The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
VEAIVEFDYQAQHDDELTISVGEIITNIRKEDGGWWEGQINGRRGLFPDNFVREIK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Cbl Promotes Clustering of Endocytic Adaptor Proteins
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH3-DOMAIN KINASE BINDING PROTEIN 1
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O9S A; 4DEY A; 1UEC A; 5FWB A; 2EVR A; 1BB9 A; 2L2P A; 2ED0 A; 4JZ4 A; 2DL3 A; 1JO8 A; 3SEM A; 1JQQ A; 1UHF A; 1K0X A; 2KYM A; 4HVV A; 2CH4 W; 2IIM A; 4OMQ A; 3VS1 A; 2LJ3 A; 2W0Z A; 1AD5 A; 1ABO A; 3FJ5 A; 1SRL A; 1GCP A; 2FO0 A; 1QKX A; 3VS3 A; 2J7I A; 3VRZ A; 3VS4 A; 4JJB A; 2A28 A; 2DE0 X; 2K3B A; 4J9B A; 2KXC A; 2K79 A; 1M3A A; 4OMM A; 1NEB A; 1EFN A; 1PKT A; 2ROT A; 2LNH B; 2GQI A; 4IIO A; 4AFQ C; 2PZ1 A; 1X6G A; 1ARK A; 3NPF A; 2K2M A; 1OV3 A; 2LZ6 B; 2O88 A; 1ZX6 A; 2ESW A; 1PWT A; 2DF6 A; 4RTT A; 1WLP B; 2CUD A; 1BK2 A; 1HJD A; 1GRI A; 2H8H A; 1NEG A; 4HXJ A; 1MV3 A; 3R6N A; 1SHF A; 2FPD A; 2M51 A; 2J05 A; 5L23 A; 2AZS A; 3I5R A; 3IQL A; 1M8M A; 4HVU A; 1PNJ A; 1TUD A; 1VYU A; 4JPB W; 4RTV A; 3VS5 A; 1JU5 C; 4Z8A A; 2RPN A; 1U3O A; 1OOT A; 2RQW A; 4RUG A; 2EBP A; 1QWF A; 2L3S A; 1M3C A; 1AWJ A; 1I1J A; 1OPK A; 2DRM A; 2O9V A; 2XMF A; 4J9I A; 3M0R A; 4AG2 C; 1T3L A; 1SRM A; 4D8K A; 1M3B A; 1PKS A; 2KR3 A; 1UUE A; 2J6O A; 1E7O A; 2NWM A; 2O31 A; 2LQN A; 2L3P A; 5I22 A; 3QWY A; 2KYB A; 1RI9 A; 1T0H A; 2JS2 A; 2DM1 A; 1ZUU A; 4GBQ A; 1X27 A; 2RN8 A; 1N5Z A; 1X2K A; 3EG1 A; 1ABQ A; 2M0Y A; 2KRS A; 2D8J A; 3H0F A; 4F17 A; 1BBZ A; 1G83 A; 2V1R A; 1GCQ C; 1NM7 A; 4OML A; 4JZ3 A; 1Z9Z A; 2JM8 A; 2KNB B; 4KRT A; 2W10 A; 2AKL A; 2DRK A; 4HCK A; 2RNA A; 3PVL A; 1UE9 A; 2G6F X; 2K9G A; 1WFW A; 5FWC A; 2EQI A; 2EGA A; 1AWO A; 2QDL A; 4RTY A; 4QT7 