2DJKA

Solution structure of the b' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
133
structure length
133
Chain Sequence
GPLGSPLIGEIGPETYSDYMSAGIPLAYIFAETAEERKELSDKLKPIAEAQRGVINFGTIDAKAFGAHAGNLNLKTDKFPAFAIQEVAKNQKFPFDQEKEITFEAIKAFVDDFVAGKIEPSIKSEPIPEKQEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of the b' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
source organism Humicola insolens
molecule tags Isomerase
total genus 19
structure length 133
sequence length 133
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2djkA01
1GSEA 1GH2A 2H30A 1EV4A 5IMCA 1SL2B 4P3YB 1K3LA 3UOMA 3C1RA 3D4MA 1H75A 1O85A 3P2AA 1OC3A 2IMFA 1AAZA 2VO4A 3D6IA 3CSIA 1ERUA 4HZ2A 3IK9A 5IIZA 3MWHA 3HJPA 2XBIA 4K7NA 4POMA 3KEBA 3HY2A 4ID0A 3KM6A 1HNCA 2WDUA 2IMEA 2JSYA 2N5BA 4NWYA 2H19A 4J57E 3N5OA 4I2UA 4MZCA 4ML1A 1F6MC 4HI7A 2IFQA 3GN3A 4NV2A 5ECIB 1V57A 2KOKA 1VGLA 3GIXA 1MDJA 2FWEA 5LCZA 2H72A 3DGQA 3TGZA 3F3RA 5B6MA 5HR0A 1JLWA 3VLNA 3C1SA 2PBJA 4TR0A 2HRNA 4MJCA 3V1WA 5B6NA 2E7PA 4E8EA 2HFDA 1FB0A 5GAND 3Q6OA 4K7IA 5DCHA 5KN0A 1TKDB 1YEXA 2B1KA 3CTGA 2WULA 4IELA 3KIJA 3VWVA 5HFKA 2OE0A 1FG4A 2M46A 2VCXA 4KH7A 3HJMA 2C0GA 4EE0A 1TK5B 3GX0A 4O5RA 3A2XA 4YQMA 5EPFA 2D2ZA 3GH9A 3WGXA 3S9FA 1B8XA 3TOTA 5AGYA 3O6TA 1M9BA 1S3CA 10GSA 3GYKA 4MPGA 1GSQA 1EP8A 3EMPA 4RI6A 2RM6A 4IQAA 4K6XA 4ZBDA 3HVXA 1IYHA 4NXIA 1K0OA 1PX6A 3Q19A 2C80A 2RLIA 2RUFA 4TKYA 3GKMA 4I6XA 4OD7A 5D9WA 3MAKA 2IN3A 20GSA 1JZWA 8GSSA 2VLTA 4O7HA 1ZZYA 3CRUA 4KCEA 3GTUA 1HNBA 2L59A 2DBCA 3CMIA 1FW1A 5ECLB 4NAXA 5DQSA 2IL3A 2X8HA 18GSA 3DRNA 2O8VB 2QSIA 2HXKA 5B8AA 3L9VA 1DSBA 1Z3EA 3RPNA 2CA8A 2I3YA 1M2AA 2GQLA 5L71A 4QQ7A 2YCDA 4K7OA 4LL1B 1THOA 3H93A 1TXXA 1UC7A 3GMFA 4GWRA 2HT9A 1I9DA 2IMIA 1SYRA 1PX7A 2O85A 1OC9A 3ZIVA 2X8CA 1DUGA 1H4OA 5ECPB 2DJ3A 5ECOB 4PQIA 5FHIA 3VWUA 2L6CA 3GKNA 2WZ9A 1TTZA 3LYKA 4K0NA 1TK8B 1K0BA 1WWJA 1KNGA 5EVOA 3TRPA 1TP9A 3IRAA 3HHVA 4Q5RA 2H1GA 5G1KA 2FNOA 2VAFA 2B3SA 3APSA 2C0FA 1R4WA 3PGTA 2HLSA 