2CIPA

Structure of the michaelis complex of a family 26 lichenase
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
276
structure length
273
Chain Sequence
SGLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAQFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Substrate Distortion by a Lichenase Highlights the Different Conformational Itineraries Harnessed by Related Glycoside Hydrolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE H
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 110
structure length 273
sequence length 276
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cipA00
4HPGA 5IHSA 1NWSA 1OWQA 4LYRA 5D9MA 1HJQA 4CN4A 5DF0A 2EBNA 1KGWA 2J7CA 3BAIA 4NZCA 1WNOA 1B3VA 4J28A 1G0CA 3EMCA 3WD4A 3L4TA 3N1AA 1BGAA 4Y7EA 2J7GA 1UZ4A 3WENA 3VIKA 1EOMA 5DFAA 2QPSA 3OZPA 1WP6A 3WQ8A 3BAWA 1KXTA 2G4FA 3MMWA 1W9DM 1SMAA 4NF7A 4J3TA 4AZ5A 2XVLA 3TTOA 2W62A 4PMUA 2WMKA 4UOZA 4PMVA 5ECUA 3RM8A 4AIEA 1KWGA 1TE1A 4UFKA 3N12A 1UR8A 2V5CA 2E9MA 1G01A 1TUXA 4HA1A 2FHCA 3BAXA 1I1WA 2VO5A 1E3XA 4W7VA 5EBAA 4HMDA 5AYBA 1AQ0A 5EFDA 1X1NA 3ALFA 4WKFA 1YQ2A 4H41A 1KFWA 3GH4A 4UZSA 1WO2A 3BMVA 1E4NA 3AISA 4RE4A 1B31A 3NCOA 3PZVA 1TR1A 3ZSSA 3W53A 4GQRA 4UOQA 1W9BM 1E15A 2W66A 1QHOA 1OBAA 3CZGA 4HU0A 4X0NA 4CD4A 1GHRA 1HKMA 2WVUA 3QHOA 4Z2GA 4D1IA 3VKKA 3AXXA 3POCA 3VD7A 1EO7A 3K4DA 2OYKA 1JFXA 3ZJKA 1BYDA 2J77A 4W86A 5E6ZA 2B31A 5LYRA 3WH5A 4U2ZA 5JIPA 2BHZA 2VZOA 2VQUA 1E70M 3N04A 3VILA 4BS0A 1VFFA 2VCCA 4PUDA 4PMYA 5A2CA 1JDDA 1BG9A 1BLIA 2E3ZA 5BRPA 3UG4A 1V0NA 2O9PA 4AEFA 3D3AA 1V3KA 2D1ZA 4M82A 5KZ6A 4PUEA 2WYSA 2BFGA 2WZHA 1E71M 1NWRA 3AIQA 1E0XA 1GQJA 3UG3A 2WHKA 4IPLA 1NOUA 1V6XA 4MAVA 5JBFA 1B2YA 2XVKA 3W24A 2JEPA 3IJ7A 1H0GA 3VGGA 1C8YA 5C70A 1L0PA 3T2PA 1V0MA 1YHTA 5CGTA 1CZ1A 1UR0A 4IM4A 4AYSA 4E2OA 