The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
68
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Structural analysis of the myoglobin reconstituted with iron porphine.
pubmed rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
68
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-12-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QFK A; 2ZFO C; 1SI4 B; 2PGH A; 2HZ1 A; 2ZS0 A; 1ABY A; 1YFF B; 2RAO A; 3UGY A; 2O5Q X; 2MGB A; 3UHT A; 3GYS B; 1QPW A; 1Y0D A; 2ZSZ A; 3UHK A; 2CMM A; 1S56 A; 1Q1F A; 1O1O B; 2MGH A; 3OO4 B; 5HLU A; 1YMB A; 1QSI B; 1NS9 B; 1CLS A; 2VYW A; 1DXT B; 3UH5 A; 3SZK B; 1Y5J A; 3TLD A; 1V4X B; 2R80 A; 2O5B X; 2ZS0 D; 1UVY A; 3D7O A; 3AQ6 A; 3BJ1 B; 3NG6 A; 1BUW B; 1R1Y B; 3HRW A; 1Y0T A; 1BAB A; 4KMV A; 1NIH B; 1YH9 B; 4F6D A; 2GNW A; 1G09 B; 3P5Q B; 3WCT D; 2HCO A; 1Y0C A; 1DXV B; 3OJ1 A; 1XZ2 B; 2ZLW A; 5EYS A; 5B84 A; 1O1L A; 6HBI A; 1IWH B; 1HCO B; 2W72 A; 3VRF A; 3ZJO A; 1AJ9 B; 5SW7 B; 3V2Z A; 4N8T A; 2DN2 B; 3GOU B; 1ECD A; 3E55 A; 3ECX A; 2VRY A; 3UHX A; 1ECO A; 1H97 A; 3TM9 A; 2MYB A; 2KSC A; 1XZV A; 2MGF A; 3KMF C; 1YE0 A; 2MGM A; 1MBA A; 1SDL A; 1LHS A; 4F6F A; 1O1I B; 1ECN A; 1Y5K B; 1A3N A; 3MYN A; 4ZVB A; 1G0B A; 3R5I B; 1CH1 A; 2ZS0 B; 1ABY B; 1Y4V A; 1HBG A; 4O4T A; 2HZ2 A; 3VRE A; 3HHB B; 5CN8 A; 2ZSR A; 1BZ6 A; 3UGZ A; 1FSX A; 3PT8 A; 1HDB A; 4G51 A; 1XZ5 A; 1QXD B; 3FH9 A; 3MN0 A; 3WCT B; 1NS6 B; 4M4A A; 2R80 B; 2AV0 A; 1K1K A; 3E5O A; 1XXT A; 1MTK A; 4O2G A; 1MNO A; 3ZHW A; 1LFV B; 2ZSX A; 3AT6 A; 1IBE A; 3ECZ A; 1MLJ A; 2GTL A; 4QAU A; 1URV A; 2XKH A; 1Y31 B; 2ZSQ A; 3IXF A; 4ROM B; 4XDI A; 1LFY B; 1M9P B; 1Y4F B; 1VXB A; 2V1K A; 1Y7C A; 2YRS B; 2MGE A; 2V1I A; 3VRF B; 1LFQ A; 3DHR B; 4N8T B; 5JOM A; 3UBV A; 2EKT A; 5KER A; 1JF4 A; 2GTL D; 1SDK B; 1A6K A; 1RQ3 A; 4F69 A; 1MTJ A; 3BCQ B; 1H1X A; 2FRF A; 1Y4B B; 2R1H A; 3A59 B; 101M A; 2SPM A; 1MLS A; 1MNK A; 3UHW A; 2G0V A; 4H2L B; 2R4Z A; 3WFW A; 1HBH A; 3LR7 A; 5EUI B; 1MGN A; 1A3N B; 1GLI A; 1MWC A; 4MQI B; 4L7Y A; 1Y4V B; 2G0X A; 1HDA A; 2HBD A; 2ZFB B; 5E83 B; 1Y46 A; 3WCU A; 1DWT A; 3WTG B; 1QI8 B; 7HBI A; 1X9F C; 1OUT A; 2GRZ A; 3W4U A; 2VLZ A; 