1X9WB 4HOJA 2A2SA 2R2JA 2GLRA 4GSSA 5DBQA 4IJIA 3RHCA 4PQHA 1TJDA 1T4YA 4FYBA 1GL8A 2OADA 1GSSA 1T4ZA 1N2AA 2H1BA 4OO4A 4HQSA 5JWOB 1FO5A 3UIWA 4G2EA 1K3OA 4XTSA 1PA3A 4HU9A 2REMA 2QC7A 2KLXA 3TKPA 4XRAA 4I97A 1X9MB 3ZZXA 2B6MA 5CP1A 1B48A 3IR4A 3TJKA 1R7HA 2H0HA 2YWOA 1FOVA 2I81A 1B4PA 2O7KA 3DVWA 2DJKA 3PH9A 3KD0A 4POBA 1XZOA 2VD1A 3UAPA 4F03A 3TDGA 2V41A 3LXZA 4K0GA 3QAGA 1GUMA 1PMTA 1XXUA 2EIOA 3JCML 3F4TA 4F0BA 2AAWA 4GXZA 5J9BA 2B5EA 3TKSC 5GSTA 4EUYA 5CO3A 2JL4A 4K9ZA 5G5FA 2AYTA 4ZIJA 1YY7A 3HCZA 1TU7A 4RQRA 2BMXA 2ON5A 2ALBA 3ERFA 3KJYA 2YZUA 3L9SA 2DIYA 5IMDA 22GSA 3FRCA 4EXJA 3ZFLA 4HU7A 4QL7A 1YJ6A 2H73A 2IFQB 5HR2A 1AC1A 2EIQA 5A4UA 5IMVA 1YEPA 4MA9A 2K8SA 3ISOA 2LQOA 4EL1A 3P7XA 2PPTA 2DMLA 2V6KA 3IK7A 2VCVA 3KH7A 2WFCA 4ZXGA 4V1Ap 5D73A 4L0UA 5E4WA 1GTIA 2K9FA 2LQQA 3UEMA 4LMWA 3K8NA 3C8EA 3F3QA 5IOWA 2KUCA 4KSOA 2RUEA 2DLXA 2AHEA 4NHZA 3L0HA 4AJ6A 1ZGNA 3KP8A 1ERTA 3I6AA 3FKFA 5G30A 4O92A 4CHSA 5IMFA 3HZ8A 2BJXA 1GSDA 4ZB6A 1O7UA 1GUHA 2H8LA 1OE8A 1GSFA 1C72A 1J08A 1FAAA 4JR4A 2ZUPA 1BQ7A 3UJ1A 2GQMA 3EURA 3LORA 4KE3A 2DJJA 4GTUA 3W8SA 3GSTA 1ACVA 4FYUA 5ECRB 1MD3A 1A23A 1X9SB 1SD8A 1JFUA 2YPMA 2CX4A 2PVOC 4KA0A 2GZYA 1XPVA 2VD0A 1VF1A 2I4AA 1OKTA 1WIKA 5ABRA 4QL9A 4OO5A 2DJ2A 14GSA 4POLA 1RW1A 4WBRD 5F06A 4GCIA 2I9HA 1CQHA 1YKAA 2XHFA 4Q5FA 3GFKA 2K8VA 3KXOA 3L78A 3APOA 4TXVA 5A5KA 2FD3A 1SU9A 4IGJA 1QFNA 4XHMA 1PKWA 1ZYEA 2DMMA 2J9HA 3US3A 5G1LA 4LMVA 1ERVA 4GQFA 2MBTA 3GX8A 3H79A 4Z7XA 3IPZA 3LXTA 5JCUA 3RHBA 3DXBA 1F3AA 3KH9A 4OWYA 3W6GA 2MBSA 2YANA 1A24A 4G10A 3DVXA 1GNWA 1CQGA 5DDLA 2K6VA 2OBIA 4XIHA 4JE1A 3LG6A 1PN9A 3QDNA 1E6BA 4OFNA 4IVFA 3ZREA 2RIIA 4IP6A 4ULXA 1DE2A 1HNAA 1B9XC 1EWXA 2H6XA 4MP4A 4FH8A 4N0ZA 4F82A 5A4WA 1WRYA 3IOSA 3CXGA 5J4UA 1NHOA 3KP9A 3EU4A 5IOXA 1ST9A 1JHBA 1DE1A 1AW9A 1OC9B 4V2NA 4MLYA 1PRXA 5LNKe 1TRVA 2GZPA 3LGCA 1TRUA 2K18A 1XFLA 2CQ9A 2HNLA 2VCWA 4GSNA 3QPMA 5CRDA 1PL2A 3GNJA 2GTUA 3GKKA 4I2TA 4V2MA 2VLUA 3LWAA 4MJEA 5JCWA 3IDVA 1LBKA 