2C0DA

Structure of the mitochondrial 2-cys peroxiredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
b'LVTKKAYNFTAQGLNKNNEIINVDLSSFIGQKYCCLLFYPLNYTFVCPTEIIEFNKHIKDFENKNVELLGISVDSVYSHLAWKNMPIEKGGIGNVEFTLVSDINKDISKNYNVLYDNSFALRGLFIIDKNGCVRHQTVNDLPIGRNVQEVLRTIDSIIHVDTSGEVCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Biochemical Characterisation of a Mitochondrial Peroxiredoxin from Plasmodium Falciparum
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 54
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.7: Peroxidase.
pdb deposition date 2005-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0dA00
2VAFA 1Z7RA 3GH6A 3FK8A 3NOFA 3HVSA 2K9FA 1K0AA 1GNEA 3L0HA 3IBHA 5AIXA 5ECKB 4MH2A 4OFMA 3KD0A 1Q4JA 3ZFLA 1GWCA 3VWXA 1X9SB 2GTUA 1XW9A 2VL2A 1MDJA 1ON4A 2WDUA 4RQRA 3FZ9A 1U87A 1EOGA 3RHBA 3GL3A 2LNTA 4TR1A 3MNGA 2CVBA 4ZL8A 3KH9A 2RM5A 1V98A 3LG6A 1SJZA 3IA1A 4OCEA 3TOUA 1F6MC 1Q98A 3BCIA 2GDRA 2C0DA 2KOKA 3G7JA 3LWAA 2A2SA 2KHPA 3V1WA 2GGTA 3RPPA 1SKSB 5G5EA 3C1RA 1G7EA 1K3OA 3CSJA 2DLXA 2AUVA 4NMUA 3ZREA 1GSDA 3TJJA 4JR6A 1T7PB 3IRAA 1K0CA 3CRTA 1X9WB 3PR8A 3D6IA 4ZL9A 1T4YA 1TK5B 1RQMA 4XS4A 6GSTA 1SL0B 4ZXGA 2FA4A 4JZQA 4KNDA 3LXZA 3VWUA 6GSVA 4MMMA 5ELGA 5IO0A 5HFKA 3TRQA 3A3TA 1XBSA 1A2JA 3HYPA 2DJKA 4X0XA 3ZVJD 4X43A 1VRSD 2H71A 3GL5A 1WJKA 2B7KA 1TJDA 2LQOA 4LMWA 16GSA 4HU7A 3MDKA 5AISA 2I1UA 3DVXA 3GN3A 2XBIA 1OC8A 5D8IA 1S3DA 3QD9A 4EDZA 4TR4A 4V2NA 1FOVA 3O76A 5CAXA 1FG4A 4MJAA 2NBSA 2C3QA 2LRCA 1Z9HA 4F82A 1A2LA 3RDWA 1B48A 1TRVA 3J7Yb 4ECJA 2YJHA 1A0RP 2WJUA 3ZITA 1HNAA 2H30A 4IP1A 1W4VA 3E3EA 3DGQA 2H0GA 3H8QA 4HEA2 1PN9A 3ZMLA 4BWSA 3F6FA 4L0UA 2ON5A 2CX4A 1JZOA 3UIWA 5DQYA 4LL4B 3CRUA 3IC4A 2VCQA 4EKZA 2E0QA 4GF0A 2FNOA 2C4JA 1O73A 1OKDA 1FVKA 3WYWA 5EPFA 4D73B 3F3RA 2XPEA 1YKCA 1GSUA 3Q6OA 2IPAA 4XS1A 2YP6A 5HFGA 2C3NA 2PVQA 5CRHA 4TOPA 4F03A 1A23A 2E2MA 2H6ZA 1MDKA 1J9BA 1TI3A 2IL3A 3QDNA 5IIZA 4G19A 5JCUA 4E8EA 5DJMA 2FUG2 1T4ZA 2CT6A 3N5OA 5CRGA 4FYCA 3S9FA 4ML6A 3QR6A 