2D3IA

Crystal structure of aluminum-bound ovotransferrin at 2.15 angstrom resolution
Total Genus 222
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
222
sequence length
682
structure length
670
Chain Sequence
b'SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQVFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of aluminium-bound ovotransferrin at 2.15 Angstroms resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ovotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 222
structure length 670
sequence length 682
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2d3iA03
1ELJA 3OSRA 4ZZEA 4ELPA 4RK2A 1M5DA 1IIWA 4NF6A 4RPNA 1ZLQA 4GIZA 3PUXE 2O6AA 3GZGA 2E0SA 3SETA 3RY3A 3K6XA 1B2HA 3RT6B 4YZZA 2NWJA 5I56B 1H45A 3SEUA 5HPQA 4R6KA 3OSQA 4EF2A 5TPAA 4ZEDA 1A55A 4WKMA 3MVYA 4OESA 2XX9A 2ZYOA 2OWTA 2YLNA 4UACA 5CMMA 4XKRA 3K6UA 3MVZA 1LGBC 1QUIA 2O1MA 2I3VA 3PPRA 1URGA 4R9GA 3G3KA 2OLBA 1B5IA 3FIRA 4U22A 3CI8A 4ELRA 5CMCA 4DZ1A 2UVJA 4R6YA 3CFZA 1MRPA 1LAHE 2H98A 1H3DA 1SQYA 2F35A 2AIXA 1FTJA 4NTLA 1Y3QA 4O3CA 4OENA 2B65A 1T0KA 4MLVA 4PP0A 2THIA 4JWOA 3VV5A 3R6UA 1ZMGA 1GR2A 3PV0E 3VLVA 1B40A 2ZYMA 2HXWA 4F3PA 1YTVA 1GV8A 5EHMA 2P2AA 4YMBA 5CBRA 1B4HA 1M5BA 4DDDA 4GRKA 4RJZA 3I3VA 4LVQA 4RA1A 4POXA 1XC1A 1CE2A 2QPQA 3LSFB 3DLNA 3C9HA 1OVTA 2DWIA 3S9MC 5KZTA 5HM4B 5I57B 3ZKKA 4F31B 3K2DA 3H6WA 1R9QA 3SEXA 1Y1MA 4GFRA 3HCQA 3UIFA 1SYIA 4OFJA 1FQBA 3OO7A 4PETA 4OEVA 1LAXA 1I6QA 1SW5A 3U72A 1PC3A 2DQVA 5AA4B 2YPNA 3HHFA 5CI5A 4O3BA 4GQOA 5EYFA 4OEUA 1JQFA 3Q29A 4DCXA 4QFLA 3PU5A 2QRYA 4EXKA 2DE3A 4U2RA 1NH8A 4QFKA 1I6AA 4TQUQ 4YB7A 3VFJA 1P99A 2HQ0A 2ZMBA 3T93B 1MQGA 2V3TA 4ZS9A 2REGA 1ZIUA 4BDRA 5B70A 1EZ9A 2I3WA 4F2QA 2RINA 3T9HB 5L9MA 4ZE8A 1DTGA 1IQ7A 1DOTA 4NF5B 5LOMA 3O97A 2G93A 2H9BA 3LR1A 4IGTA 2AL4A 3EF7A 2VGQA 4ONYA 1B7UA 4EDPA 4QSEA 1ZKBA 3UA8A 4EUOA 1N3XA 4KYSA 2DVCA 2F7CA 4BDMA 5A5XB 1MG1A 5H8QA 1D4NA 4EXLA 1Y3PA 1RYOA 4BDOA 3RQTA 