The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GSSGSSGEEKYVTVQPYTSQSKDEIGFEKGVTVEVIRKNLEGWWYIRYLGKEGWAPASYLKKAKDSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-061, a SH3 domain from human
rcsb |
| molecule keywords |
SH3 multiple domains 1
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| total genus |
7
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RQR A; 1AOJ A; 5EC7 A; 1G2B A; 1M3A A; 1OPK A; 2J05 A; 4E6R A; 2KRM A; 2M0Y A; 4OMQ A; 1RUW A; 4IIM A; 2LX7 A; 1RI9 A; 2JMC A; 1X27 A; 1X6G A; 1VA7 A; 2D0N A; 2LMJ A; 1UDL A; 2J6F A; 5FWB A; 1J3T A; 1HD3 A; 1VYV A; 1BB9 A; 2RPN A; 2PZ1 A; 3VRZ A; 1AWJ A; 1GBQ A; 4LUD A; 3UA6 A; 3O5Z A; 3M0S A; 2L3Q A; 3VS0 A; 2O88 A; 2BZY A; 2KR3 A; 2HCK A; 4AG1 C; 1JXM A; 2ABL A; 2GBQ A; 2K3B A; 1HSQ A; 2DMO A; 1SEM A; 3VS5 A; 2RQV A; 1SRM A; 3H41 A; 1GFC A; 2BTT A; 4LUE A; 5I11 A; 1K0X A; 3UAT A; 2L0A A; 1T0H A; 2J6O A; 1GRI A; 1NYF A; 2IIM A; 1V1C A; 4D8D A; 1X6B A; 2W0Z A; 2E5K A; 2KEA A; 4Z88 A; 3M0R A; 2OJ2 A; 1X69 A; 2LZ6 B; 1JO8 A; 1YNZ A; 2EGC A; 1H92 A; 1UG1 A; 1RLP C; 2JM8 A; 2LJ3 A; 2DIL A; 4AFS C; 1T0J A; 3M0U A; 4F17 A; 1N5Z A; 4IIO A; 1E6G A; 2J06 A; 2D8J A; 1MUZ A; 4RTV A; 1U5S A; 2B86 A; 4RTY A; 5ECA A; 1H3H A; 1PWT A; 2VWF A; 1NEB A; 3EG2 A; 4GBQ A; 1AD5 A; 3QWY A; 1NM7 A; 1WIE A; 2C0O A; 1U06 A; 5GJV B; 1QLY A; 3VS4 A; 1XOV A; 1Z9Q A; 2FPF A; 4HVU A; 2DRM A; 1CSK A; 2XMF A; 2YT6 A; 1E6H A; 1WXT A; 2X3X D; 3PVQ A; 1M30 A; 2NWM A; 3FJ5 A; 5IHN A; 1Y57 A; 3VS6 A; 2DE0 X; 4HXJ A; 1JQQ A; 2YUP A; 2YSQ A; 3IQL A; 1Z9Z A; 2JXB A; 2RQW A; 1NEG A; 2JS0 A; 1W1F A; 2LQN A; 1KSW A; 4GLM A; 3NPF A; 2CRE A; 2I0N A; 3VS3 A; 1X2K A; 2LP5 A; 2KYM A; 2A37 A; 2OAW A; 2CDT A; 1ZUK A; 4HVW A; 3U23 A; 4DEX A; 4J9H A; 1M8M A; 3UA7 A; 1YN8 A; 1AWX A; 1KIK A; 1B07 A; 1PKT A; 4OMN A; 1B3Q A; 1WXU A; 2CT4 A; 3NGP A; 1BU1 A; 1UJY A; 2DRK A; 2FO0 A; 1ARK A; 1TG0 A; 2YDL A; 1PRM C; 2EW3 A; 2M51 A; 3THK A; 