The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
VEAIVEFDYQAQHDDELTISVGEIITNIRKEDGGWWEGQINGRRGLFPDNFVREIK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cbl Promotes Clustering of Endocytic Adaptor Proteins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| molecule keywords |
SH3-DOMAIN KINASE BINDING PROTEIN 1
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| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3JV3 A; 1N5Z A; 4GBQ A; 2IIM A; 1I07 A; 2DRK A; 1W6X A; 3GBQ A; 1M3B A; 1UGV A; 2GBQ A; 1EFN A; 2ED1 A; 2DLP A; 1JXO A; 4OML A; 4CC7 A; 2J06 A; 1QWF A; 2O31 A; 4GLM A; 2L3S A; 4Z89 A; 4EIK A; 1E7O A; 2DX1 A; 3M0R A; 4JJC A; 1JXM A; 2HBW A; 5I22 A; 3A98 A; 2KBT A; 1AVZ C; 2PNI A; 3LH5 A; 4D8K A; 2RMO A; 4OMN A; 1T0J A; 3M0T A; 2CT4 A; 3ULR B; 2CSQ A; 1M3A A; 1W70 A; 2KRS A; 2D0N A; 2LP5 A; 2V1R A; 2C0T A; 1BK2 A; 1NG2 A; 2RQW A; 2JS2 A; 3EHR A; 1G83 A; 1YNZ A; 4Z8A A; 2AKK A; 2LZ6 B; 4J9E A; 4AG2 C; 4F16 A; 1JU5 C; 1OEB A; 4F17 A; 4RTW A; 2NUZ A; 4JJB A; 1UHC A; 1GFC A; 3EGU A; 2DYB A; 1FMK A; 1I0C A; 4J9C A; 2YDL A; 1JO8 A; 5L23 A; 4KRT A; 4JJD A; 2W10 A; 2KRO A; 5IXF A; 3VRY A; 2VWF A; 3EHQ A; 2BZY A; 2J6F A; 1U3O A; 1NYF A; 2KT1 A; 1E6G A; 3VS4 A; 4AFU C; 3KFV A; 1JQQ A; 2L2P A; 2CUB A; 5I11 A; 1JEG A; 3PE0 A; 1RI9 A; 2KXC A; 1U06 A; 4JZ4 A; 3RNJ A; 5FW9 A; 2X3X D; 5GJV B; 2X3W D; 1PWT A; 1WDX A; 1NLP C; 1YWP A; 2EGA A; 1OPK A; 2K6D A; 2FPD A; 3RBB B; 2MIO A; 1HJD A; 1SSH A; 2HEQ A; 4HVW A; 5EC7 A; 2KYB A; 2KRM A; 3SHW A; 1SEM A; 4OMQ A; 1TUD A; 1H8K A; 2FEI A; 2M51 A; 2KE9 A; 3IQL A; 1WYX A; 2FPE A; 2DA9 A; 2KYM A; 1NM7 A; 2KR3 A; 2JT4 A; 1UJY A; 3H41 A; 4AG1 C; 1SRM A; 2LMJ A; 5IHK A; 2PTK A; 2MCN A; 2GNC A; 1NEG A; 2DJQ A; 1K0S A; 2LJ0 A; 4RTY A; 2CSI A; 4J9H A; 1AOJ A; 1U5S