The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
GSSGSSGPLPNPEGLDSDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the human SRC-like adopter protein (SLAP)
rcsb |
| molecule keywords |
SRC-like-adapter
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| total genus |
10
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| structure length |
79
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| sequence length |
79
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9D A; 2DRM A; 4CC7 A; 1K4U S; 1E6H A; 1JU5 C; 1YP5 A; 5L23 A; 3IQL A; 4IIO A; 1ZUU A; 1T3L A; 4RTV A; 1M3B A; 3GBQ A; 3UA7 A; 1RI9 A; 1CSK A; 2GQI A; 1NEG A; 4LN2 A; 1UHC A; 3KFV A; 2J7I A; 3RNJ A; 2L0A A; 2CT3 A; 2EYX A; 1MV0 B; 1Z9Q A; 2K9G A; 2W10 A; 4Z89 A; 4HVU A; 2CRE A; 2P4R A; 2YDL A; 2O31 A; 1SHF A; 1I07 A; 1YNZ A; 2ED1 A; 3RBB B; 3I9Q A; 1QCF A; 1FMK A; 2LMJ A; 5I22 A; 4F14 A; 4JJD A; 2OI3 A; 5IHK A; 1OOT A; 2K2M A; 1WYX A; 2FRY A; 3H0F A; 1EFN A; 2DNU A; 5I11 A; 5EC7 A; 2MIO A; 1OEB A; 4OMP A; 2BZX A; 2DE0 X; 3EG1 A; 1JXO A; 1T0J A; 2EYW A; 2NUZ A; 3EGU A; 4LUE A; 4JZ4 A; 4OMM A; 1BB9 A; 1AWO A; 2DRK A; 2MCN A; 1QLY A; 1FYN A; 4E6R A; 4X1V A; 1N5Z A; 1SSH A; 2LJ1 A; 1QKX A; 2RMO A; 2W0Z A; 3SEM A; 1NYG A; 2NWM A; 3M0U A; 1Y0M A; 2RQU A; 1NYF A; 4HVW A; 1QKW A; 2KGT A; 1YN8 A; 4RUG A; 1JEG A; 3NPF A; 1GRI A; 2ECZ A; 2D8H A; 2KRO A; 2EKH A; 2F2X A; 2CH4 W; 3VRY A; 1WX6 A; 4WCI A; 4AFQ C; 3PE0 A; 1AWW A; 2L3Q A; 2JW4 A; 1VYU A; 2BTT A; 3NHN A; 2DYB A; 2CSQ A; 2J6K A; 2YSQ A; 2KYM A; 1UTI A; 2V1Q A; 3M0P A; 1ZX6 A; 2DJQ A; 2FPE A; 2PNI A; 2LP5 A; 2RQT A; 1X43 A; 2EBP A; 4J9H A; 2J05 A; 2ROT A; 3M0S A; 1WXU A; 3JV3 A; 2ENM A; 3REA B; 1XOV A; 2ESW A; 4EIK A; 1PWT A; 2J06 A; 2KXD A; 2SEM A; 2DF6 A; 2DLP A; 1UE9 A; 4J9G A; 1K1Z A; 4J9B A; 3ULR B; 2G6F X; 2KBT A; 2GTO A; 2LNH B; 4OML A; 4KRT A; 1M3C A; 1ZBJ A; 2V1R A; 1AWJ A; 1RLQ C; 1M8M A; 2GTJ A; 3EHR A; 4AG2 C; 2J6O A; 1VYV A; 5GJV B; 2YUO A; 2DL5 A; 1G2B A; 2KRS A; 2JTE A; 1AOJ A; 2DVJ A; 2BZY A; 1WIE A; 3H0I A; 2K7A A; 1JQQ A; 2JM8 A; 2KT1 A; 2BZ8 A; 3C0C A; 4D8K A; 2KYB A; 1U06 A; 2LX7 A; 1X27 A; 3TVT A; 3U23 A; 3UF4 