2CLKA

Tryptophan synthase in complex with d-glyceraldehyde 3-phosphate (g3p)
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLAIIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title Synthesis and Characterization of Allosteric Probes of Substrate Channeling in the Tryptophan Synthase Bienzyme Complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
total genus 101
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2clkA00
1EP3A 4Y9AA 1TIMA 5F2GA 4FNSA 3NDOA 1HTIA 2OT0A 2QEZA 3I6RA 1H7OA 3C2EA 4HNNA 3O16A 1VH7A 4X22A 2CZEA 4EWND 3O07A 3S5ZA 5I3JA 4HPJA 2QCNA 3IGXA 5EPDA 4DELA 2NXGA 1M7OA 3PG8A 4POCA 2PRHA 1GTEA 1VZWA 3GYEA 3GK0A 5CG7A 3QH2A 3L68A 4KFPA 3GR8A 3B06A 5EY5A 4JDBA 1X8FA 4HNUA 2C13A 1LOSA 5E93A 2CLEA 1S3HA 2ZRXA 4JS3A 5CZJA 3W1MA 2WV8A 4OQVA 2QCEA 5K2ZA 3QSRA 5KZMA 3WK0A 5G2IA 2QDGA 1Q6QA 4PTNA 4FEZA 2VC6A 1TV8A 3GXTA 3NZRA 3W7IA 1OFBA 1YYAA 2FB3A 4QITA 4LVAA 1EWEA 3CWOX 1SO3A 1OG0A 3P80A 2V2CA 4OT7A 3QQ0A 4MIMA 3P8JA 1XUZA 4XKYA 3TC7A 2A4AA 1A5BA 3G1HA 5IBXA 2CZFA 1AW1A 3L5LA 4A22A 5K9CA 1WYIA 3B04A 3SGUA 4O10A 4GRSA 5C2XA 1HO4A 2RDWA 1MEWA 4UMCA 1NSJA 1OYCA 1LLWA 3I65A 3TUUA 5LNSA 4JX5A 1OFOA 5FESA 3IGSA 4O57A 3SSJA 4O1AA 2A5HA 5FF0A 2W6RA 4UXDA 4PFMA 3QW4B 4S1FA 2JK2A 3SIZA 1XCFA 1SW3A 4TR9A 3W7GA 5C54A 3NQDA 1U83A 2FB2A 2NV2A 4G1KA 3I7QA 3NR0A 1Y0EA 4IXHA 4ORMA 3R89A 3C2FA 3HG2A 4X2RA 2B4GA 3W7HA 1NF0A 1KM2A 2NWSA 4LWWA 2WNZA 1OX4B 3E02A 3MYPA 3E49A 1FCBA 3CC1A 4O11A 3WJXA 3E12A 2EF9A 1VYRA 4LVDA 3TNOA 2G96A 1KBIA 3GDRA 4YLWA 4JTTA 3P84A 3TQVA 3TAKA 1L9WA 1FQ0A 2RHGA 2QJIA 3UWQA 2YGYA 1JCNA 3ANYA 1TB3A 3GXNA 2H90A 3W1TA 1VS1A 1W3NA 2E09A 4AH7A 4UR8A 2V82A 1LCOA 5E0KA 2NLIA 1QR7A 5AYZA 1S5WA 2JKEA 3IIOA 1PV8A 2YR1A 1WOBA 3T55A 1O94A 4WX2A 3MP5A 1ZFJA 1SSDA 3EWZA 4N9DA 3W73A 3W7QA 3EKLA 5EL1A 3P81A 5F2LA 4IXXA 5HR7A 3O05A 4IWWA 3OBKA 1TTIA 4K8EA 1L2UA 1WX0A 3PBUA 3HMJG 1FXPA 3LI1A 4LS1A 4A21A 2YW3A 3FLUA 2E6AA 1F7BA 3G22A 