The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
b'GSSGSSGKLHYKQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYVEGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKASGPSSG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of second PWWP domain of WHSC1L1 protein
rcsb |
| molecule keywords |
WHSC1L1 protein, isoform long
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
14
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature |
ec
2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase. |
| pdb deposition date | 2005-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00855 | PWWP | PWWP domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4Z02 A; 2GFU A; 1OZ2 A; 3OYF A; 3MET A; 3OYN A; 4C5E A; 4E7J A; 3PMI A; 3OYE A; 5IAY A; 2YRV A; 4BE2 A; 4BD3 A; 3OYM A; 3OYA A; 3OA6 A; 4GY5 A; 2O4X A; 5IN1 A; 2M16 A; 3NTI A; 4Q5W A; 3OS1 A; 3H8Z A; 1H3Z A; 5FRM A; 4HCZ A; 2QQR A; 3O8V A; 4BDY A; 4E7L A; 3E9F A; 4UC4 A; 3L2V A; 2NLU A; 2JTF A; 2RHI A; 3OYD A; 3PMT A; 2RHY A; 4BE1 A; 3SD4 A; 2FHD A; 3M9Q A; 3C4S A; 1N27 A; 2EQK A; 4II1 A; 4PLL A; 3GOX A; 3EAE A; 3MO8 A; 4QQ6 A; 2F5K A; 2GF7 A; 1WGS A; 1OYX A; 2L8D A; 2PQW A; 2L3R A; 4N4G A; 2RHX A; 3P8H A; 3FC3 A; 3DLM A; 4ZTJ A; 3OYL A; 5FRO A; 4PL6 A; 2B8A A; 5C6S A; 4IKF A; 3CEY A; 2R5A A; 4A4E A; 3MP1 A; 4QQD A; 4IUU A; 4E7H A; 5KCH A; 4IUQ A; 1SSF A; 2X4Y A; 5D6X A; 3MEV A; 3L2R A; 2GFA A; 2RI2 A; 5KCO A; 3LYI A; 1KHC A; 3OYG A; 2O4X B; 3OYB A; 3OYI A; 3QII A; 3OYJ A; 2RJD A; 5M9O A; 3OYK A; 2LCC A; 4C5G A; 2XK0 A; 4QW2 A; 3E9G A; 5D6W A; 2LVM A; 3FLG A; 2RJC A; 2E6N A; 3KUF A; 3MEA A; 1G5V A; 1WJS A; 4ZTF A; 4IUP A; 1OI1 A; 2X35 A; 4RG2 A; 3S6W A; 4B9W A; 2E5Q A; 3L2U A; 1WJR A; 4BE0 A; 2RI5 A; 4C5I A; 3FEO A; 3BDL A; 3FDR A; 4CRI A; 4IUV A; 3QJ6 A; 3MEW A; 2DIQ A; 2IG0 A; 5J39 A; 4A4F A; 2HQX A; 3ZEH A; 3LLR A; 2WAC A; 4FU6 A; 4N4H A; 2XDP A; 3QBY A; 2RHU A; 1MHN A; 2R58 A; 3OMG A; 2BKD N; 2HQE A; 3DB4 A; 4C5H A; 2R57 A; 5KE2 