The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GIZ A; 2EPF A; 1XTA A; 1RC9 A; 1WVR A; 2CQ7 A; 2DDA A; 2DDB A; 3MZ8 A; 1XX5 A; 2A05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3JRG A; 3OY9 A; 3OSF A; 2GM4 A; 5LD2 C; 4HV6 A; 3WG7 H; 5D4S A; 3BC8 A; 3H9G A; 2YS9 A; 3E5Q A; 3ZN0 A; 5FD6 A; 1W1W E; 3LQQ A; 2PFB A; 1R00 A; 5GPA A; 4KIF A; 2HDD A; 1EJ9 A; 2OC6 A; 3ABL H; 3E0J B; 3CZ6 A; 4XLF A; 2HWV A; 2QLZ A; 3K1N A; 3D1N I; 4IRG A; 3IL2 A; 2L9R A; 1YYV A; 2VB6 A; 4RAY A; 4ENJ A; 4WK8 F; 4U7D A; 1D1B A; 1D8K A; 2DQR A; 4UV8 A; 3UR3 C; 3SEQ A; 1GUU A; 2GWR A; 4WWC A; 1LFP A; 2EZL A; 4PFP A; 5E20 A; 3P9K A; 3W6K B; 4AIK A; 5FFZ A; 2XPW A; 1PP7 U; 1F36 A; 2K3F A; 4C2U A; 1ZG1 A; 3OYM A; 1EF4 A; 3K4K A; 3F8M A; 3HL2 A; 1W7P D; 3OMY A; 2CV0 A; 2KJB A; 2NNY A; 2QBY B; 2CQX A; 4MEY F; 5FLX Z; 1ONV A; 3KP3 A; 3H35 A; 3I58 A; 3QQA A; 1T0F C; 3U21 A; 4PSX A; 2QM3 A; 4BJ5 C; 5BS6 A; 3JRC A; 3L2W A; 2R5Y A; 5HLH A; 2A5Y B; 2Z9O A; 1K6O A; 2QA4 I; 3HGY A; 4IRI A; 3OYF A; 2R7Q A; 4CA0 A; 1JJ6 C; 1VQK I; 3FX3 A; 1Z3X A; 4OMZ A; 5EYR A; 1IUF A; 1FP1 D; 2QQA A; 5K1Y A; 5E3M A; 1YX3 A; 3P5J A; 4BEH B; 2W85 A; 3G71 I; 1DU0 A; 3JR9 A; 3J81 K; 4TV7 A; 4EM0 B; 2VBZ A; 1YE9 A; 2IA1 A; 5IT3 A; 4Y4R A; 3RYR A; 5EEH A; 2Y9Y A; 2HS5 A; 2R7F A; 1BBY A; 2A6H F; 4IJA A; 4IHS A; 3M8J A; 2JJ7 A; 2K9Q A; 2X6X A; 3Q0U A; 5ILS A; 1MH3 A; 1IV6 A; 1E0E A; 3ZOB A; 1A6Q A; 4NC6 A; 1H9G A; 4XLP F; 1D8J A; 2FQ4 A; 2L4A A; 1U5T B; 1K6Y A; 4D5F A; 1P92 A; 3SQN A; 3HDD A; 2L02 A; 4QTR A; 2EV0 A; 1GV5 A; 4M9Z A; 3KZY A; 4WXD A; 1BL0 A; 2QSF X; 3FWE A; 3HOV J; 4HBL A; 3L2V A; 5D5X B; 3NAR A; 2E1M C; 4QLC U; 2D5V A; 2L2O A; 1QU3 A; 2PG4 A; 2OU2 A; 3QPL A; 3T1B A; 1YW9 A; 1EKE A; 2KFD A; 3KP5 A; 1ZGJ A; 2V9V A; 2CGP A; 2WAE A; 1HCR A; 2EA4 A; 1G8X A; 1O3T A; 4AM3 A; 4RB0 A; 4F3Q A; 1WI3 A; 4BHP A; 3RIR A; 4F52 A; 3S2D J; 3LFU A; 2QEN A; 3S14 J; 4CYC B; 4G6D A; 2A61 A; 3H5N A; 3F21 A; 1A5J A; 1XDU A; 3B02 A; 3HXL A; 3ABT A; 5JVT A; 3M4O J; 3CQZ J; 5L3D A; 1MW7 A; 2MH9 A; 3F8B A; 3IH2 A; 3I71 A; 5CVR A; 4U7B A; 3IAS 