The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RUW A; 4DEX A; 5GJV B; 1I07 A; 4RTZ A; 2DBK A; 4CC4 B; 3EHQ A; 4AFS C; 1T0H A; 1ABQ A; 3UF4 A; 2CUD A; 1QLY A; 1WXT A; 1ZX6 A; 1U3O A; 1GBR A; 1QCF A; 3VS2 A; 5IHK A; 1AD5 A; 2DX1 A; 2FPE A; 2K7A A; 4RTY A; 2HCK A; 3C0C A; 3IQL A; 3H0I A; 2M51 A; 5HCK A; 1ZLM A; 4F14 A; 2DE0 X; 2O9S A; 1K1Z A; 5I11 A; 2HDA A; 2JMA A; 3M0R A; 4IIM A; 3M0P A; 1I0C A; 1NYF A; 4X1V A; 1WXB A; 1UUE A; 1HJD A; 1GFC A; 1K76 A; 1ZBJ A; 4EIK A; 1UJY A; 2ABL A; 3H41 A; 4KRT A; 1W6X A; 2B86 A; 2LJ1 A; 1S1N A; 2EYY A; 2EYZ A; 2KEA A; 1TG0 A; 2LJ0 A; 1W1F A; 3VS0 A; 2EW3 A; 1GCQ C; 2FO0 A; 2P4R A; 4JZ4 A; 1SSH A; 3VS4 A; 2C0O A; 5IHI A; 1T3S A; 4RTU A; 4AG1 C; 3M0T A; 2RQT A; 1H3H A; 5ECA A; 2W0Z A; 5EC7 A; 2HEQ A; 2DIL A; 1UDL A; 2C0I A; 2SRC A; 2RQR A; 2EYW A; 1YWO A; 3RNJ A; 2K2M A; 3SEM A; 2O9V A; 1X69 A; 4A63 B; 1GRI A; 1X27 A; 2VVK A; 4D8K A; 1NM7 A; 1NG2 A; 1PRM C; 2RQU A; 3JV3 A; 2CRE A; 2RPN A; 1WX6 A; 1NLP C; 1WA7 A; 3CQT A; 1UGV A; 2AKL A; 3UA7 A; 1QKW A; 2JXB A; 2M0Y A; 4QT7 A; 1B3Q A; 2EKH A; 2KRO A; 2D0N A; 2DBM A; 2F2X A; 2RNA A; 3I9Q A; 1CKB A; 1M3C A; 1XOV A; 2RQV A; 4RTV A; 2FEI A; 1YWP A; 1H8K A; 1KFZ A; 4F16 A; 1M27 C; 1K0S A; 2OAW A; 2JM9 A; 2DLP A; 3QWX X; 2NUZ A; 1W70 A; 1OPL A; 4HVV A; 3VRY A; 1G83 A; 1IO6 A; 1SHF A; 5IXF A; 1AWX A; 3EG2 A; 2BTT A; 4CC7 A; 3TSZ A; 2CSQ A; 2G6F X; 2PNI A; 3REA B; 2YUQ A; 1T3L A; 4HCK A; 4LN2 A; 2LMJ A; 3NMZ C; 1UHC A; 4J9I A; 1UJ0 A; 1MUZ A; 1JEG A; 2L2P A; 1WYX A; 1U06 A; 1QWE A; 4OMP A; 3I5R A; 4JZ3 A; 3PVL A; 5L23 A; 2VKN A; 2QDL A; 2K9G A; 1WLP B; 4E6R A; 2RQW A; 2FRW A; 1UFF A; 2DNU A; 4OML A; 2GQI A; 4HXJ A; 3VS7 A; 2KR3 A; 4F17 A; 3VS3 A; 1YCS B; 2CUB A; 3I35 A; 3TSW A; 1AEY A; 4RTW A; 1BK2 A; 2DVJ A; 2YUO A; 2K79 A; 1ARK A; 2BZY A; 4JJD A; 1Z9Q A; 2L3Q A; 3PVQ A; 1QKX A; 2OI3 A; 1M3A A; 4Y92 A; 1AZG B; 2LQW A; 2V1Q A; 2K6D A; 4OMQ A; 2O31 A; 2JTE A; 1KIK A; 1K9A A; 1K0X A; 1E7O A; 2DYB A; 1LCK A; 1RLP C; 4GBQ A; 4GLM A; 2FPF A; 3NPF A; 1NEB A; 2JW4 A; 2DF6 A; 3UA6 A; 1UTI A; 5IHN A; 1UEC