The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GIZ A; 2A05 A; 2CQ7 A; 2EPF A; 1XTA A; 2DDA A; 1WVR A; 2DDB A; 1XX5 A; 1RC9 A; 3MZ8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AHQ A; 3GCM A; 3GZ6 A; 3HSR A; 1V5E A; 2DJI A; 1PDN C; 1XTA A; 4XLA A; 1BL0 A; 2DCE A; 4KT6 A; 1BJZ A; 1LNW A; 5BQT A; 4HF2 A; 2VKH A; 2OAZ A; 3KP6 A; 3HEF A; 4IO9 F; 3HHG A; 3Q0U A; 1PJR A; 5EJC A; 5EZH A; 1JJ6 C; 2H8W A; 2IA2 A; 2ETH A; 2X48 A; 3ESW B; 3I4N J; 1FX7 A; 4A93 J; 2IJL A; 1AA7 A; 3ZCO A; 1Z3X A; 2K4B A; 3O3K A; 3OSF A; 3I54 A; 4BJ6 C; 2FRH A; 2DA7 A; 3KEQ A; 3GLL A; 1KU3 A; 4XLE A; 2R5Y B; 1PYV A; 2KP6 A; 4QIW N; 2UWM A; 2IS1 A; 2IP2 A; 2YS9 A; 3ZQL A; 1MSF C; 1USS A; 2D1V A; 2ME0 A; 2L5Q A; 3GXO A; 2Q1Z B; 4IQJ A; 2XSJ C; 3I64 A; 4DIQ A; 4BBR J; 5E1W A; 2RNJ A; 1F9N A; 2L7M P; 2IBD A; 2LY9 A; 4II2 A; 3AFH A; 3HZJ A; 1V3F A; 3TDZ C; 2RC4 A; 2W00 A; 3T8T A; 2GOX B; 5CVU A; 3HM5 A; 2L01 A; 2KJB A; 1VQ4 I; 1AWC A; 2GXB A; 2VKV A; 5E8I A; 2UZK A; 1ZAO A; 2HYG D; 2OUM A; 1Z67 A; 4UUS A; 2Y2Z A; 4I76 A; 2NS7 A; 2IT0 A; 3K4C A; 4HDU A; 1ETO A; 2KQR A; 3RYP A; 3GFL A; 2EIM H; 1LDK B; 2L7F P; 1VF9 A; 2W82 A; 1V54 H; 5C4J J; 1T38 A; 1IN8 A; 4OAZ A; 1U8B A; 4OIO F; 2QVO A; 5CPR B; 3BP8 A; 1XN7 A; 3K70 C; 3R60 A; 1ZQ3 P; 2F4O B; 3BG9 A; 2KZV A; 4M9Z A; 1U8R A; 1REP C; 4A0Y A; 2CWE A; 5FKL A; 3ZRG A; 2R7Z J; 1MH3 A; 4XK4 A; 4BQA A; 1U6G A; 4F91 B; 1ZEL A; 3PSF A; 2R0Q C; 5JLW A; 4PDK A; 4BEH A; 1KU9 A; 6PAX A; 1OR7 A; 2ZB9 A; 1VQL I; 4KT5 C; 2KDZ A; 2FJ1 A; 5DS9 A; 3L2C A; 2FSW A; 3DPU A; 1O7L A; 3UR3 C; 5HS8 A; 2V9V A; 2DK8 A; 5E3M A; 3GTJ J; 2WB1 N; 1FMW A; 1H89 C; 1E0E A; 4CDG A; 1HA8 A; 2EJR A; 3IWZ A; 2GIV A; 4Q5S F; 4ZH4 F; 1T0F C; 2VUM J; 2F6C A; 2OV7 A; 1QA6 A; 1SC7 A; 1XMK A; 3L2Q A; 2KJC A; 1IN4 A; 1A6I A; 3IKV A; 3CCR I; 1S29 A; 3WOD F; 1VND A; 3BWG A; 1EA3 A; 1Y8Q B; 1R22 A; 1ZR4 A; 1T0F A; 4XRS G; 2MLK A; 2Y75 A; 5K7F A; 3ZQC A; 1R23 A; 2FNP A; 2RGV A; 2X1E A; 4AUX A; 5FLX K; 2IS6 A; 4RGR A; 3LFU A; 3J80 K; 2IRF G; 3GTL J; 1MJ9 A; 4HA8 A; 4AYB A; 1WI9 A; 2FU4 A; 2JRM A; 1B8I