ATO A; 1ZSG A; 3FJP A; 2JS0 A; 3X24 B; 3HHT B; 1K9M R; 5LJ3 j; 1M1K U; 1H3H A; 1UHF A; 1ZX6 A; 3LH5 A; 4JJC A; 4FSX A; 3FB9 A; 4HCZ A; 4L6V 5; 2XD0 A; 3RMS A; 3REB B; 2VXE A; 1SRM A; 4M7A G; 1Q82 R; 3GNF B; 3INZ A; 4VUB A; 3UAT A; 1BIB A; 2DTI A; 3OQ5 A; 3VYG A; 1AD5 A; 4JRI A; 1K8A U; 2YWW A; 1MV0 B; 3GNG A; 2RH2 A; 3MP6 A; 2NYS A; 3L2Z A; 2DA9 A; 2DYI A; 2MMP A; 2KQW A; 2QTV A; 2FL7 A; 1K8A C; 2OAU A; 1QMC A; 4E7S A; 2FZK B; 2W10 A; 3JAM E; 2EGE A; 4HKE A; 3SB2 A; 4HXJ A; 1M8V A; 2HKQ B; 2RQT A; 3VJP A; 2YLC A; 2QXF A; 5GMK m; 2XIC A; 2NUT A; 3SFM A; 4C8Q E; 3A8O B; 4JS4 A; 1PSE A; 5DM7 R; 1UGV A; 2HQX A; 3MCA B; 4CC2 A; 4DEY A; 4TVR A; 1U8R A; 2L89 A; 3RR6 A; 1D09 B; 3CCU Q; 1VQ4 Q; 5GMK h; 1QCN A; 4A63 B; 4EMG A; 2KRS A; 2LX9 A; 2GQV A; 2GBQ A; 5D6W A; 4BY6 C; 5IXB A; 4A4F A; 4E7K A; 2V8J A; 2GFA A; 2WSE E; 1NZ9 A; 1VQ7 A; 1M90 C; 1LJO A; 1WJQ A; 4XTX A; 4C8Q B; 2JM9 A; 5GAN 6; 2HMA A; 4M78 A; 4J9D A; 3NFC A; 4O6J A; 5KYN A; 5LJ3 g; 2DBK A; 3RNJ A; 4DOV A; 1UEC A; 3OW2 P; 1FXX A; 3CCR Q; 3JCM h; 1KHC A; 3JB9 D; 5DY9 A; 2X4X A; 4XK8 E; 1UG1 A; 1YWP A; 2KXD A; 3ULR B; 3CME T; 2AT1 B; 3S3N A; 2PUK B; 3S6W A; 4R0K A; 1EFN A; 2X4J A; 3M5A A; 1M27 C; 2ZPF B; 1Y0M A; 2DL4 A; 3CBP A; 4Y91 A; 1SEM A; 1Z9Z A; 5LJ3 d; 2CRE A; 2HSE B; 3QWY A; 3RKY A; 2O9S A; 2CUD A; 4X9C A; 3KBG A; 2M02 A; 1YJW Q; 3P8B B; 2RQU A; 2KXC A; 4C92 B; 4J9I A; 5GJW B; 1MUZ A; 2JOY A; 3C4S A; 2P4T A; 2RI3 A; 2I0N A; 2BUD A; 4ANJ A; 1AWW A; 2DXC A; 4E7I A; 4RTU A; 4M7D C; 4OP0 A; 2O4X B; 4HT9 A; 2DET A; 3CQT A; 1KSW A; 1OZ3 A; 3A8L B; 2FPD A; 2LNH B; 1XOV A; 1IRE B; 1ZBJ A; 1NM7 A; 4A53 A; 2F1L A; 3P8H A; 5I21 A; 3MEA A; 2V8I A; 1YJN Q; 1G3T A; 4LNP A; 1YBY A; 4WCI A; 4AFU C; 3BE3 A; 2EYW A; 3EHQ A; 4C0D B; 1Q82 C; 2A37 A; 3OMG A; 4PLI A; 3CC4 Q; 2RA2 A; 3MET A; 4J9G A; 5FU6 C; 1AHJ B; 2GTO A; 4D8D A; 2GQI A; 2BZY A; 2K57 A; 4B9X A; 1C0M A; 3A8H B; 4II1 A; 3OSS C; 4ZTJ A; 3CPF A; 4PLL A; 4F7U G; 4RTZ A; 2A36 A; 5LJ3 e; 2HCK A; 2MAM A; 3L2Q A; 2OTL Q; 1UB4 A; 2FB7 A; 2D9T A; 1H8K A; 2VXF A; 2JMC A; 3EG0 A; 2FG0 A; 3CCE A; 2A08 A; 1D3B A; 3OS1 A; 2DMO A; 3EH2 A; 3GIB A; 4PJO D; 4OMM A; 1BCO A; 1KD1 C; 2DBM A; 3SEM A; 3CXC A; 4C0Z A; 4M7D A; 1UTI A; 2K9G A; 1NYG A; 5KE3 A; 2G3R A; 1ABQ A; 5C0M A; 3UA7 A; 4A4G A; 4BAC A; 1QVF P; 2A7Y A; 3A8G B; 2EGC A; 3CBM A; 4RCB A; 2J6K A; 1X6G A; 2SEM A; 4MDX A; 1C1A A; 2QEX A; 5CCA A; 2XMF A; 2LNV A; 2MK5 A; 5HY6 A; 1KFZ A; 2MCN A; 2RF0 A; 3V8L A; 4LDY A; 2EQM A; 1H64 1; 3BDU A; 3EFS A; 2QAZ A; 2ED1 A; 4LE9 A; 1WLP B; 1N8R R; 4IUV A; 4HCK A; 2OTJ A; 2KI7 A; 5GAO l; 