The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
GSSGSSGRSSRTRFTDYQLRVLQDFFDANAYPKDDEFEQLSNLLNLPTRVIVVWFQNARQKARKSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Solution structure of the second homeobox domain of AT-binding transcription factor 1 (ATBF1)
rcsb |
molecule tags |
Transcription
|
source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
Alpha-fetoprotein enhancer binding protein
|
total genus |
14
|
structure length |
70
|
sequence length |
70
|
ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2005-12-13 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00046 | Homeodomain | Homeodomain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Arc Repressor Mutant, subunit A | Homeodomain-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DN0 A; 3BTI A; 4ABZ A; 3ZOB A; 3H3V K; 2LR8 A; 1QRY A; 3Q0W A; 5JLW A; 1PUF B; 4C3H J; 4XRM A; 3JRG A; 2PMZ N; 1MSE C; 2DA7 A; 5DS9 A; 1RKT A; 2GLO A; 2HOT A; 2X6O A; 1UHS A; 4A3C J; 3PM1 A; 2G0E A; 3JR9 A; 1WPK A; 5J1Y A; 2TCT A; 1O4X A; 2FD5 A; 5DTD A; 1JJ6 C; 1TWC J; 1XG1 A; 4A3K J; 2KT0 A; 2ID3 A; 5M5W J; 5F0F A; 5FKL A; 2DA6 A; 3BR2 A; 3FK7 A; 3JRC A; 2CJJ A; 1D5Y A; 2KDZ A; 2W48 A; 3HGG A; 1FJL A; 4Y7N J; 2DA4 A; 2HXI A; 5F08 A; 1BL0 A; 2DMN A; 4A3G J; 1OJL A; 1XC5 A; 2CU7 A; 1X2M A; 3NAU A; 5F1J A; 5K7F A; 3DCF A; 1Z77 A; 2LK2 A; 1IUF A; 4DYR A; 3HOZ J; 4B3A A; 1FIP A; 2NVT J; 1MBJ A; 2JWT A; 1JTY A; 4X6A J; 3OOU A; 1HDP A; 2JJ7 A; 3ZQH A; 1IG7 A; 1A5J A; 4A3J J; 2DJN A; 3SJM A; 2XSD C; 1P7I A; 1AKH B; 4L5E A; 3IV5 A; 2LD5 A; 3PO2 J; 3BTL A; 2VKE A; 2JA5 J; 4DZP A; 2CQQ A; 4Y52 J; 1X2N A; 5IP6 A; 5EGO B; 3RZO J; 4A69 C; 5C3E J; 5EEA A; 2COB A; 5K7Z A; 1G2H A; 5GPA A; 2P81 A; 1ENH A; 5FKO A; 3ZQG A; 2IAI A; 4JX6 A; 1B8I A; 1DU6 A; 2Y9Z A; 2XGD A; 2JA7 J; 2LLK A; 1BW6 A; 2E2I J; 3S1R J; 5F0C A; 4XIC A; 3BG3 A; 1VFC A; 1JT0 A; 5FLV A; 3IH2 A; 3QQA A; 1QPI A; 1ETV A; 3MN2 A; 1PUF A; 1ZQ3 P; 5HOD A; 2LFB A; 4DW6 A; 2O7O A; 2LTP A; 1ITY A; 4JX5 A; 2CUE A; 2NOG A; 