The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
79
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structure length |
79
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPLPNPEGLDSDFLAVLSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SRC-like-adapter
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the human SRC-like adopter protein (SLAP)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
10
|
| structure length |
79
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| sequence length |
79
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YUQ A; 1Y57 A; 4RUG A; 2H8H A; 2AKL A; 4ORZ A; 1WXB A; 2EGE A; 1AZE A; 1NLO C; 2EGC A; 4AFQ C; 1BK2 A; 2DRK A; 1OPK A; 2PNI A; 1FYN A; 2F2V A; 2JM9 A; 2F2W A; 3IQL A; 2J6K A; 1TUC A; 2BZ8 A; 2DL4 A; 2JT4 A; 4OMM A; 1QKW A; 1KSW A; 3SEM A; 1YN8 A; 3PVL A; 2RNA A; 2EVR A; 2RQW A; 3M0Q A; 5FWB A; 2QDL A; 3CQT A; 2RQV A; 4ZNX A; 1RI9 A; 5EC7 A; 1FMK A; 5HCK A; 1T0J A; 2DE0 X; 1WX6 A; 1GCP A; 1OOT A; 1GL5 A; 4AG2 C; 2B86 A; 1ARK A; 3VRY A; 1RLP C; 3VS2 A; 2ESW A; 2ROL A; 3I9Q A; 1UGV A; 2AZS A; 2KRM A; 5IHI A; 2E5K A; 4J9I A; 4D8D A; 1ABO A; 1S1N A; 4AFU C; 2SEM A; 3VS3 A; 2I0N A; 2V1Q A; 4J9D A; 1BB9 A; 2DF6 A; 1AWJ A; 2J7I A; 2YSQ A; 1U3O A; 2DYB A; 1T0H A; 2EBP A; 1UJY A; 1KFZ A; 1AWX A; 1NEG A; 3RBB B; 3TVT A; 1PRM C; 3LH5 A; 2KRS A; 2BTT A; 2O9V A; 2KGT A; 1B3Q A; 1VYV A; 2YUN A; 2FO0 A; 1M3A A; 1QKX A; 4LN2 A; 1WXT A; 2EGA A; 4OML A; 4Z8A A; 2D8H A; 2KT1 A; 2MCN A; 2ROT A; 1JQQ A; 2YUO A; 1ZSG A; 1KJW A; 1SRM A; 1BU1 A; 1K9A A; 2LJ1 A; 1NYG A; 1JXM A; 2K7A A; 2DLP A; 4DEY A; 2DM1 A; 4OMO A; 4Z88 A; 3VS4 A; 2VKN A; 2GQI A; 1MV0 B; 2RF0 A; 1YCS B; 4ESR A; 4X1V A; 4IIM A; 1AOJ A; 2EYX A; 4JJB A; 3TSZ A; 1ZUU A; 2IIM A; 2L3P A; 2EQI A; 2DMO A; 1G2B A; 5IH2 A; 4QT7 A; 1AD5 A; 1VA7 A; 1NEB A; 1VYU A; 2JS2 A; 1YP5 A; 3VRZ A; 1T3L A; 2D1X A; 1PHT A; 2DIL A; 4AFS C; 1BBZ A; 1ZX6 A; 2LP5 A; 2RQT A; 5FWC A; 2K2M A; 2L3Q A; 3C0C A; 1XOV A; 1K0X A; 2PZ1 A; 1Z9Q A; 2OI3 A; 1NLP C; 4F16 A; 1W1F A; 3I5S A; 2BZX A; 1NG2 A; 3JV3 A; 2EYY A; 2RQR A; 1T3S A; 2VWF A; 4KRT A; 1X43 A; 1PWT A; 4HVV A; 3REA B; 1PKT A; 1YNZ A; 4JZ4 A; 