A; 1WJQ A; 2M0O A; 5KE3 A; 2RHZ A; 3L42 A; 3OYC A; 3L2Q A; 3S3M A; 3DB3 A; 2R5M A; 3MEU A; 4N4I A; 4EDU A; 2K3Y A; 2VYT A; 4L59 A; 3QKJ A; 2DIG A; 2LTO A; 2L89 A; 2P0K A; 2RJF A; 2BIV A; 3OY9 A; 2EKO A; 2D9T A; 2M1H A; 3MP8 A; 1RI0 A; 3NTH A; 5CIU A; 2RJE A; 4A4H A; 4A4G A; 3LX7 A; 2X4W A; 2RO0 A; 2EQU A; 2K3X A; 3ME9 A; 4QVZ A; 3OQ5 A; 5KH6 A; 5FRN A; 2X4X A; 3NTK A; 3UWN A; 2LRQ A; 4E7I A; 4QQG A; 3F70 A; 3L2W A; 3S3O A; 3OMC A; 2DAQ A; 4X34 A; 4E7K A; 2MWP A; 3LGF A; 4LD6 A; 4B9X A; 4BAC A; 3UT1 A; 2EQM A; 3LGL A; 2EFI A; 2BUD A; 2CKK A; 3OB9 A; 2JZ2 A; 3H6Z A; 3Q1J A; 2QQS A; 3OS2 A; 2EQJ A; 1XNI A; 3OS0 A; 3OYH A; 3LH0 A; 3ASK A; 3PNW C; 4IUT A; 4FL6 A; 4PLI A; 2G3R A; 2MWO A; 5D6Y A; 5J26 A; 4BDZ A; 3S3N A; 4OVA A; 2RI3 A; 4IUR A; 3PFS A; 3P8D A; 5C0M A; 1OZ3 A; 4NS5 A; 2LDM A; 3MP6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GFU A; 1X6G A; 1Q86 R; 1KIK A; 3MET A; 1OUL A; 3RBB B; 3M5A A; 4GY5 A; 1I07 A; 5FRM A; 5GAN h; 2YWW A; 3PE0 A; 4AFZ C; 4HXJ A; 4EMG A; 1VYU A; 5LJ3 j; 3NHN A; 1KC8 R; 2CZ6 B; 4PKC C; 1QCF A; 3CCS A; 2GBQ A; 5D7U A; 2CP7 A; 3VV0 A; 4MML A; 3DLM A; 2CZ1 B; 1AZE A; 2DL8 A; 1MMN A; 3CPW A; 4DEX A; 3CCM T; 5LJ5 f; 2RQU A; 4PK4 A; 1WX6 A; 5GJW B; 4JS5 A; 1UE9 A; 2COZ A; 2P4R A; 4YTL A; 2O4X B; 1I81 A; 1WYX A; 3TVT A; 2L3P A; 2XG8 D; 4C8Q F; 1SSH A; 4GLM A; 3E9G A; 4C92 C; 1GCQ C; 2CZ0 B; 1ZUU A; 1TUG B; 2YDL A; 2RA2 A; 4M7A C; 1AT1 B; 1VQ9 T; 5LJ3 d; 3QO3 A; 3FEO A; 5I2M A; 2LNV A; 1Y7X A; 1X6O A; 2LQN A; 2IVW A; 3G6E A; 3CCL Q; 5L8R E; 2KRN A; 4QVD A; 4J7I A; 4JUV A; 1N8R R; 3EGD A; 1ZSG A; 1BKB A; 1WJQ A; 2M51 A; 2M0O A; 2MCN A; 4C92 E; 1WFW A; 1VOM A; 3L2Q A; 5DM7 R; 2DEU A; 3DB3 A; 1YIJ A; 4M7A E; 3I55 A; 3CC4 T; 2A0F B; 5GAM d; 2KRM A; 4M7D F; 2DET A; 1PNJ A; 1OOT A; 2DYI A; 2RH2 A; 2EYY A; 4PJO A; 2DVE A; 1SHG A; 2LRQ A; 3F70 A; 4R55 A; 2E4H A; 4E7K A; 5DLO A; 1UTI A; 1SRM A; 4JZ3 A; 2NUT A; 2LQW A; 1V76 A; 7AT1 B; 1GFC A; 5A0D A; 2E64 A; 3P8D A; 1VQK T; 3HP9 A; 2KMT