2DS9A

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with mannose at 2.8 a resolution
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with mannose at 2.8 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 107
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ds9A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2ds9A02
1OLAA 4BDOA 3D4CA 2OJTA 3TKDA 4ELQA 1B1XA 5K2XA 1N84A 4FJPA 4OWDA 4IO5A 1NH7A 3FJMA 2RC9A 2R6GE 4PFTA 2GFEA 4MF3A 1MH4A 1LSTA 2I3WA 4MLVA 3N5LA 5JK4A 4AB6A 5A5XB 2YJPA 4H5FA 3RY3A 3MPKA 4HCYA 1MY4A 4WEPA 4GL0A 2OWSA 2DOJA 4F1UA 1H44A 2ZNTA 4I62A 2THIA 3FJ7A 4QFLA 1LAHE 2ANJA 4BDLA 1NH8A 3BBRA 4OEVA 1B52A 4THIA 2DXRA 3FD3A 2QPQA 1B46A 5KDTA 1Y1ZA 4IO4A 3OENA 4FEBA 2H9BA 3PPNA 1B5JA 5TPAA 3N26A 2QMWA 2F8DA 3B6TA 4GIZA 3PV0E 1GV8A 3DELB 1FTKA 4F18A 3IO6A 4I8CA 4OFOA 1MXYA 2G29A 3LR1A 4F2QA 3SEYA 3PD8A 2X7PA 4NMYA 1B7UA 3MP8A 1Z7ME 3DP4A 4Q5TA 3K0VA 5F1QA 2XXRA 3CFLA 3MBPA 3KBRA 3SETA 1H43A 1IQ7A 2REJA 2RC8A 3KJTA 4OESA 3FASA 4NF5A 2V93A 3OO8A 3CIJA 2RINA 2Q2CA 1FCKA 3LSFB 2OK2A 4U4SA 3HSTA 3K00A 3K1NA 2UVGA 1I6QA 5CMKA 3UGWA 1WDNA 4IO6A 4ZEDA 2A5TB 3S9NC 4RYAA 3T9HB 3MJNA 5JTYA 2BJJX 3PPRA 4OQOA 4R6KA 1XS5A 3BFUA 3LUYA 3IOUA 2NWJA 2RKMA 3EN3A 3R7XA 2RCAA 1VE4A 3RPWA 3ONMA 1MXXA 3QAXA 1UIVA 1SW1A 1B3GA 4GD5A 1YCJA 1TXFA 4EXKA 1JEUA 3KEIA 3C4MA 1B40A 4F22A 1VFDA 3M3KA 1MY0A 3N94A 4OEUA 3T66A 3VDFA 2XXTA 4GWOA 3IAZA 4GXSB 1TT1A 3Q25A 3D4GA 4F2OA 3C34A 4OZ9A 2HAUA 4R6YA 1DTGA 2DSFA 3OO6A 1XOCA 3C32A 2HFBA 3QUJA 2ESNA 3FXUA 5EYFA 3RN8A 1ANFA 1H76A 3CSGA 3CRBA 1ZKBA 2F6GA 1QKBA 4MFIA 1N3XA 4EF2A 5L8DA 2PT1A 2B3BA 2AYSA 5DEXA 4Q30B 1KWHA 1PB7A 3JV9A 1XVYA 2X7QA 1B51A 4IGRA 2RCBA 2ZMBA 1FQDA 2XXUA 2FA7A 3O6IA 2IEEA 1AIVA 2Y7RA 5CBRA 4ZS9A 3O97A 4O3AA 1AOVA 1MPBA 3IR1A 1IXIA 3V89B 1MQJA 1CB6A 3H03A 3HHFA 3ZKLA 4LUBA 3MC2A 4N6PA 3V83A 2M8CA 4YKIA 1LLSA 2H5YA 1ZTYA 1MQDA 1UTHA 3P7IA 4G68C 3TUSA 3TZAA 3W9WA 3U72A 3S9LC 1Y4TA 3CG3A 1AL3A 2LAOA 2D21A 1R9QA 3THIA 1XVXA 3QXMA 2H4IA 1DSNA 1FQFA 3MP1A 2V84A 2ZYMA 3S4UA 3SESA 3ILUB 5I59A 1UIUA 4ZZAA 4K3FA 4ND9A 3IORA 2I0BA 3K01A 4NEDA 