4LRTA 2ZZ6A 3CTLA 3M16A 1P5BA 5BMWA 3TW7A 3NM3A 5D2YA 4N02A 1T99A 2E5BA 3TSDA 3MJYA 3SJ3A 5I3FA 3L0KA 1N7KA 3HGOA 1RD5A 1DKWA 1G4SA 3HJZA 3TCEA 3A5VA 1KM0A 4NX5A 3MMTA 1FDJA 3KVLA 3STCA 2AGKA 4LY8A 4YMZA 5A8GA 1SFLA 1JJKA 1F74A 4AWTA 3K30A 4EVZA 4FNRA 2JGQA 2DZXA 4M6QA 1BWKA 2GUUA 5D37A 4R33A 3BGGA 5AYXA 3KFTA 1W31A 4JTLA 3LLDA 1TMHA 1G4TA 4AMAA 4GWEA 1TTPA 3W2NA 3BG9A 4RKAA 2E77A 2R14A 1EEPA 3EX2A 5D09A 3DKLA 1GVOA 3MI2A 3ATYA 3NL2A 3LHUA 1CX9A 4ONVA 5DLCA 1VHCA 1OX4A 3C3NA 4LVFA 3P61A 3VI2A 1VHNA 3WJYA 1SZEA 5HWMA 2QJGA 1OVDA 3HO8A 3TSBA 3PB2A 3NO5A 3PBVA 4FXSA 5G1TA 3MI6A 4ML9A 2ZTKA 1EX5A 4NZJA 2DZPA 2F7FA 5EMUA 1K7FA 3G0UA 3BLFA 5DCDA 3T40A 1MSSA 1YPIA 1IF2A 1KV8A 3M47A 1PS9A 1NFBA 5LHFA 1JRCA 1GVQA 2CWNA 1KFEA 3LERA 3F4WA 3HQ1A 5D2WA 3MBDA 3DFSA 3ZR4A 4GFSA 2X1UA 4LS2A 1JUBA 4N2YA 2VKZG 3GIYA 4AHPA 2Y85A 3NOEA 4JTJA 1GWJA 3QF0A 1OYAA 1L6SA 1FWNA 5LSMA 3KAOA 4TX9A 3KVKA 1CW2A 3I7RA 2V8ZA 5D2TA 1QPRA 3CB8A 5CPOA 1LTDA 4LOCA 4OU1A 3NQ8A 4CQAA 3PAJA 3UXAA 4WJEA 5MHBA 2YPIA 1LLZA 3MHFA 3EWYA 4MZYA 1TCDA 2GVLA 3LCHA 2VFFA 1EP2A 2V5LA 5D05A 2H8ZA 5DBTA 2A7PA 3CEUA 3N73A 1GQNA 2YZRA 1SR9A 3V75A 3O8AA 5DXXA 1R47A 4GBUA 4PH6A 1OF8A 4R34A 1W5PA 1RV8A 3GKFA 2O7SA 1T96A 1FCVA 1MEIA 4CCEA 3BK0A 1WA3A 3EXRA 4BI6A 5F4SA 3RK8A 3BARA 1SO5A 5TBOA 1O60A 3W75A 1QWGA 3R2GA 2Y62A 4RLIA 1KFKA 3ELFA 4JR5A 4HSOA 3C6CA 4MPQA 1LZOA 4CQ9A 2J24A 2EAWA 3NQGA 3GLCA 4X9SA 3IVTA 2QDHA 3W1PA 1IGSA 2ZZ7A 5BMXA 3BVJA 1JRBA 1QOPA 3NPWA 4ICNA 3L65A 3WJZA 2DU2A 1KLYA 2V2DA 3OVRA 2VFDA 4IMCA 1UASA 3JR2A 2BZNA 3M7WA 4PL1A 3IIZA 3S5OA 4LC6A 4GE8A 3RMJA 3LCXA 3B05A 3LCGA 4H3DA 2ZCGA 2DZTA 4Y96A 4WZHA 4I7VA 2V9DA 2G5WA 3BO9A 4K38A 1LROA 3HPSA 3QEZA 5GVJA 5F4XA 1KM6A 2QCHA 1KW1A 1FCUA 1K3UA 5G1YA 1VQTA 3CIWA 5LHEA 1IXQA 3W23A 1WV2A 3SI9A 3B4UA 1YXYA 3HG4A 1IXPA 1ZCOA 4Q33A 1VCVA 2VEMA 5ABTA 1XBVA 1GYNA 1H1YA 2X1TA 2QR6A 3G1AA 2TRSA 3KRSA 1LRNA 4KWWA 3FJLA 4IMGA 1JVNA 2PC4A 1VYSX 4K37A 