4L2M A; 4G51 B; 1A0Z B; 3A0G A; 3E5I A; 1GDI A; 1MOC A; 1VXE A; 3V2V A; 1YE2 A; 4NI0 A; 1X9F B; 1Y8W A; 4PQC A; 4M4A B; 4MAX A; 1O1N B; 1HGC B; 1J7Y A; 3BOM B; 1DXC A; 4OF9 A; 3ONZ A; 2V1E A; 5ILM A; 4KN3 A; 1J40 B; 1MBI A; 2BNL A; 3IC2 B; 1MZ0 A; 3QJD A; 3HF4 A; 3AT6 B; 1IBE B; 1OUU B; 6HBW B; 2GTL B; 2NSS A; 4HRR A; 2VHB A; 3ARK A; 1Y8I B; 1XYE A; 1Y7C B; 4UIQ A; 3U3E A; 1Y7G A; 1F65 A; 4MXL A; 1C7B B; 1MYG A; 3LQD A; 5E29 A; 1OBM A; 1LTW A; 1JF3 A; 1SPG A; 2ZLT B; 112M A; 1NZ3 A; 3GDJ B; 3ZH0 A; 1MNJ A; 1XZ4 A; 4NI1 A; 3M39 A; 1C7C A; 3PT7 A; 1CO8 A; 4SDH A; 2LH7 A; 3IC0 B; 3TM3 A; 1RQA B; 1OFK A; 3D17 B; 5EQM A; 4U8U A; 1RPS B; 1CG5 B; 2JHO A; 1MTI A; 2D2N D; 2ZS1 C; 1Y4Q B; 1FLP A; 5HU6 A; 1YEQ A; 3D1A A; 3ZJM A; 2MYE A; 2MGI A; 3MVC A; 2HBD B; 2ZLV B; 1HDS B; 4HSW A; 2Z6N B; 2G0R A; 5CHQ A; 2EF2 A; 4U8U D; 2V1J A; 2OHA A; 3ZJL A; 1S5X A; 1V4W B; 2R4W A; 1UMO A; 1Y5F A; 1F5O A; 4X0L A; 5EOH A; 1GBV A; 3MOU A; 5C6Y A; 3H57 A; 3M3B A; 1VXC A; 3GKV A; 4F6G A; 1FHJ A; 1FSL A; 3CIU B; 1Y2Z A; 1LH7 A; 1YDZ B; 1DUO A; 2G10 A; 3ASE A; 4ROL B; 2ZWJ A; 2MGG A; 3ZJQ A; 4NS2 A; 3BJ2 A; 3GQG A; 4HBI A; 3UI0 A; 4YU4 B; 4ESA A; 1S69 A; 2LH5 A; 4OOD A; 2R4X A; 3QQQ A; 2V1F A; 1Y0A A; 1HBR B; 2W6W A; 1O1J A; 2MHB B; 3ZJN A; 1L2K A; 2ZT1 A; 1B86 A; 2EB8 A; 2D2N B; 1YHR A; 1RSE A; 3RJ6 A; 3WHM B; 1HBA B; 1URY A; 1DWR A; 2NX0 A; 1YHU A; 1XY0 B; 2EVK A; 1QXE B; 1VXF A; 1PBX A; 2D6C A; 109M A; 1HGA A; 3CY5 A; 3PI8 A; 1ABW A; 1NZ5 A; 2ZST A; 3WCV A; 1DKE B; 5C6E B; 1GZX B; 1M6M A; 2LH3 A; 1HBS B; 2AA1 A; 2HHE B; 3GQR B; 1NZ4 A; 3AT5 B; 1BIJ A; 2ZFO A; 4HRT A; 1SPE A; 1YG5 B; 1GDL A; 3NL7 B; 3ZOL A; 3HEN A; 1MKO A; 3MKB A; 1YVQ A; 3QM7 A; 1C7D B; 1Y83 B; 1Y7Z A; 5EET A; 4FC3 B; 2DN1 A; 3G46 A; 4C0N A; 3AQ8 A; 4N7N B; 1G08 B; 2RI4 A; 3QJB B; 1Y4P A; 1NGK A; 1YIH B; 1U7S A; 1Y4R B; 1M6C A; 3ZJR A; 3IA3 B; 1YEN A; 4DC7 A; 1V5H A; 2ZLX A; 4ESA B; 1BIN A; 1UIW B; 3DUT A; 3WCW C; 5CNC A; 1JEB B; 1LUE A; 1OR6 A; 1YHE B; 2HBE A; 1RTX A; 5EE4 C; 4H0B A; 1MLL A; 1S61 A; 2D5Z A; 3QJE A; 2HHB A; 3NMM A; 1MLG A; 4M4B A; 4F4O B; 1HAC B; 1Y7D B; 1COH A; 2MGL A; 1QSH A; 2ZSO A; 2D2M D; 2OLP A; 3VRG