2D3IA

Crystal structure of aluminum-bound ovotransferrin at 2.15 angstrom resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
682
structure length
670
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of aluminium-bound ovotransferrin at 2.15 Angstroms resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 222
structure length 670
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA03
1LBCA 4RPOA 1MH3A 2P0SA 3G3GA 4YMBA 3W15C 3FJGA 1MXYA 2F78A 1URGA 4NF5B 3H6WA 4FECA 3PPOA 4YKIA 1M5EA 2G93A 4R6KA 2AL4A 3LSLA 5LOMA 1B46A 4E0WA 3DP6A 3CG1A 1GGGA 3U8QA 4G2ZA 4IGRA 4Q0CA 3USDA 4OZ9A 4BLAA 2Q8JA 4EF1A 4ZEDA 3BKIB 1POY1 4JWYA 3FXQA 4HCYA 2I4BA 5CI5A 1POTA 2Y7KA 2I3WA 3V5AA 1Y4TA 3U1OA 2R6GE 1Q1KA 3PUWE 1WODA 1ANFA 2XXRA 1N7XA 1AIVA 1EU8A 2XXTA 1BP5A 1TXFA 3H03A 3EF7A 4LQ5A 1B5HA 3S9MC 2H9BA 2WKYA 5M2VA 4IB2A 5TP9A 1I6BA 3QSLA 3GZGA 3H7MA 1ZMGA 2F8DA 2O1LA 1OIBA 1SBPA 5L9OA 1XHYA 2A5TB 1B3HA 1H45A 4NMYA 1GVCA 1VR5A 3PPQA 4H1XA 1MM7A 4H65A 4YKKA 1EH3A 1AL3A 3UA8A 2XXWA 4Q5TA 1B9JA 1JQFA 1BIYA 4G68B 1VE4A 5CRYA 1UTHA 2ONKE 3PMVA 4H67A 4BDNA 2ZYMA 3FVOA 1OVBA 3TTMA 3T9HB 5DYHA 4NF6A 1DOTA 2DSFA 2LAOA 4E0XA 1D9VA 3FJ7A 2NWJA 2A5SA 4PP0A 3EHTA 3H6VA 3IB2A 2D5WA 4H8JA 2DWAA 3Q26A 3T9UA 3B7DA 4EF2A 2XXUA 3SEVA 1FQFA 3G3IA 4NWDA 4G77A 3VLWA 1N7WA 2Y7WA 1FTOA 1SQYA 2B3FA 4KYSA 3R7XA 3K01A 1S9TA 5FTIA 1P1QA 3EHSA 1SW5A 4IY5A 1N84A 1ZU0A 3QIMA 4U2RA 4EDPA 4DE8A 4KPTA 3O9PA 4YB6A 5F1QA 1FQAA 1MXWA 1URDA 3OO6A 5AA3A 4U4XA 2DWJA 2IEEA 3EPEA 2XHDA 3MVYA 2HCAA 3KJTA 1GV8A 2I49A 3I6VA 1NNPA 3MW0A 1LSTA 4RNSA 3QK6A 3VV5A 1PB8A 5I2NB 1UIVA 3CRBA 4KQPA 1SDXA 4RPNA 2ABHA 5DT6A 3FJMA 2HEUA 1MQHA 3RQTA 5JTYA 2VHAA 4ZS9A 5K2XA 4I62A 4GVOA 4ZDMA 4OQOA 5DEXB 4QF9A 4QFKA 3RGYA 1D4NA 5I59A 2Y84A 3HSTA 5CMBA 4KYDA 3KSJA 3TODA 1USYH 3OEKA 5FHNA 4Z7EA 3L6HA 3KEIA 3H3GA 4FIMA 1FTMA 4OYVA 3O6GA 4KI0E 3TCGA 2Z8EA 4H5FA 4ECFA 4YU0A 3SEUA 2Q88A 