The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2A05 A; 2CQ7 A; 2DDB A; 1XTA A; 1XX5 A; 1WVR A; 2DDA A; 3MZ8 A; 1RC9 A; 2GIZ A; 2EPF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IH4 A; 4OIP F; 3GEZ A; 1ETX A; 2N8G A; 3BCA A; 4XL9 A; 2RQP A; 5GTI C; 4XLF A; 1YE9 A; 1TT5 B; 4F55 A; 3H35 A; 5L3G A; 4KFC A; 3JRB A; 3S1R J; 2QSF X; 3J7A O; 3OR2 C; 3WOD F; 2JA7 J; 2YX7 A; 3WG7 H; 1RKW A; 4DYR A; 1HBX G; 2DAO A; 4MEY F; 4IJA A; 1QVU A; 1BI2 A; 1K6Y A; 3ISP A; 2CU7 A; 3O8H A; 3K7A J; 4UVB A; 3OYC A; 4PSW A; 2CJJ A; 4BBR J; 5TJJ A; 3ZP5 A; 4HF0 A; 2XV4 S; 4CA0 A; 5C4J J; 3B02 A; 1WJA A; 5EZH A; 1JHF A; 1FLI A; 2LLK A; 5ICG A; 2WAQ A; 1QHH D; 1DPR A; 1I27 A; 3E0J B; 4A3M J; 1N25 A; 2BEO A; 2ZME C; 4UHT A; 2KIF A; 3G1O A; 2LYC A; 1H0M A; 4L5E A; 3S2H J; 4A3B J; 1YYV A; 3OIP A; 2QQ8 A; 2XF5 A; 4OIR F; 2D2W A; 3RKQ A; 4EQQ A; 1JT0 A; 2KLO A; 1WKM A; 3BG6 A; 4XLN F; 3CF2 A; 2L9R A; 1IN7 A; 1PJR A; 1FWZ A; 3KPH A; 3LST A; 2FBK A; 4G7Z F; 1MJ9 A; 4IXA A; 5LGN A; 4BDY A; 1QO0 D; 3V4G A; 1HW1 A; 1P4X A; 1Y0N A; 1S5L C; 2EFN A; 1EH6 A; 4L18 B; 5FD6 A; 4RB2 C; 1KYW A; 5D6E A; 1YI2 I; 2EV6 A; 4II2 A; 3NQO A; 4CCK A; 3S15 J; 1G4D A; 1G3Y A; 5F27 A; 4Z6Y A; 5K5O A; 1X4P A; 3FMQ A; 1AHD P; 2V26 A; 1T0F C; 1WJD A; 3K1M A; 1UMQ A; 4IX7 A; 2NOG A; 2LY1 A; 2XAQ A; 2KQR A; 5D4R A; 2YX4 A; 2FU4 A; 3H5N A; 3QQA A; 5GTH C; 5DM7 F; 2BW3 B; 2DLL A; 2HYJ A; 1U3E M; 4KIB A; 2WWY A; 4XK4 A; 1VQP I; 1Z3X A; 1P9Q C; 2PG4 A; 2X48 A; 1XSD A; 2DMT A; 4RS8 A; 1D1C A; 1VND A; 1Y8Q B; 4NQW A; 2H94 A; 1IV6 A; 4D0P A; 4AVZ A; 3T1B A; 4LOC A; 2A61 A; 5LFA A; 4LLN A; 4KJZ A; 3VEP A; 4E70 A; 4YG2 F; 5ICC A; 1A5J A; 3DPT A; 4DBQ A; 4DQ2 A; 3DKY A; 2CYY A; 3KEY A; 2E1O A; 3C2H A; 4RB3 C; 2DFI A; 1GDT A; 2MLK A; 2BW3 A; 2DA2 A; 1ZKG A; 2X0L A; 5FGM A; 1QPM A; 4A0Y A; 2Q2E A; 3FBI B; 2RRE A; 4DIQ A; 2IS1 A; 3PO2 J; 2Y31 A; 2QGU A; 3MVP A; 2HGC A; 1D8J A; 3VPR A; 3M9A A; 4P9F A; 4XRM A; 5IT9 K; 1XC5 A; 3TKY A; 2R3S A; 3WU1 B; 1P7J A; 3WTT C; 4E6K G; 1Y56 A; 4ZZD A; 5M3F J; 3W2A A; 4BHP A; 3O6B B; 1YJW I; 1SFU A; 2X6W