2DJXA

Crystal structure of native trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCCTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of native Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate Dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 110
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2006-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2djxA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2djxA01
5HQEA 1A5BA 2FTPA 3UWUA 2I9EA 1OFDA 1QPNA 1FWNA 1T0OA 5FESA 3FJLA 2Y61A 4NX0A 4O50A 3QSTA 3C61A 3UNDA 4JYFA 1OHLA 3GR8A 3C2VA 3RLVA 3DZ1A 1LOLA 1B4EA 3G8EA 3TC7A 2HS6A 1UCWA 5K2ZA 1S5VA 4A3UA 3DBPA 3RNDA 4NXSA 3L0GA 2CWNA 4RKAA 1TPC1 4JX4A 1SO3A 1AK5A 2ZRYA 3WJZA 1R30A 5LNRA 3I6RA 3LI1A 1ME8A 3UWQA 3DI0A 3TAKA 1TTQA 3QMRA 4JTKA 2A2IA 1GOXA 3UWVA 1H62A 3W84A 3SGZA 1YTDA 4FB7A 3PUDA 2QCGA 5DCEA 3QSRA 2R91A 5LGXA 3S8HA 2NX3A 4NQ1A 5HR7A 1LROA 4AVFA 1D3GA 1T96A 1Q6LA 3C4UA 2WPBA 1MEHA 1JUEA 3NA8A 3FFSA 3W7GA 4RCXA 1OYAA 3NVTA 1YXCA 4Q4KA 4OQVA 4LTSA 4OHQA 1GTEA 2E5BA 2FJKA 3C56A 3KHJA 2DP3A 4M6PA 1EWEA 2J27A 2FB3A 3NQEA 1PE1A 1YXYA 3JS3A 2WNZA 4Y90A 4JTHA 2WNNA 2NXIA 3M44A 1JCYA 3N3MA 4MJZA 5I3JA 4K7YA 3U2OA 5BMWA 1VS1A 2VKZG 2HSAA 1VLWA 3PWAA 5I3GA 1LP6A 4JIQA 1TPB1 1PV8A 1OG0A 2V5LA 4AWTA 2V9DA 3TDFA 3PBUA 3HQ1A 4NZJA 4IX0A 3CEPA 3EXSA 5K4XA 5BOOA 3WK2A 4C1LA 4LRTA 1H7NA 1FCVA 3IIZA 3DFPA 5HWJA 1FUYA 4O16A 4ZZ9A 4UFKA 3WJWA 4BI7A 3Q37A 3YPIA 2E1DA 4DO5A 2ZRWA 3W7LA 3W1AA 4M7SA 4AEOA 3W1PA 3TU9A 5C5YA 1VYRA 2A6NA 4R34A 3ZR4A 3HG3A 3DGRA 2QAPA 2RFGA 4ZL1A 4FNQA 3BGGA 2QR6A 4GUHA 2E6AA 1WV2A 1IF2A 3OA3A 4MYXA 1OX4A 3DFOA 3MMTA 5FEPA 1VC4A 3E96A 4Y96A 1H7OA 3S1WA 2OCZA 3TH6A 2CZ5A 1TIMA 1RR2A 4UUIA 3KRSA 2GJNA 2AGKA 1SSDA 2AQWA 1F73A 4O53A 1G7UA 3IEBA 