The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
GSSGSSGQYFVALFDYQARTAEDLSFRAGDKLQVLDTSHEGWWLARHLEKKGTGLGQQLQGYIPSNYVAEDSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Mus musculus
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Fyn-related kinase
rcsb |
| molecule keywords |
fyn-related kinase
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| total genus |
7
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2005-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KEA A; 2A28 A; 1HJD A; 1TG0 A; 1NEG A; 2ED1 A; 2L2P A; 1UTI A; 4HCK A; 2KE9 A; 1I07 A; 3I5S A; 4RUG A; 1U3O A; 5I22 A; 3RBB B; 2EGC A; 1WYX A; 1T0J A; 4IIO A; 3VS0 A; 1OV3 A; 1K0X A; 4JPB W; 3GBQ A; 4FSS A; 1U06 A; 3UF4 A; 2OJ2 A; 1LCK A; 3KFV A; 2DJQ A; 1OOT A; 1VYT A; 2LJ1 A; 3I5R A; 3SEM A; 4OMO A; 3VRY A; 5IH2 A; 1MUZ A; 2FG0 A; 2KRM A; 1JXM A; 4AFQ C; 2D8J A; 2EGA A; 5HCK A; 1AZG B; 5FW9 A; 1G83 A; 1UJ0 A; 1AZE A; 1GBQ A; 1T3S A; 3H41 A; 4EIK A; 3UA7 A; 4AFU C; 1OEB A; 2RQR A; 1RLQ C; 4X1V A; 2O2O A; 2JS0 A; 4CC2 A; 2DE0 X; 3UAT A; 2LQN A; 1NM7 A; 1CSK A; 3THK A; 1BU1 A; 1JO8 A; 2YUP A; 1X43 A; 1MV0 B; 4HVU A; 3EG1 A; 4R0K A; 2DIL A; 2FRW A; 4D8K A; 1MV3 A; 1UUE A; 1QWE A; 4CC4 B; 1S1N A; 3REA B; 1AD5 A; 2ENM A; 3C0C A; 3O5Z A; 2DL3 A; 1VYU A; 4WCI A; 2O31 A; 4J9G A; 1WDX A; 3VS5 A; 3JV3 A; 2RQW A; 1E6G A; 2GGR A; 1AWW A; 1YWO A; 1W6X A; 3VRZ A; 2CT4 A; 2DMO A; 1Y57 A; 2BTT A; 2LZ6 B; 2GNC A; 2ROL A; 4K11 A; 1UFF A; 4F16 A; 2CH4 A; 3ZL7 C; 4OMP A; 1UJY A; 1PNJ A; 1ZSG A; 1UHC A; 5GJV B; 2KRO A; 2HSP A; 1SEM A; 1M27 C; 1SHG A; 2F2W A; 3VS7 A; 2CUB A; 4ORZ A; 4M4Z A; 2RPN A; 1UDL A; 1ZUU A; 2L3S A; 2DVJ A; 1CKB A; 1ZUY A; 1HD3 A; 5IXF A; 2DNU A; 2XMF A; 2J06 A; 4LUD A; 1H8K A; 1I0C A; 2K79 A; 3EGU A; 2DM1 A; 2PTK A; 1PKT A; 2D8H A; 2LX7 A; 2DRK A; 1ABO A; 3PVQ A; 2FPD A; 4RTZ A; 1BK2 A; 1GFC A; 1WA7 A; 4ZNX A; 4HVV A; 1WLP B; 1H3H A; 1GL5 A; 2LJ3 A; 2FRY A; 2VVK A; 3TSW A; 