The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
49
|
structure length |
49
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSCQYQDLLSNCDSLKNTAGCEHELLKEKCKATCLCESGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-032, a cystein-rich domain of CRISP-2 from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
Cysteine-rich secretory protein-2
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| total genus |
5
|
| structure length |
49
|
| sequence length |
49
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Crisp domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XTA A; 2GIZ A; 1RC9 A; 2A05 A; 3MZ8 A; 2CQ7 A; 2DDA A; 2EPF A; 2DDB A; 1XX5 A; 1WVR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BR5 A; 4WCG A; 4UV9 A; 2J5O A; 4GYI A; 2LMD A; 1LKX A; 1R5H A; 4LGW A; 3RKW A; 4YFX F; 1EF4 A; 2XGX A; 4D1Q A; 3V4G A; 1S9H A; 2V1X A; 3BCA A; 4A6E A; 3HL2 A; 2E2H J; 1N77 A; 4J00 A; 3E6C C; 4CUG A; 1MSF C; 1FLI A; 2BVM A; 2GIV A; 1K61 A; 9ANT A; 2PJP A; 4MEY F; 1TTY A; 4OIQ F; 5F27 A; 4LD5 A; 1GXP A; 2Z99 A; 4IHV A; 1MND A; 4G7Z F; 1IN6 A; 2F5E A; 4CXF A; 1OCP A; 4LG0 B; 5CLS A; 1XGN A; 4BKX A; 5CVU A; 1LDJ A; 4V19 K; 3TQN A; 3HRM A; 2WB1 N; 3QYE A; 3ZPL A; 1FSH A; 4JP0 A; 1TL8 A; 2BV6 A; 1J09 A; 1YIT I; 3ZMD A; 3K69 A; 1B8I B; 2EFN A; 4TV7 A; 4BHC A; 1ETK A; 1ZK8 A; 4OOI A; 3HGG A; 4YIF A; 1B6A A; 1SVL A; 2P8T A; 3HG9 A; 1MZB A; 4OIP F; 3ZQI A; 1JKQ C; 1FOX A; 3QAH A; 1OCT C; 1WI3 A; 2AHQ A; 4ENJ A; 3KZZ A; 3E5U A; 1RC9 A; 3PUF A; 4HW0 A; 1BR2 A; 4M9S A; 5J8C A; 2ECC A; 2VL8 A; 2KJB A; 3LNQ A; 4BE1 A; 2UXX A; 2X9D A; 1BI0 A; 4KIC A; 3S93 A; 3HRS A; 1IC8 A; 4XK4 A; 3ZMT A; 3E1S A; 3BTI A; 2HYG D; 1XCV A; 3DPU A; 2M0M A; 3A01 A; 1YFH A; 3GZ6 A; 3CME I; 3CP8 A; 3LWF A; 1YIO A; 3ZXS A; 5IYD J; 2MGQ A; 1C0W A; 2K9L A; 