4LUJA 2HS8A 3MP3A 1CI1A 4BWLA 2ZZ2A 3CTLA 2RKXA 3HF3A 4TO8A 2YW3A 4O1BA 3W6YA 5K9XA 1Z41A 2E5CA 1VHNA 4QJ1A 5DCBA 5G1TA 4EF8A 1YLVA 3QQ0A 5D05A 4UXDA 1LOSA 3TIMA 4CCDA 4HSOA 4OBTA 1GEQA 2QUUA 3SI9A 3USBA 1BWLA 3AJXA 1LBFA 3NQGA 1SW0A 4GUGA 1PL9A 1EUAA 2EGZA 4M6VA 3O16A 3NQDA 4WY0A 3I7SA 3TFCA 3W87A 1KFEA 2ZCGA 3W2JA 1EWDA 3LXCA 2E6DA 1J4EA 5EA9A 1XCFA 3NQ6A 4BFAA 5U7SA 1W0MA 1OX4B 4EOUA 3EX3A 2Y85A 4XWUA 2YW4A 3OVPA 4IPJA 1Q3NA 1GWJA 4NJJA 3SR7A 3M0ZA 1KFBA 1XDMA 3W86A 3LTSA 5TIMA 4LOCA 3JRKA 5IM51 3VE9A 4JR5A 1AL8A 4ORIA 5C54A 1SUXA 2JBMA 3P7YA 1WBHA 1MSSA 3CC1A 3PC0A 3IVTA 3TE9A 3C0JA 1W5QA 4WY0F 1O4UA 4UMAA 3FKRA 4NVTA 2B4GA 1XFBA 1DJQA 2V82A 2WSYA 4I7WA 4UTKA 1XC4A 2CLLA 3WJYA 5G1YA 2ZA1A 3N9RA 3IV3A 4ZQOA 2C14A 3DHFA 1IXPA 3EWYA 3EWBX 3TV8A 3GXNA 4UFMA 3UXAA 4LVGA 1KM2A 2CLFA 1U5JA 3EEGA 4UMBA 1O94A 3V75A 3QC3A 1Q45A 1TPEA 3DI1A 1KM6A 3MYOA 2H6RA 4WY0B 2XFWA 3ABQA 2YCEA 4AHOA 4AB4A 2J9YA 4TMCA 2X30A 1TYGA 4JTGA 5D2VA 4ZQRA 1RQHA 3M7WA 2VFDA 2VFHA 1G69A 2X1TA 1ML1A 3NM3A 2GUUA 2X1SA 4ICNA 2R14A 3MHUA 3PR2A 4PH6A 2B7OA 1GVRA 2ZRXA 2B7NA 3E49A 3NQVA 1HUVA 1NF0A 3FEMA 1LTDA 3HPSA 2OX1A 1UASA 2VFIA 1LCOA 4JTTA 4R7JA 4UTTC 1KM0A 3G1YA 1DHPA 5DXYA 1OABA 1NAL1 1GYLA 3PG9A 4E2DA 3G1DA 3TXVA 1AMKA 3M5VA 3PS7A 1KFCA 3FOKA 1QR7A 1F7BA 3P67A 2YFOA 5CG7A 4LC8A 3SY5A 5G4WA 3LRKA 2QJIA 1LRNA 3LHUA 2D73A 1NEYA 1RVGA 3F4WA 3MP5A 4O52A 1QPQA 3W7KA 4HNNA 3W7JA 3EX6A 4S2CA 3S5NA 3T4CA 4IMDA 4JYDA 1G4TA 3P81A 3G0SA 2A21A 3C52A 3QPZA 2V0TA 2YXGA 2FFCA 1H63A 2H3BA 3TKFA 3OVRA 3GDTA 4UR7A 4UFIA 1OX6A 4AHQA 3MUXA 5D03A 1H7XA 1T99A 4OV4A 4MFEA 4CCEA 3L0KA 4HN4A 1N8FA 1ZAJA 1KLZA 1YDOA 3SECA 3TSBA 1QO2A 2FPVA 2PCQA 3UY8A 3A21A 5AYXA 2X2GA 3NQ8A 1YPFA 4CNNA 1EP1A 2Y7FA 3BARA 4H4IA 2CLOA 5AC7A 1B57A 2VFFA 1W31A 