1O95A 3B0PA 3MI3A 1GVFA 3CT7A 4RJEA 1YLVA 5D32A 3JRKA 4N4PA 3LXAA 3O1NA 3TV8A 4P2VA 4JGDA 3NPVA 1GTHA 5CSSA 3TU9A 2Z2UA 2ZRVA 2NX1A 1MEHA 4MYXA 1G69A 1ADOA 3OIXA 4FNUA 2J6XA 4JY9A 1AL7A 1Z44A 3NPXA 5IM51 4XBSA 4UTWA 3MYOA 1KTCA 3RLUA 3GB6A 5HULA 3M0ZA 4Z08A 1ONRA 2QCFA 5BRBA 3QMTA 4LT9A 3FYPA 2X2GA 3RLVA 3B0VC 3LGEA 1G7VA 1ZENA 2GPTA 4TU1A 5AHFA 3TJXA 2Y6ZA 5C6MA 5J5DA 3W3OA 3F03K 4Q4KA 3W7RA 1H7NA 1EP1A 4JTGA 1KTBA 4MZ8A 2QJHA 4UTJA 2YYUA 4UFKA 3W7KA 4O14A 2J9XA 2VFHA 5F4WA 3NGJA 2PURA 2CZDA 5FF3A 3W2MA 3HF3A 5AHNA 3LRKA 4GUJA 4UTTA 2EPHA 1ZALA 1K7XA 3LCIA 1JCLA 2I9EA 1XBXA 1UUOA 4PCFA 3NPUA 4JEQA 1GVRA 2RKXA 4JTKA 1P1XA 2EKCA 4FNTA 1K8ZA 3W70A 4LU0A 1VLIA 4H4IA 3BW4A 2PE4A 4WOZA 4UTKA 4PL2A 1Q6OA 3PF3A 3B03A 3W7CA 1IIHA 3W07A 2A7NA 3N14A 4K7VA 4LUJA 5KINA 1PE1A 5DCBA 1ICQA 3NAVA 4IPIA 4O16A 4M6PA 1W8SA 4RR4A 4LW7A 1LM1A 2GJNA 2VFIA 4PC8A 4R53A 3O63A 3G8RA 4UTLA 5U4NA 5D33A 1JCMP 3VKJA 4CCCA 1ML1A 4EIVA 1H60A 3HPXA 2C1HA 2FPVA 1MO0A 1BKSA 3HGSA 4M5PA 1WOAA 2C18A 5CPMA 2VEKA 3TXVA 3C52A 2FTPA 4O17A 5C55A 5DELA 3AO0A 3LRMA 3G1SA 1S5TA 4UFMA 4B5NA 4XZ9A 3IIXA 3DU0A 2Q8ZA 1FXQA 5I3GA 1Q45A 1MXSA 2WJZA 3M5VA 2ZRUA 1KM4A 3QRHA 3VFLA 4RXGA 5I3HA 1IIGA 3IRDA 3R12A 3W74A 1G4EA 3F4NA 3LX9A 3P8IA 4UIOA 2NXHA 3WJSA 1SO4A 3UWYA 4AEOA 2E6DA 3SECA 1H7WA 3NQFA 3PBYA 4NJHA 4RZ4A 3USBA 2Y63A 1XBYA 1T8XA 1XDLA 2NZLA 1TPDA 2XN0A 1LRQA 3QZEA 3MP4A 2WSYA 4NNBA 4WUIA 5KITA 1W5OA 3BG3A 1LYXA 1NAL1 2OJPA 3W2KA 5KZDA 4TMCA 3S5YA 3F1QA 4IOTA 4LVGA 3DENA 4M6VA 4LUIA 5LZLA 1A5SA 4GC4A 5J5RA 3THAA 3W7LA 3OG3A 2C0AA 1Z48A 3VCRA 2R8WA 1LRTA 1SZGA 1OFAA 1VR6A 4C1KA 2JGYA 1LOQA 2I14A 1UJPA 2CLLA 4O13A 2Y7EA 3E0IA 1AMKA 3DZ1A 4FX8A 5F1VA 4HN4A 3GDKA 3L0NA 2QF7A 4AHOA 3ZWTA 3TMQA 3GAYA 1SW7A 2ISWA 2C6QA 5LGXA 3UWWA 1I45A 1RZMA 5HWNA 1QPNA 3A23A 1YTEA 1KFBA 4AB4A 1BWLA 5AOUA 2A0NA 1OF6A 3W1QA 4DQWA 5G5IA 3QMSA 4TIMA 1YTDA 3TE9A 2QCDB 3PC0A 1PCWA 4AWSA 2NX9A 3IEBA 4JXCA 1XI3A 4I9AA 