2DKHA

Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from comamonas testosteroni, in complex with the substrate
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
639
structure length
614
Chain Sequence
b'MQFHLNGFRPGNPLIAPASPLAPAHTEAVPSQVDVLIVGCGPAGLTLAAQLAAFPDIRTCIVEQKEGPMELGQADGIACRTMEMFEAFEFADSILKEACWINDVTFWKPDPGQPGRIARHGRVQDTEDGLSEFPHVILNQARVHDHYLERMRNSPSRLEPHYARRVLDVKVDHGAADYPVTVTLERCDAAHAGQIETVQARYVVGCDGARSNVRRAIGRQLVGDSANQAWGVMDVLAVTDFPDVRYKVAIQSEQGNVLIIPREGGHLVRFYVEMDNITVEQLIATAQRVLHPYKLEVKNVPWWSVYEIGQRICAKYDDVVDAVATPDSPLPRVFIAGDACHTHSPKAGQGMNFSMQDSFNLGWKLAAVLRKQCAPELLHTYSSERQVVAQQLIDFDREWAKDPKEFQKYFEQHGRFTAGVGTHYAPSLLTGQAKHQALASGFTVGMRFHSAPVVRVCDAKPVQLGHCGKADGRWRLYAFAAQNDLAQPESGLLALCRFLEGDAASPLRRFTPAGQDIDSIFDLRAVFPQAYTEVALETLPALLLPPKGQLGMIDYEKVFSPDLKNAGQDIFELRGIDRQQGALVVVRPDQYVAQVLPLGDHAALSAYFESFMRA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 3-hydroxybenzoate hydroxylase
publication title Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from Comamonas testosteroni has a large tunnel for substrate and oxygen access to the active site
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 195
structure length 614
sequence length 639
ec nomenclature ec 1.14.13.23: 3-hydroxybenzoate 4-monooxygenase.
pdb deposition date 2006-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
A PF07976 Phe_hydrox_dim Phenol hydroxylase, C-terminal dimerisation domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2dkhA02
3.40.30.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dkhA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2dkhA01
3NK1X 3NT6A 5C2TA 2IVDA 3P1WA 2GR2A 4AT2A 4CCQA 2X99A 1Q1RA 1XANA 3AE9A 2C75A 2XCGA 1KNRA 3AYJA 4U8NA 3VRDB 1CL0A 4TM3A 3UOZA 1NHRA 4ICYA 2UZZA 2R4JA 5J7XA 5IQ4A 3GWDA 5FS8A 1B37A 1L9EA 1ONFA 3VQRA 1D4DA 1O95A 2QA2A 4H4PA 3P4RA 1FCDA 1CHUA 5M0ZA 3DK9A 4JY3A 1PHHA 1Y56A 3GD4A 3D1CA 5U25A 1TYPA 2WBAA 1CC4A 1ZOVA 2AQJA 1EL9A 1JRZA 2X50A 4EQWA 1NHQA 2Y6RA 3GD3A 3T37A 1PBDA 3AD7B 4C3XA 3CPIG 5BRTA 2JKCA 2WU5A 5JCMA 2F5ZA 3ALJA 2R46A 4J33A 1YQ3A 4U2TA 2J3NA 5U63A 2WOIA 2H88A 3NYEA 1L9CA 1FL2A 2FJAA 2QAEA 3SFEA 