The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
71
|
structure length |
71
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEEKYVTVQPYTSQSKDEIGFEKGVTVEVIRKNLEGWWYIRYLGKEGWAPASYLKKAKDSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-061, a SH3 domain from human
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SH3 multiple domains 1
|
| total genus |
7
|
| structure length |
71
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| sequence length |
71
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LZ6 B; 3PVQ A; 3NMZ C; 1NM7 A; 1JU5 C; 2K3B A; 2AK5 A; 2RMO A; 2D1X A; 1AWW A; 2J7I A; 2RQW A; 2RF0 A; 2X3X D; 4F14 A; 4HVU A; 1NYG A; 1B07 A; 2JW4 A; 1GFD A; 3UA6 A; 2KYB A; 1GCP A; 2DM1 A; 5L23 A; 1U3O A; 1I07 A; 1UDL A; 2KRN A; 1AEY A; 1WA7 A; 2DBM A; 1KIK A; 2ECZ A; 2EPD A; 2L0A A; 1GCQ A; 1A0N B; 3I5R A; 1OV3 A; 1GRI A; 4E6R A; 2EYX A; 2GBQ A; 5IXF A; 2F2V A; 2G6F X; 4HVV A; 1XOV A; 2KT1 A; 2OAW A; 4RTY A; 2CT4 A; 3VS5 A; 1GFC A; 4J9I A; 2FEI A; 4CC2 A; 2OJ2 A; 4J9G A; 4OMM A; 5IH2 A; 4M4Z A; 1ZUY A; 1ABQ A; 2O31 A; 2XMF A; 2DYB A; 4Z89 A; 2EQI A; 2ED1 A; 3UA7 A; 4LE9 A; 1VA7 A; 2EVR A; 1FMK A; 4JZ4 A; 2EGC A; 1NEB A; 1PHT A; 1JEG A; 1IO6 A; 1AWX A; 2SEM A; 4RTT A; 3UAT A; 2KRM A; 4CC3 A; 1WXU A; 2EGA A; 4JPB W; 2JTE A; 3RNJ A; 3QWY A; 2A08 A; 1WX6 A; 2D0N A; 2J6K A; 2GGR A; 3TVT A; 3NGP A; 4HXJ A; 4EIK A; 3VS4 A; 2GTO A; 3EG0 A; 2GTJ A; 2PTK A; 1W1F A; 3EGU A; 4JJB A; 1AWO A; 2D8H A; 2JM8 A; 4A63 B; 2D8J A; 2K79 A; 1HJD A; 2O2O A; 2JXB A; 1B3Q A; 2C0T A; 4CC7 A; 3I35 A; 3THK A; 1Y57 A; 2EW3 A; 2LQN A; 1T3S A; 4K11 A; 4LUE A; 1M3B A; 3FJ5 A; 5IHN A; 1I0C A; 2EGE A; 4GLM A; 2VWF A; 2E5K A; 1S1N A; 2PNI A; 4RTZ A; 2EKH A; 4RTU A; 4RTW A; 2CH4 W; 3EG2 A; 1OPL A; 5FWC A; 2CH4 A; 4J9F A; 3EG3 A; 2KT8 A; 