2C0DA

Structure of the mitochondrial 2-cys peroxiredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
LVTKKAYNFTAQGLNKNNEIINVDLSSFIGQKYCCLLFYPLNYTFVCPTEIIEFNKHIKDFENKNVELLGISVDSVYSHLAWKNMPIEKGGIGNVEFTLVSDINKDISKNYNVLYDNSFALRGLFIIDKNGCVRHQTVNDLPIGRNVQEVLRTIDSIIHVDTSGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Biochemical Characterisation of a Mitochondrial Peroxiredoxin from Plasmodium Falciparum
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 54
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.7: Peroxidase.
pdb deposition date 2005-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0dA00
2VD0A 3LWAA 2BMXA 5J9CA 4F03A 1B48A 4WXTA 1ZYQB 1XWGA 2GSQA 4WETA 3LYKA 3R2QA 2C4JA 2HFDA 4POLA 2GDRA 2B6MA 2FY6A 4LL1B 4PNFA 4CDOA 3LQ7A 5F8BA 5FT3A 2R4VA 2M72A 3M9KA 2VL2C 2LV3A 1Z7PA 1KNGA 2REMA 5KN3A 4EO3A 2I81A 3D21A 3CBUA 2H19A 1SU9A 3DMLA 1TJDA 3QAWA 3Q18A 6GSXA 3DVWA 17GSA 2C0GA 4OCFA 4N30A 4FH8A 4POKA 4KA0A 1FVKA 5B7CA 3DWVA 2RLIA 3D22A 18GSA 1WE0A 2V1MA 4K0NA 3LFLA 1ZYEA 9GSSA 4ML1A 5IMZA 3BBYA 1LU4A 2JZSA 1G6YA 3IAS2 3O3TA 1G0TA 1V2AA 4V1Ap 4MH3A 3QR6A 1SKSB 3IA1A 2YCDA 8GSSA 2OA7A 3LEFA 2I9HA 5GAPD 1YJ6A 3F8UA 5D93A 5ECQB 5ECOB 4F0CA 3IR4A 1YKCA 2CT6A 2IIYA 1JFUA 3SBCA 2CVBA 4ZBBA 4KH7A 1PGTA 2H0IA 3GURA 3M0FA 3F3QA 3HJOA 3L0HA 5ENUA 1YEXA 5KN0A 1ABAA 1THXA 5DJLA 4FO5A 3UAPA 1J08A 1LJRA 1E2YA 2ALBA 4PUFC 2OJLA 3GKKA 1XWKA 3U5RE 3ERWA 5ECLB 1B4PA 3FW2A 3P8WA 4IQ1A 2GT5A 5DAKB 2H0HA 2VL3A 5ID2B 2C3QA 1OKDA 1TW9A 3GL3A 5COHA 3GUSA 2D2ZA 1Y6EA 2MMAA 1NHYA 2PBJA 4X1UA 2LRTA 5EPFA 13GSA 2WULA 2VCWA 4ID0A 2V2GA 12GSA 1Q4JA 3LYPA 5JWRB 4TOPA 5H5RA 1BEDA 22GSA 4KUNA 1X9WB 3RDWA 5HR0A 3H1NA 5G31A 5IO0A 4MCUA 2IFQA 2LS5A 3DRNA 1WP0A 3FZAA 2A2RA 1WPIA 3GKMA 3LG6A 1ZGNA 5A5KA 5JCGA 2A2SA 4KNDA 3KMOA 2ZNMA 3ZL5A 4ECCA 2NBSA 3D6IA 3TB2A 3VI7A 4J56E 2LRNA 2HT9A 3HZ8A 4GRFA 5H5SA 4XS6A 3FYGA 5A4VA 2IMDA 2YP6A 4I6XA 4V2LA 3H8QA 1VF2A 2P5QA 1PL1A 1K0OA 3DVXA 2IN3A 2RUFA 3BOAA 1HNCA 5KN1A 1M0UA 4RQRA 