2DKHA

Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from comamonas testosteroni, in complex with the substrate
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
639
structure length
614
Chain Sequence
MQFHLNGFRPGNPLIAPASPLAPAHTEAVPSQVDVLIVGCGPAGLTLAAQLAAFPDIRTCIVEQKEGPMELGQADGIACRTMEMFEAFEFADSILKEACWINDVTFWKPDPGQPGRIARHGRVQDTEDGLSEFPHVILNQARVHDHYLERMRNSPSRLEPHYARRVLDVKVDHGAADYPVTVTLERCDAAHAGQIETVQARYVVGCDGARSNVRRAIGRQLVGDSANQAWGVMDVLAVTDFPDVRYKVAIQSEQGNVLIIPREGGHLVRFYVEMDNITVEQLIATAQRVLHPYKLEVKNVPWWSVYEIGQRICAKYDDVVDAVATPDSPLPRVFIAGDACHTHSPKAGQGMNFSMQDSFNLGWKLAAVLRKQCAPELLHTYSSERQVVAQQLIDFDREWAKDPKEFQKYFEQHGRFTAGVGTHYAPSLLTGQAKHQALASGFTVGMRFHSAPVVRVCDAKPVQLGHCGKADGRWRLYAFAAQNDLAQPESGLLALCRFLEGDAASPLRRFTPAGQDIDSIFDLRAVFPQAYTEVALETLPALLLPPKGQLGMIDYEKVFSPDLKNAGQDIFELRGIDRQQGALVVVRPDQYVAQVLPLGDHAALSAYFESFMRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 3-hydroxybenzoate hydroxylase
publication title Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from Comamonas testosteroni has a large tunnel for substrate and oxygen access to the active site
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 195
structure length 614
sequence length 639
ec nomenclature ec 1.14.13.23: 3-hydroxybenzoate 4-monooxygenase.
pdb deposition date 2006-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
A PF07976 Phe_hydrox_dim Phenol hydroxylase, C-terminal dimerisation domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2dkhA02
3.40.30.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dkhA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2dkhA01
3P4PA 4EMJA 3IHMA 1N4WA 4K7ZA 3B6DA 2XVFA 4LU6A 5DBJA 2ZBWA 3UTEA 3AYIA 4GUVA 2EQ9A 3SFEA 3LADA 4EMIA 3Q9TA 2B9WA 2GQWA 3AXBA 4PABA 5BVAA 1PXAA 3PVCA 4A6NA 2YR6A 5GSNA 2BXSA 4BJZA 2Y6QA 1DNCA 4IVOB 3NYEA 4JDRA 4M52A 1OJAA 3CNTA 3M12A 2C67A 2WETA 2X99A 4FDCB 2BXRA 5FS7A 4B69A 1E1NA 4OPUA 1IJHA 1S2YA 2C3DA 1Q1WA 2RABA 3GRSA 2X50A 3ATRA 4TM3A 2JKCA 2WHDA 1ZMDA 4GR1A 4RG4A 2OLOA 2BCPA 1DJQA 2Z5XA 3F8PA 1JOAA 1BF3A 4RSLA 5M0ZA 1GRBA 2VQ7A 3FPZA 2WOVA 2WBAA 4H4ZA 4X4JA 3DJJA 1IUXA 3BNMA 4OPTA 2W0HA 3AE8A 4KX6A 