1MQJA 3MZBA 1MQIA 3TCFA 4KYDA 3TAJA 2Q9TA 3KOSA 3O6GA 3KSXA 1PB7A 1S50A 3KGCA 3V89B 4U4SA 4NE4A 1LB9A 4RNSA 1SW2A 1URDA 2F34A 2O51A 3T66A 2XXXA 3CG3A 4FIMA 2V25A 2QS4A 3DP8A 3GXAA 3MZ9A 4LQ5A 1UTHB 4F19A 2P1SA 2GFEA 1AL3A 3EHUA 4IB2A 2XXVA 2QS2A 5AA3A 4U23A 2Z8EA 4NF8A 4JDFA 1B3LA 2F6PA 1NNTA 1POY1 2XD3A 3PUZE 2H25A 2A5SA 3S4UA 5F7VA 5EHSA 1PEBA 3TTMA 4IY5A 1JEVA 2BJJX 4PQJA 4F1UA 4DE8A 3CG1A 5TPAB 4OQOA 3TTKA 1ZTYA 1LBCA 3FASA 1J1NA 2ZNUA 1JVYA 5DVIA 1N04A 3VVFA 4GXSB 2DXYA 4QFOA 5KCJA 5I2NA 1P1UA 3H6UA 1B32A 4G68C 2F97A 3TTNA 2NUVA 2GHAA 3GBAA 3TZAA 2RF1A 4RY1A 4OYVA 3PMVA 4FAJA 3ZKLA 1WODA 4FORA 2VHAA 5ELVA 5H8FB 4YKPA 2RKMA 5AE4A 2ZXTA 3JZJA 3UN6A 3O2AA 1XS5A 3PPNA 3N6TA 2XX8A 1FTOA 1LAGE 1PDAA 4NWCA 3T96B 5ICTA 3S9EA 5M2VA 5K2YA 3VLUA 3KBRA 4X48A 2PT2A 3RLFE 3N94A 4RPOA 4BLAA 1NMUA 1QJMA 1B5JA 1VSOA 3L6GA 2F5XA 5AA2A 3FV1A 5I2KA 3K00A 1USYE 1US5A 2H99A 3TCGA 2M8CA 1TT1A 4QSCA 3N6UA 3HO7A 4F1VA 2XXHA 5JTYA 4QRZA 1I69A 2VP1A 4R74A 1A99A 3FVNA 4QFNA 5H8SA 2I0CA 1PBQA 3FJGA 4XXUA 3ILUB 5FTIA 3EQ1A 4YU0A 3MAMA 3TPAA 3G3IA 3R26A 4PE5B 5H8HA 2FA7A 4K3FA 1AIVA 3PPOA 3W9WA 1N7XA 4YICA 1EU8A 3MC2A 1LSTA 3RPWA 3MW0A 1LLSA 3QUJA 5BUUA 5J1DA 3TFLA 4ZECA 3O66A 4Q30B 3E13X 5DEXA 1Y4CA 1HSJA 1NL5A 3BKIB 4ND9A 1OQHA 3T9XB 4FJPA 1LAFE 2YJPA 1FQDA 1DPPA 5CMBA 4IO6A 5AA2D 1MS7A 4AB5A 4YKKA 2XD2A 1Y9UA 1B4ZA 3IO4A 3S9NC 5ICQA 2NOOA 4Q5TA 3C32A 3KN7A 1RKMA 2UYFA 3E4RA 1XT8A 1N76A 4R72A 3I5OA 5I59B 4G68A 3B6TA 5H8QB 1B3EA 1MY1A 3TTLA 2PVUA 1O7TA 4BDQA 4H65A 4OMBA 3SEYA 1MXZA 4NF4A 3U93A 4HTGA 3Q27A 5L9OA 5I58A 2R6GE 5KDTA 2DS9A 3OXNA 3FVOA 3EN3A 1IXGA 1R6ZA 3MP6A 3U1OA 1B51A 4WXJA 1B46A 2ZYKA 2ZNTA 1F9BA 2NVUB 5CBSA 3KJ7A 1IXIA 4IO7A 1UTBA 5TP9A 3TCHA 3VXCA 3UK4A 1VE4A 4RXLA 4G8MA 3CR9A 1JNFA 2FNCA 2VD3A 4F1YA 3KZGA 3S9LC 3USDA 1XHYA 2I0BA 3QIMA 3OO6A 4RK9A 1AOVA 3SEWA 1Z7ME 2G29A 2XXTA 1BKAA 4LQ2A 3TQWA 1P1OA 1DMBA 2Z23A 3PD8A 5DVJA 4E0XA 3GBBA 3MVWA 1ZBMA 1AMFA 2HZLA 