3EPTA 2XFUA 2R0GA 2IIDA 3UKHA 2ARDA 3L1RA 4PAAA 4Y4MA 3UOXA 3UTHA 4TLXA 2C72A 1BKWA 1BGJA 1YQZA 4A9WA 2APGA 2OLNA 3M0OA 3P4PA 3IHMA 4EM4A 1F8RA 4B69A 2GEWA 2WS3A 2RGHA 4YTPA 1W4XA 4OPCA 2YG3A 1K0LA 3AYLA 4AOXA 2WP6A 1E1LA 1EBDA 1JU2A 4NEWA 3GMCA 5TR3A 3B3RA 3SM8A 4OPTA 1M6IA 3UKAA 1TDKA 4U8MA 3AE2A 2WESA 3DMEA 1PBCA 3QSSA 3ALMA 5FS6A 1PXCA 1YQ4A 3CNJA 3S61A 3BNUA 5KRQA 4B68A 5EBKA 4NTCA 1BZLA 2YVJA 3GRTA 2QA1A 1PBEA 1ZKQA 2XYOA 3AE1A 4LU6A 1IUTA 3NYFA 2JB3A 4OPLA 2YLXA 4GUVA 4IA6A 3GMBA 1CC2A 1DODA 1DXLA 2WPEA 3LB8A 4K2XA 3QFAA 2BCPA 4A6NB 3BI2A 1EL5A 1K4QA 1OJCA 3DK4A 3H4KA 3PS9A 4WCTA 3EANA 3NN6X 4TM1A 2GAHB 3NRNA 2WU2A 4B65A 3OZ2A 3PO7A 2OALA 3DJDA 1S2YA 2C66A 1YKJA 3ATRA 4ZCCA 1AOGA 3OC4A 3UOVA 3KD9A 4Z2UA 2WDRA 2BS3A 4EMWA 1DJNA 2R0PA 3KVEA 2B76A 2VQ7A 1ZY8A 1CF3A 2VQBA 4EMIA 4OPUA 3QVRA 3GDNA 3DJJA 4RSLA 1OJAA 4J57A 1OJTA 3H8LA 1PJ6A 2E5VA 2VRMA 3ICSA 4FX9A 2BACA 4OVIA 4X9MA 3IHGA 3UKLA 1OJDA 1H84A 2WOVA 4H2RA 2X8HA 3AD8B 4H50A 1N4UA 4BJYA 2NVKX 5CKUA 2BC0A 2BYBA 5BUKA 1F3PA 3URHA 3NNEA 4A5LA 1DOBA 4PABA 1Q9IA 2XVEA 1GERA 3VR9A 4J34A 4IV9A 4OPDA 1ELIA 5EB4A 4CCRA 1TRBA 3C4NA 2R45A 2V6OA 3DA1A 2XLUA 3ICRA 2YM1A 2Y6QA 4DNAA 1NG3A 1E1KA 1EL8A 1VRQB 2BK5A 2WHDA 4YT0A 3AE6A 1CBOA 1H82A 2XLSA 2C7GA 2C3DA 2X3NA 4CNJA 3CNDA 1P2HA 5EOWA 1MOKA 2RABA 1GNDA 1IJHA 1TDEA 2ACZA 1JRXA 1ZDLA 2BCGG 2GMJA 3RNMA 4B66A 3ALLA 3Q6JA 4K5RA 1VG9A 2BK3A 2JAEA 2E1MA 1ZK7A 4XWZA 2DKHA 1CJCA 2XFQA 4U8LA 4DGKA 4EM3A 3G5QA 3AE8A 3AE7A 4OPGA 3JSKA 2RGOA 4H4WA 4I58A 4TLZA 2FJBA 4RG3A 4YSYA 3RP6A 2V5ZA 3CN8A 3AEDA 3UP4A 4XXGA 1NHPA 2WEUA 3IF9A 2XDOA 3NTAA 3FG2P 2PYXA 2YWLA 3R9UA 3CNSA 1E6EA 2A89A 1DOCA 4P9SA 2YVFA 4GCMA 4APNA 2GV8A 2DKIA 2C3CA 3M13A 1X31B 3GWFA 4MJWA 5BULA 2XLPA 4CBQA 5JCLA 2WPCA 1EL7A 3QSEA 1S3BA 1GTHA 1GRAA 4A79A 4JNAA 2RGJA 5LV9A 1H81A 1FEAA 1GRFA 3QVPA 3DJEA 1REOA 1ZOYA 2WETA 3LZXA 2WDQA 4A7AA 2ZBWA 2C67A 1F8WA 1RP0A 1QLBA 2QCUA 3CIRA 4AP1A 2WP5A 2C76A 3AB1A 1KF6A 2GVCA 3COXA 1LQUA 4OPIA 4YKGA 4X4JA 1ZMCA 2OLOA 3P4SA 3REDA 4H4XA 1QJDA 3AYIA 3DK8A 4C3YA 2O9ZA 3F8DA 1N4WA 2XFPA 3SGLA 1D4EA 1E1NA 2YLRA 3G5RA 1IUWA 4KX6A 3AEBA 3AE5A 2VRLA 2GAGB 2B7SA 5KXJA 5DBJA 