2V1R A; 1K0S A; 5IHI A; 5ECA A; 1UE9 A; 2MOX A; 1WFW A; 2J06 A; 1RLP C; 2JS0 A; 4Z88 A; 4LNP A; 3NPF A; 2ENM A; 1PNJ A; 2V1Q A; 1UJ0 A; 1YP5 A; 2RNA A; 2M51 A; 2JMA A; 4OMN A; 1K9A A; 1X2K A; 2ESW A; 4OML A; 1H8K A; 2DNU A; 3GBQ A; 2FO0 A; 4RUG A; 2P4R A; 1ZX6 A; 1ZBJ A; 2KGT A; 4Y92 A; 1TG0 A; 1VYU A; 2LX7 A; 2JM9 A; 3KFV A; 2DL3 A; 2DA9 A; 1MV0 B; 1NYF A; 2ROL A; 2ABL A; 1ARK A; 2BZ8 A; 4F16 A; 2DJQ A; 1T0J A; 2RQU A; 1X6B A; 2I0N A; 3C0C A; 5GJV B; 1M3C A; 1K4U S; 1AD5 A; 2CUB A; 4J9C A; 2KYM A; 2EBP A; 3VS0 A; 1I1J A; 2EYZ A; 1SHG A; 4IIM A; 2O9S A; 4AFS C; 1QWF A; 5FWB A; 3LH5 A; 1KSW A; 2MCN A; 2LQW A; 2JS2 A; 2LCS A; 1Z9Q A; 1SPK A; 3EG1 A; 2YDL A; 2DE0 X; 2KRO A; 3NHN A; 2IIM A; 1HSQ A; 3SEM A; 2CRE A; 3I5S A; 1TUC A; 1VYV A; 2CDT A; 2L3S A; 4JJD A; 3A98 A; 2K6D A; 2FG0 A; 2VKN A; 1M3A A; 1X69 A; 2DIL A; 1BB9 A; 3TSW A; 3IQL A; 2FPE A; 1ZUK A; 1BK2 A; 1W6X A; 1UGV A; 1VYT A; 3PE0 A; 4Z8A A; 1K0X A; 3VS3 A; 2DX1 A; 2LJ0 A; 2K7A A; 1WXT A; 2LP5 A; 1QCF A; 2FRW A; 2FRY A; 2JT4 A; 1AZG B; 4ORZ A; 3VRZ A; 4AG1 C; 1HD3 A; 1AWJ A; 2DRM A; 2VVK A; 5IXB A; 3H0F A; 3M0Q A; 4WCI A; 2LNH B; 1NG2 A; 1CKA A; 1X27 A; 4IIO A; 1YCS B; 2A37 A; 4J9B A; 4GBQ A; 1SSH A; 2LJ3 A; 1UTI A; 4LN2 A; 1UHF A; 1H3H A; 1E6H A; 2CSQ A; 2HCK A; 2KR3 A; 2DLP A; 1JO8 A; 2KEA A; 2DL4 A; 2W0Z A; 2HEQ A; 4KRT A; 5IHK A; 1UG1 A; 1U06 A; 1KJW A; 1GL5 A; 1OEB A; 1AVZ C; 5I11 A; 1YN8 A; 3VS6 A; 2L2P A; 2ROT A; 3UF4 A; 2KXD A; 1QWE A; 4HCK A; 4AG2 C; 3O5Z A; 1X2Q A; 3M0R A; 1PKT A; 3H0H A; 2DMO A; 4LUD A; 3H0I A; 1YWP A; 2EYY A; 1BBZ A; 2KRS A; 1WI7 A; 2O9V A; 3H41 A; 1W70 A; 2RQR A; 2C0O A; 1PKS A; 2KE9 A; 1QLY A; 2HDA A; 1BU1 A; 1X6G A; 2YUO A; 4JZ3 A; 2RQT A; 2YSQ A; 2YUP A; 1RLQ C; 3R6N A; 2NUZ A; 2KBT A; 2DL5 A; 1RI9 A; 3EHR A; 4RTV A; 1OOT A; 4ESR A; 2OI3 