1M30 A; 2V1R A; 1UG1 A; 1H92 A; 1PHT A; 2W0Z A; 1EFN A; 3NMZ C; 4OMQ A; 1NLP C; 2YUQ A; 4J9H A; 3H0H A; 3VS3 A; 2C0I A; 1QKX A; 2V1Q A; 1FMK A; 2KXD A; 1U5S A; 1BB9 A; 2NUZ A; 2KXC A; 2X3X D; 1NLO C; 2MOX A; 4AFZ C; 2SRC A; 3M0P A; 1HSQ A; 1V1C A; 1TUC A; 4LN2 A; 4HVW A; 4KRT A; 1OPL A; 3PVL A; 2P4R A; 4GLM A; 2KYB A; 2OI3 A; 1K9A A; 2VKN A; 4AFS C; 2JM8 A; 4E6R A; 3TVT A; 5IHI A; 3R6N A; 1GBR A; 1K4U S; 4RTT A; 1Y0M A; 3PE0 A; 2DL5 A; 3EG3 A; 1FYN A; 2J6K A; 1YNZ A; 5FWB A; 2FPF A; 5FWC A; 2LCS A; 1JU5 C; 5IXB A; 1N5Z A; 1TUD A; 2C0T A; 2LP5 A; 3H0I A; 1X6G A; 2ROT A; 2ABL A; 4OMM A; 2EQI A; 3M0U A; 1SHF A; 2JMC A; 1I1J A; 2YT6 A; 2OAW A; 2KR3 A; 3NGP A; 2KRN A; 2M51 A; 2EGE A; 3EHR A; 1JQQ A; 3QWX X; 4QT7 A; 1CKA A; 4JJC A; 1UGV A; 2L3Q A; 3H0F A; 4OML A; 1G2B A; 4DEY A; 2DL8 A; 1AWJ A; 2BZ8 A; 2DA9 A; 2D0N A; 2KBT A; 2AKL A; 2QDL A; 2JM9 A; 1AOJ A; 4JJD A; 2YSQ A; 4A63 B; 1Z9Q A; 2KGT A; 4OMN A; 2G6F X; 1M3C A; 2NWM A; 1X27 A; 4RTX A; 2EKH A; 1QCF A; 2CDT A; 1ZUK A; 2DLP A; 2CH4 W; 3NPF A; 1SRL A; 1ZBJ A; 2EYX A; 1E6H A; 3A98 A; 3M0R A; 3VS4 A; 1PWT A; 1AVZ C; 1YP5 A; 1T3L A; 1X2Q A; 3M0T A; 1RUW A; 2AKK A; 4AG2 C; 1X2K A; 2B86 A; 2ED0 A; 2MIO A; 2C0O A; 2H8H A; 4RTW A; 1GCQ C; 2FEI A; 4J9C A; 2K3B A; 2SEM A; 4Z88 A; 1WXT A; 5EC7 A; 2GTO A; 1UHF A; 1QKW A; 1K76 A; 1WXU A; 3I9Q A; 2KT1 A; 1K1Z A; 4F14 A; 1AWO A; 1NYF A; 2K6D A; 2J7I A; 3IQL A; 5GJW B; 2D1X A; 1A0N B; 3TSZ A; 1GCP A; 1W1F A; 4J9B A; 1B07 A; 4LE9 A; 4Y92 A; 2F2X A; 2CUD A; 4JJB A; 5ECA A; 1VA7 A; 2J05 A; 2ECZ A; 2PZ1 A; 1X69 A; 2CSI A; 2BZX A; 1NEB A; 4RTU A; 2J6O A; 3VS6 A; 2LQW A; 2EYW A; 2JXB A; 1PKS A; 2EPD A; 4RTV A; 1KIK A; 2KRS A; 1SPK A; 1JXO A; 3EG0 A; 3VS1 A; 1BBZ A; 1Z9Z A; 2L3P A; 2YDL A; 4CC7 A; 2HDA A; 2O9V A; 3QWY A; 2HBW A; 1QWF A; 1NYG A; 2VWF A; 4DEX A; 1ARK A; 2DL7 A; 2O88 A; 1NG2 A; 2E5K A; 2RMO A; 4Z8A A; 1SSH A; 2MCN A; 2DBK A; 4JZ3 A; 1KFZ A; 1PRL C; 4IIM A; 2A36 A; 3CQT A; 3NHN