The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
79
|
structure length |
79
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPLPNPEGLDSDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the human SRC-like adopter protein (SLAP)
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SRC-like-adapter
|
| total genus |
10
|
| structure length |
79
|
| sequence length |
79
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JMC A; 3UA6 A; 4RTW A; 4J9G A; 2RQT A; 1X6G A; 2KXD A; 3UA7 A; 1H92 A; 1ABO A; 2KE9 A; 2KT1 A; 2YUP A; 1BBZ A; 3VS0 A; 2F2W A; 1PRL C; 3A98 A; 4J9B A; 1TG0 A; 1UTI A; 1UDL A; 1J3T A; 2A08 A; 2J06 A; 2K2M A; 4IIO A; 2CUD A; 1BK2 A; 3GBQ A; 2DL3 A; 1M3B A; 2W0Z A; 2YSQ A; 2DRK A; 1OPL A; 3CQT A; 5FWC A; 1JU5 C; 4OMO A; 2CH4 W; 2YT6 A; 2I0N A; 1UHF A; 1M27 C; 1ZLM A; 1JXM A; 2BTT A; 3H0I A; 1SRL A; 1A0N B; 4F17 A; 3U23 A; 4FSS A; 2NWM A; 1WXT A; 1AOJ A; 2OJ2 A; 2ROL A; 2DVJ A; 4E6R A; 2FEI A; 2M51 A; 1GFC A; 1PRM C; 1MV0 B; 3PE0 A; 4R0K A; 1M3C A; 2HEQ A; 1AWX A; 1GRI A; 2HBW A; 3M0U A; 4LUE A; 2ESW A; 1AZG B; 1PKS A; 1UG1 A; 2NUZ A; 3H0F A; 3RBB B; 2PNI A; 3UAT A; 1QCF A; 2ENM A; 2EYX A; 4J9E A; 4D8D A; 4ORZ A; 2KR3 A; 2FPE A; 2SRC A; 1T0H A; 4DEY A; 4RTZ A; 1NYF A; 3VRY A; 1E7O A; 2DBM A; 5FW9 A; 2MCN A; 2DM1 A; 4DEX A; 4RTV A; 1CKA A; 4OML A; 1UE9 A; 1UHC A; 5FWB A; 2W10 A; 3VS3 A; 1YP5 A; 1NYG A; 1NM7 A; 4D8K A; 1ZUU A; 1T3S A; 3JV3 A; 2DYB A; 2LZ6 B; 2KNB B; 1G2B A; 3QWX X; 4JJD A; 2CH4 A; 2X3W D; 2KXC A; 1VYU A; 3RNJ A; 2DIL A; 1TUC A; 1MV3 A; 2ECZ A; 4AG1 C; 5IH2 A; 1S1N A; 3NPF A; 4AFS C; 1U3O A; 2KT8 A; 2JM9 A; 1GCQ A; 2KRO A; 4EIK A; 2L3Q A; 4Z8A A; 1OOT A; 1WYX A; 5GJW B; 5GJV B; 1K9A A; 1XOV A; 2PZ1 A; 4X1V A; 2D8H A; 1SSH A; 3H41 A; 1PHT A; 1HSQ A; 1U5S A; 2RQR A; 1EFN A; 1CKB A; 1UFF A; 2CSI A; 2CSQ A; 4K11 A; 1ARK A; 2CDT A; 2JW4 A; 3C0C A; 1UJ0 A; 2GTJ A; 2LJ3 A; 2M0Y A; 1KFZ A; 2B86 A; 4J9F A; 2EVR A; 4RTX A; 3SEM A; 2BZX A; 2K7A A; 2MOX A; 4ZNX A; 1VYV A; 1VYT A; 2AZV A; 2JTE A; 2LJ1 A; 1ABQ A; 2GBQ A; 1QWE A; 1H8K A; 1BB9 A; 1I1J A; 4HXJ A; 4IIM A; 1GBQ A; 2DE0 X; 2EPD A; 2LP5 A; 1QWF A; 5I22 A; 1E6G A; 