A; 1WYX A; 2ED0 A; 2F2W A; 1EFN A; 2BZX A; 1YWO A; 1E7O A; 1UFF A; 3VS1 A; 2GNC A; 2AKK A; 1G2B A; 1M8M A; 4AFQ C; 2CUD A; 3M0U A; 1K1Z A; 2RQV A; 2BTT A; 2EYW A; 2X3W D; 2SRC A; 2K2M A; 1NEG A; 3TSZ A; 1CSK A; 3M0S A; 2DBK A; 3M0P A; 4AFU C; 1T3L A; 1UJY A; 1JQQ A; 1CKB A; 2B86 A; 4DEX A; 2KXC A; 5FW9 A; 2L3Q A; 3REA B; 1M27 C; 4J9H A; 2J6F A; 2LJ1 A; 3EHQ A; 3SHW A; 3JV3 A; 5I22 A; 2DL7 A; 2MIO A; 3VRY A; 2PZ1 A; 2AKL A; 2O88 A; 4QT7 A; 2C0I A; 1UUE A; 1WLP B; 2AZV A; 2GQI A; 2FPD A; 1UEC A; 2H8H A; 4R0K A; 1GCQ C; 4X1V A; 1KFZ A; 2DL8 A; 4D8K A; 2K9G A; 2JMC A; 1QKX A; 1SHF A; 1WXB A; 5EC7 A; 4F17 A; 1LCK A; 2FPF A; 4AFZ C; 1AZE A; 1QKW A; 1SEM A; 1U5S A; 1T0H A; 2A36 A; 5HCK A; 2A28 A; 1JXM A; 2M0Y A; 1H92 A; 3VS2 A; 4OMP A; 2LMJ A; 4D8D A; 1E6G A; 2J6O A; 5GJW B; 1N5Z A; 1WIE A; 2QDL A; 4OMQ A; 3U23 A; 2YUN A; 1Z9Z A; 1J3T A; 1MV3 A; 2DF6 A; 4CC4 B; 2AZS A; 2W10 A; 1JXO A; 2F2X A; 2KNB B; 4RTX A; 1ZLM A; 1ZSG A; 4J9D A; 2J05 A; 1RUW A; 1NLO C; 2YT6 A; 1ZUU A; 2DRK A; 4JJC A; 3ULR B; 3REB B; 1AOJ A; 2CSI A; 2DVJ A; 4J9E A; 3M0T A; 3QWX X; 1UHC A; 3RBB B; 2HBW A; 1GBR A; 1WDX A; 1Y0M A; 1SRM A; 3I9Q A; 2HSP A; 1FYN A; 1X43 A; 1PRM C; 3VS7 A; 3ZL7 C; 4ZNX A; 1V1C A; 1GBQ A; 2CT3 A; 1ABO A; 4DEY A; 1M30 A; 2RN8 A; 1MUZ A; 1PRL C; 1YNZ A; 4FSS A; 1G83 A; 2L3P A; 3CQT A; 2RPN A; 1K76 A; 3PVL A; 1NLP C; 1SRL A; 1OPK A; 2BZY A; 2NWM A; 4OMO A; 1PWT A; 1TUD A; 2YUQ A; 4HVW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ATC B; 3QZ5 B; 2MYS A; 2K3B A; 2H3E B; 2KK4 A; 3EFR A; 1D3B B; 2HL3 A; 4QVZ A; 2E65 A; 3OYB A; 2K3Y A; 2J7I A; 6AT1 B; 1I5L A; 3VYH B; 1NYG A; 1R0B G; 4M75 G; 4M7A G; 3ASK A; 3QSU A; 4JLI A; 1KIK A; 5GAN h; 5LJ3 h; 2EYX A; 3WVD B; 2GBQ A; 1D3B A; 1OZ2 A; 4E7L A; 2G6F X; 1M1K R; 2CT4 A; 2V8J A; 2K3X A; 3E19 