2DMLA

The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse protein disulfide-isomerase a6
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GSSGSSGAVSGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDGLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVNADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGANKNKPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse Protein disulfide-isomerase A6
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A6
source organism Mus musculus
molecule tags Isomerase
total genus 24
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dmlA01
1WRYA 1XXUA 1R26A 5IIZA 5IMCA 3ZZXA 2CT6A 4WKWA 2C3NA 3ZRDA 2GQMA 4KDXA 3FEUA 2OADA 2MYGA 5JCWA 3ERGA 1FVKA 1PQNA 3MAKA 1BEDA 2BTOT 3H8QA 1TJDA 2YPMA 2ON5A 4CW9A 5FT3A 1F2EA 2GSRA 4TXOA 4MZBA 3ZIVA 1Z3EA 5CYYA 1PKZA 1XW6A 2IFQB 3W8JA 1O73A 2OE3A 4XTSA 1V2AA 5D9XA 2VUPA 3QPMA 2YNXA 2GTUA 3I43A 2OBKA 4X0XA 2K6VA 2PGTA 1BQ7A 1TU8A 4K8MA 3GKXA 2I81A 4HJ2A 2NVLA 3M9JA 3UL3A 2LQQA 2C0GA 5IMAA 3ZFLA 1XZOA 2L57A 5IO0A 4MABA 2ZNMA 3LFLA 4EDYA 3WGEA 1QFNA 4JR6A 1SD9A 5ECPB 2DJ0A 4BWSA 1AC1A 5CAXA 2FHEA 4AJ6A 1ZYQB 1IYHA 2V6KA 3ME8A 3CYNA 4N11A 4ACSA 2LUSA 4BPYA 4RI6A 2LJAA 1SYXA 2KLXA 4POLA 4MMMA 1M2AA 3GUSA 2B6MA 1FOVA 1M2DA 4E8HA 1VF4A 3VI7A 2OACA 3F6DA 3DVXA 3P90A 3HVSA 3M3MA 3Q74A 1MD4A 3W8SA 4MZWA 2CVDA 4KDYA 5B6MA 3ZMKA 2IL3A 4IQ1A 5A5KA 1PN9A 1R5PA 1MDKA 1GWCA 2LQOA 5H5RA 1GUHA 2VM2A 3IE3A 2VCZA 1PA3A 2GZYA 1GLPA 5B8BA 1TRUA 2H0HA 3L0HA 3M0FA 4GCIA 4YQUA 4Q5RA 4ZBBA 14GSA 1B4QA 2BJXA 5G5FA 4AGSA 4G9HA 5CP1A 4OFNA 5FWGA 3NIVA 3D6IA 4KX4A 2LJKA 5J9CA 3F3QA 1EGRA 1U3AA 4IP1A 2WS2A 3TCOA 4ECCA 4K7NA 5EVOA 1A8LA 3C1SA 1XOAA 5HFIA 4ECBA 5A4WA 3CXGA 2AJQB 1VGLA 5ABRA 3TJFA 3DRNA 1ON4A 2H6XA 2HRNA 4KCAA 4KSOA 3RBTA 5JWOB 1YJ6A 5A4UA 4O32A 1X0RA 1GNWA 5DCGA 3APSA 2BMXA 2X64A 2H73A 2K8VA 4MF6A 3TDGA 1JZDA 1OAZA 2VCVA 1B4PA 4JE1A 4MLYA 4GQFA 1GULA 2VL3A 2PERA 1G6WA 1OVNA 3KMOA 1BJXA 3UMAA 5G1LA 5J41A 2HI7A 5DQSA 2VD0A 4JZQA 