3CMY A; 2H1K A; 2DA1 A; 1LFU P; 2ZB9 A; 3K2A A; 4CYC B; 1JUP A; 1JUM A; 2X9D A; 4D5F A; 3LSR A; 3JRE A; 1MH4 A; 2HXO A; 4RDU A; 3GTO J; 2HDD A; 1LFB A; 3GTK J; 5EF6 A; 3FIS A; 4IHW A; 3SDG A; 3BQZ A; 3M3Y J; 2M2E A; 2ID6 A; 5C4J J; 1JJ8 C; 2XPV A; 1IDZ A; 3D1N I; 4FE4 A; 4NDL A; 2XPU A; 3TW6 A; 1OCT C; 2LVS A; 3L1P A; 1FEX A; 1Y1W J; 1RR7 A; 1DU0 A; 3WHC A; 3G1M A; 5E3O A; 1GDT A; 2WV1 A; 3FK6 A; 2HQ5 A; 3BR3 A; 2N8G A; 2GM4 A; 3HOY J; 4XID A; 1ETO A; 2Y2Z A; 4GFB A; 2R7Z J; 1RES A; 5EDN A; 4QSH A; 2NVX J; 1GV5 A; 2YU9 J; 3WHB A; 4A3B J; 1F43 A; 2GBY A; 1APL C; 1AKH A; 2RAE A; 3HOU J; 2M34 A; 2NS8 A; 2JMW A; 3CCY A; 2DMU A; 5EGO A; 2M0C A; 2EZK A; 4MFD A; 3S2D J; 1QVU A; 4JP0 A; 1B72 B; 1I6H J; 2E1O A; 1T56 A; 2EZI A; 1JKP C; 2NVQ J; 2YS9 A; 3JRB A; 2VUM J; 2YUS A; 4BY7 J; 1TWH J; 1GUU A; 3I4N J; 4M3B A; 2JK3 A; 2LP0 A; 1VND A; 1ZGW A; 1MBH A; 4A3M J; 1SFO J; 3JRF A; 1IV6 A; 5EZH A; 4B1R A; 4MO7 A; 1HF0 A; 1TWA J; 5JLX A; 3BTJ A; 1ETY A; 1JTX A; 2EQR A; 4M3G A; 5IOZ A; 2R5Y B; 1IC8 A; 1MBF A; 2H8R A; 2VPR A; 5J1U A; 2HOA A; 1RPW A; 1TC3 C; 2QF7 A; 4EEF G; 2MSY A; 3B6C A; 1VF9 A; 1U8B A; 1JKO C; 4CYC A; 2JA8 J; 2DMT A; 1WI3 A; 5FKK A; 2O9L A; 2WB1 N; 5EG0 B; 4BBR J; 3GTL J; 3HOX J; 1NTC A; 1MH3 A; 4X1E A; 1ETK A; 2OF7 A; 1VI0 A; 3B6A A; 1FTT A; 2FQ4 A; 1OCP A; 2MW8 A; 2ME0 A; 3ZQC A; 3LNQ A; 2FJ1 A; 2XGE A; 2K9N A; 4AYB N; 5IPA A; 5IP9 J; 2L7F P; 3S14 J; 1HOM A; 2ME6 A; 5E3L A; 4DYQ A; 2LY9 A; 5K7H A; 3A02 A; 3JRI A; 3QPS A; 3S16 J; 2E19 A; 4M3F A; 4JX4 A; 4I76 A; 1SAN A; 1U9O A; 1MSF C; 3S2H J; 3LSG A; 1HLV A; 3MKL A; 3BR5 A; 2X48 A; 5GP9 A; 1NK2 P; 3SFI A; 2XB5 A; 2O8K A; 5EZG A; 4FE7 A; 3S15 J; 5BNG A; 5IYC J; 4HNV A; 3LSJ A; 3C2B A; 4D5C A; 5IOY A; 1GV2 A; 3BG9 A; 4G12 A; 3GTG J; 1Q1V A; 4JYK A; 4C2M J; 3LOC A; 1HCR A; 1BJZ A; 1OFC X; 3BT9 A; 3G1O A; 3K7A J; 4AC0 A; 2AO9 A; 5EYR A; 4FIS A; 3E7L A; 3FKI J; 1BW5 A; 5M5X J; 2K40 A; 3GTP J; 1Y1V J; 1U78 A; 3G1L A; 1LE8 B; 2L0K A; 1WH7 A; 4UUS B; 3OIO A; 3HB9 A; 1F36 A; 3Q3S A; 4FTH A; 