2C80A 2FCHA 2CVDA 4TN8A 3FKFA 1O73A 1O6JA 5G1KA 4TR1A 4NV5A 3VWXA 4ECIA 3GFKA 2LQOA 1B9XC 2C1YA 2GQLA 4RUVA 4EL1A 2HXKA 2YN1A 3KTLA 2R2JA 2AHEA 3GA4A 3IK7A 4KSMA 4XCSA 5DBQA 1WMJA 3VURA 1BYEA 4V1Ag 1DUGA 1QK8A 1ON4A 2CZ2A 1PSQA 1F3AA 1GTAA 4POMA 3I9V2 3KM6A 1T7PB 2PGTA 3Q19A 4L5LA 2DLXA 3ZRDA 2R6KA 1FW1A 3O76A 4IJIA 2I4AA 3UVHA 3FZ4A 4PQIA 5AIXA 3KXOA 1R7HA 4K0GA 2MBSA 2EIQA 4AF2A 3TJGA 3HKRA 3QMXA 1LBKA 4TVEA 3A5WA 2FA4A 2IMKA 1GTIA 2LJAA 2WB9A 4N11A 5GAND 4WR5A 3GTUA 1F9MA 4L5OA 1XPVA 5E59A 4KSOA 2X8HA 1A24A 5DCHA 2G2QA 3HJMA 1WRYA 1EEJA 5G30A 1VF4A 1SJZA 3EVIA 4NMUA 3HY2A 2E0QA 3UOMA 2H1DA 3APSA 3C7MA 3FZ9A 2I3YA 3PINA 2H75A 2NTOA 3IV4A 2XPDA 2L59A 3F6FA 3TUEA 4ZL9A 1K3LA 4NHZA 2L4CA 1EV9A 4L0UA 3ZREA 14GSA 2B7JA 1EP7A 2HSYA 1SJ6A 2YV9A 3HD5A 2F8FA 2H6YA 2L4QA 4J2FA 5D96A 4N0ZA 3WT2A 3Q6OA 4Q5QA 3FHKA 1PQNA 1MD3A 4TXOB 4NWYA 3GX0A 3TJJA 1GTUA 1OVNA 2P5RA 1GNEA 2DMMA 3ZZXA 3G7YA 4LMVA 3GH9A 1XOAA 11GSA 1YKAA 3F63A 1YEPA 3US3A 3EYTA 2C8UA 1I5GA 2E2GA 5GSTA 4BVXA 4Q5FA 4TW5A 3M8NA 4I2UA 5F06A 4F0BA 3HVVA 1RK4A 16GSA 3TOUA 1SJIA 4EVMA 4OCEA 3TKQA 4MZCA 4MPFA 1TDIA 3JCML 2YWIA 3GX8A 3FK8A 4CW9A 3HDCA 1JZOA 1SL0B 4HUAA 2LSTA 1AW9A 4PNGA 3EURA 1T1VA 2VD1A 1EP8A 2H1BA 1EV4A 3I6AA 4OFNA 2FWGA 5JCWA 1VF1A 5F07A 4ECBA 3ME7A 1S3CA 1FVJA 2WFCA 2DIYA 3F3RA 4E8EA 4AJ8A 2YZUA 4EDYA 2GLRA 4IW9A 1Z6NA 5B6MA 5AN1A 1F37A 2B5EA 1SK0A 2JACA 3DYRA 4F9ZA 4Z7XA 3RBTA 3HVSA 2O7KA 2KUCA 2VLVA 4XTSA 3VI5A 1HQOA 4HZ4A 2H66A 1SKWB 5EL8A 2VM2A 3D5JA 4FYUA 4ECJA 3BJ5A 1N2AA 5LD0A 4FYCA 4TRXA 1OE8A 2H1AA 4MMMA 4K7IA 5L71A 2HSHA 3RHCA 2AUVA 3E0UA 5A4WA 1GSQA 2L5OA 1FAAA 3L4NA 5AISA 2VCXA 3GNJA 1PL2A 2CAIA 2XC2A 1X9MB 1SL2B 2PVQA 2CA8A 3K8NA 2H8LA 1AQWA 5JCUA 2OE1A 1Z6MA 1YQ1A 3F6DA 1QGVA 2FNOA 2K18A 5CRWA 1N8JA 4XS4B 5HQPA 1T4ZA 1URMA 4MH2A 3FEUA 1B4QA 3ERGA 2GQMA 2GT6A 3HYPA 2AV4A 4IQAA 4BPYA 1BAYA 3NIVA 4KW6A 2HRFA 4O32A 1JZDA 2X8GA 4J57E 2HRNA 5ECKB 1X0RA 1R5PA 4QL9A 5LCZA 2LKUA 3TRQA 5G1LA 1V58A 2RUEA 1ILOA 2OE3A 3GHAA 1YDKA 3P90A 