2D3IA

Crystal structure of aluminum-bound ovotransferrin at 2.15 angstrom resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
682
structure length
670
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of aluminium-bound ovotransferrin at 2.15 Angstroms resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
molecule keywords Ovotransferrin
total genus 222
structure length 670
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA03
1EZ9A 4QF9A 4RNSA 5I59B 3MVZA 3H6WA 2ZNSA 2I58A 4ZECA 4IY5A 1I6BA 1SVXB 3N6UA 3SKPA 2XXRA 1EH3A 5H8HB 2I6EA 2OK2A 3TTKA 3EQ1A 4DXBA 4MBPA 4U2RA 1FQAA 3CIJA 3O29A 1NNTA 4KCDA 4IO6A 4JDFA 3FD3A 3KFMA 4OFLA 4O3AA 4F3PA 4QFNA 3G3HA 3MQ9A 3O66A 4LP2B 3SEXA 4EDPA 4F2QA 5HM4B 4XKRA 1H45A 3PUVE 1NH7A 5CMBA 1MH3A 3O28A 4H5FA 2DVZA 4F1YA 2FA7A 2BJJX 2WKYA 3FVOA 1N0TA 3C4MA 1JQFA 3B7DA 4IGTA 1LAXA 4RK2A 4YKKA 1IQ7A 4QRZA 1B0HA 3SESA 4QFLA 2ZNUA 3JYRA 5CMCA 3T9XB 4ESWA 4JSDA 3FGSA 1SW1A 4JXIA 2NXOA 2ZYNA 1P1NA 3E4RA 3O6IA 2V3UA 3I3VA 4R6KA 5CMMA 2P0SA 1LB9A 1EZOA 2HAVA 2REJA 3GLBA 3S9NC 2H4IA 1A55A 3RLFE 1P99A 1PB8A 4EXLA 1XC1A 2QMWA 3Q25A 3Q27A 5KCJB 4JWXA 1EZPA 1A8EA 3LSWA 1B40A 3K2DA 2O69A 1JW4A 2AIXA 4DE8A 3T22A 1FQDA 1BLFA 3SEYA 3TTNA 4R2FA 3K6WA 2NVUB 3LUYA 3F11A 1OLCA 1J1NA 4OQOA 3USDA 2E1SA 4ZEKA 5A5XA 1JW5A 4IO5A 4KQPA 4AB5A 1I6QA 1USYE 3FXUA 5I2KB 1ZMGA 4GXSB 2GFEA 4AB6A 5ITPA 2DOJA 5DEXA 4OTEA 4I9DA 1LFGA 1MXZA 2O1LA 5I56A 4UACA 1NFTA 2XXIA 1SI0A 5F7VA 3PV0E 3MPKA 2VP1A 1PC3A 3K6XA 4QFPA 3TQLA 5H8SA 4ZDMA 3OSQA 3A3CA 1POTA 4IO2A 1FQFA 1OQHA 2DWJA 1YTVA 1ZU0A 1S9TA 2AL5A 2PBWA 3AXFA 3KEIA 1NL5A 4N6PA 3W15C 2ONSA 3HPIA 3SEVA 1IUDA 2Q89A 1AIVA 1WVJA 2G29A 3H3GA 4Z0IA 4ZEDA 1A40A 5JTYA 2ONRA 3PPPA 3SETA 1SW5A 3PPRA 1H76A 2DE4A 1LFIA 1QKBA 3A3UA 4OEVA 3KJ7A 3H03A 1R9LA 1B4ZA 3L6HA 3TKDA 4ZE9A 3QUFA 1GTKA 4X9TA 3VVEA 3OO8A 1IXIA 1NNKA 3M3FA 4OETA 3RT6B 5JEIA 4R72A 2VD2A 1UQWA 4QSCA 5TP9A 3IOWA 