1TWF J; 4XRS A; 2R5Y A; 3BG5 A; 3O8H A; 1IDY A; 5FLM J; 1W0T A; 3MVP A; 2R92 J; 2TRT A; 3BR6 A; 1XS9 A; 3S1M J; 1WH5 A; 3HBL A; 3ZQF A; 3A03 A; 4A3E J; 1ETX A; 2EBI A; 1E3O C; 4BY1 J; 5J1R A; 3S1N J; 3HKZ N; 3UKG A; 1QVT A; 1HDD C; 2K9S A; 1FTZ A; 1T33 A; 2DMQ A; 2XRL A; 4J19 A; 1K61 A; 3HOW J; 1P7J A; 5F27 A; 4QIW N; 3TW7 A; 1K83 J; 5M3M J; 4W1U A; 2E2J J; 4A3L J; 4A3I J; 1UG2 A; 2CRG A; 2VI6 A; 5F0H A; 2IEK A; 2R5Z B; 1POG A; 5GPC A; 3BR0 A; 4M3E A; 3HGY A; 4IHY A; 1YRN B; 3BQY A; 4M6V A; 3FIW A; 4DYC A; 1ETW A; 2JN6 A; 3TP3 A; 5IYD J; 1ZK8 A; 3JRH A; 3NAR A; 5E3M A; 3HEF A; 2IBD A; 3GTJ J; 2E2H J; 4A93 J; 3H0G J; 5J3L A; 3BR1 A; 2EZL A; 2WAQ N; 4D7N A; 1H88 C; 1JT6 A; 4C3I J; 4BKX A; 1ZR4 A; 2XPW A; 3OSF A; 3O8G A; 2ECB A; 2FX0 A; 1ORK A; 3A01 B; 2DTZ A; 2L9R A; 2DA3 A; 4XK4 A; 4IHV A; 2CQX A; 3ZQI A; 1U9N A; 2Y30 A; 1GVD A; 2HI3 A; 1RET A; 2LKX A; 4IEJ A; 1AHD P; 3HM5 A; 4BBS J; 1S7E A; 2L7M P; 1W0U A; 4AUX A; 1UMQ A; 4XRS G; 1FIA A; 1LE8 A; 2AHQ A; 4UUT A; 4UUS A; 3RKQ A; 2Y31 A; 1RKW A; 3OSG A; 2ELK A; 5E3N A; 9ANT A; 4FCY A; 2JA6 J; 3IH4 A; 3S17 J; 2I10 A; 2NVY J; 3CDL A; 2HOS A; 1ZKG A; 5C44 J; 4BXX J; 3IH3 A; 3RZD J; 2Y9Y A; 1ETQ A; 5IYB J; 1IJW C; 3PO3 J; 4V2G A; 2HYJ A; 1R9T J; 1H8A C; 4QTR A; 2D5V A; 3GTM J; 1JKR C; 3F0C A; 1NK3 P; 3JRD A; 5FKM A; 1ZTR A; 4MIM A; 3ZQL A; 2M8G X; 4A3D J; 3BTC A; 2R0Q C; 1B72 A; 4C3J J; 1JUS A; 3M4O J; 3GTQ J; 4D7M A; 4DZJ A; 4MLO A; 2EZH A; 4LOC A; 2R5Z A; 2ECC A; 5FJ8 J; 3QPL A; 1Z0X A; 1JGG A; 1IGN A; 5M3F J; 4S0H B; 1YRN A; 4M3D A; 2M9H A; 5M5Y J; 4MFE A; 4RBO A; 3TP0 A; 3LSP A; 4IHX A; 4B4C A; 1IRZ A; 2OPT A; 1MBG A; 1WCM J; 3DEW A; 5FKN A; 1BA5 A; 1AU7 A; 3I4M J; 3Q0U A; 1MNM C; 4A3F J; 1H89 C; 3HDD A; 1GT0 C; 3CQZ J; 2MG4 A; 3RQI A; 2K9Q A; 2Y0S N; 3VPR A; 3JRA A; 3GBG A; 2XGC A; 2VKV A; 2XB0 X; 3HOV J; 2DMP A; 2MGQ A; 3A01 A; 2B63 J; 4W97 A; 1CQT A; 3W6V A; 2DA2 A; 2EH3 A; 5F04 A; 1MBE A; 2NS7 A; 1MBK A; 2DA5 A; 4I6Z A; 3Q0V A; 3S1Q J; 1ZR2 A; 5EG0 A; 1WGX A; 1EF4 A; 2QCO A; 1A6I A; 