3HJOA 4PUAA 3ZRDA 3TKSA 3EVIA 1THOA 1MD3A 19GSA 1BYEA 5FHIA 9GSSA 2H74A 3NZNA 4TR0A 2IMDA 2F8AA 4ZIJA 2FD3A 2R37A 1ZGNA 1ZYQB 4GQFA 2NPBA 2LJKA 1PA3A 5ECQB 3VK9A 1ZMAA 4MLYA 3ZFBA 4XS6A 2IFQB 2C3TA 3LSZA 2P5RA 3HKRA 1EZKA 3DMLA 5ECPB 3GYKA 1AQVA 2WB9A 2GQMA 2H19A 2DMLA 2H1BA 3UARA 4H86A 1YEPA 3M0FA 3QAGA 4IS0A 2YNXA 4EDYA 4YQVA 2MMZA 3LYPA 3F6DA 3ERWA 1AQXA 2LNSA 3CXGA 5KN1A 4I2UA 4K7NA 4KGIA 1URMA 5ID2A 3IOSA 2DJ2A 1RK4A 3F8UA 1WIKA 5D9WA 3LQ7A 3L9UA 5CREA 3A2VA 4L8EA 4TXOA 1W89A 4KCAA 1PL1A 1VF4A 1YKAA 3GKXA 2K8SA 1PX7A 2C1YA 1FW1A 3FEUA 4DSQA 2J23A 5IMFA 5H5RA 3JCML 2ES7A 3CTFA 4K8MA 2IMKA 4NHWA 2VD1A 2JADA 2P0GA 2HLSA 2V41A 4ZBBA 1JFUA 1QQ2A 5A5KA 3W8JA 4JEDA 1ACVA 2K6VA 3EURA 4K0NA 1F3AA 1K0OA 3TJGA 1BJXA 5D93A 4PQ1A 5G1LA 1GSEA 1JLWA 1GNWA 4LA1A 3M8NA 4K2DA 1PKZA 4IW9A 3WGDA 1EOHA 2MBTA 5AIVA 5G5FA 4AJ7A 2KUCA 3FR6A 4IGJA 4O7HA 1SD8A 3WGEA 3IAS2 3GV1A 2F3MA 2GSQA 2CAQA 2OE0A 3DVWA 2O85A 3A2XA 3WGXA 4MJEA 5J3RA 1NHYA 2DJ3A 2CV4A 1O6JA 2HFDA 3EWLA 4WF4A 3Q19A 4ULXA 5EVOA 5JCGA 1ILOA 2HRFA 1R5AA 4HS1A 2VM1A 2RLIA 5D9VA 5L71A 4KH7A 1SL1B 1WPIA 2VCXA 3ME7A 4OCFA 1M2BA 5LNKe 2XPDA 2YWNA 3F9UA 4YQUA 2X8CA 2PUKC 2RUFA 3WT1A 1C72A 2DJ0A 5IM9A 1VF3A 3BBYA 2G0FA 5COHA 3DKSA 4IBPA 4RQXA 4HZ2A 3HZ8A 5IO2A 1TP9A 4N10A 3Q74A 3IE3A 1GTAA 5F8BA 2G2QA 4MF7A 4AF2A 13GSA 3ZMKA 3F63A 4POBA 2VM2A 4HDEA 4FIWA 4WEYA 3PGTA 2NDOA 1AIUA 4NV5A 3P90A 4NXIA 3L9SA 2ALBA 2R4VA 5GSTA 1ZZYA 4MJBA 2H70A 3K8NA 1TK0B 4BWQA 1AW9A 4MF5A 2OA7A 4GTUA 1PRXA 2HYXA 5B6NA 5IMZA 3F3QA 2HZEA 4BPYA 1U6TA 3GA4A 4ZB6A 6GSYA 1J08A 4K0GA 4EF0A 4ECIA 1UC7A 3RHCA 5C00A 1B9YC 3EMXA 5HQPA 5CYYA 1KBNA 4G2EA 4WXTA 1XIYA 4OO5A 4ZILA 3O3TA 5IMCA 2B5EA 4O32A 1OAZA 3C71A 2TRCP 2B6MA 4IQ1A 5INYA 1ZYEA 4DSRA 3GFKA 3NIVA 1F2EA 4GSSA 2VCVA 1B4PA 1PSQA 2WULA 2R2JA 3FZ5A 5ECRB 1FAAA 4F0CA 3DXBA 3SBCA 1XOAA 5EY6A 2H76A 1ZCPA 2PU9C 2WRTA 5H5SA 3KTLA 2TIRA 3APOA 2GLRA 5HR1A 4PURA 1OE8A 4PXOA 2CX3A 1K3YA 1T3BA 1XW5A 2VCWA 3TDGA 1M99A 12GSA 2VLVA 3BD2A 4P3YB 3GX8A 1EV9A 