B; 1IZ1 A; 3M1C A; 5EGO B; 2ISY A; 3K4B A; 5FFX A; 4XKV A; 4V2G A; 2UUZ A; 4CCN A; 1FY7 A; 4DJA A; 2KRC A; 3T0Y A; 1B72 B; 1NTC A; 1VI0 A; 1Y8R B; 2CQX A; 2NAZ A; 2Z1D A; 5E79 C; 1R1U A; 2JQ7 A; 4BXX J; 2HVQ A; 1TP4 A; 1MBH A; 2HDW A; 4RM3 A; 2R7Q A; 2IS4 A; 2M7A A; 2V1D A; 4OIQ F; 2ELH A; 4WX9 A; 4M3G A; 3TO9 A; 5C44 J; 5LEJ A; 2G7U A; 2L4A A; 1XCB A; 4PGG A; 2H27 A; 5H6Q A; 1GXQ A; 3MMY B; 1MMA A; 4Y13 A; 3ECO A; 3MCZ A; 2ZBK A; 2MGQ A; 2HI3 A; 4CO8 A; 2D1H A; 5ILV A; 4ESB A; 1FBU A; 1MMS A; 4BL0 B; 1UG0 A; 1X1B A; 4BS9 A; 4BE0 A; 1XSD A; 1WJB A; 2XRL A; 1IJW C; 2OCC H; 2ZME C; 3IHU A; 3PFI A; 3AG2 H; 2K27 A; 1OCO H; 3WTU C; 3MZ8 A; 1IXR C; 5DUI A; 1HW5 A; 1FEX A; 5F27 A; 1B59 A; 4RAZ A; 2NYX A; 2TDX A; 3P9C A; 1UB9 A; 5HDN A; 3OYC A; 3GTK J; 4LJZ F; 3S3N A; 4MLO A; 1YLF A; 2CS3 A; 5B1B H; 4CCK A; 1SD4 A; 2R7V A; 1UHM A; 1SMT A; 3SXY A; 1S9H A; 4Y17 A; 4IRH A; 2P8T A; 5J40 A; 3KYL A; 1P92 A; 3G6E I; 1EV7 A; 5B5E C; 2JPC A; 5IT3 A; 1D3Y A; 4ASN A; 4PSW A; 2VOO A; 1LE8 B; 4CYD A; 3OIO A; 1E17 A; 4BHC A; 3FZV A; 4PUS A; 3CCU I; 1IN7 A; 3OS1 A; 1CF7 B; 3I59 B; 2DO7 A; 2M34 A; 1YIJ I; 3L2W A; 2ZFW A; 2HU9 A; 1BC8 C; 2RNG A; 1FOY A; 4JX5 A; 1MH4 A; 2LH9 A; 1IC8 A; 2JN6 A; 3FBN B; 1F43 A; 2IGO A; 3OIQ A; 2VLA A; 3BR3 A; 3LFK A; 4M6V A; 3HRT A; 1B1B A; 2I5U A; 3LSK A; 3KZI C; 4M9X A; 1D1B A; 1MDM B; 1YW7 A; 5D5W B; 2H6C A; 2ZFU A; 2ECC A; 3OYH A; 1H0M A; 3GEZ A; 2O6G E; 2LP0 A; 3JRA A; 2VJJ A; 3ERM A; 3G1O A; 2MC3 A; 3SQN A; 2EQR A; 2V6C A; 1G3W A; 1X4O A; 3ISP A; 2QGU A; 4LIV A; 2NS8 A; 3S1N J; 1JHF A; 1W0T A; 4A3C J; 3CES A; 3ERE D; 3MAJ A; 4A3J J; 5FRO A; 3BG5 A; 4A3B J; 1STZ A; 2CSO A; 2V9K A; 3Q9V A; 1A5J A; 1WH7 A; 1J0R A; 2F5E A; 1SAU A; 4XOP A; 2KT0 A; 1R5G A; 3SZT A; 3LMM A; 3W6J B; 1OFC X; 3BQY A; 1W36 D; 2E34 A; 3KEO A; 4XQF A; 5K7H A; 4F7Z A; 1LFP A; 3GBG A; 2RN7 A; 4KFC A; 1DGW Y; 4Z6Y A; 4ENN A; 1JKO C; 5K5Q A; 1ETY A; 1VQ5 I; 3M3Y J; 4MTD A; 2OZU A; 1K78 A; 4G6T B; 3E6B A; 4S04 A; 1W7P A; 3EUH C; 3WHB A; 1FP2 A; 3CC2 I; 2CQQ A; 3HRS A; 1N77 A; 3VWB A; 4BDZ A; 4PSX