5ABRA 5AGYA 1OC9B 1T3BA 2VCVA 2AB6A 1GNWA 1GLPA 3EE2A 2YJ7A 3UMAA 1GSSA 5KEJA 3ZTLA 1V40A 3TKSE 2AAWA 1U3IA 3QDNA 4ULXA 1SKRB 3DGQA 5D9TA 1ERWA 1EOGA 2MMOA 3UBKA 2YWNA 4MJCA 1F2EA 2X8CA 1SD8A 5F05A 3F9UA 2VL2A 4NHWA 2R5GA 3G9BA 5CREA 4IBPA 1QMVA 1Q98A 2GSSA 3C71A 5ECIB 3F4SA 1CQHA 2LJRA 2YNXA 2OADA 4L0WA 2DJJA 3N9JA 5CRDA 5DJMA 5EY6A 3UARA 1RQMA 3E9JB 2VL9A 1TI1A 2VCZA 3GL5A 3PGTA 1TI3A 1IYHA 2P0GA 1NW2A 3U6VA 2H01A 3VWUA 3IBHA 2WCIA 4HS1A 4ZBDA 3EINA 1Z9HA 3UEMA 3HJPA 4MJBA 5ECSA 3S9FA 2JZTA 2H76A 1XOBA 3QAVA 4F82A 1AC1A 4WKWA 1X5DA 1R5AA 4MP4A 4F2IA 4GSTA 3ZIJA 3HVXA 1VF3A 2TRXA 3KH9A 5FHIA 3W8JA 2ZUPA 1EWXA 2DJ2A 4YAVA 1GL8A 5CP1A 3FR9A 1CQGA 1VGLA 1M2BA 4E8HA 2DBCA 2LUSA 3H4KA 4MABA 4ML6A 5HR1A 3KZQA 2HZEB 2WGRA 1MDJA 4Q5NA 1O85A 1ZMAA 3V1WA 3GMFA 4JEDA 1EGOA 3CXGA 2B5XA 4JR4A 3WGXA 4EUYA 1M99A 3M9JA 2O85A 3CYNA 2JSZA 3TKPA 1GSUA 2YV7A 4TR0A 3ZVJD 4EE0A 1XIYA 2M46A 3ISOA 1H4OA 4HQSA 1HYUA 4MJAA 1Z3EA 2PU9C 1M9AA 5LNKe 1U88A 4BWSA 1JHBA 4GXZA 4O92A 4XIHA 2GSRA 3BCKA 4GWRA 2FUG2 2WRTA 1BX9A 2LNSA 3CSJA 1HD2A 3QD9A 1M7TA 2ON5A 4KX4A 2FA8A 3WGEA 6GSUA 4RQXA 4ZBAA 2RIIA 4KCEA 2H72A 4BL7A 1A0RP 4EXJA 1YF1A 1QFNA 1K0BA 2N5AA 2CV4A 2OACA 3VPQA 3ZITA 4KDXA 1J0FA 3IDVA 4TXOA 4K9ZA 3A3TA 3MAKA 1PX7A 1MD4A 5J3RA 2E7PA 4TR4A 4PQ1A 5D9VA 1HNAA 3TKSC 4LMWA 2F8AA 1M2AA 1BQ7A 4N0VA 4ZB8A 4KDUA 1ZCPA 1TK0B 3L78A 1K3OA 3J7Yk 3ZIVA 1XW9A 4GCIA 3QCPA 2ON7A 4LLRA 2NPBA 3GRXA 1R4WA 2CX4A 3ZFBA 4IELA 1A8YA 5ELGA 2MMZA 1E6BA 1Z5YE 4LL4B 2IJYA 3CMIA 4HZ2A 4WR4A 4IS0A 1O81A 2GVPA 4GSSA 3APOA 1Z7RA 3PH9A 5JWQB 2VCTA 5IO2A 3RPNA 3BCIA 3DXBA 2GSTA 1Y25A 3C8EA 4RI6A 4BWQA 4MF5A 4G2EA 1XW5A 5ECHB 4EC0A 4AJ7A 3VWWA 3ZMKA 4OWYA 1V98A 3HCZA 3DD3A 1TU7A 2EC4A 5IPHA 3L9SA 1K0AA 5DDLA 3LGCA 2C3NA 1XCCA 3QPMA 4JR6A 4PXOA 1GUHA 2DMLA 2KHPA 2DC5A 3IPZA 4DSQA 2XPEA 2LJKA 4XS1A 1J9BA 2X64A 3LSZA 1XZOA 1U87A 1G7OA 1SL1B 5E4WA 2TIRA 2O8VB 2QKEA 3VK9A 3GSSA 3A2XA 5HFIA 1RW1A 1YF0A 2P31A 1TK8B 2HZFA 2QGVA 5AIVA 1V9WA 2R3XA 1XWCA 4KAEA 2LQQA 2KOKA 