A; 1YNZ A; 1M30 A; 3FJ5 A; 2O88 A; 2I0N A; 3EHR A; 2KRN A; 2CT4 A; 3ZL7 C; 1G2B A; 1NEG A; 1SRM A; 5FW9 A; 2O2O A; 2L3S A; 3LH5 A; 1X2K A; 2ROL A; 2YT6 A; 2CH4 A; 2JS0 A; 5FWB A; 1HD3 A; 1NYG A; 1KJW A; 2AKK A; 1B07 A; 4J9D A; 1U5S A; 2KRM A; 3GBQ A; 1OOT A; 1OV3 A; 1UG1 A; 1PKS A; 1PKT A; 3VRZ A; 2ED0 A; 1ZUK A; 2KNB B; 2VWF A; 3VS6 A; 2YUN A; 1NLO C; 2DL3 A; 4J9E A; 3A98 A; 1WIE A; 4OMM A; 4K11 A; 2EGA A; 2KE9 A; 4J9C A; 1Y57 A; 3SHW A; 1X2Q A; 4CC2 A; 2CDT A; 2ROT A; 3RBB B; 4Z8A A; 2J06 A; 2EYX A; 1ZUY A; 2EVR A; 2DMO A; 4LUE A; 1M3B A; 2GGR A; 2DA9 A; 1HSQ A; 3M0S A; 4FSS A; 2NWM A; 4IIO A; 4LNP A; 2JM8 A; 2LP5 A; 1OEB A; 2KYB A; 2FG0 A; 2DL8 A; 3NGP A; 1SEM A; 1JQQ A; 1PRL C; 3VS5 A; 1Y0M A; 1YN8 A; 1E6H A; 3EG1 A; 2CSI A; 1M8M A; 1GBQ A; 5IXB A; 2FPD A; 4WCI A; 2SEM A; 2BZX A; 3EG3 A; 2DM1 A; 1TUC A; 4AFU C; 2X3W D; 2GNC A; 2F2W A; 1SRL A; 2JMC A; 2A28 A; 2HSP A; 1YP5 A; 2AZV A; 3EG0 A; 2CT3 A; 3R6N A; 4D8D A; 2E5K A; 1BU1 A; 2IIM A; 4R0K A; 2CH4 W; 2YUP A; 1J3T A; 2K3B A; 4OMO A; 2D8H A; 1RI9 A; 2GBQ A; 1JXM A; 2ESW A; 3EGU A; 2RN8 A; 2KXD A; 1E6G A; 4OMN A; 3H0F A; 2GTJ A; 3THK A; 4RTX A; 2MIO A; 3NHN A; 2KXC A; 2ECZ A; 2KT8 A; 5IH2 A; 1KSW A; 2LCS A; 2ENM A; 3M0Q A; 4Z89 A; 1V1C A; 1AWO A; 1FYN A; 1VA7 A; 2L3P A; 1MV0 B; 1CKA A; 1WXU A; 4DEY A; 1MV3 A; 3M0U A; 5GJW B; 1X6G A; 2DRK A; 2W10 A; 3UAT A; 1PHT A; 1PNJ A; 2ED1 A; 4AG2 C; 2AZS A; 2HBW A; 1SHG A; 4RUG A; 5I22 A; 1AVZ C; 1UHF A; 3REB B; 1ABO A; 2LX7 A; 2MOX A; 1GFD A; 1T0J A; 2EPD A; 3H0H A; 2DL7 A; 2D8J A; 2KT1 A; 4ORZ A; 2L0A A; 2EBP A; 1JO8 A; 2JS2 A; 2FRY A; 3ULR B; 1AWJ A; 4J9F A; 3QWY A; 3O5Z A; 1AWW A; 2H8H A; 2A36 A; 2KRS A; 1JU5 C; 1AOJ A; 2J6F A; 4M4Z A; 3I5S A; 4J9H A; 1GCP A; 2XMF A; 1EFN A; 2YDL A; 2LJ3 A; 4RTT A; 4JJB A; 3TVT A; 1RLQ C; 2DL5 A; 4HVW A; 4AFQ C; 1I1J A; 2A37 A; 2AK5 A; 3PE0 A; 1AZE A; 4ESR A; 1K4U S; 4LE9 A; 5FWC A; 2RF0 A; 4J9G A; 1X6B A; 4LUD A; 1N5Z A; 1QWF A; 3U23 A; 1SPK A; 1FMK A; 2EGC A; 1H92 A; 1OPK A; 1WDX A; 2LNH B; 2KYM A; 1WI7 A; 4ZNX A; 1BB9 A; 2A08 A; 2BZ8 A; 2GTO