1U3O A; 1AVZ C; 2PNI A; 4JJC A; 1W6X A; 4J9C A; 2ESW A; 2DA9 A; 2F2V A; 2KE9 A; 2LCS A; 1M27 C; 2CSQ A; 3EGU A; 1GFD A; 1HJD A; 3EG1 A; 5IH2 A; 1JXO A; 4J9D A; 2KBT A; 2BZ8 A; 4HVV A; 3NHN A; 2JW4 A; 2L3P A; 4DEY A; 4AFZ C; 2DL7 A; 5GJW B; 1GBR A; 2RQT A; 2DVJ A; 1I07 A; 1GL5 A; 2RN8 A; 2KT1 A; 2A28 A; 2AZV A; 2K6D A; 1WYX A; 3I5R A; 1M3C A; 2BZX A; 4RTW A; 2ENM A; 2K7A A; 4RTX A; 2J6K A; 2LNH B; 1EFN A; 1QWE A; 1TUC A; 1YWP A; 2SEM A; 1BBZ A; 3M0Q A; 2DF6 A; 5IHI A; 1OOT A; 3H0H A; 5FW9 A; 1UHF A; 4RUG A; 2D1X A; 4ORZ A; 2KYB A; 2C0I A; 2O9V A; 3EHQ A; 2EYW A; 5I22 A; 2GQI A; 3REA B; 1UEC A; 3EG3 A; 2ECZ A; 1UE9 A; 3JV3 A; 1AZE A; 2GTJ A; 2KRO A; 2FPE A; 1WA7 A; 2DYB A; 3SEM A; 1ZBJ A; 4F16 A; 2GTO A; 2JTE A; 2DX1 A; 4OMP A; 2AKK A; 1H8K A; 3NMZ C; 4Y92 A; 1WLP B; 1SSH A; 2O2O A; 1OEB A; 4JJB A; 1T3S A; 1K9A A; 2EQI A; 2JT4 A; 2KGT A; 4CC2 A; 2HSP A; 2OI3 A; 3H0I A; 2V1Q A; 3ULR B; 3SHW A; 1AEY A; 3TSW A; 2DBM A; 3ZL7 C; 1VYU A; 2HDA A; 3EHR A; 1ZX6 A; 1LCK A; 2SRC A; 4D8K A; 1YWO A; 2FG0 A; 1I1J A; 2KNB B; 4CC4 B; 3KFV A; 4R0K A; 1SPK A; 1YCS B; 1K1Z A; 5HCK A; 1NLP C; 4J9G A; 2EBP A; 2CH4 W; 4LNP A; 1QWF A; 4A63 B; 1CKA A; 4KRT A; 1NYG A; 3I9Q A; 5FWC A; 3PVL A; 3TSZ A; 2RNA A; 4JJD A; 2EYY A; 2YUQ A; 3LH5 A; 2EGA A; 3C0C A; 4QT7 A; 2K79 A; 3CQT A; 1CKB A; 1YP5 A; 2EVR A; 1AZG B; 2EPD A; 2RMO A; 2W10 A; 5IXF A; 2ROT A; 3VRY A; 2DM1 A; 1QKW A; 1IO6 A; 1WDX A; 4LN2 A; 1PHT A; 4ZNX A; 2QDL A; 1MV3 A; 3M0T A; 1SHG A; 2K2M A; 1ZUU A; 2FRW A; 2VKN A; 2L2P A; 2EKH A; 4RTT A; 4J9F A; 1VYT A; 4AFU C; 1SRL A; 2ED1 A; 1KJW A; 1I0C A; 2ED0 A; 4OMO A; 4J9E A; 2KRS A; 3M0P A; 2V1R A; 4J9I A; 1SHF A; 2CUD A; 3A98 A; 3UF4 A; 2KXC A; 1PNJ A; 2DL8 A; 4JPB W; 3EG0 A; 3VS7 A; 2EYX A; 5L23 A; 1JEG A; 2YUO A; 4J9B A; 4WCI A; 2F2X A; 2HEQ A; 3RBB B; 1RLQ C; 1G83 A; 2MIO A; 1M3B A; 2O9S A; 2KRN A; 2P4R A; 2DJQ A; 2KT8 A; 4AFQ C; 4JZ3 A; 2AKL A; 4CC7 A; 2YUN A; 4FSS A; 4Z89 A; 