A; 3N4M A; 3DFG A; 1PUF B; 5E20 A; 2V4J C; 5EF6 A; 3QOP A; 3K10 A; 1ZG3 A; 1U5T B; 2W84 A; 3SZP A; 3CMA I; 4RGR A; 1AKH A; 1ENH A; 2X1C A; 3IP4 B; 1BJA A; 3FDY A; 3J7Y J; 4XOT A; 3BTC A; 1T6S A; 3FXO A; 1SAU A; 3OYF A; 1SAX A; 1NH3 A; 2IA0 A; 2JUG A; 1KYZ A; 4G7H F; 3ZMD A; 4MIM A; 1GLN A; 2COM A; 1GVD A; 2OZU A; 4RLQ A; 5ILS A; 1YTY A; 1Y39 A; 5B66 C; 2YS9 A; 2CV0 A; 2EFP A; 3E3V A; 1BBY A; 2DFE A; 4DYC A; 3LWF A; 4KA4 A; 3H0G J; 3O2P E; 5KAF C; 1G6N A; 3UR3 C; 2MC3 A; 1E17 A; 3ZQI A; 3DLA A; 2M2E A; 3SDG A; 1MW7 A; 1XCB A; 1POG A; 3W6V A; 2F5V A; 2DT6 A; 2MAB A; 3RQ4 A; 1U5T C; 4ZYG A; 4DW6 A; 3A02 A; 2EH3 A; 3H9J A; 1MBK A; 1DQU A; 2H09 A; 1Z1D A; 3ML6 A; 2Z16 A; 3HEF A; 1B1B A; 1HQC A; 2F5D A; 3I55 I; 5F64 A; 4LG0 B; 2MFZ A; 4BXX J; 4KIF A; 5HLH A; 4RGU A; 3OYM A; 2VAS A; 1FC3 A; 2COB A; 2ZME A; 4J01 A; 4IVN A; 5FKK A; 3QYB A; 3FK7 A; 2WBM A; 3F6V A; 2DQR A; 1RKT A; 3HC7 A; 3ASO H; 4M9Z A; 4FAS D; 2MC4 A; 4CH7 A; 2STW A; 4GO1 A; 2JVH A; 4Y17 A; 2JQ7 A; 1O57 A; 2L7Z A; 3CJN A; 2L5Q A; 3L2C A; 5E1Z B; 3G73 A; 2VQL A; 3MFK A; 5KVR A; 1KZH A; 1R5I D; 2HDD A; 3S93 A; 4RAF A; 5IY5 H; 3FXJ A; 4BNC A; 2HPM A; 2RNG A; 4CCM A; 2CV2 A; 4FIS A; 2GOX B; 3E7L A; 4EJT A; 4QPQ A; 3BR1 A; 1P2F A; 4HOB A; 4I09 A; 3PIO F; 2VPL A; 1YQA A; 4IRH A; 3WHB A; 3OOP A; 2BXZ A; 2CW7 A; 5BPI A; 1W4M A; 3TO6 A; 4DOZ A; 3IV5 A; 4J19 A; 4BUP A; 2HQN A; 4Z2Y A; 2DA5 A; 3HUG A; 4EM1 A; 4ZDL A; 4P5O A; 4A6E A; 1MSF C; 3KP6 A; 2R7D A; 1UZC A; 3KP4 A; 3Q5F A; 1ULY A; 4IOA F; 3K4K A; 2R7S A; 1LPQ A; 1O3T A; 3CCE I; 1SD4 A; 1WHU A; 2PJR B; 5E8I A; 1VQN I; 1BOB A; 1W1W E; 1FMV A; 5ED4 A; 2H1K A; 1MD0 A; 1TWG J; 2JUC A; 4YIF A; 1IN5 A; 3AL0 C; 2NVX J; 4ZZL A; 4PJM A; 4BY1 J; 1J2X A; 2YU3 A; 4RAY A; 1XDS A; 2E35 A; 2KT0 A; 5CYV A; 2ZJQ F; 4AUX A; 4DNC A; 2GWR A; 1RNL A; 3LA3 A; 5E3M A; 2R5Z A; 1A04 A; 1S7A A; 1UB9 A; 3LQR A; 4HV5 A; 1I6X A; 5L3E A; 2B63 J; 2FNP A; 2QSH X; 5E3L A; 5EEA A; 3WGI A; 2V1N A; 2CW0 F; 3FHZ A; 5F0C A; 2XKO A; 3TP0 A; 2P5K A; 2K7L A; 2EQR A; 5IYD J; 5EGO B; 4M3G A; 2I8D A; 3HYI A; 1MZB