A; 2BZY A; 1K0S A; 1RLP C; 2GQI A; 1WXB A; 2JTE A; 4ESR A; 2RQT A; 2AZV A; 1GCQ A; 4Z89 A; 3ULR B; 1PRM C; 3FJ5 A; 3SHW A; 2K9G A; 1UEC A; 1WI7 A; 2IIM A; 1SRM A; 2J6F A; 2O9S A; 1YCS B; 2RN8 A; 2GBQ A; 2CT3 A; 2M0Y A; 2JW4 A; 2YUN A; 4JZ4 A; 1ZLM A; 3EG2 A; 4RTY A; 1IO6 A; 2DF6 A; 4J9I A; 2HEQ A; 2RF0 A; 3M0S A; 1GRI A; 1J3T A; 2DL4 A; 4AG1 C; 4LUE A; 1T0H A; 2LNH B; 4J9E A; 2W10 A; 3U23 A; 5L23 A; 1WX6 A; 2DBM A; 2DRM A; 2YUO A; 3I35 A; 2CSQ A; 1WIE A; 2I0N A; 1WFW A; 2RQV A; 1YWP A; 4LNP A; 1VYV A; 4J9F A; 1KSW A; 1E7O A; 2K7A A; 2F2V A; 1OPK A; 2FPE A; 2HCK A; 1B3Q A; 1ZX6 A; 1UE9 A; 2RNA A; 1GFD A; 2JMA A; 3M0Q A; 3UA6 A; 2DX1 A; 1KJW A; 5IHK A; 4J9D A; 3EHQ A; 2EVR A; 2RQU A; 1M8M A; 2A08 A; 2JS2 A; 2KNB B; 4HXJ A; 1JEG A; 2JT4 A; 1X6B A; 3RNJ A; 2K2M A; 2DYB A; 1M3A A; 2KT8 A; 2EYY A; 1AWX A; 2GTJ A; 2FO0 A; 3REB B; 1QLY A; 1ABQ A; 2EW3 A; 5IHN A; 2CRE A; 2PNI A; 1XOV A; 1AEY A; 2EBP A; 4GBQ A; 2AK5 A; 2A37 A; 2KYM A; 1W70 A; 3VS2 A; 2AZS A; 2LMJ A; 2ESW A; 2L0A A; 4D8D A; 2EYZ A; 5I11 A; 1YN8 A; 1M3B A; 4F17 A; 4CC3 A; 3LH5 A; 2X3W D; 1RI9 A; 2LJ0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQL A; 1TG0 A; 1UTI A; 3MET A; 2KE9 A; 2JNG A; 3LYI A; 3CCV T; 1YJN Q; 4A4K A; 5I2M A; 3RBB B; 4M7D E; 3CCM T; 4IIO A; 4M77 C; 1Q7Y R; 2GQV A; 5GAM e; 2K5L A; 2E64 A; 1LCK A; 4EMK A; 3FLG A; 3CC4 Q; 2LJ1 A; 3I5R A; 4OB0 B; 1BKB A; 4AMC A; 2WSF E; 1D09 B; 5IH2 A; 1MUZ A; 1TOV A; 1FMW A; 4AFQ C; 4E47 A; 2BKD N; 2DER A; 5FW9 A; 1YIJ Q; 1AZE A; 4PKC C; 3CC2 T; 4EIK A; 3PTA A; 4C5G A; 3G71 T; 3T9N A; 1YJN A; 2R57 A; 1IZ6 A; 3QUI A; 4C8Q D; 2RJE A; 4N0A C; 2NYS A; 4ATO A; 1X43 A; 1RAB B; 3JCM h; 3EG1 A; 2XID A; 5GAO r; 1W2B P; 2FRW A; 3JCM f; 1LVK A; 2XHC A; 3CC4 A; 5GAN e; 2JUF A; 4J8O A; 3C0C A; 3O5Z A; 1NBE B; 5LJ5 g; 1MHN A; 1YIJ A; 1KD1 R; 3CPW A; 1WDX A; 2DD4 A; 2QG9 B; 5I2S A; 4M77 G; 3JV3 A; 4M77 A; 1YWO A; 1W6X A; 4PJO G; 2F69 A; 5J3B A; 4PJO A; 2L5Q A; 4DQ2 A; 