3EE2A 3F4TA 2MZCA 2HE3A 2BJXA 2CQ9A 3VURA 2H1AA 3CSHA 2LEGA 4DSSA 4ZBDA 1XFLA 5CRWA 1YF0A 4KW6A 2PN8A 4YAVA 1EEJA 2P31A 4XRAA 2DSAA 5D9TA 1E2YA 2DBCA 5C04A 1GL8A 3Q18A 1NHOA 2LSTA 3QFBC 4O92A 4ZL7A 4MPGA 1PMTA 2EIRA 2EIOA 4IELA 3QAVA 2M80A 3HHVA 1EV4A 2HZFA 2YWMA 3KGKA 1GUMA 1HNCA 2YPMA 5EL8A 1VF1A 3TJBA 4J56E 4QQ7A 1HD2A 4WBRD 1GSFA 3PH9A 1OC9A 5LD0A 1XCCA 4MCUA 4FH8A 5FT3A 8GSSA 1XWGA 1V58A 1E6BA 4JE1A 1WOUA 4NAXA 4Z7XA 1KTEA 5HR3A 1EGRA 1T1VA 3LORA 1PQNA 1NSWA 3UJ1A 2BTOT 4EO3A 3IK9A 1M9BA 3BJ5A 3FHKA 2CVKA 3GX0A 5ID2B 4KA0A 5B6MA 2WZ9A 4MZWA 5A4UA 1RW1A 1ML6A 4K6XA 1GSYA 1SKRB 1O85A 1XW6A 3MSZA 5GAPD 3UBLA 4MF6A 3RBTA 1N2AA 2XC2A 1M7TA 5ECHB 3KTBA 5DALA 1K0DA 1QGVA 1EP8A 1OYJA 3IR4A 4OWYA 2GSTA 1TRWA 2LS5A 3I9V2 2FWGA 4XHMA 5IMDA 3SWLA 3A2WA 2D2ZA 4XIHA 2H01A 5B8AA 5DAKA 1FHEA 1V9WA 1TXXA 1SJIA 3DRNA 3QMXA 3HY2A 5HR2A 4NHZA 4YH2A 1SENA 2CVDA 2VCTA 2YV7A 4EUYA 2FA8A 5KN2A 3DIEA 4IHUA 2VOCA 3APSA 1XWBA 2OACA 3IXRA 3H4KA 2B5YA 4MH3A 1TRUA 1ZOFA 3A5WA 4KDYA 1PD21 1WMJA 2VCZA 3RPNA 2MYGA 5DQSA 1G6WA 2KLXA 3EU3A 3KMNA 3ED3A 3GTUB 3UVTA 5G1KA 4Q5FA 2VLTA 2OBKA 2DIZA 1M2AA 1SKWB 1XPVA 4V2MA 3HXSA 3UAPA 1ABAA 2FWFA 4BL7A 2LTKA 3VWVA 4O5RA 2QKEA 4TXVA 2CZ3A 1TDIA 3ERFA 5KN0A 1OE7A 2QSIA 3FZAA 3G7YA 2N5FA 1SU9A 1TW9A 5KEJA 1Z7PA 2HI7A 4ECBA 4TRXA 2OE3A 3KP9A 1Y25A 2M46A 1FO5A 2JSZA 4YAPA 5JCWA 2LRNA 4F0BA 1AAZA 4MZCA 1NW2A 1YF1A 3TUEA 2I81A 1AQWA 2WFCA 2V6OA 5A4VA 2LQQA 3KXOA 3D5JA 3IV4A 3BOAA 3I43A 1PX6A 2IMIA 2JU5A 4ILFA 4OMVA 1O8XA 3UBKA 6GSSA 3IDVA 3IHQA 1QK8A 2H1GA 5ENUA 2H6XA 1YZXA 1H75A 1M0UA 3TJFA 2H72A 3FZ4A 2B3SA 2HZEB 3EU4A 2O8VB 1B8XA 4MZBA 4PGTA 3DYRA 2LJRA 4F9ZA 1G7OA 2X64A 1S3AA 4LMVA 3DD3A 1A24A 1F37A 4OO4A 1KNGA 3ZZXA 1U3IA 3G9BA 3VI7A 2HNLA 3I69A 4RUVA 4AGSA 2GT5A 4LL1B 4AJ8A 4XRDA 4BVYA 3BCKA 1B9XC 1ERTA 3KEBA 4ML1A 2F9SA 3TGZA 1O81A 2YANA 2R3XA 1TK8B 2H66A 3LXTA 1BAYA 3U6VA 2AHEA 4K7IA 4J57E 1WRYA 1YQ1A 3D4MA 2VL3A 2OJLA 1SD9A 3C7MA 1X5CA 4N11A 2ZUPA 2GQLA 3HA9A 3KP8A 4NWYA 3QFAC 1THXA 2A4VA 