A; 1YI2 T; 4LUE A; 4C5E A; 1YFN A; 2E3I A; 2XDD A; 1H3Z A; 3CCE Q; 3SDZ A; 4OB0 B; 4RTX A; 1AZG B; 3M4Y A; 3CCM Q; 3PMT A; 1E7O A; 4RTY A; 2PTK A; 4CC3 A; 4II1 A; 1H8K A; 1ZUY A; 1WHK A; 5GMK l; 4N4G A; 2XID A; 3HFO A; 1W6X A; 2QG9 B; 1WHL A; 4A4E A; 1KQ1 A; 1K9M R; 5FW9 A; 1VQ9 Q; 1KFZ A; 4XTX A; 1I4K 1; 1C6V X; 2WSE E; 1VQL A; 2KAF A; 1IHW A; 5GAN 8; 2JN0 A; 1M5Q 1; 1QCO A; 1Q7Y U; 3QYH B; 4C0F A; 2LVM A; 2EYW A; 3MEA A; 1ZA2 B; 1OI1 A; 4C8Q G; 1Q81 C; 2ED0 A; 3CC4 Q; 1TH7 A; 4JJD A; 2EQI A; 2XDP A; 3QG1 A; 3DB4 A; 4JJC A; 3CME Q; 5KE2 A; 3HL8 A; 1NLO C; 2GNC A; 2YXY A; 3CC7 T; 1IRX A; 2F2X A; 2GQI A; 1SG5 A; 4RTU A; 3QKJ A; 3EGX A; 4RUG A; 3L1A A; 4XK8 E; 3CXC S; 2RJF A; 3GF5 A; 4DOV A; 3OW2 S; 3JCM b; 3UA7 A; 1VQK Q; 2ZPB B; 4M7D G; 1YI2 Q; 1GXI E; 3VS0 A; 1T0H A; 1QQJ A; 1R77 A; 3OS2 A; 3OYH A; 3JCM c; 4X9C A; 5GAO n; 5IHI A; 1KQS S; 1VQP Q; 1U3O A; 2LCS A; 4C8Q B; 1ABO A; 3OA6 A; 4E7Z A; 3EG1 A; 2EJG A; 4PJO D; 4EMK A; 3JCM P; 2DEQ A; 1E6G A; 1BI2 A; 1DJ7 B; 2BE7 D; 4DBQ A; 1I5O B; 5GAN 6; 2DO3 A; 1GBQ A; 2H3J A; 2PQW A; 2QTV A; 1D1C A; 1VQ6 A; 1BCM A; 3CCS T; 2J06 A; 4ZN1 A; 2D6F A; 2OTJ A; 1D1A A; 5LJ5 g; 4OMP A; 1VQO A; 5GMK i; 4IUQ A; 1SSF A; 5HK0 A; 5FU6 B; 5KYX A; 3OYB A; 1RLP C; 3NMZ C; 4M7D B; 2E6Z A; 1X01 A; 3CCQ T; 2QEX T; 4C0D C; 3L2U A; 1K0S A; 1X2Q A; 3CC7 Q; 4TVR A; 5GAN 5; 1Z9Q A; 1ABQ A; 2EGA A; 3VS5 A; 4HA8 A; 2P84 A; 4FU6 A; 4MZP A; 3VJP A; 1FXX A; 4C92 A; 2CP5 A; 2MI6 A; 3CXC P; 2L2P A; 4M7A A; 3RKY A; 2RHZ A; 2EYZ A; 3CCR A; 1YHQ T; 3MEU A; 3OW2 P; 1QMC A; 4BY6 B; 1CKA A; 1SKU B; 1LJO A; 3MKD A; 3INZ A; 5LJ3 f; 1GFD A; 1S1N A; 2RJE A; 2CUB A; 4A63 B; 5IXB A; 4E7I A; 4QQG A; 1ACM B; 4WF2 A; 4LD6 A; 1IB8 A; 4O6J A; 1BI0 A; 1VQM T; 1QVG S; 1H3H A; 3EFR A; 5EG2 A; 2G3R A; 2CSQ A; 4PNO A; 2M02 A; 4IUR A; 4M75 A; 1VQ8 A; 5GAM f; 5GAN 2; 1TG0 A; 1PD0 A; 4Z02 A; 1H92 A; 1S72 T; 2JOY A; 3CCS Q; 1VQ7 T; 3O8V A; 1D3B B; 4OGC A; 1WHM A; 2JTF A; 4K11 A; 5I21 A; 3KBG A; 2QDL A; 2ZPH B; 2FHD