2MYGA 3EC3A 2JSYA 1MDKA 1F6MC 4PQHA 3J7Yb 3M3MA 4JE1A 3NOFA 2RM6A 5D9WA 2FHEA 2IMIA 3TRPA 2V41A 1OC8A 3ZVJA 4ZIJA 3UIWA 3WYWA 5KN2A 1K0DA 3VWVA 1TOFA 2WDUA 3KD0A 1XVQA 5D8IA 2M80A 5DALB 4HJMA 1X5CA 4GQCA 4I5QA 4YQVA 3VFIA 1TRSA 4K7OA 3FR3A 1H75A 6GSVA 2EIOA 4XS4A 3SWLA 2BTOT 1EOHA 4D73B 1FB0A 3H93A 3Q74A 1DE2A 2O89A 4MZWA 5B8AA 1G7EA 3G7JA 2G0FA 2GZYA 1A2MA 1XBSA 2F3MA 1XW6A 4KGIA 3C73A 3KEBA 2QSIA 1A2JA 4PURA 4WEYA 1PMTA 3CRTA 2OE0A 2FLSA 2V6OA 2XBQA 4IP1A 5ECPB 3EWLA 5IM9A 1PRXA 1PA3A 1FOVA 3CTGA 2J23A 1FHEA 3WGDA 4LA1A 2C0FA 5INYA 3GIXA 2GTUA 3WT1A 1TRVA 3KP8A 2PVOC 1GSFA 3MWHA 3F4TA 3RAZA 4K2DA 2L6DA 2H30A 1UVZA 3RHBA 4IJ3A 1GSDA 2H6XA 5J41A 5CYYA 1EZKA 4OO4A 3UVTA 3LORA 1K0CA 1X5EA 3EMXA 4ILFA 3KP9A 5CRHA 1NHOA 5CAXA 1HNBA 5DAKA 5ID2A 1XWBA 4JZQA 6GSYA 2WJUA 2JADA 5B6NA 1GUKA 2B3SA 1THOA 2VAFA 4DSSB 2WZ9A 4GTUA 1G6WA 3ME8A 5G5FA 4NV2A 1GLQA 2H1GA 4H86A 2O87A 3TJBA 3IE3A 2OBIA 3KGKA 2VOCA 1DSBA 3HA9A 4HI7A 1ACVA 2DJKA 4K7NA 1ZOFA 1X9SB 1M2DA 1K0MA 1XXUA 4EF0A 1EEMA 4ZILA 2H70A 5IQYA 2R37A 2PUKC 4CHSA 4PGTA 1GTBA 1WWJA 4HOJA 2OBKA 2V32A 2NDOA 3L9UA 1OKTA 4ISDA 3FZ5A 4MDCA 4ZL7A 2PERA 1OAZA 4IN0A 5CO3A 20GSA 1ERVA 3QFAC 2HZEA 3MDKA 4DVCA 6GSTA 2KP1A 3TKRA 4O5RA 2PN8A 5G5EA 2B1KA 1ML6A 2F51A 1U3AA 2GGTA 2LRCA 2FWHA 4MA9A 1TRUA 4WF5A 1O7UA 3FY7A 1ERUA 2BJXA 3TCOA 5IMDA 4MPGA 3W8SA 3C1SA 1PX6A 2GS3A 1PD21 2ES7A 3HZ4A 1AAZA 3LJRA 4FYBA 3RPPA 4BA7A 4EKZA 4V2NA 5IPGA 1XVWA 5HFKA 2YWOA 3GKNA 2ZCTA 5DCGA 2E2MA 1FB6A 2FD3A 3CRUA 3VLNA 5G2ZA 4I97A 2K8VA 1AUCA 5D9XA 2YWMA 2KP2A 3OR5A 2YOIA 1SENA 3IXRA 2X99A 4P3YB 3G7IA 2VM1A 1R26A 2AYTA 3TRXA 1UA5A 3IHQA 1U6TA 2WS2A 4HJ2A 4AGSA 2CAQA 2VLTA 3P2AA 3D0ZA 1FG4A 1PKWA 2A4VA 4QQ7A 4POBA 2H71A 4GSNA 4MK3A 1M9BA 1GSYA 2H73A 1I9DA 1ZL9A 1A2LA 4JBBA 3O6TA 3F4RA 4NXIA 2EIRA 2LEGA 3BD2A 3MNGA 4MF6A 1GRXA 3I69A 4K6XA 3NZNA 4DSRA 4L8EA 2K6VA 2L6CA 3GSTA 10GSA 4PUAA 3KIJA 2VO4A 1AQXA 2HNLA 5J9BA 3UL3A 4HQZA 2CX3A 1S3AA 1O8WA 4MF7A 3EU3A 1VRSD 19GSA 1OC3A 5DVBA 4Q5RA 4V2MA 3WD6A 