A; 4P5N A; 1HXD A; 1GFC A; 4J9I A; 4CC2 A; 1VQN Q; 2OJ2 A; 4OMM A; 4DQ2 A; 2HQE A; 2E1H A; 2E10 A; 1VQ6 T; 4PK4 A; 3SB2 A; 3CPW P; 3UA7 A; 5KYU B; 4C8Q F; 3L2W A; 1VA7 A; 1QMC A; 2EVR A; 4PJN A; 4OGC A; 3I55 A; 1EZZ B; 4ZGE B; 1IO6 A; 1C1A A; 4RTT A; 3UAT A; 2Y4Y A; 2LX9 A; 3G4S A; 3CCV T; 2E3I A; 3QWY A; 1O9S A; 2J6K A; 4BAC A; 2YRV A; 2GGR A; 1YJN A; 3NGP A; 4HXJ A; 1YIJ T; 3I56 A; 1M90 U; 1V76 A; 3WVE B; 1G3W A; 4V2S A; 4JJB A; 2JNG A; 4HCZ A; 1WNL A; 4J5Y A; 2D8H A; 3OBY A; 3ZEH A; 1HJD A; 1RAE B; 1B3Q A; 1MND A; 2C0T A; 4CC7 A; 1Y57 A; 4M77 F; 4L5G A; 3HRS A; 4EDU A; 3PIO A; 4EMK B; 3FJ5 A; 1IB8 A; 3CD6 A; 2CP6 A; 4BUG A; 3A8L B; 1I0C A; 1KK7 A; 2ZAE A; 3CC7 A; 2PNI A; 2EKH A; 4RTU A; 2CH4 W; 5FWC A; 3CCJ Q; 1IRE B; 5GAN 7; 4C0G A; 5EG2 A; 3JCM P; 5DLO A; 1K9M R; 1WFW A; 1VQK A; 3CC2 Q; 2J06 A; 1VQP A; 2CKK A; 4PJO A; 3L2Z A; 3GP8 A; 5DY9 A; 2EJG A; 4FCY A; 1UJ0 A; 2YWW A; 1YP5 A; 2RNA A; 2K2V A; 1K9A A; 3HRT A; 3GLX A; 3T9N A; 4HT8 A; 2DNU A; 5CAI A; 1JJ2 P; 3VUZ A; 4KUD K; 3MO8 A; 1TOV A; 4A53 A; 4Y92 A; 2DFU A; 1VYU A; 1WZO A; 5CQY A; 2P0Q A; 2DA9 A; 2KQW A; 3RKY A; 2ABL A; 4E2F B; 3EGX A; 1N9S A; 4C92 F; 4GLK A; 2QAS A; 4EMK C; 5GAM h; 3C0C A; 4XTW A; 4DBF A; 4OGE A; 2F5K A; 2KYM A; 3E2U A; 4WF2 A; 2EYZ A; 4PJO G; 1G8X A; 3I55 T; 5HK0 A; 1N27 A; 1JJ2 A; 3G4S T; 2LQW A; 2JS2 A; 4FM4 B; 2YDL A; 3CCM Q; 1YJN T; 3I56 T; 2VYT A; 3CCE Q; 3NTH A; 1QW1 A; 3A98 A; 1NJI C; 2VXE A; 2VKN A; 1KD1 U; 1YIT A; 2XDP A; 1BK2 A; 1U1S A; 1K0X A; 1VQ5 A; 4D6W A; 1VQ7 T; 3CD6 T; 1OUL A; 2LP5 A; 3CC7 T; 3JCM d; 4OVA A; 3V8L A; 5KCH A; 4ORZ A; 3HRU A; 3JCM b; 2DRM A; 1FXX A; 2VVK A; 5IXB A; 2LQ8 A; 3H0F A; 5GAN 3; 3M0Q A; 4WCI A; 2LNH B; 1QVF S; 4FYY B; 1NG2 A; 1VQP T; 2FZK B; 2X4J A; 2WSE E; 2VV5 A; 4X34 A; 4XTY A; 5CKF A; 1H64 1; 2LJ3 A; 