1I69A 2DE4A 1OMPA 3O29A 2PBWA 5DYHA 4GXAA 4QF9A 3SDFA 3IJOB 3RGYA 3KFMA 5H8QB 1URSA 3MAMA 2XXXA 3K6XA 5DVFA 1URGA 2GHAA 4NF8A 1MPCA 3OXNA 3SKPA 5H8HB 3OELA 3T22A 4OFLA 4JDFA 1B0HA 3LSWA 3I3VA 1QULA 1B3FA 4UACA 3WAEA 1QUJA 1Y4CA 4ZECA 2XX9A 3HHGA 3OO9A 5AA2B 5CBSA 2QSXA 2UYEA 3MQ9A 1D9YA 3G7WA 4F1YA 3FVGA 3E13X 1EZOA 1WVJA 3CVGA 4FEDA 4OHNA 5DVJA 3FV2A 1QW0A 5H8NB 3PPOA 1Y9UA 1JVXA 4C0RA 2F35A 3E3KA 1OVBA 1MXWA 4ELOA 4RJZA 4YZZA 4X1BA 1PBQA 1BKAA 3O28A 2I0CA 3MVYA 1LBBA 4G4PA 4RK2A 1RYXA 4H1XA 4MH5A 3IX1A 3MW0A 1JW1A 3N6UA 4LZ5A 3TQWA 1QUKA 3MZ1A 2X26A 3UORA 3O2AA 5I2NB 4ESXA 4BDRA 3FXQA 1S9TA 3CFZA 4BDQA 4I1DA 3TCFA 4U1ZA 1MDP1 3ODBA 4QRZA 3RNNA 4LVQA 3TEPA 5KCJB 2RC7A 2B3FA 3S9EA 3KN8A 3U1OA 4IO2A 1PC3A 1B3EA 4IO3A 4F39A 5CM6A 2R9JA 3MP6A 4JBZA 3L6HA 2E0SA 4R2BA 1JW4A 2F6PA 1Q35A 4F3PA 3TQLA 1IITA 4QFNA 4H67A 2I48A 4BLAA 1A99A 2F7CA 1P99A 1NNKA 2XXQA 4YICA 4LQ2A 2HEUA 1P1NA 1MY2A 3FATA 4QFPA 5I58A 3RUMA 1LCFA 4AQ4A 3IOVA 4NF5B 2AIXA 1FQCA 1GTKA 2XX8A 2XXHA 3PUYE 3USDA 4EDPA 1LAFE 2E1SA 4KYDA 1IXHA 3H6UA 4Q0CA 3QK6A 2DWJA 3K6WA 5CMMA 2G93A 2VD2A 2Z8EA 4ESWA 1BP5A 4H65A 2XD2A 3B6QA 3U93A 2OLBA 1IEJA 3RT6B 1IXCA 2V3UA 4HTGA 2DWAA 5CI5A 3HPIA 3GBBA 4P11A 1EZ9A 3GZGA 1NL5A 3DP8A 4WKMA 5I57B 1MM6A 1NMUA 4U22A 2A5SA 2OCUA 1SI1A 2DWHA 1GGGA 1B6HA 2ONKE 2F36A 5H8FA 4RXLA 3IO4A 4H6DA 1N76A 2XD3A 3PMVA 3OSQA 2DYXA 1B1HA 2O7UA 2Z22A 3KOTA 4BDMA 3KSXA 4C1UA 2ZYNA 1WODA 5CC2A 2DE2A 1B2HA 3UP9A 1HSJA 1UQWA 1N04A 4R2FA 5L9MA 4DXBA 1SYIA 1F9BA 5DVIA 1Q1KA 5BUUA 1TFAA 2Q2AA 5A5XA 1Z7NE 2PYYA 3B6WA 5AA4B 4KHZE 4WEDA 4GOTA 3VVFA 1MM7A 3BFTA 3EHSA 5I56A 5DEXB 3KN7A 4LZ8A 2VP1A 1NNFA 4KQPA 4KCCA 4DXCA 3GBAA 2CZLA 5ICQA 3PGFA 5BWJA 4JWOA 3C35A 2O68A 3O6HA 2ABHA 4R72A 1N3WA 4RY1A 3IB1A 4FORA 3RLFE 1D4NA 4GLIA 4DE8A 3CI8A 1B7ZA 2DVCA 3SERA 4F3BA 4XKRA 1UTHB 4EUOA 2GRVA 1POTA 3T9VA 1GR2A 4YU0A 5FHMA 3OSRA 3H6VA 3V8XB 4IY6A 3PD9A 1DPEA 3TODA 1ZMGA 3IOTA 2I58A 1MXZA 3TTNA 4KCDA 3FVOA 2P1SA 4GVOA 1VFEA 3CFXA 1UTBA 4OYVA 5I59B 1T0KA 2HZKA 5EHMA 2QS2A 5AE4A 3K6UA 2O7IA 4QSEA 4G2ZA 3S9MC 4O3BA 2Z8FA 2OZZA 4OVJA 2NXOA 3OEKA 3QIMA 