1I3Q J; 2R93 J; 2L7Z A; 4V2F A; 1B8I B; 5C4X J; 1TWG J; 5IP7 J; 3TED A; 2CUF A; 1JKQ C; 1I50 J; 1X58 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BTI A; 1DP7 P; 3WTT C; 1OPC A; 2LYC A; 3KP7 A; 5JLW A; 3HUG B; 3D5L A; 4XRM A; 4ZYA A; 5KAF C; 5DS9 A; 4X0G A; 1QPM A; 5L3E A; 3W2V A; 3KX2 A; 1FWZ A; 5LEK A; 3ERM A; 4E4H A; 2ACJ A; 2J5O A; 1OIS A; 2G0E A; 2K4B A; 2KLO A; 3LST A; 2WC2 A; 2X6X A; 1JJ6 C; 2IRF G; 2O03 A; 1TLH B; 2PBI A; 3MMY B; 4PFP A; 1R5G A; 5HLI A; 1IXS B; 2I8D A; 2CSO A; 2L9N A; 2DDB A; 3K4L A; 1SMY F; 5F0F A; 3K6G A; 2V1N A; 3FXU A; 2CJJ A; 3P9K A; 2W48 A; 3WE3 A; 4Y15 A; 3RSN A; 4BL0 B; 4AIK A; 1BL0 A; 1S6L A; 2DMN A; 1T0F A; 2DFE A; 2Q2E B; 1X2M A; 3QU6 A; 2VBZ A; 3CLO A; 3GWZ A; 1Z05 A; 2L4A A; 1Z77 A; 2AQF A; 2MD0 A; 5HNH A; 1IUF A; 1J7K A; 2ZSI B; 2NVT J; 4XLC A; 1JTY A; 2E1M B; 2F4O B; 1XCV A; 3ZQH A; 3SQN A; 2ELH A; 2NAZ A; 3SJM A; 4RB2 C; 2RRE A; 3CME I; 4L5E A; 1AKH B; 3KIO A; 1WJA A; 4ENN A; 2VKE A; 1FY7 A; 1ZRD A; 2JA5 J; 4L18 B; 2KRH A; 1T95 A; 5J8C A; 3RZO J; 4F93 B; 5TIS C; 4Y4R A; 1G2H A; 4JOM A; 3J80 K; 2P81 A; 4UXN A; 5LRR A; 5CKT A; 4IF4 A; 5H6R A; 2IAI A; 2H8W A; 3QWL A; 4HQM A; 5JHF A; 1B8I A; 3DXJ F; 4CCO A; 1YYV A; 3I54 A; 2GXA A; 2LLK A; 2WY8 Q; 1LDD A; 2L7K A; 1JT0 A; 1T0F C; 5DCM A; 3AL0 C; 3R6S A; 2L9S A; 1RNL A; 2WTE A; 1YW8 A; 1IF1 A; 1ZQ3 P; 4BJT A; 3S32 A; 3TL4 X; 4II3 A; 2XUB A; 1BOB A; 5DM7 F; 2NVU B; 3DTE A; 4CO8 A; 1YHQ I; 1ITY A; 3IRQ A; 4JX5 A; 2CUE A; 4KJZ A; 3A1Y A; 3ZQQ A; 4DJA A; 4XON A; 1JUP A; 1JUM A; 2VN2 A; 1W7P A; 3LSR A; 3ZMV A; 2HXO A; 4RDU A; 2KZV A; 2WAE A; 3ZGK A; 3SDG A; 3TO6 A; 2CQ7 A; 2YSR A; 2CWE A; 3DF8 A; 1MMN A; 3FMQ A; 1JJ8 C; 3VYS B; 3PNY A; 3CMA I; 1TQP A; 2XPV A; 4N4N B; 4NDL A; 3TW6 A; 2ZJP F; 2A3S A; 3JCU C; 1HW2 A; 3WHC A; 2DYS H; 5E3O A; 2JT1 A; 1GDT A; 2VQG A; 2OTL I; 3TKY A; 3KP6 A; 1NH3 A; 1ETO A; 2Y2Z A; 2RQQ A; 3TDZ C; 3DU6 A; 3O6B B; 3HG9 A; 1QBJ A; 2HU9 A; 2HZT A; 4PK4 A; 4PJM A; 4RB0 A; 2GBY A; 4RGX A; 2K7L A; 3WGG A; 4EJV A; 3CCU I; 2M34 