3U72A 1MXXA 4HTGA 5H8QB 1D3KA 2XX7A 5H8FB 3HO7A 1L5TA 1CB6A 1FW0A 2QS2A 1MPBA 2XXPA 2Z8DA 4PP0A 2X7QA 1A7LA 3QIMA 4G4PA 3KSXA 1IITA 3K02A 2XXHA 5DVFA 3UORA 4BDNA 3ZKKA 4GWOA 4QFOA 3D4GA 3RN8A 1JW1A 5AA3A 1B7HA 1FQCA 1B4HA 3I6VA 1B3GA 1O63A 1UTBA 1IZ1A 4H8JA 5TPAA 1MPCA 2XXVA 3IB0A 5I57A 2VD3A 3TODA 3B6TA 4BDRA 3B6WA 3EN3A 3UK4A 2F6PA 2Q9TA 3KG2A 4G68A 1PB7A 4GIZA 4MFIA 4YAHX 5FTHA 4RPOA 2QL3A 1H44A 4OESA 2DE3A 2HXWA 1UIUA 1O64A 2B3BA 2FYIA 4NEDA 4TOZA 3P7IA 1B32A 1B6HA 4EF1A 1FQBA 2GHAA 1AL3A 1MDQA 5IAIA 5ICTA 3K0VA 1B46A 2Z8FA 3ZSFA 4ELRA 2DP8A 1MM7A 1ZTYA 1HSLA 2NUVA 2ZXTA 1N3XA 3PMVA 1VE4A 1LLSA 1LCTA 4JBZA 3TZAA 1JEVA 4NWCA 3T96B 3OENA 3K1MA 4OEUA 3V5AA 1LCFA 4R9FA 3DLNA 1IXGA 2DWIA 2Y84A 4KR5A 3KSJA 5AA1A 2ALUA 1P1QA 2ZNTA 3C35A 3W9VA 4GL0A 1MXYA 3V83A 3KN7A 3CG1A 4U1OA 3U94A 3QYTA 3MC2A 5AA2A 1B5HA 4GD5A 5DVIA 4H5GA 4F22A 3FV2A 4QFKA 2XHDA 2YJPA 1I69A 4NTLA 1B5JA 4NE4A 4ZS9A 3T9UA 3U1OA 5BWJA 1URSA 1R1NA 5FTIA 3LSXA 3K1PA 5A5XB 1B3EA 4R73A 2V93A 1LAHE 2XX9A 1P1UA 3G3IA 3MVXA 1MY0A 2Y7IA 4YKIA 3N6TA 4BDOA 3RGYA 3IB2A 3PUZE 3G3KA 4NF4A 4OVJA 4ZZAA 1QUJA 3H4ZA 1MQGA 5I2NB 1JEUA 2GH9A 5I84A 2F6GA 4DIGA 2VOZA 3HSTA 2F78A 1SBPA 2PT2A 2ANJA 3FVNA 3N26A 3TELA 4NF4B 3CRBA 5JK4A 1O7TA 3MW0A 4FATA 3EHUA 3KJTA 4U4XA 4YU0A 4R9GA 3DP6A 4OWDA 3T9VA 2RC9A 3WAFA 4POXA 4NF8A 2ZYMA 2DE2A 3MJNA 3PUYE 4OXVA 2AYSA 4P0GA 3WAEA 3FATA 3UA8A 3MWBA 2PX1A 4GF8A 4BDQA 4QSDA 1VFDA 1DTZA 2OBGA 2UYFA 3KOTA 4OFOA 4F19A 4TLLB 2QRYA 5AE4A 2XXYA 4H8IA 5AA2B 4JSOA 3H06B 2QMXA 5CMKA 1N7WA 3IK6B 1UTBB 1GGGA 2D5WA 4KYSA 1QUIA 2NOOA 1QULA 2FNCA 4K3FA 3TPAA 1MH4A 3IR1A 1FCKA 1S50A 3OMBA 2QPQA 4LUBA 3PUWE 1S7YA 2O6AA 1IEJA 3FVKA 3R7XA 4F1VA 4GVOA 4XKPA 5LOMA 3FASA 3V8XB 5H8QA 5H8FA 2DVCA 3T9HB 3JZJA 4KHZE 3VVFA 4YB6A 5M2VA 5HBCA 1ZJLA 2RINA 1MPDA 5I58B 1DMBA 2I3WA 4GL8A 4ISUA 4L17A 4OERA 4YICA 5K2XA 4OMBA 2F8DA 1PB9A 4ZEIA 1HSJA 1B3FA 3OELA 4FORA 2NWJA 3M8UA 5F1QA 