1GRI A; 1V1C A; 2JTE A; 4EIK A; 2CT3 A; 1TUD A; 4LUE A; 2DJQ A; 3EHQ A; 3UA6 A; 4JZ3 A; 3R6N A; 2J6O A; 2AKK A; 1M30 A; 3ULR B; 4LUD A; 1PRL C; 2LX7 A; 1E6G A; 2HCK A; 4CC4 B; 1WYX A; 1ZUK A; 3UF4 A; 4LNP A; 5IXB A; 2ABL A; 4OMQ A; 1IO6 A; 1SSH A; 1WA7 A; 3H0H A; 4F14 A; 2CRE A; 1GCQ C; 1X6G A; 1AZG B; 1KIK A; 4HXJ A; 2ED0 A; 4JJD A; 1CSK A; 2KYM A; 2NWM A; 2A08 A; 2X3W D; 2C0I A; 2JM8 A; 2KR3 A; 1GCQ A; 3M0R A; 3UA7 A; 2A37 A; 1JXO A; 3M0U A; 5ECA A; 4J9E A; 3M0P A; 1JO8 A; 2W0Z A; 2CH4 W; 1NYF A; 4DEX A; 1CKA A; 2J06 A; 2CSQ A; 3KFV A; 2KE9 A; 3NMZ C; 4CC3 A; 3EG2 A; 1OV3 A; 2YUP A; 4E6R A; 1ZLM A; 2O2O A; 2RMO A; 1SHG A; 1U5S A; 2LQW A; 1K76 A; 2XMF A; 2F2X A; 2FG0 A; 4J9H A; 2DL5 A; 2W10 A; 1LCK A; 4M4Z A; 2CT4 A; 3UAT A; 4RTV A; 3VS1 A; 2ECZ A; 2KXD A; 1UJ0 A; 4RTU A; 2LJ3 A; 1WI7 A; 2YT6 A; 1X2Q A; 1ABQ A; 2LNH B; 2FPE A; 2L2P A; 3EG3 A; 2D0N A; 1QWE A; 5IHK A; 2A36 A; 1H92 A; 2CSI A; 2LQN A; 5IHN A; 2HDA A; 1SHF A; 4RTZ A; 1A0N B; 1EFN A; 2HSP A; 2FPD A; 2CUB A; 4J9B A; 4LE9 A; 2KYB A; 1I0C A; 1HD3 A; 3A98 A; 1UEC A; 1VYT A; 2RPN A; 2J6F A; 4HCK A; 2JMA A; 4Z89 A; 1B07 A; 2GTO A; 2JMC A; 3ZL7 C; 4CC2 A; 1HSQ A; 1AVZ C; 2PTK A; 3O5Z A; 1X6B A; 2M51 A; 2K79 A; 2FPF A; 2CUD A; 2ED1 A; 4J9C A; 2DRM A; 1AWO A; 1M27 C; 1GFC A; 1QWF A; 2KNB B; 3U23 A; 1M3B A; 1JU5 C; 1N5Z A; 2JS0 A; 2FEI A; 3H0I A; 1UFF A; 1UUE A; 5GJW B; 3NGP A; 2LMJ A; 2FRW A; 3I35 A; 2L3S A; 1X2K A; 4IIO A; 2LZ6 B; 2DA9 A; 2EW3 A; 3H41 A; 3H0F A; 1UDL A; 2DBM A; 3SHW A; 1WDX A; 4HVW A; 2KBT A; 2V1R A; 1TG0 A; 2EKH A; 4GBQ A; 2HEQ A; 4K11 A; 3FJ5 A; 5I22 A; 1M3C A; 1JEG A; 1G83 A; 1WLP B; 2G6F X; 2DNU A; 1UHC A; 2LJ0 A; 4J9F A; 1X69 A; 2RQU A; 1E6H A; 2SRC A; 1WFW A; 3VS7 A; 2M0Y A; 3PE0 A; 1U06 A; 1I1J A; 1E7O A; 2EYW A; 4RTY A; 1H3H A; 2VVK A; 2C0O A; 2DBK A; 1YWP A; 2K6D A; 2X3X D; 4RTT A; 1PNJ A; 2KT8 A; 4JPB W; 1GBQ A; 2AK5 A; 2DL3 A; 2KRO A; 2GGR A; 4JJC A; 2J05 A; 2LCS A; 1I07 A; 2EPD A; 2A28 A; 2ENM A; 3QWX X; 2O88 A; 1MUZ A; 2O9S A; 2MIO A; 1J3T A; 1UHF A; 1X27 A; 1ZBJ A; 3VS0 A; 1YWO A; 2KRN A; 1UG1 A; 1M8M A; 5L23 A; 2K3B A; 4AFZ C; 1WIE A; 1Y0M A; 1SEM A; 1SPK A; 4OMN A; 2L0A A; 3VS5 A; 4A63 B; 1QCF