1JLVA 2IJYA 3VWXA 5DVBA 6GSXA 1K0DA 3P8WA 4XS1A 2M80A 3IA1A 2Z9SA 4F2IA 1PKZA 3EYTA 2C3NA 2OE3A 1YF0A 2O87A 4RQXA 3C7MA 1S3DA 2YWNA 5H5SA 2VCQA 1F37A 2JACA 3GSSA 3Q18A 1U3IA 1HQOA 3E3EA 4V1Ag 3EINA 1B9YC 5D93A 2GGTA 1NSWA 1XOAA 2HYXA 3CSJA 2R6KA 2HSYA 4DSRA 3D5JA 2YWIA 5FWGA 3VK9A 1SK2A 4TR1A 2VL9A 2G2QA 1GWCA 1BX9A 3F6DA 1A0RP 3M9KA 3G9BA 4XS4A 4KNDA 1TDIA 2G0FA 3WT1A 4ZL7A 4Q5QA 4X43A 5CRWA 4G9HA 2GSSA 3G7JA 5IPGA 1OAZA 3FZ9A 4IN0A 4PNGA 2AJQB 3IV4A 2MMOA 3GHAA 5J9CA 4TN8A 5G31A 6GSSA 2KHPA 2YNXA 2DC5A 3GL3A 1JZOA 3KMNA 5ECMB 2L5LA 4L5OA 5CRGA 1A0FA 16GSA 2YJ7A 5JWRB 1XWAA 4TW5A 1AXDA 1Z9HA 2VCTA 4IJ3A 3J7Yb 2C1YA 3EU3A 1K0CA 4PGTA 1A2MA 3CTFA 4HZ4A 2ON7A 1PD21 3F9UA 2CZ2A 2FWHA 3D4TA 3NZNA 2GS3A 1WMJA 2C8UA 3QR6A 4EKZA 4EF0A 3M8NA 5CREA 4JU5A 1J9BA 2MZCA 5CNWA 1M0UA 2LV3A 4K2DA 2TRCP 5GAPD 2JZTA 1T00A 4KDXA 4DVCA 2LSTA 1A2JA 3ZLPA 4BPYA 5ID2A 2L4QA 3E9JB 1YZXA 5G5EA 2TIRA 5D96A 3D0ZA 4ECBA 1FVJA 3IE3A 4POKA 1VF4A 2R5GA 3FEUA 4I8BA 4J56E 4MF6A 4JZQA 3IAS2 1ZOFA 4G19A 2YP6A 1KEBA 1M2BA 5GZZB 5H5RA 3M3MA 2QKEA 4YH2A 9GSSA 2DJ1A 1EV9A 1OYJA 1KTEA 1A8YA 2HZFA 2ES7A 5DAKB 3AY8A 3UL3A 3DIEA 4IS0A 3F6FA 3GA4A 1PL1A 3CYNA 2F8FA 1M99A 3TKRA 3A5WA 2CAIA 3DWVA 3I9V2 3O3TA 4MF7A 1G6YA 1PGTA 4J2FA 12GSA 3BBYA 2JU5A 1GSYA 3P90A 2NBSA 5CRHA 5HFGA 2XPEA 4I5QA 1WE0A 2FUG2 1GTAA 4EDYA 3KGKA 2NPBA 4HS1A 4MDCA 4ZILA 2IWTA 4N10A 5FT3A 3WD6A 2XBQA 11GSA 4DSSA 2C0EA 3HYPA 2DSAA 5IM9A 1DBYA 1JZDA 2GSQA 2LJKA 2C3QA 3KMOA 17GSA 3ZTLA 1TI1A 3TUEA 2E0QA 5ELGA 1O81A 4KX4A 1V40A 2B5XA 1N8JA 3ME7A 3IAM2 4PNFA 2OACA 2V1MA 2FA4A 1AQXA 4WXTA 2HSHA 1T8EB 1GTUA 3QD9A 5CYYA 4HJ2A 4TR4A 3VFIA 3G7IA 2LRNA 3GRXA 2CVKA 5ECKB 2RM5A 1GUKA 2PGTA 2VL2A 2IMDA 2CZ3A 1QXHA 4MF5A 2GT6A 2OJLA 4BVXA 3R2QA 1SK1A 3APQA 1GULA 1NHYA 3TKSE 3F0IA 3HA9A 2H6YA 5DCGA 3MNGA 4KDUA 2OKAA 3I69A 1YKCA 2X99A 2XPDA 3IBHA 3UBLA 19GSA 3WGDA 2LRCA 4MZWA 1O73A 2WCIA 2H75A 1EGOA 1M2DA 3F8UA 3NIVA 1K0AA 3Q74A 3HZ4A 3GV1A 4HUAA 4IP1A 4RUVA 1XWKA 4ZBBA 1TW9A 3ZVJA 