2CESA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with glucoimidazole
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
443
structure length
440
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKEEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural, Kinetic, and Thermodynamic Analysis of Glucoimidazole-Derived Glycosidase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 177
structure length 440
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cesA00
2DIJA 4HOXA 2VZVA 1E6NA 1GW1A 1I75A 1EH9A 1B3ZA 2YKKA 3CUFA 5KEZA 2YDQA 3T2OA 3LMYA 3WFLA 2VNCA 4J28A 3VGHA 4GI6A 4HPGA 1JI1A 2J79A 1K9TA 1H49A 3QR3A 1WB0A 1VB9A 3SUSA 3WDQA 3WIJA 5FIPA 1XRVA 3MUY1 1GQJA 3KEHA 4FLRA 3KE0A 4W5UA 4D1IA 3WBAA 2ZIDA 2ZICA 2G3JA 3GH5A 1GCYA 2ZXDA 2ZUTA 1E6XM 4DUWA 1LWHA 3L4VA 4MB4A 1B9ZA 3AXHA 2EBNA 3W29A 3AYSA 3TA9A 5A95A 5A8PA 3VM5A 1UR1A 1CXHA 4PMXA 1KXQA 2PBGA 4H2CA 3VIOA 1ZBCA 3W26A 2E8YA 2JF7A 5HPOA 3MMUA 4PMNA 1JFHA 3VO0A 3BAIA 3W4RA 4CD5A 1TFVA 4L4PA 5HPCA 1GVIA 3TTSA 3EDKA 1ZJAA 1KGWA 3I3BA 1OT1A 3ZMRA 1WNOA 3N15A 3CGTA 4JFUA 2C7FA 4ATWA 4J3VA 1I1WA 3OLIA 1U30A 1V0MA 5CGTA 4PN2A 1VFUA 1QPKA 1V6XA 1V08A 1LL4A 2D0HA 3AIWA 1B3YA 3WF0A 1W1VA 4CD4A 1GONA 3WH7A 3GXDA 4AC1X 3L4UA 3VNYA 1QI4A 4PMDA 4TVCA 3OIHA 1CBGA 1F4HA 1E6ZA 1JL8A 1FHDA 1K9FA 2IXVA 4KWUA 4XB3A 3ZR6A 1UKPA 4ATLA 5AY7A 3CZKA 1HJSA 5C8BB 1HP5A 1W3HA 3F5JA 2PC8A 3FHQA 3GDBA 4N0RA 1DWGM 2NT1A 3AIVA 3MMWA 1DWFM 1UZ1A 1QHOA 1GNXA 1C8YA 4AIOA 1CXIA 1GPFA 4RE2A 4TX8A 5D8ZA 1SYTA 1CXFA 3DYMA 1H0IA 4QCFA 5D8WA 1TG7A 2VZSA 3NSMA 1C92A 3WNOA 4MB3A 1UKOA 1MW1A 1KCKA 2CETA 2WHLA 1JDDA 2J25A 3SCQA 3KL0A 4MNMA 5AC5A 2WAGA 5I24A 2BXZA 3ARWA 3AS2A 3FXYA 1DWHM 2VT0A 1JYXA 3IANA 3BGAA 2XVKA 3NUKA 5HBFA 4E8CA 4IUGA 2J4GA 1PX3A 2X2YA 4PSPA 1R8LA 5IHSA 1K9DA 2V38A 3IAPA 3W28A 3WH9A 4CU6A 3WBEA 4AEEA 1TVNA 3WDJA 3VIFA 4P7NA 5FOOA 2VJXA 2EPKX 1LL6A 2CHOA 3FHAA 5JIPA 2DSUA 4UCFA 5A6SA 1V6UA 2JEQA 3QOKA 2TAAA 1VEMA 3POCA 3PBGA 5ABGA 4GO9A 2ZXQA 