A; 2D8J A; 3VS3 A; 2EKH A; 1FYN A; 3SEM A; 4IIM A; 2K7A A; 1W1F A; 2EBP A; 2F2X A; 2FO0 A; 2JW4 A; 2C0I A; 2XMF A; 4LUD A; 1Z9Q A; 3CQT A; 4DEY A; 2CT3 A; 3QWX X; 2RF0 A; 2RQT A; 2K9G A; 1WLP B; 1ZX6 A; 1TUC A; 1WIE A; 1NEB A; 1BBZ A; 3UF4 A; 1VA7 A; 2KGT A; 3FJ5 A; 4DEX A; 2O2O A; 1T0H A; 1WX6 A; 1X2K A; 2CH4 A; 3NPF A; 2J6K A; 2JTE A; 4IIO A; 2A36 A; 1SHG A; 2J05 A; 3NHN A; 2G6F X; 2D1X A; 2FG0 A; 1GRI A; 2O9S A; 1UEC A; 3I5R A; 2HCK A; 2RNA A; 1GBQ A; 4LNP A; 1H3H A; 1QLY A; 4J9F A; 1MUZ A; 1G2B A; 3VS0 A; 1QCF A; 2BTT A; 2LQW A; 2OI3 A; 2C0O A; 2L3Q A; 2LJ1 A; 1AZG B; 2CH4 W; 1KIK A; 1UG1 A; 4CC4 B; 1KSW A; 5IHI A; 2K3B A; 4J9G A; 2FRW A; 1UFF A; 1PNJ A; 1SPK A; 2DMO A; 2EYW A; 3QWY A; 1OPL A; 3EG0 A; 2DE0 X; 1S1N A; 2EQI A; 4RTZ A; 4JZ3 A; 2YUO A; 2KRN A; 4CC3 A; 2A37 A; 1CKB A; 2LNH B; 2ROL A; 4QT7 A; 2JS0 A; 4HXJ A; 2V1Q A; 2W0Z A; 4CC2 A; 1TG0 A; 5ECA A; 2JMC A; 2ABL A; 2RQR A; 2SEM A; 4FSS A; 3TSZ A; 2PZ1 A; 1WXB A; 2CUD A; 1M3C A; 1SRL A; 2LQN A; 3H0F A; 1GCQ C; 2SRC A; 2JXB A; 3PVL A; 1YWO A; 4LN2 A; 2O88 A; 3H0I A; 1M27 C; 2DF6 A; 3PVQ A; 2L3P A; 4LUE A; 3M0U A; 1X43 A; 3VS5 A; 2JMA A; 2OJ2 A; 2GTO A; 1X27 A; 3UA6 A; 1UE9 A; 1PHT A; 1MV3 A; 2I0N A; 2A28 A; 1PRL C; 2FRY A; 4R0K A; 1K4U S; 5GJW B; 1X2Q A; 4Z88 A; 3I9Q A; 1HSQ A; 2K2M A; 2DBK A; 4RTX A; 1X6B A; 1X69 A; 2RQV A; 2DL7 A; 4HVU A; 4Y92 A; 2CRE A; 1WXT A; 4ORZ A; 4AFS C; 1RUW A; 1YP5 A; 2EYZ A; 2NWM A; 1ZUU A; 1QWE A; 1RLQ C; 1IO6 A; 2DNU A; 4K11 A; 2K79 A; 2A08 A; 4J9D A; 2LJ3 A; 1AEY A; 2AZV A; 2GTJ A; 1ZLM A; 2QDL A; 1E6H A; 2H8H A; 1QKX A; 2VVK A; 1M8M A; 1B07 A; 2VKN A; 1OOT A; 2DIL A; 3NMZ C; 4ESR A; 1ARK A; 1H92 A; 4LE9 A; 3THK A; 1CSK A; 2LX7 A; 4RTV A; 3O5Z A; 1UHF A; 2P4R A; 4A63 B; 1YN8 A; 1ZUY A; 2GQI A; 1I1J A; 1KJW A; 1WFW A; 