3UCLA 2V60A 4FK1A 2OAMA 3QJ4A 1KDGA 2JK6A 4LIIA 2YLSA 3RP7A 5KOWA 2XLRA 3AEAA 4HB9A 4TM4A 2YR6A 1Y56B 2BS2A 2EQ9A 2V3BA 4N9XA 1S3EA 4Z25A 4CNKA 2OA1A 1NEKA 4K22A 4JY2A 3UTEA 3I3LA 4GF7A 1GRGA 1KNPA 2GH5A 2I0ZA 2YG4A 1F6MA 3NGCX 2EQ6A 3K7MX 3ADAB 3UKFA 3NN0X 1OJ9A 3BNMA 1E39A 2YG7A 1NHSA 2GB0A 2E4GA 2GRTA 2VVLA 2XVIA 4YWOA 1GTEA 4ZCDA 3M12A 1DOEA 3F8RA 1IUVA 1K0IA 4U8OA 1GEUA 1NDAA 1TDNA 4D03A 1S2QA 5C3JA 3QSMA 4B1BA 5JCIA 1GSNA 4U8KA 4BURA 1P2EA 4UDPA 1LPFA 2YR5A 2TMDA 3NTDA 2CFYA 4KPRA 4DSGA 3NYCA 2C64A 1PXAA 5M10A 1VG0A 1GT8A 1D7LA 2PHHA 3AECA 2ZZBA 1L9DA 1PBBA 4BK1A 3CGDA 1PXBA 1CJ3A 3DJGX 3GRSA 1PBFA 3NG7X 3NH3X 4C74A 4I59A 2YLZA 3D8XA 3AEFA 3KPFA 4M52A 1PJ5A 1L0VA 5ER0A 3EF6A 4O5QA 2BXSA 2HQMA 4NZHA 1HYUA 4OCGA 2B9YA 1JNZA 3CNPA 3FBSA 4H2QA 1Y0PA 3H8IA 3VRBA 2VOUA 3KLJA 3CPJG 5HYMA 5HY5A 1PDHA 1GRBA 4NTEA 1JOAA 1M64A 2JB1A 3BI5A 4A99A 3AE4A 5FS7A 1KSSA 1VDCA 4AT0A 4Z2TA 1GETA 3QFBA 3K7QX 4CY6A 3K30A 1H6VA 4TM0A 1H86A 2WP9A 3ICTA 1Q1WA 3UP5A 4J36A 4H4VA 1D7YA 1FECA 2WPFA 2Q7VA 2GMHA 2ZZ0A 2Z5XA 1SEZA 4IVMB 4Y4NA 3CNTA 3FPZA 1ZX9A 4XWRA 2V3AA 2VZ2A 4JQ9A 3V3OA 4NEVA 2A8XA 2GQWA 3EAOA 4JNQA 1K0JA 3ZYXA 4H4QA 5L46A 1GESA 2GR3A 4YXDA 2XFNA 3AWIA 4U2LA 3GDPA 3BI4A 3L8KA 3LOVA 5IPYA 4IA5A 3CGBA 4BK2A 1B5QA 1RYIA 1LQTA 1KFYA 1CC6A 1TDFA 3LXDA 2YQUA 3IC9A 4K8DA 2WOWA 3UOYA 3UTGA 2C73A 1COYA 1MXTA 3SFDA 3F8PA 3KA7A 4USRA 4X9NA 3P4QA 4H4YA 1PJ7A 4H4SA 1N1PA 3WE0A 1CJ2A 2CDUA 4Y4LA 4H2NA 2GR0A 1YY5A 1BF3A 3FIMB 3ITJA 1O5WA 1LVLA 2AAQA 4UP3A 3NK0X 1PS9A 3AXBA 3NLCA 4YSHA 1O94A 2YLWA 3GYJA 4A6NA 4ZN0A 2V61A 3AE3A 4DSHA 4H4RA 1GRHA 4U2SA 5GRTA 2BK4A 3CGEA 4J31A 3GYIA 4J56A 2CVJA 2WDVA 4B67A 4C5OA 2BC1A 2Q0LA 1JRYA 1MO9A 2XVFA 3DGZA 1B8SA 4B64A 4Z2RA 1IUXA 3AEGA 4GR1A 3UTFA 3C96A 3RP8A 1DJQA 1JNRA 1TDOA 4AP3A 1F8SA 1GRTA 4A65A 4GRTA 4UDRA 2JBVA 1IUUA 3LZWA 4USQA 2BA9A 3ATQA 3KKJA 3FMWA 1BWCA 3I6DA 3NIXA 4YKFA 1QO8A 1GOSA 2ZZCA 3BHKA 4U8IA 3V3NA 1BGNA 1GREA 4E0VA 4JDRA 4EMJA 2Z5YA 4O5UA 4U8PA 4EIPA 2EQ7A 1B4VA 1DNCA 2A87A 2XVHA 4Z44A 4B63A 5KVHA 4CY8A 1ZMDA 4BV6A 4H2PA 4C77A 4D04A 5JCKA 3NKSA 4FK1C 5U1OA 5J60A 3ABVA 4LA1A 1E1MA 2EQ8A 2YR4A 4K7ZA 1CJ4A 5GSNA 2IVEA 3RHAA 