A; 4OMY A; 5DD8 A; 2XDV A; 5F04 A; 3JRF A; 1WVR A; 1MMD A; 2BOL A; 1I1G A; 2IPQ X; 2OCE A; 4RGS A; 1K61 A; 1BA5 A; 2QCO A; 3HHG A; 5JHU A; 1FT9 A; 2JSP A; 5FKM A; 1Z6T A; 2FNA A; 2DPD A; 2DJI A; 3L2U A; 1R5G A; 3CCS I; 4I6Z A; 3QOE A; 3DCF A; 4CCN A; 2DYR H; 1KON A; 2GA2 A; 4HZF A; 4EM0 B; 2XHK A; 4G94 A; 2CRG A; 3KYL A; 2H6B A; 4I0B A; 5E79 C; 2WAE A; 3AG2 H; 1SFK A; 3FX3 A; 3LQQ A; 4HV6 A; 1R4M B; 2YSR A; 2XAH A; 3NEU A; 3S32 A; 3KLN A; 4B4C A; 1Z7L A; 4EEF G; 1SFX A; 1KQ8 A; 4KN7 X; 3CDL A; 3DTK A; 3CD6 I; 4A3G J; 5LHG A; 4B1R A; 3HOS A; 3BT9 A; 3LMM A; 2AHQ A; 3BJA A; 5FRN A; 1HF0 A; 3OYN A; 3REO A; 1BR2 A; 2DFH A; 2M0C A; 3LSJ A; 5CLS A; 1SEU A; 3OIO A; 2K3P A; 2OA4 A; 2Y0S N; 2E71 A; 1D5V A; 3LAJ A; 2DXI A; 2L02 A; 1FBU A; 3LFK A; 3JAM K; 3LL7 A; 3F8F A; 4DZP A; 1QVT A; 4CZZ A; 3RZD J; 3M1C A; 1BN5 A; 4BEH B; 3W3C A; 1AOY A; 5DM6 F; 4KT5 C; 1Z77 A; 1WJF A; 3N05 A; 4JYK A; 4M3B A; 4AM3 A; 4EM2 A; 1A35 A; 4LJZ F; 2L9V A; 3S1Q J; 2ZBK A; 4CCL A; 5LGT A; 1BM9 A; 1TLH B; 4L5I A; 1OCO H; 3KFW X; 1DDN A; 2ME6 A; 3LAP A; 2OPT A; 4PUS A; 2GXB A; 3GUD A; 1NK2 P; 1XDU A; 5CQG A; 2E2J J; 2R92 J; 5LBQ A; 4G9Y A; 4LIV A; 2LR8 A; 1X1B A; 2PEX A; 4X6A J; 5FLX Z; 2F5C A; 4I76 A; 3VFZ A; 1DPU A; 2CSO A; 2JK3 A; 2PX9 A; 4KN4 X; 3EQL F; 4XON A; 4HLY A; 5HDK A; 5HDN A; 2K9M A; 3MWM A; 2R4G A; 1Z0X A; 4BQN A; 2OBP A; 2VOP A; 3NWS A; 1JKQ C; 2LTP A; 2Z5U A; 3Q0W A; 3GW2 A; 4Q47 A; 3SDB A; 3F8B A; 3VSK A; 1HXD A; 5H2F C; 5F0F A; 4XLE A; 4B44 A; 3DU6 A; 3KP3 A; 4CGZ A; 2KJB A; 3OOU A; 1W7P D; 3HL2 A; 3AKZ A; 1A31 A; 3P9K A; 3K4N A; 3FBN B; 1F4K A; 2CUZ A; 2IGN A; 2NVT J; 4EV0 A; 1G3W A; 1J59 A; 3CCQ I; 2B7E A; 1S6L A; 3FM5 A; 2HFH A; 3RJP A; 5GAG J; 2LY2 A; 3ZQL A; 4A69 C; 3GZN B; 1KA8 A; 4I99 C; 3WTS C; 1LDJ A; 4JX5 A; 1KU3 A; 3I53 A; 2M45 A; 1IV8 A; 2M1B A; 2VIX A; 3K70 D; 1OKR A; 1VQ9 I; 1HA8 A; 1X1P A; 4HX8 A; 4XOP A; 2IA2 A; 5DYM A; 4ZYE A; 1GXP A; 4V2G A; 3EUH C; 3H5R A; 3P5J A; 4AIJ A; 1N78 A; 3KZZ A; 2JA6 J; 2EFO A; 2Y48 A; 3WHC A; 3OS2 A; 4U88 A; 1D8K A; 3BP8 A; 1TQI A; 3DU5 A; 3PQJ A; 