The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
b'GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VRZ A; 5ECA A; 1VYT A; 2L2P A; 4OMO A; 2MOX A; 3VS3 A; 1UTI A; 5FW9 A; 1K0X A; 1AZG B; 2RQU A; 4JJC A; 2DJQ A; 3PVQ A; 5I11 A; 1SPK A; 2O9S A; 2DE0 X; 2ABL A; 2YDL A; 1SHG A; 4JZ3 A; 2P4R A; 2CUD A; 1NEB A; 5GJV B; 2KEA A; 1I1J A; 4RTZ A; 1PKT A; 1QWF A; 1RI9 A; 2DL7 A; 1ZSG A; 1JXO A; 1SHF A; 3GBQ A; 2DYB A; 1GFC A; 1WDX A; 4DEY A; 2EPD A; 1Z9Q A; 2J6K A; 4ESR A; 5IHK A; 4AFZ C; 3M0T A; 3PVL A; 2D8H A; 4IIM A; 1HJD A; 1BBZ A; 1GFD A; 1GRI A; 2C0O A; 1QKX A; 1TUD A; 3R6N A; 1E6G A; 2DVJ A; 1LCK A; 1PHT A; 4JZ4 A; 1W1F A; 4RTW A; 2J6O A; 1WLP B; 2OJ2 A; 3M0R A; 1OV3 A; 1QCF A; 2OAW A; 2KE9 A; 2J6F A; 4J9H A; 1U06 A; 1SRL A; 4WCI A; 2ED1 A; 2HEQ A; 1GBR A; 2EQI A; 2GQI A; 2RNA A; 3SHW A; 1SRM A; 2PZ1 A; 1RLP C; 2DL4 A; 4JJB A; 2K7A A; 2AKL A; 5HCK A; 1JEG A; 5IHI A; 3H0I A; 2KR3 A; 2ECZ A; 2ROT A; 1AWO A; 3O5Z A; 4HVU A; 2LCS A; 4RTX A; 2GBQ A; 2RN8 A; 3M0Q A; 1Z9Z A; 3NHN A; 4RTV A; 2LNH B; 1AWJ A; 2KYM A; 2DLP A; 2H8H A; 2K79 A; 4EIK A; 1VYV A; 4OMP A; 4A63 B; 2ENM A; 2RMO A; 1BB9 A; 2VVK A; 5EC7 A; 2ROL A; 2DA9 A; 5IH2 A; 2KGT A; 1GCQ A; 1GCQ C; 1JQQ A; 2VKN A; 1CSK A; 1UEC A; 4F16 A; 3M0S A; 2AZV A; 1KJW A; 4J9B A; 4QT7 A; 4RTU A; 2BZ8 A; 1AVZ C; 4LNP A; 1VA7 A; 3VS7 A; 1YWP A; 2K3B A; 3I35 A; 1JO8 A; 4K11 A; 1QKW A; 1U3O A; 4GLM A; 4J9E A; 2B86 A; 1M8M A; 4OMM A; 2DMO A; 1X27 A; 2KT8 A; 1NYF A; 3CQT A; 2GNC A; 2FPF A; 3VS6 A; 1V1C A; 1K9A A; 5IXF A; 2AZS A; 1YNZ A; 1WXU A; 5IHN A; 1T0H A; 2DRK A; 1OPK A; 3A98 A; 1W6X A; 2NUZ A; 2YT6 A; 1M27 C; 1NG2 A; 2GTO A; 3THK A; 2O2O A; 2MCN A; 4Z89 A; 1GBQ A; 1E6H A; 3PE0 A; 3VRY A; 1NLO C; 1M3A A; 2JT4 A; 1WA7 A; 2J05 A; 1AOJ A; 2KRS A; 2X3W D; 4Z8A A; 1PRM C; 2CSI A; 2EGA A; 1S1N A; 4JPB W; 1PWT A; 2BTT A; 2V1R A; 1ZX6 A; 2JMA A; 3ULR B; 1YP5 A; 3RBB B; 2DM1 A; 2K6D A; 2JTE A; 4LUE A; 4M4Z A; 1WI7 A; 1WFW A; 2FPD A; 2V1Q A; 2X3X D; 1CKB A; 2RQR A; 3C0C A; 2FPE A; 4LE9 A; 1GL5 A; 3I5S A; 3EG3 A; 4X1V A; 1NYG A; 2JM9 A; 4CC7 A; 1NM7 