2I0CA 3L6GA 5I2NA 3G7WA 4U1ZA 4P11A 5I58A 2V3QA 3LBSA 3KBRA 4ZEBA 3U93A 4G68B 5JTYB 2OCUA 1ZKBA 4GFRA 1N76A 3QSLA 4XIGQ 5B70A 3UIFA 1R6ZA 3Q28A 4WEDA 4GRKA 1JVYA 1XT8A 1JETA 1KWHA 3PUXE 4ZEFA 1XHYA 4KCCA 2RC8A 2W7YA 2I3VA 1SW4A 1USYH 3EHSA 3O2AA 3PMXA 1B0LA 3FJMA 4R6HA 3C36A 1N7XA 4N07A 4DDDA 2H98A 3KOSA 2A5TA 4G77A 1ZLQA 2F36A 1M5DA 2HEUA 5TP9B 2O7UA 2YLNA 1PEBA 2GHBA 3LR1A 4LA9A 3PPNA 3U8QA 3TTMA 1Y4TA 3TTLA 1Y3PA 1ANFA 1B3HA 2V3TA 3MZBA 4F3GA 1AH5A 3RUMA 4RPNA 4TQUQ 3PGFA 1B9JA 3CVGA 2Q2AA 3IORA 3C34A 5CI5A 3G3FA 3D4CA 1TFDA 1DOTA 1GV8A 4R74A 4NMYA 4EQ7A 3BFTA 1OVBA 1BKAA 2ONKE 1GR2A 2HQ0A 4MH5A 1B52A 5FHNA 3DP8A 4ELQA 4IB2A 3VXBA 1M5EA 2P1SA 5L9SA 4GQOA 1MY3A 3RPWA 3EF7A 1NKXA 5DVJA 4JWYA 3TUSA 1D4NA 3R26A 2O68A 2I48A 3PU5A 3FIRA 5CRYA 4X1BA 3E13X 1XOCA 3MZ9A 3BBRA 3U92A 3I5OA 4IO7A 2D3IA 1P1WA 4U22A 5DYHA 2PT1A 2UYEA 4WEPA 4YKJA 1II5A 1LBBA 1Z7ME 3IB1A 3GBBA 4PFUA 5ELVA 4F3SA 5H8NB 2OZZA 4FEBA 1FTKA 2HZLA 4G8MA 1JNFA 4PQJA 1ELJA 4JB7A 1AOVA 1LBCA 3VLWA 2D21A 4MLQA 4O3BA 2THIA 3H6VA 3TAJA 1SI1A 4RXLA 5KZTA 4RA1A 2Q88A 5I56B 1OQGA 3LSFB 3GXAA 4F31B 3HV1A 4XTCQ 1MXVA 3IO4A 3CG3A 3FXQA 2UVIA 3MVYA 4OYVA 3MUQA 2PMSA 4F2OA 2F35A 3OO6A 3OEMA 1NNFA 4P0IA 1B7ZA 4PFYA 3C32A 3EHTA 4OHNA 4FJPA 4RK9A 4E0WA 5H8NA 3O6GA 3S2VA 2I49A 2H25A 3PPOA 3MAMA 1NNPA 3SEWA 3OEKA 1MQDA 1YAEA 4FIMA 2PYYA 4IGRA 4BDMA 3VVDA 3TDJA 4H1XA 1QUKA 2KLFA 3T66A 4Z7EA 2XD3A 2O7IA 2Y7RA 5CC2A 4KYDA 3IO6A 4EQ9A 2Y7WA 5FHOA 1PBQA 5ICQA 3EPEA 1POY1 1OLAA 3IOVA 1ZBMA 4F1UA 2IEEA 2B3FA 3VXCA 2OJTA 4NF6B 3DP4A 5B7DA 2DQVA 4OZ9A 3UN6A 4DCXA 1RYXA 1URGA 2VGQA 2X26A 1Y1MA 3PD8A 4C1TA 1MXWA 1SYIA 2B65A 3IOTA 4PFWA 1T0KA 1M5FA 3ILUB 4FE8A 4X48A 3MP1A 1MQJA 3B6QA 5H8HA 3VFJA 1DPEA 1LB8A 2ZYKA 4LVQA 1D9VA 2QS3A 4Q8RA 4IY6A 3DELB 2V25A 3ILTB 3RQTA 2UVHA 4IO3A 3FZVA 3SEUA 1Y3NA 3CI8A 3E3KA 3KN3A 3VLUA 1AMFA 5AA2D 1H43A 4IO4A 1A99A 3N5LA 1R9QA 2Z8EA 4KYEA 2RF1A 2ESNA 1IXHA 