A; 2O5M X; 1JP6 A; 2ZT2 A; 2GL3 A; 2PEG A; 3O89 A; 1YEO A; 1JY7 A; 2H8F A; 1O1P B; 1LJW A; 106M A; 1Y45 B; 2FRJ X; 5E6E A; 3S48 C; 1GCW A; 4MQJ A; 5HBI A; 2HBC B; 2WTG A; 1IRD A; 5AZR A; 1A00 B; 1DXU A; 3KMF A; 3AQ7 A; 4N7P A; 1MYT A; 2AA1 B; 2EB9 A; 1DLW A; 1J3Z B; 2HBF A; 2QMB A; 2WTH A; 4AVE A; 3EOK B; 4ODC A; 1IOP A; 1O1K A; 3G4U A; 5ILE A; 2DXM B; 5CMV A; 2VEE A; 1J7S A; 3EU1 A; 5JDO E; 3QQR A; 1Y7Z B; 3ORD A; 3PEL A; 4N7O B; 2QLS B; 2XYK A; 3LB1 A; 3UHG A; 1HAB A; 2VYZ A; 3KUN A; 2O5L X; 2RI4 B; 1CQX A; 1THB B; 3QJC A; 111M A; 3UHE A; 5CNB A; 2QSS A; 4MQH B; 3B75 B; 1XQ5 A; 2D2M B; 4O1T A; 1HHO A; 1MWD A; 1G9V B; 2H35 B; 2GDM A; 2DN3 A; 3DHT A; 1BBB A; 2HBE B; 3OGB A; 3EDA A; 5MBN A; 1T1N A; 1DO1 A; 3UHR A; 2D5Z B; 4MU5 A; 5JGG B; 5HY8 A; 107M A; 2VLX A; 1Y8H A; 4XS0 B; 3FS4 B; 1YEV A; 3VAU A; 4YU3 B; 2ZS0 C; 2W6Y A; 1I3D A; 1KR7 A; 1JL6 A; 4B3W A; 1MLQ A; 2LH6 A; 1D8U A; 2PEG B; 1YGF A; 2PGH B; 1A9W A; 2B7H A; 2OIF A; 3M38 A; 3UHN A; 2RAO B; 1VHB A; 1IRC A; 1MCY A; 1VWT A; 1QPW B; 1Y0D B; 3WCT C; 1HJT A; 1UVX A; 2FRK X; 1EMY A; 2IG3 A; 1CLS B; 3HYU A; 1DTM A; 1Y5J B; 2WY4 A; 1YZI A; 3R0G A; 1S0H A; 3D7O B; 1O1K B; 3K8B A; 2O5T X; 3NG6 B; 1J7S B; 3EU1 B; 3HRW B; 1Y0T B; 1BAB B; 1A6N A; 4O35 A; 3ODQ A; 1NQP A; 1MYZ A; 1VRF A; 4F6J A; 2QSP A; 1MLH A; 2FRI X; 2W72 C; 3VHB A; 2HCO B; 3UH3 A; 1HAB B; 1Y0C B; 1YMA A; 1BZP A; 5ILR A; 2ZLW B; 2MGJ A; 1W92 A; 3PI9 A; 3HC9 A; 1O16 A; 1O1L B; 2VEB A; 1HLB A; 4LPI A; 1LFL A; 2W72 B; 2SPL A; 4NK2 A; 4G1V A; 2QSS B; 1JP8 A; 1BZ0 A; 5B85 A; 2G3H A; 2HZ3 A; 1UC3 A; 5EV5 A; 1EBC A; 4BJA A; 3UHZ A; 3ECL A; 3M3A A; 1VXD A; 1XZV B; 2MB5 A; 1YE0 B; 4ZVA A; 3MYM A; 3G4Q A; 1SDL B; 2VLY A; 1FCS A; 1LA6 A; 3QM9 A; 1Y35 A; 2MYA A; 1YGF B; 1MOA A; 1OJ6 A; 2GLN A; 1G0B B; 1YVT A; 1JDO A; 3VRE B; 2ZLU A; 4MQC A; 2AUP A; 5F2A A; 1FSX B; 1GDJ A; 2D5X A; 3BJ3 A; 3PT8 B; 1MYF A; 1HDB B; 1XZ5 B; 1MYM A; 4TYX A; 3UBC A; 3FH9 B; 4MXK A; 3HEP A; 2AUR A; 1JPB A; 2M6Z A; 2ZSY A; 1K1K B; 2D60 A; 2AUO A; 2ZS1 A; 3WCU D; 1UX9 A; 5CN7 A; 1XXT B; 1FN3 A; 5ILP A; 2GTL C; 5IKS A; 1EWA A; 1A01 A; 1A9W E; 1X46 A; 3NML A; 1MLU A; 5KDQ A; 4PQ6 A; 3S1I A; 2SPO