1DTGA 3CI8A 2V3QA 4XKQA 4KHZE 5H8FB 1QW0A 3UIFA 1P1UA 4OETA 1SI1A 4Q30B 3UN6A 4C0RA 3SERA 3SEWA 2R9JA 1ZBMA 3K1NA 3N5LA 3CR9A 3FATA 5L9MA 3PV0E 3KGCA 2CZLA 3GXAA 4IO5A 1XT8A 2DE3A 1UTBA 2DXRA 3DP4A 4P11A 1Y1MA 3IOVA 3EHUA 3RPWA 2ZNSA 5I56A 4C1TA 2ZMBA 5I2KA 1JW4A 2HZKA 3T9VA 3S9LC 3TZAA 4AQ4A 2ZNUA 1XVYA 3GBAA 3V89B 1VFDA 3C34A 1H43A 2PT2A 1RYXA 3RT6B 4KFQA 3OELA 4OEVA 3M3KA 5HM4B 1NNFA 4NEDA 3MPLA 4H5GA 2THIA 5FTHA 4ONYA 4QFOA 1AH5A 3C4MA 3IO4A 2V25A 4RK9A 1IQ7A 1QULA 2DVCA 3CSBA 2YPNA 4RK2A 4XTCQ 1QJMA 3IB1A 1ELJA 4GXAA 3O6IA 4R74A 3MZBA 4NF8A 3K0VA 3B6QA 5HPQA 1OQHA 3W9WA 4ESXA 3PGFA 4JDFA 5CC2A 4GRKA 5L8DA 3N6UA 4P0IA 1VSOA 2RCBA 4FEDA 1II5A 2CMOA 4YICA 1YPNA 1PBQA 1EZPA 1RYOA 3KG2A 3FASA 2RC8A 2O7IA 3K6WA 4DXCA 3PD9A 4QSCA 4FORA 4F3SA 2OCUA 4DDDA 1OMPA 3OO9A 4OEUA 4LONB 4KCDA 2X7QA 1MY1A 1FQEA 1S7YA 4GOTA 4F1VA 1SVXB 2UVIA 4QHQA 4BDQA 3A09A 4FAJA 1MY2A 4BDMA 4LQ2A 3S9NC 4WEDA 3VVEA 4F3GA 4F2OA 5ICQA 2VP1A 3G3JA 3FIRA 2VOZA 1PBPA 1R6ZA 2V84A 1PDAA 1DTZA 1R9QA 5KCJA 4OESA 1SW4A 1B7HA 3TCHA 3KFMA 2H5YA 1B6HA 1JVYA 4X1DA 1A40A 1B1HA 1QKAA 2UXAA 3K1PA 3VVFA 4U4SA 4HTGA 2PX1A 2Q2CA 3R26A 2GHAA 3RLFE 1F9BA 2DQVA 1A7LA 1AOVA 3QXMA 3IOWA 1O64A 3OENA 3JZJA 3LUYA 1MPDA 3Q28A 5TP9B 4U23A 1M5DA 4RYAA 3OSQA 2QMXA 1MXVA 3IJOB 4YAHX 1ZJLA 3PUXE 5K2YA 3VDFA 3TQLA 1ZKBA 4LP2B 3HCQA 1LCTA 2YJPA 4THIA 3RUMA 5AA1A 3RTFB 3K1MA 2XXHA 1NL5A 2HQ0A 4LA9A 3TAJA 2FNCA 1B4ZA 1B0HA 2Y7IA 4OFLA 3C35A 3K00A 3TTNA 5KDTA 1UTHB 3M8UA 1T0KA 4F29A 4OWDA 1MQGA 1GR2A 1O7TA 3PUVE 5EYFA 2PMSA 1NNTA 4YB7A 1FTJA 3CFXA 3KOTA 1SW2A 2Y7PA 1B05A 4QSDA 1Y9UA 2XXYA 4NF6B 2AL5A 1OVTA 4MLVA 4Z0IA 3TKDA 1B51A 2Z23A 1SYIA 2DE4A 4ELRA 3HPIA 4EUOA 4BDOA 2PVUA 4R6YA 1LB9A 3Q29A 4KR5A 3MC2A 4NF4A 4N6PA 4WEPA 5L9SA 5I84A 3O6HA 4JWOA 3H6TA 1N3XA 3OEMA 2XX9A 4H6DA 4DCYA 4BDLA 1IZ1A 1SYHA 2NVUB 3ZSFA 3O2AA 2RINA 1S50A 1TWYA 1A55A 4GIZA 5ELVA 1JVXA 3IO6A 3SETA 3PPNA 2XXIA 