2VBX A; 2LKS A; 2IVM A; 2VPL A; 2XAF A; 5GAG J; 3OIP A; 5DEQ A; 3GTQ J; 3E5X A; 3JTG A; 3CO6 C; 1JUP A; 2Y0S N; 3S32 A; 2ZNY A; 2XAH A; 1P7I A; 4IXA A; 2DA4 A; 3KP3 A; 1PP8 F; 3A03 A; 2Q8K A; 2B7E A; 4HRI A; 3G2B A; 3LSJ A; 4PJM A; 1ZAR A; 3BZC A; 5IPA A; 2X6Y A; 2W25 A; 4IHT A; 5D5U B; 3ISP A; 3WE3 A; 2ZO4 A; 2R0Q C; 2R7X A; 1OR7 A; 4HA8 A; 3L2V A; 1D0Z A; 3MZH A; 1TWA J; 4PCQ A; 4ON0 A; 1YG2 A; 4RM3 A; 4XLA A; 3N05 A; 2KQR A; 5ILU A; 3PNT A; 3OYJ A; 2NVQ J; 2E19 A; 3I4P A; 1IUF A; 2YU9 J; 2RKH A; 2GM4 A; 3JW4 A; 4HDU A; 5FD5 A; 1A6Q A; 4IL6 C; 2HI3 A; 3ESW B; 4BGD A; 1V5G A; 2Y0M A; 4YIR X; 2MSY A; 2YUS A; 5DCM B; 5ED4 A; 2OC6 A; 4LLL A; 1TT5 B; 1ZRC A; 4A93 J; 3PJR A; 3F8C A; 2HQ5 A; 4B3A A; 3RTR A; 4OIR F; 1MJ9 A; 1OCC H; 2DI3 A; 2IP2 A; 3EET A; 2W85 A; 3BRO A; 4HX8 A; 3VWB A; 2WAE A; 1U0J A; 2Q2E A; 4DYR A; 1UHM A; 4NC6 A; 4XSZ F; 3M1C A; 3GFM A; 3QYB A; 3F8F A; 1XMA A; 5IOY A; 3X2Q H; 1YHQ I; 3CCM I; 4FTH A; 3J81 K; 4D7N A; 3FXU A; 3BG5 A; 5TIS C; 3DEU A; 3WHC A; 2A69 F; 3WE2 A; 1VF9 A; 2FML A; 3DU6 A; 1Y8R B; 3SZP A; 1FOK A; 2DYS H; 4JYK A; 5F6F A; 1U78 A; 1OYI A; 5TJJ A; 2XSJ C; 4GRI A; 4XON A; 3ULQ B; 1KYW A; 1OCR H; 3FBN B; 2VE9 A; 2BW3 B; 1U5T B; 3T8T A; 4RM2 A; 2F48 A; 1PUF B; 2MC3 A; 2VQL A; 3WG9 A; 2CMP A; 4XRF A; 2F5C A; 2UXN A; 2GOX B; 4BEH A; 4KT6 A; 1FTZ A; 2O3F A; 2MG4 A; 1RRJ A; 3JRE A; 4HDV A; 1S7A A; 1GDT A; 4FE4 A; 2NS8 A; 2AXL A; 2RDP A; 3NAR A; 2E60 A; 5E1Z B; 5KVR A; 1IN7 A; 3DPL C; 3D5L A; 5FFZ A; 2IS2 A; 2DA3 A; 1TNS A; 5K5O A; 3BJA A; 3FDY A; 2BY2 A; 1FBS A; 3HDD A; 2GOM A; 4ZJZ A; 2W7N A; 2CW0 F; 1V55 H; 2BVL A; 2E35 A; 3ABU A; 1ONV A; 1ON1 A; 4JK1 X; 4XRM A; 4C3J J; 1U3E M; 4DW6 A; 3H9G A; 4U0Y A; 2E1M B; 4A3K J; 2FSW A; 2Y75 A; 4XNF A; 1OQY A; 2OCC H; 4A3I J; 4BE0 A; 3JSO A; 1ZH5 A; 2ESN A; 3MD2 A; 1E3P A; 