2QCHA 4W9TA 1WBJA 3CU2A 2Y7GA 3KVJA 5HULA 4Z08A 4K36A 3S5YA 3VE7A 5D2XA 1EP2A 3W2NA 1GVSA 4NXKA 5CZTA 5KTLA 3PVFA 2PRMA 5HINA 1DQXA 1V7YA 2B7PA 4MZ8A 3BGJA 2KZHA 2A4AA 3P84A 4KFOA 5A8GA 1DBTA 1JCNA 5D38A 4RR4A 4Y6GA 3L68A 3O6CA 1SFLA 4JX6A 4O57A 1ICPA 1W3IA 3MBDA 4K6AA 5F4WA 3TROA 3N9SA 1QOPA 3P82A 1GQNA 2CU0A 3DHDA 5D32A 2G5WA 3ATYA 2H8XA 1TPUA 3B0UX 2CLHA 3LV5A 3BPWA 4Z0JA 4RX0A 4TR9A 3HGSA 5C55A 3RMJA 3TQVA 4JTFA 4QNEA 3VNDA 4BK9A 3F03K 1ICSA 4UTLA 1QFEA 1OVDA 1J5TA 2ABAA 3RFAA 5EMUA 3SJ3A 4JTIA 4ZQMA 2NUWA 2Z6IA 1R47A 3QM3A 3PF3A 1F76A 3FLUA 3LDVA 3W7PA 4A29A 3LCFA 4DBDA 3C2OA 3N34A 4LY8A 2FPTA 5FF0A 3C8FA 3UY7A 3QJAA 3FKKA 2ALDA 5AHEA 3CWNA 4X2RA 3QW3A 4I7VA 3PBVA 4QAIA 1DQWA 4O17A 3RLUA 3OEXA 3L2IA 1GVFA 5HWMA 3G1HA 3VI2A 3W70A 1VCVA 2CLEA 4CCCA 4KWVA 2VEIA 2P10A 1SO6A 1ZJIA 1LM1A 2ATSA 3L5AA 1EUNA 1JCLA 3G8RA 4JTUA 2NWSA 5D04C 1L2UA 3GAYA 3C2RA 1ALDA 4ALDA 2QUVA 3S1VA 3M9YA 3GDRA 4DEFA 4OGZA 4N4QA 1K03A 1XDLA 4JICA 4AWUA 3DFQA 3L5MA 1FWWA 2ZRZA 3SW6A 2FQIA 4FNTA 5LHEA 2QF7A 1K7XA 3LLFA 4LV9A 5EL1A 3O8AA 1XM3A 4EIVA 4DO6A 1SU5A 1XL9A 4IMEA 2B7QA 5HJLA 3Q58A 2DZVA 4XUGA 4N4PA 3NGJA 1AW5A 2WSQA 1P0NA 3UZJA 3KFTA 1OFBA 2DJXA 3U8GA 1RQBA 4RXFA 5LSMA 1X1OA 2CFFA 4JX5A 5EKYA 4YXGA 5KZEA 2CW6A 3W85A 1JRBA 1JR1A 4XBSA 1OFAA 1Z42A 5F4SA 1HTIA 1C29A 4DO4A 1UUOA 3NYZA 4DBEA 1X8FA 3FS2A 5LNSA 4IJBA 1O95A 1MXSA 2EKCA 2P1FA 1FBAA 3STFA 4DPQA 1PVNA 4FNPA 4XZ9A 1DVJA 2G96A 3O6YX 3P80A 4DELA 3B4UA 3U6WA 4CLMA 3QRHA 1H60A 3GK0A 3GXTA 1VLIA 3JR2A 1I8JA 3C2EA 3GR7A 1SW3A 1OFEA 3HGOA 1S5WA 2ZZ3A 2ISWA 3IVUA 3W1TA 1TPH1 3BG3A 4Y8FA 3PM6A 3TR2A 1HO4A 4FIRA 4P61A 3QMTA 3GB6A 1GVOA 2ZTJA 5CGQA 1CX9A 1IIGA 4YL2A 1ZY9A 3CLMA 1HFBA 4C1KA 3NL6A 3O15A 3BW3A 3LCLA 4E0CA 2A5HA 2ZDRA 5EBUA 2A7RA 4BI6A 1OYCA 3Q2DA 