A; 2F2V A; 2YSQ A; 4J9B A; 1CSK A; 2MCN A; 1VYT A; 1JXO A; 4Z88 A; 1GCQ A; 1UE9 A; 2DL4 A; 1PWT A; 2DRM A; 2V1R A; 2J6O A; 2D1X A; 2X3X D; 2EGE A; 1WFW A; 1TUD A; 3VS1 A; 1A0N B; 2RMO A; 4AFZ C; 3KFV A; 1Z9Z A; 1ZUU A; 1GL5 A; 2JT4 A; 2LQN A; 2J05 A; 2EQI A; 2J6K A; 2DJQ A; 1BBZ A; 4JPB W; 4JJC A; 1VYU A; 1X43 A; 2LZ6 B; 4HVU A; 2J7I A; 2C0T A; 2KGT A; 2PTK A; 2KBT A; 2OJ2 A; 1ZSG A; 1VYV A; 4CC3 A; 2PZ1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4N0A C; 3HTR A; 4CC4 B; 3CCJ Q; 5AT1 B; 3CCE T; 2HQH A; 1U3O A; 1GBR A; 1NPR A; 1AD5 A; 1OZ2 A; 3GNG A; 4M78 C; 4KT0 E; 2GCX A; 3CBM A; 1Q7Y C; 3IQL A; 1YJ9 Q; 2M51 A; 2EJF A; 3FDR A; 5LJ5 e; 1ACM B; 2E5Q A; 4DBQ A; 2DE0 X; 2DD4 A; 1N8R U; 1OUL A; 3VUZ A; 3CC7 A; 2MK5 A; 7AT1 B; 2HDA A; 4C0Z A; 5GAN j; 3M0R A; 5KE2 A; 1VQ5 A; 1NYF A; 3CCJ T; 1UUE A; 1GFC A; 2DEU A; 3CCL Q; 4FYW B; 1D1A A; 1Q95 G; 3RUX A; 1W6X A; 2EYZ A; 2EIF A; 2ZPE B; 3JCM b; 3AHU A; 3OQ5 A; 3VS0 A; 2A3L A; 2FO0 A; 4J83 A; 3VU3 C; 1I81 A; 5FU7 B; 3VS4 A; 5IHI A; 3BDL A; 5AYF A; 4RTU A; 2PVG B; 2XDB A; 3E19 A; 3M0T A; 2RQT A; 1XJW B; 2A7Y A; 5ECA A; 1WJQ A; 2DIL A; 1VQ7 T; 1TSF A; 4LDV A; 3CCL T; 2SRC A; 3V8L A; 1YWO A; 3OYE A; 1N8R R; 3QZ5 B; 1X69 A; 1S72 Q; 1SF9 A; 4A63 B; 2HMA A; 1B34 B; 1X27 A; 1KHC A; 1NM7 A; 1PRM C; 3JCM d; 1WX6 A; 1NLP C; 8AT1 B; 5CQY A; 5DLQ E; 2E12 A; 2P0Q A; 2AKL A; 2RHI A; 2K3Y A; 1UGR B; 1QKW A; 3CCE A; 5GAO p; 2JXB A; 3MEU A; 4C5I A; 4QT7 A; 1B3Q A; 2JZ2 A; 2EKH A; 3OYC A; 1D0Z A; 4M75 C; 3CXC A; 1XOV A; 4RTV A; 2RJD A; 4J7F A; 2FEI A; 3L2R A; 1YWP A; 1MMN A; 1OI1 A; 1N9R A; 1M27 C; 4M7D C; 2JM9 A; 5KYY B; 2RM4 A; 1LPL A; 3MEV A; 1IO6 A; 4JUV A; 1ZHI A; 5IXF A; 3CCJ A; 2E6N A; 1WHL A; 2RA2 A; 4ZTJ A; 1UHC A; 3E1S A; 4A4H A; 3O8V A; 2DYI A; 1OU8 A; 2L2P A; 1NJI R; 1FX7 A; 1WHG A; 3WXM B; 3NTH A; 1YIT Q; 2P4T A; 3I5R A; 5CO7 A; 3QZ9 B; 2HNI A; 1OX8 A; 3OYG A; 1BCM A; 3EG9 B; 4OGC A; 3C95 A; 5GAN 6; 4BI4 A; 2DD5 A; 2E10 A; 2DNU A; 1YCS B; 1VIF A; 1VQ7 A; 3CCL A; 5DY9 A; 1BK2 A; 5GAM f; 4BI3 A; 1AT1 B; 2QQB A; 3EGD B; 2P0P A; 2L8D A; 