1B1YA 3B9EA 4D6CA 1KGUA 5CPTA 3S2CA 2A3BA 4JIEA 4UQEA 4ATDA 1AQ0A 3A4AA 2W67A 4TVDA 5A2CA 3IJ7A 1Q6GA 1WZKA 5I6SA 2O9OA 1OIFA 4MB5A 4DWSD 4D6JA 4X0VA 2F2HA 3AHXA 5F7UA 1XHGA 1BFNA 4GZIA 3AHZA 2WZHA 3SURA 1UWQA 3PTMA 2WVTA 5JIWA 1HNYA 1VEOA 1UR2A 1Z32X 4YHGA 5E0CA 1XH2A 3OA5A 1U33A 3A6OA 3EMZA 3VIJA 1G9HA 5TD4A 5M03A 4GINA 1V6WA 4M24A 4CVWA 2W63A 1HKMA 3VD7A 4AMCA 2EO7A 4M29A 1ZL1A 4EKJA 2XG9A 2UWFA 2XFYA 1JXKA 1UWTA 1MW0A 4WJXA 1QOXA 1GVYA 1OCQA 1LG1A 2WMHA 1BG4A 3AMDA 4EAMA 1KBKA 2A3HA 5BROA 2XTKA 1BF2A 3HMCA 1E3ZA 3VX0A 1MWOA 5BRQA 4CCEA 2Y8KA 1UKQA 1IT0A 2WSPA 1A3HA 4RL3A 1ZU8A 5D9OA 1WZLA 3VIIA 1UR9A 4HU8A 2J7BA 4MDOA 4L4OA 2FH6A 2WLYA 4UR9A 2WMIA 4UFMA 3WH5A 1W3LA 2WYSA 1QBBA 4GO8A 3BMVA 1UWUA 3DYOA 4DM2A 2YOCA 1GJUA 3QHNA 1BYDA 1HL9A 4J3TA 4LYRA 7A3HA 1CECA 1J12A 5M17A 4B16A 4HPHA 2O9PA 2J7GA 3ZT7A 3AXXA 1UD4A 2BVYA 1WO2A 4CN6A 1AQMA 2ZUMA 2RGLA 3T0BA 4HZ7A 3WF1A 2YDSA 5A8NA 5D9MA 3AIBA 1NP2A 3AIUA 1VBRA 2BY1A 3M07A 4U3CA 3PZVA 3CUIA 4KRTA 1EO5A 2CIPA 2GDVA 2FDMA 2WSKA 2WKLA 2D3LA 4MPKA 1H3GA 5CSYA 1JD7A 1CXEA 1KXHA 5JUVA 1IV8A 1XH1A 2WMIB 3ALGA 4AXNA 2CBVA 2EJ1A 1CGVA 3VNZA 3K1DA 2BVDA 1QBAA 5C71A 4GZJA 3ZR5A 4AZGA 1V6VA 2WC4A 3MUIA 3WUEA 1H0GA 2FGLA 1E4IA 4JFSA 4B3KA 1E55A 3WDPP 3IK2A 1V0KA 1DP0A 1TVPA 3TOPA 3PZQA 1VRXA 4TXEA 1HJWA 3RILA 3T09A 2WPGA 4ZE5A 3OB8A 1RP9A 4JHZA 1QNQA 3DYPA 3VX1A 2V5DA 1BAGA 1OSEA 1BHGA 2VC9A 2OYKA 1X1NA 2E4TA 4Y7EA 2EQDA 3VILA 2WLZA 3MO4A 5GNZA 3WN6A 4MTVA 2OWCA 2PWFA 2ZUUA 1NWSA 2WVVA 4FF5A 4D1JA 6CGTA 3B9AA 1WZMA 1PX8A 5JBDA 4WLCA 2C0HA 1M03A 1ISYA 4AZ6A 1CWYA 1CEOA 1WKYA 2XWEA 3GXFA 3RJXA 3ZJKA 1GQKA 1BTCA 3A4WA 2V3EA 1W32A 4HP5A 1E15A 2VRKA 2VX5A 3ARXA 1PIGA 4UZUA 3ZM8A 4AEFA 2DDXA 1E40A 5CGMA 4MB1A 3VKKA 2DT3A 4UFJA 2E8ZA 1LF1A 4PMYA 2J8FA 1W1PA 3L4ZA 1UD3A 4BQ3A 5DT7A 1AQHA 1UWIA 3VU2A 1WDQA 3BAYA 4AD3A 4Z2HA 1E1EA 2O9TA 5CPQA 4HZ6A 1W9PA 3AFBA 2D3NA 4JHOA 1UZ4A 2XUCA 2BVTA 3II1A 4PMVA 2DPEA 2AMGA 3AZTA 4ZENA 2GSJA 1X6LA 4U2YA 1E0VA 1WZAA 5A6AA 4BQ5A 