2CLEA

Tryptophan synthase in complex with n-(4'-trifluoromethoxybenzoyl)-2- amino-1-ethylphosphate (f6) - lowf6 complex
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
266
structure length
251
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 95
structure length 251
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cleA00
3G1HA 3GAKA 1M5WA 4I9AA 2J9XA 1BKSA 2V81A 3M9YA 3HGRA 4JIQA 2CLIA 4M19A 2QDHA 2E5CA 3PWAA 3T44A 3W7MA 1GVQA 4JTFA 4LS0A 4E2BA 2GVGA 3TQKA 4N9DA 5G4EA 4ZQRA 2ZCGA 3TROA 1W5NA 1SW3A 3NL3A 2YFNA 2X16A 1JCXA 1G6CA 1FCUA 1ZALA 2V2HA 1LDCA 1K7FA 2H3BA 3PF3A 3PR2A 3V1PA 2RFGA 2P0OA 1RV8A 2C18A 2GQ9A 3GR8A 3MMTA 4HPXA 4PODA 2DU2A 4DXVA 4WOQA 1QPQA 5TQLA 1KLYA 4PL2A 2FIQA 1GJPA 2BZNA 2V9DA 3P60A 1LRTA 3L0GA 1FX6A 3EXRA 1SO6A 4CCCA 1PHQA 3VNDA 3MW7A 3NQCA 3BARA 5FESA 1TPVA 3CWOX 3CEPA 2V2DA 3HGOA 3NL5A 4GJ1A 4AXKA 3BV4A 1ME8A 1AW1A 5D03A 4IXHA 2EPHA 4LC8A 3U2OA 2P10A 2JBMA 1Z44A 3PUEA 2X1RA 4UUIA 1QNVA 3UZ5A 3UWQA 2J6XA 1ME9A 1KV8A 1YPIA 5DN1A 5CPLA 4QAIA 1K8YA 1GTEA 2ZDRA 4UFLA 2BTMA 4LUJA 5F1UA 2C0AA 3TMLA 4RZ6A 3EX1A 1HUVA 5EMUA 4GUIA 4JNMA 2XFWA 5C5YA 4ZQOA 3W23A 3QMRA 5HUOA 3EWBX 4S2BA 1XBYA 2CZFA 3PS7A 1SFJA 1TV8A 3C2VA 1H7PA 1LCOA 3BG5A 3OHIA 5FF2A 5HWMA 5C6MA 1TV5A 4N9CA 3ABRA 4LV4A 1OFRA 2WNNA 3CHVA 1NAL1 5D37A 3TW6A 1EIXA 3S8HA 5AN7A 2YFOA 3RU6A 4M7TA 5LGXA 4Z08A 2PRHA 4RX0A 2OZ0A 3Q2DA 2EKCA 4YWIA 1EB3A 1DQWA 1QPNA 1W56A 1M6JA 1I2NA 1X6UA 3UWWA 1AW2A 1OK6A 2WO5A 3MYOA 2CLHA 3M43A 4R53A 5I3KA 3LGEA 4Q32A 4HSOA 1SO3A 3BW4A 3TQ0A 4ONVA 2ZRWA 2VENA 2YW4A 7TIMA 3W85A 4BWLA 3C3NA 4C1KA 1JULA 3H55A 2FTPA 3M47A 3BG9A 3W7GA 1HO1A 4UTUA 2ISSA 4HIBA 1TQXA 3E49A 3MHUA 3WK3A 2ZZ5A 1ZAIA 3QM3A 3TV8A 1G67A 4OGZA 1HO4A 2WOQA 4FNRA 2B0MA 5AYYA 5G2IA 4R34A 3H53A 2X2GA 2CZDA 2VFDA 2YPIA 4S1FA 1EP2A 2BX7A 1I2QA 5AHEA 3E02A 5D2TA 3IVUA 2C15A 1XI3A 1VC4A 4ADTA 4P2VA 1GYNA 4HNTA 2HTMA 1WQ5A 3LDVA 2QKFA 4EF8A 5L9FA 