2D1ZA

Crystal structure of catalytic-site mutant xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVSHAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystallographic snapshots of an entire reaction cycle for a retaining xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-XYLANASE
total genus 163
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d1zA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2d1zA01
1AVAA 1BFFA 1O7AA 4ZXOA 1AFCA 3OGSA 1JZ4A 1VAHA 5GNYA 3BRDA 3V79C 1VJZA 1H2JA 2CETA 2J7FA 3BAHA 3FUQA 2WZIA 2ZWYA 4EFQA 3AXIA 3CTTA 4PBGA 2AFGA 1JZ8A 1BASA 1V3MA 3R4SA 1J01A 3CBWA 3VIOA 2L5XA 3MALA 2VOTA 3EDEA 1I75A 3VMOA 5HXMA 3A07A 2QHAA 4ZFWB 4MTVA 3BADA 1C7SA 4HMCA 2NSXA 5D9OA 4M24A 3K46A 4PRWA 3CHFA 5TD4A 5A6MA 3BAKA 3WNOA 4QLLA 1G01A 4BQ3A 4ZOTA 1TA3B 4N42A 4AN6A 1UWRA 3VIPA 2RGLA 5CSUA 3PZIA 1UWTA 1EXPA 3EMCA 3EMZA 3H6RB 3KEHA 1TZ7A 2DRZA 1E0OA 3NIYA 3WD0A 6CGTA 1GQLA 3NJ3A 2A3BA 3O3QA 4QBVA 4PEEA 2VUYA 3N12A 1MW3A 3ZR6A 1UZ1A 2J25A 4MAVA 3J7HA 3RILA 3TTQA 1IJTA 3WL1A 3RM8A 4AD2A 4EK7A 5EHAA 1Q6EA 3S8JA 1PX4A 1UWUA 4H8UA 2ZUTA 2ZUWA 3RMYA 1RG8A 1YF8B 4PYSA 4PTXA 2YA0A 4TX6A 4TXEA 1QI2A 3AHXA 1JZ6A 4AZ6A 1WD3A 2WC3A 1WE5A 5BYWA 3T0DA 4EE9A 1TVPA 3NBCA 4LX4A 3WMUA 1DP0A 1R87A 4U2ZA 4TVUA 3GXIA 2WKGA 1G9DA 1BGGA 3OJMA 2WVTA 3AJ7A 4UR9A 5CPQA 5I23A 2GO2A 3AMGA 3GNRA 1B30A 2BEBA 2D2OA 3WA1A 3QGVA 3SCUA 5B2HA 1QQLA 3WNLA 1MW0A 3IAQA 1MQPA 1IZKA 4TOQA 1FN0A 1HL8A 4JFSA 3APGA 1CTNA 4PMRA 4AZCB 1BVZA 2BVYA 5C8BB 1G5AA 1TG7A 2CNCA 4HZ7A 1G94A 1EOKA 1CGTA 1XCWA 5A6SA 1V3KA 4KEIA 3U57A 4QD2C 2VZTA 4Q91A 3SCRA 2WKLA 3TONA 2DH2A 4BZYA 2O9TA 5GQBA 2UY5A 2F8XC 4GO8A 4HA3A 4J2YA 2YDRA 4ACZA 5BXSA 4HA1A 3BCDA 2VZSA 2XVLA 4KRTA 4HOZA 2DT3A 1UPSA 1Q6CA 1LL4A 2WMIA 1WCGA 2J8FA 3WQ4A 3BAXA 2J77A 2HZ9A 4KRUA 4UOJA 2XHYA 3OJVA 1DTUA 4ENDA 2UUSA 1CWYA 4P7RA 4GQQA 1JD7A 4NI3A 2ZQNA 2CESA 1V6XA 1S0EA 2E4MC 6I1BA 1VEPA 4P8XA 2QPUA 