2PE4A 3O06A 4YLWA 3BK0A 4FXRA 4MY1A 3NL2A 5KSWA 4QQ3A 2A1YA 1LRTA 3FIGA 4FNUA 5EYWA 1V5XA 4XTIA 1W54A 1H51A 4I9AA 4O4WA 2C16A 4AXKA 3CT7A 3W2LA 5F2IA 3LHZA 3CIWA 2NX1A 5AHLA 3TSDA 2BTMA 3QH2A 1RV8A 5C6MA 3P8JA 2V81A 4K8HA 3HJZA 3FYOA 5HUOA 2Y70A 3R13A 3O6DA 2I14A 5K7JA 1TB3A 3PUOA 1KTNA 3TCEA 1HO1A 2HMCA 4O18A 2F84A 3BLFA 1G67A 4JTLA 3ZWSA 1PS9A 3HOJA 3I7QA 2QJGA 1OK4A 5IBXA 3A5FA 2ZBTA 1D9EA 3PSWA 1SZFA 4NJIA 1F2JA 2EPHA 3M41A 2NXHA 3T78A 2Z0IA 4ZQPA 4O0ZA 1SW7A 1TV7A 1W3TA 4N6EA 5AFDA 4BR1A 1WA3A 4M6QA 1OYBA 4FHAA 3SGUA 3CHVA 4LW7A 1F6PA 1SQ7A 3NPWA 4RZ4A 5KZMA 1LORA 4K38A 3EXTA 5MHBA 1W5NA 1BEUA 1BKSA 1B3OA 1VPXA 8TIMA 5F1VA 2JGYA 3DKJA 4IWWA 1WYIA 3UPBA 4EF9A 4UIOA 2EHHA 1TV8A 1ZFJA 1AG1O 3LGEA 1O5KA 3L66A 5G2IA 2ATMA 2CZEA 2OT0A 3SZ8A 1HL2A 3MI2A 3B0VC 4MJMA 2QJHA 1QDSA 3TQKA 1VGAA 2OT1A 2GJLA 3GVGA 4E2BA 1JCXA 3G1XA 1A50A 3LCWA 4FEZA 4UNLA 5HUPA 1IIHA 3IGUA 1FDZA 3BW2A 2E6YA 3NL5A 1H7RA 5I3HA 1M5WA 3S1UA 4NJGA 3EWZA 2BSLA 5CPMA 1VR6A 2ZYFA 4UTWC 1A5CA 2V2DA 4O19A 2FB2A 1G4SA 2GVJA 2RDUA 4PL1A 3F1QA 3LTYA 4NT0A 1OF8A 1I45A 4LRSA 1WXJA 1FQ0A 4JGDA 3S5OA 3R89A 4QIUA 3C3NA 5I3KA 4IXXA 2H90A 3SFKA 3W07A 1PCKA 3UYCA 1A5SA 1TQJA 2RHGA 2NV2A 5D30A 2VFEA 3DH7A 2C0AA 3NQFA 2NUXA 3KX6A 2Y63A 3LXBA 4WOQA 3B05A 5D2YA 1VH7A 5SWUA 1F5ZA 1DL3A 4FNRA 3W1UA 2PRHA 3DAQA 2RDTA 3DU0A 1FXPA 4IGHA 2JKPA 3A22A 3HBLA 5FEXA 5DLCA 3DFTA 4XKYA 3S1XA 1P1XA 1THFD 4HT3A 1H7PA 3CQ0A 3GXPA 1ZENA 1KBJA 4YWIA 4RXGA 3CPRA 3EWWA 4JDBA 1TTJA 2QKFA 4RZ5A 1EPXA 1BWKA 2DZPA 2C19A 3NPVA 3MWAA 3ZFHA 2C15A 1LBLA 1MEIA 1S5TA 3M6YA 2Q8ZA 3G1VA 3D0CA 1VHCA 1T8XA 1XI3A 2VC6A 4TIMA 4DQWA 4OE7A 3TJXA 1JCMP 4WXYA 5HNRA 1M6JA 3GX9A 3E02A 1GPWA 3KVLA 1KLYA 2TMDA 2CLMA 3EX4A 4NX5A 4BF9A 1GJPA 3S5ZA 1FCUA 1XBYA 4JD4A 3HPZA 2WO5A 4PEKA 