The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
84
|
structure length |
84
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPWQPPADLSGLSIEEVSKSLRFIGLSEDVISFFVTEKIDGNLLVQLTEEILSEDFKLSKLQVKKIMQFINGSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the SAM_PNT-domain of the hypothetical protein LOC64762
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein LOC64762
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| total genus |
18
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| structure length |
84
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| sequence length |
84
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5J8Y C; 2F3N A; 1RG6 A; 1SV4 A; 4RQM A; 2QKQ A; 3BQ7 A; 1SV0 C; 2KMD A; 1SGG A; 1V85 A; 2YTU A; 1X40 A; 2EAO A; 4PZN A; 1PK3 A; 2EAM A; 1V38 A; 1SXE A; 5JRT A; 2K60 A; 3TAC B; 5F3X B; 2KIV A; 2K4P A; 2F44 A; 2QB1 A; 2QB0 A; 2B6G A; 2KSO A; 4NJ8 A; 2LPE A; 3TAD A; 2KSO B; 1WWU A; 2ESE A; 1F0M A; 4IS7 A; 2D3D A; 5JU5 A; 1X9X A; 2E8O A; 1COK A; 1B0X A; 1Z1V A; 1UCV A; 3BS5 A; 2KG5 A; 5J8Y A; 2L5Y A; 3BS5 B; 2DKX A; 2D8C A; 2DKZ A; 3HIL A; 2E8P A; 2QB0 B; 3KKA C; 1OW5 A; 1LKY A; 1SV0 A; 2EAP A; 3K1R B; 3SEI A; 4NL9 C; 2LMR A; 1LKY B; 3H8M A; 4RQN A; 2JV3 A; 2F8K A; 2E8M A; 1DXS A; 3IDW A; 3SEN A; 2EAN A; 1B4F A; 2QAR A; 1UQV A; 1X66 A; 5KNI A; 3KKA A; 1PK1 A; 2KE7 A; 4MHV A; 2GLE A; 1PK1 B; 2ES6 A; 4PZO A; 5L1M A; 1JI7 A; 3BS7 A; 5JTI A; 2FE9 A; 1KW4 A; 1OXJ A; 3TAD C; 2E8N A; 2DL0 A; 1WWV A; 2Y9U A; 2Y9T A; 2QAR B; 1SXD A; 4NL9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EDU A; 3BZC A; 4RU9 A; 2W8L A; 7ICJ A; 3BQ0 A; 1M6Y A; 1ZQP A; 4DL4 A; 3MFI A; 3GIM A; 1D8Y A; 4YMN A; 5KFO A; 5F9N A; 1HJP A; 4YCX A; 3UMG A; 1X40 A; 2EAO A; 4UAZ A; 4QZB A; 3SV3 A; 5KFG A; 2W9C A; 4DCC A; 3JPP A; 2FI1 A; 2OYY A; 2WF7 A; 2K4P A; 4DOB A; 3N28 A; 2XY5 A; 2OXO A; 4US8 A; 3RB6 A; 9ICO A; 2R8I A; 4J9O A; 4BXO B; 3R9K A; 1ZJN A; 3OPX A; 4C8N A; 3KBB A; 4QZE A; 5KT5 A; 4DL7 A; 