2; 5M5Y J; 2DXI A; 2HZD A; 4N4N B; 2HU9 A; 3ERE D; 5BMZ A; 2NAZ A; 4BS9 A; 2O5R A; 3OYB A; 2UWM A; 2R7Z J; 3RTR A; 2OTJ I; 5LEJ A; 1XD7 A; 3I53 A; 2FBK A; 1JUP A; 2LK2 A; 2PMZ A; 2ICW G; 2RRE A; 5JR3 A; 3FKJ A; 2GA1 A; 5B1A H; 1V4R A; 1J0R A; 2V7F A; 2WAQ N; 3EUH C; 4NHJ A; 2XRO A; 1ZKG A; 3OYI A; 1F43 A; 4IVN A; 1ZRF A; 1JUM A; 3N05 A; 4KIC A; 4ESJ A; 3VFZ A; 2Z99 A; 1JJ8 C; 1YLF A; 4AIH A; 1PYV A; 1QGP A; 1TLH B; 3KFW X; 1FBU A; 4N0B A; 1BI0 A; 3BG6 A; 1V5E A; 3BOQ A; 1AHD P; 1XSV A; 1CF7 B; 2FEZ A; 1LB2 A; 3SFI A; 1YRN A; 1MJA A; 1WJD A; 2MD0 A; 5DEQ A; 3HRM A; 1YIO A; 3TOA A; 4B44 A; 1QRY A; 5GTI C; 2IXS A; 1BI2 A; 1RNL A; 2FF4 A; 2IGM A; 2QQ8 A; 2QWW A; 3KZZ A; 3K2Z A; 4LLN A; 5F1J A; 2XAQ A; 2ZJP F; 2W25 A; 4NUB A; 1QHG A; 1BI1 A; 3PSF A; 3K10 A; 2UUZ A; 3DWL E; 4G7Z F; 5L3E A; 1I6H J; 5IT9 Z; 1MBJ A; 2CUE A; 2W1O A; 2XAU A; 4M73 A; 4A3J J; 1GV2 A; 3BR2 A; 4WXH A; 3P7N A; 1S7A A; 5F6F A; 3MZH A; 2JSC A; 3A0H C; 4KT6 A; 3WOD F; 5BNG A; 4PJM A; 1NHA A; 2F5D A; 1Y6I A; 5K5Q A; 3IHU A; 4L9V A; 3IWF A; 2BY3 A; 4I6Z A; 4Y3O A; 2NVT J; 1IDY A; 2LBF A; 1X58 A; 4KFC A; 2L5Q A; 2RNJ A; 1BIA A; 2HKO A; 2PI0 A; 4GCV A; 5FGM A; 2GBY A; 4PK4 A; 4XN0 A; 2DFE A; 1X3U A; 2CU7 A; 2DA1 A; 4U0Y A; 4FT8 A; 4HNU A; 4KT5 C; 2MC3 A; 3F8C A; 4KJZ A; 1HKS A; 2BHZ A; 1R58 A; 3LL7 A; 1ZAR A; 1N75 A; 2X51 A; 2OQG A; 3DF8 A; 3ZMS A; 5EZG A; 3A0B C; 3ZR8 X; 3B6C A; 3SZG A; 4CIC A; 1S7E A; 3G1M A; 5E8G A; 2G7H A; 2AHQ A; 1YHQ I; 4I02 A; 1VND A; 4UVB A; 1ULY A; 4G94 A; 5L3C A; 1R49 A; 3I4N J; 1A31 A; 3HTS B; 2KDZ A; 3WE3 A; 3L09 A; 4KUM A; 3ROU A; 5J40 A; 1IN8 A; 4KMU X; 2R5Z B; 2DPU A; 2BV6 A; 3QOE A; 1FBS A; 2QF7 A; 3ZN1 A; 2QZ8 A; 2O61 A; 5CPR B; 1ODD A; 2X6Y A; 4CZZ A; 4K2E A; 2IAI A; 4MO7 A; 3VSL A; 1LDD A; 4LB5 A; 1F9N A; 4NC8 A; 2V1X A; 4PJN A; 4B8X A; 3C2B A; 3GTL J; 1J9I A; 1D0Y A; 2EH3 A; 3AAF A; 2VC0 A; 3C2G A; 4C3J J; 2BXY A; 4KA4 A; 2UV1 A; 3J81 Z; 1FY7 A; 3OYH A; 3K0L A; 1ZHF A; 1BW5 A; 1RES A; 1W5T A; 3A01 B; 3AG2 H; 2VOP A; 2K40 A; 1KGS A; 3L2Q A; 1JKQ C; 2PX9 A; 3HTU A; 2H1L A; 4IHY