1PWT A; 2EYY A; 2JS0 A; 3TVT A; 1M8M A; 2ED0 A; 2KYM A; 4HCK A; 4HVV A; 1WIE A; 1B3Q A; 1YCS B; 3ULR B; 1K4U S; 1Z9Z A; 2AK5 A; 5I11 A; 3ZL7 C; 3M0Q A; 1WA7 A; 1BU1 A; 3M0S A; 4M4Z A; 2O31 A; 3H0H A; 3NHN A; 1X2Q A; 2F2X A; 2FG0 A; 1NEG A; 4CC7 A; 2X3X D; 4J9C A; 2D1X A; 2DF6 A; 3SHW A; 1HJD A; 1H3H A; 2RMO A; 2YUQ A; 2HDA A; 4OMQ A; 1UGV A; 2C0I A; 4RTT A; 4HVW A; 1SHG A; 2DBK A; 4J9I A; 3TSW A; 1K1Z A; 1SEM A; 1LCK A; 2JT4 A; 2VWF A; 4AFU C; 2GTO A; 4J9D A; 2JS2 A; 2MIO A; 1X27 A; 4OMM A; 1X2K A; 2OI3 A; 4LE9 A; 5IHI A; 4KRT A; 2LJ0 A; 1HD3 A; 3VS1 A; 3UF4 A; 1WI7 A; 2O9S A; 4AG2 C; 2EGC A; 1Y0M A; 1U06 A; 1QLY A; 1YN8 A; 2BZ8 A; 2P4R A; 1Z9Q A; 3QWY A; 4GLM A; 3VRZ A; 2VKN A; 3LH5 A; 1N5Z A; 3THK A; 1KSW A; 1V1C A; 3VS5 A; 2DLP A; 2DJQ A; 2L2P A; 3VS6 A; 1UJY A; 1WXB A; 2JM8 A; 4CC3 A; 2D8J A; 1M3A A; 1X69 A; 1QKW A; 3EGU A; 1K0S A; 1X6B A; 2ED1 A; 2FO0 A; 3M0R A; 5EC7 A; 2OAW A; 1OV3 A; 1SRM A; 2DL5 A; 5IHK A; 3VS4 A; 3I35 A; 3TSZ A; 2EW3 A; 4F16 A; 2CT3 A; 1AWW A; 2FPF A; 2O9V A; 1WFW A; 1RLP C; 2JXB A; 1I0C A; 1OPK A; 1ZBJ A; 2HCK A; 2FPD A; 1T0J A; 1GL5 A; 4GBQ A; 4RTY A; 3VS2 A; 1E6H A; 1W70 A; 1YNZ A; 2AKL A; 2EYW A; 1M30 A; 3EG0 A; 1G83 A; 1KJW A; 4RTU A; 1SHF A; 1KIK A; 2RF0 A; 1NG2 A; 2YUO A; 1W6X A; 2A36 A; 1JQQ A; 2CRE A; 4WCI A; 1RI9 A; 2XMF A; 2J6K A; 1NEB A; 1OEB A; 3EHQ A; 2DRM A; 1UEC A; 1AEY A; 2A37 A; 1AWO A; 2L3P A; 1CSK A; 1AVZ C; 1GCQ C; 3REA B; 2DNU A; 1I07 A; 1JO8 A; 2K6D A; 1RUW A; 2HSP A; 1AWJ A; 2YDL A; 4AFQ C; 2FRY A; 1FYN A; 2KEA A; 2FRW A; 1ZSG A; 3EG1 A; 2JMA A; 4JPB W; 5L23 A; 2SEM A; 4CC4 B; 3O5Z A; 2H8H A; 3I5S A; 2DL7 A; 5ECA A; 2K9G A; 3VS7 A; 1MUZ A; 2GGR A; 1ZX6 A; 2EGE A; 2L0A A; 4LN2 A; 1AZE A; 2KBT A; 3PVQ A; 1YWP A; 3M0T A; 2L3S A; 2AZS A; 1VA7 A; 2YUN A; 4Z88 A; 2DMO A; 2LQW A; 2DX1 A; 2EQI A; 2RQV A; 4JJC A; 4CC2 A; 1IO6 A; 2EKH A; 4ESR A; 2J05 A; 4RUG A; 2KGT A; 2EBP A; 2D0N A; 1TUD A; 3I5R A; 2LNH B; 1AD5 A; 2E5K A; 2ROT A; 3NGP A; 4JZ3 A; 2LMJ A; 1WDX A; 1WXU A; 4JZ4 A; 1NLP C; 1SPK A; 2KRS A; 2BZY A; 3I9Q A; 1PKT A; 3PVL A; 2RNA A; 2DL8 A; 2KRN A; 2KYB A; 4F14 A; 2G6F X; 4HVU A; 3R6N A; 5HCK A; 2RQW A; 