A; 2C0T A; 3EGU A; 2JW4 A; 1UTI A; 2P4R A; 4OMP A; 1QLY A; 3EHR A; 1HJD A; 3I5R A; 1NM7 A; 2CDT A; 1H8K A; 1W70 A; 2DL8 A; 3M0S A; 2YDL A; 2NUZ A; 3QWY A; 2DL7 A; 3TSW A; 3VS6 A; 1K0S A; 3PVQ A; 2CH4 A; 4J9G A; 1GBR A; 2JXB A; 4F17 A; 2KEA A; 3THK A; 1OEB A; 1W6X A; 1SRL A; 2GNC A; 3NHN A; 4HVU A; 3REB B; 2EYZ A; 1WXU A; 4RTW A; 1RUW A; 2FRY A; 2HBW A; 1ZUY A; 3NPF A; 1RLQ C; 4R0K A; 3M0T A; 5FW9 A; 2MOX A; 1UE9 A; 3GBQ A; 3EG1 A; 1AWW A; 2GTJ A; 1PKS A; 1OPL A; 4D8K A; 2D8J A; 1CKB A; 2OJ2 A; 2RN8 A; 2BZY A; 1AEY A; 4WCI A; 4CC7 A; 4Y92 A; 3RNJ A; 2AZV A; 2K9G A; 2GBQ A; 2DX1 A; 4GLM A; 5GJV B; 4FSS A; 1MV3 A; 4AG1 C; 2DVJ A; 1K1Z A; 1Z9Z A; 2KXC A; 5IXF A; 1K4U S; 4RTX A; 2OAW A; 3EG0 A; 5I11 A; 2O31 A; 1GFD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XTY A; 1Y57 A; 2H8H A; 2CP0 A; 2RD1 A; 1IGQ A; 4BDY A; 3JCM P; 1K73 R; 4AFQ C; 1SG5 A; 2VUB A; 1OPK A; 4EPC A; 2F2V A; 4C0G A; 4PJO C; 2BZ8 A; 3JB9 G; 4OMM A; 1QKW A; 2DD4 A; 4M7A G; 2O4X A; 1YN8 A; 3PVL A; 2RNA A; 4XU3 A; 3CQT A; 2RQV A; 4ZNX A; 1YIJ T; 1YIJ Q; 1M1K U; 1WPY A; 1OUL A; 1FMK A; 2B8A A; 4M78 E; 4QQ6 A; 4Q5W A; 2KSS A; 3TCJ A; 1GL5 A; 3VYG A; 3GP8 A; 2HL3 A; 1RLP C; 2DZC A; 3VS2 A; 3N5B B; 2AZS A; 1U1T A; 2X9H A; 4KUD K; 5GAO r; 2SEM A; 1NJI R; 2CZ1 B; 4E7S A; 2KK4 A; 1WHL A; 1T0H A; 2VGN A; 3OYB A; 1D0X A; 4XTW A; 1IHV A; 3HRU A; 1M9S A; 4PFO A; 3RBB B; 3QSU A; 1M2O A; 1BIA A; 1LVK A; 3ZEH A; 3L2Z A; 1B3Q A; 4LN2 A; 4M78 C; 1M3A A; 4PLI A; 3SDZ A; 2G3R A; 1WXT A; 1V29 B; 1Q95 G; 5KCO A; 3OYL A; 1RI0 A; 2QQ9 A; 4C92 E; 5KYY B; 2P84 A; 3OYJ A; 1VQ4 T; 1BU1 A; 2GFA A; 5GMK i; 2YRD A; 2LJ1 A; 1AHJ B; 1VQ4 Q; 1OX9 A; 2GQV A; 3CC7 T; 1D0Z A; 1YJW A; 3CC7 Q; 4OP0 A; 3VS4 A; 1EX4 A; 1MV0 B; 2RF0 A; 3MKD A; 3E1S A; 4F7U G; 2X4Y A; 3CXC P; 1ZUU A; 3PFS A; 2HAX A; 1M1F A; 2DO3 A; 4QT7 A; 3S3O A; 2K5I A; 3QKJ A; 1VA7 A; 2CP6 A; 2DD5 A; 1NEB A; 2JS2 A; 2K3Y A; 2RI5 A; 3OYN A; 5FLX E; 3G4S T; 5GAN j; 1T3L A; 5A0L A; 1OQK A; 4C92 C; 4AFS C; 3G4S Q; 5GAM g; 4PK4 A; 2CP7 A; 3HSB A; 2HQE A; 2OTL A; 1W1F A; 3I5S A; 3M58 A; 1VQN T; 2BZX A; 1NG2 A; 1KHC A; 4J6Y A; 5KYN A; 1VQN Q; 1RAH B; 3JCM X; 4KRT A; 1PKT A; 1YNZ A; 1JJ2 