A; 3CCQ I; 3ZGK A; 1ZLJ A; 3ELK A; 5DM6 F; 2ECC A; 1MMS A; 5C4J J; 2CRG A; 2HQN A; 1YOV B; 3ASN H; 2R93 J; 3H9Q A; 1O3R A; 1IF1 A; 3S93 A; 3DKW A; 3OYK A; 1D0Z A; 3L00 A; 2Z5U A; 2QKM B; 3VOE A; 4DYR A; 5CYV A; 5D8L B; 2ZB9 A; 4MFE A; 1O7L A; 5LGU A; 3H36 A; 4M3F A; 1FX7 A; 3FMS A; 2COM A; 3QWL A; 3K1M A; 2P7C B; 2MFZ A; 3W3C A; 4E7L A; 4FTH A; 1YRN B; 1G3T A; 3MMY B; 4UV9 A; 5CQE A; 4UUS B; 3BJ6 A; 1DGR M; 3CDH A; 3DKY A; 5HOD A; 1YW7 A; 2CQQ A; 4ZTF A; 3GTG J; 2VPL A; 4DOZ A; 3GTM J; 3LSR A; 3KP4 A; 3PFI A; 3LSH A; 5E3O A; 4RM2 A; 3E5X A; 1IG7 A; 1XMK A; 5D5W B; 2DK5 A; 3R61 A; 4A93 J; 3JRA A; 2EBI A; 2I5U A; 1R1T A; 4IQJ A; 4I0A A; 3SYT A; 2PN6 A; 5LHG A; 1K7A A; 5K5R A; 2L9S A; 3RPU A; 4M6V A; 1OIS A; 1G2H A; 1DUX C; 1LDK B; 2XAS A; 4B3X A; 5C4X J; 4EJW A; 2FSW A; 3RQ4 A; 2B7E A; 1LVK A; 1I3A A; 4FET A; 3RI4 A; 1P4A A; 3OYJ A; 4IHT A; 3I5U A; 1MBE A; 2M5W A; 2OUM A; 2L9V A; 3ZMD A; 4NBQ A; 2EWN A; 2X1E A; 4EM1 A; 4YFX F; 3E1S A; 2OQR A; 4PGG A; 2IBD A; 2P81 A; 4RLF A; 3QYE A; 2DA7 A; 2ZO4 A; 2IGO A; 2XGC A; 3OS1 A; 3VWB A; 3ZPL A; 4IHX A; 2PEX A; 2Y0S A; 3DP7 A; 5JLW A; 3Q5F A; 2I8D A; 1XGM A; 2Y2Z A; 4WF2 A; 3E5U A; 5FRN A; 3DEU A; 3M3Y J; 2ZME B; 2LLK A; 4UUV A; 1RR7 A; 1SAX A; 2NOJ B; 5GPC A; 2L54 A; 3FXJ A; 2E7W A; 4G7H F; 5IYD J; 5IP7 J; 4H4K C; 5D4R A; 1XSD A; 3V7C A; 2LH9 A; 2Y48 A; 2EFN A; 4QSH A; 2K3P A; 2LP0 A; 3T5X A; 2W4S A; 1I27 A; 2NS0 A; 2CO5 A; 1WHU A; 4HLY A; 1O3S A; 2BYV E; 2IS4 A; 2HFH A; 2ZKZ A; 4JK1 X; 4G9Y A; 1Z0X A; 2M87 A; 3LSI A; 4ZYH A; 1RUN A; 2KIS A; 3WU0 A; 2DK8 A; 4DBQ A; 3V8L A; 5IPA A; 3E6C C; 5TJJ A; 3BLY A; 5H6Q A; 4MQ9 F; 2NS7 A; 1SMT A; 2F48 A; 2PMZ N; 2KZG A; 1FOX A; 1XGS A; 4IZZ A; 5FLM J; 2Q8K A; 4CDG A; 5DYM A; 5EJC A; 1V5F A; 2M7A A; 4IQ4 A; 2KRF A; 5D6E A; 1IC8 A; 2RC4 A; 4WX9 A; 1GDT A; 3BJO A; 2B9S A; 1RC9 A; 5F27 A; 3LQR A; 2FNP A; 2M7B A; 2VJ5 A; 1G3Y A; 1MJ9 A; 2BY2 A; 1Z6T A; 4FCY A; 1R1V A; 1BN5 A; 3L7W A; 4KIT B; 2M8E A; 3EDP A; 3J7A Y; 2FOK A; 4J01 A; 1Z6R A; 2OV7 A; 3DV8 A; 5J8F A; 1JGG A; 2PMH A; 1FIP A; 2OZ6 A; 3MAJ A; 