3AE2A 3UP4A 1XHCA 5FS9A 2BCGG 2CVJA 4OVIA 1JRXA 4Z25A 2YQUA 1O94A 3UP5A 1NPXA 2VVLG 1SEZA 3G5QA 4C3XA 1K0IA 3CTYA 3QVRA 3S61A 2OA1A 1GRFA 2VVLA 2WU5A 2GH5A 2B7RA 2CDUA 4LA1A 4OPGA 2BC1A 4Z2RA 2XLSA 1GREA 3GRTA 1K4QA 3AYJA 3KA7A 1DOBA 4CY6A 4YKGA 2GB0A 3AEBA 3DH9A 4H7UA 3GDNA 1GRAA 3UTFA 1ZK7A 2ARDA 1REOA 2GEWA 1GSNA 5KVHA 4U2TA 4K2XA 5JCNA 3K7MX 2C73A 5C2TA 4BJYA 3I3LA 3KKJA 3D8XA 1F8WA 2YVJA 3BHKA 3UOYA 1YQ4A 4FK1A 2OAMA 2APGA 4JNQA 4U2LA 3VR9A 1BGJA 4ZCDA 1RYIA 5CQFA 1NG3A 3CNPA 3L1RA 4EMWA 1CC4A 2WP6A 4WX1A 4JQ9A 1GALA 1CJ4A 3C4AA 4YTNA 1B37A 4A7AA 3UKAA 5KRQA 3H4KA 3VRDB 3UKLA 2YM2A 2R45A 3QFBA 1JRZA 2WPCA 4B63A 3UOVA 3D1CA 4JNAA 1DODA 2JK6A 1E6EA 1TDFA 4OPIA 4XXGA 2YG6A 1D4DA 2B76A 1FCDA 1TRBA 5J7XA 2DKIA 2V60A 4K8DA 4TM1A 4EQSA 3RP8A 1K0LA 2JBVA 2GR0A 2VOUA 2XLTA 1EL5A 3NIXA 2J3NA 4K5SA 4JY3A 3UKFA 3OC4A 4ICYA 5FS6A 4B66A 2YLSA 2XLPA 4NTCA 4U8JA 4B65A 1DJNA 4A9WA 2XVEA 3UTGA 1B5QA 1YQ3A 4H4RA 1ZOYA 4U8PA 3NH3X 2YLXA 3NYCA 2V3BA 5IQ1A 1S2QA 1ZDLA 1GTHA 5JCMA 1PXCA 3ALLA 3UTHA 3GMCA 1TDNA 2YWLA 3KD9A 4UDRA 3UKKA 1S3EA 1EBDA 3NLCA 2WQYA 4ZN0A 5KWFA 3NN6X 1PBBA 4J33A 4APNA 5L46A 4YXDA 1D5TA 2QA1A 3I6DA 3EPTA 3RP7A 2YG3A 2E1MA 1KF6A 1PN0A 3K7TA 2R4EA 5IPYA 2BACA 2C76A 3AEAA 3HZLA 3AYLA 1EL8A 3UKHA 1E1LA 3FG2P 4Z26A 4BURA 1TYPA 3P1WA 3GD3A 1L0VA 4C5OA 2C75A 2WPFA 4BK3A 3NKSA 2QAEA 5IQ4A 3RHAA 3ABVA 5EOWA 1NHSA 1GV4A 1NHPA 2FJAA 2WS3A 3FIMB 3F8RA 1W4XA 3CN8A 4IA6A 2NPXA 3C4NA 4TLXA 1K0JA 2PHHA 2YG4A 3GD4A 2TPRA 1IUTA 1PBFA 2XFUA 1Q1RA 3GDPA 3DMEA 1UKVG 4H2NA 3SFDA 5CKUA 3P4RA 2C64A 4H4UA 1JNZA 1RP0A 2WEUA 4USQA 4DGKA 4ADWA 3DK9A 2NVKX 3DK4A 2OLNA 2Q0KA 3II4A 3ZDNA 3UCLA 4AOXA 1NDAA 3G5SA 1OJ9A 4D03A 5BUKA 2WDVA 2O9ZA 2C7GA 1NHQA 3FMWA 1PS9A 2R9ZA 1CJ3A 3DA1A 1GOSA 1XPQA 1LV0A 1CBOA 1E1KA 1KNPA 5TR3A 4U8NA 3AE6A 4YSXA 4NEWA 1CC2A 4CNKA 1CJ2A 4OCGA 5EB4A 3T37A 3V76A 3QSMA 3AD9B 1RSGA 2YLWA 1FEAA 2TMDA 1ZX9A 4D04A 4IV9A 1VRQB 1VG0A 1VQWA 2BS3A 2C65A 2JB3A 2V5ZA 2VQBA 2XDOA 4U8IA 5EB5A 4Z44A 4C3YA 4K22A 4J2WA 2XYOA 2AAQA 2X8CA 2BS4A 1Y56B 2CULA 4AT2A 3IWAA 1CC6A 1P2EA 3DK8A 3CNSA 2GF3A 3NG7X 2WESA 4N9XA 4Z2TA 2B7SA 3K30A 1AOGA 1MO9A 4A5LA 3UKQA 1N4UA 3NTDA 1CHUA 