P; 3RER A; 4EIK A; 1G3S A; 4M78 D; 2CT3 A; 2E41 A; 1G3Y A; 4JRQ A; 2OX7 A; 1WHJ A; 3UA6 A; 1KK7 A; 3OSS C; 1M30 A; 1Q81 U; 1KQS A; 2ZGW A; 4OMQ A; 1SSH A; 3QDR B; 2EKO A; 2ZPH B; 2LRQ A; 1GCQ C; 5IN1 A; 3LWI A; 4OB2 B; 4FYW B; 4JS4 A; 1VQL A; 2PVD B; 3CC4 T; 4JJD A; 1XJW B; 3X28 B; 4IUV A; 4QVC A; 4MDX A; 2JM8 A; 5KH6 A; 3UA7 A; 2A37 A; 1VQ7 A; 1JXO A; 3V7C A; 5I2M A; 2NUP A; 3QHS A; 3JRZ A; 3M0P A; 2XU8 A; 2EQU A; 1M1G A; 1QVP A; 4C92 D; 1CKA A; 2YRV A; 2CP5 A; 1DJ7 B; 2HKN A; 2KE9 A; 3EFO A; 1TH7 A; 3SWN A; 3J80 E; 4BE0 A; 4C5E A; 4L5G A; 2RB6 A; 2RMO A; 2LDM A; 1K76 A; 1R77 A; 1PC0 A; 2F2X A; 3KBG A; 1W2B P; 2FG0 A; 2JJ9 A; 1OZ2 A; 3RKW A; 1IXD A; 1D3B A; 5A0G A; 5J26 A; 4M75 A; 3OYG A; 4RTV A; 3QZ5 B; 4M7D E; 3FC3 A; 2YLB A; 1UJ0 A; 1NPR A; 2QI2 A; 3MP6 A; 4C5H A; 2GCX A; 3ER0 A; 2XD0 A; 5CO7 A; 1S72 T; 1ABQ A; 2LNH B; 1S72 Q; 2LCC A; 3MP8 A; 3EG3 A; 3NTK A; 1QWE A; 3NTH A; 2A36 A; 4KH0 B; 1VUB A; 1AT1 B; 2LQN A; 4C0Z A; 1SHF A; 1A0N B; 3CD6 A; 1G5V A; 4WTO B; 2DEQ A; 1I5O B; 3MEW A; 1OU9 A; 2FPD A; 3JCM W; 1OU8 A; 2K5L A; 3EGD A; 1VQ8 T; 2R58 A; 1VQ8 Q; 4LDY A; 4M7D C; 4C8Q G; 4HCK A; 2JMC A; 2PVG B; 1HSQ A; 4J83 A; 5GMK h; 3MET A; 4M75 F; 2ED1 A; 3QG1 A; 1RAC B; 2DRM A; 1AWO A; 5IAY A; 2DER A; 1GFC A; 5KYW A; 1I4K 1; 5GMK m; 1M3B A; 3RDV A; 4HCZ A; 2DJZ A; 3FIF A; 1N5Z A; 2JS0 A; 3RUX A; 2PQW A; 3I55 T; 3I55 Q; 3OS5 A; 2FRW A; 3DKM A; 5GAM e; 4A53 A; 2O4X B; 2LZ6 B; 2EW3 A; 1M2V A; 3H0F A; 1UDL A; 3L2Q A; 3OBW A; 2L8D A; 4HVW A; 2ZPG B; 4B6M A; 4PLL A; 1VQP A; 5CK9 A; 5I22 A; 2NUT B; 2BIV A; 2G6F X; 2IPO B; 2DNU A; 3QO3 A; 1X69 A; 4X34 A; 3V8L A; 2M0Y A; 1IGU A; 1H3H A; 1KC8 C; 2VVK A; 2C0O A; 1HYO A; 2DKG A; 2D9T A; 4M7D D; 3HRS A; 1WHM A; 3R6O A; 3PMT A; 3PIO A; 3L2U A; 3RIR A; 3HP9 A; 2CKK A; 2AK5 A; 2KRO A; 3C12 A; 2GGR A; 4D6W A; 2JZ2 A; 1I07 A; 2A28 A; 3OA6 A; 5GAN 2; 2ENM A; 2KQW A; 1RAE B; 2O9S A; 3QYG B; 2MIO A; 1J3T A; 1ZBJ A; 1Q86 C; 3MJX A; 3VV0 A; 4DBH A; 1M8M A; 4ANJ A; 3QZ9 B; 3CC2 A; 2LX9 A; 1PCX A; 3M56 A; 1MMD A; 1QVG S; 5FU7 C; 4AFZ C; 4FT2 A; 3HTR A; 3M53 A; 1WIE A; 4EDU A; 4OMN A; 1VQ4 A; 3INZ A; 2C0T A; 3EGU A; 4Y28 E; 2JW4 A; 2QGG A; 1RAA B; 1BI3 A; 