2RF0 A; 1WX6 A; 2CT3 A; 1E7O A; 1NG2 A; 1UUE A; 5IXB A; 1OPL A; 4M4Z A; 1QCF A; 4LE9 A; 2LQW A; 1UHC A; 2J7I A; 1WXB A; 1X2Q A; 4JZ4 A; 1KFZ A; 4F14 A; 1FYN A; 2HBW A; 2KXD A; 1ZLM A; 1UJ0 A; 1MV0 B; 1GCQ C; 4Z8A A; 1UFF A; 3REB B; 2X3W D; 1X43 A; 2DL3 A; 3TVT A; 1UGV A; 2FPD A; 2JMA A; 1PKS A; 1GCP A; 3RNJ A; 2LJ0 A; 2MOX A; 2AK5 A; 2DL5 A; 2F2W A; 2RQU A; 2GNC A; 2FEI A; 3PE0 A; 3R6N A; 1QKX A; 4AG2 C; 3I5S A; 1WI7 A; 1ZSG A; 4HCK A; 3VS2 A; 3GBQ A; 2MCN A; 4CC3 A; 1FMK A; 2CH4 A; 4ESR A; 3I35 A; 4EIK A; 1T3L A; 2DNU A; 1S1N A; 2DL4 A; 2JS2 A; 2O31 A; 2PTK A; 2EGE A; 2EYZ A; 2L3S A; 4RTZ A; 2D8H A; 2AZS A; 1Y0M A; 1GCQ A; 1WFW A; 2LJ1 A; 5IHK A; 1PRL C; 2A08 A; 2CUB A; 2FRY A; 2C0T A; 1ZUY A; 1W70 A; 2G6F X; 4OMM A; 1K76 A; 1K4U S; 2K9G A; 2VVK A; 1NLO C; 1OV3 A; 1AWO A; 1UTI A; 2A36 A; 4X1V A; 2CSI A; 1A0N B; 1ABQ A; 2ROL A; 2JM9 A; 4RTU A; 3VS1 A; 1ABO A; 1AWW A; 2H8H A; 1K0S A; 2DBK A; 3QWX X; 4OML A; 2GGR A; 1TUD A; 1JU5 C; 4K11 A; 2DLP A; 2NUZ A; 3H0F A; 1BK2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HKE A; 3OYY A; 5HY6 A; 1SF9 A; 4C0F A; 1M3A A; 4E6R A; 2KRM A; 2M0Y A; 3CCQ A; 5FU7 B; 2LX7 A; 2JMC A; 1X27 A; 3PIP A; 1VA7 A; 2D0N A; 1UDL A; 3CCU Q; 3GIB A; 3Q1J A; 3HRU A; 1VYV A; 2HMA A; 4X34 A; 1ZA2 B; 4FW2 A; 1GBQ A; 2XDP A; 3UA6 A; 2XD0 A; 1VQ9 Q; 2IVW A; 3O5Z A; 1RI0 A; 3M0S A; 4PFZ A; 4AT1 B; 3VJP A; 1K9M U; 2L3Q A; 2PQW A; 2HSE B; 4MZM A; 3QHS A; 4E7K A; 4RKU E; 1VQ7 A; 1N6A A; 3CEY A; 3CPW A; 1SRM A; 1HK9 A; 4LUE A; 4BI8 B; 2DTH A; 3EG9 B; 2J6O A; 1KD1 C; 1GRI A; 1NYF A; 1H3Z A; 4QVC A; 4XTV A; 3L2U A; 3E19 A; 2KEA A; 2OJ2 A; 2DPP B; 1YNZ A; 4FW1 A; 1H92 A; 3QXE B; 2R57 A; 2LJ3 A; 4VUB A; 1VQO A; 4AFS C; 1UB4 A; 1B34 A; 1N5Z A; 4IIO A; 1E6G A; 1VQ4 Q; 2L5Q A; 4RTY A; 4C92 C; 3JCM b; 3G6E A; 3CD6 A; 3MJX A; 4ELZ C; 5GAO m; 2VWF A; 1NEB A; 3I56 T; 4C92 F; 3QO3 A; 2RO0 A; 3CBO A; 1NM7 A; 3OB9 A; 3J80 E; 2COW A; 1ZBX A; 3VS4 A; 1VQ5 