1OFPA 5DCDA 4KFNA 1G6CA 1KM1A 1YADA 1PHQA 2JGQA 1ZNNA 2YYTA 2DZXA 3UZ5A 4GE8A 1W37A 3NXFA 2E68A 4ADUA 3HPXA 5E0KA 2V5BA 4J9JA 3W71A 5G5IA 3NQCA 2JKAA 1J2WA 1YYAA 4XKYB 4QITA 4UTIA 3W7OA 5J5DA 3N2MA 3W23A 1AL7A 6TIMA 2BZNA 4DPPA 4JYEA 3PBWA 3R12A 2QCMA 1GG0A 1TMHA 3ELFA 3G1AA 3TA6A 1H1YA 3IIVA 5FF2A 1KFKA 3N19B 1I4NA 4X3ZA 4GBUA 4M19A 3W88A 1FDYA 1K7FA 2EAWA 1LYXA 3OBKA 3GNNA 2VEKA 5HWNA 3W7IA 2WNQA 4O28A 4AAJA 3F4NA 1H50A 2PC4A 4I7UA 4H3DA 2Y7EA 3WJXA 1ICQA 2QAFA 1KFLA 1YTEA 3TQ0A 1EP3A 2J9ZA 2QDGA 2JKEA 3HG5A 3M5ZA 2A7NA 5FEZA 3HB9A 1H1ZA 3KAOA 4O10A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CD5 A;  1A5B A;  1QPN A;  1FWN A;  1T0O A;  1P43 A;  3AIB A;  4X63 A;  4I5R A;  3CHE A;  3TC7 A;  3CUI A;  4L56 A;  1UCW A;  3GY1 A;  3DBP A;  2Y8V A;  1MRQ A;  3RND A;  4NXS A;  3VA8 A;  3N29 A;  2BXY A;  3WLM A;  1GOM A;  5A2C A;  1PKM A;  5A8M A;  5MKG A;  1OM0 A;  4GA8 A;  2P8B A;  2Q8X A;  2V3E A;  4MB5 A;  3WCZ A;  1TTQ A;  3QMR A;  5DX7 A;  4CVU A;  1GOX A;  1OCJ A;  5XIN A;  1H62 A;  3MUI A;  1MNZ A;  3EZ4 A;  4IGS A;  4OKD A;  4AYG A;  4AVO A;  3S8H A;  2XVN A;  4GZ7 A;  4S3K A;  2DT2 A;  3B8U A;  2AKZ A;  1MEH A;  5KZ6 A;  3FFS A;  2VUN A;  3NVT A;  5I03 A;  4H41 A;  1YXC A;  1KC7 A;  4LBS A;  3RM4 A;  4IIB A;  5DAN A;  1AZ1 A;  2E5B A;  4TXE A;  2FTY A;  3NQB A;  1JGM A;  1H3G A;  1H0I A;  3AZS A;  4W8L A;  1PE1 A;  1YXY A;  3QY8 A;  3EPN A;  2FMN A;  3V18 A;  2WNN A;  3M44 A;  2EG7 A;  4K7Y A;  5BMW A;  4JIE A;  1K4G A;  2VKZ G;  3V0S A;  1LP6 A;  1FP9 A;  3WUB A;  2V5L A;  3GTN A;  5MKG B;  1CXH A;  4B5U A;  4NZJ A;  4NZC A;  3EXS A;  3WK2 A;  2CIT A;  3U2E A;  3UA4 A;  3DFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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