3GR7A 4ZQPA 1KM3A 1FY6A 3PUOA 2OX1A 4ZL1A 3PBWA 1J2WA 3M6YA 3N9SA 4DBDA 5K9DA 4IJBA 5C5YA 8TIMA 1E51A 5F1UA 3M41A 3W1RA 4NJGA 4LNYA 1PHWA 5AFDA 1B3OA 3QMRA 3NL3A 1ZJIA 4DO5A 3BW3A 4BWLC 3TQ0A 4CNPA 3BLEA 1ALDA 4QNWA 1U5JA 3N2MA 5LNUA 1ME7A 4LS0A 3CHVA 1S5VA 4IPJA 2G95A 4TO8A 4ZQOA 1XBZA 1L6WA 4MLRA 5EA9A 6TIMA 3KVJA 3H53A 1JCJA 1DQWA 3MHUA 4MKNA 1FWSA 3G8EA 3L2IA 4R7JA 1TYGA 3PM6A 1KFJA 1KV5A 2ZA3A 4S2CA 2OCZA 3DFPA 3C2RA 1W5MA 2YDAA 3STGA 1G6CA 1LOLA 4RCXA 3QW3A 2FPTA 5CPLA 1TPWA 4RXFA 1TQXA 3DAQA 5HQEA 3U2OA 5TIMA 2EHHA 2HS6A 4Z0JA 3UYCA 3TFCA 3QYQA 3LTPA 4GUHA 1FX6A 3W6YA 4MY9A 5AHLA 4O4VA 3EWUA 3GNNA 4FIRA 5D02A 3NYZA 3EXSA 3HG3A 1BTMA 1VLWA 3TXZA 3P60A 1IXOA 1I2PA 1VJIA 2NX3A 3LB0A 4Z1CA 4BR1A 1UBSA 3KX6A 3PY2A 3W76A 1SUXA 1B4EA 5H2ZA 3EEGA 5CZSA 4FO4A 3M5ZA 3L9CA 1YDVA 1ZNNA 1DORA 3O6CA 3LCFA 2DP3A 5AC7A 2RFGA 3GX9A 4U28A 2CU0A 3LBCA 5D30A 1WQ5A 1DV7A 3RU6A 2DZSA 3G24A 2Q3OA 2CLHA 3L21A 3GDLA 4M7TA 4YCPA 5D2XA 4NX0A 1D3GA 4NXKA 2ZRWA 2ZFAA 3W7MA 3LCWA 1TREA 2H8XA 2QCDA 3TA6A 3AJXA 4BF9A 3NEVA 3LHWA 4LVBA 2ZYFA 1KBJA 2YFNA 1QPOA 5KZEA 1EUAA 4E2DA 5H91A 3R8RA 1RQHA 3HPZA 1FWRA 2V30A 3W7OA 1PHQA 1YADA 2FQIA 1FCQA 4FNQA 4O1BA 4NJKA 2Z1BA 4JYEA 1M6JA 3LCLA 5KMYA 3B0UX 2GOUA 4MY8A 5K4XA 2Z6JA 3FA5A 3NQ2A 3LXCA 3MO7A 1OFEA 2BSLA 3R5EA 1GG0A 3FIGA 1OFDA 3YPIA 1VYPX 4O1CA 2XN1A 4MJMA 2YCEA 3ZWSA 4AF0B 3G3MA 1KM1A 5CZTA 1LBFA 2O7QA 2QUVA 2ZQ0A 1AG1O 2E68A 5HNRA 3L66A 4QM1A 1TQJA 4NJIA 2CLKA 3T78A 2WOQA 1F6PA 4AAJA 2NUYA 4JTHA 1R46A 4DEFA 1GG1A 5DBUA 3OA3A 5LGZA 3UZ5A 2ATMA 2TPSA 4IX0A 1WDWA 3LRLA 2DZWA 1XM3A 4MJZA 4UTUA 1EA0A 4QQ3A 4ZQRA 2ABBA 1JQXA 4FF7A 4QISA 4AXKA 3DI1A 2CFFA 2GQAA 5A5WA 4MY1A 3TROA 1LBLA 3INPA 5AHMA 2V0TA 2LLEA 3C2OA 2VFEA 4UUIA 1YDOA 1DHPA 3TJLA 1PL9A 2GJLA 5FF2A 3KOFA 4W9TA 3THQA 2E5CA 3E9AA 3A21A 3D0CA 1A50A 4NNAA 1H7PA 1LBMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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