3VM7A 3SCPA 5F8SA 3ZSTA 3AFBA 3ARWA 1NM9A 3PHAA 4AZBA 4HMEA 4W86A 1J11A 4H41A 1OIFA 1RP8A 1H4PA 3SCOA 1XSJA 4LO1C 1EOMA 1DZCA 3CGTA 2EPLX 2QF8A 2XUCA 3NSXA 2Y9WC 3VGGA 3W37A 3FJKA 3POKA 3W6LA 4JL2A 3FXYA 3VT2A 3VUOA 1VFMA 3WF0A 2J62A 2XSAA 1UD3A 1AVUA 2NP0A 4OJYA 1FFRA 4ZKTB 1BFNA 3OGFA 2Y24A 1E4MM 3CHCA 4DUVA 3K1DA 1HIZA 2FFVA 4LO8B 4UFKA 1LQ0A 4ZXLA 2RSTA 5BOWA 1OT1A 5IDIA 3SUSA 3I3EA 4R5EA 3RTJB 4MNJA 2CYGA 1JDAA 5D62A 3NCOA 3I2XA 1OWQA 2WVSA 4GXPA 5DO8A 3PZOA 2A3CA 4AISA 3WH8A 4D8HA 1GQJA 3VIJA 2G8ZA 3ARRA 3ARPA 4A7YA 4WKFA 2X1IA 1B3YA 3AXXA 7A3HA 1MVYA 5BROA 3UDAA 1QHOA 3U5YA 2OSWA 3UR8A 2Q3NB 2XPKA 2JF7A 4NZCA 1EYLA 4P8WA 1W3GA 4U31A 1S46A 4LO2C 1A8DA 1E56A 3THCA 2D3LA 1ODUA 5F7UA 3FAWA 1E0XA 1XZZA 4ZFYB 4KC3A 4AD1A 21BIA 5E0FA 2MIBA 2UWFA 1WP6A 2X2YA 5EFDA 2RGMA 1JGIA 3NJ5A 5DZUA 1ZL1A 3IK2A 4UOZA 1J12A 4CN1A 4NSBA 4PTVA 2WMGA 1G82A 1W9BM 4CKQA 41BIA 1TFVA 1KCLA 1G0CA 3UJ4A 1KBKA 2OWXA 4PTMA 3VIHA 3TTYA 1C93A 1SFSA 1VEMA 4E2OA 1LWJA 1EHAA 2CEQA 3O4AA 5JMCA 3AISA 4W5ZA 1JT7A 1K9EA 1JLYA 3AOFA 4JHOA 4I96A 2FHFA 2WYSA 4WJXA 1BGAA 5DT5A 1BLAA 2Z1KA 4LGXA 3S6TA 1G9CA 1HN1A 2LIQA 3KWXA 2G3NA 4OWKA 4AZ5A 2WRYA 1E70M 3B9EA 5FKYA 2YL9A 2AAIB 4LXFA 4ACZB 1CEOA 3FJFA 1E1EA 1TFMB 3EMQA 4UQEA 4XV0A 3IIRA 3AZVA 2X2SA 1CXFA 3DECA 2WMIB 3FHQA 1NZKA 2JALA 1RMLA 3VT0A 1GVYA 3GNOA 3WEZA 3II1A 3NBDA 5EB8A 1VFUA 4A7ZA 2ZUMA 3QHNA 1JT5A 4L4HA 4U5IA 4CUCA 4FLOA 4KEJA 1HF6A 4CD8A 4I4QA 4LO7B 1EQPA 1OQLB 2YL6A 3SCSA 4KWUA 4J3VA 3ECQA 2BXZA 4PMUA 2YIHA 3ZSSA 2VR5A 3CA6A 3CZ8A 1W2PA 4WKAA 8A3HA 1K5VA 3F4VA 3W25A 2WVVA 4ZA3B 1Z2VA 1YTOA 2CBVA 1O6IA 4AEEA 3VX1A 4DM1A 3SNVA 2G4FA 1CDGA 1H49A 3E1F1 5I0DA 4QLJA 4D6DA 1KWKA 5BCAA 3IM6A 3ALFA 2FH8A 1HJSA 4J3UA 5I6SA 3T08A 3Q7YA 4J2XA 2J7HA 2EPKX 2YDSA 3M7SA 3EYPA 3UR7A 3WD2A 4L4OA 2MANA 1DIWA 9ILBA 4DENA 4QCEA 3ALGA 3AS2A 4Z2IA 1QNSA 4I4OA 1CXEA 3QR3A 3KZSA 5GPRA 4E8DA 1KBBA 3A21A 3S8KA 5IHRA 3RMXA 1HJXA 1BFCA 