2IN3A 1LBKA 1OE8A 5JCUA 2TRXA 4FYCA 2O87A 2CAQA 5CO3A 3C73A 3FZ5A 4NAXA 4K9ZA 2N5AA 4K6XA 3GX8A 4NPBA 1PKWA 7GSSA 5INYA 5HR0A 2LNSA 1W4VA 5F07A 2O89A 5HFKA 4N0ZA 5AGYA 4G10A 1TP9A 1KNGA 5AIXA 1J0FA 4EO3A 4OO4A 1R7HA 3UEMA 4GRFA 5KN3A 3TJKA 4EC0A 3TJBA 5DAKA 3F0IA 5LNKe 1A0RP 4ISDA 2H1GA 5A4VA 3A2VA 2VIMA 1T1VA 2KP2A 2DIYA 1Z6MA 2IIYA 1TK0B 3HYPA 1EP8A 2VL2C 1WWJA 4BL7A 2FWGA 3ZMLA 2A2SA 1QUWA 2PVQA 3BJ5A 2AYTA 5COHA 1UC7A 1HNCA 2B1LA 1DBYA 4GF0A 1Q4JA 2C8UA 3L9UA 4F03A 4WETA 1JZWA 3TGZA 1GTAA 1Z7RA 2V6OA 3ZFBA 2ZCTA 3H4KA 4MZCA 4F2IA 4QL9A 2P31A 1HNAA 1AAZA 1M99A 1RQMA 5AIVA 2DJJA 4BVYA 2H70A 1S3CA 3LEFA 2VCQA 4PXOA 2XPDA 2R6KA 1XOBA 2FY6A 4XHMA 2PMTA 2E7PA 1U6TA 3P2AA 3CTFA 2CV4A 2H72A 2C4JA 2LTKA 1O85A 1AW9A 3N5OA 4N0VA 1WMJA 3IC4A 3QFAC 4MF5A 2IMFA 5AISA 5HR2A 2YN1A 5IPHA 5C00A 2TIRA 3WYWA 5ECOB 3VWVA 3HA9A 4J56E 4KDUA 1EEJA 4J57E 1KBNA 2R3XA 5F8BA 3A5WA 1A24A 1IYIA 1TXXA 3M1GA 4ZB8A 4ZBDA 1W89A 2PWJA 4ZIJA 2WCIA 3G7YA 3HVVA 1FB6A 3BCKA 4BA7A 3C71A 4RUVA 1AXDA 3GSSA 2RUEA 1TK5B 22GSA 2GQLA 1ERVA 1YEPA 4MPFA 2FD3A 3P8WA 3CRUA 2P5RA 4BVXA 4HOJA 2WFCA 1F9MA 3EVIA 1GSUA 3WGDA 2E2GA 4OD7A 3ZYWA 3TKSC 3MWHA 5DJLA 4DVCA 3GKKA 1SL2B 2GGTA 2VLTA 4J2FA 2IJYA 3HDCA 4NV5A 2PPTA 2AB6A 3FYGA 1XW5A 2CZ3A 1XVQA 1YDKA 3BD2A 3DD3A 2N5FA 3APOA 2YV7A 2K8SA 1A23A 3FRCA 2XC2A 2AAWA 1PD21 4F0BA 4PUAA 4GTUA 1UVZA 2C0DA 4G19A 4GSTA 2C0EA 4TXVA 2JZRA 4OFMA 2HT9A 1E2YA 3KH7A 1EOHA 3KD0A 2H1DA 4DSRA 1K0MA 2XPEA 2E0QA 1XIYA 1WJKA 3D0ZA 4MJCA 4D73A 4GSSA 4GXZA 3TUEA 2B5XA 1T8EB 4POKA 1U88A 1A2LA 3H79A 2J9HA 4KNDA 1K0BA 1XWAA 1QK8A 5C04A 2VLUA 1GL8A 3GN3A 2I3YA 1USBA 2LS5A 3HJOA 3KZQA 2H75A 2JSYA 3IBHA 4AJ8A 3C7MA 2HSYA 5KN0A 4HZ4A 1SL0B 5B7CA 5ECQB 2LV3A 1URMA 4ZILA 1J08A 1SK2A 1I5GA 3F6FA 1NSWA 3UIWA 3LORA 4PQHA 1YKAA 2NTOA 5DVBA 2C80A 1PSQA 4V1Ag 1XBSA 6GSVA 4XRDA 3EE2A 2B7JA 2VOCA 3PGTA 6GSXA 3S9FA 5KEJA 4IQAA 4MJAA 5EY6A 1PMTA 2X8HA 2IWTA 1G7OA 1R4WA 2DJKA 1X5CA 1CQHA 3EU4A 1KEBA 1YY7A 1V98A 2G2QA 3GX0A 4OCEA 17GSA 3PINA 