2XXVA 4PE5B 1M5CA 3M3LA 4U23A 4P0IA 5HPQA 3KN3A 4NF8B 3T93B 3GXAA 4TQUQ 2QL3A 4EF1A 4R75A 1IXGA 1B3HA 4FATA 3Q29A 2A5TA 4YKPA 1II5A 1MG1A 1RYOA 1M5BA 1YPNA 5B7DA 4F19A 1PB9A 2ZXTA 1ZJLA 4OENA 4C1TA 3VVDA 2O1MA 1M5FA 2UVJA 4ELRA 4JSOA 4EQ9A 1LB9A 5I2KA 3C31A 5AA2D 5TU0A 4KYEA 2YLNA 1MY3A 2DXYA 3A3UA 4DCYA 1FTOA 3K2DA 4QHQA 1FQBA 2QS3A 2I4CA 4G68A 5EHSA 2ONSA 2DVZA 3N6TA 3JZJA 1Y3PA 3L6GA 1AMFA 3OO7A 2H98A 3ILTB 3HN0A 4Z0IA 1FTJA 3DM0A 3RTWB 3EPEA 3CG1A 3TAJA 2XXPA 4JWYA 2H25A 3TCGA 1I6AA 4Z7EA 2I49A 3KG2A 4U21A 1DMBA 5DT6A 1ZIUA 3G3IA 3PMWA 1H45A 4NF4A 1S7YA 3H3GA 1SW2A 3CSBA 3PMXA 4IO7A 4KYSA 1RKMA 1S50A 2QS4A 1ZBMA 1B9JA 5TP9B 3DLNA 5ICTA 3PPPA 1SQYA 4LP2B 3RQTA 2VD3A 3Q28A 2FYIA 1H3DA 2Y7PA 3AXFA 4ISUA 3FZVA 3VXCA 2Y7IA 3CR9A 3OEMA 1OIBA 2HXWA 4R9FA 4DLDA 3VLUA 1LFHA 4YB5A 1D3KA 4YMAA 1PEBA 3KOSA 5L9OA 2FNCA 5I58B 3KSJA 3TTMA 2Q8JA 2GHBA 4L17A 4EQ7A 3PUVE 4ZEBA 2QMXA 2F5XA 3MPLA 1ELJA 1SBPA 5K2YA 2W7YA 4ELPA 2UXAA 2O69A 2WKYA 4GQOA 4QFOA 1IZ1A 2Y84A 1B5IA 3R26A 1P1OA 5CRYA 2ZYOA 1B32A 4F1VA 3UA8A 1NNTA 2OBGA 4LA9A 4LZ7A 4NF6A 1LAXA 4DDDA 5KDTB 1EU8A 3TDJA 5TPAB 1OVTA 1QJMA 1MXUA 1MY1A 4H8JA 1I6BA 2ZYKA 5IKBA 2DS9A 4ZEKA 3LSLA 3VV5A 3MWBA 1LBCA 5HM4B 2GH9A 3Q26A 5AA2A 3E9XA 3G3KA 1LFGA 3Q27A 1OLCA 4FIMA 1N7WA 5FHOA 4G8MA 3IB0A 1A40A 2UVHA 4ZZEA 4EQBA 4HCWA 3W9VA 4ZE9A 5ISUA 4YKKA 4G77A 1JVYA 3M3FA 2NUVA 1FQAA 3ZS6A 1POY1 4ZEIA 1L5TA 3GLBA 5H8NA 3W15C 4YAHX 1YTVA 4M1VA 5FTHA 1OQGA 3U92A 3VVEA 3S2VA 3F11A 4OMBA 2XXYA 2HZLA 5J1DA 1Y3NA 3IOWA 4DIGA 3HO7A 1J1NA 5I56B 1GVCA 1EZPA 4XIGQ 5JTYB 3SEXA 3KJ7A 4XKPA 5I2NA 4O3CA 2XXWA 1PDAA 1FTMA 1MQHA 2Y7WA 1SI0A 5B70A 2AL4A 4YB6A 4QFKA 4F3SA 4RPOA 3B7DA 4POXA 3FGSA 4U4XA 2P0SA 4WXJA 2PT2A 1MRPA 4M4GA 1A55A 3TTLA 3FVKA 1HSLA 5KCJA 3K4UA 1FTLA 3TYHA 4ECFA 1QUIA 3OD7A 5F7VA 3MVXA 1B58A 3WAFA 3HV1A 4QSDA 2KLFA 3QSLA 1URDA 2V25A 1CE2A 1M5EA 2VGQA 2YPNA 2UYFA 4X1DA 3EQ1A 3QYTA 4MBPA 5LOMA 4POWA 4F3GA 1UTBB 4N07A 2REGA 2Q9TA 4PETA 2UVIA 4OFJA 3PUZE 3FXRA 3ZKKA 3T9UA 3O9PA 4N13A 2Q88A 4GFRA 4QSCA 4TLLB 1SVXB 3ZSFA 1SW5A 1MPDA 1B4ZA 2Z23A 2O51A 4IY5A 3LBSA 4PQJA 4R74A 