T; 4PJO E; 4M78 A; 4M7D G; 4N0A A; 2DRM A; 2YT6 A; 3CXC A; 2NWM A; 2LVM A; 5KE2 A; 4KH0 B; 3OYE A; 2YXY A; 2RM4 A; 3GF5 A; 3CCL T; 2O01 E; 4DA4 A; 3L42 A; 5CAI A; 4XAX B; 5KYX A; 2RQW A; 2DEQ A; 4C8Q A; 4GLM A; 3NPF A; 2CRE A; 3HKS A; 3VS3 A; 1X2K A; 2LP5 A; 2KYM A; 2DTO A; 2QQ9 A; 4MDW A; 4HVW A; 4DEX A; 4J9H A; 3CMA Q; 3UA7 A; 4BAC A; 1AWX A; 1KD1 U; 1MGQ A; 4RCC A; 1VQ6 Q; 3OYN A; 5KYN A; 2DRK A; 3EH1 A; 3CCM A; 3M56 A; 1ARK A; 1TG0 A; 3HL8 A; 2DIQ A; 1W2B P; 2M51 A; 1YJ9 Q; 3THK A; 2HQH A; 1QQJ A; 2O4X B; 1ACM B; 2PNI A; 1M2V B; 1Y96 A; 1W6X A; 1QVG S; 4PJL A; 1TWB A; 4N4G A; 3CPF A; 2KE9 A; 1RAD B; 2K5I A; 5GAO q; 4J5Y A; 2GFU A; 5LJ5 f; 4QQ6 A; 1Q81 R; 1HJD A; 1NJI C; 1D0Y A; 1OUL A; 1M4Z A; 1VQ9 T; 1JXO A; 4QW2 A; 3NHN A; 4PNO A; 2KT1 A; 2A28 A; 4OVA A; 5IAY A; 2K6D A; 1WYX A; 3RMS A; 1QVP A; 3A5Z B; 2E10 A; 4FYX B; 3CBP A; 1M3C A; 2J6K A; 2KK4 A; 1QWE A; 1YWP A; 2SEM A; 2RJF A; 2Y4X A; 4OP0 A; 4XTX A; 3H0H A; 5J3B A; 3DKM A; 2D1X A; 4RUG A; 5I2S A; 2C0I A; 1S72 Q; 3REA B; 4TVR A; 2O4X A; 1UE9 A; 1AZE A; 4PJO B; 1M2V A; 3J81 E; 1NPR A; 4XU0 A; 3OYH A; 2JTE A; 5J26 A; 2DX1 A; 2JZ2 A; 3E9G A; 4A4F A; 4C92 D; 5GAN j; 3E9F A; 3NMZ C; 3CCJ A; 1WLP B; 1YIJ A; 2O2O A; 2B8A A; 1T3S A; 4M75 G; 2JT4 A; 1QP3 A; 1VQ7 Q; 1KHI A; 3RDV A; 2V1Q A; 2P0P A; 3KXT A; 4WF2 A; 3ZL7 C; 1NJI U; 5GAN 8; 3CME A; 3EHR A; 4D8K A; 1YWO A; 2FHD A; 2FG0 A; 3VV0 A; 4C0D C; 2JVV A; 2QQR A; 1M9S A; 5GAN g; 1MMA A; 4L6V 5; 5HCK A; 1NLP C; 2EBP A; 4LNP A; 3I9Q A; 5FWC A; 2RNA A; 4ZTJ A; 2EYY A; 1IXD A; 5M9O A; 4M7D F; 1SSF A; 2OTL T; 4QT7 A; 3ER0 A; 2H3J A; 4FL6 A; 1BI0 A; 1YP5 A; 2RMO A; 5GMK e; 4PJO A; 4II1 A; 2R58 A; 2ROT A; 3CXC S; 5FRO A; 2NYS A; 2DXB A; 2QDL A; 1MV3 A; 2K2M A; 2VKN A; 2L2P A; 2DD4 A; 3M5A A; 3EFR A; 3H9N A; 1VYT A; 4AFU C; 4XTY A; 3RKY A; 1G5V A; 4OMO A; 2OTJ T; 4J9E A; 3PMI A; 3M0P A; 2ZZD A; 2CUD A; 3A98 A; 2VV5 A; 4J6W A; 3AHU A; 3OBW A; 2YHT A; 4UC4 A; 3RR6 