A; 3FJ5 A; 1ZSG A; 2O88 A; 2A28 A; 3VS2 A; 2AZS A; 3REB B; 1BBZ A; 4HCK A; 2HBW A; 4K11 A; 2K6D A; 1OV3 A; 2CUB A; 2JXB A; 3NMZ C; 1VYT A; 2GGR A; 3R6N A; 1HSQ A; 1TUC A; 2C0I A; 2M0Y A; 2RNA A; 2K79 A; 3THK A; 2EGC A; 4HVV A; 4RTZ A; 2O9S A; 1RLP C; 4AFZ C; 2E5K A; 1GCQ A; 3ZL7 C; 1NLP C; 2LZ6 B; 1M27 C; 1X6G A; 1KJW A; 2JMA A; 5IH2 A; 2C0O A; 2F2V A; 1W6X A; 3SHW A; 1BU1 A; 1Z9Z A; 1K0X A; 2EW3 A; 3CQT A; 4HXJ A; 2FPD A; 1AWX A; 2KRM A; 1IO6 A; 2JS2 A; 4JZ3 A; 2JMC A; 2D0N A; 2A37 A; 2RN8 A; 1ABQ A; 2GNC A; 3EG0 A; 2LQW A; 5IHN A; 1LCK A; 2DIL A; 4AG1 C; 1TG0 A; 4DEX A; 3I35 A; 1OPK A; 2DL4 A; 2C0T A; 1WA7 A; 2LJ0 A; 2JM9 A; 3UAT A; 2MOX A; 2F2W A; 2YUP A; 1YWO A; 1J3T A; 4A63 B; 1AVZ C; 1S1N A; 1H3H A; 2CSI A; 3TSZ A; 1PRL C; 1T0H A; 1M30 A; 1MV3 A; 5FW9 A; 1PRM C; 3I5R A; 2HSP A; 4AFU C; 2A08 A; 2D1X A; 2L3S A; 1BK2 A; 1GBR A; 1QWE A; 3VS1 A; 1UUE A; 1ZUK A; 1UJ0 A; 2DM1 A; 3VS3 A; 2FO0 A; 1WDX A; 2EPD A; 5IHI A; 4CC3 A; 1CKB A; 3VS0 A; 2CT4 A; 2H8H A; 1YCS B; 2SRC A; 2IIM A; 1X2K A; 2L2P A; 4RTW A; 3LH5 A; 2CH4 A; 4M4Z A; 1CKA A; 3NGP A; 4QT7 A; 5ECA A; 2ABL A; 1JXM A; 2O2O A; 2FRW A; 1WI7 A; 3QWY A; 4J9E A; 2YT6 A; 4Z8A A; 1U3O A; 5GJW B; 2VWF A; 2AZV A; 2JS0 A; 4R0K A; 1NG2 A; 1WXB A; 2A36 A; 2DL3 A; 4FSS A; 3VS5 A; 4IIM A; 2DX1 A; 3H41 A; 1B07 A; 2YUN A; 4ORZ A; 2DL8 A; 2KEA A; 1AZG B; 2KRN A; 1U5S A; 1GBQ A; 1GFD A; 2K3B A; 2VKN A; 2DBK A; 2LCS A; 2FEI A; 2YUQ A; 1UEC A; 2O9V A; 2X3W D; 1SRM A; 1W70 A; 1I0C A; 4LUD A; 1YWP A; 1UHF A; 1SHG A; 1I1J A; 2EGA A; 4RTU A; 2ED0 A; 3H0H A; 1UDL A; 4F16 A; 3TSW A; 3VS4 A; 1UJY A; 1X69 A; 1ARK A; 2GBQ A; 2KR3 A; 2QDL A; 4JJC A; 2PZ1 A; 3M0T A; 3UA6 A; 3QWX X; 1JO8 A; 2KT8 A; 1HD3 A; 4F17 A; 2DL7 A; 2CUD A; 4OMN A; 2CDT A; 1KFZ A; 1T3S A; 4J9I A; 2EYZ A; 1K0S A; 1GL5 A; 1ABO A; 4J9C A; 1A0N B; 5FWC A; 1ZLM A; 4LNP A; 1PHT A; 2XMF A; 4RTT A; 1NLO C; 1K9A A; 4J9F A; 2ROL A; 2L3P A; 2D8J A; 3PVL A; 1VA7 A; 2RQW A; 2B86 A; 1GCQ C; 1HJD A; 2HCK A; 2LJ3 A; 4OMO A; 1X2Q A; 3VS7 A; 1X6B A; 2PTK A; 1SEM A; 4LE9 A; 3EHQ A; 2DMO A; 3EG2 A; 2EYY A; 1SPK A; 4Y92 A; 1SRL A; 1UGV A; 2I0N A; 3I5S A; 2JT4 A; 1UG1 A; 2RQR A; 2RF0 A; 