3H06B 1IEJA 1N0TA 2GRVA 5I2NB 3VVDA 1B7HA 4OFLA 3FJ7A 2O7UA 2W7YA 4QFPA 2QL3A 3H6VA 4KCDA 1YAEA 4WEDA 2Q8JA 1NH7A 4GWOA 1MPBA 4XKNA 3T9UA 4N13A 4M4GA 1VFEA 1B5HA 5DYHA 2R9JA 1FQEA 4HCYA 1N7WA 2PMSA 1Q1KA 1CB6A 4THIA 2OWSA 1Y4TA 1JW5A 4YB6A 4JWXA 5FHMA 3IOWA 5B7DA 1B3HA 1BIYA 1VR5A 4E0WA 3QK6A 3G3JA 1B52A 3CSBA 4N6PA 1MY0A 3PMWA 3RUMA 4G8NA 1L5TA 1B3GA 2Y7PA 1ATGA 3OD7A 3PPPA 1PB9A 1QKAA 1ANFA 4IGRA 3IR1A 1MM6A 3WAEA 2XXQA 4P0GA 1TWYA 3IOTA 5K2XA 2I58A 2XXYA 3FJMA 2V3QA 4IO3A 2I4CA 5JTYB 3T22A 1AH5A 1P1WA 2XXWA 3IJXB 3LBSA 1N3WA 5FHOA 3EPEA 3W15C 1OIBA 1II5A 1I6BA 2ONSA 4YB5A 1B0LA 4KHZE 5ISUA 5FHNA 3KJTA 3FVKA 3JV9A 1OLCA 5H8HB 2FYIA 3PUWE 4RYAA 2O69A 3K6VA 5CMKA 4R73A 4JSOA 3QAXA 1GVCA 1XVYA 1JETA 2XXRA 1MXUA 4KFQA 2X7QA 3K6WA 1MXXA 3MQ9A 4H8JA 3RTFB 4ELQA 4FE8A 1GTKA 1MPCA 4QF9A 1JW4A 4KPTA 1QKBA 3K02A 3MVXA 4NF6B 5H8NA 3AXFA 4TOZA 4X1BA 5CRYA 1QW0A 3GLBA 3M3LA 1Z7NE 4U21A 4Q8RA 3LSWA 4GL8A 1O64A 4DLDA 2UVGA 1XOCA 1M5EA 2O1LA 2RC7A 1MXYA 4EQ7A 1ZU0A 2F7BA 3SESA 4PFTA 5IAIA 4DXBA 1P1NA 2UVIA 3OO9A 1D9YA 2HEUA 1MY4A 1IUDA 1TXFA 1QUJA 5I57A 3O6IA 3IL1B 2PT1A 3VVEA 4NF4B 2UVHA 2DOJA 3O29A 2Z8DA 1Q35A 3CFXA 1VFDA 1XVXA 5IKBA 4H67A 3KFMA 1MQHA 2REJA 4PFYA 3FZVA 2I49A 3C31A 2RC9A 2HAUA 4F3BA 3HPIA 4X1DA 5AA4A 1NNKA 3KN8A 3FXUA 3RNNA 3D4CA 3VLWA 2ABHA 3QXMA 1YPNA 4LATA 1NNPA 4ZEBA 2ALUA 3K01A 3TKDA 1UTBB 5CC2A 1A8FA 5L8DA 1M5CA 3IAZA 5I84A 4BDLA 3B6WA 5AA1A 4F29A 1TFDA 3U92A 1HSEA 3MUQA 1OLAA 2R71A 3H7MA 2X7PA 1EH3A 4ZE9A 4H6DA 4R6HA 4IO4A 1IITA 3UORA 4ESWA 2D21A 3ZS6A 1ZJLA 1MDQA 4R9FA 3N5LA 4XKQA 3SERA 2UYEA 4YKIA 4Z0IA 3CVGA 1MPDA 2QMWA 3KEIA 4ZDMA 3IORA 3MZ1A 4U1OA 4FATA 1GGGA 2O7IA 4KQPA 5A5XA 1H44A 4F2OA 3EHSA 2PX1A 4XIGQ 2V93A 3M3KA 1B7ZA 3C4MA 3R7XA 1JW1A 4MH5A 1B3FA 3IB1A 3H03A 3C34A 1SI1A 3P7IA 4GF8A 1RYXA 4MBPA 1IXCA 4MLQA 4AB6A 1H43A 1POTA 3FATA 2XXUA 3IJOB 4G4PA 2QJEA 1BP5A 3TMGA 1MQDA 1H76A 3FXRA 3N26A 3EHTA 1UTHA 3FXQA 3MPKA 3TUSA 2ESNA 3RTWB 2DWAA 