1ZCPA 1AQWA 3US3A 1SENA 2F8AA 3L9VA 5ENUA 2H6ZA 3H1NA 2WB9A 4O5RA 2DC5A 1X5DA 4XS6A 4IN0A 6GSYA 4D73B 4YQMA 2DJ2A 3LSZA 4V2NA 3TKPA 2X8GA 3TRQA 3V1WA 4GSNA 2IMDA 1T7PB 3KIJA 3PH9A 1GTUA 4ZL8A 1GSEA 3GYKA 1JZRA 2H30A 2YANA 2NBSA 3IK7A 4Z7XA 3LXZA 1M9BA 4HU9A 1ABAA 2XBIA 4CHSA 3VLNA 3CBUA 2V1MA 1O6JA 4BWQA 4NV2A 1GTIA 4L5OA 2FA4A 2Z9SA 1GUKA 3FY7A 4TXOB 1GNEA 4WR4A 1OKTA 5DJMA 3Q18A 5J4UA 2WJUA 3E3EA 2DMMA 3UARA 1S3AA 1XWCA 4K0NA 1K0DA 2H6YA 2JSZA 3LG6A 1R5AA 3TKRA 3IAS2 3U6VA 2PVOC 4K7IA 1K3OA 4EVMA 1X9MB 5GAND 2DJ1A 4V2MA 2GZPA 1SJZA 3A3TA 4L0UA 4X43A 1GSYA 3H93A 1FW1A 3GIXA 3QOUA 1UN2A 4PNFA 2CA8A 2B7KA 2F51A 4GLTA 5CREA 2FUG2 1G6YA 2VL9A 3ZREA 2RM5A 2IMIA 2A2RA 4XRAA 2VD1A 3ZVJD 2H8LA 2PBJA 1SKSB 4K7OA 4TR4A 3O76A 4NHZA 2VCWA 4TR0A 2L5LA 1MD3A 3UAPA 1DUGA 2HZEA 2DJ3A 2L59A 1OC8A 3ERFA 3EWLA 1T4ZA 2I4AA 1MDJA 5KN1A 5IMVA 4IJ3A 2MBSA 4I2UA 2YJHA 2EIOA 5ELGA 4IGJA 4IHUA 1WOUA 5DCHA 2GSTA 3TRXA 2MMAA 2F9SA 3Q6OA 3TOUA 4XIHA 3D4MA 1HYUA 2C0FA 4PX1A 3LYKA 2RUFA 1TRVA 3D21A 3IAM2 3KP9A 3VFIA 2YV9A 1XWBA 4V2LA 1GSSA 2EIQA 4HQZA 4K2DA 4YQVA 1HNBA 3DEXA 3BOAA 4K0GA 2C3TA 1Z7PA 4ZBAA 4OMVA 2F3MA 4TR1A 1F3BA 3IPZA 4KW6A 3TRPA 1GUMA 19GSA 5ECRB 3E0UA 1XVWA 4PUFC 1SYRA 4KE3A 2FCHA 5D9TA 2WGRA 3WD6A 3R2QA 3A2XA 1ERUA 4AF2A 1T3BA 1OC9A 3LYPA 6GSWA 4MCUA 2TRCP 1BX9A 2ALBA 2L4QA 3WGXA 2CVKA 4IW9A 1VRSD 2B1KA 4OWYA 1QQ2A 2R5GA 2J23A 3UJ1A 4MDCA 2JZTA 4I6XA 2HZEB 1YQ1A 3GMFA 1EZKA 3FR9A 2GT5A 1AQVA 5H5SA 5ID2A 4LL4B 3A2WA 1H75A 6GSSA 3RHBA 3EINA 4TVEA 1K0AA 3GRXA 4KGIA 10GSA 4FO5A 4LMWA 1B8XA 1PRXA 1GTBA 2JACA 1ML6A 1SK1A 3F4RA 2HYXA 4RI7A 2N5BA 3TKSE 4ECJA 3KM6A 2JADA 4QQ7A 4XS4A 4F9ZA 3KEBA 2YJ7A 4WBJA 1B9YC 3ZIJA 3HVXA 4EXJA 1SJ6A 1OKDA 3KH9A 3QR6A 2JU5A 2YOIA 2B3SA 2QSIA 1WE0A 2VCXA 5EPFA 2O85A 3ED3A 4Q5NA 5GZZB 4IKHA 1ZGNA 3EC3A 3ZTLA 2LSTA 4EUYA 3VPQA 4LA1A 4TKYA 1N2AA 2K18A 2JL4A 3M8NA 4HZ2A 1M0UA 4WF5A 2P0GA 1SKRB 2OKAA 4E8EA 4RQXA 20GSA 5DAKB 2NPBA 3RAZA 3Q19A 1THXA 4N10A 1PL2A 1JZOA 4HQSA 5HQPA 4TW5A 1JHBA 