1UTHA 2H9BA 4R2BA 1A8FA 1BIYA 2GRVA 1YCJA 3K1NA 3MVWA 2O51A 3O6HA 2V84A 3OOAA 3VLVA 4YMAA 5KCJA 1Y4CA 3PD9A 5ISUA 4N13A 1ZIUA 3ZKLA 4G8NA 3BKIB 1B3LA 3QUJA 1LAFE 3S9EA 2OWSA 3MP8A 3K4UA 1RKMA 3GBAA 3ODBA 3OD7A 2CZLA 4ECFA 5TU0A 3HN0A 3VE1B 4ONYA 3RY3A 4M4GA 1US5A 1FTOA 2UVGA 2F34A 3HHFA 4FECA 5KDTB 3RNNA 1LSTA 4XXUA 4XKQA 3TCHA 4F18A 3CSGA 4NWDA 4PE5B 2I0BA 2A5SA 2QSXA 3FJ7A 4HCYA 2HAUA 2DXYA 3THIA 3E9XA 2HFBA 1B05A 2VHAA 3K01A 2XXXA 4QHQA 5DEXB 5DTBA 4C0RA 1P1OA 2LAOA 2HZKA 1Y1ZA 1LFHA 1QVSA 3FV1A 4ELOA 4YB7A 3OXNA 3O97A 1N04A 4RY1A 4U21A 3VV5A 2E0SA 4PFTA 2XXTA 2R6GE 1MQIA 1US4A 3IJXB 3JV9A 3TFLA 5I59A 2ABHA 1MG1A 2XX8A 5TPAB 4WXJA 4YZZA 4QSEA 3UGWA 2O1MA 1MS7A 2G93A 3FVGA 4EQBA 2QS1A 2F5XA 4U23A 4GLIA 3RTWB 1Z7NE 3O9PA 3TTRA 4ZE8A 2DXRA 1HSEA 2F7AA 1SW2A 3FUZA 4Q30B 3FJGA 3IAZA 1B51A 4R75A 3TCFA 1I6AA 3T93B 3RTFB 3SERA 1TFAA 3IJOB 3PPQA 4KPTA 4U4SA 3QAXA 1FQEA 4HCWA 4BDLA 5I57B 4THIA 3ECRA 2Y7PA 3IOUA 2H99A 1URDA 1ATGA 1MQHA 4GXAA 4DXCA 5L9OA 2DWAA 3CFXA 1JVXA 4H6DA 4TLMB 1B1HA 3V89B 5KDTA 2XXQA 3H6UA 2CMOA 3K6VA 2Y7KA 3W9WA 1QKAA 1GVCA 5AA4A 1MY4A 2XXWA 4C1UA 1IIWA 1LGBC 1MRPA 3C31A 4Q0CA 2Q8JA 3OO9A 4MF3A 3MP6A 5CBRA 3KZGA 5IKBA 5ITOA 1OVTA 1WDNA 1XS5A 4FAJA 4DCYA 5I2KA 1OIBA 3CFZA 1VFEA 3HHGA 1DPPA 4H0WA 4E0XA 1UTHB 2I4CA 4YMBA 2RC7A 1FTMA 4EF2A 1Q35A 3CFLA 3H7MA 4FEDA 2RCBA 4F39A 2OLBA 3RT8A 5J1DA 5BUUA 1VR5A 1CE2A 2F7BA 4G2ZA 2X7PA 2Q2CA 2RKMA 5EHMA 3S9LC 2OWTA 3QK6A 4PETA 1SD3A 2Z23A 4G68C 3TQWA 3C33A 4DLDA 4NF5B 1TXFA 1VSOA 1PDAA 1IXCA 1SQYA 3IX1A 4RJZA 2M8CA 1B7UA 4LONB 3GZGA 3G3GA 4WKMA 1UIVA 3IL1B 4LQ2A 1BP5A 1SDXA 1F9BA 2XD2A 4M1VA 4NF6A 1SYHA 5EHSA 4KD5A 4F29A 1NMUA 2DS9A 2H5YA 2ZMBA 3QXMA 4H67A 3KGCA 3MPLA 1D9YA 1B2HA 1PBPA 3BFUA 3Q29A 4I62A 4R6YA 3TMGA 4OENA 3S9MC 4LZ7A 2QJEA 3DM0A 1RYOA 3HCQA 4RYAA 1Y3QA 4BLAA 4X1DA 1B58A 1QW0A 4KI0E 5K2YA 2Z22A 3OSRA 3TYHA 1LAGE 2AL4A 3S4UA 4HW8A 4DXUA 3FXRA 1FTLA 1EU8A 3LC8A 