3PUVE 4C1UA 1B58A 1MH4A 3LC8A 4TLLB 3K1NA 2QS1A 5ITOA 2DYXA 2DE2A 1DSNA 2IA4A 4KCCA 2WKYA 4LUBA 3FV2A 4LZ8A 4FEDA 3TTRA 3K1MA 3HV1A 1LFIA 1SYHA 3OMBA 4HW8A 3Q25A 1D9VA 1UIUA 2VOZA 3PMXA 3MBPA 3O9PA 3K0VA 4LZ7A 1NFTA 5ITPA 1BTJA 1S9TA 1PBPA 2NXOA 2VD2A 3CFLA 4L17A 2ZYNA 4XKPA 4OHNA 3M8UA 2Y7KA 2DVZA 4FECA 1PB8A 3ODBA 5TU0A 2RCBA 3Q28A 2LAOA 4OXVA 4GL0A 1MDP1 3FVGA 4FEBA 3BFUA 3VXBA 3K4UA 2F8DA 2UXAA 1WDNA 5F1QA 1SI0A 4NWDA 4ZEIA 1B1HA 1WVJA 4EQ9A 3S2VA 1OMPA 1MH3A 2GH9A 3HN0A 4MFIA 4H5GA 2D5WA 1YCJA 4NF8B 3HSTA 4ZZAA 5H8NB 1IZ1A 4G8HA 1URSA 2H4IA 3WAFA 4N07A 5H8FA 2A5TA 3E9XA 1O63A 3VDFA 4UA8A 1LFGA 3TELA 4LONB 1FCKA 4GLIA 3UGWA 3BFTA 1SVXB 4G2ZA 4O3AA 2B3BA 3SDFA 5JEIA 5CM6A 3IB2A 1SD3A 2Y7WA 3KN3A 2O84X 4QHQA 5KCJB 3LSXA 4OTEA 1Y3NA 1D3KA 1US4A 2OCUA 4AQ4A 4U4XA 5HBCA 1UQWA 3B6QA 4Q0CA 2XHDA 4TLMB 2DE4A 4KR5A 4OZ9A 2XX7A 1A8EA 4YKJA 4C1TA 4HS7A 3DP6A 3MJNA 2PYYA 4R2FA 3TDJA 4DXCA 3D4GA 3PD9A 4EQBA 1QVSA 1QULA 4ESXA 4WEPA 4JB7A 1MY3A 1SW1A 2PBWA 2OBGA 5FTHA 3FGSA 3A3CA 4IO2A 2F6GA 3F11A 3BBRA 3QUFA 2QSXA 3KOTA 3ILTB 3UP9A 3CIJA 1Y20A 2DWJA 1JVXA 1B6HA 3G3GA 3OO8A 1JEUA 4IO5A 2Q2AA 4KI0E 4ECFA 1B1XA 4NEDA 3V8XB 5AA2B 5I2KB 2B3FA 1M5FA 4F3SA 1P1QA 4DCYA 1A54A 3OEMA 3IB0A 3IK6B 3G3HA 3RN8A 3TEPA 5I56A 3QSLA 2Q88A 3A3UA 2HAVA 2AL5A 3SKPA 2X26A 4I9DA 3TYHA 4GD5A 1MY2A 2F36A 3W9VA 5I59A 3V83A 3SEVA 1Y1ZA 2DSFA 3KG2A 2OZZA 1FQCA 3C33A 3CRBA 1BLFA 2I4BA 3MP8A 2D3IA 4QSDA 2KLFA 3QYTA 4POWA 3KSJA 2DXRA 3PPQA 3TQLA 3IX1A 1DTZA 3PGFA 5DEXB 3O28A 4R75A 4YAHX 4F22A 1FW0A 5DVFA 4I1DA 4PFWA 2DWHA 4H0WA 1OQGA 3Q26A 2ONRA 4NMYA 4YMAA 1FQFA 3DELB 3ECRA 1A7LA 1EZOA 4F3GA 1A40A 3MPLA 2QS3A 2F78A 3VE1B 2AYSA 2IEEA 3OELA 4DIGA 2XXIA 2OJTA 3ZSFA 5BWJA 4P0IA 4OFOA 3B7DA 3RGYA 3PUYE 4G68B 4ZEFA 2Q2CA 4GXAA 4JWYA 2I6EA 2I48A 4U1ZA 3JYRA 3G3FA 2GHBA 3O6HA 5DT6A 1OVBA 5I58B 5KDTB 1IXHA 1LFHA 2Y7IA 4MF3A 4KD5A 1QUKA 4LZ5A 2HCAA 4BDNA 3C35A 3FUZA 4IY6A 4JSDA 4P11A 2Y84A 3G7WA 1B05A 2HFBA 