2HOQ A; 4ED2 A; 4BJQ A; 3M1Y A; 3PML A; 3SAG A; 1IV8 A; 4Z6E A; 4FS2 A; 5CRX A; 3M8S A; 1X9M A; 2V9W A; 4O3N A; 4RQ8 A; 1ZQY A; 1C7Y A; 4QWC A; 5AK3 A; 3G6X A; 2KK0 A; 2HHQ A; 1U9L A; 1FIQ A; 3MDC A; 4DQI A; 2DQN B; 3SD7 A; 5D49 A; 4F8R A; 2RDI A; 1WUD A; 5ALI A; 4KMO B; 3PX6 A; 1Q46 A; 2E5S A; 1X6I A; 2KFN A; 1AQ6 A; 3TAD C; 4UB5 A; 2BPF A; 3PZP A; 2A19 A; 2AU0 A; 2BGW A; 4UAW A; 5J2K A; 3OJU A; 4I2C A; 4B9T A; 5AI6 A; 3BJY A; 2LI6 A; 5ALJ A; 4DSK A; 3NVW A; 4O3O A; 4UW9 A; 4NLB A; 4GC6 A; 1A0P A; 4BWJ A; 1L7M A; 3OHB A; 3SAH A; 4UAV A; 8ICK A; 1BPZ A; 2YB1 A; 1BGX T; 2R8G A; 1SZH A; 5HMM A; 3M6Z A; 4PGY A; 3TAD A; 2PKE A; 5KFC A; 1TK5 A; 1KBU A; 2FMS A; 2KIC A; 1BNP A; 4C4S A; 1RPL A; 2H3I A; 3LVV A; 4IL6 U; 1SB3 C; 1Z1V A; 1RYS A; 4RQ0 A; 3PSI A; 2AGO A; 2D8C A; 1DK3 A; 2IA6 A; 2ZIV A; 4YXJ A; 4ECZ A; 5KFE A; 2WF9 A; 4XRH A; 4GLX A; 5AKJ A; 4PHE A; 8ICJ A; 8ICW A; 4DQS A; 3SV4 A; 3QUB A; 3H8W A; 4YD1 A; 2MU2 A; 5J0R A; 4PGQ A; 4PHP A; 4UB8 U; 2P35 A; 4P0Q B; 5KT7 A; 4EBE A; 3SEN A; 5KAI U; 3QU5 A; 1ZD4 A; 4OJ5 A; 1B4F A; 3O0F A; 3CRX A; 5KNI A; 1KFS A; 1NK0 A; 3RRG A; 4Y2Q A; 2FMQ A; 4IRD A; 1GO3 F; 5AKK A; 5A0L A; 1Z4O A; 5G5H A; 1N5W A; 4F4Y A; 3RB4 A; 2FE9 A; 3NUQ A; 1PVP A; 2GH1 A; 4U7C A; 2ALZ A; 4EZ6 A; 5EE3 A; 1UA1 A; 4I2B A; 3MR3 A; 9ICC A; 5EE0 A; 2Y9T A; 4CF4 A; 3WK6 A; 4Y2X A; 5KT4 A; 1QSS A; 1BPB A; 5ALU A; 4YP3 A; 7ICP A; 4KIT B; 4KLE A; 4Q44 A; 2HSZ A; 5DLG A; 4ED7 A; 1ZQR A; 4C7Y A; 1RQL A; 1S77 D; 4TQR A; 2QKQ A; 5AKL A; 3V6H A; 4LJX A; 9ICK A; 3SQI A; 4ICA A; 3EW9 A; 3FYH A; 5JRT A; 2WF5 A; 4BWM A; 2QB1 A; 3QZ7 A; 4RNN A; 5KFI A; 2QB0 A; 4I2F A; 4NJ8 A; 4DS4 A; 5ALS A; 3IV6 A; 1PZN A; 2ESE A; 5ALD A; 5D46 A; 3ZD9 A; 3HW8 A; 2KEY A; 3FM9 A; 4DQR A; 3H0L B; 1DRG A; 4RQ6 A; 3BZK A; 1QSY A; 2JH7 A; 4IRK A; 2C28 A; 4FZN A; 5ALV A; 2L5Y A; 4ED8 A; 4TUQ A; 1QQ7 A; 1S0N A; 1XS9 D; 1Z3E B; 1K1Q A; 5EE9 A; 1ZQA A; 2F8L A; 3H40 A; 4RQ3 A; 4DLG A; 3KKA C; 3PW4 A; 3TAN A; 4Y2V A; 4RQN A; 2HHT A; 5J0W A; 