4USPA 4X0VA 1JLXA 2ZIDA 2VZUA 5LA0A 2WANA 2DSVA 1UKTA 4P0JA 5CQ1A 1QNRA 4XFUA 4D6CA 1JF5A 3PZVA 5CGMA 4F8XA 4I0YA 2EPMX 2ZXQA 1LL7A 1SR0A 4F66A 1W1VA 3BH4A 4ZLBB 4HP5A 1L2HA 4L4PA 3WDJA 3BA4A 5IHSA 1JFHA 3B9UA 4AD0A 4ZFUB 2PF0A 3N11A 2YJQA 1AVXB 5HBFA 3D3AA 1U2YA 4XZBA 3WIJA 1XRVA 2QMJA 5D9PA 5D9MA 4HOWA 5JBDA 5HDRA 2V3DA 3AZTA 3QYDA 3RSJA 4JFVA 4BCEA 1MQQA 2VNCA 4QBCA 4GO9A 1HJVA 3CUHA 3ZMRA 2WSPA 3AXHA 3SCWA 2KI4A 2VXTI 4J7RA 1AF9A 3BB2A 4AC1X 4P0LA 5I3DA 3LPPA 3HBWA 3BX1C 2VR4A 1HWMB 2X8RA 4GI9A 4GZEA 3WH9A 3FJHA 5DUYA 5F8YA 2CIPA 2XIBA 1E15A 3NYDA 4WLCA 4Z2KA 3VD3A 1E73M 4AY1A 1UA3A 3ZT6A 3FJCA 1UZ4A 4S3KA 3AI0A 2CHNA 4PMDA 2Y4SA 3AROA 4PUDA 1R7OA 2EPOA 1GUVA 3ZJ6A 4QLKA 2J7GA 3A22A 2WMFA 1Q03A 5I78A 1QNPA 3VDHA 3WNMA 4C7GA 1TE1A 4WK9A 4JPZA 4QD2B 1JF6A 3RM9A 1KCKA 3NDYA 1WNOA 1RP9A 3SUUA 1V6YA 2Z49A 5GAQA 1GONA 3RCNA 1E6QM 5BVPI 2BY1A 3AIEA 4LO0A 2NZ9A 1Z4SA 4GAIA 5I2UA 1GQKA 3FY1A 5BRPA 1JDCA 4JFTA 4Z2LA 3GNPA 1E9LA 2B31A 2WVVB 4G9MA 2XOAA 3PG0A 4P0KA 1V0KA 2D0FA 2AMGA 4JKMA 3A3HA 4MB1A 2VL4A 3IM5A 2VQUA 1H0IA 1W9PA 4YPJA 1H11A 2JEQA 2ET2A 1PIGA 3BAJA 3G6MA 2DSWA 2IXUA 3UG5A 5DF0A 1C91A 3ZJ7A 4BA0A 1L8NA 3L2MA 1OIMA 1ZS2A 4D1IA 1XSKA 3GDBA 5A69A 4I4RA 1XH2A 4BS0A 4XFTA 3I2AA 2VT0A 4ZGRB 5CSYA 4U33A 1UA7A 2ESCA 4DWSA 2VURA 2WAGA 1GJUA 5DEZA 3L4YA 4Q9PA 3FHAA 4CD6A 5A6JA 1HJUA 4M81A 1ISZA 3A4XA 1TVNA 1YXWA 2NYYA 6TAAA 3HALA 1C92A 3L4TA 4GINA 3MUZ1 2K8RA 5DT7A 4Q7NA 1FFQA 1W9UA 3CRIA 2ZUUA 3WSUA 2DIEA 1JY0A 3AMLA 2ZUVA 2J7BA 4MB4A 1AXMA 3F5KA 4CCCA 5JIWA 3GH5A 3GH4A 4BQ4A 1QHPA 3O5WB 1QVBA 4H04A 1CXIA 2VZOA 3BLPX 3FGMA 2WLYA 1M53A 5D8ZA 2O92A 1M01A 2WHKA 4I2SA 4IHZA 2O9RA 2QPSA 4EEEB 3ZJ8A 2DEPA 3T0BA 5A8PA 3VT1A 5HPOA 3N17A 3VIIA 5CXPA 1MD6A 1BARA 5GNZA 3VU2A 1FOBA 4D72A 1X1NA 1TIEA 2ZX7A 4H8VA 1PZZA 3H6QA 1MW2A 2PWGA 5BWFA 2QYIB 3BAQA 2NTDA 2ZWZA 4JIEA 3AYSA 4A4AA 1VBRA 4V28A 4I37A 1HNYA 2DT1A 3W26A 4CD5A 3VX0A 2Z48A 3N7KA 