3QDNA 3FZAA 3LJRA 3QFBC 5G2ZA 2GVPA 6GSUA 3MSZA 3GA4A 3ZLPA 4MK3A 1ERTA 4OFTA 1T00A 1GSDA 1OC3A 5HFGA 3ERWA 2GT6A 4K1FA 1BYEA 2FLSA 4ZL9A 1K3YA 3GL3A 1I9DA 5G31A 3IA1A 1K0NA 4ULXA 3CRTA 4XS4B 2FWEA 1EV9A 2R4VA 2P5QA 2O7KA 1EOGA 1YEXA 2DBCA 1FO5A 2IMKA 3GH9A 3FHKA 3HXSA 4JU5A 5CRHA 4F0CA 1TW9A 5DALA 3GTUA 5JWRB 3I69A 2IPAA 3UBKA 1DE2A 5DQYA 1V9WA 4H86A 2GQKA 3N9JA 1V40A 2CVBA 1F6MC 3EYTA 3VWWA 1O7UA 2H19A 3IRAA 1XW9A 1SKWB 1XCCA 1EP7A 4NWYA 4HU7A 4G2EA 3DVWA 13GSA 1DSBA 3CTGA 4EDZA 3BBYA 4ML6A 3U5RE 4GQCA 2LRTA 4POBA 1C72A 3KCMA 3DYRA 3I9V2 3KTLA 2DIZA 5IM9A 5ELAA 1X5EA 4FIWA 1F3AA 1DE1A 3HKRA 3ME7A 3LXTA 4AJ7A 3KXOA 4ML1A 4POMA 3GKNA 3ZL5A 2H66A 1NHYA 3ZVJA 5G1KA 3K8NA 4DSQA 4NXIA 4RQRA 4PQ1A 1A8YA 4EE0A 5ECLB 3CSIA 1U3IA 3IOSA 2X99A 1YKCA 2HNLA 1A0FA 2HXKA 5ECKB 1B48A 2YWOA 3HD5A 2FA8A 1V58A 1N8JA 2OA7A 1GRXA 1ZL9A 4P3YB 2OE0A 5DALB 1U87A 2YWMA 1A2JA 3GTUB 2MBTA 3VURA 1VF2A 1SK0A 4L8EA 2WDUA 1YF0A 2AUVA 4CDOA 1PX6A 4MJEA 5J5NA 5CRDA 2CQ9A 1FHEA 4OO5A 5IO2A 1O8XA 3F3RA 3LGCA 1B9XC 4V1Ap 3O6TA 2YCDA 3UBLA 2PU9C 5J3RA 2O8VB 4EKZA 4TRXA 4KB3A 3D5JA 1AQXA 1ZOFA 2V2GA 3QAGA 1FB0A 3AY8A 5IQYA 2MMZA 2QC7A 4ZXGA 5F05A 3TB2A 4QL7A 5D96A 5IOXA 3F4TA 4DEJA 2QGVA 3UVHA 4WBRD 4EF0A 4I2TA 3QMXA 5B8AA 4HJMA 3FZ4A 1FAAA 5LD0A 2H1BA 2F8FA 3RDWA 5ECNB 4LLRA 3ZITA 3QD9A 1X9SB 1YF1A 1ACVA 3VI5A 4DSSA 1PGTA 5EL8A 1TTZA 2R37A 3FW2A 4I97A 3VK9A 5D73A 1OYJA 4MA9A 2C1YA 2V32A 4O7HA 4NHWA 1GH2A 1XWGA 3FZ9A 3APQA 1ILOA 5HR3A 2B5YA 3KTBA 1QGVA 4ZB9A 1MEKA 2ZUPA 3FR3A 3DKSA 3QAVA 2GSQA 3VPTA 1TOFA 3RPNA 2M46A 2X8CA 1GP1A 5HR1A 3F4SA 4YAPA 2YWIA 3TJJA 4YH2A 1CQGA 4WEYA 5GSSA 1F37A 2CZ2A 2OBIA 4ZL7A 1AIUA 9GSSA 3HZ4A 1Y6EA 4HI7A 2ON7A 1AUCA 4LMVA 5ECHB 4MH2A 4IVFA 1SD8A 2KOKA 3J7Yk 5CNWA 3WT1A 4XCSA 4X1UA 4PNGA 2HE3A 2R2JA 2DMLA 1TKDB 3OR5A 8GSSA 1KTEA 1LU4A 1O8WA 1T4YA 1EWXA 3IXRA 4IELA 1PL1A 2FNOA 2VAFA 3GKMA 1OE7A 2PUKC 1Y25A 2A4VA 1JLWA 4FYUA 4DSSB 2QKEA 4WF4A 4ZB6A 1NHOA 2K9FA 1H4OA 3PR8A 2VM1A 2EC4A 3W6GA 1G0TA 1A2MA 3SBCA 1XWKA 