A; 2MCN A; 1GBR A; 1T0J A; 2VWF A; 4EIK A; 2BZ8 A; 1RLQ C; 1W70 A; 1VYV A; 1E6H A; 1I0C A; 2J6K A; 2KRN A; 2L3Q A; 3TVT A; 1NLO C; 2F2V A; 3ZL7 C; 1X69 A; 4J9F A; 2DBK A; 2ED1 A; 2FPE A; 4ORZ A; 2CRE A; 3U23 A; 2A36 A; 4Z88 A; 3PVQ A; 4WCI A; 1A0N B; 1SHG A; 2EKH A; 1ZLM A; 3NGP A; 4OMO A; 2EYZ A; 4OMN A; 1UDL A; 3EHQ A; 1I07 A; 2E5K A; 4RTX A; 2KT8 A; 2BZX A; 2ECZ A; 3GBQ A; 2EW3 A; 1QWE A; 2KT1 A; 4LE9 A; 3TSZ A; 2D8H A; 1AWW A; 2EPD A; 5IXF A; 1AEY A; 4JJC A; 2RQV A; 4E6R A; 1AZG B; 2VKN A; 1CKA A; 2RQT A; 1CSK A; 1SSH A; 1FMK A; 2LQW A; 5HCK A; 1XOV A; 2DBM A; 4Y92 A; 3RNJ A; 4A63 B; 3I9Q A; 3NMZ C; 2K7A A; 4JJD A; 1JXM A; 4AFU C; 4CC7 A; 4F14 A; 4HVW A; 3UAT A; 2AK5 A; 2OAW A; 1U06 A; 1TG0 A; 1IO6 A; 3EGU A; 2L0A A; 3LH5 A; 1UHC A; 2X3W D; 3KFV A; 3EG3 A; 1QKW A; 1ZUK A; 1MV0 B; 1Z9Q A; 4RTZ A; 4DEX A; 1UGV A; 1X2Q A; 3SHW A; 2LP5 A; 1KSW A; 2PNI A; 1GCQ A; 1YNZ A; 2EGC A; 2FEI A; 1TUC A; 3M0U A; 1NYG A; 2EYW A; 1NYF A; 5FW9 A; 2DMO A; 1YWP A; 1G2B A; 3CQT A; 4LN2 A; 2HDA A; 3EG2 A; 4R0K A; 3A98 A; 1RUW A; 1ZBJ A; 2LX7 A; 4AG1 C; 2BTT A; 2P4R A; 3VRY A; 1S1N A; 1W1F A; 1GFD A; 2EYY A; 4J9G A; 2K6D A; 2B86 A; 3NHN A; 1E6G A; 1YP5 A; 1RLP C; 5EC7 A; 4M4Z A; 2LMJ A; 2DL7 A; 1UFF A; 4D8D A; 2LJ1 A; 1H92 A; 2EGE A; 2YUO A; 2OJ2 A; 1AOJ A; 4CC3 A; 2RF0 A; 4OMP A; 2AKK A; 1V1C A; 1K0S A; 4X1V A; 3M0S A; 2LCS A; 3REB B; 1LCK A; 2CSQ A; 1UJY A; 3VS6 A; 2HSP A; 2LJ0 A; 2F2X A; 1OPL A; 5GJW B; 2I0N A; 2O2O A; 1OEB A; 2DVJ A; 1K4U S; 2DJQ A; 1FYN A; 2JS0 A; 1WX6 A; 3EG0 A; 1KIK A; 3C0C A; 2GGR A; 2EYX A; 1B07 A; 2PTK A; 4AFZ C; 2YT6 A; 3M0P A; 2DYB A; 2CT3 A; 2CDT A; 2DX1 A; 1U5S A; 2JW4 A; 2DLP A; 2CSI A; 2HCK A; 2JXB A; 2FG0 A; 4J9E A; 2D1X A; 1B3Q A; 2CT4 A; 2KGT A; 2ENM A; 4ZNX A; 3UF4 A; 2GTJ A; 1NG2 