3G4S A; 3TEE A; 5A0G A; 2H8H A; 4WTO B; 2O88 A; 1JJ2 A; 1E7O A; 1JRI A; 2FRW A; 1YNZ A; 2D0N A; 2JTF A; 4M77 B; 2D8H A; 4J9E A; 1V29 B; 2FHD A; 3CEY A; 3H41 A; 3CC2 T; 4N4I A; 5GAO p; 1VQ6 T; 1VQM A; 3MP1 A; 3CMA A; 4ZN1 A; 3JB9 G; 2X4W A; 1QLY A; 1WHK A; 4ZTF A; 1U1T A; 1VQ9 A; 3OYM A; 5KCH A; 3MPU B; 1BI3 A; 4M75 F; 1WIE A; 2DL3 A; 3CC7 Q; 1UGS B; 2NLU A; 2RO0 A; 4DQ2 A; 1Q86 C; 1QVG S; 2QDY B; 1PRL C; 2FZG B; 1QCF A; 3I55 T; 2HSP A; 2RMO A; 1M2V A; 4KUL A; 1ZA1 B; 3M56 A; 2QQA A; 1XJW B; 2OX7 A; 2NUT B; 4IUQ A; 3RER A; 4M7A A; 1TOV A; 4M78 E; 3NHN A; 1UJY A; 4RKU E; 3QG1 A; 3MEW A; 3CCS A; 4IIM A; 4JPB W; 3X20 B; 2HD0 A; 4QQG A; 1ZLM A; 2KYM A; 2ZCF B; 1YCY A; 2PU9 B; 1NLP C; 2K4Y A; 2CSI A; 4BI4 A; 2KRO A; 1T0J A; 2YRC A; 5DLO A; 3OA6 A; 3EHR A; 4AT1 B; 3EGX B; 1JEG A; 1B34 B; 4HVU A; 2ECZ A; 2DIL A; 5IHN A; 5FRO A; 5KE2 A; 1H92 A; 4QVD A; 2OAW A; 1Y07 A; 1WHL A; 2ESW A; 1AVZ C; 1YHQ Q; 1WJR A; 4Z88 A; 3ME9 A; 1FX7 A; 2JMA A; 3M55 A; 2CZ1 B; 1MNE A; 3JCM b; 1NJI U; 1W2B S; 3RDV A; 2ZAE A; 8ATC B; 1I81 A; 1K4U S; 1QWF A; 2EYY A; 1R0C B; 5I2M A; 4KH0 B; 1C6V X; 1KHI A; 1QQJ A; 4AFQ C; 2RHU A; 3EFO B; 4R55 A; 2JM8 A; 1ZHI A; 2EKH A; 3QBY A; 1DJ7 B; 2EIF A; 3X28 B; 5D6Y A; 2FEI A; 1VQO Q; 3FJ5 A; 4C5G A; 1JB0 E; 4C0D C; 3LLR A; 1JO8 A; 1VQP A; 5I2S A; 3CPW P; 5LJ3 h; 5CQX A; 4N4G A; 1MGQ A; 1KQ1 A; 1QP2 A; 3M0U A; 2VWF A; 4PJO G; 3EG9 A; 1SHF A; 2DIG A; 1PC0 A; 2KMT A; 4DEX A; 1LPL A; 2QA4 A; 2I2L A; 3Q1J A; 4C8Q D; 2V1Q A; 1VQ7 T; 1OPK A; 5GAO q; 3JSC A; 2HL5 C; 2ROL A; 1Z9Q A; 2RI5 A; 1YIJ A; 2XDP A; 2RPN A; 3J80 E; 4NL3 A; 2EWN A; 4MMK A; 2A0F B; 3CCQ A; 1I0C A; 2W0Z A; 2DL8 A; 2JXB A; 3DLM A; 4BE0 A; 3EH1 A; 2X4Y A; 4GBQ A; 4GY5 A; 1EZZ B; 1VYU A; 1JBM A; 4FU6 A; 1BB9 A; 3L2V A; 2KK4 A; 4JRP A; 4LD6 A; 1VQ8 Q; 3WVD B; 1YJ9 Q; 1Q81 U; 4NL2 A; 4RMO A; 2RD1 A; 4ELY C; 1VQK A; 2LRQ A; 4M78 F; 2K5F A; 2MWP A; 2D8J A; 3JCM P; 5A0D A; 1PNJ A; 3OYJ A; 1Q81 C; 4M7D E; 5A2Q E; 1IB8 A; 1S72 A; 2G6F X; 2D1X A; 4C92 D; 1X01 A; 5HK3 A; 1AZG B; 3TSZ A; 2DZC A; 3NTK A; 1IHV A; 2YUP A; 4KGV B; 5CIU A; 4BDY A; 1YI2 A; 2KT8 A; 4M75 A; 2K2M A; 1RAG B; 4OMO A; 4AMC A; 4X9D A; 5GAN j; 4FT2 A; 1D3B B; 1NBE B; 7AT1 B; 1BI2 A; 3FLG A; 5KYW A; 1WQW A; 3ZBD A; 2L3Q A; 1OU8 A; 1RAF B; 1PSF A; 4L5G A; 3OBW A; 3EAE A; 1KC8 U; 4F17 A; 1O9S A; 3OYC A; 1ARK A; 2RK2 A; 1MHN A; 2XKO C; 5IN1 A; 2X3X D; 2R5A A; 3QJ6 A; 2KBT A; 4F7U A; 3MO8 A; 1AWX A; 4OF1 A; 4DBQ A; 2DRM A; 3ER0 A; 1QWE A; 2MF2 A; 2QGG A; 3SHW A; 4EIK A; 1SSF A; 2ZGW A; 4CC7 A; 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