4AVFA 3TXVA 1KW1A 2YYUA 1W5MA 4JIPA 3S42A 2J9YA 3G0SA 3QW3A 5AHLA 1LOSA 2C1HA 5GVJA 3SFKA 3P82A 1GVSA 1TV7A 2DZTA 5D2XA 5FEPA 3HMJG 2QCDB 3TE9A 3W1XA 4TX9A 3S6DA 4O4VA 3ZR4A 3VKJA 2HS8A 4BWLC 3UWZA 4UTTA 3MYPA 4MOZA 3SSJA 3GLCA 4O16A 3W83A 1FXPA 3AJXA 2OT1A 2WSRA 3G1YA 3I7QA 4O57A 4UTKA 3TSBA 1VCGA 1WOAA 5G2HA 3N9RA 1QO5A 1EP3A 1OK4A 1WBJA 4M6QA 3CIXA 4LRSA 5AHFA 4CLMA 3UPBA 1PIIA 2A7NA 3OEXA 4TMBA 3S1XA 2GJNA 4BF9A 5D02A 4AMAA 1UJPA 1W0MA 1FDJA 4Q33A 4U28A 2YXGA 2P1FA 3L9CA 2A21A 1K7EA 4MKNA 1R2RA 3T78A 2PC4A 3W6YA 1W54A 4KFNA 1OFQA 2GQ8A 1IXQA 1MEHA 4DELA 5KZEA 3KVJA 3MJYA 4JYEA 2WJZA 4EIVA 5FEZA 5LNVA 2J88A 1JCMP 1W5PA 3TMQA 3B0PA 1YDOA 2FPTA 5I3IA 1WXJA 4X2RA 3DENA 4IPIA 3BO9A 1XBZA 2A85A 2H6RA 3S5OA 4LW7A 3WJXA 3ZWSA 3RMJA 5F2IA 2CLOA 5KITA 1GVOA 2NWSA 2VEMA 3G8RA 4ZQNA 4O0KA 3DGRA 3ELFA 4XBSA 3LXBA 3QH2A 5AYXA 4WXYA 3IEBA 4AWSA 2Y7GA 3L66A 1TTIA 3DI0A 3G8EA 3BLFA 4X22A 2GUUA 1UUMA 3L0NA 5G1YA 3NDOA 4GXMA 1ICSA 2WSQA 3W74A 4PCFA 5KTLA 4O0ZA 2CLKA 5D2YA 1JQVA 2ZZ4A 3NQAA 4MIMA 4WY0B 2CU0A 2X1SA 3OVPA 1DOSA 5EL1A 1Z48A 2E09A 3R8RA 3W1LA 1XBXA 2H90A 4JTHA 5E93A 2DJLA 4UTJA 1JUKA 4N6EA 4XKYA 1H51A 1AW5A 5CPNA 3LCWA 1FWNA 3G3MA 3W7QA 3QF0A 2WPBA 5C54A 1JCYA 2NX1A 1LOLA 3RK8A 2OMAA 5EYWA 1A50A 3WFAA 3B8DA 4UNLA 1A53A 5AC6A 3DFSA 1TJPA 2RDTA 2W0UA 3DFPA 3E96A 3TDFA 3QRHA 3PBUA 4UFHA 5FF0A 5KSWA 2QUVA 2I9EA 1KM2A 1LRQA 3LBCA 3STCA 1YXYA 2GQAA 2DP3A 1OFBA 1CX9A 3C4UA 3LRKA 2QCDA 3USBA 1U83A 1UB3A 3UZJA 3P67A 1DORA 3IGXA 3P80A 3GZ3A 1YDVA 3DFNA 3P5YA 4JICA 1YTEA 4ML9A 3B05A 4TU1A 1YXDA 1FDYA 5A8GA 4EVZA 1DHPA 4PL1A 2ZRXA 3QZEA 4R7JA 3A23A 5BOOA 3TJLA 3BPWA 2A7PA 4RJEA 4Y8FA 1B57A 2OJPA 1PL9A 1L9WA 4TO8A 4JTTA 1LLWA 4O12A 4QIUA 1VPXA 3W87A 1BWKA 5I3GA 3S1WA 3FFSA 4N4PA 3N9SA 1G4SA 1P0NA 3B0VC 2ZRVA 4LVGA 4WQ6A 3M16A 1YXCA 4XTDA 5D2VA 3SJ3A 4MJZA 1S5VA 4MY8A 4UIOA 4N9EA 3LV5A 3QSRA 4I7VA 1L6WA 4UMBA 3C0JA 2EGZA 1THFD 1LORA 