A; 3B02 A; 3IV5 A; 2KL4 A; 4NC8 A; 2P5K A; 2QUF A; 3EUH A; 3MZY A; 2HTS A; 2Y0S A; 3HOZ J; 5ICG A; 1AKH B; 1G3S A; 2LFB A; 4MTE A; 1RR8 C; 4Y33 A; 4G7Z F; 2K02 A; 3IAM 2; 3VYR B; 2E2J J; 5DEQ A; 4BJ5 C; 4ZYH A; 1OYI A; 5FJ8 J; 4GO1 A; 2FNA A; 4FE7 A; 2ZJP F; 2XIG A; 1YS7 A; 1B9M A; 2RDP A; 2L7K A; 5IY5 H; 2HOS A; 1VQO I; 5BNG A; 2DA3 A; 2IS2 A; 1QZZ A; 4P5O A; 4XBF A; 3LOC A; 1UAA A; 5F04 A; 4R1H A; 2HPM A; 5FD6 A; 2R5Z A; 1BIB A; 2HZT A; 3WGI A; 1BI3 A; 3FM5 A; 1MW7 A; 2DFF A; 3CMY A; 2LG4 A; 3ZMT A; 5EEG A; 5H6R A; 2R7O A; 2AXL A; 2MW8 A; 3AL0 B; 2XGX A; 1MIJ A; 2ESN A; 1OYY A; 2X1D A; 2DYR H; 3FXK A; 2YU3 A; 3PFY A; 4E7H A; 1TWG J; 4WXH A; 3W3C A; 3CJQ B; 2KHM A; 2E60 A; 3BG7 A; 3KCC A; 1W5S A; 3NWS A; 2XKP A; 5KAI C; 4ABZ A; 4XLN F; 4CHU A; 3BZC A; 3KYD B; 3S2D J; 1O3T A; 1GHC A; 1ZR2 A; 4DBR A; 3OYK A; 5BMZ A; 2JA6 J; 3BR5 A; 1POG A; 2M3A A; 3LA2 A; 2JZY A; 1IG7 A; 1RRJ A; 3LL7 A; 3CJR B; 2HOA A; 1K61 A; 3OYG A; 3VSK A; 4XSZ F; 2X4H A; 1QVU A; 1I6H J; 1FMV A; 1IN6 A; 2YX4 A; 2V26 A; 1R5H A; 4F52 A; 1GV5 A; 3P9I A; 2VQC A; 1PP8 F; 2P81 A; 3DXJ F; 2ZJQ F; 5KHD A; 2E1M C; 4EQQ A; 3H5N A; 3DLL F; 3CME I; 3O8G A; 4A3K J; 3I0T A; 2IW5 A; 3PUB A; 4ZYA A; 4IQ4 A; 1E2X A; 5FLX Z; 2PBI A; 2R7S A; 1UHW A; 3BOQ A; 3K10 A; 3AG4 H; 2F5D A; 4LG3 A; 5DCM B; 1PUF B; 4I02 A; 4UVC A; 5E8G A; 4DNC A; 2DFH A; 3WGH A; 5GAE J; 5IP6 A; 1XC5 A; 4J01 A; 4KIC A; 4AVP A; 1A6Q A; 3TMO A; 3H36 A; 5IT9 K; 4L9T A; 5K7Z A; 1WH5 A; 4A12 A; 1WJE A; 3TED A; 4MEX F; 4IXA A; 2WTE A; 3IH2 A; 4EVI A; 2EZK A; 2AQE A; 3WTV C; 1F1Z A; 3E5U A; 2X9D A; 3LQQ A; 5LD2 C; 1ETQ A; 2HTJ A; 3NAU A; 3WTZ A; 1ULY A; 3T5X A; 2O9L A; 2FD5 A; 3HOU J; 3DKX A; 3IWF A; 3F23 A; 3P7N A; 1Z21 A; 3W6K B; 2DBB A; 4W97 A; 3BG3 A; 5D8L B; 3H3V K; 3ELK A; 2FBH A; 3JRE A; 4N4N B; 2K9M A; 3HPH A; 3H9J A; 3L09 A; 4HG2 A; 1E3H A; 4BQN A; 3SJM A; 5M5W J; 2IAI A; 4IJA A; 3JR9 A; 5ILS A; 1MNE A; 3KPH A; 1BOB A; 3S3O A; 3T1B A; 2RKH A; 1SFX A; 5D4S A; 2LKP A; 1TWA J; 2HKO A; 1O3Q A; 3OYN A; 1X58 A; 4IF4 A; 4A6E A; 2LBF B; 4HDV A; 5F1J A; 2E5Z A; 