The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
77
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structure length |
77
|
Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
fyn-related kinase
|
| total genus |
7
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JMC A; 3EG1 A; 4F17 A; 2YDL A; 2RN8 A; 1JXO A; 3I5R A; 1K1Z A; 1NLP C; 1T3S A; 4CC7 A; 1M8M A; 2JT4 A; 2KYB A; 1ZUY A; 1QKW A; 1NYF A; 4AFZ C; 2CDT A; 2LCS A; 4D8D A; 1G2B A; 2EYW A; 2ED1 A; 2ENM A; 2YUQ A; 2EVR A; 2V1R A; 2V1Q A; 2M51 A; 1U5S A; 2L0A A; 2RQT A; 1UUE A; 2IIM A; 2L3P A; 3EHQ A; 4RUG A; 4JPB W; 2K6D A; 1YNZ A; 2EQI A; 1AWJ A; 4RTX A; 1VA7 A; 4RTT A; 1SRL A; 2KGT A; 1YN8 A; 4OML A; 2E5K A; 2OJ2 A; 2JMA A; 1TUD A; 2KE9 A; 5FW9 A; 3VRZ A; 1JXM A; 2J6K A; 2RMO A; 1GCP A; 1MUZ A; 4Z88 A; 1WDX A; 2K9G A; 1X6G A; 4IIM A; 4CC4 B; 3NPF A; 2KRM A; 4F16 A; 2DL4 A; 1AVZ C; 2CH4 A; 2CUD A; 1K9A A; 2RQR A; 3ULR B; 5GJV B; 3TSZ A; 5ECA A; 4GBQ A; 4D8K A; 3CQT A; 3UF4 A; 2HSP A; 4AFU C; 2YUN A; 1SPK A; 1WLP B; 2KT8 A; 3QWX X; 1YP5 A; 3UA7 A; 2GTO A; 4RTU A; 2XMF A; 3VS5 A; 2DE0 X; 1NEG A; 1X2Q A; 4M4Z A; 1Z9Z A; 4ESR A; 2I0N A; 1GBR A; 1M3B A; 2KRN A; 1S1N A; 2J06 A; 1U3O A; 5FWB A; 1M30 A; 2CUB A; 2L3S A; 1QKX A; 2PTK A; 1BBZ A; 2X3W D; 4R0K A; 2MIO A; 1UE9 A; 1UGV A; 1EFN A; 2HBW A; 2VWF A; 2ABL A; 2ED0 A; 2HCK A; 2K3B A; 1OOT A; 1HSQ A; 3H0H A; 5IXF A; 2F2X A; 1Y0M A; 3O5Z A; 2LZ6 B; 2C0T A; 2DBM A; 3M0T A; 1J3T A; 4IIO A; 1K76 A; 4CC2 A; 1SHF A; 4J9F A; 2FO0 A; 1RLP C; 2KEA A; 2DF6 A; 4HVV A; 3GBQ A; 1T3L A; 5L23 A; 1K4U S; 3M0U A; 1BB9 A; 5HCK A; 1PKS A; 3VS1 A; 1WXT A; 1HJD A; 4J9G A; 1W1F A; 4AG1 C; 2JM9 A; 2A08 A; 2FG0 A; 2HEQ A; 2DL5 A; 4RTZ A; 2RQW A; 4HVW A; 1KSW A; 2O88 A; 2DMO A; 1A0N B; 2C0O A; 3KFV A; 2DA9 A; 1K0X A; 2KXD A; 1OV3 A; 1TUC A; 2EPD A; 1JQQ A; 1ZLM A; 2AKK A; 2KNB B; 3SEM A; 4AFQ C; 1UTI A; 2DIL A; 3LH5 A; 2RQV A; 3REB B; 4OMM A; 