3N94A 4ZZEA 1MM6A 4DZ1A 3PMWA 4OFJA 1B5IA 1M5CA 4Q5TA 2I4BA 1Y9UA 4HS7A 4NF8B 3TCGA 2XXUA 3SDFA 2ZYOA 1FTJA 2UXAA 1M5BA 1MXUA 4JWOA 2DSFA 3H6TA 4MLVA 3K6UA 3LSLA 5HPQA 1H3DA 4KFQA 3KN8A 3K00A 3C9HA 1DTGA 3Q26A 5CM6A 1BTJA 3UP9A 3R6UA 4LATA 4LZ8A 4LZ5A 4POWA 4YB5A 1Y20A 4XKNA 5DT6A 1Q1KA 2RCAA 5AA4B 5CBSA 2A5TB 4YKPA 4H65A 4ND9A 2DYXA 5L8DA 1N3WA 3OO7A 1MY1A 2R71A 4AQ4A 3MZ1A 4O3CA 4ELPA 2DWHA 2F7CA 1WODA 2QS4A 2UVJA 4ESXA 1XVYA 5EYFA 2REGA 2PVUA 3G3JA 4F3BA 3TEPA 1OMPA 1A54A 1MY2A 1N84A 2YPNA 2HCAA 3A09A 3MBPA 3ONMA 4I1DA 1TWYA 3M3LA 3CSBA 4LQ5A 3VDFA 4UA8A 5L9MA 4NF5A 2R9JA 3ZS6A 2O84X 3CR9A 4EUOA 2P2AA 1NH8A 2F97A 1DSNA 1B1XA 1TT1A 3M3KA 5FHMA 1XVXA 1QJMA 2IA4A 1MDP1 4G8HA 4GOTA 4EXKA 1YPNA 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MVZA 4O7MA 1SVXB 5LTCA 1EH3A 2I6EA 2OK2A 3TTKA 3EQ1A 3O29A 4JDFA 4O3AA 3ROJA 1FPIA 5HM4B 1H45A 2HPGA 5CMBA 1MH3A 3O28A 2FA7A 1IQ7A 1B0HA 4ESWA 3FGSA 2ZYNA 4R6KA 1LB9A 3RLFE 4N8YA 3Q25A 2O69A 4DE8A 4PAKA 3SEYA 2NVUB 1J1NA 4ZEKA 2OX3A 5A5XA 4AB5A 1USYE 3FXUA 5I2KB 4GXSB 4AB6A 5DEXA 4OTEA 2O1LA 2Y5LA 5F7VA 3PV0E 1PC3A 3K6XA 1IMCA 4JVIA 5H8SA 1KZ8A 1POTA 1YTVA 3KEIA 2DWJA 3AXFA 3W15C 1NL5A 1EYKA 1WVJA 1A40A 3PPPA 4PDHA 2DE4A 4I3EA 1GTKA 3VVEA 1Q9DA 1FPLA 1NNKA 5TP9A 3IOWA 4HTGA 2XX7A 1CB6A 2XXPA 2X7QA 2XXHA 4BDNA 3D4GA 1JW1A 3I6VA 4H8JA 4N15A 3TODA 3B6TA 3UK4A 2Q9TA 4G68A 4YAHX 4OESA 1H44A 2HXWA 4NEDA 5IAIA 1AL3A 2Z8FA 1N3XA 1LLSA 4JBZA 5EQ9A 2QVVA 3T96B 1LCFA 2FVZA 3RPLB 4KR5A 3KSJA 3CG1A 4U1OA 3QYTA 3MC2A 4PF8A 5DVIA 4MNIA 4F22A 1I69A 4NTLA 3T9UA 4NE4A 5BWJA 1URSA 4NGUA 1MY0A 2Y7IA 4YKIA 4BDOA 3G3KA 3FVNA 4NF4B 3CRBA 4R9GA 4PFRA 4POXA 2ZYMA 3PUYE 1FPDA 3FATA 3UA8A 2PX1A 4GF8A 4BDQA 1FPKA 1VFDA 4OFOA 2OBGA 3KOTA 5AA2B 3T0JA 1S7YA 4I3YA 2DVCA 4YB6A 1FPGA 1MPDA 1DMBA 5J16A 4ISUA 4OERA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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