3CFZA 5EHMA 2GFEA 2F97A 2ANJA 1I6AA 4HCWA 4IO4A 3VE1B 1MG1A 3KSXA 2NXOA 1B40A 3D4GA 3DM0A 2Q9TA 4UA8A 5I58A 4POXA 3RTWB 4JB7A 5A5XA 2QSXA 5TPAA 2QJEA 5JTYB 3LSFB 3ILTB 3MZ9A 1IXHA 4JSDA 2AYSA 4ZEBA 4ZEFA 5H8HB 4N07A 3C33A 4OVJA 5H8NA 1D9YA 5AA2D 5KZTA 3H6UA 2G29A 4YMAA 1NMUA 5JK4A 1YCJA 4DIGA 4G8MA 4ISUA 2PT1A 5B70A 2O7UA 1TFDA 1QVSA 3LBSA 3N26A 1LAGE 4OFOA 1EZOA 1JETA 2XX7A 1MXXA 4KCCA 4RA1A 2I58A 3ONMA 2V93A 1URSA 4F19A 4IO2A 4MLQA 1FW0A 4K3FA 1MXUA 3FVKA 2ZYOA 3OMBA 3WAEA 2FA7A 1IIWA 1MPCA 3HHFA 4FE8A 4AB6A 5ISUA 1LFHA 1B3FA 1UTBB 2RC7A 3IORA 1MY0A 5FHOA 3TELA 3IB0A 1M5BA 3CIJA 1MDP1 3FV2A 3T96B 2O68A 4ELOA 4RXLA 1B7UA 1MH4A 5B7DA 5I56B 5I2KB 2E1SA 1MM6A 3KZGA 2GRVA 2I3VA 4JXIA 2O69A 2F35A 3G3HA 3THIA 2QL3A 1PB7A 4QFLA 1Y3NA 4EXKA 1B5JA 4TOZA 2NOOA 4PETA 1FCKA 3MP6A 2UVGA 1US4A 1B58A 2F6PA 3TEPA 4POWA 4X9TA 2Q2AA 4LATA 4XXUA 4QRZA 2DP8A 3PUZE 4WKMA 4R9FA 2BJJX 3H4ZA 5I2NA 5BWJA 2HFBA 2E0SA 4GXSB 4LZ8A 3W9VA 2I48A 3K4UA 5DVFA 1B1XA 3B6TA 2XD3A 5CM6A 1B0LA 3VVDA 4OHNA 1B52A 4ZECA 1M5CA 5DEXA 1US5A 1MQIA 4DZ1A 4ZZEA 1A99A 3SKPA 1IEJA 2YLNA 4EXLA 5H8QA 1H44A 2UVHA 2RF1A 2Z8DA 1LFIA 2QS4A 5CMMA 1OLAA 3HO7A 1MDQA 4YKJA 1I69A 3M3LA 1YTVA 2OK2A 3T93B 1DSNA 3D4CA 2HZLA 1JNFA 1P1OA 4PFWA 5FHMA 1WDNA 2NUVA 3UK4A 1IXIA 5H8FA 1Y4CA 2ALUA 4R73A 3LR1A 3PPRA 3MAMA 4O3BA 2H4IA 2H99A 1MRPA 3M3FA 2P1SA 3KN8A 1M5FA 1QUIA 5DVJA 2VD3A 4GL0A 2ZYNA 3T22A 2HXWA 4KD5A 5KCJB 3C32A 4U1ZA 1P1WA 1JEVA 1B32A 5DTBA 4M1VA 4ELPA 3FV1A 2PYYA 2Z8FA 1WVJA 3S2VA 2B3BA 4YB5A 2W7YA 4F1YA 4XKRA 2F6GA 1IITA 2OZZA 3Q25A 3TDJA 4F1UA 2DS9A 3IAZA 4G8HA 1MXZA 1MPBA 3BBRA 4MFIA 1N04A 1FQBA 3ZS6A 3N94A 4NWCA 3V8XB 4H0WA 2OJTA 5CMKA 3JYRA 4YKPA 3Q27A 4IGTA 3C9HA 1HSLA 3IOUA 1AMFA 2V3TA 1Y3QA 3RN8A 1B3GA 4PE5B 2ZNTA 4R2FA 3OSRA 5AA2A 3MBPA 1MQJA 4H8IA 1B4HA 3QUFA 1XVXA 4RJZA 2OBGA 5KDTB 3UP9A 1PEBA 3LSWA 4ZE9A 4XKNA 4DXBA 3L6GA 5CBSA 4EQ7A 3O66A 4DCXA 3KOSA 3E3KA 