2M9N A; 4TUS A; 5L1L A; 4CNQ A; 9ICG A; 2EAN A; 4DS5 A; 4GXJ A; 4O3Q A; 5ALM A; 2BR0 A; 2BDU A; 4KLD A; 1LB2 B; 1X9S A; 3GZF A; 3SYZ A; 2JGA A; 1T94 A; 1ZQC A; 4O0I A; 1FFU A; 3L3F X; 1QSL A; 3HX0 A; 4F5N A; 2JZB A; 3IG5 A; 2W55 A; 4J9R A; 1QQ5 A; 2C2E A; 2A1J B; 4UAY A; 2KHV A; 7ICK A; 1KFD A; 5GTI U; 3SR6 A; 4J9M A; 1IM4 A; 2FLL A; 2V4R A; 3PNC A; 2Z7J A; 2MA1 A; 3N7R C; 4YG2 A; 4DOC A; 2K8C B; 4O9M A; 1KLN A; 2W04 A; 5KFM A; 1S0M A; 3I1Y A; 1TFR A; 2G08 A; 3KHR A; 3UPQ A; 4EBD A; 2W9B A; 4DSL A; 4O3P A; 1SXE A; 4F2R A; 3RJF A; 2W9C B; 3Q8L A; 3PSP A; 2KIV A; 3C29 A; 4DFD A; 7ICG A; 2W3S A; 4M9J A; 2DPI A; 1TK0 A; 2RP5 A; 3M9N B; 4CRX A; 7ICQ A; 5AKG A; 2IHN A; 5KG6 A; 2VA3 A; 3TFR A; 2DWQ A; 3C2L A; 3SZ2 A; 4KLJ A; 1FEZ A; 4J9N A; 4ECT A; 2RLT A; 2BHN A; 3D2N A; 4P4O A; 3JPR A; 2YMQ A; 4GIB A; 5HP4 A; 2AJQ A; 2IBK A; 4XA5 A; 2HI0 A; 4IRC A; 3PO4 A; 1D8B A; 1CRX A; 2OEH A; 5KFP A; 4C0Z A; 4RQ1 A; 2WF6 A; 5AKH A; 5KG1 A; 3C1Z A; 1XSL A; 3KOO A; 2VJ4 A; 2XCP A; 4I2E A; 5ALL A; 5FP0 A; 5IIM A; 3KHL A; 3EWA A; 3C21 A; 4DSF A; 1DK2 A; 4KX3 A; 1OXJ A; 2XO7 A; 2KZ3 A; 3C23 A; 1NOM A; 1T7P A; 1QTM A; 4MFA A; 7ICN A; 2JEG A; 5AIA A; 4I2G A; 4O5K A; 4RQ2 A; 1NJW A; 4KX5 A; 2HMX A; 2ZJ8 A; 4QIW C; 2AH5 A; 5KFQ A; 2G5H B; 2IOF K; 1JXL A; 4DO9 A; 1X2I A; 3RJG A; 5KFV A; 2JEJ A; 2H5X A; 4LVS A; 4F5Q A; 2DFL A; 1TE2 A; 7ICR A; 2ZIX B; 4QWB A; 1J2M A; 4ECX A; 5IIL A; 2AQ4 A; 5AKZ A; 2KIW A; 4O5C A; 2F1H A; 2FJ6 A; 1S10 A; 2KSO A; 1V9P A; 2C2R A; 5JU5 A; 3THV A; 7ICV A; 4C7Z A; 3TI0 A; 5ALY A; 5HML A; 2OCE A; 8ICH A; 4Y2Y A; 8ICE A; 2ZTD A; 4MF2 A; 5J0P A; 5DDY A; 1B43 A; 4UQG A; 1IG6 A; 2R8J A; 3H0M B; 3CNH A; 2VA2 A; 1SKW A; 4DSE A; 4QZD A; 2F8K A; 2R8H A; 3EPI A; 3GIL A; 2KV2 A; 4P2H A; 4I2H A; 1QQ6 A; 1ZQS A; 4CCH A; 5J2H A; 3OGU A; 3HP6 A; 1MA7 A; 1JAL A; 2VKQ A; 2XID A; 2XVT A; 1PK1 A; 5C0Y A; 4FBU A; 5CA7 A; 8ICR A; 5L1J A; 1TAM A; 2W9M A; 1ZET A; 2JEI A; 5J2I A; 2JH1 A; 4JMU A; 4DFK A; 5KFF A; 5T14 A; 3PW5 A; 4K4I