2C0T A; 2VVK A; 4OMN A; 3M0P A; 5IXF A; 1JXO A; 5IXB A; 1K76 A; 2V1R A; 2J6F A; 2J7I A; 3EG3 A; 4JJB A; 4QT7 A; 1Y57 A; 2A28 A; 1B07 A; 2GNC A; 1NLO C; 1WX6 A; 2AKK A; 2EYZ A; 4Z89 A; 2K79 A; 2DL4 A; 4OMP A; 2C0O A; 2CT4 A; 1FMK A; 3KFV A; 1YWO A; 1K0X A; 2EGA A; 2LX7 A; 2LQN A; 1T3L A; 3EHR A; 2RQU A; 3NMZ C; 3REB B; 2RN8 A; 1ZUY A; 4AFZ C; 4Y92 A; 3EG2 A; 2O88 A; 2CUB A; 2LCS A; 1W1F A; 2GQI A; 2PTK A; 4LUD A; 2KRM A; 1RLQ C; 1GBR A; 3IQL A; 4J9H A; 1JEG A; 5IHN A; 1UUE A; 1WLP B; 2ABL A; 1GFD A; 1X43 A; 2IIM A; 2QDL A; 4A63 B; 2V1Q A; 2F2V A; 3FJ5 A; 1GCP A; 1ZUK A; 4LNP A; 2DA9 A; 2RPN A; 2J6O A; 1QKX A; 2K3B A; 1PNJ A; 2O2O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QTV A; 4XTV A; 3UA6 A; 4M78 B; 2AT1 B; 5GAN 8; 1ABO A; 1VQM Q; 1Q95 G; 1BBZ A; 2L8D A; 3VS0 A; 2F2W A; 4GY5 A; 1UTI A; 4ZGE B; 3ZEH A; 2J06 A; 2K2M A; 4N0A C; 1B34 A; 2KY9 A; 2KDS A; 3MO8 A; 2W0Z A; 2QAS A; 1JU5 C; 2RI3 A; 2DTO A; 2XDP A; 2I0N A; 1UHF A; 4BDY A; 1YJW Q; 1JXM A; 3F70 A; 1VIF A; 1M2V B; 1V29 B; 1BKB A; 5I2S A; 2EQJ A; 3MP8 A; 2ROL A; 1VQK T; 1VQM A; 2V8K A; 4R0K A; 4JS5 A; 1M3C A; 2QG9 B; 4PJM A; 1K73 C; 2NUP A; 1AWX A; 1GRI A; 4MDX A; 2HBW A; 3M0U A; 3MET A; 2QQA A; 2QGG A; 3CXC S; 3I55 A; 1IXD A; 1M5Q 1; 1PKS A; 5KYW B; 1Y07 A; 3RBB B; 4E47 A; 1W2B P; 4J9E A; 4BUG A; 4D8D A; 2DAQ A; 1C6V X; 3ZBD A; 2SRC A; 1T0H A; 4PJO E; 4RTZ A; 1YJW A; 3FB9 A; 2PVO B; 1Q7Y C; 1M1F A; 2DM1 A; 5KCO A; 4RTV A; 2ZAE A; 1RAC B; 5GAO r; 2FHD A; 1ZSZ C; 2A0F B; 5FWB A; 2W10 A; 3VS3 A; 4DBQ A; 1IHW A; 1N8R R; 1NM7 A; 3JV3 A; 3JCM Q; 4IUV A; 2DYB A; 2M02 A; 3JCM f; 5CQX A; 4MMK A; 4JJD A; 1OI1 A; 5LJ5 j; 4KT0 E; 1QVF P; 2D0Q B; 4AG1 C; 1N6A A; 4ZTF A; 1U3O A; 4C0F A; 5HK0 A; 2VXF A; 2LVM A; 2JVV A; 4DBH A; 3QDR B; 4BE2 A; 5GJW B; 4KH0 B; 5CK9 A; 1O75 A; 3P8B B; 4E7S A; 1SSH A; 4KUL A; 1U5S A; 3GF5 A; 1CKB A; 4LDU A; 3TRE A; 3NTK A; 2COZ A; 2DER A; 4KUI A; 1G3W A; 1TOV A; 2CDT A; 2JW4 A; 3C0C A; 2M0Y A; 3E9G A; 3PMI A; 4J9F A; 3MP6 A; 4C5H A; 1MMD A; 4E2F B; 1RAH B; 1Y96 B; 2AZV A; 2LJ1 A; 2GBQ A; 1QWE A; 2QA4 T; 2HZY A; 3VYH B; 1I1J A; 3ER0 A; 3OMC A; 1VQ9 A; 4QKU A; 1GBQ A; 5CCA A; 