2WC4A 1EQCA 1J0KA 1OT2A 2FDMA 1MFUA 1NWSA 1W9XA 4RE3A 3DYPA 4IZEA 4MB3A 3SUVA 3WDQA 4USOA 3UG4A 2TAAA 3I29B 4W89A 4IM4A 1ZBCA 2YDQA 1E72M 1LG2A 3ARSA 1R8LA 2YL5A 1CVSA 5CG0A 2XVKA 3MPPG 4PCSA 4WSJA 2VJXA 1R8NA 3AKGA 1V3IA 3ZQ9A 1XHGA 3NSMA 5DVHA 3CH9A 4F9DA 1J0IA 2YA1A 1KFWA 3JRRA 4EFRA 1B1YA 3MUY1 4TTGA 2D20A 3PTMA 3A4WA 3NUKA 1WAWA 3EF2A 2DPEA 1AMYA 1WKYA 1FH8A 4AD5A 1C8QA 1QW8A 4CJMA 3WNKA 1MQRA 5A6BA 4Q9GA 4I3NA 3AICA 2JF6A 1ZBWA 4A3YA 3PZGA 1C90A 5FIPA 4U3AA 2V3FA 1KGUA 3RJXA 3NSNA 1ILR1 1CZ1A 1M7XA 4GQRA 1HL9A 1XH1A 2E9BA 2X05A 3A47A 5EBAA 3VUPA 1X6NA 3WELA 3L4UA 4ATWA 4DEPA 3AS0A 3JUGA 3K4AA 4M80A 4AW7A 3BSHA 4AIUA 1YQ2A 3K1XA 3W81A 1WZKA 4CD4A 4KEKA 4PMOA 2GUYA 4DWSB 1XG6A 5BXRA 4G1RA 1UKQA 4J2KA 3CMGA 4U5KA 4H8HA 4IQPA 4LYPA 2GDUA 1XC6A 3IJ8A 3FJDA 1DHKA 1B9ZA 2VXRA 3VINA 3R4UA 2HVMA 3AS1A 3VMPA 1JTCA 3O4BA 3TOPA 5AYIA 4TUFA 3WH5A 3MKKA 2VX6A 4OUJA 2WCGA 4HPGA 4QP0A 1ZJAA 3OJ2A 3UD7A 1GOMA 2Q8XA 2J47A 3AHYA 1KNMA 3UD8A 1L0PA 2WBCA 4PMYA 3MMDA 2ZE0A 5DSSB 2O9PA 4J3SA 4GPNA 1EDTA 3PUBA 3UESA 3F5LA 3TTOA 3OG2A 1UD5A 2JFEX 1DQOA 3MUAA 3CUIA 3OB8A 3MANA 2D7RA 3W27A 1D0HA 5BP5C 3VGDA 3ZC8A 4ZENA 1EPWA 4ZBVB 4D71A 3TA9A 5BQUC 3L4ZA 3WEOA 1WDSA 1EV2A 4OOUA 1VIWA 1UR0A 1MYRA 5D61A 5A3HA 3PHZA 1QW9A 1G9AA 2NM1A 1E3XA 4NRSA 3AIQA 2X2TA 2VVNA 2WZHA 3BA5A 3O6AA 3VD9A 4ATLA 2GFTA 2FGZA 1W2VA 2VU9A 1NOWA 1V6VA 4QO3A 2BXYA 3QOMA 3ZX7A 3VNYA 2F2FA 2VCCA 1Q6DA 2PBGA 2OYMA 3T2QA 4X38A 2VCBA 2A3EA 3WF2A 2G3JA 5FNXA 3W28A 1R7AA 3U5UA 4TTUA 2OLHA 4FF5A 1CIUA 3W9TA 1BHGA 4QAWA 5A6KA 3AHVA 3BXWA 9CGTA 1BA7A 4JKQA 1PX8A 1FV2A 4WIWA 1HJQA 3UETA 3VSFA 1JI1A 2WMJA 3AZWA 3IM7A 1BYBA 4G6MA 3FW6A 3AH2A 3FJEA 4M8UA 3UERA 3VD4A 1YBIA 3K8LA 4HOXA 2F8QA 5FZZA 4G6JA 3KL5A 4E8CA 3WUBA 4D6GA 1V3JA 4QDMA 3N1AA 3Q7WA 1BAGA 2VX4A 1EHNA 1JNEA 3JUTA 1B31A 1KGWA 1J0YA 1IILA 1JD9A 4D6FA 1BG4A 1AQHA 3PTKA 4OEEA 3VNZA 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