1TZ7A 4IM4A 2D24A 5EMYA 3WQ6A 3WD3A 4MAVA 1E0XA 1MYRA 3VGGA 1JZ3A 1VF8A 1OGSA 2VCAA 4B15A 2E40A 2OWWA 1V02A 4PUDA 1KCLA 4W93A 2ZX8A 2YBUA 1VJZA 4PTMA 2XJ7A 1DWAM 1CDGA 5HNNA 3GBEA 2YLLA 3W6LA 3ARRA 5IFTA 2XSBA 1L0PA 2XGIA 1MW3A 4CCCA 5EFFA 1J0ZA 1E5NA 2CHNA 1NARA 1JNDA 3WENA 2CITA 3AQUA 1JYVA 5AC4A 4UQDA 3WD0A 1W3JA 3EDDA 1BGAA 2J74A 3PZUA 3APGA 5FD0A 1UQYA 3THCA 1ZS2A 3QHOA 5ABFA 4JZ5A 7TAAA 2NSXA 2VX4A 2QLYA 2G3MA 3VMOA 2AAAA 2XFRA 1JAEA 1QW8A 5CPSA 3N11A 4AY1A 3ARUA 4DWSA 4JCMA 2CCRA 5CLTA 1OINA 3VIGA 1E4MM 2Y24A 4BCEA 5I0DA 2J77A 3SCRA 5HDRA 1EO7A 1V02E 4KGLA 1H4PA 4PCSA 1HXJA 3GNRA 4B9YA 4QDMA 5A8MA 4NZCA 4Q7NA 3WEOA 3EDEA 3PZ9A 1VBUA 2PWEA 1BGGA 3MSDA 1VFMA 2GJRA 1CYGA 4J3UA 4D71A 3AISA 5FL0A 6A3HA 1KQYA 1YHTA 1FH7A 3MSGA 2J62A 3W25A 1BSIA 2W4XA 3WD1A 3WFZA 2D22A 4DWSB 2GUYA 5E09A 3WDHA 1BVZA 5IFPA 1HP4A 4W89A 3MKKA 3ZJ7A 1ISXA 1SFSA 5E70A 1EA9C 3VIMA 3ZJ6A 1EHNA 4S3JA 3WH8A 2WCGA 1VJSA 4D6HA 3AMLA 4WKFA 3BXWA 3RIKA 1W9UA 4QFUA 1EQPA 5GPRA 4XV0A 2CBJA 4NF7A 4KH2A 3G6MA 4PCTA 4C7DA 2J7DA 3I3DA 4M80A 1WE5A 1O6IA 2EPLX 4W84A 2X0HA 3VIKA 4H8UA 4UOQA 4OOZA 3TTQA 5HOSA 1ZJBA 3VGDA 4K68A 2FH8A 4HMCA 3SCSA 4W8AA 3CZEA 3ZSTA 2NT0A 4P8UA 3BLKA 3HN3A 4W8LA 4J7RA 1W9VA 5GNYA 1HVXA 2XVLA 5LYRA 3QOMA 1E1FA 2V5CA 3GBDA 3WNKA 1NP0A 4Z2KA 1KR0A 1B2YA 3I3EA 4JKMA 1CTNA 2XYLA 1HJUA 3AS3A 3T08A 3NDYA 4PUEA 3UEQA 4W8BA 1MXGA 2WWCA 4E4PA 1E5JA 4KRUA 3CZ8A 2XVPA 4E8DA 1AMYA 4PMUA 3BSGA 2XWDA 1C8QA 3IJ8A 1BPLB 3DHPA 4H7VA 3B8SA 2DEPA 3J7HA 8A3HA 2CESA 2WZEA 1R86A 4QAWA 4GPNA 1E6SM 2QPUA 3RMEA 3GTNA 4H41A 5I78A 2IXUA 2YL5A 4AD0A 1OBAA 4HTYA 3KL5A 2YDRA 3VMPA 3N12A 2X1IA 2YA1A 2GJPA 2YBTA 4MNLA 4XUYA 2E9LA 2MANA 4UOJA 3RM9A 3SUUA 5M3WA 1V3HA 4PTVA 2D0FA 3WNPA 2YIHA 5BWFA 1E6QM 3N9KA 3MANA 2UY3A 1UOKA 1XCWA 2DT0A 2G41A 1HT6A 2VURA 3VD3A 3ZQ9A 3CMJA 5DF0A 3K8MA 4JFTA 1JXJA 2VZOA 3MV01 4FLQA 4UFHA 2XIBA 1WDPA 4PTXA 3L2LA 4JFWA 5I5RA 1UA3A 1UWSA 1XGZA 4WF7A 1CGWA 4UZSA 4AW7A 4QCEA 1GOWA 1GOQA 1HN1A 1V3IA 1ODZA 