3RUX A; 5I22 A; 4KH1 B; 1PWT A; 2ED0 A; 1K9M C; 2OTL A; 5DM7 R; 1VQO A; 3M0Q A; 1K73 R; 5GAN 6; 1RAF B; 3OS2 A; 5GAN e; 4PJO F; 2DZC A; 3QSU A; 1HJD A; 1N9R A; 2LQK A; 5GAO p; 3CD6 Q; 1SHG A; 2DBK A; 2HNI A; 2A7Y A; 5GAN h; 3P8H A; 2DET A; 4LD6 A; 3OYL A; 5GMK l; 2VWF A; 3EG9 A; 2EYQ A; 2JS2 A; 4BI3 A; 4OMM A; 1X27 A; 2MWO A; 3QUI A; 2MI6 A; 3VJP A; 5IHI A; 2EKO A; 3VS1 A; 5GMK h; 3CPW A; 4DBF A; 1D0Y A; 4OB1 B; 2V8I A; 5LJ3 e; 3CBP A; 1M90 U; 2MPX C; 3E19 A; 2VYT A; 3PIP A; 3QWY A; 4C92 E; 4ZN3 A; 1PSE A; 4WTO B; 3CCU A; 3LH5 A; 2EQK A; 1V1C A; 4C8Q D; 5GAN 4; 3G4S A; 3CD6 A; 4R55 A; 2DJQ A; 3L2U A; 1B34 B; 2L2P A; 2XG8 D; 3VS6 A; 2K3X A; 5LJ3 h; 1UJY A; 2JM8 A; 3PFS A; 3PIO A; 3EGU A; 1X6B A; 4M78 D; 2ED1 A; 2FO0 A; 2OAW A; 3BDL A; 4HCB A; 2VUB A; 5IHK A; 3VS4 A; 1KC8 C; 2QGF B; 1C0M A; 2H3E B; 1FMW A; 5GAN 3; 3AHU A; 1WFW A; 5LJ5 f; 1I0C A; 4VUB A; 2NUP B; 5J26 A; 4R56 A; 2XK0 A; 4AMC A; 1E6H A; 1W70 A; 1M30 A; 1SHF A; 2CP5 A; 1KIK A; 3QKJ A; 2YUO A; 1W6X A; 1K9M R; 2CRE A; 5DLO A; 3M53 A; 3CME Q; 1NEB A; 1YIJ T; 1Q81 C; 1OEB A; 1UEC A; 2A37 A; 5J3B A; 4A4E A; 1CSK A; 3LWH A; 2QQ9 A; 3GPL A; 2QQB A; 1QCN A; 1GCQ C; 4BI4 A; 3CC2 T; 1VQK Q; 1NZ9 A; 2LCL A; 4JLG A; 5FRN A; 2DXU A; 2RA2 A; 3CC4 Q; 3QG1 A; 1FYN A; 3HFN A; 4OVA A; 3QJY A; 1ZQ1 A; 2X9H A; 2SEM A; 3QO3 A; 1VOM A; 1BCO A; 2H8H A; 3S3N A; 2DL7 A; 2ZPE B; 4C92 F; 2EGE A; 4MZP A; 2HBP A; 2L0A A; 1LJO A; 4M7D F; 1G3S A; 1YWP A; 2BIV A; 2L5Q A; 3M0T A; 4BE0 A; 1KQS A; 3CCQ T; 3GLX A; 4Z88 A; 5GAO l; 1YJN T; 2EQI A; 1H64 1; 1VQK A; 3QZ9 B; 3PTA A; 1VQN T; 4ZGJ B; 1IO6 A; 2EKH A; 3CPF A; 2JOY A; 4RUG A; 3CMA T; 2CZ6 B; 2LNH B; 1AD5 A; 4JZ3 A; 1JRI A; 2CZ1 B; 5CKH A; 3URG A; 5GAM e; 1PKT A; 1WHG A; 1VQ6 T; 5HCK A; 1KC8 R; 1JB0 E; 3M56 A; 4OMN A; 5LJ5 d; 4DOV A; 1SF9 A; 2Y4Y A; 2WSC E; 3JB9 I; 4PJO G; 3EG3 A; 4M75 A; 2K5F A; 3JCM b; 5GAM h; 5CAI A; 3ME9 A; 2YLB A; 1AHJ B; 3JAM E; 3JSC A; 1Y57 A; 3QJ6 A; 3PNW C; 3OS0 A; 4P5N A; 2EFI A; 4EDU A; 2HAX A; 3FIF A; 3HHT B; 3SWN A; 3G7Z A; 2IG0 A; 3OS1 A; 3JCM V; 1UGP B; 4J7F A; 3V8K A; 1IRX A; 2MYS A; 1Q81 R; 2MWP A; 2Y4X A; 3QZ5 B; 4PL6 A; 4C8Q C; 1ZUY