A; 3EHR A; 4ESR A; 3H0H A; 1UG1 A; 1AWX A; 1WDX A; 2YUQ A; 1SPK A; 3M0Q A; 2YSQ A; 2SEM A; 1WA7 A; 1UTI A; 1W6X A; 2HEQ A; 1J3T A; 3RBB B; 3PE0 A; 2OI3 A; 3TSW A; 1WXT A; 2J06 A; 2YDL A; 2SRC A; 2D0N A; 2AZV A; 1AVZ C; 1M30 A; 1YWO A; 3M0T A; 4LUD A; 5IHI A; 1MUZ A; 1PRL C; 3QWX X; 4RTU A; 2A37 A; 2KXD A; 3UA7 A; 4F16 A; 5IXB A; 2FRY A; 1BU1 A; 1ZUY A; 2V1Q A; 1K1Z A; 1QCF A; 2KBT A; 1UJ0 A; 2X3X D; 2JMA A; 1T3S A; 2HBW A; 4Z89 A; 1VYT A; 2RQR A; 2YUP A; 1PHT A; 2DIL A; 2JT4 A; 3THK A; 1NLP C; 2DL4 A; 1AZE A; 5ECA A; 2VVK A; 2MOX A; 2C0T A; 3O5Z A; 5GJV B; 1M27 C; 2FPF A; 3JV3 A; 2GTO A; 1WXU A; 1Y0M A; 2GNC A; 1X6B A; 1GBQ A; 2KRM A; 2NUZ A; 4CC2 A; 2CH4 A; 4J9C A; 1ZSG A; 2FRW A; 2JTE A; 2MIO A; 2RQU A; 2BZY A; 1H8K A; 2KE9 A; 1K9A A; 4LUE A; 5IHN A; 1Y57 A; 1WYX A; 3UA6 A; 3REA B; 2KRO A; 1GFC A; 2ROL A; 1HSQ A; 1KFZ A; 2GBQ A; 4GLM A; 2DA9 A; 1K76 A; 5I11 A; 4J9D A; 2C0O A; 2J6F A; 5IH2 A; 5IHK A; 3VS0 A; 1JEG A; 2CUB A; 1WIE A; 1VA7 A; 2ABL A; 2KEA A; 2YUN A; 2JMC A; 1PRM C; 4RTW A; 3H41 A; 1YCS B; 3I35 A; 4J9H A; 1CKB A; 1HD3 A; 3H0I A; 2F2W A; 1WI7 A; 4IIM A; 1WXB A; 2A08 A; 3I5S A; 2DNU A; 2DL8 A; 4K11 A; 1SEM A; 1KJW A; 4CC4 B; 1JXO A; 1H3H A; 4LNP A; 1X43 A; 2C0I A; 3ULR B; 4AFS C; 2JM9 A; 4FSS A; 3VS7 A; 1YN8 A; 1QLY A; 2RMO A; 3VS2 A; 2DL5 A; 1GL5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2R58 A; 3FDR A; 2X4X A; 2XDD A; 5GAN 2; 1BB9 A; 4ZN3 A; 1M90 C; 2ED0 A; 4OB1 B; 5CKD A; 1M8V A; 3H6Z A; 3G4S T; 1K0X A; 3MP8 A; 1VQL A; 2HAX A; 4A4H A; 3MPU B; 2Y90 A; 1M1K U; 2JJ9 A; 1M1F A; 5HK3 A; 4TVR A; 1KG1 A; 1RAE B; 1SRL A; 1GCP A; 3CCE Q; 3BY7 A; 2NUP A; 4M78 E; 1QVF P; 2DXC A; 1TXQ A; 2FZG B; 2DTO A; 2XD0 A; 2ZGW A; 2QYZ A; 3HL8 A; 1VQO Q; 1M3A A; 2F69 A; 1TOV A; 2IG0 A; 4D6W A; 