1CJCA 4KPRA 1GRHA 4B67A 5HYMA 2XFPA 2BC0A 4C74A 3AB1A 1JRYA 1ZOVA 3COXA 5JCIA 1V59A 4YTMA 1L9CA 3AE1A 3NTAA 5LV9A 1LJ1A 1VG9A 2AR8A 4AP3A 4Z43A 2C3CA 1KNRA 3P4SA 4JN9A 2HQMA 2R4JA 3VRAA 2YVGA 4U8MA 2GR3A 2JAEA 2RGHA 3QJ4A 1GPEA 4YTPA 1IUVA 4YKFA 4EM4A 4EIQA 3EANA 2BS2A 3O0HA 2GR2A 1YY5A 1NENA 1EL7A 2YM1A 3SQPA 5JCLA 2GVCA 1H7XA 3GSIA 4H4PA 1QLBA 1KSSA 3CPJG 1KFYA 2ZZ0A 2H88A 1PBDA 2QCUA 3GYIA 2BYBA 4WCTA 4B1BA 1PXBA 1BZLA 3QSEA 4MJWA 3KPFA 2A89A 4REKA 1NHRA 4UDPA 5GRTA 2V6OA 2VRLA 1PJ7A 3AE7A 3BI2A 3NT6A 3QVPA 4J36A 4RG3A 5M10A 2Q6UA 4IA5A 1GERA 4BK1A 5BULA 1Q9IA 2XFQA 3DJGX 2AQJA 2BK4A 3REDA 1TDKA 1PJ5A 3AE4A 3E1TA 4NZHA 3ADAB 3CGBA 3NYFA 4H4YA 4GF7A 2ZZBA 1TDEA 1F8SA 2WPEA 1BKWA 1PJ6A 1FECA 4XWZA 3ATQA 5U63A 4A6NB 5ER0A 1H6VA 3F8DA 1H82A 5FMHA 3FBSA 3ISHA 3PO7A 1S3BA 2YG5A 2XVJA 1GXFA 2X8HA 4Y4NA 4CNJA 1LVLA 1H86A 1F3PA 1OJDA 5FS8A 2R0PA 4CRTA 1OJTA 2X3NA 1O5WA 1EL9A 2F5ZA 1NEKA 1PHHA 4U2SA 3CGDA 3CGCA 2E4GA 2UZZA 4J31A 2GMJA 1E39A 2GRTA 5HXIA 3JSKA 3OZ2A 3LOVA 1H83A 1QO8A 2WOIA 4EM3A 3CNJA 2XLUA 4O5UA 4DSHA 2GAGB 3PS9A 2B9XA 1VDCA 3C96A 1LPFA 4B64A 4H2QA 1B4VA 2FJEA 2V3AA 3P9UA 4Z2UA 1XANA 1NG4A 1GESA 2C66A 3GWFA 1NAAA 4FX9A 1H7WA 4NEVA 4U8LA 1GT8A 4EQWA 3UKPA 5HY5A 2YR5A 5KVIA 1MXTA 3UOXA 2GV8A 2X8GA 4NTDA 2E5VA 1H81A 3ICRA 2WU2A 2CFYA 1OJCA 3CNDA 4TLZA 3S5WA 4LIIA 5EBKA 2YVFA 1FOHA 2IIDA 3CGEA 3BI5A 1XDIA 2GAHB 2C72A 4H4WA 4CCRA 4AP1A 4H2PA 4DSGA 2XVHA 5BRTA 5JCKA 1ZKQA 1O95A 4IVMB 2DKHA 1KSUA 3NHOX 4EQXA 1E7PA 2Y6RA 1E1MA 3AEEA 3NRNA 2EQ6A 2YAUA 3DGHA 4I58A 4P9SA 3G5RA 3SM8A 2BK3A 2FJDA 4EIPA 1CL0A 2BABA 4TM0A 3ALJA 4UP3A 4H2RA 1MOKA 3LXDA 1KDGA 4YSHA 3EAOA 4OPDA 2RGOA 4ZCCA 4YT0A 2QA2A 2R0CA 2V61A 4DNAA 4PAAA 2RGJA 4CCQA 1F6MA 3BNUA 3KLJA 1COYA 3DJEA 1PBEA 3GWDA 3P4QA 3H8LA 2WP9A 4C77A 3DGZA 1M64A 5HHFA 1ZY8A 2B9YA 2JB1A 4E0VA 4J56A 4NTEA 3WE0A 3K7QX 5U1OA 5KOXA 2Z5YA 3M13A 3VRBA 3AE9A 1TYTA 4H50A 2BA9A 1GRTA 4X9MA 3QSSA 2XVIA 2FJBA 4H4XA 1QJDA 4J34A 2IVDA 3SGLA 1ZMCA 1B8SA 4X9NA 2PYXA 2IVEA 3AD8B 3ICSA 1IUSA 1LQTA 1GNDA 2YLRA 1GEUA 3CPIG 3NGCX 3NK1X 2YG7A 4Z24A 1IUUA 2R46A 2Q7VA 3UOZA 1BWCA 3B3RA 4FK1C 4Y4MA 3IHGA 5KXJA 3QFAA 1GETA 2GMHA 3Q6JA 