2K79 A; 1RAB B; 1YI2 Q; 2XHC A; 1GXI E; 3QKJ A; 3P8H A; 5GAM h; 1YIT T; 1AZG B; 3UDC A; 3WVE B; 1BIA A; 2JTE A; 3X28 B; 3E9G A; 3JCM W; 5LJ3 g; 2EJ9 A; 3T9N A; 1E7O A; 4V2S A; 3S3N A; 4GBQ A; 2FPF A; 3NPF A; 4L5G A; 1NEB A; 4HT8 A; 3E9F A; 1D0Y A; 4II1 A; 1UTI A; 1UEC A; 1VUB A; 3QII A; 3EHR A; 2CT4 A; 3ZL7 C; 1NEG A; 1SRM A; 4OB1 B; 2LT4 A; 5FW9 A; 3G6E Q; 3LH5 A; 1D1C A; 2ROL A; 4LDY A; 4M78 D; 1X75 C; 4M78 G; 1NYG A; 4O6J A; 1B07 A; 3GBQ A; 1P92 A; 1OV3 A; 1ZSZ B; 1PKT A; 4C8Q A; 2ED0 A; 2DL3 A; 1WIE A; 3H8Z A; 4J9C A; 4C92 C; 3L2V A; 4CC2 A; 2CDT A; 3MO8 A; 1PM3 A; 2PVD B; 3CPF A; 2Y4Y A; 5LJ3 f; 3G6E T; 4D6W A; 2EVR A; 2KY9 A; 1VQO Q; 2DA9 A; 4MDX A; 3QHS A; 5LJ3 h; 3LW5 E; 1JJ2 P; 2LP5 A; 1OEB A; 2HSE B; 1YHQ T; 1JQQ A; 2LCL A; 5FU6 C; 3CC4 T; 1LOJ A; 2BUD A; 4RKU E; 1YN8 A; 2EWN A; 1M8M A; 4XAX B; 2O4X B; 2BZX A; 2OX7 A; 4M77 D; 1M2V B; 2DM1 A; 3M56 A; 2MMP A; 1R0B G; 1YIT A; 2X3W D; 3OYD A; 2F2W A; 1VQO T; 2YRC A; 5GMK j; 2AZV A; 3EG0 A; 2CT3 A; 3R6N A; 3MEA A; 3M4Y A; 2YUP A; 1N27 A; 2X4Y A; 2E64 A; 3WVD B; 4OMN A; 3S6W A; 2GTJ A; 4RTX A; 2MIO A; 2ECZ A; 4PJO B; 2LCS A; 4RCC A; 2ENM A; 1VQK Q; 4A4K A; 3LWH A; 3QYG B; 3URG A; 1M90 C; 1QVF P; 1V1C A; 2XU8 A; 2V8K A; 4M75 G; 1MV0 B; 1OYX A; 1MV3 A; 4LD6 A; 5KE3 A; 1RL2 A; 3M0U A; 1X6G A; 4M7D G; 5CKE A; 1PHT A; 3VYG A; 4AG2 C; 2HBW A; 4ME7 A; 4QVD A; 4M78 E; 3C4S A; 1C0M A; 2VAS A; 4B9X A; 3ZFJ A; 3REB B; 1UGQ B; 2K5F A; 1H3Z A; 3G6E A; 2EPD A; 3H0H A; 5KYW A; 1VQK T; 2EFI A; 3SWN A; 2ZPF B; 2D8J A; 4KUL A; 3BY7 A; 2ATC B; 5C0M A; 1WHJ A; 1YHQ A; 3G71 T; 3QWY A; 1M5Q 1; 3UWN A; 3X24 B; 2M16 A; 1M8V A; 2A36 A; 1VQ6 T; 3M9Q A; 2DVE A; 3CC4 A; 2J6F A; 4M4Z A; 4X9C A; 5IN1 A; 4FIB A; 2YDL A; 4RTT A; 1WPY A; 2RK1 A; 2XID A; 4JJB A; 1YJW T; 4GY5 A; 4XU0 A; 1VQO A; 3P8B B; 1RLQ C; 3AT1 B; 1QW1 A; 3L2Q A; 3INZ A; 4LUD A; 4FM4 B; 2F5T X; 4C0G A; 1LVK A; 4IUR A; 3DLM A; 1KQS P; 2EGC A; 1QQJ A; 4PKC C; 1OPK A; 1ZA1 B; 4GLK A; 4EDU A; 4B9W A; 1WI7 A; 5FRM A; 4PJO F; 3FRN A; 4ZNX A; 4M7A C; 2A08 A; 2JNG A; 1TWB A; 2DTH A; 4XTU A; 