1Y57 A; 1QWF A; 2KE9 A; 1V1C A; 4RTX A; 2VVK A; 2HEQ A; 2X3X D; 4CC4 B; 1M3A A; 1PKT A; 2KNB B; 2LQN A; 2EQI A; 1E6G A; 2FPF A; 1W1F A; 2RQV A; 4OMQ A; 4DEY A; 1NM7 A; 4CC2 A; 2AK5 A; 2AKK A; 2OAW A; 4Z88 A; 1AEY A; 1PNJ A; 4RTY A; 4ESR A; 2EGE A; 1B3Q A; 1AD5 A; 3VS6 A; 4ZNX A; 2DA9 A; 1PKS A; 3VRZ A; 1RUW A; 5IXB A; 3O5Z A; 1KIK A; 2AKL A; 2OJ2 A; 2HDA A; 5IXF A; 3PVQ A; 2DBM A; 5FWB A; 1GFC A; 1GCP A; 1KSW A; 1G83 A; 2J6F A; 1K76 A; 1TUD A; 1E7O A; 1WFW A; 4JJB A; 3M0Q A; 2M51 A; 1OPL A; 2FG0 A; 2EVR A; 1AZE A; 2RPN A; 4GBQ A; 1MUZ A; 4JPB W; 2KXC A; 1NEB A; 1WXT A; 1UFF A; 3M0R A; 4AFS C; 1H8K A; 3A98 A; 4GLM A; 1WLP B; 3EG3 A; 1H92 A; 4D8D A; 1ZUY A; 5HCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1C0M A; 2DRM A; 1K8A C; 1K4U S; 1JU5 C; 1U8R A; 5KYU A; 4EDU A; 2QXF A; 5GAM j; 3OYL A; 3BE3 A; 2LT1 A; 2J7I A; 3RNJ A; 2PVO B; 2YRC A; 4UC4 A; 3L2W A; 1JJ2 A; 1AHJ B; 2HL5 C; 2W10 A; 9ATC B; 3BW1 A; 2GFA A; 2P0Q A; 2E4H A; 4KUD K; 2YDL A; 1VQ8 T; 4A4H A; 1TOV A; 4DBF A; 1YJN T; 3G4S Q; 3OYF A; 3I9Q A; 4II1 A; 2LMJ A; 4F14 A; 5CCA A; 5GAN f; 2QAS A; 4NOY A; 1OOT A; 2MPX C; 2AT1 B; 3OYA A; 4HCZ A; 3HTR A; 1W2B P; 4DQ2 A; 3X20 B; 4IUV A; 1VQ5 A; 2DNU A; 4CRI A; 3LWH A; 2MIO A; 3CCL Q; 3G71 A; 2PVD B; 4C8Q G; 4OMP A; 3NFC A; 2PQW A; 1JXO A; 4FL6 A; 1VQO Q; 3EGU A; 3L42 A; 3VYH B; 4BI8 B; 4N4H A; 4C0D B; 3QXE B; 2KAF A; 4X1V A; 4F7U F; 1JRI A; 5FRM A; 1PSF A; 1ZBX A; 3SEM A; 2NWM A; 3M0U A; 3JB9 I; 3DB4 A; 1YN8 A; 1V29 B; 1N9R A; 2O01 E; 2EKH A; 2OTL T; 4R55 A; 5CQX A; 4WCI A; 1HXD A; 1NBE B; 2X35 A; 4M7D C; 1LOJ A; 4AMC A; 3PE0 A; 2EKO A; 4PKC C; 3RKW A; 2NYS A; 2YSQ A; 4N0A A; 1UTI A; 3S3O A; 1R0B G; 2K5F A; 3CCR T; 2FPE A; 4OGE A; 3SWN B; 3CC7 Q; 1TXQ A; 2K5I A; 4FW1 A; 2LP5 A; 2RQT A; 8AT1 B; 1X43 A; 2EBP A; 3E9F A; 1XJW B; 3CPW A; 4C8Q C; 1WXU A; 1FMW A; 3CME Q; 4F04 B; 1XOV A; 3WVE B; 4EIK A; 4XTW A; 5FU6 B; 2SEM A; 3C4S A; 5GAO r; 1UE9 A; 2XIC A; 4ZGJ B; 3TEE A; 4FYY B; 4J7F A; 5FU7 C; 4ELY C; 2FZC B; 1Y96 A; 2LNH B; 3E19 A; 1IZ6 A; 2V1R A; 3L1A A; 2DTO A; 3TCJ A; 1Y07 A; 2DER A; 3M9Q A; 4PJO G; 4AG2 C; 2J6O A; 2MF2 A; 4XTU A; 5KYX B; 2YUO A; 3SDZ A; 