4AT0A 4OPLA 3DJDA 3AD7B 4H4QA 2A8XA 2I0ZA 2C70A 4U8OA 1M6IA 1N1PA 3KU9A 2A87A 4TM4A 3L8KA 1F8RA 3AE5A 4GCMA 1Y56A 4USRA 3RNMA 1D4CA 1CF3A 1ELIA 1PDHA 1D4EA 3IC9A 4H4VA 1GRGA 2YLTA 2YR4A 3RP6A 3AEDA 3VQRA 2H89A 3ICTA 3NNEA 1D7YA 4JY2A 1LQUA 1Z6LA 2WDQA 4HB9A 3AE3A 4I59A 3R9UA 2VRMA 3V3NA 4AOSA 2ACZA 1ZP0A 4HA6A 4YSZA 4K5RA 2R0GA 4Y4LA 2GR1A 1P2HA 5U25A 3AECA 3IF9A 3ZYXA 1JU2A 1HYUA 2XCGA 4BK2A 4CBQA 4J57A 3EF6A 4UDQA 3AWIA 4A99A 4BV6A 3V3OA 4GDEA 4XWRA 2EQ8A 1JEHA 1TDOA 2ZZCA 3GMBA 4A79A 5J60A 3H8IA 2EQ7A 1H84A 2VVMA 5C3JA 2FBWA 1DXLA 4YWOA 4ECHA 2WOWA 3BHFA 3KVEA 5KOWA 1Y0PA 3AEFA 3CPHG 4GDPA 2GQFA 3AEGA 4GRTA 3NN0X 1LTXR 1GTEA 1PBCA 3LB8A 1DOEA 1YKJA 2XFOA 3LJPA 3LZWA 2OALA 1D7LA 3VR8A 2JB2A 2XLRA 1FEBA 2VZ2A 3ALMA 1BGNA 1IUWA 1DOCA 3GYJA 3LZXA 4O5QA 4U8KA 4B68A 4EQRA 4CY8A 3BI4A 3ITJA 4YSYA 4A65A 2WDRA 1L9DA 1L9EA 1FL2A 1ONFA 2Q0LA 3CIRA 2WP5A 3NK2X 1N4VA 4H4SA 1JNRA 1YQZA 3URHA 2YLZA 3M0OA 2BK5A 2XFNA 3NK0X 4H4TA 4OPCA 1X31B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EMJA 1TXXA 4K7ZA 2K6VA 3B6DA 3LYKA 1X5EA 5CRHA 3VPQA 4JRRA 1Z6NA 2I3YA 3SFEA 3N9JA 5COHA 3IRAA 4F82A 2VM2A 5CRWA 4PABA 4KCEA 3PVCA 3WGDA 2YR6A 4BJZA 3I69A 1DNCA 2Y6QA 3NYEA 5CRGA 4JDRA 2OBIA 1N8JA 1XBSA 3Q19A 6GSYA 1OJAA 3DEXA 2X99A 5FS7A 1XVWA 4B69A 3CTGA 1TOFA 3FEUA 2FA4A 2H74A 4PUFC 2JKCA 1ZMDA 4K0NA 1DJQA 2Z5XA 3F8PA 1J0FA 2BRYA 2VQ7A 4X4JA 3BNMA 2PVQA 1YF0A 4OPTA 4XS4A 1EEJA 3S9FA 3UP4A 1XHCA 2JZRA 2LJKA 11GSA 2CVJA 2R37A 18GSA 2QSIA 4Z25A 2YQUA 1O94A 3G5QA 4NV2A 3S61A 4GCIA 4DSSB 3HY2A 4G9KA 2WU5A 3HVNA 1C0LA 1GNWA 3IBHA 1K4QA 1DOBA 4ZL9A 2GB0A 2A4VA 4FH8A 3TJFA 1GRAA 3QR6A 3GTUA 4GSTA 5D9WA 2ARDA 4GSNA 5DALB 2C73A 4BJYA 4XS6A 3TOUA 3I3LA 3VWWA 3G7YA 3T2KA 1F8WA 4YJGA 2E4AA 3E9JB 1OKTA 1YQ4A 2OAMA 5DCHA 3ERFA 2APGA 1BGJA 4OCFA 1NG3A 3CNPA 6GSUA 2O85A 3HVSA 2PVOC 1DDOA 4WX1A 1GALA 1CJ4A 3C4AA 1B37A 3UARA 3H4KA 4ECIA 3VRDB 2O89A 4B63A 3UOVA 3JCML 4V2MA 1E6EA 4OPIA 1B8XA 3GH6A 4MH2A 4ACSA 4HJMA 4YAVA 1ZMAA 1TRBA 3EINA 2DKIA 3RP8A 1TK5B 2JBVA 1M99A 1EL5A 3NIXA 1TK0B 3EYTA 4ICYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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