4TVR A; 1W4S A; 2F2V A; 2MCN A; 2PUK B; 3Q1J A; 3OBW A; 2HZY A; 5LJ5 d; 1WFW A; 4ANJ A; 3JCM f; 1LJO A; 5EG2 A; 3QDR B; 5GAM d; 4M75 E; 3ER0 A; 5GAN 3; 1ZUU A; 3JCM h; 3GLX A; 2EQI A; 2J6K A; 4JPB W; 1VQK A; 1EX4 A; 4PFZ A; 4MZP A; 4EMK B; 1VYU A; 4C92 G; 1VQN T; 4HVU A; 1I5L A; 4M7D E; 2QXF A; 2KBT A; 2FYK A; 4CC3 A; 3G71 A; 1PD0 A; 1RUW A; 1IHW A; 2RI5 A; 1VQ6 A; 4F04 B; 3LX7 A; 3JB9 D; 2HD0 A; 3FLG A; 3JB9 G; 1BI3 A; 3RKY A; 3CCU Q; 4OGE A; 3V7S A; 1JJ2 A; 2CP2 A; 2FPE A; 4NL2 A; 4RTY A; 4X34 A; 2HCK A; 5CIU A; 1YJW A; 3CME Q; 1SSF A; 4PLL A; 5HCK A; 1M1F A; 2E41 A; 3FIF A; 4A4E A; 2O9S A; 1JJ2 S; 1KHI A; 1TU0 B; 4IIM A; 2JOY A; 3M0P A; 1VQ8 T; 1HJD A; 1ZBJ A; 3CCU T; 2ZGW A; 4N0A A; 2AIR B; 1R8O B; 3A8G B; 2RHY A; 3VKI A; 1BIB A; 1OZ3 A; 4M7A F; 2HAX A; 5D6W A; 2KVQ G; 1WHM A; 1K9M C; 2ZPI B; 3OMC A; 3CCQ Q; 2C0O A; 1Q7Y U; 2NUT B; 4FT2 A; 4FL6 A; 4AG1 C; 5KYX B; 1QVF A; 5EC7 A; 2C0I A; 4C8Q D; 2MWP A; 2QGG A; 4C8Q G; 3OS0 A; 2EYW A; 1WQW A; 2RH2 A; 2FZK B; 3RNJ A; 2QQ9 A; 1Q82 U; 1QVF S; 1VQN A; 3X26 B; 2H3E B; 3OW2 P; 2P0K A; 1JBM A; 2CRE A; 2RPN A; 1FXX A; 4MZM A; 3CCQ T; 1WA7 A; 1O9S A; 4IUU A; 3M58 A; 2G3R A; 3M5A A; 3FC3 A; 2JN0 A; 2D0N A; 2DBM A; 2F2X A; 2RNA A; 4N4H A; 5LJ3 j; 2CP0 A; 2PVO B; 2GFA A; 2RQV A; 1Q7Y R; 2KDS A; 2E3I A; 3M53 A; 3EAE A; 1H8K A; 1KFZ A; 1XNI A; 1IXD A; 2OAW A; 3QXE B; 4BUG A; 4MZT A; 2DLP A; 4LDU A; 4A53 A; 2NUZ A; 1OPL A; 4HVV A; 3VRY A; 3QO3 A; 1SHF A; 3EG2 A; 2CYZ B; 4HA8 A; 2BTT A; 4CC7 A; 3SFM A; 1VQ8 A; 2CZ0 B; 1MNE A; 3REA B; 3CCU A; 5J26 A; 4XTX A; 1Y07 A; 4LN2 A; 3MET A; 3GIB A; 1KQS A; 1QWE A; 4JZ3 A; 5L23 A; 4F7U F; 2KQW A; 2XDD A; 4A4F A; 4LDX A; 1D3B B; 1WLP B; 4E6R A; 3TU4 K; 4C5H A; 4M75 A; 2RQW A; 2O01 E; 1UFF A; 4OML A; 4HXJ A; 1KQS S; 2KR3 A; 1V76 A; 2DTO A; 4F17 A; 3EFO B; 1I4K 1; 4M7D A; 3I35 A; 3QBY A; 1AEY A; 4DBH A; 2GQV A; 4JJD A; 4XU1 A; 1Q82 C; 3ZEH A; 1Z9Q A; 3EH1 A; 2LQW A; 4VUB A; 2V1Q A; 3RMS A; 2K6D A; 2IG0 A; 1VQ4 Q; 3CCQ A; 3M57 A; 2A0F B; 4C8Q E; 3PMT A; 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