5GAM d; 3A1P A; 2HSE B; 3M0S A; 3MCA B; 2VYT A; 2P0K A; 4MDW A; 3VS6 A; 2V26 A; 2QXF A; 3THK A; 2HQX A; 1G3T A; 3REB B; 2EYZ A; 2DYI A; 4RTW A; 1RUW A; 2HBW A; 2XG8 D; 1FX7 A; 3L2V A; 2VGM A; 5CQY A; 5KYY A; 1H3Z A; 1U8R A; 1IZ6 A; 4XTV A; 3GBQ A; 3SB2 A; 3EG1 A; 2EQJ A; 2GTJ A; 1PSF A; 3CCE T; 1PKS A; 2EJG A; 3CCE Q; 5C0M A; 2RN8 A; 2EAY A; 4O5V A; 1M4Z A; 4DBQ A; 3BDL A; 1RAI B; 2AZV A; 2K9G A; 1UGR B; 3JSC A; 3GOX A; 1MHN A; 5GAO n; 1M1K C; 4QW2 A; 1MV3 A; 4ELZ C; 3OYE A; 2QQB A; 4BUG A; 4HVU A; 1GFD A; 3OYD A; 2JOY A; 1Q82 U; 2LTO A; 4L59 A; 2DXU A; 2K3X A; 2EGE A; 3L2W A; 4E7K A; 3EFO B; 4PJO G; 5CKE A; 3SWN B; 4ATO A; 2CGH A; 3P8D A; 2DVE A; 2J6K A; 1TUC A; 4M75 E; 4MZM A; 3MEU A; 1KSW A; 3SEM A; 1YCY A; 2K4Y A; 3T9N A; 4KUI A; 2YHT A; 2QDL A; 3UDC A; 1RI9 A; 3SFM A; 4MML A; 3EGX A; 5LJ3 g; 1T0J A; 2QTX A; 4JRP A; 2DE0 X; 3WVE B; 3DB4 A; 1ZHI A; 2VC8 A; 2VAS A; 3WXM B; 4M7A A; 4KH1 B; 3VYH B; 3HKS A; 2HMA A; 2KAF A; 2ESW A; 4X9C A; 3JCM f; 2E5K A; 2V8I A; 4D8D A; 1S1N A; 4AFU C; 1S72 A; 3VS3 A; 2I0N A; 4J9D A; 1IB8 A; 1ZSZ A; 4MZP A; 3OS0 A; 2YSQ A; 2DYB A; 1UJY A; 1KFZ A; 1AWX A; 3EGD B; 5CQX A; 3X20 B; 4M78 G; 3LH5 A; 1KC8 R; 2BTT A; 4J8O A; 1VYV A; 3CMA T; 4BDZ A; 2FO0 A; 3CMA Q; 5GAM j; 3UWN A; 2QQS A; 4Z02 A; 3M55 A; 2FYK A; 2KT1 A; 2ROT A; 4J7I A; 4RMO A; 3OW2 P; 4KT0 E; 2MAM A; 1KJW A; 3CXC S; 1ZA1 B; 1K9A A; 2E70 A; 4OF1 A; 5KYW B; 3MEV A; 1JB0 E; 4NS5 A; 1Q86 R; 2DLP A; 3JB9 F; 3LYI A; 2DM1 A; 1TXQ A; 4M7A F; 2DFU A; 4OMO A; 2E65 A; 2VKN A; 1IHW A; 2QGF B; 2QG9 B; 5C6S A; 1Q81 C; 4RG8 A; 2L3P A; 2EQI A; 1IRX A; 4C92 G; 4PJN A; 5GAN d; 3VRZ A; 3OYI A; 1BBZ A; 1YIT T; 2RQT A; 1YIT Q; 2KDS A; 1ACM B; 3X25 B; 4XU2 A; 2XI9 A; 4F7U A; 1Z9Q A; 4KBM B; 2OI3 A; 4F16 A; 3D7S B; 5HK0 A; 1TTH B; 5FU6 C; 4M75 D; 3JV3 A; 4EMK B; 3CCS T; 1T3S A; 5CAI A; 1QVF A; 3CCS Q; 2QDY B; 5GAN 4; 1PWT A; 2YLC A; 2DIQ A; 3J7A F; 1Q7Y C; 3CBP A; 1YFN A; 1MND A; 4LUE A; 2DJQ A; 2JN0 A; 4HKE A; 4LUD A; 2LX7 A; 2R5A A; 1Y96 B; 2HCK A; 4PJO B; 2RHU A; 4CC4 B; 3FLG A; 5IXB A; 1KD1 U; 3H0H A; 4F14 A; 3DB3 A; 1MMA A; 4XTU A; 1KIK A; 3JCM Q; 4HXJ A; 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