1BAYA 3G7YA 5IPHA 3KTLA 4F9ZA 4TRXA 4OFMA 2BTOT 2GQKA 2PMTA 3ZVJD 2PWJA 3QFBC 1AQWA 4KGIA 1GRXA 4MH2A 3QAVA 4MZBA 2MMNA 1MDIA 1T7PB 2FLSA 1TOFA 5HFIA 5CAXA 4MJBA 2LJAA 4AJ8A 2P0GA 4ZL8A 2NVLA 4ACSA 1Y6EA 1I5GA 4FYCA 5DAKA 2YOIA 4JR6A 3LEFA 1SYXA 1NW2A 1EOHA 2VM2A 1JZRA 3QCPA 5INYA 3VURA 1GP1A 1ZMAA 2H74A 4TR1B 4L5LA 1GLPA 1SKWB 4XS4B 1MEKA 2H0IA 3FY7A 1TRSA 2F8AA 5ENUA 2PU9C 2C4JA 4JRRA 1IYIA 1GTBA 2FWFA 6GSWA 2VL3A 4WBJA 1ERWA 4IW9A 4K8MA 2IPAA 4PXOA 4ZB9A 3ZIJA 3UVHA 1Z6NA 13GSA 1G6WA 4GF0A 3HDCA 2B7KA 3VWWA 2LTKA 4N30A 2L6DA 2GSRA 1EOGA 4ECJA 1EZKA 3OR5A 3GKXA 4AF2A 2YWMA 4X1UA 1GNEA 5ECQB 3IHQA 1FB6A 1Z7PA 4MK3A 3H1NA 4IKHA 3O76A 2GDRA 3F4SA 1VF2A 4GRFA 4PX1A 4KW6A 5A4VA 6GSUA 2X8GA 1URMA 2VCZA 2P5RA 5AIXA 1XWBA 3TOUA 3H8QA 5AIVA 4GLTA 5DALA 2PUKC 1ML6A 1UN2A 5ID2B 4KDYA 1WP0A 2AV4A 5DJLA 3TRQA 2KP2A 2YZHA 4OMVA 1RQMA 5D8IA 4YAPA 4KSMA 5LD0A 2LRTA 5KEJA 2F51A 2MYGA 4DEJA 1SK0A 1RK4A 1OVNA 1X5EA 2FWGA 1QUWA 3H4KA 2CX3A 3U5RE 2R3XA 1U88A 1Q4JA 1B4QA 1ZYQB 5GSSA 4XS6A 2B7JA 2JADA 3DKSA 2JZRA 1NM3A 2YJHA 2H0GA 3EVIA 1A8LA 5G2ZA 4YQVA 1Z7RA 1F9MA 1MD4A 3WT2A 4Q5NA 3ZFBA 5IO0A 2FGXA 4MH3A 5EY6A 5HR1A 1EGRA 4TVEA 1G0TA 1XWGA 3MSZA 1SJIA 2FA8A 4ZB8A 2NDOA 4MABA 1BEDA 3UBKA 3UMAA 3HVVA 4LLRA 4YQUA 4ZL9A 4DSSB 1XVWA 7GSSA 3IC4A 2HE3A 2WRTA 2P5QA 2XC2A 1PSQA 1U3AA 1GSUA 4OCFA 2FHEA 3KZQA 5E59A 3BOAA 4MMMA 4O32A 4HDEA 2MMZA 1BG5A 3TJJA 1YF1A 2IIYA 4H86A 3TRXA 4RI7A 1OKDA 5ECHB 2CAQA 2VOCA 3M9JA 1SD9A 3EMXA 1K0MA 3FZ5A 1XBSA 2R4VA 1XW5A 4L0WA 1T1VA 2B5YA 1G7OA 1R5AA 1O8XA 2KP1A 4EDZA 2PERA 3CRTA 5B8BA 1G7EA 2HRFA 3FYGA 1S3AA 2HZEB 4HEA2 4TXOB 6GSVA 2O89A 2AUVA 1V98A 4ECCA 1SKSB 4E8HA 2CVDA 3EE2A 5COHA 2WS2A 3ZMKA 4AGSA 1XWCA 1OC8A 1K3YA 5F07A 1XCCA 5HR3A 2DIZA 3F63A 4D73B 3HVSA 3GUSA 2ZCTA 4WETA 1U6TA 5ELAA 2WB9A 3I43A 1SJZA 5KN2A 2R37A 4WKWA 1M7TA 1HD2A 2GVPA 3BCKA 3VI5A 3EWLA 1AQVA 3L4NA 2LJRA 1J0FA 3ME8A 1K0NA 2YV7A 2A4VA 4JBBA 1QK8A 3LQ7A 4CDOA 5AISA 3BJ5A 4IHUA 1EEJA 3SWLA 1X5CA 4PUFC 1ON4A 4NHWA 