3DM0A 2V84A 3CSGA 3T9VA 3H6TA 1B0HA 4Z7EA 5TP9B 1LBBA 1LB8A 3M3FA 4XTCQ 1R9LA 4G77A 3FD3A 2E1SA 2QMXA 2A5TB 3E3KA 1SBPA 2ANJA 3H4ZA 3ONMA 3IOUA 2Z8FA 3U8QA 2CMOA 4ISUA 4GOTA 4R2BA 4LP2B 4HCWA 4F39A 1DPEA 4I62A 2V3UA 4KYEA 4OERA 1EZPA 4NF5A 3IO6A 4M1VA 4F18A 4I8CA 4GVOA 2RCAA 2F7AA 4OVJA 3L6HA 1FTMA 1N84A 3U94A 3C36A 1KWHA 1MM7A 4LA9A 5JK4A 4JXIA 3HHGA 1MXWA 4EF1A 2Z22A 1SDXA 4OETA 1FTKA 2OK2A 2Q89A 4H5FA 4X9TA 3V5AA 4ZEKA 2ONKE 1USYH 3I6VA 3THIA 1TFAA 3OOAA 3TODA 2RC8A 4H8IA 3IOVA 1MXVA 2DP8A 1S7YA 1B9JA 3MWBA 1UIVA 1R1NA 1HSLA 2ZNSA 3LUYA 3RT8A 3DP4A 1NNFA 2HZKA 2CZLA 1LCFA 3MP1A 3LSLA 3OEKA 2XXPA 2O68A 1LCTA 3A09A 1NKXA 4JBZA 2Y7RA 3OENA 4OWDA 1SW4A 5DTBA 4PFUA 4H1XA 4DXUA 1FQAA 4ELOA 5L9SA 2P0SA 2H5YA 3K1PA 4C0RA 3H3GA 1FTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ELJA 3OSRA 2PFYA 4ZZEA 4ELPA 4RK2A 1M5DA 1IIWA 4NF6A 2VT5A 4RPNA 3B50A 1ZLQA 4GIZA 3PUXE 2O6AA 3GZGA 2E0SA 3SETA 3RY3A 3K6XA 1B2HA 4NF0A 3RT6B 4YZZA 2NWJA 5I56B 1H45A 3SEUA 5HPQA 4R6KA 4OVPA 3OSQA 4EF2A 1DK4A 2CEXA 5TPAA 4ZEDA 1A55A 4OVTA 4WKMA 3MVYA 4OESA 2XX9A 2ZYOA 2OWTA 2YLNA 1Q9DA 4UACA 5CMMA 4XKRA 3K6UA 3MVZA 1LGBC 1QUIA 2O1MA 2I3VA 2XWOA 3PPRA 1URGA 4R9GA 3G3KA 2OLBA 1B5IA 3FIRA 4I3YA 4U22A 3CI8A 4ELRA 5CMCA 4DZ1A 2UVJA 1K9ZA 4R6YA 3CFZA 4QBAA 1MRPA 1LAHE 2H98A 2FIEA 1H3DA 3EKIA 1SQYA 1FBHA 2F35A 2AIXA 1FTJA 4NTLA 1Y3QA 4O3CA 4OENA 2B65A 1T0KA 4MLVA 4PP0A 2THIA 4JWOA 3VV5A 3R6UA 1ZMGA 1GR2A 3PV0E 3VLVA 1B40A 2ZYMA 2HXWA 4GWSA 4PE3A 4F3PA 1YTVA 1GV8A 1FPBA 2P2AA 5EHMA 4YMBA 5CBRA 1B4HA 1M5BA 4DDDA 4GRKA 1FBCA 4RJZA 1RDZA 3I3VA 3QMFA 4LVQA 4RA1A 4POXA 1XC1A 1CE2A 2QPQA 3LSFB 2WYKA 3DLNA 3C9HA 1OVTA 2DWIA 2JJKA 5IM2A 3S9MC 5KZTA 5HM4B 2Y5LA 5I57B 3ZKKA 4F31B 3U65A 3K2DA 2WX9A 3H6WA 1R9QA 3SEXA 1Y1MA 4GFRA 3HCQA 3UIFA 1SYIA 4OFJA 1FQBA 3MSTA 3OO7A 4PETA 4OEVA 1LAXA 1I6QA 4JVDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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