A; 4JJN K; 2YUN A; 3M0U A; 1C1A A; 1NM7 A; 2F5K A; 4Z89 A; 3I5S A; 4N0A C; 4CC2 A; 1RAH B; 3JB9 D; 1X43 A; 2QEX Q; 3CCQ Q; 4LDY A; 1BK2 A; 1UG1 A; 3LWI A; 5D6X A; 2CT4 A; 2H8H A; 3CMA A; 5KCO A; 4M77 C; 1WA7 A; 2LT4 A; 1BYM A; 3LYI A; 2ED1 A; 1ZUK A; 1TUC A; 2RB6 A; 3VRZ A; 2A36 A; 2XK0 A; 4F04 B; 1YJW Q; 1NJI R; 1OU8 A; 5GAN g; 2E6N A; 2YSQ A; 1W2B S; 1I1J A; 4RG2 A; 3X20 B; 1YHQ Q; 4LE9 A; 2HZY A; 4RTV A; 3RNJ A; 4AT1 B; 3CBM A; 4M77 E; 2EJF A; 1X2K A; 1IGU A; 3SWN B; 1JO8 A; 1TXQ A; 2Y4X A; 1I5L A; 5IHK A; 1K8A R; 2VC8 A; 4EDU A; 4F14 A; 2RD1 A; 2DIG A; 5LL6 S; 1PC0 A; 2CRE A; 1VQM Q; 5CO7 A; 2EKO A; 4OF1 A; 4A4H A; 4QKU A; 3PT9 A; 2K3X A; 1QVG P; 4QVZ A; 5CKH A; 2LQ8 A; 2OTL A; 4X34 A; 4PJM A; 4KUD K; 3CC2 A; 1S72 Q; 2O9S A; 1VQ7 Q; 3CCJ T; 2K79 A; 4M7A D; 4P5N A; 2JXB A; 3S3N A; 2ZAE A; 1QKX A; 1QVP A; 3I5R A; 3PMI A; 4RTW A; 4XTW A; 3NTI A; 4Q5W A; 2C0O A; 3M59 A; 4KRT A; 3OW2 A; 3AT1 B; 4J9H A; 3QWY A; 3RUX A; 2JMC A; 2E41 A; 3URG A; 3GOX A; 3N5B B; 2ROT A; 5KYY B; 1AHJ B; 3V8L A; 3OYL A; 2FEI A; 2LQK A; 4JLI A; 2R5A A; 1KQS A; 2B86 A; 2ESW A; 2C0I A; 1YJN T; 2DL7 A; 4E7S A; 1VQO T; 1W2B P; 1UGV A; 5M9O A; 4LNP A; 2PZ1 A; 2FZC B; 3JCM h; 1WDX A; 3RR6 A; 1IHV A; 4DOW A; 1NG2 A; 3M0Q A; 3S6W A; 1PRL C; 5GAN d; 4PFO A; 3ZEH A; 2V1Q A; 1M90 C; 2LX7 A; 1N5Z A; 3QBY A; 1OPL A; 3OMG A; 2CZ7 B; 2VGM A; 2YHT A; 1QVF S; 2JVV A; 2CSI A; 1RAD B; 1X69 A; 4JLG A; 3OS5 A; 1W4S A; 2KDS A; 1SEM A; 2YUP A; 5CKE A; 2K6D A; 3CCJ Q; 2D9T A; 2M1H A; 3PIO A; 4RTT A; 2NUP A; 3EH1 A; 1MUZ A; 4XU0 A; 2X3X D; 1YWO A; 1PM3 A; 3L2W A; 2VGN A; 4CC4 B; 1RUW A; 3OYY A; 3HPW A; 4OB1 B; 2EQM A; 2AT1 B; 2KI7 A; 1M90 R; 5CAI A; 1FYN A; 4ANJ A; 4FL6 A; 2RN8 A; 1JXM A; 1Q86 C; 5C0M A; 2LNH B; 1M1K R; 2DXT A; 5EC7 A; 4HCC A; 1VQ8 T; 3LW5 E; 1PSF A; 2HNI A; 4LN2 A; 3RMQ A; 2QQR A; 3TQ7 P; 1KC8 C; 1QLY A; 2XKO C; 2ZZD A; 2HBP A; 2JMA A; 2NLU A; 2DL4 A; 3CPF A; 4AFU C; 3CCU T; 5L23 A; 1YJN Q; 4M78 G; 2DX1 A; 1VQO Q; 4NL2 A; 4LUD A; 3OBY