3M59 A; 2CT4 A; 2V8K A; 3CCU T; 1EX4 A; 2CH4 A; 4CI0 C; 4OMP A; 4JLG A; 1DJ7 B; 2X4J A; 1PNJ A; 4D6W A; 1Q95 G; 2RI5 A; 2HSP A; 1IRX A; 4Z02 A; 3L42 A; 1SEM A; 2K5I A; 2F2W A; 4IUR A; 1KQ2 A; 4LD6 A; 1UGR B; 4BB7 A; 4ELZ C; 2CUB A; 5GAO m; 1ZUU A; 3HPW A; 2AIR B; 4N0A A; 3DLL A; 5J39 A; 2XMF A; 5LJ3 h; 3G4S Q; 2J06 A; 3BE3 A; 4LUD A; 1H8K A; 1I0C A; 2K79 A; 5LJ3 f; 3EGU A; 2DM1 A; 2E3I A; 2D8H A; 2RJF A; 1VQ4 Q; 1M1F A; 3RER A; 2QA4 Q; 4RTZ A; 4HVV A; 3CME T; 1KQS P; 1WLP B; 5DM7 R; 4XTZ A; 3HRT A; 2K5F A; 1Q81 U; 2FRY A; 2LVM A; 3TSW A; 2HQH A; 1M30 A; 1X6O A; 1PHT A; 2W0Z A; 1NJI C; 2RI2 A; 4J9H A; 3VS3 A; 1MNE A; 4ZN1 A; 1FXX A; 1BB9 A; 1OZ2 A; 2F5T X; 1VQ7 Q; 2DAQ A; 4ZGE B; 2MOX A; 3A8L B; 5FU7 B; 4AFZ C; 3G4S A; 1V1C A; 3OYD A; 3WXM B; 1XNI A; 4DOV A; 2P4R A; 2E70 A; 3CCQ Q; 1VQ4 A; 4PFO A; 2QA4 A; 1K9A A; 2VKN A; 1RAC B; 1Y0M A; 3PE0 A; 1YNZ A; 2FPF A; 1K73 C; 1YI2 Q; 3J7A F; 1N5Z A; 1R0B G; 1X6G A; 1VQ8 T; 1YBY A; 2ROT A; 4RKU E; 3J81 E; 1VQ7 A; 4PJM A; 3M0U A; 1TSF A; 2JMC A; 2XIC A; 3JCM c; 1YHQ T; 1BI1 A; 2H3E B; 5CR2 A; 2KRN A; 3M9Q A; 3QWX X; 4QT7 A; 4JJC A; 2L3Q A; 3H0F A; 4OML A; 2DL8 A; 5AT1 B; 5DLO A; 2PVD B; 5FU7 C; 2D0N A; 1Q7Y C; 2DXT A; 2KBT A; 2GCX A; 3RKX A; 3JCM g; 1H64 1; 1YI2 A; 1AOJ A; 1Q82 R; 1TU0 B; 1HK9 A; 1XQH A; 2DO3 A; 3JSC A; 4OMN A; 5CKB A; 2VC8 A; 3EH1 A; 1NPP A; 5DLQ E; 2R58 A; 2O01 E; 4RMO A; 4PJO D; 4M78 F; 1SRL A; 2EYX A; 5LJ5 e; 2X4W A; 3A98 A; 4RCC A; 1JJ2 S; 2MPX C; 2FL7 A; 5GAM h; 1RL2 A; 5CIU A; 1X2Q A; 1RUW A; 1VIF A; 2E6Z A; 5A0D A; 3I56 Q; 3SWN A; 2H8H A; 2K3B A; 2QGG A; 2Y90 A; 1G8X A; 5EC7 A; 2GTO A; 4X34 A; 2BE7 D; 1QKW A; 1K76 A; 4M7A E; 1AWO A; 3CCE T; 2CP3 A; 2J7I A; 5GMK e; 1JJ2 P; 1M90 R; 1A0N B; 3A8O B; 2YRD A; 1GCP A; 1QVP A; 4J9B A; 5A2Q E; 4FL6 A; 4JJB A; 4BAC A; 3CCS Q; 2VGN A; 1N8R U; 1X69 A; 2E1H A; 1KD1 C; 4BI8 B; 2EYQ A; 2EKO A; 5LJ3 g; 2EYW A; 5GAN h; 3I56 A; 1KIK A; 1M8V A; 1M2O A; 1Z9Z A; 2L8D A; 3QWY