3E1TA 3PVCA 3AD9B 2TPRA 5FMHA 3VR8A 1NG4A 1LTXR 5IQ1A 3HZLA 2XVJA 3CPHG 1H7WA 5JCNA 2JB2A 2GQFA 2GF3A 3GSIA 4CRTA 1TYTA 1GPEA 1GXFA 2W0HA 4GDEA 2VVMA 4Z26A 3Q9TA 2FBWA 3S5WA 5HXIA 1XDIA 3ISHA 4NTDA 3LJPA 3B6DA 5KVIA 3VRAA 5KWFA 1LV0A 1H83A 4Z24A 3IWAA 3SQPA 1LJ1A 3K7TA 5KOXA 2XLTA 3UKKA 4BK3A 1KSUA 1XPQA 2BABA 2VVLG 2X8GA 1PN0A 1Z6LA 1GV4A 4H4ZA 5BVAA 1XHCA 4EQRA 3C4AA 3CTYA 1N4VA 2YLTA 2FJEA 3G5SA 2FJDA 2C65A 2H89A 3UKQA 4YSZA 5FS9A 4HA6A 3O0HA 2R4EA 3P9UA 3NHOX 1V59A 2YVGA 2R9ZA 2Q6UA 2NPXA 4Z43A 4ECHA 4RG4A 1JEHA 4EQSA 2X8CA 3UKPA 4UDQA 1IUSA 2XFOA 1D4CA 1NPXA 1RSGA 2WQYA 2C70A 2B9WA 3NK2X 3LADA 1E7PA 5EB5A 3ZDNA 1GALA 2Q0KA 2YG6A 2BS4A 4H4UA 4H7UA 3II4A 4WX1A 1FEBA 1NENA 2YAUA 1NAAA 3KU9A 4YTNA 2AR8A 1H7XA 3CGCA 4J2WA 5HHFA 2YM2A 1ZP0A 1VQWA 4K5SA 2YG5A 2R0CA 3DH9A 4YTMA 4EQXA 2CULA 4REKA 2B9XA 3BHFA 5CQFA 4YSXA 4EIQA 4FDCB 2B7RA 4IVOB 4GDPA 4ADWA 4AOSA 1D5TA 4H4TA 2GR1A 3V76A 4JN9A 4U8JA 4BJZA 1UKVG 3AEEA 1FOHA 3DGHA 2BXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H0GA 5D9XA 2VIMA 1H75A 2JSYA 1AQXA 4EUYA 1GUHA 2OACA 2C3TA 1CL0A 1M99A 2E4AA 2IMFA 3LFLA 2R4JA 1R5AA 1A2LA 2DBCA 2E7PA 1BEDA 1O95A 3P4RA 2FD3A 5DBQA 2BTOT 4EF0A 1FCDA 1CHUA 2ZNMA 4KB3A 3HZ4A 3VI7A 3DK9A 1PHHA 5U25A 3GD4A 2HI7A 5H5RA 1OKDA 1YZXA 2Y6RA 1TJDA 2FA4A 3GD3A 3AD7B 4G74A 3NIVA 5IOXA 2L6DA 1SENA 4IHUA 4DSRA 1EP8A 2N5AA 2R46A 3VK9A 2PWJA 3ZTLA 4U2TA 1L9CA 1OAZA 3W4JA 4ZIJA 2BMXA 2R0GA 3L1RA 4Y4MA 3UOXA 4NAXA 1ZL9A 1BGJA 1BJXA 2APGA 5E59A 3HA9A 1ERVA 4ID0A 1F8RA 2GEWA 2VL9A 3HVXA 2XBIA 3AYLA 3FR9A 5TR3A 3GMCA 2VCXA 2H1DA 3PINA 2RUEA 4G0KA 2GVPA 1M6IA 3UKAA 1TDKA 4ISDA 3UEMA 3ALMA 3ME7A 3I69A 4X0XA 2CX3A 1KTEA 2VCVA 5ECMB 3BNUA 4FQUA 5EBKA 4NTCA 5IMFA 3GX0A 2CVDA 3GA4A 3ZLPA 3NYFA 3ZVJD 2JB3A 4OPLA 3KP8A 3ZVJA 3ZFBA 1CC2A 1DXLA 3KGKA 4FH8A 4XRAA 1E6BA 2LTKA 1EL5A 2CAQA 3EANA 1T00A 3NN6X 3LJRA 3NRNA 3LWAA 1WRYA 2YNXA 4B65A 3Q6OA 4K8MA 3F6DA 2H72A 2YANA 3GURA 3WGDA 4EMWA 2VQ7A 1DUGA 3FK8A 1CF3A 1RQMA 3DYRA 3QOUA 4OPUA 3GDNA 2YPMA 4J57A 4N0VA 3KTLA 1OJTA 1TRVA 3GKXA 2E5VA 3UKLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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