5GAO r; 1DJ7 B; 2LNH B; 1VQ8 T; 2MPX C; 3F70 A; 1QVF S; 4FCY A; 1ARK A; 2FHD A; 4XQ3 A; 2LZ6 B; 1ZX6 A; 2P0P A; 2CUD A; 4E7S A; 1HJD A; 1JRI A; 4HXJ A; 4C8Q C; 1V29 B; 1SHF A; 2M51 A; 3IQL A; 4HVU A; 3V7R A; 4B9W A; 3HKS A; 1M2V A; 4RUG A; 1QWF A; 5D7U A; 1M3C A; 1ZSZ B; 1OPK A; 2FVU A; 2DRM A; 2XMF A; 3OY9 A; 4E7J A; 3M0R A; 3ZBD A; 1VQ9 T; 4IUP A; 3JCM Q; 4XTW A; 3MO8 A; 1IHW A; 2DJZ A; 1M4Z A; 1QMC A; 1QVG P; 5FRM A; 1YJ9 A; 2DM1 A; 1KHC A; 1ZUU A; 1WHM A; 3I55 Q; 3OSV A; 3EG1 A; 3SWN B; 5GAN 8; 1B34 A; 1QW1 A; 1VQ4 A; 1FMV A; 2KRS A; 1G5V A; 2GFA A; 2FZK B; 1NM7 A; 2KY9 A; 2LT4 A; 2QI2 A; 3VU3 C; 4M78 A; 3QZ9 B; 5A2Q E; 4HCK A; 2RNA A; 3M57 A; 1YJN Q; 2G6F X; 3RMQ A; 4N0A C; 1WFW A; 5FWC A; 4C8Q G; 1X6O A; 5GMK j; 3G1J A; 4RTY A; 1IRE B; 2MCN A; 4V2S A; 4O6J A; 2JUF A; 1NZ9 A; 3L2Z A; 2F2V A; 1X69 A; 4J9F A; 2ED1 A; 2VXF A; 3U23 A; 3CC2 A; 2DXU A; 3OBY A; 4NL2 A; 4Z02 A; 4EMK A; 2CZ1 B; 2JTF A; 3I56 T; 2EJF A; 3LH0 A; 1X01 A; 1ZLM A; 1YJW Q; 1N8R U; 3VYG A; 1UGQ B; 2DZ9 A; 3G6E A; 1Q7Y R; 4RTX A; 2BKD N; 4PJM A; 2KT8 A; 2M02 A; 3GBQ A; 2EW3 A; 4C92 E; 4JDS A; 1QWE A; 2KT1 A; 3TSZ A; 3CD6 Q; 5GAO p; 2EPD A; 1AEY A; 4OMF B; 4PFP A; 3V8L A; 1QVF A; 2FB7 A; 1VQP T; 4E7K A; 2FZC B; 2CYZ B; 5GAN f; 1QCO A; 1G3W A; 4C8Q F; 1YIT T; 3RNJ A; 2EWN A; 2OTJ Q; 4DOW A; 5KYX B; 3ER0 A; 4JJD A; 4BE1 A; 4F14 A; 1WHL A; 4NL3 A; 1MHN A; 3KUF A; 2VC8 A; 2LCL A; 2H3J A; 1UHC A; 5CCA A; 3EG3 A; 1QKW A; 5LJ5 f; 2HQH A; 1ZUK A; 1YI2 Q; 1UGV A; 2MMP A; 3RDV A; 1K8A R; 1Q82 U; 1KSW A; 2EYQ A; 1GCQ A; 4XU1 A; 2OTL A; 3A8H B; 2DK3 A; 1JB0 E; 3C12 A; 2FEI A; 1D0Z A; 2EYW A; 3JCM h; 1NJI R; 1NYF A; 1Q95 G; 3G4S Q; 5LJ3 j; 1VQK Q; 4LN2 A; 3EG2 A; 3C4S A; 1K9M R; 1XTD A; 3A98 A; 1W4S A; 3MJX A; 2HSE B; 1K73 C; 1GFD A; 4J9G A; 4HCZ A; 5KYU B; 4ZGJ B; 3QXE B; 1E6G A; 4X9C A; 1UGP B; 5DLQ E; 1OQK A; 2DL7 A; 3E1S A; 2EGE A; 2YUO A; 3EFO B; 2AKK A; 1K0S A; 4A4G A; 1MNE A; 1UJY A; 4M7A E; 3L2V A; 2HSP A; 2LJ0 A; 5GMK h; 1QVG A; 4Y28 E; 2I0N A; 1I81 A; 2P0K A; 3JB9 I; 2DJQ A; 3CCS Q; 4ELY C; 3QZ5 B; 4HA8 A; 3CMA A; 1OUL A; 2PTK A; 2RJF A; 4C92 A; 2DX1 A; 3OYC A; 3INZ A; 4HKE A; 4HCB A; 3OS0 A; 2LQK A; 3OYD A; 5FU7 C; 1BI2 A; 2K5I A; 3JCM b; 4PJO B; 3L2W A; 3QDF A; 3UF4 A; 3CPW P; 5GAN j; 4OF1 A; 1UG1 A; 4RCC A; 1SPK A; 2SEM A; 1WA7 A; 3JCM e; 1J3T A; 3RBB B; 3OYY A; 3EGD B; 3TSW A; 1W2B P; 1WHH A; 4XTV A; 3DLM A; 1M30 A; 5LJ5 j; 3CPW S; 3M0T A; 3MP6 A; 2RJE A; 1VQ7 T; 3QWX X; 4RTU A; 3S6W A; 3UA7 A; 2E65 A; 1BU1 A; 2KBT A; 1W2B S; 2P84 A; 3JCM g; 1T3S A; 2A7Y A; 2I2L A; 1PHT A; 1NLP C; 2KDS A; 2VVK A; 3A8M B; 1S72 A; 5GMK e; 3BDL A; 3O5Z A; 4E7H A; 4OGE A; 3GPL A; 3CCU A; 1Y0M A; 3OYH A; 4C0D B; 2GNC A; 3DB4 A; 3T9N A; 3CCE T; 2EJG A; 1TU0 B; 2MIO A; 3PNW C; 3V8K A; 2BZY A; 1Q81 R; 4M7A A; 3SDZ A; 1OYX A; 5GAM f; 1Y57 A; 2K5L A; 3RR6 A; 5KE2 A; 2ZZD A; 2LC4 A; 4Y91 A; 3UA6 A; 2DER A; 1VQO T; 3REA B; 2ROL A; 2JNG A; 2GBQ A; 4GLM A; 4OB3 B; 5CIU A; 4J9D A; 2C0O A; 2XK0 A; 1OU9 A; 2RJD A; 2A3L A; 6AT1 B; 4KGV B; 5IHK A; 3LWH A; 5L8R E; 3VS0 A; 1KQ1 A; 2VXE A; 2QQS A; 4A4E A; 3MP1 A; 3TEE A; 2DYI A; 1N8R C; 2QGG A; 3GLX A; 2A08 A; 1WNL A; 3I5S A; 4IUV A; 5FU6 C; 4LNP A; 1X43 A; 4C8Q B; 5KYU A; 2JM9 A; 1UGR B; 4II1 A; 1YIT Q; 1U1S A; 4F7U G; 4DEY A; 3CC7 A; 7AT1 B; 5GAN h; 4FL6 A; 2DL3 A; 2XIC A; 1JO8 A; 3SEM A; 3EFR A; 1VQN A; 1VQ6 A; 1KD1 R; 2KYM A; 3GF5 A; 3C95 A; 2BE9 B; 2QTX A; 4OMQ A; 5LJ3 e; 1ABO A; 3FJ5 A; 1PG5 B; 1O75 A; 1QP2 A; 5LJ5 h; 3I55 T; 1QKX A; 3BDU A; 2J7I A; 4JJB A; 2X35 A; 2QQ9 A; 3CCR Q; 5KCO A; 1HYO A; 2YRV A; 