2D3IA 1YAEA 3R6UA 5I84A 1R9LA 1MQIA 1Y20A 3O6GA 2DWIA 5DTBA 3MZBA 3H4ZA 1VSOA 4IGTA 4KR5A 3TTRA 2HQ0A 4FAJA 3VLWA 1B5HA 2F7BA 2OWTA 3I5OA 1MXVA 2AL5A 4ZEFA 3FV1A 1US5A 1US4A 3IJXB 4HW8A 1SDXA 1OQHA 3LC8A 1AH5A 5H8SA 3G3FA 2B65A 4GRKA 1PBPA 4P0GA 1JQFA 2PMSA 3ECRA 4XXUA 3C33A 4JWXA 5CMCA 5I2KB 2RF1A 2XHDA 1JETA 2O84X 5M2VA 5I57A 3H06B 1SW4A 3I6VA 4NTLA 3TMGA 5CMBA 4BDNA 1B4HA 1SD3A 3V5AA 1ATGA 4OETA 2H99A 3H6TA 2ALUA 4G68B 4EXLA 2ZNSA 4X48A 2I6EA 2P2AA 3KGCA 2NOOA 4H0WA 4JSDA 3MVZA 1N0TA 4YB7A 3U94A 1Y1MA 3BKIB 1LAGE 4DCXA 2PVUA 4I9DA 3IL1B 4OERA 3PPQA 4MLQA 4PP0A 2DQVA 4PFYA 4H8IA 3G3HA 1HSEA 3RTFB 3OOAA 2O6AA 4Q8RA 3M8UA 3FJGA 1MS7A 4XTCQ 4XKQA 4NF4B 3SEWA 5AA4A 1TFDA 3G3JA 1ZLQA 4X9TA 3RT8A 3FIRA 4RPNA 2D5WA 1TWYA 3FVNA 3C9HA 2F34A 2I4BA 4R6HA 3EHUA 3VE1B 2R71A 3UN6A 1BTJA 1DTZA 4KD5A 2V3TA 3MVWA 3PUWE 4LATA 2DE3A 1XHYA 4NE4A 4KFQA 4KPTA 2DP8A 3K1PA 1FQEA 1MDQA 3IB2A 3JYRA 1LB8A 4AB5A 2Y7KA 3UK4A 4F29A 3SEVA 4RK9A 4E0XA 3UIFA 3SEUA 1XT8A 1R1NA 4NWDA 1QVSA 3IK6B 5KZTA 2VHAA 1IUDA 3K6VA 3T96B 1LFIA 3K02A 4G8NA 1EH3A 1A7LA 1JW5A 1P1WA 2CMOA 4R73A 1ZU0A 4TLMB 1JNFA 3H7MA 3TELA 4RNSA 1B3LA 1PB8A 1NNPA 3HCQA 4XKNA 1LGBC 3FUZA 3TTKA 4PFUA 2Q89A 3H6WA 1NFTA 1BLFA 1VR5A 4HS7A 4R9GA 2XXIA 1O7TA 4NF6B 5AA3A 4UA8A 2VOZA 3DP6A 2HCAA 1R6ZA 4GF8A 3VFJA 1A8EA 4YMBA 1P1QA 4TOZA 3TPAA 3PU5A 4GL8A 1FW0A 3O66A 3MZ9A 1MQGA 5ITPA 1DOTA 1LCTA 4NWCA 4YKJA 3E4RA 3EHTA 2ZNUA 5IAIA 3K1MA 1P1UA 1BIYA 4RA1A 2I3VA 2QRYA 3G3GA 3VXBA 4DXUA 3LSXA 3OMBA 3KZGA 4FECA 3T9XB 5HBCA 1USYH 1B0LA 1USYE 4LQ5A 1NKXA 2PX1A 4DZ1A 5JEIA 1O63A 1O64A 5L9SA 2XX7A 1XC1A 3EF7A 4KI0E 1A54A 2ONRA 1N7XA 5ELVA 2NVUB 5FTIA 3TCHA 5FHNA 4LONB 2HAVA 3C36A 3U8QA 2QS1A 4IB2A 2IA4A 4ZDMA 2F97A 3MUQA 5H8QA 5ITOA 1Y3QA 1A8FA 4JXIA 4PFWA 3PUXE 1JEVA 2QJEA 1SYHA 5H8HA 4ZE8A 3A09A 1M5DA 1IIWA 4G8HA 3A3CA 1DPPA 2Z8DA 1QKAA 3QUFA 3TFLA 2O1LA 4U2RA 1B7HA 4F31B 1MH3A 2F7AA 1B05A 5AA1A 4ONYA 4OTEA 4H5GA 3VLVA 4FE8A 5H8FB 4OXVA 4E0WA 5TP9A 4JB7A 2V3QA 4U1OA 2F78A 1D9VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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