2E2GA 1QQ2A 4WR4A 1QGVA 2IMKA 4FO5A 4ZBAA 1Z5YE 3ERWA 3VPTA 5J41A 1LJRA 5JCGA 1X5DA 4OFTA 3FR3A 3HJOA 3HD5A 3ZMLA 2VL2C 4CW9A 3DMLA 3A3TA 5D9TA 3TCOA 4ILFA 2NTOA 1WPIA 2QGVA 4ISDA 5F05A 4XRDA 2H01A 3VI7A 3L9UA 1SL1B 1ILOA 3EC3A 4EC0A 2VM1A 4GSTA 1KBNA 3TB2A 1WOUA 1W89A 2OA7A 4XCSA 2MMAA 3TJFA 1A2LA 4KCAA 1FHEA 4ML6A 1EEMA 3LSZA 3RDWA 1V2AA 2L4CA 1XW6A 1T3BA 4N11A 5IMAA 2EIRA 3ZYWA 3FW2A 4PQ1A 1QMVA 3A2WA 1YQ1A 5B7CA 3RPPA 2H70A 2LKUA 1HYUA 2A2RA 2GZZA 3PR8A 4V2LA 4F0CA 3HXSA 3TJBA 2P31A 3ZL5A 4GQCA 3C73A 3CBUA 5H5QA 1AIUA 3BCIA 1PQNA 2H6ZA 2X64A 3C71A 1WJKA 2PVQA 1TI3A 2J23A 1W4VA 1GLQA 1V58A 1R5PA 4KB3A 2FY6A 2AB6A 2YN1A 4DSQA 1TU8A 5DJMA 2FCHA 3E0UA 4BWQA 4PURA 1Q98A 5ECSA 1EP7A 2L5OA 5DALB 4NPBA 1SENA 5DQYA 3A2VA 3QAWA 1M9AA 2F9SA 2H66A 3WYWA 3RBTA 4JEDA 2LNTA 2HZEA 6GSTA 4YAVA 1UVZA 2WJUA 4EVMA 2H71A 4TXOA 5EL8A 4LL4B 4N0VA 2LEGA 4IQ1A 1BYEA 3FZAA 3LYPA 2WGRA 3N9JA 1Y25A 1R26A 4TOPA 2OE1A 3WGEA 1LU4A 3FR9A 2V2GA 5C04A 4HQZA 3LFLA 4BA7A 2JZSA 1O6JA 3QMXA 5F8BA 3VPQA 5F0GA 4KUNA 4D73A 5D9VA 3DEXA 2OBKA 5JWQB 2LS5A 2B1LA 3MDKA 1U87A 2N5AA 1THXA 5D9XA 3CSHA 5KN3A 5IQYA 3M1GA 4PUAA 4X0XA 2CT6A 4NV5A 2N5FA 1V9WA 4K1FA 2V6OA 4MPFA 3UARA 4WEYA 2HI7A 1OE7A 3PINA 4IBPA 2V32A 2C0DA 1O8WA 1ZCPA 1SKRB 2M72A 2PN8A 1MDKA 2E2MA 3GURA 1XVQA 3UVTA 3LJRA 2YV9A 3TJGA 4WF4A 3M0FA 4NMUA 5HQPA 1F2EA 1YDKA 2GSTA 3RAZA 4WR5A 5ECNB 2VLVA 5J3RA 3ED3A 3QFAC 1TK0B 4MCUA 4LA1A 4HJMA 4TR3A 5J5NA 3FR6A 3F4RA 1ZL9A 3HKRA 5C00A 2GT5A 4FIWA 3TKSA 4BL7A 4AJ7A 5IMZA 1XIYA 1MTCA 3U6VA 1USBA 1SJ6A 1F3BA 2H76A 2F3MA 1FVKA 3KCMA 1VRSD 2EC4A 3SBCA 1SL0B 2CV4A 3DD3A 1XOBA 1ABAA 4BVYA 1AUCA 4EO3A 3D22A 4L8EA 2DJ0A 1X0RA 3ERGA 3ZRDA 2ZNMA 3ZITA 1BJXA 1VF3A 2H1DA 3D21A 2JSZA 4KAEA 3BD2A 4BWSA 2C3TA 2VUPA 2H1AA 4MJAA 3GH6A 4WF5A 1E2YA 1Z6MA 2LNSA 6GSYA 3FK8A 2LUSA 3DYRA 5KN1A 2TRXA 3QOUA 3KTBA 5AN1A 3J7Yk 3FHKA 2I1UA 1TRWA 2L57A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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