2C0DA

Structure of the mitochondrial 2-cys peroxiredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
LVTKKAYNFTAQGLNKNNEIINVDLSSFIGQKYCCLLFYPLNYTFVCPTEIIEFNKHIKDFENKNVELLGISVDSVYSHLAWKNMPIEKGGIGNVEFTLVSDINKDISKNYNVLYDNSFALRGLFIIDKNGCVRHQTVNDLPIGRNVQEVLRTIDSIIHVDTSGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Biochemical Characterisation of a Mitochondrial Peroxiredoxin from Plasmodium Falciparum
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
total genus 54
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.7: Peroxidase.
pdb deposition date 2005-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0dA00
2YJ7A 3G7JA 9GSSA 2RIIA 2D2ZA 1TJDA 1TOFA 3BOAA 5ECIB 2K8VA 2VO4A 4TVEA 2E7PA 4PQ1A 1QMVA 3GUSA 2H74A 3GTUB 1XBSA 3VWUA 3UJ1A 3V1WA 6GSYA 5KN3A 3LG6A 3TJJA 4GSNA 3ERGA 5COHA 4FH8A 1DBYA 1MD3A 4Q5RA 2HXKA 2C4JA 3CRUA 3FR9A 5IMVA 3TKRA 3G7IA 2CZ2A 2E2GA 2OE1A 1XXUA 3UOMA 4JR6A 1K3LA 4L8EA 3UBLA 2IFQA 4ZL8A 3HVVA 1FVJA 1B4PA 2J9HA 4KGIA 1R5AA 4EL1A 2FWGA 1AIUA 1K0MA 5IO2A 1UA5A 1XOBA 4XS4B 3CRTA 1ON4A 3EVIA 1RK4A 5IMFA 20GSA 1GUMA 1HD2A 13GSA 1GTUA 3NOFA 1XWAA 2IMFA 2L59A 3ZZXA 1X9WB 4IS0A 2H19A 3DMLA 1V58A 2PU9C 2VL9A 4IP6A 3GTUA 4KCEA 1MEKA 2IIYA 4I5QA 2LEGA 3E0UA 1XW9A 4GTUA 3IA1A 3MSZA 2YWMA 2Z9SA 4GSTA 1WJKA 4TR3A 2CX4A 3WGDA 1PL2A 4PUAA 1VF3A 4CW9A 4XS4A 4F2IA 3KMNA 4IKHA 1O85A 3QFAC 4KUNA 4F9ZA 3DXBA 2NTOA 1E2YA 2N5BA 1BX9A 4OFMA 5B7CA 4IELA 1YDKA 4NHZA 2VD1A 2PBJA 2H0IA 1ZYEA 2WCIA 6GSWA 3CSHA 2PERA 2GZYA 4TW5A 1Q98A 1GP1A 1B4QA 5F06A 3QD9A 2DIZA 2EIQA 4L5OA 4L5LA 5FWGA 3ME7A 1SKRB 2VOCA 3RHCA 4XS6A 2B5EA 1X5DA 2P0GA 4YAPA 2M46A 4JR4A 2VL2C 4IBPA 1HNCA 4OFTA 2LUSA 2H6YA 2OJLA 4AJ6A 2LNTA 5JCUA 4EVMA 2V32A 2YZUA 19GSA 2YWIA 1IYHA 2IL3A 5AIXA 2O7KA 5CRHA 3GV1A 3ZIVA 5J9BA 3IC4A 2FD3A 5AISA 3QDNA 5LCZA 2I1UA 3TOUA 3RBTA 5A4UA 2YV9A 4YQMA 1A8LA 2GTUA 5DDLA 5B6NA 1SK2A 3RPPA 2LKUA 3IK9A 2JZTA 1DSBA 2I81A 4GQFA 1SU9A 2TRXA 5DJMA 1ERWA 4WETA 2H75A 3IXRA 3UEMA 2L6DA 1T7PB 3QAWA 