2JXB A; 1GFD A; 4GLM A; 2K79 A; 1JO8 A; 1GCQ A; 1HD3 A; 2J05 A; 1MV0 B; 4OMP A; 2L2P A; 2K2M A; 2EGC A; 1MV3 A; 2LQW A; 4AG2 C; 2DJQ A; 1Y57 A; 4F14 A; 3M0P A; 2KR3 A; 4J9H A; 1TG0 A; 2EW3 A; 2DYB A; 2GBQ A; 3TVT A; 2DRM A; 2CSQ A; 4LN2 A; 1IO6 A; 1X69 A; 3THK A; 2JM8 A; 2JW4 A; 1T0H A; 1UHC A; 4J9C A; 1W70 A; 2M0Y A; 1V1C A; 2O31 A; 4J9B A; 2EBP A; 1WA7 A; 2EKH A; 1SSH A; 2VKN A; 2LJ1 A; 3EG2 A; 3M0Q A; 1UHF A; 4QT7 A; 3M0S A; 1WXB A; 2A28 A; 4EIK A; 2EGE A; 2D0N A; 1KFZ A; 1VYV A; 4Z8A A; 4ORZ A; 3PE0 A; 2YT6 A; 1AOJ A; 1PWT A; 3NHN A; 3C0C A; 4J9E A; 1VYT A; 3NGP A; 3A98 A; 1WFW A; 3I5S A; 3VRY A; 4DEX A; 2AZV A; 2MCN A; 2L3Q A; 3FJ5 A; 2O9S A; 1E7O A; 2ROL A; 2QDL A; 5IHN A; 2OAW A; 1BK2 A; 2W0Z A; 2NWM A; 1OPL A; 3R6N A; 1GL5 A; 2X3X D; 1LCK A; 2H8H A; 2DRK A; 1FYN A; 1X43 A; 2FPE A; 2SRC A; 2RPN A; 2LQN A; 1WXU A; 4HXJ A; 2LNH B; 1RI9 A; 2AKL A; 2CSI A; 2DL7 A; 2ESW A; 1PRL C; 2RNA A; 2FRY A; 1AZG B; 3VS3 A; 2FEI A; 3RNJ A; 1UEC A; 2BZ8 A; 2FRW A; 2O9V A; 5GJW B; 1X2K A; 1E6G A; 2GGR A; 1UJ0 A; 3VS2 A; 1WX6 A; 3RBB B; 3PVL A; 4ZNX A; 1XOV A; 1QLY A; 2A36 A; 4J9D A; 1B3Q A; 2EYZ A; 1AWW A; 2KRS A; 2J7I A; 1AZE A; 1ABQ A; 1WI7 A; 1YWO A; 4AFS C; 2RF0 A; 2KBT A; 3REA B; 2W10 A; 1NLO C; 4OMQ A; 2K7A A; 1AD5 A; 1M3C A; 1QWF A; 2OI3 A; 3IQL A; 1QWE A; 2DBK A; 1RLQ C; 1GBQ A; 3VS6 A; 4E6R A; 2RQU A; 3EG0 A; 3UAT A; 5IH2 A; 2DL3 A; 2BTT A; 1WYX A; 2LJ0 A; 4Y92 A; 1UJY A; 3SHW A; 2CRE A; 1PRM C; 2JTE A; 4K11 A; 1K0S A; 2GTJ A; 1YCS B; 3VS7 A; 2B86 A; 4Z89 A; 3H41 A; 2GQI A; 2YUO A; 2J6F A; 2F2W A; 1JEG A; 3TSW A; 1AWO A; 1WIE A; 1X27 A; 2YUP A; 1CSK A; 1GFC A; 4HCK A; 1H8K A; 2J6O A; 3ZL7 C; 1NEB A; 2D1X A; 4JZ3 A; 4RTW A; 1VYU A; 3EG3 A; 1G83 A; 2NUZ A; 3U23 A; 2DLP A; 2AZS A; 1NYG A; 3EHR A; 4A63 B; 1ZSG A; 2ROT A; 4HVU A; 4LUD A; 2MOX A; 4RTY A; 5EC7 A; 2DM1 A; 2JS2 A; 1ZUK A; 5I11 A; 2BZX A; 2FPD A; 1NM7 A; 3VS4 A; 2YSQ A; 1ZBJ A; 1B07 