A; 2CRE A; 4J9I A; 1E7O A; 1ZLM A; 2RPN A; 2VWF A; 1T3L A; 2G6F X; 1A0N B; 2JM8 A; 1UJY A; 1X2K A; 3VS5 A; 2BZX A; 1Y57 A; 2CH4 W; 1AD5 A; 2RQW A; 2IIM A; 2J7I A; 4OML A; 2W0Z A; 2EYW A; 1NLP C; 2D1X A; 3FJ5 A; 2SRC A; 1YWO A; 2KNB B; 2F2V A; 2L0A A; 3NMZ C; 1WXB A; 1UFF A; 2LMJ A; 2M51 A; 1H92 A; 4AFU C; 1K1Z A; 2L3Q A; 2YUP A; 1ZBJ A; 4OMQ A; 2DX1 A; 3NGP A; 3IQL A; 1M3C A; 2AK5 A; 3VS2 A; 1BK2 A; 2KYB A; 3REB B; 4RTY A; 1K4U S; 5FWC A; 3NPF A; 1FYN A; 1HD3 A; 4D8K A; 1PNJ A; 1UDL A; 2CSQ A; 4ZNX A; 2YUQ A; 2DF6 A; 3EHQ A; 1N5Z A; 1G83 A; 2KRM A; 2LJ1 A; 4E6R A; 2ESW A; 1OEB A; 2LJ0 A; 3EG1 A; 2EBP A; 2KRO A; 2NWM A; 2EYZ A; 2EGC A; 4HVW A; 2HSP A; 1AEY A; 1X69 A; 1IO6 A; 1ABO A; 1H8K A; 2FG0 A; 3H41 A; 1GCP A; 3UF4 A; 1Y0M A; 1K76 A; 3VS4 A; 2RQV A; 2OI3 A; 1KIK A; 1W70 A; 4KRT A; 2D8J A; 1UG1 A; 1JXM A; 4J9G A; 4HVV A; 1SEM A; 1UUE A; 2KBT A; 3QWX X; 2KXC A; 2YSQ A; 2HDA A; 2YUN A; 2LP5 A; 2L3P A; 2CT4 A; 3QWY A; 2JW4 A; 2XMF A; 3I5R A; 1H3H A; 3ZL7 C; 4JJD A; 4D8D A; 4Z88 A; 2F2W A; 2CH4 A; 2LQW A; 2EVR A; 1UGV A; 5IXB A; 4OMN A; 2F2X A; 2KRN A; 2LQN A; 2HCK A; 4R0K A; 2JS0 A; 4F14 A; 1ABQ A; 1T0J A; 1K0S A; 2FO0 A; 1UJ0 A; 1I07 A; 1ZUY A; 1MV0 B; 1MV3 A; 2FRW A; 2LX7 A; 3UAT A; 1UE9 A; 2O31 A; 1ZUK A; 2QDL A; 4DEX A; 2DL3 A; 4AFS C; 4IIO A; 3SEM A; 3U23 A; 2D0N A; 3I9Q A; 5L23 A; 1X6B A; 1SSH A; 2K9G A; 3TSZ A; 2C0I A; 2YUO A; 1KSW A; 4J9C A; 4Y92 A; 3EHR A; 4RTT A; 4AG1 C; 2KT1 A; 1NEG A; 2A37 A; 3EGU A; 5GJW B; 4FSS A; 4HCK A; 1CKA A; 1OOT A; 1EFN A; 2EW3 A; 1YCS B; 3REA B; 2MIO A; 1B07 A; 1PKS A; 1XOV A; 2DRM A; 4LUD A; 2LJ3 A; 2DBM A; 5FWB A; 1G2B A; 2CDT A; 1HSQ A; 2ED0 A; 2DL5 A; 1TUC A; 1AWX A; 4HXJ A; 1T3S A; 2JMC A; 1X6G A; 1VYU A; 2M0Y A; 2A28 A; 2EGE A; 2BZY A; 4F17 A; 2CUB A; 2E5K A; 2L3S A; 1PRL C; 2JS2 A; 4AG2 C; 2GGR A; 1X43 A; 2DIL A; 2DL8 A; 1WYX A; 4RUG A; 2GTJ A; 2KXD A; 3VS1 A; 2EYY A; 1QWE A; 2C0T A; 2AKK A; 1U5S A; 1JU5 C; 1WIE A; 4LN2 A; 4ORZ A; 4AFQ C; 3TSW A; 3UA6 A; 1X2Q A; 2CT3 A; 2HBW A; 1B3Q A; 1AZE A; 1OPL A; 3JV3 A; 1WXT A; 5I22 A; 4CC2 A; 1UHF A; 2J06 A; 2PTK A; 3H0F A; 1MUZ A; 2DNU A; 2LZ6 B; 3KFV A; 2O9V A; 3M0U A; 1QLY A; 4CC4 B; 1M3B A; 3EG2 A; 3VS0 A; 1YN8 A; 2EYX A; 4J9D A; 2O88 A; 2K2M A; 2PNI A; 4J9F A; 4CC3 A; 2DBK A; 1UHC A; 1AWW A; 2JXB A; 3TVT A; 3RNJ A; 1J3T A; 1KFZ A; 1WX6 A; 2FRY A; 3UA7 A; 3H0H A; 2EKH A; 3M0P A; 2I0N A; 1TG0 A; 1FMK A; 2W10 A; 2SEM A; 4GBQ A; 2FEI A; 3EG0 A; 1RUW A; 1ARK A; 1M30 A; 1BU1 A; 3LH5 A; 2A36 A; 2RF0 A; 2RQT A; 1RLQ C; 1ZUU A; 1I0C A; 2A08 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VRZ A; 1C1A A; 4OMO A; 2MOX A; 1K0X A; 1AZG B; 1Q81 U; 2DJQ A; 2JN0 A; 3KXT A; 3LX7 A; 4PFZ A; 3NTK A; 1SHG A; 1VQN Q; 4JZ3 A; 2P4R A; 1D0X A; 1XTD A; 3CEY A; 3OS1 A; 3QO3 A; 5DLO A; 2EFI A; 3CBM A; 1VQ9 T; 1OUL A; 1QWF A; 5DLQ E; 3MEU A; 5CCA A; 1IGU A; 1JXO A; 3BFM A; 1GFC A; 1WDX A; 2EPD A; 1Q7Y U; 4KH1 B; 5IHK A; 4AFZ C; 3PVL A; 5M9O A; 5KYN A; 5KYW A; 2C0O A; 4IUU A; 2DVJ A; 3FC3 A; 2CZ0 B; 3EGD B; 3QZ5 B; 5IAY A; 1PHT A; 1F1B B; 1W1F A; 4RTW A; 1MNE A; 2J6O A; 3C4S A; 2OTJ Q; 2NYS A; 4A4G A; 2R5M A; 1K73 C; 1Y96 B; 2K5F A; 1YHQ Q; 5GAM f; 3TU4 K; 2R57 A; 4WCI A; 1VQ8 T; 3J7A F; 1KHI A; 4EMG A; 4DBQ A; 2E41 A; 2RNA A; 1NJI U; 2X4J A; 1SRM A; 2DL4 A; 4L6V 5; 2K7A A; 4A4H A; 1MMN A; 5GAN 7; 3FB9 A; 3RER A; 3QXE B; 4KGX B; 3DB4 A; 2KR3 A; 3C94 A; 3DKM A; 3O5Z A; 4DA4 A; 3CXC A; 1M90 C; 1PM3 A; 1KQ2 A; 1WQ7 A; 3CC7 A; 4M75 B; 3UT1 A; 4RTV A; 3A8H B; 4BDZ A; 4J6X A; 1D1C A; 2DET A; 5GAN 5; 2KYM A; 5GMK m; 4FT4 A; 4IUQ A; 4OMP A; 3X25 B; 2HKQ B; 4DBR A; 2DAQ A; 2RMO A; 3CBO A; 5EC7 A; 2ROL A; 2MF2 A; 1GCQ A; 3LWI A; 5FRN A; 4F16 A; 2CP5 A; 2AZV A; 1KJW A; 4QT7 A; 3RMQ A; 2VYT A; 3PMT A; 2E4H A; 2K3B A; 4K11 A; 1U3O A; 2K4Y A; 3BDL A; 4PK4 A; 3G71 A; 2DMO A; 3VKI A; 1VQ6 A; 2FPF A; 5KYY B; 1V1C A; 2LT4 A; 2AZS A; 4C92 A; 3G1J A; 3A98 A; 3CXC S; 3QUI A; 3JCM P; 4C8Q A; 2QK0 A; 1NG2 A; 2CP2 A; 3THK A; 1XQH A; 3NTI A; 5D7U A; 3ZEH A; 3VRY A; 1NLO C; 1M3A A; 2WSE E; 4FYX B; 4Z8A A; 2EGA A; 2HMA A; 1M8V A; 2KSS A; 1PWT A; 3I56 A; 2BE7 D; 5GMK j; 4M75 E; 5FRM A; 2CGH A; 2X4Y A; 3INZ A; 3L1A A; 2JMA A; 2PVD B; 4MML A; 3RKY A; 1K8A R; 1QCN A; 2FPE A; 4FU6 A; 2XDP A; 4C0F A; 3CC4 A; 1UGQ B; 3HTR A; 1VQL Q; 1Q82 U; 2RHI A; 3HPW A; 3P8D A; 2DD4 A; 1IB8 A; 2QQR A; 3CPW A; 1E7O A; 2NLU A; 3C95 A; 3JCM d; 1Q86 C; 3CCM Q; 3BW1 A; 1A0N B; 2JM8 A; 1MMA A; 1N8R R; 2WAC A; 1AD5 A; 1TXQ A; 4OML A; 3OQ5 A; 2D0Q B; 2E70 A; 2YXY A; 5KYU B; 3CMA A; 4M77 B; 4A4K A; 3HFN A; 2LMJ A; 4PJL A; 3OYH A; 2L3Q A; 3MP8 A; 1ZBJ A; 1BI2 A; 4OMQ A; 2DX1 A; 2VGM A; 2DEQ A; 1WJS A; 4M75 C; 1OU9 A; 3AHU A; 5IT9 E; 2AK5 A; 4JDS A; 1K4U S; 4RTY A; 3OSS C; 1VQ9 Q; 2OTJ A; 3NPF A; 1FYN A; 3OY9 A; 2QQA A; 3R6O A; 1YHQ A; 4QVZ A; 1LOJ A; 1UGS B; 2CSQ A; 1K9M C; 2D9T A; 5GMK i; 4R56 A; 2VC8 A; 5FRO A; 4M7A D; 3LGL A; 3S3O A; 2KRM A; 4F7U A; 3M53 A; 1VIF A; 4E6R A; 2ESW A; 3CPW S; 4L5G A; 1RL2 A; 1RAB B; 5GMK l; 1YJN T; 4FCY A; 3LWH A; 4BE1 A; 1KQS A; 4PJO D; 2LQK A; 4LDV A; 1X69 A; 1IO6 A; 2OTL Q; 5LL6 S; 3H41 A; 3CC7 T; 2QDY B; 5GAO r; 1S72 Q; 5C6S A; 2F5K A; 2EYQ A; 3BE3 A; 1W70 A; 1VQ8 Q; 4J9G A; 4HVV A; 3CCU A; 2L5Q A; 1SEM A; 4ZGJ B; 3PIP A; 4FSX A; 2HDA A; 2YUN A; 2L3P A; 3AT1 B; 4JS4 A; 2MAM A; 3ZL7 C; 2R58 A; 4JJD A; 2AT1 B; 4AMC A; 4Z88 A; 5CO7 A; 3CME A; 2XG8 D; 2EVR A; 5IXB A; 3HRU A; 1VQK Q; 2LQN A; 4M75 F; 4KT0 E; 4M78 A; 4C0D C; 2HCK A; 3EG9 B; 4R0K A; 1OX9 A; 8ATC B; 3OYK A; 1K0S A; 3NTH A; 1MV0 B; 4EMK A; 2ZPI B; 1N6A A; 1KQS S; 3UAT A; 2DL3 A; 4AFS C; 2QA4 T; 2IPO B; 3U23 A; 4OB0 B; 3HP9 A; 1OZ3 A; 4E2F B; 2YHT A; 4J9C A; 4Y92 A; 4RTT A; 1NEG A; 1DJ7 B; 5L8R E; 1C0M A; 5GAO n; 1QVP A; 3OYF A; 3REA B; 1ZHI A; 2A7Y A; 1TH7 A; 2GFU A; 3I56 T; 1B07 A; 2ZPE B; 4XAX B; 4M77 C; 3CC2 A; 1B34 B; 2DL5 A; 5GAN 8; 3H6Z A; 1JBM A; 4PL6 A; 1G5V A; 1T3S A; 2GF7 A; 1KK7 A; 3FJP A; 4NL3 A; 3CC4 T; 2CUB A; 4AG2 C; 4B9X A; 2DIL A; 2YRD A; 4RUG A; 2GTJ A; 2L3R A; 3S3M A; 1Q81 C; 3VS1 A; 3I55 Q; 2EYY A; 2C0T A; 4KGV B; 1VQL A; 2FZG B; 4AFQ C; 4C5I A; 3JCM b; 3CCL T; 1YBY A; 2DTI A; 4X34 A; 1WXT A; 5I22 A; 4N4G A; 2J06 A; 5GMK h; 3CMA T; 1KG1 A; 2EIF A; 1MUZ A; 4AT1 B; 3JAM E; 1BKB A; 1QLY A; 3JCM h; 3EG2 A; 4CC4 B; 3VS0 A; 1SSF A; 1UEB A; 4J9D A; 1YN8 A; 2FB7 A; 2X4W A; 2O88 A; 3JB9 F; 3NFC A; 2PNI A; 3QJ6 A; 2DBK A; 2NUT B; 1GXI E; 5D6X A; 4JRK A; 3RNJ A; 3L2W A; 3UA7 A; 1BCO A; 5CQY A; 1KC8 U; 2I0N A; 3ZFJ A; 3TQ7 P; 2ZGW A; 3EG0 A; 4M77 F; 3JSC A; 1RUW A; 1U8R A; 2DXU A; 4M7D C; 2RF0 A; 4QQD A; 3VYG A; 1N9R A; 4FIB A; 3M4G A; 4C92 D; 5ECA A; 4M77 G; 1D1B A; 1FXX A; 2DTO A; 1RAF B; 1IHV A; 5GAN g; 4ZTF A; 2JTF A; 3PVQ A; 2LCC A; 3JB9 H; 4Y91 A; 2O9S A; 2DE0 X; 2ABL A; 4X9C A; 1LJO A; 2OTL A; 1WZO A; 3MPU B; 2CUD A; 2NUP B; 5GAM e; 1UB4 A; 3CCU T; 1S72 A; 5KYX A; 4Y28 E; 1RI9 A; 2DL7 A; 1YIT A; 3OYE A; 1VQ8 A; 5CIU A; 4DEY A; 2X9H A; 4PJM A; 1YJN Q; 2DIG A; 2DER A; 2E12 A; 3TEE A; 2QQS A; 4ME7 A; 3JCM V; 2LQ8 A; 2RK2 A; 2J6K A; 3V7R A; 4ESR A; 2VB6 A; 3CME T; 1ZQ1 A; 4IIM A; 2C06 A; 1HJD A; 3MET A; 1GRI A; 4N0A C; 3OS2 A; 3R6N A; 1E6G A; 3CC7 Q; 5LJ5 g; 1YCY A; 1WLP B; 1VQK A; 1QCF A; 1KD1 U; 4EPC A; 2LC4 A; 2OAW A; 4J9H A; 2CZ7 B; 1U06 A; 2RHX A; 5DM7 R; 3RKW A; 2M02 A; 1TWB A; 1VOM A; 4DBH A; 3EFR A; 1UGR B; 2YLB A; 4E7S A; 3JCM g; 5GAN 4; 1Q82 R; 3P8B B; 4PNO A; 2EQI A; 4C5E A; 1RLP C; 4M7D G; 2HQH A; 1TUG B; 3PNW C; 5HCK A; 1JEG A; 4PLL A; 3CC2 T; 4MDX A; 3VJP A; 3QBY A; 1AWO A; 2MMP A; 3OS5 A; 2CYZ B; 2KVQ G; 2RN8 A; 1IRX A; 3NHN A; 5CQX A; 2QA4 Q; 4E7H A; 2ZCF B; 2DLP A; 3EAE A; 1G3S A; 2VVK A; 2DA9 A; 1WJR A; 5IH2 A; 2KGT A; 3HL8 A; 3PT9 A; 3MCA B; 1RI0 A; 2CP6 A; 1CSK A; 1UEC A; 2P0K A; 3I56 Q; 4J9B A; 4RTU A; 3I55 A; 2E3H A; 3Q1J A; 4OB2 B; 3VS7 A; 1WPY A; 2H3E B; 4JRQ A; 4BD3 A; 3M9Q A; 3I35 A; 3KUF A; 3GOX A; 2M9U A; 2X35 A; 1QKW A; 4M7A B; 2BUD A; 4BAC A; 1P92 A; 4FW1 A; 2B86 A; 4II1 A; 3CCJ T; 5DY9 A; 1BIB A; 2KT8 A; 8AT1 B; 1VQO A; 3CQT A; 2GNC A; 4PJO B; 3CC4 Q; 5IXF A; 1K9A A; 1ZA1 B; 2XIC A; 4XTX A; 2DO3 A; 3CCS Q; 3QKJ A; 2RH2 A; 1OPK A; 4NOY A; 2NUZ A; 2GTO A; 2F69 A; 2PUO B; 2O2O A; 3TCJ A; 4PLI A; 4LDY A; 4E7Z A; 4M78 D; 3PE0 A; 3L2Q A; 3CCL Q; 1WA7 A; 1AOJ A; 3KBG A; 5AT1 B; 2DTH A; 4FL6 A; 3CMA Q; 1S1N A; 1VQ4 Q; 2BTT A; 1K73 R; 1WJQ A; 1X75 C; 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