4YH2A 1M0UA 3QFBC 1F3AA 2H1AA 2DSAA 2DJKA 4TRXA 2FUG2 1PD21 3FR6A 1XZOA 5DVBA 2CAQA 3VLNA 3SWLA 4O7HA 3DWVA 3W6GA 3US3A 5GAPD 2P31A 3DIEA 3GKNA 1K3YA 4TR1B 3GKKA 1SL1B 8GSSA 4OO4A 4K2DA 1ERUA 1V9WA 4BA7A 2HSHA 4TXVA 3C7MA 3HJPA 2QC7A 1XIYA 4MJEA 3ZL5A 1EEJA 4TXOB 4Z7XA 1TU7A 4HUAA 3CYNA 2NDOA 5DAKA 1ILOA 4F03A 1ZCPA 3HXSA 1PQNA 1BJXA 4TR4A 4DEJA 4E8HA 4WF4A 4HU7A 4KW6A 4G9HA 4ZB8A 1QK8A 4MJBA 5DQSA 4EDZA 2R5GA 1OKTA 5IOWA 1LU4A 3NZNA 2R4VA 2H0HA 2I3YA 4POKA 2GSSA 1EWXA 1PKZA 2HE3A 1SK0A 2AAWA 3GN3A 3UMAA 1XWCA 3EINA 3GH6A 3HHVA 4MPGA 4TR1A 3I43A 1SJZA 1B8XA 4KE3A 5L71A 3P90A 3LWAA 3LEFA 2CVBA 3HYPA 1URMA 5ECSA 4MP4A 1G6WA 1SYRA 1XW6A 3HZ4A 4BWSA 1SL0B 2FWEA 4NMUA 2DIYA 1GSEA 3GRXA 4BWQA 1BG5A 1SENA 5ECHB 1EV9A 3L9SA 3HVSA 1NHYA 3BCIA 1OYJA 3KCMA 1OE7A 1YJ6A 4I97A 2YZHA 3GX8A 3H1NA 4HJ2A 2OBKA 4X1UA 3EWLA 2B1LA 3LYPA 5KN2A 1SL2B 3TJBA 3H79A 3KM6A 4PQHA 3TKPA 1X9SB 5INYA 3WGEA 4N10A 5D8IA 2H71A 2OKAA 5JWRB 3F4TA 5ABRA 3MNGA 3RAZA 4WBRD 3GH9A 2HRNA 4JRRA 2LJKA 2LQQA 4IJIA 4DVCA 4RUVA 1W89A 2A2RA 3GSTA 3F9UA 1GSQA 2FGXA 3BCKA 1U87A 5HFGA 4PNFA 1Z3EA 3PGTA 4K7NA 2LV3A 4PX1A 3RDWA 3FZAA 4HZ4A 4WKWA 2XC2A 2VCZA 2DJJA 2HZEA 1H75A 2M72A 1GSSA 4HU9A 1Z5YE 1S3AA 2TIRA 4MF5A 1G7EA 2LQOA 2RUFA 1TI3A 2HRFA 5H5RA 2YJHA 2IWTA 1OC9B 5LD0A 2AV4A 3FZ4A 4TR0A 1TK8B 3ERWA 5ECNB 1Z7PA 4MF7A 4RQXA 2P5RA 4AJ7A 3HZ8A 1S3CA 1PSQA 2PVQA 5B8BA 2J23A 3PR8A 1I5GA 4XS1A 4EKZA 1PX6A 1WWJA 4NPBA 1RQMA 1PRXA 1EGRA 1OC8A 2NVLA 1F6MC 3FR3A 1RW1A 1O6JA 4WR4A 4XIHA 2G0FA 5ID2B 2QKEA 3F4SA 4GWRA 1EOGA 4MCUA 1R4WA 2KHPA 3DKSA 3FKFA 2GQKA 2LSTA 1YEPA 2VCWA 3CBUA 1XVQA 1V57A 1ZL9A 1R5PA 1A0RP 1K0CA 4FYUA 4GRFA 1TXXA 4ML1A 4HI7A 2XPDA 5J41A 2H6XA 3J7Yk 3KP9A 1WE0A 2HNLA 3IOSA 4TKYA 1GSYA 1GRXA 3RHBA 4EXJA 1M9AA 5CAXA 3VK9A 3VWVA 1B9XC 2KP2A 2AHEA 1TRUA 1ERTA 4XRDA 1GTIA 2B7KA 2C8UA 6GSUA 4V1Ag 3Q19A 4NXIA 1K0AA 3LORA 4OCEA 3W8JA 3VURA 1U3IA 1TU8A 4TN8A 5G1LA 3D21A 3IV4A 3TJKA 3C73A 4ML6A 4H86A 2VLTA 2OBIA 5DALB 5D9XA 5JWQB 3FW2A 4KH7A 4LL4B 