A; 1UDL A; 2KXC A; 3H0I A; 2SEM A; 2LP5 A; 2VVK A; 2KRO A; 1M27 C; 1PKT A; 3I9Q A; 5FWC A; 1X6B A; 4OMN A; 3VS0 A; 2DNU A; 2GNC A; 1ARK A; 2LX7 A; 1H3H A; 4JZ4 A; 1I1J A; 2AK5 A; 3I35 A; 4LUE A; 3M0R A; 2KT1 A; 1OPK A; 2F2V A; 2CH4 W; 2EYY A; 2PZ1 A; 2JS0 A; 3PVQ A; 3EGU A; 2O2O A; 4FSS A; 1KIK A; 1KJW A; 4JJB A; 1AEY A; 2DVJ A; 1SHG A; 1M3A A; 2EYX A; 2DX1 A; 1AWX A; 2LMJ A; 4LNP A; 4J9I A; 3H0F A; 4JJC A; 2ECZ A; 1CKA A; 5IHK A; 1BU1 A; 3NMZ C; 2EGA A; 1ABO A; 2FPF A; 4KRT A; 1SRM A; 4JJD A; 1OEB A; 3UA6 A; 4WCI A; 1T0J A; 2LJ3 A; 3QWY A; 4CC3 A; 1YWP A; 1GRI A; 1PHT A; 1SEM A; 1PNJ A; 2P4R A; 2A37 A; 4LE9 A; 4OMO A; 1UFF A; 2PNI A; 1RUW A; 4RTV A; 1QCF A; 5IHI A; 1U06 A; 2DL8 A; 1UG1 A; 1ZX6 A; 1FMK A; 1Z9Q A; 2HDA A; 4DEY A; 2G6F X; 4X1V A; 1ZUU A; 2C0I A; 1I0C A; 3JV3 A; 2KYM A; 2CT3 A; 5IXB A; 2D8H A; 1N5Z A; 5I22 A; 1CKB A; 1W6X A; 2BZY A; 1NG2 A; 2D8J A; 2CT4 A; 1I07 A; 1JU5 C; 1GCQ C; 1H92 A; 1E6H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RKW A; 3GPL A; 3EG1 A; 4O6J A; 1ACM B; 2WSC E; 2RN8 A; 2ZPI B; 2DO3 A; 2YWW A; 3O8V A; 1UEB A; 5GAN j; 2HZY A; 4B9X A; 3CC2 A; 2OTJ A; 4MZT A; 3UT1 A; 3HTR A; 2EYW A; 3OYE A; 1GXI E; 1N9S A; 1WHJ A; 2ENM A; 4M77 D; 1IHW A; 3E19 A; 2E6N A; 1F1B B; 1N6A A; 2EVR A; 3V8J A; 5HK0 A; 4C8Q C; 3CMA T; 2DEQ A; 2QTV A; 1UUE A; 2FB7 A; 4JPB W; 2K6D A; 2X9H A; 2EQI A; 3OS0 A; 5AYF A; 2Y4Y A; 1M5Q 1; 3CCQ Q; 4RTT A; 3GF5 A; 2KGT A; 3HKS A; 1YN8 A; 2DK3 A; 5GAN e; 3CME T; 2RHI A; 4DBR A; 3JCM Q; 4E47 A; 5GAN g; 3JCM W; 1YHQ Q; 4RG8 A; 1MUZ A; 2DXB A; 3SWN B; 4PK4 A; 1WDX A; 1WPY A; 2E12 A; 3X28 B; 3QG1 A; 3EFO A; 5CKF A; 1BKB A; 4IIM A; 1MHN A; 2RHU A; 4HA8 A; 4J83 A; 2KRM A; 1PCX A; 2DL4 A; 1AVZ C; 2CUD A; 2RO0 A; 5ECA A; 4D8K A; 1OZ2 A; 5I2M A; 3AHU A; 2A7Y A; 1VQP A; 1SPK A; 1WLP B; 3CC7 T; 1WQW A; 3V7C A; 1YP5 A; 4RTU A; 2DE0 X; 5IAY A; 1X2Q A; 1GBR A; 3L2V A; 1PD1 A; 1MND A; 1U3O A; 2CUB