4KYW A; 2FOW A; 3BPV A; 4KIG A; 2HU9 A; 5D5X B; 4BQO A; 1K4S A; 4XBF A; 2DMQ A; 1JKR C; 1MIJ A; 3HSE A; 3CCJ I; 1HSJ A; 3BY6 A; 1AA7 A; 1VTN C; 1IAW A; 4PGG A; 3BPX A; 4F93 B; 1RIO H; 2IRF G; 5EJC A; 3ZOB A; 3PNV A; 3J80 K; 3KEQ A; 2A5W A; 2PMH A; 2F5F A; 3S3N A; 2NNY A; 1ZN2 A; 3T0Y A; 4GDF A; 2EIM H; 4V2F A; 4IZZ A; 3RPU D; 2H6C A; 3ZN0 A; 3R61 A; 5FKO A; 2IGM A; 1HDP A; 1RRJ A; 2ELJ A; 4LIU A; 5GAD J; 4PSX A; 4M3D A; 4QSH A; 3MZY A; 5D5V B; 2CW8 A; 5M5W J; 1Z21 A; 3PFI A; 3LNQ A; 4A3F J; 4AD9 A; 5BQT A; 3FXU A; 3PSI A; 2F4I A; 1MKM A; 4UNO A; 2IGO A; 1T8I A; 4XNF A; 3F0C A; 4F3Q A; 1BW5 A; 3GO5 A; 1K78 B; 1TNT A; 3KYC B; 1YIO A; 2DDB A; 5M3M J; 2OUM A; 2O3F A; 4AIK A; 2HQ5 A; 5L3C A; 3RCO A; 2JA2 A; 5E18 F; 2H27 A; 3RI4 A; 2KJC A; 2FOK A; 1R7J A; 1MMN A; 3G6E I; 1VQM I; 4RB0 A; 4XLC A; 3AG4 H; 1O3S A; 3LSR A; 2KDO A; 3VB2 A; 1OJL A; 3OYE A; 3JRI A; 3OYB A; 1F5T A; 3F9K A; 4UUS A; 1E0E A; 4ITV A; 1ONV A; 3TL4 X; 3ZXS A; 4KMF A; 3HOW J; 5AON A; 5D4S A; 2XGD A; 1TWA J; 2ACJ A; 4NUB A; 4PCQ A; 1R71 A; 2Z9O A; 4IRG A; 1VQ4 I; 2EBI A; 3GZ6 A; 3D5R C; 4ZTF A; 2OQG A; 3AFH A; 3VOE A; 1SFO J; 1IXS B; 2K4B A; 2O8X A; 4HQM A; 5HOO A; 2MSY A; 3CUQ B; 1WI3 A; 2EA4 A; 5E1X A; 5K7H A; 1B8I A; 4A5M A; 4ZJZ A; 2M7A A; 5E1W A; 4M6V A; 3DEU A; 4WXC A; 4UUS B; 1WSU A; 2K02 A; 5FRO A; 5ILV A; 4MFE A; 1FOX A; 4I98 B; 1X1C A; 4S0H B; 1FTZ A; 2E36 A; 1G3S A; 5B5E C; 3OYA A; 3CZ6 A; 2JWT A; 5IT3 A; 4EGZ A; 2ETH A; 1PYV A; 4N9H A; 3E6M A; 1S7O A; 1T95 A; 1XCV A; 2ZFU A; 3TQN A; 3K1N A; 5JFR A; 1K7A A; 1IO2 A; 2MA3 A; 3L1P A; 1R4N B; 1WRJ A; 3GWZ A; 1JT6 A; 1FP1 D; 5A2Q Z; 4XOR A; 1WQ2 A; 2KP6 A; 3BTJ A; 3VDX A; 3GTQ J; 3QRF F; 2F48 A; 5DUI A; 4ESB A; 2PMZ N; 1VQ6 I; 4Y7N J; 2HXI A; 4P96 A; 1Z7U A; 2PI0 A; 3PNT A; 3TMO A; 2IS6 A; 1R00 A; 4KNY A; 1NK3 P; 1BJZ A; 5CPR B; 3CO7 C; 2ME0 A; 1TBX A; 2CGP A; 3HPG A; 3HJE A; 3I71 A; 3FXQ A; 2CO5 A; 5IYC J; 1XGM A; 1QRY A; 5HLT A; 2L54 A; 3U2R A; 4HAM A; 1ZGW A; 5IP9 J; 1BI1 A; 2M30 A; 4Q4Z F; 2XSD C; 5F1R A; 1PUE E; 4C2M J; 1HCR A; 2VJ4 A; 3PSF A; 3JTG A; 