1OT2A 2BV9A 1E0WA 4AD4A 1UR8A 1KXVA 1KGXA 4A3HA 3T0AA 1P6WA 1B3WA 3FY1A 3ECQA 3QHMA 4HA3A 4ZFMA 4Z2JA 3RPMA 4TTGA 4LPCA 4PMOA 5LA1A 2JEPA 3CTTA 4LGXA 1JZ6A 1LLOA 4AD1A 2AOSA 4UFKA 1ITXA 4NRSA 4P7LA 4WKHA 2UY5A 3W53A 1UD2A 3BMWA 4WKAA 5I2UA 3VOCA 1V0LA 4V27A 1E3XA 1FP8A 4AIUA 4LYQA 3JUGA 1IZKA 1Q6EA 2XVGA 3OGVA 1PBGA 1QI5A 2WKGA 3GYCA 4IISA 1KQZA 3PTQA 2QPSA 3ARSA 1GOMA 4J27A 1G5AA 3UERA 1B30A 5DO8A 2ZX9A 1M7XA 5DMYA 1U2YA 2DH3A 3OLGA 3WUFA 1J01A 2BXYA 1NWUA 1QW9A 3D5HA 1FFRA 1EGZA 4P8VA 3VIHA 2ZXBA 3N04A 2D23A 1HL8A 3VDCA 3VDAA 1JNEA 1JG9A 3WMCA 4W7VA 2GK1A 1SMDA 4W5ZA 2QMKA 1E43A 2XM2A 3VINA 3VVGA 2E3ZA 1HJXA 4ACZA 2O9RA 4CD8A 3ZO9A 3WH6A 2OSXA 1HIZA 3PZNA 2XVNA 3N17A 5BRPA 2WANA 4XX6A 1Q6CA 2WHMA 4Q22A 3SCNA 1LG2A 1WCGA 4XZBA 4PSRA 3MS8A 4AZCA 2VMFA 3ZIZA 3KZSA 1FP9A 1H1NA 4JL2A 2VX6A 1CNVA 2WBGA 3CZGA 1E70M 4U5KA 3A47A 1QI2A 4NRRA 7CGTA 1RD6A 4ZXLA 1PIFA 3ARZA 2GK1B 2YJQA 1E6PA 1G01A 1FOBA 3THDA 2G8ZA 3EDJA 2XSAA 5A6LA 4ACZB 1UD8A 1W91A 1GZJA 4NI3A 2XIIA 2ESCA 1KFWA 1ISZA 1QHPA 4BA0A 2J78A 3W82A 3UR8A 3VD9A 4LQ1A 4UQBA 1E4NA 4A4AA 1JD9A 1E4LA 3CMGA 4P8XA 5A8OA 1XSJA 5A6BD 2ZX6A 4GKLA 1LL7A 3WEZA 1J0JA 1EDTA 1PPIA 4AZCB 3IJ9A 4MAZA 2A3CA 2WW5A 4ZEPA 2V3FA 2VQUA 3KL3A 1RPKA 1R87A 3EMCA 3ARYA 3UG5A 3KWXA 2YLAA 1FFQA 2VZUA 3UESA 1BVNP 3BAKA 2DT1A 2GDUA 1H11A 2DGAA 4U5IA 3ZT5A 4FLSA 3W38A 4WK9A 2Z1SA 3WNMA 2WC7A 4J3SA 4AZHA 1BYCA 1ISVA 3UR7A 3AMGA 1UA7A 3WDRA 1TCMA 2W91A 3PZGA 5BYWA 2GFTA 1ISWA 4PMRA 5I79A 4LXFA 1UG6A 2YL6A 1UUQA 3SCWA 3RM4A 4OUEA 1MVYA 2WNWA 3RO8A 3UG3A 3AICA 1VIWA 3GNPA 3EDFA 4CU8A 2WXDM 1JYWA 2G3IA 2BHYA 5DFAA 2QF8A 2OYMA 4AISA 4LYPA 1HVQA 4WSJA 9CGTA 2ZUNA 3VM7A 2BY3A 4AD2A 4EE9A 3M7SA 3U5UA 2CXGA 1EQCA 3O6AA 1ZBKA 4HMDA 2VVSA 3O9NA 1AVAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DIJ A;  4HOX A;  2VZV A;  1E6N A;  1GW1 A;  1I75 A;  1EH9 A;  1B3Z A;  2YKK A;  3CUF A;  5KEZ A;  2YDQ A;  3T2O A;  3LMY A;  3WFL A;  2VNC A;  4J28 A;  3VGH A;  4GI6 A;  4HPG A;  1JI1 A;  