A; 4BY6 C; 4R0K A; 4J6X A; 2PVD B; 1P92 A; 3QZ9 B; 2HBW A; 3CCJ A; 2ATC B; 1VIF A; 3HL8 A; 3MJX A; 2HCK A; 2E70 A; 2F2X A; 1D3B B; 1PSE A; 1M2V A; 3LLR A; 2DER A; 2DBM A; 4MZP A; 1VQ7 Q; 1UGQ B; 2V8K A; 3MEU A; 1XNI A; 1SHF A; 2Y90 A; 4NOY A; 4PLL A; 3QO3 A; 2L5Q A; 3LYI A; 2KEA A; 3PIP A; 1KQ1 A; 2X4W A; 3GBQ A; 1T3L A; 3MO8 A; 1Q81 R; 4ATO A; 1OU9 A; 1K4U S; 1V29 B; 2KI7 A; 2HMA A; 3M0U A; 5GAN 2; 1VQ9 Q; 1G3S A; 4N4G A; 1PKS A; 1WXT A; 2E3I A; 4DOV A; 1VQ8 A; 3CBP A; 1HXD A; 4XU0 A; 3A8M B; 2DL5 A; 3H8Z A; 2RQW A; 4HVW A; 3FLG A; 3G71 A; 2C0O A; 2IPO B; 2DA9 A; 2QQB A; 1MGQ A; 2MPX C; 4OB1 B; 2KNB B; 1VQ5 Q; 2ZZD A; 1WHG A; 1UTI A; 3MET A; 2ZCF B; 1YIJ Q; 1Q7Y C; 3CD6 Q; 2WSF E; 3CCL Q; 2HQX A; 4EMH A; 2L8D A; 1GCQ A; 1HD3 A; 2EKO A; 4L5G A; 4A4F A; 1LVK A; 2D9T A; 2AIR B; 2LCC A; 1FX7 A; 1FMW A; 1Q81 U; 4E7I A; 2M1H A; 3OYD A; 1QMC A; 1B34 A; 3M0P A; 2HQE A; 4J9H A; 1TG0 A; 2QG9 B; 3TVT A; 3JB9 H; 4HCB A; 4JS4 A; 2KDS A; 2JM8 A; 4M75 E; 3CCQ T; 4C92 A; 4IUV A; 1MNE A; 2YHT A; 1V1C A; 1BIA A; 2PUO B; 1BI2 A; 1TH7 A; 2EBP A; 2EKH A; 1QQJ A; 2YRV A; 4A54 A; 4OB0 B; 2LJ1 A; 4JUV A; 2H3E B; 2MK5 A; 3M0Q A; 2RJF A; 4EDU A; 4EIK A; 1KHI A; 1KFZ A; 3PE0 A; 3M58 A; 2K3X A; 5GMK e; 2YRC A; 2YT6 A; 1VQM Q; 4J9E A; 2R5M A; 4A4H A; 3NGP A; 3A98 A; 3TEE A; 2GFU A; 3VRY A; 4N0A C; 2AZV A; 2XIC A; 4LD6 A; 5IHN A; 5A2Q E; 1QVF A; 3A8H B; 1BK2 A; 2W0Z A; 2X4J A; 1OPL A; 3R6N A; 1KC8 U; 1I4K 1; 4DBF A; 4C92 G; 5FU6 C; 4C8Q D; 1YJN A; 3CC7 A; 4HT8 A; 2DL7 A; 2ESW A; 1KD1 R; 2OTJ T; 4M7D B; 3M9Q A; 2FEI A; 2BZ8 A; 1TSF A; 2FRW A; 2E1H A; 2PQW A; 2O9V A; 5GJW B; 2GGR A; 2YRD A; 5LJ5 f; 3J7A F; 4J9D A; 2VC8 A; 3T9N A; 2EYZ A; 2VAS A; 1AZE A; 4OP0 A; 1VQN Q; 4ZN3 A; 3CCU A; 4ZGD B; 3OW2 P; 4C0D C; 4M77 A; 5CKD A; 2HSE B; 3OW2 A; 4OMQ A; 2K7A A; 3PIO A; 2JOY A; 3S3O A; 3IQL A; 2DBK A; 1RLQ C; 4E6R A; 3OYN A; 5IH2 A; 2DL3 A; 2BTT A; 2LJ0 A; 3OMC A; 2CKK A; 