4BE2 A; 1F4K A; 1APL C; 5FB2 A; 1Y1W J; 2XPV A; 3KEY A; 4A3D J; 3K2A A; 2RVC A; 3BZK A; 3BT9 A; 1X19 A; 1EH6 A; 3U21 A; 1XSV A; 3WG7 H; 3TO7 A; 4GDF A; 1I1G A; 3K1P A; 1V5F A; 4C2M J; 2ESH A; 2M5W A; 1TLH B; 2PJR A; 3WTT C; 1W5T A; 1XMA A; 1G3Y A; 3GO5 A; 1PUE E; 3ABK H; 2L54 A; 3KZZ A; 3LST A; 3HB9 A; 1ZG3 A; 3LSP A; 1I1S A; 3DV8 A; 2JJ7 A; 1UMQ A; 1TQM A; 3DKW A; 3WHC A; 4LFU A; 4XL9 A; 2QQ9 A; 1MZB A; 4CIC A; 5FD5 A; 2ZXI A; 2BW3 B; 4A5N A; 5DYM A; 3C2G A; 1MND A; 3DBH B; 4A3M J; 2GWR A; 2NVT J; 2W24 A; 3I5U A; 2A6T A; 2V1X A; 1HLV A; 3SEZ A; 3BTL A; 2R92 J; 2O3F A; 2DA4 A; 1P7J A; 1FBS A; 4Z2Y A; 2XAJ A; 4FE4 A; 3DBR B; 3E3V A; 1R7J A; 1NG7 A; 2BXZ A; 1Z6R A; 5JVT A; 1BC7 C; 1JGS A; 4DZJ A; 2MFZ A; 1RIO H; 2FF4 A; 5CVV A; 1WZ2 A; 3M1E A; 4XLP F; 1ZRC A; 3H92 A; 3IC7 A; 1Q1H A; 4MQV A; 2AQF A; 4UVB A; 5GPA A; 3GTO J; 1O57 A; 1W7P D; 3ZQI A; 3K4N A; 1FYM A; 4IX7 A; 3FK7 A; 1TQI A; 1BJA A; 4U87 A; 3WE2 A; 4BNC A; 3BRO A; 5HNH A; 2MC4 A; 2WWY A; 1LEB A; 5LRR A; 3U1K A; 4N4O B; 4XLH A; 2RRE A; 4XRF A; 5ICC A; 3BDD A; 2DK5 A; 5IYB J; 5FKM A; 4MHG A; 3Q3S A; 1M1E B; 3DU5 A; 2K7L A; 2VQH A; 3NQO A; 5HOO A; 4WXD A; 3KP2 A; 3M07 A; 1XCV A; 2J5P A; 3EUA A; 1MNM C; 1LUJ B; 2O03 A; 3UKG A; 1ZGW A; 5EYR A; 5AON A; 5F0F A; 3W2W A; 4XOT A; 5F1R A; 3MN2 A; 3CCS I; 3FXL A; 1A35 A; 3GTQ J; 3S1M J; 2D45 A; 4GFB A; 3RKW A; 3QOE A; 4XLC A; 3VSL A; 1O3S A; 2CJJ A; 3AG3 H; 4XNF A; 4E7Z A; 4HNV A; 4BEH B; 1VTN C; 5EEH A; 2XAS A; 4IKF A; 2QKL B; 2H1L A; 3HG9 A; 2DA1 A; 1J75 A; 2M4G A; 3OYD A; 1X3Z B; 2HQ5 A; 2ZKZ A; 4EGZ A; 2EV0 A; 3GWZ A; 2A6E F; 3E1S A; 1ON1 A; 4PJJ A; 4I01 A; 3K4J A; 2X6O A; 5EEA A; 2E1C A; 4BKX A; 2E19 A; 3ZMZ A; 2QZ8 A; 4AD9 A; 1J09 A; 5M3F J; 1RI7 A; 1HCR A; 2K3F A; 3BR1 A; 3F8C A; 3R0J A; 3ZGK A; 3F22 A; 2WAQ N; 4G6Q A; 5FRM A; 2A5W A; 3GW2 A; 4HLX A; 3SZG A; 2BOL A; 4IOC F; 1W1W E; 3K4L A; 1VQ6 I; 3E6D A; 4LK1 F; 3DPL C; 5C3E J; 2GXG A; 2QM3 A; 3HHH A; 1V4R A; 4G7H F; 1R71 A; 3EYI A; 4AYB N; 1BR2 A; 3QAH A; 1OCP A; 1RR7 A; 3HGY A; 2HYJ A; 2XGC A; 4F92 B; 1QPI A; 4PFP A; 1HSJ A; 2I10 A; 3O6B B; 1Z91 A; 2DDA A; 1KYW A; 1OCZ H; 1U5T C; 2EFO A; 2KRF A; 2XAQ A; 3C18 A; 4GRI A; 1S6L A; 4HST A; 4RGX A; 1H9T A; 1OCR H; 2TCT A; 5DD8 A; 2HS5 A; 2LYC A; 2CUE A; 1Y1V J; 1U5T A; 3S93 A; 2BYV E; 5ICF A; 3ZMU A; 4I99 C; 2P5V A; 1GLN A; 2IEK A; 3FXU A; 3G1M A; 3CCE I; 3CDL A; 2QCO A; 1JE8 A; 2M4K A; 4A0X A; 2PN6 A; 4U0Y A; 1QGP A; 2CG4 A; 2LF8 A; 5EG0 A; 4C3H J; 3J81 Z; 2CFO A; 4UVA A; 2Z99 A; 1E3O C; 5JI6 A; 2W57 A; 5J6X A; 4ZZL A; 4IHV A; 3D5S C; 3TKY A; 3BLY A; 1X3W B; 1MJA A; 3KYC B; 5LRS A; 3HTU A; 2R7T A; 4AC0 A; 3CLO A; 4FT8 A; 1LJ9 A; 2XAU A; 2KIS A; 2GIZ A; 1MSE C; 1NK3 P; 1U9N A; 4ZJZ A; 2Z2S B; 5K5O A; 3GX4 X; 1D5V A; 5FLM J; 3DU6 A; 1WSU A; 4Y7N J; 2B7E A; 5IT9 Z; 5H2F C; 2E7W A; 4YEJ A; 1Q1V A; 5K5R A; 1YJW I; 4C3J J; 1U0J A; 1KQ8 A; 1Z05 A; 1Z1D A; 4HAM A; 1ZG5 A; 1K4S A; 3OOU A; 2UXN A; 1VQK I; 2ZME B; 2EFN A; 3E6C C; 1W36 C; 2DQR A; 4PGH A; 3ZMD A; 2XF7 A; 1Z7L A; 3PNY A; 2HYF A; 4P9U A; 3FKI J; 2A61 A; 1IV6 A; 1X1D A; 1HBX G; 3MQ0 A; 3G2B A; 4IEJ A; 3KET A; 2YU9 J; 3ECH A; 3EUK L; 2A07 F; 2EV5 A; 5CJ9 A; 2E7X A; 4LMY A; 3O8H A; 2OPT A; 2GA2 A; 3CDI A; 2VC1 A; 1FOK A; 4I0A A; 1VQM I; 1P4W A; 2V1N A; 3OL4 A; 3ULQ B; 1IAW A; 2W48 A; 4XON A; 3SDB A; 5LLQ A; 4NNJ A; 5DTD A; 2NNN A; 4HZF A; 5AIQ A; 3ZQ7 A; 2STT A; 4KN4 X; 4DBQ A; 2D2W A; 3GFM A; 2FOK A; 1OR7 C; 2NOG A; 3LA7 A; 2PG4 A; 3DEW A; 5KAF C; 2WA0 A; 4KUM A; 2HQN A; 1DU6 A; 1ZK8 A; 4OMZ A; 5LFA A; 2ZNY A; 2CRG A; 4HEA 2; 3A0B C; 1RKW A; 3B73 A; 2J5O A; 4UV8 A; 4AM3 A; 1KA8 A; 1J5Y A; 2PMZ A; 4HPQ A; 3SHF A; 3ZOB A; 4FET A; 1IRG A; 1HKS A; 2A68 F; 3QYB A; 1LVK A; 2ZSI B; 1QPM A; 3VYS B; 4E7L A; 5J3L A; 4P55 A; 3C2B A; 3ZQQ A; 4I6Z A; 2BXY A; 4B3A A; 1YRN A; 3JAM K; 3S32 A; 2HDC A; 2ME6 A; 1KGS A; 4LLG F; 5LGN A; 4A2U A; 2DMN A; 3K7A J; 4CUG A; 2JVG A; 5J8C A; 4BQQ A; 2HNH A; 2OA4 A; 1SVM A; 1MBG A; 3GME A; 2PEX A; 3F21 A; 1LQ1 A; 1GDT A; 3RDI A; 1Z6T A; 3IH3 A; 1VQ9 I; 3QOD A; 3KP7 A; 2O7O A; 1IRF A; 1MMG A; 4C2U A; 2G7H A; 5FO5 A; 3TL4 X; 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