3V8L A; 4DOV A; 5GAM g; 1WNL A; 4ME7 A; 2DVJ A; 2BZY A; 3H0I A; 2BZ8 A; 5I21 A; 4PJO E; 3S3N A; 1WHK A; 4KBM B; 3EGX A; 1X75 C; 2A28 A; 3VS2 A; 3G4S T; 1BBZ A; 2HBW A; 2X9H A; 1OV3 A; 1KC8 U; 3ER0 A; 1VYT A; 4OB2 B; 3RKY A; 4ZN3 A; 4C5H A; 2C0I A; 3PIP A; 2RNA A; 1VQP A; 2EGC A; 4HVV A; 4RTZ A; 4M75 F; 4XTY A; 5GAN 2; 1PCX A; 2DJZ A; 4DBR A; 3ZL7 C; 3CCL T; 1NLP C; 2EQK A; 5CVI A; 2C0O A; 2RJD A; 4GLK A; 2EYQ A; 2XKO C; 1VQO T; 1WHH A; 4RCC A; 3CMA A; 1K0X A; 3MKD A; 3CQT A; 2QTV A; 3BFM A; 5IAY A; 2RD1 A; 2JS2 A; 2GCX A; 1TUG B; 2JMC A; 2GNC A; 4B9X A; 3X26 B; 1LCK A; 3A5Z B; 1K73 C; 1H64 1; 4IUT A; 4E7H A; 1ZSZ C; 1O75 A; 2JM9 A; 2DET A; 5DLO A; 2NLU A; 1YWO A; 1AVZ C; 3A8O B; 1H3H A; 1S72 Q; 3JB9 D; 1MV3 A; 3JCM b; 3ZEH A; 3VJP A; 2FZK B; 1OX9 A; 3MEW A; 1QMC A; 3I5R A; 4ZTF A; 2L3S A; 1SSF A; 2R5A A; 3RUX A; 3DLM A; 1ZA1 B; 1QVG S; 3CC7 T; 1M9S A; 3FJP A; 4FT2 A; 4HT8 A; 2E70 A; 4M77 C; 3CME T; 5LJ3 d; 3VS0 A; 3OQ5 A; 1YCS B; 2SRC A; 3LW5 E; 2MMP A; 3J80 E; 2DZ9 A; 4QT7 A; 2VAS A; 2OX7 A; 2O2O A; 2FRW A; 3ASK A; 4JDS A; 4M78 D; 2FVU A; 4MZP A; 6AT1 B; 3V7R A; 2COZ A; 4MML A; 2DL3 A; 3ZBD A; 4XQ3 A; 1VQN A; 3QSU A; 4IIM A; 5IT9 E; 1YIT A; 2DX1 A; 1Q81 U; 3V8J A; 1AZG B; 1U5S A; 4O5V A; 1Q82 R; 2DIQ A; 2VXF A; 1I4K 1; 2LCS A; 2FEI A; 3MEV A; 2OTJ Q; 3CCU Q; 3M56 A; 4LUD A; 2VGN A; 3GIB A; 4RKU E; 3G6E Q; 5LL6 S; 4RTU A; 2X4Y A; 1ACM B; 1FX7 A; 5D6X A; 5HK0 A; 1EX4 A; 3M58 A; 1OI1 A; 1I81 A; 4MZT A; 5C6S A; 4M7A F; 1XQH A; 5GMK e; 2PU9 B; 4C92 F; 2QA4 A; 2PZ1 A; 4A4K A; 5GAN 5; 3I56 Q; 2X4X A; 2KT8 A; 5CQY A; 2PUO B; 4RG8 A; 1KK7 A; 5KYU B; 3OYN A; 2QG9 B; 1D0Y A; 5LJ5 e; 3QYH B; 1K0S A; 4J9C A; 5GAO q; 5FWC A; 2QTX A; 4M78 B; 1ZLM A; 1RL2 A; 4J6W A; 3QDR B; 1YIJ A; 2B86 A; 3G1J A; 2ZAE A; 5C0M A; 1BI0 A; 2HCK A; 2PTK A; 3VU3 C; 4LE9 A; 3OYG A; 3HFN A; 1KQ2 A; 3SWN A; 4C5G A; 1S72 T; 3M4Y A; 2LTO A; 4JUV A; 4A4G A; 2L5Q A; 1QWF A; 2KE9 A; 1VQ7 Q; 3M57 A; 1H3Z A; 5A2Q E; 2VVK A; 4CC4 B; 2CP7 A; 2LQN A; 3OYC A; 2ZPI B; 3HRT A; 4FW2 A; 1E6G A; 1I5O B; 1NM7 A; 4CC2 A; 1GXI E; 2AK5 A; 1WJQ A; 2VYT A; 1VQM A; 2OAW A; 1VQ4 Q; 3S3M A; 1JBM A; 2KMT A; 2ZGW A; 2CZ7 B; 1OYX