3OYF A; 1E6H A; 2CSQ A; 2KI7 A; 2KEA A; 1N6A A; 4RCC A; 1KJW A; 1PCX A; 1YJW T; 3OS0 A; 5I11 A; 3VS6 A; 5KE2 A; 4XU2 A; 2JZ2 A; 2Y4X A; 1QP3 A; 2GQV A; 4AG2 C; 3O5Z A; 1X2Q A; 2IPO B; 1BCO A; 5LL6 S; 5KYY B; 2QDY B; 2LT1 A; 3JCM g; 3M58 A; 2DET A; 4FW1 A; 4YTL A; 1VQN A; 2CP7 A; 2KE9 A; 4JZ3 A; 2YSQ A; 4FW2 A; 2ZCF B; 3JCM W; 1VQ6 Q; 1RI9 A; 2QTV A; 3UPU A; 4PFZ A; 5KYX A; 5FRO A; 3RES A; 4KH0 B; 3RKX A; 3OYL A; 2BZX A; 2HSE B; 1YWO A; 3QKJ A; 1Q81 R; 3VJP A; 4E7K A; 2AKK A; 1WHG A; 3RER A; 2CUD A; 2AHJ B; 1K1Z A; 1Q95 G; 1U1T A; 4RG2 A; 2RQV A; 1MHN A; 1VQ5 T; 2V8I A; 2P0P A; 2QQS A; 2SRC A; 2GF7 A; 2DBK A; 2QAZ A; 1BI2 A; 3MP6 A; 5GAN 6; 4KH1 B; 1D0X A; 3V7R A; 1PSE A; 2KXC A; 5FW9 A; 4RKU E; 1M27 C; 4M77 C; 4HT9 A; 3JV3 A; 5I22 A; 2DL7 A; 2MIO A; 3VRY A; 4QT7 A; 4PJO D; 4BI8 B; 2C0I A; 1VIF A; 3CCJ A; 5D7U A; 2GQI A; 1M90 R; 1M1K U; 2RHU A; 4X1V A; 2OX7 A; 2EWN A; 1KQS S; 1QKX A; 2YRD A; 3CC2 A; 3ZFJ A; 4M75 F; 4AFZ C; 4M7A F; 1AZE A; 5DM7 R; 1QVF P; 1QCN A; 1T0H A; 4M7D A; 3BY7 A; 3QYH B; 1JXM A; 4OF1 A; 4AT1 B; 5CKD A; 3ER0 A; 4M78 B; 2LMJ A; 1NPR A; 1PG5 B; 1OU9 A; 2RI2 A; 1OYX A; 1M1G A; 1VQN T; 3GF5 A; 2AZS A; 2W10 A; 2R5A A; 2BUD A; 3SWN A; 2EQU A; 2JVV A; 4F7U G; 1JXO A; 3FRN A; 2DAQ A; 2QQ9 A; 4RTX A; 4QVC A; 2E41 A; 2YHT A; 3PMI A; 4KGZ B; 4F04 B; 1RUW A; 4UC4 A; 2A3L A; 1QVF A; 3REB B; 2HKQ B; 3OYC A; 2CSI A; 4DOV A; 4LXC A; 4HKE A; 4M7D G; 4KBM B; 2C06 A; 4FU6 A; 2VB6 A; 1PRM C; 5KYN A; 1F1B B; 4C8Q E; 4A54 A; 3CCM A; 1D1C A; 2L3P A; 3JCM h; 4M78 C; 1Y96 B; 3CCE A; 2KDS A; 2M16 A; 1K76 A; 1NLP C; 1SRL A; 1KC8 C; 5GAN 2; 3X24 B; 4C0Z A; 1PWT A; 1TUD A; 8ATC B; 3PVQ A; 3NMZ C; 1NM7 A; 5GAO n; 2DD5 A; 3LH0 A; 1XQH A; 2A7Y A; 2LRQ A; 3M4Y A; 3G1J A; 4PLL A; 2HZY A; 1RAF B; 2RQW A; 1VQ7 Q; 1Y96 A; 3TRE A; 3CCJ T; 1B07 