1LCFA 4ESWA 3U92A 3C36A 3SEYA 3IJXB 3H06B 1XS5A 1OLCA 4G8NA 5F7VA 4ZE8A 3MVXA 4GFRA 5IKBA 3T66A 2REGA 3N6TA 3FZVA 2ONSA 4JSOA 4ZEKA 1B3EA 3IX1A 3OO8A 5TU0A 3KBRA 3TUSA 3S9EA 5AA4A 3K02A 1HSEA 3HV1A 4ZEIA 4NF4B 3G3KA 3MUQA 1TT1A 1A8EA 4O3CA 2F34A 1LB8A 2ESNA 3ODBA 3O28A 3EQ1A 3O97A 4U22A 4P0GA 1BKAA 4I9DA 1LLSA 4NTLA 3QYTA 2XXPA 3K6UA 3E9XA 5I57A 4U1OA 4EQBA 4N13A 1LAHE 1Z7NE 2H25A 2ONRA 3MVZA 3MVWA 3MWBA 1LAFE 3TFLA 1D3KA 1ATGA 3BFUA 1P99A 4F3BA 2X26A 1B7ZA 5I58B 4NF5A 4UACA 2V3UA 5JEIA 3U72A 4GL8A 3CG3A 5A5XB 5TPAB 4MBPA 1R1NA 3PU5A 2QS1A 5EHSA 2O6AA 3CVGA 3OOAA 4DLDA 4YZZA 1CB6A 3VFJA 4OERA 1MQDA 5H8NB 3HHGA 3U94A 3VXBA 4AB5A 4XIGQ 1UIUA 4OFJA 4I8CA 3IL1B 2IA4A 1J1NA 1QUJA 3P7IA 1Q35A 1MY4A 2HAVA 4O3AA 2DXYA 4PFTA 5J1DA 1BTJA 1L5TA 4R75A 1YAEA 2F7CA 3C31A 3K2DA 2ZXTA 4ND9A 1IXGA 1NH7A 2F7AA 2VD2A 2RCAA 2DWHA 1N76A 2O1MA 3E4RA 2A5TA 4G4PA 2DVZA 1JW5A 2ZYKA 3K6VA 3DLNA 3OO7A 3QAXA 5H8SA 3FVNA 4WXJA 5I59B 3QUJA 2D21A 2HAUA 1NKXA 2AIXA 2QRYA 3MZ1A 4LZ7A 2M8CA 3SEXA 3FUZA 3RNNA 4OMBA 4TQUQ 4F18A 3JV9A 4G68A 4Q8RA 4F3PA 4IO6A 1BLFA 4XKPA 1QUKA 3TPAA 2R71A 2Z22A 4IY6A 3G7WA 4ZZAA 3DELB 1NNKA 1VFEA 2I0BA 4IO7A 3MP1A 2DWIA 2D3IA 4R72A 5AE4A 4LVQA 2QMWA 5CMCA 2H98A 3KN3A 3IOTA 3VLUA 1MY3A 4OXVA 3SESA 1OQGA 2I0CA 1H3DA 5H8HA 3TTLA 5CBRA 4JWXA 4R9GA 1FTLA 3GBBA 2UVJA 5ITOA 3PUYE 3VXCA 5DVIA 3HN0A 4GWOA 5H8QB 2Q89A 3G3FA 1O63A 2Y7RA 1Y20A 3LSXA 3FXUA 4G68C 4JBZA 4TLMB 4L17A 2I6EA 4F39A 3EN3A 3A3CA 4C1UA 4QFNA 2OLBA 2F36A 4GQOA 1XC1A 1P1NA 4BDRA 1SD3A 3FXRA 4NF8B 1PB9A 1B2HA 1N3WA 1JW1A 2RC9A 3K6XA 3PPPA 3R6UA 2GHBA 3FVGA 2UYFA 1LBBA 4LZ5A 3U93A 4GLIA 3WAFA 1LGBC 4GF8A 3FD3A 3TQWA 5IAIA 4R6HA 1USYE 4OENA 3UORA 4HS7A 1B5IA 1TFAA 3TMGA 3GLBA 3MJNA 4F22A 3PMXA 4GD5A 1DPPA 2DOJA 4ELQA 3RT8A 5ICTA 2X7PA 1NH8A 4R2BA 1CE2A 2XXVA 2DE2A 1KWHA 4M4GA 1UQWA 3ZKLA 4F31B 3ILUB 1LAXA 2XD2A 1IXCA 4MH5A 2F7BA 2GH9A 2FYIA 3PMWA 5ITPA 1LFGA 1NFTA 