2HT9A 5IPHA 4LMWA 3UARA 2YOIA 3I6AA 3HCZA 3FK8A 5HR0A 2GQLA 3APOA 5ECPB 3DEXA 4J2FA 3G7YA 4V2LA 3HJMA 1F37A 2DMLA 4JE1A 2VUPA 1LJRA 4K7IA 3AY8A 1ZGNA 1YZXA 4WBJA 3TJFA 3TGZA 3GKMA 1G0TA 1ERVA 1O8WA 2AYTA 1G6YA 4AJ8A 4HDEA 2YN1A 2WRTA 3FZ5A 3KZQA 1T3BA 5GAND 3APSA 3N9JA 1EP7A 4Q5FA 4PXOA 4POLA 1X0RA 4MMMA 1OKDA 5ECMB 2K9FA 2ZNMA 5CRDA 4ECIA 2DC5A 4MJAA 1PMTA 4K6XA 3WGXA 2B1KA 1K0BA 2MMNA 3IAS2 1NSWA 1USBA 2QSIA 4OD7A 3VPQA 5DBQA 1T8EB 3TKSA 3C1SA 3QR6A 4JEDA 1M9BA 4FO5A 2V2GA 4POBA 2AJQB 5ENUA 3KD0A 3C71A 4ZL9A 3LXTA 4XCSA 1ZZYA 2GVPA 1MD4A 2RUEA 4IW9A 3PH9A 3ZIJA 4IN0A 2A4VA 5C04A 1K3OA 4EDYA 2JZSA 1T4YA 5IMAA 3H8QA 1WIKA 1GUKA 6GSSA 3TKQA 4FIWA 1Y6EA 4XHMA 2HFDA 3QOUA 1TDIA 4IJ3A 1QQ2A 5F07A 2R2JA 3BJ5A 2GSQA 1XOAA 1TKDB 1XVWA 1KBNA 2B7JA 1DE1A 2FA8A 1MDJA 2C1YA 4DSSB 4PGTA 2H1DA 3HD5A 5EL8A 2XBQA 2PMTA 2GT6A 2MMZA 1M2AA 5ELAA 1NHOA 5AIVA 4CDOA 4GLTA 2VIMA 3FRCA 4KB3A 1R26A 3F6FA 1EEMA 3GNJA 5B8AA 2GS3A 1Z9HA 3O3TA 2X8GA 2CV4A 22GSA 4NHWA 3KEBA 3P2AA 1GULA 3MWHA 2WB9A 3A3TA 2CQ9A 5EPFA 2KUCA 4E8EA 1AQWA 1XFLA 2E2MA 2VAFA 2X64A 2DJ3A 2XBIA 1A2LA 4HQZA 4PNGA 3KIJA 3I9V2 2NBSA 5LNKe 3EC3A 2DLXA 1T4ZA 2VM2A 4KNDA 5ELGA 1EZKA 3L9UA 3OR5A 3PINA 3DGQA 2PGTA 3JCML 1ZMAA 1HNAA 2CAIA 4DSSA 3BD2A 1B48A 2VCQA 3GKXA 1M7TA 3GIXA 3D4MA 1XWBA 4ZBBA 3QMXA 4OWYA 3EU3A 3ZMLA 3KXOA 1WP0A 2BJXA 4I6XA 4IGJA 4MH3A 1A8YA 2WDUA 2F51A 1BYEA 2FWHA 1A2JA 4HQSA 1VF2A 1CQHA 2A2SA 3TB2A 2RLIA 1JZOA 1PN9A 1AQVA 4ZB9A 1A23A 4HJMA 4BL7A 1PKWA 2L57A 4ZBAA 1FB0A 1GUHA 5CO3A 3IRAA 3WT2A 1ST9A 4MZWA 3VPTA 2GDRA 5D9WA 3ZLPA 1F9MA 1XCCA 3KH7A 1F2EA 4ECBA 2GZZA 1SD8A 1UVZA 4ZXGA 2B6MA 4MH2A 1OVNA 5J3RA 1MTCA 4LMVA 3BBYA 3ZTLA 2GLRA 1H4OA 4HZ2A 1O81A 2H6ZA 1WPIA 16GSA 4Q5NA 2X8CA 4OO5A 4X43A 1QGVA 3KGKA 2R37A 1SJ6A 4NV5A 3FYGA 2OE3A 1XPVA 4MJCA 2WULA 5A4VA 4KDUA 4RQRA 5C00A 3A2WA 3IPZA 1THOA 4HOJA 5GZZB 4NAXA 3CSJA 4X0XA 4MA9A 2OA7A 2FCHA 1GLQA 2FNOA 2NPBA 5CRWA 4O92A 1DE2A 5IO0A 1FOVA 3UBKA 3MAKA 4EF0A 2FWFA 2FLSA 5E59A 1JHBA 3ZMKA 