2J79 A;  1K9T A;  1H49 A;  3QR3 A;  1WB0 A;  1VB9 A;  3SUS A;  3WDQ A;  3WIJ A;  5FIP A;  1XRV A;  3MUY 1;  1GQJ A;  3KEH A;  4FLR A;  3KE0 A;  4W5U A;  4D1I A;  3WBA A;  2ZID A;  2ZIC A;  2G3J A;  3GH5 A;  1GCY A;  2ZXD A;  2ZUT A;  1E6X M;  4DUW A;  1LWH A;  3L4V A;  4MB4 A;  1B9Z A;  3AXH A;  2EBN A;  3W29 A;  3AYS A;  3TA9 A;  5A95 A;  5A8P A;  3VM5 A;  1UR1 A;  1CXH A;  4PMX A;  1KXQ A;  2PBG A;  4H2C A;  3VIO A;  1ZBC A;  3W26 A;  2E8Y A;  2JF7 A;  5HPO A;  3MMU A;  4PMN A;  1JFH A;  3VO0 A;  3BAI A;  3W4R A;  4CD5 A;  1TFV A;  4L4P A;  5HPC A;  1GVI A;  3TTS A;  3EDK A;  1ZJA A;  1KGW A;  3I3B A;  1OT1 A;  3ZMR A;  1WNO A;  3N15 A;  3CGT A;  4JFU A;  2C7F A;  4ATW A;  4J3V A;  1I1W A;  3OLI A;  1U30 A;  1V0M A;  5CGT A;  4PN2 A;  1VFU A;  1QPK A;  1V6X A;  1V08 A;  1LL4 A;  2D0H A;  3AIW A;  1B3Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1WZM A;  3C8F A;  1XI3 A;  5FEP A;  2CC0 A;  2C0H A;  3MUC A;  1ISY A;  4IJB A;  1CWY A;  3RJX A;  1IEW A;  3KBM A;  1E15 A;  2VRK A;  2HNH A;  2VX5 A;  2ODO A;  2ZFA A;  4O19 A;  3FOK A;  2GSE A;  4MB1 A;  3VKK A;  3G1S A;  4UFJ A;  2E8Z A;  2PCQ A;  2J8F A;  3EEZ A;  4HA0 A;  3RR4 A;  2ZZ7 A;  2PRL A;  3VKB A;  1H1Y A;  4K6A A;  2O9T A;  2FDS A;  5CPQ A;  2QCM A;  1FX6 A;  1W9P A;  3AFB A;  2VWT A;  3B8T A;  1KFL A;  4FIQ A;  4HCH A;  1XLA A;  2BOD X;  2E25 A;  2AMG A;  3G3D A;  3EOS A;  3TYZ A;  4I7U A;  1W1A 1;  2E6F A;  2YSW A;  2EGZ A;  2A2I A;  1RBO B;  2Z27 A;  2QGY A;  2Z29 A;  1MYR A;  1VF8 A;  3LUT A;  7ODC A;  4NZ3 A;  4B15 A;  4CEU C;  5I07 A;  4B5T A;  3BLF A;  3GQY A;  4PTM A;  3GBE A;  4HB7 A;  1ZUA X;  3ARR A;  4QS5 A;  3N4F A;  4ZB0 A;  2XGI A;  5CCZ A;  3KBW A;  2V5B A;  4AUB A;  2AMX A;  4UTI A;  2CIT A;  2O55 A;  2BAS A;  1AMK A;  5AC4 A;  3T55 A;  3EDD A;  3PZU A;  2P0I A;  4HN4 A;  1UQY A;  4FPS A;  1ZS2 A;  3QHO A;  3THC A;  5ABF A;  2HCV A;  2NSX A;  3MPG A;  2FVL A; 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