2LRNA 2H0GA 4HUAA 1BG5A 4JEDA 4KSMA 5AN1A 4JBBA 2GS3A 1Z6NA 1TRWA 3G9BA 1K3LA 4TOPA 2KP1A 2D2ZA 1EEMA 2LKUA 3FKFA 2AHEA 5G30A 2FGXA 3LQ7A 3EU3A 2VCTA 2JZSA 3L9SA 2IMEA 3I6AA 5FHIA 3GURA 2DLXA 5DBQA 3EMPA 2YP6A 1PX7A 4EL1A 1NM3A 4IBPA 1J9BA 4TN8A 3MNGA 5H5QA 3L4NA 2OE1A 3HJMA 4HS1A 2VO4A 5JWQB 1QMVA 5DDLA 1Z5YE 2AV4A 5LCZA 1ST9A 1GSQA 2FWHA 2RIIA 3QAWA 3WT2A 5IMDA 3P7XA 1GSFA 18GSA 3IR4A 4GWRA 4I8BA 3TOTA 2H01A 1TK8B 3G7JA 2CAIA 2L4CA 5CRGA 2LNTA 2RM6A 5GSTA 5D8IA 2YWNA 4WXTA 2L6DA 3F8UA 1TI3A 6GSTA 1BAYA 3C1RA 4FYBA 2KUCA 5F0GA 4YAVA 2XHFA 1WPIA 3KJYA 2H71A 3QCPA 2GDRA 3GNJA 2ES7A 2VL2A 2EIRA 1XPVA 3KP8A 3FR6A 1SL1B 1XFLA 16GSA 1RK4A 2YZHA 2HLSA 4MPGA 4MF7A 2GLRA 3GH6A 3RPPA 3G7IA 3HJPA 4TR1B 3GFKA 3DGQA 2WULA 3C8EA 3KGKA 3BCIA 1LJRA 3HZ8A 5KN2A 4L5LA 11GSA 2WZ9A 4PGTA 1K0CA 4FH8A 3HY2A 2H76A 4N30A 3GHAA 1X9WB 4KH7A 4WR5A 1OC9B 3KMNA 1S3DA 3O3TA 3F63A 3UOMA 3NZNA 1TI1A 2M72A 2H1AA 1ZYEA 3DXBA 5IMFA 2L5OA 3GV1A 2RLIA 4PQIA 4TR3A 2HSHA 2PN8A 2LJRA 3L78A 5ECMB 2XBQA 2FWFA 4HDEA 4MH3A 5L71A 1TDIA 1EGOA 1VF1A 5ID2B 3IDVA 2H0IA 4I5QA 5IMZA 2MMOA 2MMNA 1MTCA 3LWAA 3IHQA 1SJIA 3DMLA 2YZUA 4IS0A 4NMUA 1RW1A 1TU7A 4F82A 2HFDA 5CRWA 1FVJA 5F06A 1THOA 5ECIB 2DSAA 1WIKA 5E4WA 3E9JB 5ECSA 4Q5FA 5G5EA 2M80A 3VWXA 3IK9A 4KAEA 3GSTA 1HD2A 3DWVA 4MP4A 2GZZA 5D9WA 2WRTA 3TKQA 4KUNA 4PURA 1O81A 1K0OA 1V57A 1QXHA 3J7Yb 2HZFA 1E6BA 1UA5A 3EMXA 1M2BA 1TRSA 1JLVA 2NDOA 2B5EA 3CMIA 3DIEA 2LRCA 4LL1B 2VLVA 1FG4A 2I9HA 1M7TA 3ISOA 3TKSA 3D22A 4MJBA 2E2MA 3HCZA 4ILFA 2V41A 4JRRA 4KCEA 2LEGA 2H74A 4ID0A 5E59A 2CX3A 1ZMAA 1Q98A 3HHVA 2IFQA 3GL5A 2G0FA 4OCFA 5D9VA 4KA0A 5B6NA 1EV4A 3CSJA 1ERWA 3RHCA 1G7EA 4HEA2 3M9KA 1M9AA 2KHPA 2OJLA 2CX4A 3SWLA 2HRFA 2C3QA 2MZCA 2I1UA 5IPGA 3IV4A 1JFUA 4JR4A 3D4TA 3FK8A 3EURA 1MDIA 3CSHA 1YZXA 1WP0A 3F9UA 1GLQA 3VWUA 2REMA 4IJIA 1ZZYA 3UVTA 2GSSA 1NW2A 4Q5QA 1Z9HA 5J9BA 5IOWA 3NOFA 3MDKA 4IP6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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