1WRYA 3UVHA 2JU5A 5HR1A 2PVOC 2TRCP 4KSMA 4TXOA 3LJRA 4V2MA 3QAVA 1V2AA 4KDXA 4ISDA 2MMOA 1FW1A 4LA1A 1GL8A 1THXA 3IE3A 2EIOA 3Q74A 1TRWA 5CRGA 2JZRA 2JACA 4G10A 1Z6MA 1F3BA 3KMOA 2R3XA 2IJYA 3A5WA 2VCTA 1VGLA 2LNSA 3HJOA 1A2MA 2N5FA 4O5RA 4N0ZA 1O7UA 3QAGA 3GA4A 4MDCA 4KDYA 1TW9A 3F3QA 5IMCA 6GSVA 2F8FA 2O87A 4POMA 3D4TA 2L4CA 4NV2A 1KTEA 4K0GA 4ULXA 4QL9A 5HFIA 2F8AA 3ZVJA 1GSFA 3KP8A 4JZQA 5ECKB 5J5NA 2VLVA 2VM1A 2YANA 4K9ZA 4LLRA 3ZVJD 3FZ9A 2H01A 2HYXA 2WS2A 4MPFA 18GSA 5D73A 3I69A 3CTGA 5JCGA 4JU5A 1VF1A 4IHUA 6GSXA 2KOKA 5HR2A 3R2QA 3CSIA 5IQYA 3LSZA 3KJYA 2ALBA 4EO3A 2KP1A 3GURA 1XW5A 3F8UA 5EY6A 3D0ZA 2YPMA 3S9FA 3APQA 2LJAA 5ECQB 3N5OA 2C0DA 1YY7A 5A5KA 1O73A 3EE2A 4D73B 2RM6A 2E0QA 4L0WA 3TCOA 5EVOA 1GTAA 4OCFA 2JL4A 2V41A 5CP1A 4YQUA 4F0BA 2LS5A 3J7Yb 4ECJA 1GNWA 2C3TA 1FHEA 3TRQA 2MZCA 2I9HA 4GQCA 4P3YB 3GL5A 4CHSA 1JLWA 1OC9A 1ACVA 3ED3A 5D96A 3TRXA 2YCDA 2ZUPA 2C3QA 2GSTA 2YV7A 3DVXA 5G31A 1YKCA 2H66A 5G30A 4Q5QA 1FVKA 1Q4JA 5G5EA 3UIWA 1QFNA 1B9YC 4K0NA 2IPAA 4G19A 5F05A 2VLUA 2JADA 5ID2A 2B5YA 3QCPA 2MMAA 2IMDA 4OMVA 2C80A 3GHAA 4BVXA 1TK5B 4I8BA 2PN8A 1T1VA 1TP9A 3ZRDA 2RM5A 4J57E 1EOHA 3VI7A 4ZL7A 3WYWA 4RI7A 3F6DA 2K8SA 1OAZA 1SJIA 2R6KA 1EP8A 3TJGA 2KLXA 2CA8A 5KN0A 1I9DA 4NWYA 3VFIA 3ME8A 3TKSC 2X99A 3W8SA 2G2QA 1K0NA 2DMMA 4MF6A 1C72A 4DSQA 3ZFLA 2F3MA 2PPTA 2O85A 2CT6A 2OE0A 2WJUA 2OACA 5CYYA 1SKWB 1PL1A 3EYTA 2REMA 3IHQA 4XRAA 5IMDA 4V1Ap 2YWNA 3IDVA 3L0HA 1PA3A 4K8MA 5D9TA 5A4WA 3D6IA 5DALA 2H72A 3DVWA 5F0GA 4J56E 5G2ZA 2DBCA 3F3RA 1JZDA 3TKSE 1A0FA 1GH2A 5IIZA 3Q18A 1YEXA 2LRTA 2CZ3A 1GSDA 1XWKA 4O32A 1BQ7A 1VRSD 4FYCA 1AQXA 1J9BA 2YWOA 1AXDA 3HKRA 3LYKA 3TRPA 2V6OA 2P5QA 1XWGA 4F82A 5DJLA 1A24A 3DRNA 2IMIA 1YKAA 3D5JA 1OC3A 3F4RA 5IOXA 1NW2A 2H30A 5E4WA 4YAVA 1YQ1A 5JCWA 2CX3A 2IMEA 2MBSA 2JSYA 5J9CA 3A2XA 5IMZA 4I2UA 2BMXA 1BEDA 3L78A 4EC0A 2B5XA 1Z6NA 3GSSA 3TOTA 3U5RE 1ZYQB 2EIRA 3DYRA 3M9KA 1M2DA 1UN2A 3O76A 3E3EA 1V98A 3E9JB 4IQ1A 1X9MB 1IYIA 2VD0A 3WT1A 4WR5A 1ML6A 