1CYGA 3J7HA 3MUZ1 3CZLA 3G6LA 4GO8A 2EPKX 5CPQA 1B90A 2XM1A 4UTFA 1GVYA 3EDKA 4P7RA 3ARRA 1IT0A 3OLDA 5CSYA 1GZJA 1UKOA 2VCAA 1LQ0A 1I75A 3AOFA 1JZ6A 5ABEA 1JXJA 1WDPA 4W7WA 4ML4A 4TXEA 3WD3A 4DUWA 4DM2A 2XWEA 4MJ2A 1F4AA 4PCTA 4D6IA 1W3JA 3WUGA 3VNZA 3WD0A 3MMDA 4F66A 5A8PA 3UEQA 2VJXA 2WW5A 3CBWA 2YJQA 1CGVA 1CGUA 4IUGA 3WH6A 1GNXA 5BWFA 2YDSA 3OLEA 3JUGA 4PMNA 2RGLA 1HL8A 2X1IA 4W87A 1UH4A 3TOPA 3K46A 2UY5A 5AY7A 3MKKA 1PX8A 1DWHM 5C8BB 3PZOA 4PSRA 3O2LA 1U30A 3BAJA 2G3NA 1J0KA 4WF7A 1K9TA 6TAAA 4W8AA 3GZAA 4JHZA 3CZJA 3N17A 1HXJA 1R87A 3KE0A 3AMLA 4M8UA 2C8NA 2E9BA 3ARPA 1H11A 1IZKA 3GXFA 1HJVA 2V38A 3AHVA 2DSVA 4EKJA 1W1YA 1VF8A 1UR2A 1W91A 4AISA 4JFTA 3WDRA 4D6FA 3BCDA 2GVYA 2EO7A 4AD1A 2AMGA 5A94A 3OBAA 2CERA 4PTMA 1J9YA 1ZU8A 1KXHA 1LWJA 1V3HA 1XH1A 5KEZA 3PZMA 3S2CA 3WQVA 1EIBA 1CNVA 4YPJA 2EQDA 1UUQA 5BXRA 2Y8VA 1ECEA 4OOZA 1NOWA 4Z2LA 1H41A 4UQBA 1R7OA 1G9HA 3HJEA 3PZQA 1VBRA 4JFWA 1CBGA 4OZOA 2Y8KA 1UKPA 2XFFA 3VIIA 5I79A 2QF8A 2W91A 1W3LA 1QBBA 4AZCA 4FF5A 2ZWZA 4QLKA 4B3KA 2C0HA 4HZ8A 3K8LA 3K1DA 1A3HA 2CBUA 3CZKA 5CJ5A 4RE3A 7A3HA 1KXVA 1BPLB 1EA9C 1JD9A 3I3DA 4M29A 2OWCA 5ABFA 3VIHA 3WL0A 3L2LA 2D22A 3WBAA 1V3JA 4MB1A 4P8VA 3W6LA 5BROA 5DT5A 3CGTA 4HOZA 3LPPA 4M80A 2BHYA 1W3KA 4F8XA 5DO8A 4M56A 3VDCA 4H2CA 2VRQA 3LPOA 4XB3A 4B3LA 1CXKA 1V3MA 1EH9A 1NP2A 2BVYA 2E40A 3VDAA 3WH8A 2D3NA 4U3CA 1E6QM 4XX6A 1HJXA 1NOFA 1LG2A 3TTQA 4JL2A 3MO4A 3U57A 2AOSA 3A6OA 1MQPA 3OGSA 3VGHA 4BQ2A 2Z1SA 1ITXA 5E9AA 3EMQA 4MPKA 4S3KA 3L4XA 1GOIA 3BH4A 1DWAM 4EANA 2XM2A 1C92A 3ARXA 2CBJA 3AIUA 1HKIA 3FHQA 1ISWA 1PPIA 5D4YA 3O9NA 1VBUA 3B9AA 2F61A 3M46A 1UWUA 1RP8A 3MUY1 8CGTA 1ZL1A 1UOKA 4MB5A 5FCZA 2PWFA 4CU6A 2ZUTA 2XFYA 2XSBA 2EPMX 4H8UA 1BFNA 1H09A 4CU7A 5A1AA 2DSZA 5E0CA 3L4UA 5BXPA 3GDBA 4F9JA 3KWXA 2VRJA 1J18A 1JFHA 2JFEX 3K8KA 4JIEA 4JHOA 4Z2IA 2O9RA 3AHTA 4V27A 4X0VA 1ODUA 1QVBA 3GYCA 4CKQA 1BYAA 5CGMA 4LYQA 3AS1A 3W81A 1FFQA 1HVQA 2V3EA 2BY1A 3PTMA 4H04A 1FOBA 3W82A 5EB8A 1WDSA 2PBGA 2YIHA 2CESA 2X09A 3NDYA 3SCVA 5I3DA 1C90A 2WM0A 2WB5A 1XRVA 3N13A 3GXDA 2J62A 4GZIA 2J8GA 1KB3A 2UY4A 2DT2A 4B15A 4Q7NA 1H4PA 1J11A 1CWYA 1B30A 4CD7A 1DP0A 1R8LA 3OIHA 1EHNA 1KCKA 3AROA 3SCTA 4P8UA 2CXGA 5HNNA 1XH2A 2CNCA 3WMBA 1JZ7A 1HKJA 2X2YA 4PTWA 5E0FA 2J25A 1E40A 1LL6A 5E70A 3W29A 1ISXA 4JL1A 2VCBA 4PCSA 1Y7VA 3I3BA 3VX0A 1X6LA 2D0FA 4D6JA 4UFIA 2WNWA 3GBEA 2GDUA 2YKKA 3AIWA 2E9LA 2J78A 1AQHA 4MTVA 1ZJAA 4OJYA 1E6NA 1TVPA 4FLQA 3WH9A 1KWKA 1M04A 3RPMA 5IDIA 2VR4A 2BNJA 3E1F1 3U5YA 2VX7A 3WQ6A 4FLSA 3ZT5A 4GI6A 2V5DA 5A6KA 5A8OA 1WPCA 1E5NA 2VOTA 4PRWA 1HIZA 9CGTA 2ESCA 2Y24A 5I78A 4AD3A 5I6SA 1PX4A 1NQ6A 2OSWA 2XHYA 4JKLA 1JI1A 1C91A 1JGIA 1KR0A 2Q8XA 1FH9A 5TD4A 1FH8A 1CXLA 4GPNA 2WSKA 3GTNA 1UWSA 2VQTA 4MB3A 3CUFA 4CVUA 3QR3A 4PN2A 2PI6A 4MADA 2BVTA 4BF7A 3WDHA 3WNLA 4MJ4A 4DWSB 2E8YA 3GNRA 4UFLA 1E55A 2CPUA 1QI3A 4J3WA 1OT2A 1B3ZA 4DWSA 2AAAA 3QGVA 2A3CA 2NSXA 3AHYA 1E6ZA 1GUVA 3W0KA 2J7FA 3WMCA 1B9ZA 4GKLA 1MXDA 2XPKA 2QLYA 4PEEA 1VJSA 1J0YA 5D8ZA 1UA3A 1V0LA 3MV11 1U33A 2CKSA 1HJSA 2F2HA 5A95A 4W88A 4CN6A 2MANA 1UA7A 4JCMA 2YA2A 1P6WA 1NP0A 1MFUA 4UQAA 5JIWA 1MFVA 5CG0A 3BAKA 3WDIA 4X9YA 3OLIA 1BYBA 1OB0A 1VAHA 3VVGA 2IXUA 2FHBA 4LX4A 4UFHA 3SUTA 1OINA 3DYMA 4MDOA 2DH3A 3WNMA 2VR5A 3TTSA 4JCLA 1GCYA 3CZ8A 1NM9A 1UD3A 1UR4A 1VEPA 2VZVA 4NSBA 2D20A 4W5UA 3RJXA 3WEOA 1B3WA 4GO9A 5CPTA 3CHFA 4W7UA 4BZYA 3T0DA 3WDQA 3ZQ9A 1H5VA 2Y5EA 3UG5A 4AZBA 5JBEA 1CPUA 1G5AA 2VVSA 4HPHA 3BCFA 3VGBA 5FKYA 6CGTA 3PN8A 3MSDA 5A6LA 1JG9A 3MANA 2Z1KA 2X0HA 3WDJA 2WBKA 1US3A 4C7FA 1OGGA 1JD7A 4DUVA 1QI0A 3AMDA 4PMQA 1TCMA 1FP9A 2GJXB 1HNYA 1XSKA 1HL9A 4ZXOA 2OYMA 