3KJYA 5FWGA 5HR2A 1ERTA 4NAXA 3P7XA 4I2TA 4HDEA 4AJ6A 5H5QA 5JWOB 3TJKA 2XHFA 5GSSA 3ERFA 2IMFA 2V6KA 5DQYA 5IMCA 1IYIA 1FO5A 2YANA 2JU5A 3QOUA 2J9HA 3EMPA 4TXVA 1SD9A 2I1UA 2VIMA 5C00A 1O8XA 2AJQB 3GV1A 5IMFA 3VPTA 3KTBA 1MEKA 3ZMLA 2MZCA 4FIWA 4G19A 3ZLPA 4RI7A 1ZZYA 3IC4A 3QAGA 4KDYA 4YQMA 1KTEA 2FWEA 2K9FA 4O7HA 3DKSA 3HXSA 2H0GA 2JL4A 1WJKA 2OKAA 1QUWA 2DSAA 2PWJA 5F0GA 3UJ1A 1B8XA 1K0NA 2VLUA 4EDZA 4OMVA 3GN3A 1JLVA 4KB3A 1OYJA 6GSSA 2FWFA 2H74A 5DALA 1V57A 3CTFA 2N5BA 2LTKA 4OFTA 5ECRB 3CSIA 1WIKA 1UN2A 4D73A 2NVLA 4JU5A 1SYRA 1NM3A 3QFBC 2KLXA 3N5OA 3IAM2 2L5LA 3KCMA 2MMNA 3DEXA 1GUMA 3TGZA 1F3BA 4X0XA 1W4VA 3D4MA 2H6ZA 5CNWA 2GQKA 1JZWA 1TK5B 2IFQB 1SYXA 5C04A 3KMNA 2B7KA 2Z9SA 1YZXA 3ZYWA 4IP6A 2C0EA 2HI7A 2QC7A 4XRDA 4XHMA 4MLYA 3M1GA 3PR8A 1GP1A 2DJ0A 2IPAA 3IRAA 4BVYA 1JZRA 1T00A 4ZB6A 5GZZB 1T4YA 5IIZA 4GF0A 2VCQA 4QL7A 2TRCP 1GH2A 1YY7A 2VUPA 2B5YA 3DIEA 1A0FA 1PKZA 2CVKA 4PX1A 2CZ3A 4G9HA 4DEJA 1K3YA 2HYXA 3IK9A 4GLTA 3IOSA 4ACSA 3ED3A 2FGXA 3HHVA 4OO5A 3GYKA 3TKSA 1A23A 1OE7A 5ELAA 2DJ3A 2YPMA 4TR1B 4NPBA 2XBIA 1KBNA 5IOWA 1GSEA 3C1RA 1MDIA 1S3DA 4ZB9A 1GULA 5B8BA 5IOXA 4ZL8A 1BJXA 2CQ9A 3TOTA 4WF4A 1JLWA 4XRAA 3LXTA 4DSSA 1TU8A 3GKXA 2YZHA 3TJFA 2GZPA 1TP9A 4KCAA 2K8SA 5IMVA 3GH6A 5CRGA 5IMAA 3A2VA 2GZZA 2N5FA 2HLSA 1AQVA 1ST9A 2DJ1A 4IGJA 4KE3A 1DE1A 2DIZA 1USBA 5J4UA 4X43A 1AIUA 2YJHA 2PMTA 4TKYA 4IHUA 1MTCA 1BG5A 3MSZA 1QQ2A 4G10A 3H79A 2MBTA 4OD7A 5HR3A 3CSHA 4OFMA 4IVFA 3KH7A 3EU4A 1UC7A 5A4UA 3AY8A 2LNTA 5HFGA 1TTZA 4IKHA 4N10A 3TDGA 5ECMB 3L9VA 2JZRA 5ECNB 5J5NA 3F0IA 3GTUB 4HU7A 1B9YC 3W6GA 4MJEA 4HU9A 1OC9A 1XWAA 1TXXA 4YAPA 1NSWA 3UBLA 4HEA2 2C3TA 3ZFLA 2HE3A 1EGRA 4WBJA 2F9SA 2IL3A 1C72A 1A8LA 1W89A 3FR6A 1AXDA 2IWTA 4TR3A 1SK2A 1WOUA 2PPTA 1QXHA 1DBYA 3D4TA 3I43A 2IMEA 2RM5A 1GWCA 3E3EA 1SK1A 3LXZA 1KEBA 4GQFA 1XFLA 5D73A 4YQUA 5DQSA 1PN9A 3APQA 4I8BA 2L57A 2C0DA 4K8MA 6GSWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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