A; 2O5S X; 1CH2 A; 2BKM A; 1NPG A; 3PI2 A; 4MQG A; 1MOH A; 104M A; 3UHQ A; 1J52 A; 3LB2 A; 1LFQ B; 4G1B A; 1YIE A; 1XZU A; 1LFZ A; 4WJG A; 1MDN A; 1KD2 A; 1RVW A; 5KER B; 3ARL A; 1RQ3 B; 4MQK A; 3UHD A; 1MBS A; 1Y09 A; 4NXA A; 4IRO A; 3UHU A; 1CO9 A; 2BMM A; 1CG8 A; 1A6G A; 2R1H B; 4DWU A; 1Y4G A; 2H8D A; 3QMA A; 1JZM A; 2C0K A; 1HBH B; 3AQ9 A; 3GQP A; 1LA6 B; 2W6V A; 1ITH A; 2O58 X; 1GBU A; 1Y35 B; 3UH7 A; 1DO4 A; 1GLI B; 4F6I A; 4L7Y B; 5CNF A; 3KUO A; 1HDA B; 3RJN B; 1Y46 B; 3WCU B; 2LH1 A; 1YOI A; 3BJ3 B; 1V75 A; 1OUT B; 3W4U B; 3A0G B; 3G4V A; 5HLQ A; 1YOH A; 4FWX A; 1YE2 B; 4NI0 B; 4FH6 A; 3WFU A; 1CIO A; 1Y8W B; 1J7Y B; 3A5B A; 1Y85 A; 3ONZ B; 1V4U A; 4KMW A; 1EBT A; 3G4Y A; 105M A; 2G14 A; 2NRM A; 1BZR A; 3QJD B; 3HF4 B; 1WMU A; 1MBC A; 4MBA A; 3MJP A; 3UHH A; 1A0U A; 2MGK A; 3HXN A; 4HRR B; 1S5Y A; 1CH9 A; 1J7W A; 1A3O A; 2HBS A; 3S65 A; 2D2N C; 3K3U A; 1XYE B; 2QU0 A; 3QM6 A; 1Y7G B; 1MLR A; 4NXC A; 1XZU B; 3LQD B; 3LR9 A; 5E29 B; 1CMY A; 3NFE A; 1RVW B; 4FWY A; 1SPG B; 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1MOB A; 4TWV A; 1LFT B; 4DWT A; 1PBX B; 1J3Y B; 1HGA B; 1AJG A; 1NWI A; 2MGD A; 3CY5 B; 1CQ2 A; 3PI8 B; 1B0B A; 3SDH A; 1ABW B; 1O1I A; 4HHB B; 1Y5K A; 3WCV B; 3R5I A; 5CND A; 1Y22 A; 3WFT A; 3HHB A; 1BIJ B; 4C44 A; 2ZFO B; 4HRT B; 4F68 A; 1GDK A; 5CNG A; 1MKO B; 1FDH A; 5HLX A; 3MKB B; 1QXD A; 1YVQ B; 4DC8 A; 1V9Q A; 3WCT A; 5M3S A; 4WJG 1; 1NS6 A; 2ZT3 A; 2ZSN A; 3QM5 A; 1MBO A; 2DN1 B; 110M A; 1YEU B; 1MLN A; 1A4F A; 1MWB A; 1VXA A; 4WCH D; 2D2M C; 2NSR A; 1LFV A; 1Y4P B; 1OFJ A; 3S66 B; 3QZZ A; 1YEN B; 1NZ2 A; 2MYC A; 2ZLX B; 3DUT B; 1CH5 A; 5CNE A; 2BK9 A; 1NEJ A; 2FAM A; 1NAZ A; 1AJH A; 1XCH A; 1Y31 A; 1Y8K A; 2BLH A; 4ROM A; 1LFY A; 1M9P A; 1Y4F A; 4B4Y A; 4JAC A; 3D1K B; 3OO5 A; 2YRS A; 3A5G A; 1A6M A; 1UFJ A; 3QJE B; 2BLI A; 2HHB B; 3DHR A; 5AZQ A; 1CBM A; 3NMM B; 4M4B B; 3ZJH A; 1COH B; 1QSH B; 3ED9 A; 2LHB A; 2MGC A; 3PI3 A; 5CN4 A; 1GCV A; 1SDK A; 1OR4 A; 1ABS A; 3VRG B; 2BLJ M; 1YEO B; 3BCQ A; 1JY7 B; 1WLA A; 2H8F B; 5CN9 A; 1Y4B A; 3A59 A; 1LJW B; 1SWM A; 1YCB A; 5E6E B; 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