A; 2COZ A; 4XU1 A; 1QVP A; 2JW4 A; 1GFD A; 1I4K 1; 2DM1 A; 5L23 A; 1RAG B; 1U3O A; 1B34 B; 4C5I A; 3CC2 T; 1UDL A; 2Z0W A; 1AEY A; 2EPD A; 1KD1 R; 1GCQ A; 1BKB A; 3V8K A; 3I5R A; 4E7Z A; 1GRI A; 2KAF A; 1K8A C; 3KUF A; 3S3N A; 5IXF A; 2F2V A; 1ZSZ B; 1XOV A; 1BI0 A; 4FYX B; 3CXC S; 3VS5 A; 3M56 A; 4EMH A; 5IAY A; 3JCM c; 4E47 A; 4XTV A; 5IH2 A; 4J9G A; 2AT1 B; 1N8R C; 3CCS Q; 1ZUY A; 1ABQ A; 3X20 B; 5CVI A; 1YJW Q; 1G3Y A; 1QCO A; 2EQI A; 2ED1 A; 1WJR A; 4R56 A; 2E6Z A; 3S3M A; 1FMK A; 2RH2 A; 4JZ4 A; 2EAY A; 1NEB A; 2GCX A; 2NUP A; 1JEG A; 1ZSZ A; 5M9O A; 1NJI U; 4CC3 A; 2EGA A; 3PMT A; 4PJO F; 4MZT A; 3FDR A; 3MPU B; 4FT2 A; 4ZGJ B; 3RNJ A; 4C92 E; 4JS4 A; 4LD6 A; 2D0N A; 2E64 A; 3BDL A; 3E1S A; 4RG8 A; 3JCM X; 2QYZ A; 1UGR B; 3VS4 A; 2GTO A; 3EG0 A; 1MNE A; 2GTJ A; 4PL6 A; 2JJ9 A; 1VQ6 A; 4C5H A; 3FB9 A; 1W1F A; 5C6S A; 3P8D A; 1AWO A; 3CCE T; 4DBQ A; 4A63 B; 2K79 A; 4PNO A; 5CK9 A; 3THK A; 2BIV A; 3GNF B; 4LUE A; 2OTJ T; 3SFM A; 3CBP A; 5KYW A; 5IHN A; 5A0G A; 4GLM A; 2GFA A; 2CH4 A; 4J9F A; 2V26 A; 2V1R A; 3M54 A; 3CPF A; 3EGD B; 5ECA A; 1UE9 A; 2MOX A; 2QK0 A; 3NPF A; 1TS9 A; 1JBM A; 2ENM A; 1B7T A; 4JS5 A; 2EQM A; 4JRI A; 1W2B S; 3RDV A; 2M51 A; 2HKN A; 4OMN A; 4OML A; 1TH7 A; 3OS2 A; 2VGM A; 5LJ5 f; 1VQ8 Q; 2LX7 A; 2JM9 A; 1OX8 A; 4O6J A; 1NYF A; 2ROL A; 1OI1 A; 1KG1 A; 4BI3 A; 4M7D D; 2RQU A; 5GAN 8; 3FC3 A; 1MMA A; 4N4I A; 1RAH B; 2M0O A; 2IVW A; 4M75 C; 1K73 C; 1K4U S; 4M7A C; 3A8M B; 1Q7Y C; 2PVO B; 1ZA2 B; 4IIM A; 2PU9 B; 3OW2 S; 4QVD A; 1QWF A; 3C95 A; 3HFN A; 8AT1 B; 1M1F A; 2CZ6 B; 2CS7 A; 1LVK A; 2CZ0 B; 2MCN A; 3Q1J A; 1Q81 U; 1R8O B; 2OAU A; 3CXC P; 1BYM A; 2LCL A; 1SPK A; 2X51 A; 1BI3 A; 2DE0 X; 2KRO A; 2IIM A; 3OMG A; 2LQK A; 2CRE A; 2ZPF B; 3I5S A; 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