2XUCA 2JALA 1J0IA 1LL7A 1PEZA 1GVIA 2GJXA 3SCWA 2YDRA 2CHNA 2OYLA 4LXFA 1MYRA 2VI0A 2WZEA 3NSNA 5GNZA 2VNCA 4AXNA 1XCWA 2DDXA 3SEPA 1E6RA 1N82A 2Y2WA 2WMJA 3KZSA 1DEDA 4FLRA 4KRTA 2PWDA 1ISZA 3BSHA 1GJUA 2WMIB 3BGAA 2X8RA 1UD2A 1E1FA 3DECA 1VENA 4CUCA 4OBSA 4PYSA 4AWEA 4QCFA 3ZO9A 3BC9A 2WCSA 2WMIA 5GNXA 5ABGA 1DWIM 4CD6A 4TX8A 1UD8A 1VFOA 3NYDA 3WFZA 4OBRA 4MDPA 2WANA 3VGEA 3WD1A 3L4VA 4W93A 2BHUA 1HX0A 5A2BA 3QOKA 2WBGA 2DSKA 3NSXA 1TFVA 1TZ7A 1XYZA 5C71A 2VRKA 3CUIA 4B9ZA 1BG4A 3BLKA 2F8QA 1ZJBA 4GQQA 3AS2A 4TVUA 4HOXA 1V6VA 4NRRA 5A2AA 1QBAA 1GQIA 3ALGA 1B0IA 3VPLA 3VD3A 4MNMA 2IXVA 5D9PA 4JFVA 3WUFA 4W84A 1ZBCA 4Q22A 4AIOA 1EDQA 1O6IA 1CGYA 1G1YA 3G6MA 1KBKA 4U5KA 1CLXA 2OSXA 2A3AA 1WDQA 1H2JA 3GNPA 1J0HA 1QNQA 3VIJA 3DHUA 3WFLA 4CCEA 3NIYA 2GFTA 1J10A 3A4AA 1HP5A 1OT1A 1E0WA 2BY3A 3CTTA 1ITCA 1XD0A 4GI9A 3TP4A 1OIMA 1JAEA 1W1VA 2HVMA 2J7HA 4B9YA 5BCAA 1GQLA 1CXEA 4PSPA 3RM9A 3VIOA 1VEMA 1Q6DA 4UQCA 3U7VA 4A3HA 3PZIA 2XWDA 3IJ8A 1H0IA 4TOQA 4AZIA 2W4XA 2YLLA 1UG6A 3POHA 3WQWA 2WHLA 2A3HA 1ZBKA 2GSJA 3N18A 4ATLA 3FW6A 3VINA 1E6PA 1BQCA 1EOKA 3ZT7A 1V3IA 2G3IA 4ZENA 5LA1A 7CGTA 5HDRA 1KGXA 1KCLA 2VZSA 1UKTA 3IJ9A 3NJ3A 4TVDA 5E6YA 2VVNA 3FAWA 3AYRA 3ZIZA 4GXPA 3PZUA 2CKRA 4WK9A 4IISA 1W1TA 2WHMA 3W28A 1CLVA 3WF1A 4EK7A 4HU8A 3ZM8A 1JIBA 5FL0A 1E43A 1MW1A 4DM1A 3GXIA 3TTYA 4E8CA 4CU8A 1US2A 1MQQA 2UY3A 3PZGA 3VUPA 3AYSA 4AZCB 3PZ9A 1XH0A 3ZJ8A 2X05A 3SCRA 4B16A 3VIPA 4HZ6A 3U7BA 1JYNA 3KEHA 1H3GA 4MNKA 3AMGA 3VDBA 4IPNB 1E73M 4GIAA 1OM0A 2J75A 1XCXA 4MAZA 5ABFB 3VIMA 4D6EA 2XGIA 4BQ4A 2ZICA 3WQ4A 1BVZA 3VM5A 2G3MA 4JKKA 2WC7A 4UQEA 4JAWA 1BF2A 1E6SM 1W32A 1UD4A 2XGBA 1KGUA 1OSEA 3WH7A 4AC1X 4AY1A 3OGVA 1EQPA 1UHVA 3PTQA 3SUSA 5AC4A 3EMZA 1QHZA 1W2PA 5FOOA 4DUXA 1DWGM 1K9DA 2VX4A 4BQ5A 3OZOA 1WAWA 3WF4A 2PC8A 4KGLA 1EDGA 