A; 4C4R A; 5AM0 A; 4RT2 A; 2ATL A; 2NV3 A; 4B9S A; 1SXD A; 2BPC A; 1ZRN A; 3Q8M A; 3KFU F; 4YMO A; 4QW8 A; 4DWI A; 4P0P B; 3I28 A; 1IXR A; 2DBY A; 3QUQ A; 1N62 A; 3CP8 A; 2BCQ A; 1ZQG A; 2NRX A; 2W11 A; 3QNM A; 1UT8 A; 5DQH A; 4Q45 A; 4RUA A; 4ECU A; 3C5F A; 1JX4 A; 3FAH A; 1N63 A; 2K60 A; 3AM9 A; 3GIK A; 3F2D A; 1ZD2 P; 9ICW A; 2ISP A; 3RRH A; 2LPE A; 2YQE A; 1ZQO A; 3MFH A; 4QZC A; 4U6P A; 3V7J A; 4I29 A; 5DG7 A; 2K4H A; 2ZUC A; 1ZQE A; 8ICS A; 4I2A A; 5AM4 A; 1ECW A; 3ICX A; 4J9L A; 1MC8 A; 1U48 A; 2KJ8 A; 1ZQ1 C; 5AM1 A; 3A0H U; 5KFA A; 5KT3 A; 2MUT A; 3M9O B; 1L7P A; 3GU3 A; 2ZUB A; 5B5E U; 2WF8 A; 3GV5 B; 4QZ9 A; 3NVV A; 8ICN A; 3RAQ A; 1XO1 A; 3QXG A; 1CUK A; 1XU4 A; 8ICC A; 2W3R A; 2ZIW A; 5AK6 A; 4DF4 A; 3QEB Z; 2K8B B; 5J2B A; 2KE7 A; 3TFS A; 5KFL A; 1X6J A; 5AIB A; 2K4I A; 5DB9 A; 2PI5 A; 2UVU A; 1N56 A; 3QEA Z; 1XNS A; 4UAT A; 3CYM A; 3EYZ A; 5IIO A; 2RRD A; 3LYS A; 3Q8P B; 2H3Q A; 2M0N A; 1U45 A; 4K4G A; 2JZB B; 2DL0 A; 4US9 A; 2Y9U A; 3A0B U; 2BQR A; 3SAF A; 1N5X A; 2LM1 A; 2G07 A; 1L6N A; 1MQ3 A; 2ZJ5 A; 2Q4T A; 2W7P A; 3C28 A; 1ZXI A; 4ED0 A; 1JRO A; 4JWM A; 1BPD A; 1ZQV A; 3D2Q A; 4GFJ A; 1Z19 A; 5J0Y A; 4LZD A; 5KG5 A; 2KJ5 A; 3S6J A; 2RDJ A; 1F5S A; 4KLF A; 2D6F C; 1SV0 C; 1SGG A; 5J0S A; 3LVW A; 2GWS A; 1ZQL A; 1ZQX A; 4M0A A; 3T3F A; 2BCU A; 7ICS A; 2W9B B; 1Z4N A; 3WK4 A; 4A8E A; 2ZG6 A; 3FC4 A; 1CI4 A; 3ZDC A; 4KLI A; 2YML A; 3H4B A; 1XWL A; 2ZTC A; 3LK9 A; 2G0A A; 5KG7 A; 3I76 A; 1WG8 A; 9ICM A; 4HYK A; 3IP4 B; 8ICB A; 1NKB A; 3F5A A; 4Z6D A; 3TAP A; 2LYH A; 5L1I A; 2HOF A; 2J6T A; 3T5L A; 4NLN A; 1SV0 A; 1QH9 A; 3ORY A; 4BDP A; 5KL1 B; 1A76 A; 2ODG A; 1JMS A; 4O3S A; 3WKE A; 3UM9 A; 4QZF A; 5J0U A; 5CB1 A; 4TUR A; 3PW2 A; 4R66 A; 3ZDD A; 4EEN A; 1ZQN A; 5KFT A; 3MAB A; 4QZI A; 4F71 A; 1JI7 A; 2CPR A; 5AK5 A; 2PXI A; 4LZG A; 3RB0 A; 1L3T A; 5J2J A; 3RFA A; 4EX6 A; 4JK1 A; 1KTQ A; 9ICI A; 1HEK A; 5D4B A; 3NRW A; 4ELV A; 3QU7 A; 2QAR B; 2XI9 A; 2G09 A; 2DF4 B; 4ACO A; 4QNL A; 1ZJM A; 2NO4 