3D5S C; 5CLS A; 5DS9 A; 3TO9 A; 3ZMU A; 1DGW Y; 2E35 A; 3ML6 A; 4CH7 A; 2IW5 A; 4B4C A; 1U0J A; 5B5E C; 2K7L A; 2JRM A; 4FX4 A; 4UB8 C; 2VXZ A; 2X48 A; 2IT0 A; 4P96 A; 1AKH A; 2L4M A; 5F1R A; 3RKW A; 4P1W A; 1OPC A; 4KYW A; 1LDJ A; 1Z05 A; 3RJP A; 3H5A A; 2KZV A; 2QQB A; 1RIO H; 3P9C A; 5DM7 F; 3I4M J; 1CF7 A; 3S1M J; 4II2 A; 1NG7 A; 3WGI A; 1PUF A; 5TIS C; 1R9T J; 1RET A; 1TL8 A; 4I01 A; 2BHY A; 3MCZ A; 3CMY A; 1YJ9 I; 1APL C; 1ZQ3 P; 3BJA A; 3T8R A; 2LG4 A; 3L2U A; 3GZ5 A; 1P4W A; 4HEA 2; 2V9P A; 2HEO A; 4A3B J; 3F9K A; 3N97 A; 2KLO A; 4LFU A; 3OL4 A; 1W36 C; 2HPI A; 2WY8 Q; 1TZL A; 4ZYA A; 3PJR A; 1ETO A; 5HLI A; 3V4G A; 1SFU A; 2WAF A; 1S9H A; 3PUF A; 1S72 I; 5JI6 A; 3GFI A; 4ESF A; 2A69 F; 3C3W A; 4BHC A; 2LF7 A; 3D5L A; 2HYG D; 1Y39 A; 1Q1V A; 4HQM A; 2ISY A; 1L3L A; 4HX8 A; 3COA C; 1REP C; 5HVQ C; 1YW8 A; 2OAZ A; 1OCT C; 1FEX A; 5DCM B; 3HZJ A; 3FM5 A; 5E1X A; 3S1N J; 2BZT A; 1IRZ A; 2HPM A; 2Q0O A; 4XRM A; 3CUO A; 4YFK F; 2VKH A; 3CC4 I; 4HRI A; 3HRT A; 4LMY A; 4JBA A; 1NG6 A; 1PUF B; 2EZI A; 4D9J A; 3IWZ A; 1W5S A; 3GLL A; 2BGC A; 1LE8 A; 3GX4 X; 1W0T A; 2EA2 A; 2LVS A; 2IRF G; 3OYL A; 4R1H A; 3RPQ A; 3OYA A; 2H1K A; 3HYI A; 1OFC X; 1QHH D; 2IS2 A; 3MEX A; 2KPM A; 4B3A A; 1TQP A; 2JT1 A; 3BQZ A; 1FOK A; 1T2K A; 4GYI A; 3CMM A; 5FLV A; 4KIG A; 3GZN B; 3MZY A; 4ABZ A; 4BE0 A; 1ETX A; 2Q2E A; 1MBH A; 2V1N A; 4XQF A; 4XRS A; 2E60 A; 2RQQ A; 2PJR A; 3PL8 A; 5JHU A; 2R7U A; 1UJ8 A; 1SC7 A; 3QPH A; 5KHD A; 4XSZ F; 4A2U A; 4UVA A; 2R92 J; 4MTE A; 2HDW A; 2CSO A; 5HS7 A; 4AD9 A; 2AQF A; 3BG5 A; 2VQH A; 3TL4 X; 1OJL A; 2Y0M A; 4GRI A; 3E6B A; 5CVV A; 2YX7 A; 2ZME A; 4EAT A; 1TWC J; 3QYB A; 5D8K B; 4BDZ A; 1OCC H; 2W7N A; 4XMY A; 4AVZ A; 1LFU P; 1HKT A; 4E7S A; 2VQL A; 1HST A; 3IKT A; 3PO2 J; 1V5G A; 3F8F A; 2K9N A; 1I6X A; 2KIU A; 5ILU A; 3SZT A; 3TO6 A; 5IT9 K; 3HM5 A; 4HW0 A; 3P9I A; 4ESB A; 3EPZ A; 4HYE A; 5EG0 A; 4M9S A; 4MQV A; 4I09 A; 3D5R C; 2JMW A; 5F0C A; 2BY1 A; 1T0F A; 4BKX A; 3LFK A; 2ISZ A; 3W2W A; 3KLN A; 4LIT A; 3KZI C; 2J5P A; 3ONQ A; 1FIA A; 4P9U A; 3HPH A; 