1PGTA 4KA0A 1X5CA 1SD9A 4MZBA 3WD6A 3EU4A 2OADA 5J4UA 5DQYA 2DJ0A 1GWCA 3FHKA 2GSRA 3D22A 1E6BA 1ZOFA 4DSRA 4LL1B 4KSOA 4BPYA 1GTBA 1FO5A 4ZIJA 3ZREA 5DCHA 1LBKA 4L0UA 5ECLB 1J0FA 5GSTA 2HLSA 3VI5A 1M2BA 4MABA 1MDKA 4MZCA 3KTBA 5ECOB 2H1GA 1FAAA 2HSYA 2LRCA 1X5EA 3UVTA 2K18A 3IK7A 2PWJA 3CXGA 2H73A 1U88A 1WOUA 4EUYA 1JFUA 2AB6A 3UAPA 4ID0A 4ECCA 4GXZA 1VF4A 3EURA 4OFNA 2XPEA 5AGYA 1EGOA 5IM9A 2AUVA 2VL2A 3F63A 2YP6A 17GSA 1QXHA 3IAM2 5IPGA 1DUGA 5DAKB 4WXTA 4QL7A 1QUWA 5CREA 2F9SA 4HS1A 2WZ9A 3P8WA 1JZWA 1N2AA 1W4VA 2V6KA 4ZBDA 3A2VA 3HDCA 3GFKA 2HI7A 3ZITA 2X8HA 4N11A 1MDIA 4PUFC 4N0VA 1R7HA 3TDGA 1SKSB 4MK3A 3IBHA 1EV4A 3IR4A 3NIVA 3VWXA 2H1BA 2CVKA 2MBTA 3UL3A 5H5QA 2C0FA 3LGCA 3QPMA 4V2NA 3LQ7A 4XTSA 4BVYA 3HVXA 1TTZA 2LJRA 1JZRA 2LRNA 3C1RA 1K0DA 5DCGA 5FHIA 2ON5A 3MDKA 1S3DA 3VWWA 2GZPA 1U6TA 1YF0A 3K8NA 4GF0A 3M1GA 3H4KA 2DJ1A 4WEYA 3M8NA 1FG4A 4AGSA 3TUEA 1CQGA 3M3MA 2GGTA 5G5FA 3CMIA 2V1MA 2C0GA 2L5LA 4K7OA 2XHFA 7GSSA 1TRSA 4K1FA 1TK0B 2YNXA 2M80A 1U3AA 2O8VB 2PUKC 2GQMA 1AUCA 4F0CA 1ABAA 3Q6OA 2LTKA 1BAYA 10GSA 11GSA 1HNBA 4ACSA 3GMFA 3CTFA 2B3SA 1AC1A 4ILFA 1JLVA 1M99A 5HR3A 2HZEB 4IP1A 4FYBA 2GT5A 5GSSA 5FT3A 4TOPA 1K0OA 3KH9A 4HEA2 4I2TA 1Y25A 2H76A 4KX4A 3RPNA 1O8XA 5ECRB 2VL3A 3ISOA 3ZYWA 4N30A 1J08A 2QGVA 2L5OA 4GCIA 2ZCTA 2MYGA 1KNGA 2FY6A 4IVFA 3FEUA 3C8EA 3KTLA 1OE8A 4RI6A 2IMKA 4ZILA 2H0GA 2H70A 5D9VA 1UC7A 3M9JA 3M0FA 1AW9A 14GSA 1TRVA 4MLYA 2WFCA 5KEJA 2EC4A 3P7XA 4PURA 2JSZA 5AN1A 1GSUA 3EMPA 1FB6A 3LFLA 5D93A 4WF5A 3SBCA 5B6MA 1WMJA 1SYXA 4AF2A 3DD3A 5F8BA 2C3NA 2CVDA 3L4NA 4GSSA 1GNEA 3ZFBA 2C0EA 1N8JA 2N5AA 2L6CA 3LXZA 2FHEA 2K6VA 1KEBA 12GSA 2FA4A 1NM3A 2ES7A 4JBBA 5CNWA 3F0IA 1T00A 1SK1A 1Z7RA 2DJ2A 2HZFA 3GX0A 1TI1A 1PX7A 2I4AA 2ON7A 1V40A 3ERFA 1HYUA 4EE0A 2IN3A 3G9BA 3L9VA 3O6TA 3FY7A 5KN1A 4IQAA 5HFKA 5HQPA 5JWOB 4PQIA 2L4QA 4ZB6A 1AAZA 2BTOT 1GLPA 3GYKA 4KCAA 3H93A 2VCXA 3HY2A 3GL3A 3HA9A 3U6VA 2IFQB 2H8LA 2VCVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite