The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
b'GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
7
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| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DYB A; 1T3L A; 2JW4 A; 4D8K A; 4EIK A; 1X43 A; 2RMO A; 1B3Q A; 3TSZ A; 3M0Q A; 2ROT A; 4AFS C; 2X3X D; 2EKH A; 2ESW A; 3I35 A; 1ZUY A; 1HD3 A; 2CT3 A; 2RF0 A; 2V1Q A; 4OML A; 1SRL A; 2L2P A; 1QWF A; 4HVV A; 2LP5 A; 1T3S A; 1XOV A; 2O88 A; 4ESR A; 1UTI A; 3VS1 A; 3FJ5 A; 4DEX A; 3PVQ A; 2RPN A; 2RQW A; 2YUQ A; 2ABL A; 3QWX X; 3SEM A; 2L0A A; 2DRM A; 1NM7 A; 3M0U A; 4JPB W; 3EHQ A; 2DBM A; 1JQQ A; 2DL8 A; 2CH4 A; 4KRT A; 1QWE A; 2VKN A; 2YUO A; 2K7A A; 2KXC A; 1AEY A; 1MV3 A; 5IHK A; 3VS3 A; 2D8H A; 2SEM A; 1E6G A; 1K9A A; 1UJ0 A; 1WFW A; 2J6K A; 1W6X A; 2KYM A; 2O9V A; 2DRK A; 2JT4 A; 1WDX A; 2VWF A; 4HVU A; 2LCS A; 2CH4 W; 3REA B; 1WLP B; 1UHC A; 1UG1 A; 3I5R A; 3VS2 A; 1K4U S; 3C0C A; 3ULR B; 2KGT A; 2EPD A; 1VA7 A; 4AFZ C; 4CC2 A; 1PKS A; 1TUC A; 4F16 A; 2A36 A; 1YWO A; 2CSI A; 1HSQ A; 1AD5 A; 2EQI A; 2KRM A; 1FMK A; 2AZS A; 1M3B A; 2RQU A; 2CT4 A; 3NGP A; 2FPE A; 2KEA A; 1UHF A; 3U23 A; 2GTJ A; 3M0P A; 3UAT A; 2RQV A; 1WXB A; 2J7I A; 2BZX A; 2DJQ A; 2KYB A; 2HDA A; 2DIL A; 2YT6 A; 2J06 A; 1M3C A; 1ABQ A; 2GBQ A; 4JZ4 A; 2KBT A; 2GQI A; 2PTK A; 4LE9 A; 2W10 A; 2RN8 A; 2O31 A; 1V1C A; 3H0I A; 4AG1 C; 2FRY A; 1OOT A; 1GRI A; 3UA7 A; 4Z8A A; 1U5S A; 1KFZ A; 1T0H A; 2O9S A; 1JXM A; 4F17 A; 2DX1 A; 2AKK A; 4J9G A; 2KXD A; 2LJ0 A; 4RTT A; 3TVT A; 2L3S A; 1YN8 A; 3R6N A; 2C0T A; 4A63 B; 2FG0 A; 1TG0 A; 2DVJ A; 2LJ1 A; 3EGU A; 2DA9 A; 5GJW B; 1X27 A; 1GL5 A; 2DL4 A; 1K0S A; 5FWB A; 1Y0M A; 2O2O A; 2LZ6 B; 1X69 A; 2DL3 A; 2EGA A; 2ED1 A; 2D8J A; 2G6F X; 1H3H A; 3NPF A; 3RBB B; 3M0S A; 4J9C A; 2GGR A; 2JMC A; 3KFV A; 3LH5 A; 2F2V A; 2KRO A; 2HEQ A; 1JXO A; 2XMF A; 2KE9 A; 2MCN A; 3EG2 A; 1FYN A; 2KNB B; 2KT8 A; 3SHW A; 4CC3 A; 2BZY A; 1SPK A; 1WX6 A; 4J9I A; 3H0F A; 1UE9 A; 2K6D A; 2MOX A; 1UJY A; 2OAW A; 1UDL A; 2J6O A; 3VRZ A; 1LCK A; 1YNZ A; 1PNJ A; 4HXJ A; 5FWC A; 1W1F A; 2K79 A; 2I0N A; 1WYX A; 2HCK A; 4HCK A; 2HBW A; 2V1R A; 2EGE A; 4OMM A; 2FPF A; 1PRL C; 2J05 A; 2OI3 A; 5I11 A; 1AWW A; 2QDL A; 3ZL7 C; 2D0N A; 3VS5 A; 3PVL A; 3VS4 A; 2AKL A; 1N5Z A; 2PNI A; 2E5K A; 2D1X A; 2M0Y A; 2W0Z A; 2X3W D; 3THK A; 3TSW A; 1EFN A; 1YP5 A; 4LNP A; 1K0X A; 3UF4 A; 5I22 A; 5IHN A; 2RNA A; 4X1V A; 4OMO A; 1AWX A; 1QKW A; 1QCF A; 1I0C A; 2L3P A; 2IIM A; 4RTU A; 1AOJ A; 1M3A A; 1OPL A; 1S1N A; 2NUZ A; 3EG3 A; 1NEG A; 2LX7 A; 4ZNX A; 1KIK A; 2LQN A; 2A28 A; 2JM8 A; 1X2Q A; 1CKA A; 1GCP A; 1OV3 A; 1AZG B; 2DL7 A; 1U06 A; 2BZ8 A; 1RLP C; 2VVK A; 4R0K A; 3RNJ A; 1K76 A; 2LJ3 A; 1K1Z A; 1TUD A; 2M51 A; 1G83 A; 2EYX A; 3H41 A; 2KRS A; 1ABO A; 3NMZ C; 5IH2 A; 3CQT A; 1H8K A; 3GBQ A; 4K11 A; 1T0J A; 1MUZ A; 1VYU A; 2MIO A; 3QWY A; 1OEB A; 5IXB A; 1MV0 B; 1ZX6 A; 2BTT A; 2RQR A; 2GTO A; 4CC7 A; 2RQT A; 2AK5 A; 1M30 A; 3PE0 A; 4E6R A; 1BBZ A; 4LN2 A; 4Z88 A; 1B07 A; 5ECA A; 1E7O A; 1KSW A; 2JXB A; 2ECZ A; 3M0T A; 2YDL A; 1OPK A; 2NWM A; 3IQL A; 1BB9 A; 1ZUU A; 2CUD A; 2A08 A; 4FSS A; 1BU1 A; 3EG0 A; 1QLY A; 1NLP C; 2DLP A; 2DM1 A; 4CC4 B; 4AFQ C; 1UGV A; 1YCS B; 1WIE A; 4ORZ A; 2FEI A; 1JEG A; 4GBQ A; 5HCK A; 4IIO A; 1U3O A; 1VYV A; 1ZSG A; 1PWT A; 1WXT A; 4J9E A; 1RLQ C; 2JTE A; 2K9G A; 3A98 A; 1CKB A; 4RTY A; 2EYW A; 4JJC A; 2C0I A; 1X6B A; 1AVZ C; 2OJ2 A; 1RI9 A; 4D8D A; 1YWP A; 2DF6 A; 1E6H A; 1JU5 C; 1ZLM A; 2FRW A; 1SSH A; 4J9H A; 4GLM A; 1WI7 A; 3EHR A; 2LMJ A; 2DL5 A; 1SRM A; 1H92 A; 3EG1 A; 2ED0 A; 2KT1 A; 5EC7 A; 1GFD A; 3UA6 A; 1VYT A; 1NG2 A; 1ARK A; 3REB B; 4AG2 C; 2J6F A; 2EYY A; 4J9B A; 1W70 A; 3NHN A; 1GCQ C; 1X6G A; 3O5Z A; 1WA7 A; 2EGC A; 1A0N B; 1HJD A; 1RUW A; 1NYG A; 2F2X A; 2B86 A; 1WXU A; 2JS2 A; 4RTZ A; 1GBQ A; 4Y92 A; 2C0O A; 1GFC A; 3I9Q A; 1I1J A; 2JS0 A; 2EYZ A; 1BK2 A; 1M27 C; 2CRE A; 2YUN A; 4OMQ A; 1I07 A; 5GJV B; 4AFU C; 5L23 A; 4J9F A; 4JJB A; 2CDT A; 3VRY A; 1PHT A; 1PRM C; 2EW3 A; 2KRN A; 3H0H A; 2P4R A; 4QT7 A; 4LUD A; 2DNU A; 2ENM A; 2KR3 A; 3I5S A; 1J3T A; 1G2B A; 2LNH B; 4RTW A; 4RTV A; 2H8H A; 2JM9 A; 4F14 A; 1SHG A; 2FO0 A; 4IIM A; 1UFF A; 1ZBJ A; 2FPD A; 1NEB A; 3M0R A; 4J9D A; 1M8M A; 1PKT A; 2EVR A; 2EBP A; 1SHF A; 1AWO A; 1Z9Z A; 4HVW A; 1Z9Q A; 2CUB A; 1AZE A; 1QKX A; 1IO6 A; 1X2K A; 3VS7 A; 2LQW A; 1GBR A; 4M4Z A; 1JO8 A; 5IHI A; 2YUP A; 1AWJ A; 2DMO A; 1UEC A; 2ROL A; 4JZ3 A; 2PZ1 A; 2AZV A; 2SRC A; 2JMA A; 1Y57 A; 1KJW A; 2K3B A; 2K2M A; 1UUE A; 2DBK A; 4OMP A; 2DE0 X; 2L3Q A; 1ZUK A; 2YSQ A; 1CSK A; 1GCQ A; 2F2W A; 4LUE A; 5IXF A; 4Z89 A; 2HSP A; 1NYF A; 3JV3 A; 4OMN A; 3VS0 A; 4WCI A; 4RTX A; 4JJD A; 1SEM A; 4RUG A; 3VS6 A; 2A37 A; 2GNC A; 2CSQ A; 5FW9 A; 4DEY A; 1NLO C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KQS S; 3QJ6 A; 4MZM A; 5GAN 2; 4EIK A; 5GAN h; 3TSZ A; 1NBE B; 2OTJ Q; 4DBH A; 3M0Q A; 2AHJ B; 4PJO D; 4FM4 B; 2QGG A; 2CT3 A; 4OML A; 3SD4 A; 1WQW A; 2DD4 A; 2L2P A; 3A1P A; 3CC7 Q; 1PM3 A; 1M90 U; 1XOV A; 1TTH B; 3J7A F; 5GAM h; 2MI6 A; 4OB0 B; 2YUQ A; 2ABL A; 1NPP A; 3SEM A; 2E64 A; 1Y71 A; 1PG5 B; 4BI3 A; 4JJN K; 4KRT A; 1QWE A; 3UT1 A; 2DPP B; 4IUT A; 1TU0 B; 4BD3 A; 1SG5 A; 5GAM g; 2RHZ A; 4IUP A; 1W6X A; 4MDW A; 2V8K A; 4E7H A; 3CCJ Q; 3JB9 H; 2DEU A; 2P84 A; 2DRK A; 2JT4 A; 2VWF A; 4JDS A; 2ZPB B; 1QP2 A; 1RI0 A; 2X9H A; 2Z0W A; 2YRD A; 1KD1 U; 2EPD A; 1VA7 A; 2PUO B; 3CCE A; 2E3I A; 3OYD A; 1YWO A; 4ANJ A; 2CSI A; 3RDV A; 2RHY A; 2QEX T; 3AHU A; 2FHD A; 3E2U A; 3BW1 A; 3H9N A; 1V76 A; 2CT4 A; 3MP1 A; 3UAT A; 3OYB A; 3OS5 A; 1KQ2 A; 1C1A A; 4PJO G; 1IRE B; 2EJF A; 1JJ2 S; 3QUI A; 2DTO A; 2DIL A; 1D0Z A; 2ZPG B; 4M7A C; 2KBT A; 2QAZ A; 2CP7 A; 2YHT A; 2X4X A; 1N8R R; 3H0I A; 1VQM Q; 3RKW A; 1OOT A; 2GF7 A; 5HK3 A; 2E5Q A; 1LPL A; 2O9S A; 1XQH A; 2DX1 A; 3OYN A; 4KUD K; 3JCM c; 3G6E A; 5GAN 7; 3HTR A; 3I56 Q; 3EH1 A; 4QQD A; 2YRC A; 2M02 A; 4PJN A; 4GY5 A; 4A63 B; 4C92 D; 2GFU A; 4M78 F; 1AHJ B; 1ZA2 B; 2DA9 A; 3HRS A; 1X27 A; 1HK9 A; 1GL5 A; 2DL4 A; 3S3M A; 1K0S A; 2YLC A; 4M75 C; 2EGA A; 5C6S A; 2MPX C; 3WXM B; 2FYK A; 1YIJ T; 4JS4 A; 5GMK h; 3NPF A; 4N4I A; 2GGR A; 2JMC A; 3WVD B; 3FC3 A; 1JXO A; 1WGS A; 3JCM P; 3CC4 Q; 1W4S A; 3OS2 A; 2XDB A; 2KNB B; 3SHW A; 4BE0 A; 2XU8 A; 1SPK A; 3JRZ A; 5D6X A; 3JB9 F; 1RAF B; 3QYG B; 4KBM B; 4A4H A; 2K6D A; 2MOX A; 1H64 1; 2OAW A; 1JBM A; 3VRZ A; 1YNZ A; 3SWN A; 1VQP Q; 4E47 A; 5FWC A; 4HCZ A; 2K79 A; 2I0N A; 5CIU A; 4II1 A; 3P8H A; 2K57 A; 3EG9 A; 5LJ3 h; 2FPF A; 4A4F A; 2J05 A; 2CZ7 B; 3ASK A; 2HL5 C; 1D09 B; 3HRT A; 4ZGJ B; 3VS5 A; 3VS4 A; 4XTU A; 1N5Z A; 3R6O A; 2E5K A; 1FXX A; 4KGZ B; 3PNW C; 4NS5 A; 3MP8 A; 4C0G A; 1WNL A; 4LNP A; 5I22 A; 1N8R U; 3CBM A; 1KC8 U; 4M77 F; 4C92 G; 1QCF A; 5LJ3 g; 1BIA A; 1M9S A; 3RKY A; 4MDX A; 1TOV A; 2L3P A; 2DKG A; 3CPF A; 1M3A A; 3OMG A; 3CEY A; 1TXQ A; 2WSF E; 4M7D F; 4ZNX A; 5LJ5 d; 3I55 A; 4PNO A; 2A28 A; 2IG0 A; 2XK0 A; 1CKA A; 4KGX B; 3QG1 A; 2LVM A; 3KXT A; 4C8Q A; 4R0K A; 1G3Y A; 2QA4 T; 1K76 A; 1K1Z A; 1TUD A; 2M51 A; 3MKD A; 1Q95 G; 5LJ5 j; 8AT1 B; 5CKD A; 3H8Z A; 5CKF A; 3C4S A; 4MML A; 3GBQ A; 1MUZ A; 1YI2 A; 1VYU A; 3QWY A; 3MEA A; 1ZX6 A; 2ZAE A; 3PFS A; 2VB6 A; 5KYY A; 2QQB A; 1M30 A; 1LNX A; 1YHQ T; 2LQK A; 1IB8 A; 4ZN3 A; 4NL2 A; 1PSF A; 4OVA A; 2FZC B; 1D3B B; 2I2L A; 3LWH A; 1YCY A; 3LYI A; 4KT0 E; 1RAG B; 3IQL A; 1VQ5 A; 1BB9 A; 3JAM E; 4MMK A; 2F5K A; 4QVD A; 1Y7X A; 3EG0 A; 3JCM g; 1VQ4 A; 1K8A U; 2F1L A; 3KBG A; 4ORZ A; 1WHJ A; 2FEI A; 3JCM X; 2EKO A; 3GF5 A; 3OYF A; 2RH2 A; 4AT1 B; 1WXT A; 2CZ6 B; 1K73 U; 4RTY A; 4JJC A; 1IRX A; 3RKX A; 2NUP B; 1X6B A; 2YLB A; 2XDP A; 3CME T; 1JU5 C; 1BI2 A; 3EGD A; 1SSH A; 3CCE Q; 4J9H A; 4GLM A; 3G1J A; 3EHR A; 2K3Y A; 2RI2 A; 1Q86 U; 1M8V A; 2GCX A; 3PGG A; 1GFD A; 4LDW A; 1TH7 A; 3GLX A; 4EMK C; 1PD1 A; 2EYY A; 3NHN A; 1WA7 A; 5FRN A; 1A0N B; 1YJW T; 2KVQ G; 2QQ9 A; 2HQX A; 2V8J A; 1GBQ A; 1VQ7 Q; 2C0O A; 4OP0 A; 2LX9 A; 3JB9 J; 6AT1 B; 1BK2 A; 1ZSZ B; 1TSF A; 3V8L A; 2V26 A; 3G6E Q; 4FYX B; 2MF2 A; 4PFP A; 1BI0 A; 2EW3 A; 2KRN A; 1Q7Y C; 1M4Z A; 2DNU A; 4HCB A; 2KR3 A; 2OTL T; 1QVF S; 3JB9 G; 2CZ1 B; 4LDX A; 4HKE A; 4BAC A; 1NJI C; 4DBF A; 2DXU A; 5CR2 A; 2EBP A; 1ZBX A; 1AWO A; 2PVG B; 1PD0 A; 1KK7 A; 1Z9Z A; 4HVW A; 1Z9Q A; 2DFU A; 4EMK B; 3L2U A; 3S3N A; 2LQW A; 4M4Z A; 1RAB B; 1JO8 A; 3OYG A; 3SWN C; 1VQ9 A; 1UEC A; 4F7U G; 4JZ3 A; 2SRC A; 1KQS P; 2XG8 D; 2RK2 A; 3EFR A; 1WJR A; 4M75 F; 3HPW A; 1S72 T; 4M77 G; 2Y4X A; 4CI0 C; 2RA2 A; 1CSK A; 1VQN A; 4KUI A; 4A53 A; 5GAN 6; 2OX7 A; 2LNV A; 3NFC A; 1OZ2 A; 4WCI A; 3CPW A; 1IGQ A; 3HFN A; 4RTX A; 4JJD A; 1SEM A; 4YTL A; 2QQS A; 2XID A; 2R5A A; 3M53 A; 2O9V A; 2NUZ A; 2DYB A; 1T3L A; 3M57 A; 2JW4 A; 3RMQ A; 1X43 A; 2K3X A; 3CCQ A; 1OX8 A; 2RMO A; 4M78 C; 4M78 E; 2ROT A; 2X3X D; 2AT1 B; 2VYT A; 3G7Z A; 3V7C A; 1VQK T; 1SRL A; 3VYG A; 3V7S A; 4DOW A; 3L2V A; 4HVV A; 4OB1 B; 3EFO B; 3OYK A; 3CCS T; 2KY9 A; 4A4K A; 3VS1 A; 7AT1 B; 3FJ5 A; 5D6W A; 3T9N A; 2AIR B; 3PVQ A; 1QVG P; 2RQW A; 3CBP A; 2LCC A; 2L0A A; 1NM7 A; 3L2W A; 2DZC A; 2DBM A; 2DL8 A; 1WPY A; 2CH4 A; 2YUO A; 1M1G A; 2KXC A; 4M7A D; 1YI2 Q; 3VS3 A; 3M4Y A; 1K9A A; 2O4X B; 2HNI A; 2QXF A; 1I4K 1; 2G3R A; 3QDF A; 2VUB A; 1JJ2 P; 1WDX A; 3MP6 A; 4HVU A; 3HRU A; 4M78 B; 1WLP B; 1UHC A; 3DKM A; 2OTJ T; 3VS2 A; 1K4U S; 3C0C A; 1VQ5 Q; 2RM4 A; 3S3O A; 3D7S B; 2QEX A; 2L89 A; 2LTO A; 4Z02 A; 2QTX A; 1VQ4 Q; 1Q7Y R; 4M77 C; 4M77 E; 2WSE E; 1UHF A; 2FVU A; 4M75 D; 3ME9 A; 5AYF A; 2GTJ A; 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