3I3L A; 1J7K A; 1DP7 P; 3A0B C; 2Y30 A; 3ELK A; 1LFB A; 3DWL E; 4A12 A; 1AKH B; 2P81 A; 1V4R A; 2A6T A; 2UV1 A; 1XMA A; 5FFX A; 2Q8K A; 4PK4 A; 3LSI A; 1IUF A; 3IWZ A; 4AWX B; 4FTH A; 4BYY A; 1G8X A; 3BG9 A; 4XKB A; 2HKX A; 2WY8 Q; 1PVE A; 3BG5 A; 2CUF A; 2W00 A; 2CQN A; 2IW5 A; 3BZC A; 5J8C A; 2VC1 A; 1MBH A; 1XGS A; 5H6Q A; 2CWE A; 1YO5 C; 2OD5 A; 2XF7 A; 5F6F A; 4D1Q A; 1R58 A; 1JTX A; 3MKL A; 4E7S A; 3OL4 A; 3K4M A; 2VBY A; 4NBQ A; 4HRI A; 2O03 A; 3BR2 A; 2NAZ A; 3V8L A; 2Y69 H; 2H1L A; 4CCO A; 1LFP A; 2VON A; 4UUT A; 3E5X A; 1YFH A; 1BL0 A; 4MTE A; 4MHG A; 4IHT A; 3GTP J; 4O3M A; 4ZDP A; 2EIL H; 2DDA A; 1KU9 A; 2K9Q A; 3JTH A; 3Q0V A; 2OAZ A; 1LDD A; 1YW8 A; 1V3F A; 3AL0 B; 4IQ4 A; 3Q9V A; 4XLA A; 3SEZ A; 3AG1 H; 5KCM A; 2A6E F; 2DA7 A; 3CC4 I; 3OYI A; 1IXC A; 2ZXW H; 3QAH A; 3HOV J; 1YW9 A; 2ZME B; 4L9J A; 1CQT A; 4XRS A; 5D8K B; 1ETV A; 3K4L A; 2R5Z B; 2JZY A; 3L2W A; 1IDY A; 2ISZ A; 3LSH A; 1HOM A; 3TO7 A; 2KHM A; 3KP2 A; 4L5J A; 3M8E A; 2JMW A; 4HNT A; 3I4N J; 2LG4 A; 2O61 A; 5FD5 A; 1WH5 A; 1FPQ A; 1N75 A; 2ZJR F; 3BLY A; 5JLW A; 4MFD A; 3QPS A; 5ICF A; 2DA4 A; 1LVK A; 2BGC A; 4S04 A; 1D1A A; 3CC2 I; 1VQ8 I; 2R7T A; 3H3V K; 3H92 A; 2MLG A; 4FHT A; 5DDG A; 1N77 A; 2M8G X; 4OIN F; 1WH7 A; 2VT2 A; 1EKE A; 1LFU P; 3BWG A; 5E8G A; 4I01 A; 1SMY F; 4U87 A; 2BY0 A; 3LSK A; 3ZMS A; 3F72 A; 2WY7 Q; 1RUN A; 3S3O A; 4LLG F; 4CDG A; 4U0W A; 5BOX A; 5L3F A; 2E5N A; 1U8B A; 3BR5 A; 1X3Z B; 3OYD A; 3HKZ A; 2FEZ A; 1FIP A; 1JJ8 C; 1B59 A; 4CO8 A; 1A36 A; 2FD5 A; 4XKV A; 2VN2 A; 9ANT A; 2LRE A; 1FBS A; 5LRS A; 3ZQC A; 4UVA A; 3I54 A; 2J5O A; 3A01 B; 2R7U A; 5GPA A; 2QA4 I; 4E7Z A; 5A2Q K; 1P4A A; 2DA1 A; 1IF1 A; 1B72 A; 4XKC A; 1ZQ3 P; 1W36 D; 1A6I A; 2L2O A; 3WTW C; 3WTV C; 1ON1 A; 3CUO A; 1XMX A; 1IUY A; 4N4N B; 3RDI A; 1DU6 A; 3TGN A; 1FOK A; 4BKX A; 3FIS A; 4GFB A; 5GPC A; 4BH9 A; 3KZI C; 3GLL A; 1NTC A; 3M8J A; 4H4K C; 4LG0 A; 2DFF A; 4NDL A; 4KT6 A; 2ZJP F; 2GXG A; 1IW7 F; 4PFP A; 3KZY A; 1UST A; 2DOF A; 2B9S A; 2ZCW A; 1JUP A; 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