3R89A 3HG2A 2J24A 2VFGA 5G4WA 2FDSA 2NXHA 2ZFAA 4A2SA 2W6RA 5LZLA 4O18A 1GPWA 3NQ2A 5F4SA 3TFXA 3ZWTA 3W7HA 1FWSA 5FEWA 4UFMA 1TPDA 1QPOA 3TH6A 3DFOA 1TRDA 1Q3NA 3QEZA 4NNAA 4IOTA 1YADA 3KOFA 5LHFA 1U5JA 3GDTA 3UQNA 4O28A 1LTDA 4O4WA 1SZNA 3L5LA 4N6FA 3BW2A 3BGGA 2Q3RA 3MBDA 3I7SA 3PVFA 4GC4A 2B7QA 3UXAA 1F76A 1JUBA 4M6VA 1PV8A 1O95A 1XKYA 5AB3A 5K7JA 5D33A 1KA9F 1H7OA 3OVQA 3IIPA 1K7XA 1JRCA 1OFAA 5K3VA 5BNKA 4OU1A 2NLIA 3IGUA 2J9ZA 2YR1A 2QDGA 4OT7A 4WY0A 4ALDA 5G1TA 1X8FA 4POCA 4NXKA 2QAPA 2G97A 3EXSA 4AWUA 4GFSA 1TREA 2V5BA 1YTKA 3EKZA 4O1DA 5K4XA 3W75A 1A5BA 3S5ZA 5KZDA 3PUOA 4JTSA 3NQ8A 2FB2A 5DELA 4O1CA 3K30A 1GVRA 5CPMA 1L2UA 4YMZA 3T40A 1VHNA 1HTIA 3KRSA 1OX6A 2ZA2A 3UD6A 3GX9A 3W1UA 4K39A 3EKLA 3W7JA 4ZL1A 2E77A 3EWXA 3TQVA 1FWRA 1ZAJA 3FYPA 5G5IA 4IMCA 4CQAA 3ABQA 3HGJA 5D04C 1OHLA 3DBPA 1ZY9A 1W5QA 1LROA 4Y90A 1YPFA 3QYQA 5CZJA 1SSDA 3HPXA 4BK9A 2B4GA 4W9TA 2Y6ZA 3L65A 3MBFA 4MYAA 4OBTA 3EWWA 2ATSA 2F7FA 1ZHAA 3GDLA 1PHWA 1O5KA 4GWEA 3T7VA 1H62A 1S5TA 3O07A 4X3ZA 1F6PA 3LLDA 2DZUA 4FX7A 4HPJA 3WK0A 1JQXA 5D38A 4QJ1A 2RDWA 4FF7A 4ORIA 1EUAA 4A29A 5D32A 2CZ5A 3LXCA 3SZ8A 2GVLA 4O19A 4A22A 5IM51 1I2PA 4WOZA 1S5WA 5G2WA 4UCGA 5EA9A 1OX4B 4E2DA 3DAQA 1RD5A 2EHHA 3IRDA 3E0IA 2NUYA 4LV9A 1WDWA 3Q58A 1KLZA 1GZGA 3KAOA 2QF7A 3CB8A 1W3IA 3W2KA 1QPRA 1BWLA 3P8IA 4FEZA 3WK2A 3S9YA 4O1BA 4NNBA 3STGA 1X7FA 2C6QA 3SI9A 3EB2A 5C2XA 3P81A 5HJLA 5K9DA 3TSDA 3U6WA 5K2ZA 1F73A 1VHCA 3OG3A 4LNYA 4CQ8A 3ABOA 3B04A 1T0OA 2JKAA 1R2TA 1V7YA 3NAVA 3TUUA 1MSSA 1KFKA 3G22A 1GQNA 5EBUA 2JKPA 1QWGA 3EWUA 2HMCA 4NJKA 5IBXA 5L6UA 3DZ1A 2X1UA 1LBMA 1ME7A 1OYCA 3JR2A 3M0ZA 3WJSA 4UMCA 4EF9A 4NZFA 3TIMA 5DLCA 2QCGA 1O5XA 3E12A 4IXXA 3DFTA 1AMKA 1E51A 3GB6A 4JS3A 3DHFA 3HOJA 1TPEA 4FO4A 3TW7A 4HT3A 1GWJA 4H3DA 4MVAA 3CLMA 1L6SA 3DKJA 2Y70A 1F74A 4HHPA 1LP6A 4K37A 2QCNA 4UR8A 1JJKA 4MZYA 5LNWA 1KM6A 3L0KA 4ORMA 3P7YA 2TRSA 1XDLA 2QJGA 3W7PA 1TTJA 