1FBQ A; 1K78 B; 1DQU A; 1LPQ A; 1Z3Y A; 1SVO A; 3CCJ I; 1Y0U A; 2ZXW H; 5J4Y A; 1K4T A; 2W00 A; 4GXO A; 2DTR A; 2UXX A; 4LK1 F; 2VAS A; 1IUY A; 2VXD A; 4AUX A; 5EGO A; 2K86 A; 4EMS A; 3U9G A; 1H89 C; 3LSG A; 3CCS I; 1GVJ A; 5E3L A; 4G6T B; 2VT3 A; 2BE5 F; 4CCL A; 3RYP A; 4D7M A; 3CCY A; 1UG0 A; 1JHF A; 2KDO A; 3GWZ A; 1MZB A; 3BQY A; 4WCG A; 4KDP A; 4Q5S F; 3FXR A; 3PNV A; 3VSK A; 4DYQ A; 2OCC H; 2ESN A; 1WJ5 A; 3JRI A; 6PAX A; 2DJI A; 4IHW A; 3DEE A; 2Y30 A; 2AXT C; 3A1Y A; 1ERD A; 5E3N A; 2X1D A; 3H9J A; 5FO5 A; 1RUO A; 2KIQ A; 4BE1 A; 2VBW A; 4XKC A; 4OWR B; 1B8I A; 1SAN A; 5IOZ A; 5HLT A; 3DPL C; 4Q4Z F; 1Z7U A; 5DUI A; 3ZQI A; 4I99 C; 3AG4 H; 1OMI A; 4CYD A; 2FD5 A; 3W6V A; 2HNH A; 1VQP I; 4BQN A; 2JPB A; 1R6R A; 1D3Y A; 4HDV A; 1K83 J; 5J3L A; 5LEK A; 2IVM A; 2HTJ A; 1YJW I; 4F92 B; 3TW6 A; 3TDZ C; 1UB9 A; 1MND A; 1MMN A; 4Z2Y A; 4DIQ A; 4C2T A; 2JA7 J; 3R0J A; 4DQ2 A; 2HQ5 A; 4RAF A; 3KP6 A; 1EA3 A; 2K4B A; 5IYC J; 3C1D A; 1X3Z B; 2R0Q C; 3H1C A; 4BUP A; 3FXL A; 1XX5 A; 3JTG A; 4JOM A; 3FBI B; 3JSO A; 4BH9 A; 1RR8 C; 1NH3 A; 3K69 A; 1HC8 A; 2HR3 A; 4CCJ A; 2LY9 A; 1QZZ A; 4HX4 A; 4LB6 B; 1WJF A; 4DZP A; 4I0B A; 1MNM C; 1NTC A; 2CH0 A; 3Q9S A; 3HUG B; 5CKT A; 2G7U A; 2FOW A; 1XTA A; 2DOE A; 4Y13 A; 3K4N A; 4X6A J; 3CCV I; 3QP6 A; 4G7O F; 1D5Y A; 3DLL F; 3H3U A; 1X1B A; 3DKX A; 1TQM A; 2OPT A; 1DDN A; 1FC3 A; 1S5L C; 4F55 A; 2GA2 A; 2N8G A; 4BBR J; 5BPD A; 4W1U A; 2IGN A; 1P2F A; 2DOD A; 3WTW C; 1W5C C; 3WTV C; 2ADU A; 4MLO A; 4ON0 A; 1XGO A; 2ELH A; 1HA8 A; 4RB2 C; 3RKQ A; 5CVI A; 4ZC3 A; 2WB1 N; 2B63 J; 2PJP A; 1I1G A; 1SD5 A; 1T95 A; 2L0K A; 3E97 A; 1LFB A; 1G6N A; 4YG2 F; 2V1D A; 5E8I A; 3BY6 A; 2XHK A; 3AL0 B; 2Q1Z B; 4J00 A; 3ZQQ A; 1XPX A; 5FFX A; 1F4K A; 3RZD J; 1TBX A; 1ON1 A; 4D5C A; 2XF7 A; 1IO2 A; 5C3E J; 2FRH A; 2XSD C; 1YX5 A; 3HUG A; 5LGT A; 3JCU C; 1ZRC A; 3MKZ A; 4GYG A; 1TWH J; 3HB9 A; 1ZR2 A; 1K4S A; 5L3B A; 4AU7 A; 5KK1 A; 1IAW A; 1RI7 A; 1YS7 A; 3GVA A; 2DW4 A; 3PIO F; 5LRS A; 2E34 A; 2LR8 A; 2KIM A; 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