4XN0 A; 5IT3 A; 3FXO A; 2M7B A; 2H8R A; 2HDW A; 4YG2 F; 3W2A A; 4A3M J; 5F08 A; 4GFB A; 3RSN A; 1U9O A; 2VON A; 3CZ6 A; 2QLZ A; 4XBF A; 2WTE A; 1I5Z A; 4BHB A; 3M07 A; 2ZKZ A; 3IRQ A; 1IXR C; 3NEU A; 2O8K A; 2CW8 A; 2ELH A; 5GAE J; 3CC2 I; 3OSG A; 1XCB A; 3ZQC A; 3AAF A; 5DM6 F; 4G6D A; 5DYM A; 4EV0 A; 3CD6 I; 2HZD A; 4I7H A; 2VOP A; 2L9N A; 4IQJ A; 2I8D A; 2D1V A; 2QKM B; 4CA0 A; 2GQQ A; 2KZG A; 3KIO A; 4UB6 C; 2CQ7 A; 3PSF A; 1R6R A; 3BG9 A; 4IVN A; 3VOE A; 1FIP A; 4AU7 A; 4B4C A; 4S05 A; 2Z33 A; 2K3P A; 1KZH A; 4Z6Y A; 1MJB A; 3SZT A; 1D3Y A; 3EUH C; 2XV4 S; 1EH7 A; 1WKM A; 3JTH A; 1IG7 A; 2DJN A; 1ZRD A; 1SFK A; 1ZG3 A; 3F0C A; 3HTU A; 3KEO A; 4XR6 A; 2H94 A; 3VYT B; 4IRH A; 1TW2 A; 3GWZ A; 4LG0 A; 3SDG A; 2ID3 A; 2CU7 A; 3S2H J; 4PFO A; 4G94 A; 3GEZ A; 3KYD B; 1HA8 A; 3HOU J; 2JTV A; 2X4H A; 5HS9 A; 3A02 A; 4PUS A; 3TP0 A; 1VQK I; 2EIJ H; 5H20 A; 3MKL A; 1ACI A; 5AON A; 3D0S A; 3FMR A; 5JR3 A; 2B63 J; 2KIQ A; 3R0A A; 4X0G A; 4UUV A; 2A61 A; 4G9Y A; 2O03 A; 1BW6 A; 3I59 B; 4HV6 A; 1HKQ A; 1WZ2 A; 1V5E A; 2M8G X; 4FHT A; 2CGP A; 2OQG A; 1WQ2 A; 1PVE A; 4GCV A; 4PJ0 C; 2V9V A; 1YS6 A; 2DT7 B; 3HTS B; 4N0B A; 2UZK A; 4BY7 J; 2M30 A; 2G7H A; 3JRC A; 4X1E A; 2I5U A; 1F5T A; 1Y0N A; 3CJN A; 5JVG F; 1JXS A; 4I99 C; 1X58 A; 5BPI A; 2QEN A; 3FMS A; 3DCF A; 4PFP A; 1QVT A; 5F64 A; 3RJP A; 2IS4 A; 1FT9 A; 1D1C A; 2IGO A; 1SFO J; 2DU9 A; 4JBA A; 1ZQ3 P; 4LLN A; 4HG2 A; 2V9K A; 4QLC U; 2R7T A; 4MIM A; 1YW8 A; 2XSD C; 3W6K B; 1O3S A; 2ZB9 A; 3ZQL A; 5GAD J; 1YW9 A; 1IXC A; 3IUO A; 3OR1 C; 1QHH D; 4EQQ A; 2M7A A; 3GZN B; 3PSI A; 3UNG C; 4MTD A; 1DQU A; 1UB9 A; 2FRH A; 2GIZ A; 2L2O A; 4FX4 A; 4HYE A; 5D6E A; 4QTR A; 3CMY A; 4J01 A; 4OU0 A; 3L2C A; 1Z67 A; 3SZG A; 5L3C A; 1YJN I; 1BC7 C; 1IUY A; 2CG4 A; 4PDK A; 5EEA A; 2JMW A; 4UNO A; 4L0Z B; 2M34 