1E4LA 1E9LA 5I2UA 2OLHA 2VZTA 1R86A 4P7LA 3D5HA 1PIFA 1WCGA 3VD9A 3UR8A 2QMKA 4JZ5A 3SUWA 4MNJA 1RP9A 2VURA 1UKQA 2CYGA 1GOWA 2WMGA 7TAAA 3HU7A 1E4MM 1C3FA 4AZ7A 1J0ZA 1JYVA 1JZ5A 2ZXAA 4N0RA 4QDMA 4KMQA 5CZKA 1UH2A 2WAGA 3TA9A 2WKLA 3EDFA 5CSUA 2WVTA 3ARQA 1BTCA 4AZHA 3VU2A 3OLGA 4WIWA 3RMEA 4HOWA 4HZ7A 3MUAA 2QMJA 2G8ZA 3CUGA 2X0YA 3QHMA 3VMNA 1FP8A 2RGMA 4S3JA 2WMHA 1LG1A 3UETA 3B9EA 3WBEA 3HMCA 3ZR6A 3WN6A 1WKYA 2O9TA 4CN1A 4J27A 5LA2A 5M3WA 2EJ1A 2PWHA 2YL8A 4P8WA 3WQ5A 1V6UA 2DPEA 4J3SA 3VIGA 2DSUA 4HA4A 4YN5A 2WK2A 3II1A 1H1NA 4BCEA 1TVNA 4JFSA 3AIBA 1XD1A 1WZAA 3QOMA 1EHAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HPG A;  5IHS A;  1NWS A;  1OWQ A;  4LYR A;  5D9M A;  1HJQ A;  4CN4 A;  5DF0 A;  2EBN A;  1KGW A;  2J7C A;  3BAI A;  4NZC A;  1WNO A;  1B3V A;  4J28 A;  1G0C A;  3EMC A;  3WD4 A;  3L4T A;  3N1A A;  1BGA A;  4Y7E A;  2J7G A;  1UZ4 A;  3WEN A;  3VIK A;  1EOM A;  5DFA A;  2QPS A;  3OZP A;  1WP6 A;  3WQ8 A;  3BAW A;  1KXT A;  2G4F A;  3MMW A;  1W9D M;  1SMA A;  4NF7 A;  4J3T A;  4AZ5 A;  2XVL A;  3TTO A;  2W62 A;  4PMU A;  2WMK A;  4UOZ A;  4PMV A;  5ECU A;  3RM8 A;  4AIE A;  1KWG A;  1TE1 A;  4UFK A;  3N12 A;  1UR8 A;  2V5C A;  2E9M A;  1G01 A;  1TUX A;  4HA1 A;  2FHC A;  3BAX A;  1I1W A;  2VO5 A;  1E3X A;  4W7V A;  5EBA A;  4HMD A;  5AYB A;  1AQ0 A;  5EFD A;  1X1N A;  3ALF A;  4WKF A;  1YQ2 A;  4H41 A;  1KFW A;  3GH4 A;  4UZS A;  1WO2 A;  3BMV A;  1E4N A;  3AIS A;  4RE4 A;  1B31 A;  3NCO A;  3PZV A;  1TR1 A;  3ZSS A;  3W53 A;  4GQR A;  4UOQ A;  1W9B M;  1E15 A;  2W66 A;  1QHO A;  1OBA A;  3CZG A;  4HU0 A;  4X0N A;  4CD4 A;  1GHR A;  1HKM A;  2WVU A;  3QHO A;  4Z2G A;  4D1I A;  3VKK A;  3AXX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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