A; 2WSC E; 4KT0 E; 1NYG A; 5FRN A; 2DL7 A; 5CKD A; 2RMO A; 5I21 A; 4FM4 B; 4M7D F; 3OS5 A; 2DBK A; 1PRL C; 2ZCF B; 3JB9 G; 1IHW A; 3DLM A; 3CQT A; 1K0S A; 2YXY A; 3JB9 H; 1RLP C; 2RO0 A; 2JTE A; 2FHD A; 2XI9 A; 1KHI A; 3SHW A; 2ZPF B; 3CCJ Q; 2LNV A; 2QGF B; 3RKW A; 2O9S A; 2GBQ A; 2CT3 A; 4JZ4 A; 3UPU A; 3X25 B; 3VUB A; 4XQ3 A; 2CP7 A; 2KQW A; 2RF0 A; 2HAX A; 2XKO C; 3ME9 A; 1BI2 A; 1VQ9 Q; 3HRU A; 2DK3 A; 4J9E A; 4EPC A; 4BI3 A; 2YHT A; 4V2S A; 2HZY A; 2RK2 A; 2YUO A; 4FW1 A; 1PCX A; 1MMD A; 4M78 B; 4J6X A; 3A8H B; 3DB4 A; 1PD0 A; 3V7C A; 4BD3 A; 1KSW A; 1VQK Q; 5KCO A; 2F2V A; 1B3Q A; 5GAN 3; 2RNA A; 5GAN 4; 4KGZ B; 3M0Q A; 3PNW C; 3CBP A; 3UA6 A; 3O8V A; 3BDU A; 1VQL T; 2DET A; 5IHK A; 2DYI A; 3EHQ A; 5AYF A; 1UEB A; 1F1B B; 1JEG A; 2CP6 A; 4HXJ A; 4VUB A; 4M75 G; 4M75 A; 3CD6 T; 3JCM e; 2JT4 A; 1X6B A; 1VQ9 A; 4A4F A; 2MI6 A; 2K2M A; 3OYH A; 3M56 A; 3MEA A; 4XU2 A; 2DYB A; 3QDF A; 4XU1 A; 2KT8 A; 5CKH A; 2RHU A; 3M53 A; 2GTJ A; 2X4Y A; 1K8A U; 3MKD A; 4J6Y A; 1WJS A; 2A37 A; 1VQK A; 1W70 A; 1K9M R; 1ACM B; 2QXF A; 5I11 A; 1YN8 A; 1VQ6 Q; 3CCL Q; 1RI9 A; 2LJ0 A; 2CZ1 B; 2KEA A; 2A28 A; 4M78 C; 2RHZ A; 2ED1 A; 2X51 A; 3FDR A; 3C4S A; 3GIB A; 4HCK A; 4HCC A; 1Q82 C; 1YJN T; 2VAS A; 3MCA B; 1I07 A; 4LXC A; 1GXI E; 2LC4 A; 4RUG A; 2ZPE B; 4M7D B; 1U3O A; 2QTV A; 2ATC B; 2EGC A; 2PU9 B; 1B34 B; 3S3N A; 3VS0 A; 1WHK A; 4JPB W; 3GBQ A; 3GP8 A; 3CC4 T; 3KFV A; 2ZZD A; 4FT4 A; 1VYT A; 3QO3 A; 3ER0 A; 5LJ3 e; 5FRM A; 1VQ6 A; 3VRY A; 5HK3 A; 1Q86 R; 2FG0 A; 1OI1 A; 1KC8 R; 4ZTJ A; 4A53 A; 1YIJ T; 2D8J A; 2EGA A; 5M9O A; 1AZG B; 4LDY A; 3JB9 D; 1FX7 A; 4IKF A; 5LJ5 h; 3QYG B; 3RKY A; 3LH0 A; 5KYW B; 5D6Y A; 1M90 C; 2O2O A; 2MYS A; 4PJJ A; 4CC2 A; 4EMG A; 3UAT A; 1BU1 A; 3HFN A; 2A0F B; 3M57 A; 1MV0 B; 3VU3 C; 4R0K A; 1MV3 A; 2EJG A; 4JDS A; 1QWE A; 4F7U G; 1HXD A; 4F7U A; 3PT9 A; 3P8H A; 3REA B; 4M7D C; 2Y4X A; 1VIE A; 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