A; 1TLH B; 2DK8 A; 3P9I A; 2ME6 A; 2Y9Y A; 5LFA A; 3MN2 A; 3CES A; 4RS8 A; 4AD9 A; 3Q9V A; 1FBU A; 1S7E A; 1EV7 A; 2X6O A; 4A0Z A; 5J4Y A; 4HAM A; 3HM5 A; 2DDB A; 4ZTF A; 3VYR B; 4XKV A; 1VQ5 I; 1XDS A; 5K7H A; 3DLL F; 3IH2 A; 1HW5 A; 2OF7 A; 5CYV A; 2K7L A; 3C18 A; 5DCM A; 3KYL A; 4GXO A; 2CYY A; 2KP6 A; 1ZAO A; 1ZHF A; 4XLF A; 4E7H A; 2K86 A; 1S5L C; 3W6J B; 4BAY A; 4IF4 A; 4XKB A; 4ZZL A; 1I3A A; 4WWC A; 3WTS C; 4BDY A; 5J4V A; 2CV2 A; 2LF7 A; 1EH6 A; 2P5K A; 2BOL A; 2VBY A; 3ONQ A; 2CRG A; 3U1K A; 1WJA A; 3DKW A; 3BQZ A; 1X3W B; 3ZN1 A; 1UFM A; 3OYG A; 1Z21 A; 2FNA A; 1B9N A; 3HOY J; 5IP9 J; 4BDZ A; 1ZTR A; 5LHH A; 3TMO A; 2IAI A; 4U7D A; 3BTC A; 3K4C A; 1TWG J; 2ZXH A; 3BZ6 A; 4MTE A; 4E70 A; 3M1E A; 4EGY A; 2O9L A; 1LEB A; 2BW3 A; 3DXJ F; 3VDX A; 1U5T A; 4A3F J; 1DU6 A; 1IN8 A; 1BI1 A; 2QSF X; 1PUF A; 1QQI A; 1IV6 A; 3FXK A; 1TT0 A; 4BE2 A; 3DV8 A; 3BR2 A; 5E8G A; 2EB7 A; 3S8P A; 3PQK A; 1ETV A; 1FWZ A; 2F5V A; 3ZMZ A; 3MKY B; 5HVQ C; 4ENN A; 5FLX K; 4M74 A; 2HXI A; 4IHS A; 3H3V K; 3IKT A; 2QF7 A; 2PJR B; 3PUB A; 2HOS A; 2XKP A; 2XF5 A; 1MW7 A; 2JQ7 A; 5IT9 K; 2VJ4 A; 2V26 A; 3JRH A; 3CTA A; 1OMI A; 1BM9 A; 4HLY A; 2ELK A; 2PBI A; 2W1O A; 4NQW B; 4QPO A; 2HPI A; 4ZH4 F; 3HIF A; 3H9J A; 2WAD A; 3R6S A; 5GPA A; 4XKW A; 2VKD A; 2M4G A; 1QVU A; 2ETH A; 3GX4 X; 1X2M A; 1YX3 A; 2H09 A; 4M9Z A; 1IDZ A; 4BS9 A; 4HPQ A; 5H6R A; 3HSR A; 3SFI A; 4RDU A; 4BQQ A; 3GFJ A; 1YQA A; 4L9T A; 2HGC A; 3V8L A; 1BC8 C; 2AXT C; 5CVI A; 1BIA A; 2R5Z B; 3JRD A; 2JPC A; 2OZU A; 1P9Q C; 1TP4 A; 1XMK A; 3AL0 B; 2ZJQ F; 3IH3 A; 5EEG A; 3HPG A; 4HEA 2; 2LH9 A; 1LUJ B; 6PAX A; 2CV0 A; 2W57 A; 4IOA F; 2P5V A; 4XIC A; 1R00 A; 2QA4 I; 2P81 A; 3S16 J; 3UR3 C; 2TCT A; 1Z9C A; 3GTO J; 3FIS A; 1FZP B; 1J2X A; 1QU3 A; 1AA7 A; 3A0B C; 3K1N A; 2L4M A; 4O5V A; 3PNV A; 