A; 1QO0 D; 2JMW A; 3MAJ A; 1B9N A; 3CCY A; 1YIO A; 2ZBK A; 5EGO A; 2DOF A; 3ABT A; 2JUC A; 5KCM A; 3V8J A; 4WX9 A; 1R1T A; 3ESW B; 4L9T A; 1YFH A; 3DEU A; 3CD6 I; 2M7A A; 1YOV B; 2EZI A; 3P7N A; 4NC8 A; 2NVQ J; 3FBI B; 1VQ6 I; 2O5R A; 3I5U A; 3KEO A; 2FE3 A; 2F2E A; 4M3B A; 4EGY A; 5FLX K; 4GRI A; 3EYI A; 1ZGW A; 4A3M J; 4HOB A; 3AG2 H; 1SFO J; 4XNF A; 1BOA A; 4KMF A; 5JLX A; 4KIC A; 3PQK A; 4LGW A; 1VQ8 I; 1D8J A; 2O3F A; 3F8F A; 4XN0 A; 1JTX A; 1DQU A; 4A5M A; 5IOZ A; 3CC2 I; 2R5Y B; 3HTS B; 2VOD A; 3VEP A; 1HSJ A; 2K4J A; 4FHT A; 2EIN H; 4KFC A; 2HWV A; 4HEA 2; 2HKX A; 1BI0 A; 5J1U A; 1ZRF A; 2HOA A; 1YW7 A; 2A68 F; 1OCZ H; 1GVJ A; 2UXN A; 2Q8K A; 5E1X A; 1S8N A; 2JQ7 A; 2BOL A; 2ZNZ A; 4BEH A; 2CGP A; 4XLH A; 1U8B A; 2XDV A; 3I71 A; 5E1Z B; 2F5F A; 4CYC A; 2KHM A; 1WI3 A; 1WQ2 A; 2WB1 N; 5EG0 B; 1F9N A; 1S7O A; 4BBR J; 1T38 A; 2L54 A; 1LQ1 A; 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3ZQF A; 3OR2 C; 5D8L B; 3M8F A; 1W4M A; 4BY1 J; 2A61 A; 5CLS A; 1ZG3 A; 2BYV E; 2OU2 A; 3N4M A; 2IS2 A; 2FML A; 3K69 A; 3FXK A; 4BS9 A; 1QVT A; 3W6J B; 1FTZ A; 1T33 A; 1D0X A; 2DMQ A; 1B4A A; 1TT0 A; 1K61 A; 1EH7 A; 1PUE E; 4ENM A; 4C30 A; 1T6S A; 2OZ6 A; 3DP7 A; 1BIB A; 2KRF A; 4GYG A; 3HHH A; 4EAT A; 3HC7 A; 5AIP A; 1BN5 A; 2XAG A; 3KLN A; 3FX3 A; 3FXR A; 3JTH A; 4DGW B; 4HSR A; 2EIL H; 4YFK F; 4A3I J; 3RYP A; 1UG2 A; 5F0H A; 2R5Z B; 3A0H C; 1D0Y A; 4HYE A; 1WI9 A; 2A6H F; 3J81 K; 4KN7 X; 4J01 A; 1GHC A; 4M6V A; 1ETW A; 1VQN I; 2ISZ A; 5IYD J; 2NXN B; 3JRH A; 1LPQ A; 2XF5 A; 3NAR A; 3U9G A; 3ZR8 X; 5E3M A; 2QBY A; 2IBD A; 4A93 J; 2E2H J; 1K6Y A; 5J47 A; 5D4S A; 1EH6 A; 5J3L A; 1U5T A; 2HTS A; 3U1K A; 2BW3 B; 4BKX A; 1ZHF A; 3M8J A; 3J7Z I; 5HDN A; 2V9K A; 2DTZ A; 4OOI A; 2L9R A; 1R4N B; 4CGZ A; 4PUS A; 4C2U A; 2EA4 A; 2DA3 A; 2F4M B; 4PDK A; 4IHV A; 1RI7 A; 3ZQI A; 1GVD A; 1FSH A; 4XOR A; 3HM5 A; 1GLN A; 4BBS J; 1W0U A; 1AOY A; 1UMQ A; 2FRH A; 2CUJ A; 1FIA A; 1MD0 A; 1P4W A; 1LE8 A; 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