1Z6NA 4FYBA 4E8HA 4L5OA 5IPGA 1XVQA 3VWWA 1VF2A 5IOXA 3APQA 5JWRB 3GURA 2L59A 2VL2C 1MEKA 2CA8A 2PMTA 1CQHA 4TR3A 5DDLA 1K0MA 1G0TA 3TB2A 1ZL9A 2J9HA 3FR3A 2JACA 2DJ1A 20GSA 3F0IA 2JZTA 2L5OA 3FYGA 3VPTA 3HJMA 3KCMA 1K3LA 2JZSA 4Q5QA 3VFIA 3ZVJA 4DSSB 1T8EB 4ZBAA 3MAKA 4TR1B 2K18A 3KMOA 1A8YA 3EINA 3F4RA 5FWGA 2F51A 2VD0A 2I9HA 1UA5A 5CNWA 3GUSA 4DVCA 2V2GA 2YWOA 2AAWA 3L4NA 6GSUA 3J7Yk 1QUWA 3HCZA 1DSBA 2IFQA 17GSA 3P8WA 2LJAA 1A8LA 2L5LA 1FVJA 2HT9A 4EXJA 5F0GA 2I4AA 2FGXA 1Y6EA 1GTBA 1O7UA 5AN1A 2MMAA 3ZLPA 3GIXA 3LYKA 4XS4B 4HOJA 2P5QA 5ECOB 3UOMA 2LKUA 4G10A 3O6TA 4L5LA 4WKWA 1OC9B 3TKSE 2GVPA 2YZHA 1V40A 6GSWA 3TRXA 2GSSA 2A2RA 2DC5A 3H79A 1GLQA 4K7OA 2O7KA 2E2GA 4WR4A 5B8BA 3LEFA 3GH9A 3EYTA 3HVXA 2B1LA 3E0UA 4AJ6A 2B5XA 1M2DA 1JZDA 5DVBA 4XTSA 5J9BA 3EMPA 5J5NA 1J0FA 2VIMA 1CQGA 3HDCA 4ISDA 1X5DA 1IYHA 4KSOA 4EVMA 4KB3A 1PL2A 4I2TA 1EWXA 3D22A 3TJKA 4POMA 4I6XA 5G30A 4HJMA 3LGCA 2LV3A 5IMVA 4ACSA 2V32A 3G7IA 1BQ7A 3W6GA 4GSNA 3FW2A 4YQMA 4CW9A 1GTUA 3L78A 1OVNA 4GQCA 3WT2A 3AY8A 5DAKB 1JZRA 3ZL5A 3GMFA 4IP6A 1XWAA 3QCPA 3ISOA 4WF5A 3WD6A 1LJRA 2CAIA 3TKRA 2NVLA 1O8WA 2REMA 5ABRA 5J4UA 2PWJA 1NM3A 1T00A 5IPHA 4WBJA 2O89A 4MABA 4MDCA 4ZB9A 4PNGA 1JLVA 3HD5A 3L9VA 3GKNA 4K1FA 2ON7A 1BG5A 2GT6A 3TKSC 4GCIA 5ECNB 1U3AA 1V57A 5IQYA 4IVFA 4V1Ap 1GSSA 2YCDA 2RUEA 4RI6A 5JWOB 2GZYA 5F05A 3KH7A 3UVHA 2EC4A 2XBQA 4ECCA 2YV9A 2EIQA 3FRCA 3DWVA 1I5GA 1OKTA 5LCZA 3DEXA 1R5PA 4KUNA 2R6KA 4HUAA 3PINA 4OFTA 5D73A 4ZB8A 2L4CA 1HYUA 2FWEA 3GRXA 1GSQA 1DBYA 2GZZA 1H4OA 4KSMA 3I6AA 4PQHA 2HSHA 1AC1A 4MJCA 5CP1A 3HZ4A 2M72A 2YJ7A 1B4QA 1FB0A 1HQOA 5A4WA 1OC3A 4TXOB 1XOBA 4BVXA 5CO3A 2C8UA 4XCSA 2RIIA 3ME8A 4KDUA 5GAND 1QMVA 5J41A 3C73A 5G2ZA 4G9HA 2C0EA 5E4WA 1SYRA 4LLRA 1A2MA 1ERVA 1USBA 1SJ6A 1K0NA 3E9JB 5J9CA 4HQZA 4MA9A 5ECSA 2B1KA 2HXKA 4POKA 3IAM2 1MD4A 4DEJA 1YEXA 14GSA 1YDKA 4MPFA 1S3CA 2X8HA 1MDIA 18GSA 5GSSA 3D21A 4K9ZA 1U88A 1I9DA 2L6DA 2WCIA 4KDXA 4JBBA 1EEMA 4FYUA 5KN3A 3GNJA 5ECLB 5E59A 2C0FA 3P7XA 1X9MB 