2KDZ A; 4XOR A; 3P9C A; 3LFK A; 2R7V A; 4CYC A; 4HX7 A; 1NG6 A; 3IRR A; 4RB2 C; 1JUS A; 1O7F A; 4XLE A; 2FBI A; 4CHU A; 2EIM H; 1QPM A; 4M3G A; 3HKZ N; 2Q1Z B; 4XQF A; 5HDN A; 1W7P D; 4HSR A; 3PFI A; 5GAH J; 1I27 A; 1B72 A; 2OA4 A; 1X1B A; 3E97 A; 1ENH A; 3HRT A; 1IJW C; 4C3I J; 1O57 A; 1Z1D A; 4CGZ A; 2FXA A; 5E1W A; 2PMZ N; 3DTI A; 4ITV A; 1OLT A; 4BQN A; 2R7Z J; 2EJR A; 2WB1 A; 3IKV A; 2O6G E; 3DKX A; 3OYD A; 3K4K A; 3G6E I; 4ENK A; 2MH2 A; 1NTC A; 4C30 A; 1LE8 A; 2KIF A; 2MA3 A; 1VQM I; 2STT A; 5L3B A; 2VXD A; 4JX6 A; 4D9J A; 3PIO F; 2WV1 A; 1KQ8 A; 1S6L A; 2HQR A; 4NBQ A; 5FFX A; 4E7K A; 1DP7 P; 5EZH A; 3CF2 A; 3QU3 A; 1H9G A; 1LJ9 A; 3HC7 A; 4KT5 C; 5B66 C; 4G6T B; 3RIR A; 5TRD A; 3F23 A; 3GUD A; 3B02 A; 2ME0 A; 5BNG A; 1BW5 A; 4PJN A; 4CCK A; 1VQN I; 3E5Q A; 2COM A; 1V5F A; 5KK1 A; 2OV7 A; 2PX9 A; 2DPU A; 1QGP A; 2X48 A; 4I0B A; 3N4M A; 1WWX A; 4AIK A; 2GLO A; 2Z16 A; 3DKY A; 2RQQ A; 3HZJ A; 2JVH A; 4A3C J; 4II2 A; 3JCU C; 3G71 I; 1JHH A; 2E5N A; 4BYY A; 1FY7 A; 5CVV A; 4A5M A; 3IL2 A; 4P55 A; 1R22 A; 3TOB A; 2X0L A; 3MFK A; 3W2V A; 3J7A Y; 4PZJ A; 5HDK A; 1F9N A; 3CCJ I; 3KET A; 3LMM A; 2QYO A; 4RA2 A; 3PO3 J; 3DBL B; 3CCY A; 1WH5 A; 2XGD A; 4EJW A; 4KIT B; 2NNY A; 2PQ8 A; 2Y0S A; 1D8J A; 2Z9O A; 1D8K A; 2OPT A; 3K4M A; 4F93 B; 1W5S A; 3HB9 A; 4XMY A; 3QPL A; 2JT1 A; 1OR7 C; 2F6C A; 3F72 A; 2P7V B; 2DAO A; 2LBF B; 1J75 A; 1DUX C; 2R93 J; 2VB6 A; 2YS9 A; 5E3N A; 3Q9S A; 2VC1 A; 4D5C A; 3ZRG A; 2P6T A; 1MKM A; 1X1C A; 4MLO A; 4YEL A; 3CCQ I; 2FU4 A; 1T33 A; 2VBW A; 2G7U A; 2HTS A; 3L1P A; 1VI0 A; 3O8H A; 1P7J A; 2M87 A; 2A07 F; 2IW5 A; 4IHY A; 1Z6R A; 1JGS A; 1FNN A; 1RET A; 1R5G A; 2DOE A; 2OCE A; 1IN4 A; 2A68 F; 3T8R A; 2EIK H; 1GUU A; 3NRV A; 1OCO H; 1W1W E; 2EV6 A; 5CPR B; 2UV1 A; 3ABM H; 1HQC A; 4AYB N; 2OU2 A; 2M5W A; 1O3Q A; 