3LCLA 4UNKA 1VLWA 4N9BA 3GXPA 5DCDA 4ZQCA 1UCWA 3PM6A 2EAWA 4I7UA 1D3GA 3OA3A 2NUXA 3L21A 5ABTA 3RLVA 4CCDA 2ALDA 4LU0A 3NQVA 3LCIA 1LRNA 2ZTJA 1PCKA 3HPSA 3DHDA 1TPUA 4AHOA 1YLVA 2A6NA 2Y88A 1TMHA 2CLFA 3A24A 3W86A 3MP5A 1DL3A 1IXOA 4L4MA 1H1YA 4K6AA 2Y7DA 4UTLA 5DXXA 3FEMA 2VC6A 1X1ZA 3NQDA 4JYFA 5FF7A 1OFPA 4UMAA 4NXSA 4XQ6A 1F5ZA 4HN4A 5IBXC 3DFQA 3GVGA 3NVTA 3LHVA 3LM7A 1O94A 3G1XA 2PURA 2EF9A 2A1YA 1ZCOA 2CW6A 1S3HA 3SGZA 3PBYA 4C1LA 4JXCA 3INPA 1T96A 2ZBTA 4M5PA 4O1AA 1R47A 5J5DA 1TO3A 3TAKA 3W73A 4B5NA 3N14A 4O11A 3I65A 4JTJA 3B4UA 3NQEA 3NPUA 5CGQA 4NU7A 1M7PA 2OX1A 4TIMA 1VYRA 1B4KA 1RQBA 2X1TA 4LVBA 2A6LA 3PC0A 5FEXA 1KFEA 2IQTA 3CIWA 1FCQA 5HNRA 3WK1A 2G95A 2H3DA 1I45A 3NGJA 1OX4A 4AHPA 4NX5A 4XBKA 4DQWA 1JUEA 3A5VA 1F05A 3M1ZA 4FB7A 4IMFA 1SW0A 4JYDA 1HG3A 2YW3A 3PB0A 4OE7A 3LCGA 4YCOA 3ZS4A 1UUOA 3HG5A 2FJKA 4O53A 1G4PA 3HQ1A 1LLZA 4Z1AA 2Y89A 3HG4A 1H50A 1FUYA 3UY8A 3G18A 4NUWA 5D09A 3SR7A 1QFEA 3R2GA 5J5RA 2QCEA 2E68A 1G7UA 4IWWA 4JGDA 4MLJA 4IMGA 2FFCA 5LNRA 5U4NA 5I3FA 4JD4A 5LSMA 3P5ZA 3W1RA 3NXFA 3G24A 2E6AA 4I7WA 2X30A 3MP3A 3KVKA 1TPFA 3PG9A 3CPRA 2ZTKA 1IGSA 4LTSA 3CC1A 4K7VA 4AB4A 3UPWA 3LTPA 4UTIA 3C2FA 2PRMA 4FXSA 3LOTA 1G4EA 2AAMA 4JDYA 3WJZA 1JRBA 3EX2A 4QNEA 3W2JA 3NL2A 2NV1A 2WKJA 3THQA 3KHJA 1A5CA 2TPSA 3W1PA 3W2UA 3B0UX 2JK2A 2Q8ZA 2AGKA 3NQ7A 4GUFA 5TIMA 1B4EA 2OT0A 2A0NA 4HNVA 3PB2A 4O17A 4UTTC 1GEQA 3O6YX 5KZMA 2C16A 2V82A 3MO7A 4EOUA 4DF0A 1EWDA 4H4IA 2V2CA 4BFAA 4E38A 3NQFA 1QOPA 1AG1O 3GXTA 4NQ1A 3LB0A 4DO4A 4BI7A 3C52A 3F03K 1C9DA 2Y63A 1TPB1 3W7CA 5H91A 4NZJA 3T55A 1F2JA 4UFJA 3GKAA 4AHQA 2QUTA 3LV6A 4MJMA 3NG3A 4WY0F 2GJLA 2Q8LA 2R14A 3G1DA 1FDZA 3TNOA 1MZHA 3VI2A 3C2OA 4JN6A 3GDKA 4DPPA 3S1VA 4PA8A 4NJJA 3I6RA 1M7OA 4GUHA 4XUGA 3RF9A 2YDAA 3GR7A 2QCFA 3BLIA 1EUNA 1Z41A 4N2YA 3LHTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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