A; 2QGG A; 1WXU A; 2KRO A; 2DVJ A; 1P92 A; 2L3R A; 4A53 A; 1ZSZ A; 1QVG A; 5HY6 A; 1Y96 A; 4L6V 5; 1B34 A; 1AD5 A; 2P0Q A; 4C92 F; 2B8A A; 2XD0 A; 4IKF A; 2VKN A; 3EG0 A; 3MP1 A; 4J9C A; 4IUU A; 4M7A F; 2KXD A; 3LH5 A; 1HJD A; 1KQ2 A; 1YIT A; 3SFM A; 1G3T A; 3R6O A; 4EPC A; 4QW2 A; 4N0A A; 1G5V A; 2F1L A; 3MHX A; 4Z8A A; 4FYW B; 1MMD A; 1FMW A; 2CH4 A; 4BE0 A; 3JB9 I; 1QVF P; 3FDR A; 3QJ6 A; 2AZS A; 1Q81 U; 1N8R C; 2DLP A; 4JRQ A; 4VUB A; 1YP5 A; 2K5L A; 2R58 A; 2JTE A; 3I56 A; 4M75 F; 3L42 A; 3ZL7 C; 2VYT A; 2FG0 A; 1QP2 A; 2W0Z A; 5GMK e; 1G2B A; 1BU1 A; 4M78 B; 1IO6 A; 1MMA A; 1R0B G; 4J83 A; 3UPU A; 2X4X A; 2QA4 T; 1JBM A; 3JCM e; 5HKC A; 1W2B A; 4BAC A; 4AMC A; 2OAW A; 3H0H A; 2OTL T; 1Q82 R; 3M4G A; 2EQJ A; 3L2Z A; 1VQ5 T; 2I2L A; 3O5Z A; 2LMJ A; 3PNW C; 5FWB A; 3J7A F; 1VQ4 A; 5FU7 B; 3J80 E; 1G3S A; 2LDM A; 5I2S A; 3CCU Q; 2JW4 A; 1M1F A; 1JJ2 P; 1UB4 A; 3G71 T; 3PTA A; 5IAY A; 1AEY A; 3DLL A; 4A54 A; 3MCA B; 3G4S T; 4PFZ A; 2ZPF B; 5KYW A; 1NPR A; 3RES A; 1AVZ C; 3SEM A; 2RHY A; 4X1V A; 2VXE A; 3A8M B; 4F7U F; 1UEC A; 3ZFJ A; 1PD1 A; 1JQQ A; 2GCX A; 3RDV A; 2MOX A; 1NYG A; 3A8L B; 4PJJ A; 4J9E A; 1K9M C; 3UAT A; 3H0F A; 1HSQ A; 2PVD B; 1YBY A; 4C8Q C; 2D8J A; 3CCV T; 2EGC A; 2FVU A; 4C92 G; 3UA6 A; 3MJX A; 5A0L A; 3OYG A; 4A4K A; 3I35 A; 2CT3 A; 4MZT A; 1I8F A; 4JPB W; 2DMO A; 4EMK B; 2RJC A; 3WVE B; 5CCA A; 1M4Z A; 4BB7 A; 1ARK A; 3M58 A; 2EW3 A; 2LZ6 B; 2KRS A; 2O01 E; 4C8Q E; 2E65 A; 3P8B B; 2JT4 A; 2CUD A; 2QDY B; 1M2V A; 4A4F A; 3JB9 H; 2A3L A; 2DYB A; 5FU6 C; 2DA9 A; 1BIA A; 1D09 B; 2MYS A; 2QA4 Q; 4M7D C; 3PVQ A; 2DM1 A; 2EVR A; 3EG9 B; 3H41 A; 2CP0 A; 2OTL Q; 2AIR B; 4M75 G; 3NPF A; 3OY9 A; 5GAN f; 3MP8 A; 1VQ5 Q; 4J9B A; 4A4G A; 2A37 A; 3GP8 A; 3E19 A; 4ATO A; 4XTY A; 4BI3 A; 4LD9 K; 5KH6 A; 1UDL A; 4M77 D; 2K9G A; 3G71 Q; 1AWO A; 4M7D E; 3UT1 A; 4DA4 A; 1X27 A; 1IZ6 A; 1ZA1 B; 4C92 B; 3G4S Q; 5J26 A; 2RQV A; 2KBT A; 4KGZ B; 4BY6 C; 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