3TSW A; 4HVV A; 1Y0M A; 4OMP A; 1PRM C; 1HD3 A; 1M30 A; 2FPF A; 3REB B; 2YUQ A; 4D8D A; 2J7I A; 3U23 A; 2KEA A; 2BZ8 A; 5IHN A; 1WA7 A; 1OV3 A; 5FWB A; 2KNB B; 2YSQ A; 2AKL A; 2DBM A; 2E5K A; 1ZBJ A; 2AZS A; 2L0A A; 2HDA A; 3UAT A; 3REA B; 1ZUK A; 1VYU A; 1RLP C; 4JPB W; 1T3L A; 2D8H A; 1CKA A; 1K76 A; 2DRM A; 2RQU A; 3M0Q A; 1VYT A; 1YCS B; 1AD5 A; 2YUP A; 1AWW A; 1GFD A; 3VS1 A; 2EYX A; 1NLO C; 3M0P A; 1ZSG A; 3NGP A; 4RTT A; 1B3Q A; 1K1Z A; 1K9A A; 3C0C A; 3VS6 A; 4E6R A; 3H0H A; 1LCK A; 2KXD A; 2O9V A; 2OAW A; 3TVT A; 2YT6 A; 1GCP A; 1J3T A; 2F2V A; 4AFZ C; 2ESW A; 3UA7 A; 3EG3 A; 1Y57 A; 4J9I A; 2RPN A; 3I35 A; 1VYV A; 2RN8 A; 2DL5 A; 1NYG A; 4RUG A; 4WCI A; 3VRZ A; 1ABQ A; 1SHF A; 2EPD A; 1PKT A; 2B86 A; 2J6O A; 2BZX A; 1UJ0 A; 1V1C A; 5IH2 A; 2JM8 A; 3EG1 A; 1MV0 B; 3M0S A; 1K0X A; 2DL8 A; 1ABO A; 1AZE A; 1GCQ A; 4RTU A; 2DL3 A; 2ROT A; 2MOX A; 3I5S A; 1UDL A; 5HCK A; 1WXU A; 4X1V A; 1Z9Z A; 3EG2 A; 2F2W A; 1BB9 A; 2ED0 A; 2GGR A; 2EGC A; 2AK5 A; 1AWO A; 2DM1 A; 2EW3 A; 1KFZ A; 4M4Z A; 1AWJ A; 4ZNX A; 2CDT A; 4F14 A; 2ENM A; 2EYY A; 2JM9 A; 2LCS A; 1BU1 A; 3R6N A; 1WI7 A; 5IXB A; 1PKS A; 2M0Y A; 5FWC A; 1UTI A; 1A0N B; 2YUN A; 4OMO A; 4HCK A; 1T3S A; 1GBR A; 4OMM A; 2KT8 A; 2HSP A; 1GL5 A; 2EGE A; 4J9B A; 2DVJ A; 2ECZ A; 3VS7 A; 1AWX A; 3VS2 A; 1X6G A; 4AFQ C; 2EVR A; 2DL4 A; 3ZL7 C; 1XOV A; 1UUE A; 1QKW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KI7 A; 4KUD K; 4R55 A; 2L5Q A; 3I55 T; 1VQ6 A; 2IIM A; 4IUU A; 1I07 A; 1ZBX A; 1W6X A; 2GBQ A; 2ED1 A; 5GAN d; 2O31 A; 4NL3 A; 5LJ3 d; 4EIK A; 5KCH A; 2YXY A; 4C0D C; 2X4Y A; 5I22 A; 3LH5 A; 4PFP A; 3ZEH A; 1Q82 U; 3M0T A; 3CME A; 1JB0 E; 1LNX A; 4C8Q G; 5GAN 7; 1B34 B; 2RO0 A; 3NTI A; 2KRS A; 2D0N A; 5LJ3 e; 1ZSZ C; 4M77 G; 1BK2 A; 2WSF E; 5KE2 A; 1ZA2 