1H88 C; 2L02 A; 2DA6 A; 2XB5 A; 2YX7 A; 2WC2 A; 3HBL A; 1LVK A; 3LFU A; 2DFI A; 2DJI A; 2XC7 A; 2FOW A; 1TQI A; 1O7L A; 2MLK A; 1A04 A; 1IGN A; 4Y15 A; 3JR9 A; 3DPT A; 3VYU B; 1SEU A; 2XRO A; 2KL4 A; 5CQE A; 2V79 A; 4Q5S F; 3SHF A; 1H0M A; 1SMY F; 1F4K A; 4CDG A; 2VKV A; 1P4X A; 1FEX A; 2OTJ I; 1V4R A; 1WHU A; 1W4M A; 2ICW G; 1KU7 A; 2ZJ2 A; 4QWQ A; 2ISZ A; 1J0R A; 2NS0 A; 1DGW Y; 2L7M P; 2Z5U A; 2VUM J; 3FF5 A; 3FHN A; 5LRS A; 2JA6 J; 4MNU A; 3BWG A; 4XID A; 2EFO A; 3LOC A; 2J5P A; 3W2W A; 2XB0 X; 1K78 B; 1D0X A; 1TQM A; 2RNJ A; 1SD7 A; 4HNT A; 1BR4 A; 4NB5 A; 2DT6 A; 2RC4 A; 2HXO A; 4XKC A; 5FKM A; 4JQF A; 2PJR A; 4BL0 B; 4ZYG A; 1ZGJ A; 1WRJ A; 1R5I D; 3KCC A; 3FK6 A; 4NQW A; 1A5J A; 2HNH A; 2EIN H; 4B47 A; 2M2E A; 4UUS B; 1HCR A; 1GVJ A; 1Y1W J; 4XM3 A; 4K2E A; 3K4J A; 1LVA A; 1WVR A; 2JSP A; 3LSG A; 1TBX A; 2BY3 A; 1FYK A; 3ZP5 A; 3WTX C; 5M5Y J; 3O2P E; 4JX4 A; 2G0E A; 5JVT A; 3WTY C; 2FD5 A; 1R23 A; 2R5Z A; 3VOD A; 1BJZ A; 3CO7 C; 3N97 A; 4LFU A; 2LY9 A; 1XB4 A; 2P5L C; 3C3W A; 4LG3 A; 2CS3 A; 2NOG A; 4CSW A; 1KU3 A; 4A3E J; 1SD6 A; 1XSX A; 4BXF A; 4L5E A; 3B6A A; 4ENM A; 4HQE A; 4BNC A; 2ZSI B; 4W1U A; 2FBH A; 3HXL A; 1MMS A; 1KU9 A; 3K4N A; 1HW1 A; 3RCO A; 3WU2 C; 1DPR A; 2KIM A; 1ETW A; 2M8E A; 5ICE A; 4A3B J; 4UV8 A; 4OIO F; 2EIL H; 5EF6 A; 3CP2 A; 1HDD C; 4M3F A; 1FMV A; 2R7D A; 3NWS A; 2R5Y B; 2NOJ B; 4RAG A; 3G1M A; 2HQN A; 1KQ9 A; 4PJJ A; 3QOE A; 3IV5 A; 2VOO A; 5LGN A; 4EM0 B; 1X1P A; 1YS7 A; 4XLH A; 2DCE A; 5H2F C; 3L00 A; 1RES A; 2V6C A; 4B8X A; 3RZD J; 4XLC A; 1SFU A; 4CCJ A; 5E17 F; 3QPH A; 1XPX A; 2IGK A; 2XRN A; 2KT0 A; 3DU5 A; 4PSW A; 4LK1 F; 2F4O B; 3ML6 A; 1MJA A; 2OTL I; 4U0W A; 3CUO A; 4E7S A; 4M72 A; 3VFZ A; 3K7A J; 2OBP A; 2R7O A; 2DFE A; 2DW4 A; 1HKT A; 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