A; 1X6O A; 3CXC A; 1AD5 A; 3JCM V; 4HT9 A; 1PKS A; 3VRZ A; 4PNO A; 4NL2 A; 5GAM f; 2OJ2 A; 2F5K A; 1O9S A; 5IXF A; 2VUB A; 2PVG B; 2DBM A; 1M4Z A; 5FWB A; 4KGV B; 1NJI C; 5FRN A; 5KYX A; 2CP0 A; 4JLG A; 4JJN K; 2QDY B; 4ZN1 A; 1GCP A; 1UGS B; 1KSW A; 1TUD A; 1WFW A; 1YJW A; 1BCO A; 3CBO A; 1BI1 A; 2EVR A; 1AZE A; 4XU0 A; 2RH2 A; 1D1C A; 4XTZ A; 3OB9 A; 3JCM c; 2JNG A; 5LJ3 h; 3VKI A; 5A0D A; 1RAI B; 1WXT A; 3OMC A; 1K8A R; 1UFF A; 2LT4 A; 3A8H B; 1H8K A; 2YWW A; 3PGG A; 4GLM A; 1VQ4 A; 1YIJ T; 5LJ5 j; 2VC8 A; 1H92 A; 1ZUY A; 2OTJ T; 4BDZ A; 2M16 A; 3CCU T; 1N8R C; 1R8O B; 1MMA A; 1E6H A; 2COW A; 5L23 A; 2DD5 A; 4IIO A; 3G6E T; 2V8I A; 4E7S A; 3UA7 A; 1CSK A; 1M90 C; 1U1T A; 1UHC A; 3KFV A; 4KGX B; 3PMT A; 3I56 T; 4PFP A; 4DOW A; 2B8A A; 1BCM A; 1IRX A; 4BB7 A; 4FYX B; 1Y96 B; 2VV5 A; 4Z89 A; 3CCM Q; 2KDS A; 4E47 A; 4OP0 A; 1K9M U; 2CRE A; 2P4R A; 2O31 A; 4XTV A; 3JCM d; 1VQM T; 2HKQ B; 4V2S A; 1D09 B; 2ED1 A; 1VQL Q; 3RBB B; 1QCF A; 1D1A A; 5I22 A; 1HK9 A; 4M7D F; 4ZGD B; 1NPR A; 2K2M A; 2FRY A; 1PG5 B; 3OY9 A; 1D0Z A; 1NPP A; 3EFO B; 3M54 A; 2DE0 X; 3EG1 A; 1YJW T; 2VGM A; 5GMK l; 4C92 A; 2EYW A; 2E3I A; 1VQ7 T; 4LUE A; 4C8Q F; 1BB9 A; 2CGH A; 3OMG A; 3CCM A; 1SSH A; 3QJ6 A; 4JRP A; 2K57 A; 3JB9 G; 2KGT A; 1QCO A; 3ZFJ A; 1VQ4 T; 3NPF A; 2ECZ A; 2D8H A; 2KRO A; 4BY6 B; 3MPU B; 2CH4 W; 3VRY A; 2HSE B; 4A4E A; 2CP2 A; 3LX7 A; 2RK2 A; 1WGS A; 1AWW A; 4EMK B; 2L3Q A; 2JW4 A; 1VYU A; 3NHN A; 2DEQ A; 3C12 A; 2J6K A; 4LDU A; 1VQK A; 3QDF A; 1ZSZ B; 2R58 A; 1KG1 A; 2DJQ A; 1M5Q 1; 3QZ9 B; 1M8V A; 1SG5 A; 4HCC A; 3GNF B; 4BAC A; 2F69 A; 2XDP A; 3JV3 A; 2ENM A; 5GAN d; 1VQ9 A; 3LGL A; 3NTI A; 2J06 A; 2E41 A; 3MEA A; 1VQ6 A; 3CBP A; 3JCM X; 3JB9 J; 1XTD A; 1K1Z A; 3QZ5 B; 4L59 A; 3ULR B; 2G6F X; 4M78 E; 2G3R A; 1VQ5 Q; 3UT1 A; 1M3C A; 1ZBJ A; 4BUG A; 4F7U B; 1AWJ A; 5LJ5 g; 3G71 Q; 1QVP A; 5KYW B; 5GJV B; 1YI2 A; 4M78 A; 1G2B A; 1I5L A; 2RK1 A; 2JTE A; 2V8K A; 3CCM T; 1KD1 U; 4D8K A; 2KYB A; 2KK4 A; 3QPH A; 4YTL A; 1JJ2 P; 3PNW C; 4ZGE B; 3A1P A; 2O88 A; 1VQL T; 4K11 A; 2VXE A; 2ZZD A; 4XU3 A; 2JXB A; 2E12 A; 1SF9 A; 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