B; 3JCM h; 2QYZ A; 4ELZ C; 4C0Z A; 3KUF A; 1VQ7 T; 2VC8 A; 2LZ6 B; 4XTU A; 4F16 A; 2Y4X A; 2PUK B; 3JCM P; 3EGU A; 3RR6 A; 2DYB A; 3GOX A; 1I0C A; 4J9C A; 1R0B G; 3C95 A; 4JJD A; 2W10 A; 2KRO A; 3VRY A; 1U3O A; 1NYF A; 1E6G A; 3M55 A; 2XDB A; 1JQQ A; 4PFO A; 2L2P A; 3PE0 A; 1VQ6 T; 1YCY A; 3CME T; 4OVA A; 2X3X D; 1U8R A; 4BD3 A; 2EGA A; 4E7S A; 1N27 A; 1X01 A; 5EC7 A; 2KYB A; 2JVV A; 2MWP A; 3CXC S; 2XK0 A; 2FEI A; 2KE9 A; 4OB0 B; 1WYX A; 1VQN Q; 1Y96 B; 2DA9 A; 1NM7 A; 1UJY A; 1BCM A; 2GNC A; 3R6O A; 4PL6 A; 4LDY A; 1K0S A; 4O6J A; 2E65 A; 3BDL A; 1LJO A; 4J9H A; 1AOJ A; 1U5S A; 3SWN C; 2D8J A; 2RJD A; 5GAN j; 1WHJ A; 4F04 B; 3CQT A; 4DEY A; 2CT3 A; 2MI6 A; 4PJN A; 1M9S A; 1ZX6 A; 5GAO q; 1WIE A; 4XTX A; 2LNV A; 1RAC B; 3FJ5 A; 4M75 E; 3OMG A; 2NLU A; 2OTJ A; 2IG0 A; 2CH4 A; 3NPF A; 2J6K A; 1I8F A; 2RHY A; 4IIO A; 2G6F X; 2QGF B; 3CCM A; 4RMO A; 1UEC A; 2F1L A; 1KQS S; 1N6A A; 2DFU A; 1Y71 A; 2QXF A; 1QVG S; 5LJ5 j; 4FT4 A; 1G2B A; 4NS5 A; 4A54 A; 3VS0 A; 1VQ4 A; 3T9N A; 4M7A A; 2LJ1 A; 3PGG A; 1RL2 A; 1VQM A; 5CAI A; 2FZG B; 1UG1 A; 3EGD A; 4XTW A; 3HFN A; 2FRW A; 1UFF A; 4J7F A; 3I56 T; 1OPL A; 2DE0 X; 4II1 A; 1S1N A; 2K3X A; 4C8Q F; 4C92 G; 3A8G B; 3PMI A; 3FLG A; 4JS5 A; 4ELY C; 4QT7 A; 2JS0 A; 4HXJ A; 2W0Z A; 2O4X A; 3DKM A; 5ECA A; 4ANJ A; 2ABL A; 2PVO B; 1W2B S; 2PZ1 A; 1WXB A; 3BDU A; 1WNL A; 1SRL A; 5FU6 C; 4WF2 A; 1V29 B; 2XDP A; 1GCQ C; 2SRC A; 3CCE A; 2R5M A; 2JXB A; 5IT9 E; 1YIJ T; 2F5T X; 2CKK A; 1M8V A; 1NPR A; 1WZO A; 2DF6 A; 1VQL Q; 3CCJ T; 1VQ8 Q; 4JS4 A; 4C92 C; 1UGP B; 3INZ A; 2JMA A; 2GTO A; 3TU4 K; 1ACM B; 4PLL A; 4YTL A; 4LDU A; 4X9C A; 1M1K U; 1MV3 A; 2DXB A; 2A28 A; 3JB9 F; 8AT1 B; 4PKC C; 2DBK A; 3RMS A; 2HQE A; 1KD1 R; 3GLX A; 1X6B A; 1X69 A; 3CCS A; 5AYF A; 1KC8 U; 2RQV A; 2C06 A; 