1UJY A; 4K11 A; 2DET A; 3VS7 A; 2DTI A; 3OY9 A; 3JB9 D; 3H41 A; 2J6F A; 3CBO A; 1X01 A; 4JS5 A; 3V7R A; 1X27 A; 5GAM j; 4ELY C; 1ZQ1 A; 2D1X A; 2QAZ A; 1JJ2 S; 5L8R E; 3F70 A; 2NUZ A; 3RES A; 2JJ9 A; 2EIF A; 2DLP A; 4M75 A; 1NYG A; 3JCM f; 3I55 T; 3EHR A; 1ZSG A; 1RAA B; 3M55 A; 5J26 A; 5EC7 A; 1PD0 A; 1EZZ B; 2CZ6 B; 4WTO B; 1WHM A; 2JS2 A; 1MMG A; 2MWO A; 4XTW A; 1VQ8 T; 2YSQ A; 1B07 A; 1UDL A; 3HRS A; 1M1G A; 4FT4 A; 2SEM A; 5HY6 A; 2VVK A; 3NTI A; 2DPP B; 2QGG A; 1VQK A; 5GAN 6; 3I9Q A; 2XU8 A; 4PLI A; 4OMN A; 4QQ6 A; 2BUD A; 4E7S A; 1AHJ B; 2ZPE B; 1YJN T; 3E9G A; 2ZPF B; 3M0R A; 2AT1 B; 2ZPH B; 1VQ6 Q; 2CH4 W; 1WQ7 A; 3LW5 E; 2JS0 A; 2OTJ Q; 1MMN A; 2O4X B; 4X9D A; 2GQV A; 1VQO T; 4DQ2 A; 1KJW A; 4LDV A; 1SHG A; 1IZ6 A; 3J81 E; 7AT1 B; 1M1K C; 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1S72 T; 3MP6 A; 1K9A A; 4KUI A; 4JRP A; 4FL6 A; 4QQD A; 3BW1 A; 3R6O A; 2LTO A; 3CQT A; 3UF4 A; 2HSP A; 4AFU C; 2HQH A; 1WHH A; 3CXC A; 1M1F A; 4FIB A; 1D09 B; 2FL7 A; 2GTO A; 3VS5 A; 1PG5 B; 2K4Y A; 1D0Y A; 3SB2 A; 1U1S A; 4QVD A; 4R55 A; 4M4Z A; 2GCX A; 1M3B A; 2KRN A; 1S1N A; 2J06 A; 3H9N A; 2L3S A; 1QKX A; 2X51 A; 5GMK m; 2VV5 A; 5CKE A; 2ED0 A; 1M8V A; 2K3B A; 1OOT A; 1HSQ A; 5IXF A; 4A4K A; 4FYV B; 5I2S A; 2F69 A; 5GAN f; 2M9U A; 5LJ5 e; 3VUZ A; 4BE0 A; 2QQS A; 1RLP C; 3EH2 A; 5CVI A; 3CMA A; 4EMK C; 3M57 A; 3JB9 F; 1TTH B; 4PJO E; 1VQ6 T; 1HJD A; 1W1F A; 3JCM b; 3M53 A; 4ANJ A; 4N0A A; 4IUP A; 3RIR A; 1OV3 A; 1TUC A; 2EPD A; 2QDY B; 2AKK A; 3G71 Q; 4E7Z A; 1VUB A; 3SEM A; 4AFQ C; 3M56 A; 4F7U F; 2RQV A; 4OMM A; 3CBM A; 4N4I A; 1JO8 A; 4M7D F; 3NTH A; 3M4Y A; 3JCM g; 1B7T A; 2QA4 Q; 4BDY A; 1MV3 A; 3GIB A; 1PSF A; 5C0M A; 1KQ2 A; 4BAC A; 2JTM A; 1Y57 A; 1G5V A; 2QGF B; 1VQO A; 4EMG A; 2EW3 A; 1N8R U; 1WNL A; 2DRM A; 3OYC A; 1I8F A; 3CC4 A; 2CSQ A; 4LN2 A; 4ZN1 A; 2XI9 A; 1UHC A; 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