A; 4QZA A; 2UVV A; 4NLC A; 5AM3 A; 3ZDB A; 2GO7 A; 3DDH A; 4DQP A; 3VC8 A; 5KT6 A; 4OD0 A; 4F93 B; 4QWD A; 2NRV A; 4GC7 A; 3NRZ A; 3MR6 A; 1PVQ A; 3WKB A; 3Q8K A; 9ICR A; 2EAM A; 4NXZ A; 1WCN A; 5ALR A; 4Z6F A; 2XCA A; 1SL1 A; 1KKX A; 3ZD8 A; 3E2E A; 1BVS A; 2OH2 A; 2HBL A; 4B9U A; 2KSO B; 1ED1 A; 4DEZ A; 4IS7 A; 9ICA A; 5ALZ A; 5AIC A; 2EZZ A; 4UB6 U; 4M9G A; 4KN7 A; 1U4B A; 3PVX A; 1U49 A; 7ICU A; 2ZIU B; 1NK6 A; 1JIH A; 1O08 A; 2FPK A; 2XGP A; 3PW7 A; 4R8U B; 3PR5 B; 2P66 A; 2ZXI A; 4RQ7 A; 3H4D A; 2E8P A; 5AI5 A; 4IQV A; 2YX8 A; 2K8A A; 2H3V A; 3CW2 C; 4EEK A; 2AXT U; 3C2K A; 1L7N A; 4EEY A; 5AM5 A; 5DG8 A; 1UQV A; 1X66 A; 4I27 A; 2UVW A; 4YFK A; 4DL6 A; 2VA8 A; 5KFW A; 1VDV A; 4MEY A; 5KFZ A; 1O03 A; 1PK1 B; 2I6X A; 1ZQM A; 3M8R A; 4Y2S A; 2YY6 A; 3OHA A; 1D9D A; 8ICI A; 4OCZ A; 1KW4 A; 3JPO A; 2A3V A; 3M6K A; 1BPE A; 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2BCV A; 1DGJ A; 4B9L A; 3RJI A; 5KFR A; 1UA0 A; 1K1S A; 4TQS A; 2KN7 A; 1HIW A; 5HR6 A; 1V38 A; 5ALP A; 1H38 A; 3TAR A; 4UB3 A; 3TAC B; 2K4E A; 4OJO A; 3K75 D; 3WK9 A; 1TKD A; 3AU6 A; 3NGD A; 4P0Q A; 1FO4 A; 2KVC A; 3PX0 A; 2BPG A; 4EZ9 A; 5BOL A; 3NTU A; 1UCV A; 1C20 A; 2KG5 A; 9ICN A; 4G9B A; 4KLT A; 1UPH A; 5J2D A; 3AL0 B; 4UAS A; 3T5H A; 2C22 A; 1OW5 A; 1S8O A; 1LKY A; 4C8M A; 3SEI A; 3IHQ B; 1B22 A; 1NK4 A; 1NJY A; 4B6J A; 9ICP A; 4QJF B; 2F1J A; 4NLZ A; 4YD2 A; 2KP7 A; 1ZD5 A; 4BUG A; 3PST A; 5KFN A; 3GQC A; 7ICI A; 5DGA A; 7ICE A; 1Q3U A; 1ZQK A; 2ZIV B; 2K89 A; 4NM2 A; 1S76 D; 3B0Y A; 1BNO A; 1ZQD A; 3QYP A; 4KMU A; 5KT2 A; 3MDA A; 1YZ7 A; 2HOI A; 5DGB A; 4B9M A; 4OJ6 A; 3JPQ A; 3RTV A; 4M9L A; 3IM1 A; 1NK5 A; 4FFD A; 4IQT A; 3BDP A; 2MRL A; 4DQQ A; 1WYG A; 1MSW D; 4Q8E A; 1L3U A; 3ISB A; 3C5G A; 1RG6 A; 2PMZ C; 3V72 A; 4QWE A; 8ICZ A; 2WFA A; 2FPL A; 4PHA A; 1RQN A; 9ICQ A; 3QZ8 A; 2ASL A; 3IG8 A; 4QZ8 A; 5DQI A; 3BQT A; 2P6R A; 2HHW A; 1TVA A; 1ZQU A; 5CR0 A; 4O5E A; 1RDF A; 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