3RKX A; 5GAM g; 2DTH A; 4DA4 A; 2CRE A; 2OTJ Q; 1B34 A; 1WQ7 A; 2JTM A; 4ORZ A; 3KXT A; 3G71 T; 1N9R A; 3DB4 A; 1QVF P; 3JB9 D; 2EYZ A; 1RLQ C; 3GF5 A; 3V8K A; 4K11 A; 2K79 A; 4J9D A; 2CGH A; 3O8V A; 2MPX C; 2QQ9 A; 2GTJ A; 2CZ1 B; 1D1B A; 1E6H A; 2QG9 B; 3EFO A; 4KH1 B; 1M8M A; 4M75 A; 1OI1 A; 3E9G A; 2HZY A; 2VYT A; 1OOT A; 3M56 A; 2HKQ B; 4ESR A; 1RI0 A; 5DLQ E; 4LE9 A; 1VQL T; 4GLK A; 3M53 A; 2HL3 A; 4J7I A; 1H3Z A; 3FEO A; 1UHF A; 2FVU A; 2V8J A; 3G4S Q; 2F5K A; 1YIJ Q; 1P92 A; 4XU0 A; 4Y91 A; 1I1J A; 3C94 A; 1QVF A; 1TOV A; 1WFW A; 3RUX A; 4C8Q B; 4MDW A; 4OMP A; 4DQ2 A; 1HD3 A; 3CBO A; 3QUI A; 1TTH B; 4HT8 A; 2PVG B; 3U23 A; 1AHJ B; 1U1S A; 3FJP A; 3JB9 I; 4PJO C; 3OYA A; 2KNB B; 2YSQ A; 3RKW A; 2GFA A; 2YRD A; 3M57 A; 2DD4 A; 1ZBJ A; 3SDZ A; 3CCR Q; 4VUB A; 2L0A A; 4C92 D; 1ZUK A; 1VYU A; 2VUB A; 1KG1 A; 3LGF A; 1CKA A; 1K76 A; 2DRM A; 3QJY A; 2RHX A; 4A4K A; 5I21 A; 1BCO A; 2RHU A; 2YWW A; 1K73 U; 1YJW T; 2QAS A; 3G7Z A; 3HP9 A; 5DLO A; 3L2U A; 2DK3 A; 3CEY A; 3OBY A; 1K73 C; 1QP3 A; 2H3J A; 4C92 A; 2QTV A; 4L5G A; 3H0H A; 3UDC A; 2AHJ B; 2DYI A; 3OW2 A; 2NUT A; 3X20 B; 1R77 A; 4M75 B; 1VQM Q; 2E1H A; 3JSC A; 3OYH A; 1PC0 A; 2BKD N; 9ATC B; 3EAE A; 4QVD A; 3EG9 B; 3CCU T; 1QVF S; 1NYG A; 4BDY A; 1IRE B; 3VRZ A; 1ABQ A; 2KSS A; 3CD6 Q; 4PJO G; 4ZN3 A; 4M7D G; 5IH2 A; 2KAF A; 3V8L A; 2RHZ A; 1BI1 A; 1K0X A; 5GAN 4; 1AZE A; 2ZPE B; 3GNF B; 2F69 A; 4M75 F; 4JRP A; 4RTU A; 1FWZ A; 2MOX A; 2VXE A; 4F7U E; 2XID A; 4E7Z A; 2CP2 A; 5HCK A; 1WXU A; 4X1V A; 3E2U A; 5KYU B; 4DBR A; 8ATC B; 2RJE A; 2E64 A; 3CC7 T; 2EFI A; 3CC2 A; 1Q82 C; 2DD5 A; 4OF1 A; 2EKO A; 4ME7 A; 2LCL A; 2COW A; 4IUQ A; 2OX7 A; 3CPW A; 2X35 A; 1BU1 A; 5FU7 C; 2QA4 T; 5FWC A; 2CP3 A; 2YUN A; 2X4J A; 5LL6 S; 4HCK A; 1T3S A; 4TVR A; 3S3M A; 