A; 3EG9 B; 5CKB A; 5KE3 A; 3EG2 A; 2PTK A; 4LUD A; 2KRM A; 2E4H A; 1RLQ C; 4J9H A; 1YJ9 T; 2K2V A; 3OQ5 A; 5IHN A; 1UUE A; 5DLQ E; 4M78 C; 1NJI U; 2EQM A; 5C0M A; 4BE1 A; 1GFD A; 3CCE T; 4FSX A; 3FJ5 A; 3HP9 A; 4II1 A; 2PUK B; 2MAM A; 4LNP A; 2DA9 A; 4C5G A; 2QA4 A; 3LYI A; 4RTW A; 3M57 A; 2KXD A; 2EQU A; 2HQX A; 1H92 A; 3I56 T; 2LTO A; 4M77 E; 2QEX T; 3H8Z A; 2F69 A; 2JTM A; 3HSB A; 1PRL C; 2LC4 A; 2A3L A; 2FVU A; 4C92 A; 1WHL A; 1J3T A; 4YTL A; 1M1G A; 4IIO A; 1VQ4 T; 2CUD A; 2HSE B; 1BK2 A; 2E10 A; 3GBQ A; 3RMQ A; 3JCM e; 2KQW A; 4A53 A; 1RAG B; 5EG2 A; 4O5V A; 2DRK A; 1OPL A; 3MEV A; 1BCM A; 4OMO A; 5GAN 5; 3CCS T; 2YRC A; 2CH4 W; 3A5Z B; 4GLK A; 2RJF A; 3H0I A; 4J7I A; 1SRL A; 4L59 A; 4M7A C; 2HL5 C; 4RKU E; 2QI2 A; 3VV0 A; 1IZ6 A; 2NWM A; 2OJ2 A; 3VYG A; 5CKD A; 2FEI A; 2M51 A; 3C12 A; 1MV0 B; 3Q1J A; 3S3O A; 3PGG A; 3EFO A; 1YI2 T; 4RCB A; 4LUE A; 3LH0 A; 5AYF A; 5FLX E; 1W2B S; 5HKC A; 1AZG B; 1U1T A; 3A8O B; 1JJ2 P; 3MPU B; 1NPP A; 1NYF A; 1LNX A; 5FW9 A; 2MCN A; 4XU3 A; 4DEX A; 4C0D B; 1VQ7 T; 1YHQ T; 2RJC A; 1OQK A; 4OML A; 3JCM X; 1M90 C; 5FU7 B; 1UHC A; 4C92 G; 3JB9 F; 1NYG A; 1TUG B; 1ZUU A; 4B6M A; 2Z0W A; 1VQL T; 3LLR A; 4L5G A; 3O8V A; 4LD9 K; 3CCJ T; 3QWX X; 9ATC B; 1QVF S; 4FIB A; 1VYU A; 1LOJ A; 3KXT A; 3L2Q A; 1KD1 U; 1TUC A; 1MV3 A; 2ECZ A; 4NL2 A; 1N8R C; 5I21 A; 4BI8 B; 3NPF A; 2JM9 A; 2KRO A; 2YWW A; 3CC2 Q; 4Z8A A; 1OOT A; 1K9A A; 3CPW P; 1OZ2 A; 2D8H A; 3OYM A; 1QVP A; 1LVK A; 2HKN A; 2F1L A; 2ZZD A; 3MEU A; 2X4Y A; 4K11 A; 1ARK A; 2RJD A; 1UJ0 A; 1YIJ A; 2B86 A; 4RTX A; 4XU2 A; 3E9F A; 3OYJ A; 1PC0 A; 4M75 B; 2P0P A; 3A8L B; 1VYV A; 4JRQ A; 5CQY A; 1ABQ A; 5KH6 A; 1GXI E; 3RER A; 1BB9 A; 1M8V A; 3L1A A; 4F7U E; 3CC2 A; 5GAM g; 1E6G A; 3EGX A; 2QAZ A; 3OS5 A; 4EMG A; 1WJS A; 3JCM c; 3SWN B; 2IVW A; 2LNV A; 2DTH A; 3I55 Q; 2CS7 A; 3V7S A; 1K4U S; 1TXQ A; 5I11 A; 2RHU A; 1K8A U; 3ZL7 C; 5KYY A; 1QVG A; 1BU1 A; 2RI2 A; 3M0S A; 2O31 A; 3V7C A; 2F2X A; 2FG0 A; 2BUD A; 5CR2 A; 2X3X D; 4IKF A; 1QCO A; 4QQ6 A; 2D1X A; 3SHW A; 1MMG A; 1H3H A; 2RO0 A; 1BI1 A; 2RMO A; 3CCQ A; 1R0B G; 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