1ERUA 2N5AA 3D4TA 2C80A 2O87A 1MTCA 4V1Ag 5DBQA 2H0HA 3CMIA 3TOTA 4JRRA 4X1UA 1DE2A 1Z6MA 2VO4A 1Z5YE 3ZYWA 5DCHA 1X0RA 4Q5RA 1GULA 1K0BA 1IYIA 5ECMB 3GSSA 3KIJA 11GSA 1JZWA 1ERWA 4CHSA 3ZTLA 1YY7A 2X99A 4IJ3A 1JHBA 2V6KA 2OKAA 2FY6A 2H73A 1XVWA 4OFNA 2KP1A 4I97A 2CZ2A 2X8GA 3QOUA 3M9JA 1R4WA 5IOWA 1ST9A 1DUGA 4F2IA 4GWRA 2F8FA 2MBSA 2OBIA 4NV2A 1QXHA 3D0ZA 5JWQB 6GSXA 3QPMA 4N30A 2GS3A 1GH2A 1EGOA 2WS2A 3IPZA 3R2QA 3UMAA 1LBKA 5GZZB 3TKPA 4EL1A 1TU8A 3KZQA 1BEDA 1GUHA 4I8BA 2ZCTA 1XXUA 2ZNMA 3UL3A 2JZRA 4PQIA 5HFIA 1UVZA 3LFLA 2RM6A 2TRXA 4HI7A 1PKWA 4L0WA 4WETA 3FY7A 3W8SA 4V2LA 1XZOA 3ERGA 3TCOA 1N8JA 3KM6A 4GSTA 1EP7A 4GRFA 2MMNA 2PGTA 4QL9A 2IMEA 2PVOC 3OR5A 2GQKA 1SK1A 5DJLA 2B7JA 3P2AA 4RI7A 3VLNA 3CTGA 3IK7A 2DMMA 3GHAA 4PNFA 5D96A 5AGYA 4PUFC 2QGVA 5D9XA 2WGRA 4JR4A 1A0FA 4IKHA 4TKYA 2K8VA 3F4SA 4MK3A 5F07A 1TI1A 2QC7A 1UN2A 4I5QA 3CYNA 2MMOA 3ZIVA 1GRXA 1SYXA 2E7PA 4CDOA 3GKMA 1GUKA 2YZUA 2XHFA 5IMAA 1XWCA 1TKDB 2PERA 1TTZA 1WE0A 4KE3A 3KJYA 3EC3A 10GSA 3N9JA 1HNBA 4OD7A 2AB6A 2H75A 2YN1A 3M9KA 4N0ZA 1WWJA 1V2AA 1GTIA 4D73A 3FR9A 2OADA 5G31A 1DE1A 1SK0A 2I3YA 5B7CA 2GZPA 2N5BA 2LUSA 1F9MA 1VGLA 2IIYA 1GLPA 2V1MA 3M1GA 5DCGA 2H0IA 2BMXA 4HZ4A 2R5GA 5CRDA 2AJQB 4TW5A 2HRNA 2H6YA 4PX1A 4KCEA 3HVVA 4GXZA 2IMFA 3GTUA 3U5RE 3C8EA 2VL9A 4MP4A 1YJ6A 1FB6A 1KEBA 2IJYA 4IN0A 2H1DA 3ZIJA 3GKKA 1WP0A 3TKQA 3CBUA 3US3A 2KP2A 2PBJA 3TRPA 4GLTA 4HU9A 1PGTA 2VUPA 1Z3EA 1F3BA 22GSA 2IN3A 1QFNA 1R26A 2HSYA 2LRTA 4TN8A 2NTOA 2IWTA 1TU7A 4HQSA 4EE0A 2L6CA 2H8LA 1TOFA 4J2FA 5ELAA 3RAZA 2VLUA 1M9AA 2Z9SA 2PPTA 1AUCA 2DIYA 4QL7A 1BX9A 2AYTA 2DJJA 2FLSA 3VI5A 1X5EA 2OE1A 3H1NA 1LU4A 2YWIA 1SK2A 3LJRA 4KAEA 2YOIA 4Q5NA 1G6YA 5H5QA 3MWHA 4IJIA 1SL2B 1GP1A 4BA7A 2FWHA 4HJ2A 1R7HA 2JL4A 2L57A 4KX4A 2C0GA 3VPQA 4NPBA 3HJPA 3H93A 1TRSA 3FKFA 4IQAA 3GSTA 3M3MA 4WR5A 2GSRA 5HR0A 3CSIA 4TVEA 3UEMA 5ECIB 5DALB 5F06A 4EC0A 7GSSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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