4J9B A; 3CPW A; 2E6Z A; 3CCQ A; 1Q82 C; 1KK7 A; 2NUT B; 4ZN1 A; 3QJY A; 1YJN T; 2ROT A; 3HRT A; 4C5H A; 5GAM j; 4IIO A; 4AFQ C; 2PZ1 A; 1W2B A; 1QCN A; 3GIB A; 2K2M A; 1OV3 A; 3L2U A; 2QA4 Q; 2PUK B; 2COZ A; 1PWT A; 2DF6 A; 4RTT A; 2RD1 A; 1MGQ A; 1O9S A; 4LDX A; 3V8J A; 2NLU A; 1NEG A; 4FIB A; 4M75 C; 1MV3 A; 3R6N A; 5L23 A; 2AZS A; 3I5R A; 4M77 C; 4JPB W; 1M8M A; 2O01 E; 4RTV A; 2MWO A; 1JU5 C; 4Z8A A; 4C5G A; 1QQJ A; 2RQW A; 3KBG A; 4PJO C; 3OYA A; 1AWJ A; 1VIE A; 1I1J A; 1M5Q 1; 2M9U A; 4J9I A; 1M3B A; 4OP0 A; 1PKS A; 5GAN e; 4ZTJ A; 2QQB A; 2J6O A; 4MZT A; 3UDC A; 1E7O A; 4HT9 A; 4J6Y A; 4JRI A; 3CD6 T; 3M56 A; 1NJI U; 2DIQ A; 2RK1 A; 3JCM d; 1RI9 A; 4JS4 A; 5LJ5 e; 2LDM A; 2F1L A; 4J6X A; 1Q86 U; 3TCJ A; 1VQ5 Q; 1T0H A; 2JS2 A; 5GAN g; 4M7D C; 2OTJ T; 4CRI A; 1VUB A; 2QEX Q; 3CCV A; 3TRE A; 4GBQ A; 2RN8 A; 1N5Z A; 1VQ4 T; 1YHQ A; 3M58 A; 2P4T A; 3H0F A; 2V1R A; 4OML A; 2E6N A; 2PVO B; 1R0C B; 3R6O A; 1YI2 T; 5LJ5 g; 5CR2 A; 5A0L A; 2W10 A; 1OU8 A; 2DRK A; 1R8O B; 1UE9 A; 2P0Q A; 2K9G A; 2EQI A; 5HKC A; 1EIF A; 4M75 G; 5KH6 A; 1K73 U; 2MYS A; 4M77 G; 2HL3 A; 2VWF A; 4EIK A; 1RLQ C; 2CGH A; 3OYJ A; 1YIJ Q; 1W70 A; 1AT1 B; 4PJO G; 5DLO A; 1E6H A; 2PQW A; 1WQ7 A; 1VQK T; 3TVT A; 2F5K A; 2OAU A; 3M9Q A; 2RHY A; 2RHX A; 2E12 A; 3CCJ Q; 1WGS A; 5D6W A; 1D1B A; 4ORZ A; 3CBP A; 1NPR A; 3PVQ A; 3PT9 A; 3JCM c; 1SHG A; 2RHZ A; 3CCL A; 1LNX A; 3JB9 J; 1WJR A; 2XU8 A; 2K5F A; 2BZX A; 3CC4 A; 2LT1 A; 3CCM Q; 1VQM A; 5GAM h; 1OX8 A; 3G71 Q; 4HCC A; 3S3O A; 3P8B B; 4LE9 A; 4PFZ A; 3CCS T; 4JJC A; 4J6W A; 1AZG B; 2VKN A; 1CKA A; 1CSK A; 2ZPI B; 1FMK A; 1M90 R; 3RUX A; 1B7T A; 1TUG B; 1XOV A; 4M75 F; 4A63 B; 3I9Q A; 8AT1 B; 2D9T A; 3NMZ C; 4M77 F; 4CC7 A; 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