2B65A 2OWTA 3AXFA 2P2AA 1GTKA 4PQJA 2XXXA 1N0TA 3RY3A 1PC3A 4RY1A 3S4UA 1A8FA 1DPEA 1QKBA 2O51A 4FATA 4HW8A 3LC8A 4OTEA 3IR1A 1SI0A 1SW1A 4MF3A 4NE4A 4PFYA 4X48A 1ZTYA 1Y3PA 3MP8A 5AA2B 3ZKKA 4I1DA 2XXQA 4EQ9A 4FJPA 1FQDA 4QSEA 2O84X 2VGQA 1EZ9A 4PFUA 3OD7A 3TTRA 1XOCA 1FTKA 3I5OA 2KLFA 3I3VA 4X1BA 2OWSA 2REJA 2XX8A 3FGSA 3TTKA 3KJ7A 1IUDA 1A54A 4IO3A 5HBCA 3O29A 1MS7A 3SDFA 1JEUA 3KN7A 3CFLA 3UGWA 1ZIUA 2I4CA 3CSGA 3IK6B 2UYEA 1FQCA 2QS3A 2QPQA 3ECRA 2PBWA 4QFPA 4FEBA 3PD8A 4DXUA 5AA4B 4U21A 1RKMA 3BFTA 2QS2A 2F5XA 1DMBA 1I6QA 1Y1ZA 3F11A 2DYXA 3B6WA 5BUUA 4TLLB 3VLVA 3E13X 1B3LA 3OXNA 3TYHA 3V83A 3TCFA 1HSJA 1ZLQA 3A3UA 3MQ9A 4F2QA 1Z7ME 5I57B 1H76A 4LUBA 1R9LA 3MPKA 2RKMA 3T9XB 4KYEA 3DP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBCA 4RPOA 1MH3A 2P0SA 3G3GA 4YMBA 4N17A 3W15C 3FJGA 1FBPA 1MXYA 2F78A 1URGA 4NF5B 3H6WA 5IM2A 4FECA 4JVIA 3PPOA 1FBEA 4YKIA 4OANA 1M5EA 2G93A 4R6KA 2AL4A 3LSLA 5LOMA 1B46A 4E0WA 3DP6A 3CG1A 1GGGA 4JVDA 3U8QA 4G2ZA 4IGRA 4Q0CA 3USDA 4PBHA 4OZ9A 4BLAA 2Q8JA 4EF1A 4ZEDA 3BKIB 4GBWA 1POY1 1QGXA 4JWYA 3FXQA 4HCYA 2FHYA 2I4BA 5CI5A 1POTA 2Y7KA 4H45A 2I3WA 3V5AA 5I5PA 1Y4TA 3U1OA 2R6GE 1Q1KA 3PUWE 1WODA 2ZZVA 1ANFA 2XXRA 1EYJA 1N7XA 5DW8A 1AIVA 1EU8A 4MJOA 2XXTA 1BP5A 1TXFA 3H03A 3EF7A 4LQ5A 1B5HA 3S9MC 2H9BA 2WKYA 3E79A 5M2VA 4IB2A 5TP9A 1I6BA 3QSLA 3GZGA 3H7MA 4X04A 1ZMGA 2F8DA 1FBFA 2O1LA 1OIBA 1SBPA 5L9OA 1XHYA 2A5TB 1B3HA 1H45A 4NMYA 1GVCA 1VR5A 3PPQA 4H1XA 1MM7A 4FBPA 4H65A 4YKKA 1EH3A 4N8GA 1AL3A 3UA8A 2XXWA 4Q5TA 3FXBA 1B9JA 1FPKA 4MNPA 4UABA 4N6DA 3BIHA 1DBZA 1JQFA 1BIYA 4G68B 1VE4A 5CRYA 1UTHA 2ONKE 3PMVA 4H67A 1LBVA 4BDNA 3LUZA 2ZYMA 2FVZA 3FVOA 1OVBA 3TTMA 3T9HB 5DYHA 4NF6A 1DOTA 2DSFA 2LAOA 4E0XA 1D9VA 3FJ7A 2NWJA 2A5SA 4PP0A 3EHTA 3H6VA 3IB2A 2D5WA 4H8JA 2DWAA 1FPIA 3Q26A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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