A; 5L23 A; 4FYY B; 2KI7 A; 4J9B A; 4WCI A; 3JAM E; 2M9U A; 3BDU A; 1M3B A; 3KBG A; 5GAM f; 3DLM A; 2QA4 T; 2KT8 A; 3ASK A; 1TSF A; 2VB6 A; 2GFA A; 1YJN A; 4B6M A; 2I2L A; 1WX6 A; 2CT3 A; 1E7O A; 3CCM Q; 4JUV A; 1KQS S; 1YI2 A; 2K3Y A; 4M4Z A; 3PTA A; 1RAC B; 4OB3 B; 5KYU B; 2HNI A; 3GNF B; 2HBW A; 2P0Q A; 1VQ5 A; 1OZ3 A; 3MO8 A; 1P92 A; 4IUT A; 1VQN T; 1LOJ A; 2LC4 A; 4B9X A; 2FPD A; 2JMA A; 3L2Q A; 3A8M B; 1YFN A; 2LJ0 A; 2MOX A; 2AK5 A; 4RG8 A; 3CCL A; 2PVO B; 2CZ1 B; 2RA2 A; 2MWP A; 4NL3 A; 3CCR Q; 1N9R A; 2FEI A; 3R6N A; 3URG A; 1U1T A; 3MHX A; 1IZ6 A; 2MMP A; 3FB9 A; 5KH6 A; 1QCO A; 2A3L A; 1OYX A; 1C1A A; 3M58 A; 2CH4 A; 3OY9 A; 4ESR A; 3I35 A; 1I8F A; 1S1N A; 3P8D A; 2O31 A; 1UGP B; 2PTK A; 3CPW P; 2L3S A; 2OX7 A; 3JCM c; 1GCQ A; 2LT4 A; 2A08 A; 2FRY A; 4BB7 A; 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2LZ6 B; 4LD9 K; 1VQP Q; 3M4Y A; 1I81 A; 4F17 A; 2OAU A; 2RJE A; 4DOW A; 2J06 A; 3TEE A; 2D8J A; 1U5S A; 3BW1 A; 3TQ7 P; 2YRC A; 1H3H A; 2EAY A; 2LX9 A; 2JUF A; 3GOX A; 3QWY A; 2C0O A; 1U06 A; 4XU2 A; 3G71 A; 1X75 C; 1YJN Q; 4JRQ A; 4M7A B; 4QQG A; 1CSK A; 3NTH A; 3PVQ A; 3VS6 A; 4JRI A; 2D6F A; 4OB2 B; 5GMK h; 4HXJ A; 2NUT A; 2DK3 A; 2YSQ A; 1N27 A; 1PM3 A; 1Z9Z A; 2JS0 A; 1W1F A; 1KSW A; 4EPC A; 3CCE T; 4M75 D; 3OW2 P; 1HXD A; 1W2B S; 1ZUK A; 2RJD A; 2PU9 B; 1QW1 A; 1B07 A; 2NLU A; 4DQ2 A; 4Y28 E; 4ANJ A; 4OMN A; 3VKI A; 3SFM A; 2CT4 A; 3OS0 A; 1UJY A; 4LDY A; 1FXX A; 2FO0 A; 2HL3 A; 2EW3 A; 3HPW A; 1U3O A; 2DXC A; 1B34 B; 3DB3 A; 1AVZ C; 1EZZ B; 4E2F B; 1I4K 1; 1YJW Q; 2LCS A; 1M27 C; 4M7A A; 3JCM d; 4ELY C; 5KCH A; 1VIE A; 2DXU A; 4M78 B; 1BYM A; 1GFD A; 1YIT Q; 5LJ3 f; 6AT1 B; 3ZEH A; 2KBT A; 1D09 B; 3FLG A; 4AFZ C; 2DL7 A; 5GJW B; 2PUO B; 2QGG A; 1VQM T; 1QP2 A; 1I07 A; 4PKC C; 1VQN A; 3C95 A; 2X4X A; 3GNG A; 3OS1 A; 5KYX B; 4N4I A; 4C8Q B; 3CC2 Q; 3GLX A; 5D6X A; 4LDX A; 3QJY A; 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