1G3Y A; 2XI9 A; 1GL5 A; 4OGE A; 2WAC A; 5FRO A; 1W2B P; 3PIO A; 2ECZ A; 4XU1 A; 3VS2 A; 4AMC A; 3ZL7 C; 5KYN A; 1QKW A; 3CCS Q; 2COZ A; 4GBQ A; 4BB7 A; 5LJ5 f; 4NOY A; 4BI4 A; 3NTK A; 4C8Q D; 3QO3 A; 3CCL Q; 1M3B A; 4B9W A; 1EFN A; 2V26 A; 2DLP A; 4OML A; 4CC7 A; 4F7U B; 5HKC A; 2J06 A; 5GAM f; 1S72 Q; 2ZPH B; 3E19 A; 4Z89 A; 5GMK m; 3QSU A; 1UGQ B; 2PUO B; 2DXT A; 2DEU A; 3A98 A; 4C5E A; 3CCE Q; 5LJ3 j; 2PNI A; 5I2S A; 4E7K A; 1XNI A; 1VQL A; 3QKJ A; 2H3E B; 1M90 R; 1GXI E; 5CKD A; 2V1R A; 2RQW A; 1NG2 A; 2JS2 A; 1PSE A; 4HCZ A; 1YNZ A; 4HT9 A; 4Z8A A; 2HBP A; 4J9E A; 4AG2 C; 3I56 A; 3EFO B; 2XDD A; 1JU5 C; 5C6S A; 3OS2 A; 1UHC A; 3P8B B; 3L1A A; 1FMK A; 4FU6 A; 1WHK A; 1JO8 A; 5L23 A; 4ZGJ B; 5IXF A; 2BIV A; 3I55 Q; 2GQV A; 2VWF A; 2BZY A; 2LTO A; 1KQS A; 4M7D D; 1VIE A; 3VS4 A; 1W4S A; 3KFV A; 2CP7 A; 3HPW A; 3F70 A; 5KYW A; 1JEG A; 1OX9 A; 2JJ9 A; 5KCO A; 4JZ4 A; 3PT9 A; 5GJV B; 3QZ5 B; 1PWT A; 1WDX A; 1NLP C; 1OPK A; 4Q5W A; 2FPD A; 2MAM A; 1QCO A; 3L2Z A; 2Z0W A; 2DTI A; 4PJO F; 4OMQ A; 1S72 A; 2RI2 A; 1TUD A; 1H8K A; 2CP0 A; 2KYM A; 1NZ9 A; 2QDY B; 2DXC A; 4RCC A; 2DET A; 2A7Y A; 3SFM A; 1YHQ A; 2HNI A; 2DJQ A; 1V76 A; 5LJ3 h; 2LJ0 A; 3QPH A; 1KK7 A; 3GIB A; 2QQA A; 1H64 1; 4KGX B; 3VS3 A; 4N0A C; 4M78 G; 5GAO m; 2NUP A; 3EFS A; 1W1F A; 2EBP A; 2FO0 A; 2JW4 A; 4HCC A; 3E9F A; 2RF0 A; 4BI8 B; 2K9G A; 4M78 C; 1WLP B; 3JCM J; 4UC4 A; 4XTY A; 3JAM E; 1OUL A; 4EPC A; 4BI3 A; 4QQG A; 3CCJ A; 1VA7 A; 5GAO p; 3MEA A; 1DJ7 B; 4JRQ A; 2E10 A; 1VQN A; 3JCM d; 4BE2 A; 3NHN A; 1SHG A; 2CZ0 B; 2D1X A; 3OYE A; 4BE1 A; 2FG0 A; 1S72 T; 1GRI A; 5HY6 A; 3I5R A; 2RNA A; 1GBQ A; 4QKU A; 4KGZ B; 3Q1J A; 3H8Z A; 2QQR A; 3CCL T; 2PQW A; 3CD6 A; 4KUI A; 3QBY A; 5LJ5 h; 3EGX A; 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