2DWIA

Crystal structure of the complex formed between c-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA02
4YB7A 2O6AA 2F6PA 3EHSA 1J1NA 3BKIB 4YB6A 2I3WA 3EQ1A 4UA8A 3HO7A 1A8EA 3KOSA 4R74A 3PMXA 1HSLA 4LZ8A 4XIGQ 1PDAA 5BWJA 1AMFA 4OZ9A 4P11A 5KCJA 5BUUA 2X7PA 3FV2A 1UTHA 4GIZA 3V5AA 5ELVA 2XXXA 4TLLB 1BLFA 1NNPA 2RC9A 3C34A 3IB1A 1WVJA 2RF1A 1DTZA 1XHYA 4NF5A 4YB5A 3H6WA 1EZ9A 2F97A 3FVNA 4FEDA 1MH4A 3MVYA 3CSGA 1Y9UA 3P7IA 2V25A 1XVXA 5H8NB 1H43A 3EHUA 3IB0A 4DDDA 1S7YA 4C0RA 3WAEA 4HS7A 4NEDA 1T0KA 3TCGA 2B3FA 4K3FA 4IB2A 1MH3A 2DVZA 3K1PA 4YKJA 1B05A 3MQ9A 4U1ZA 1NH7A 3KGCA 5LOMA 3H6TA 3FIRA 3G7WA 5AA2A 4IY5A 4HCYA 4NF4B 4RXLA 2I49A 1FTMA 1MXXA 2ZNTA 2QMWA 4F18A 3T9HB 3OENA 2OZZA 3L6HA 2M8CA 5I2KB 4ELQA 4ZS9A 4P0IA 3RNNA 3G3IA 1PB7A 3FVKA 4DLDA 3TDJA 3UGWA 3KG2A 4X48A 3IX1A 2XXQA 3TZAA 5KDTB 4WEDA 1MY2A 4DXBA 3G3KA 3T9VA 3FD3A 3RTWB 1CE2A 4ZE9A 2F6GA 3IO4A 2VP1A 3LSFB 3Q27A 3PUVE 3OMBA 2F5XA 5AE4A 1OVBA 3PPPA 1A8FA 5I84A 1LAGE 3TCHA 2UVJA 2I0BA 4ESWA 2I0CA 2F34A 4BDQA 1QVSA 1FW0A 5ISUA 5L9SA 2GHBA 3FXQA 2ONSA 3DP8A 4F3GA 4YKKA 3OSRA 3BBRA 3UORA 2QS1A 1FTOA 5HPQA 4RY1A 4ELOA 1LFGA 3OSQA 1MQHA 4F1UA 4O3BA 3TTMA 1VE4A 1P99A 3GBAA 4F2QA 5H8QB 1IQ7A 4LQ5A 1MDP1 3BFUA 1FQDA 1GV8A 3HCQA 4PE5B 2ZNSA 4PFUA 3TPAA 1R1NA 4Q30B 3N5LA 2OBGA 1PC3A 3SERA 1PEBA 3MVZA 2A5SA 3TCFA 3V8XB 2V84A 1S50A 2XXPA 1LBCA 2A5TB 2O1LA 3GZGA 4U1OA 1A55A 4LVQA 2P0SA 3QXMA 4YU0A 4OHNA 4PFYA 2G93A 4LZ5A 2XXHA 4F39A 1SYIA 2DE3A 4IO6A 5DYHA 1GR2A 1B6HA 1N7WA 1QJMA 1QKAA 4U4SA 3D4GA 1B9JA 1B4HA 3HSTA 3C35A 4IGTA 2O7IA 2LAOA 2ZYNA 4YMAA 1DPPA 4GFRA 4GL8A 4GXSB 4Q8RA 4ZEFA 2AIXA 3G3HA 5H8FA 3IAZA 5I59A 1GVCA 5K2YA 1I69A 1R9QA 1VR5A 3MVWA 1H3DA 3OXNA 4IY6A 2H9BA 1YPNA 3MWBA 4TLMB 3LSXA 1IXHA 1IXCA 3QUJA 1PB8A 3HPIA 3PPRA 4ZZAA 1N3WA 3CFXA 3SETA 3QYTA 5I2NA 3SEXA 2F36A 2E1SA 3G3JA 2FNCA 1RKMA 3Q28A 1AL3A 1NMUA 2I6EA 5I58B 4E0XA 1B46A 2REJA 2PMSA 4U22A 5I56B 3FGSA 2Y7IA 3DELB 1XOCA 1JEVA 5B7DA 3CSBA 4R75A 2OK2A 4OEVA 1LCFA 2QJEA 4ZDMA 1AOVA 1SI1A 2UVGA 3HV1A 4ZE8A 3MW0A 4NF8A 3IOVA 3SEWA 1ZKBA 3CG1A 1B2HA 4F3SA 4LA9A 2VOZA 5FHOA 2Z8FA 4P0GA 3I6VA 4ZEKA 3RT6B 1IXGA 4BDNA 2F7BA 1EZPA 2UYEA 1QUJA 3QSLA 1SQYA 5FTHA 3TTKA 3PGFA 3FJGA 2DOJA 2DE2A 1P1QA 3KBRA 4G8MA 2ABHA 1MQJA 5CMMA 1N3XA 1LFHA 1IITA 3K6XA 1TFDA 2VD2A 4TOZA 3TMGA 4ONYA 4JBZA 5HM4B 4F2OA 5FHNA 1MY1A 3RT8A 5AA4A 1NFTA 2V3UA 2Q8JA 3V89B 1AH5A 2QS2A 3SESA 1UTBA 1FQBA 3O6HA 4QSCA 5EHMA 2GH9A 3RTFB 1JNFA 4KHZE 1URDA 5TPAA 4NE4A 4LZ7A 4Z7EA 4BDLA 5H8HA 2HAUA 3FJ7A 2XXYA 4WEPA 1NNTA 1JVXA 2AL5A 3IJOB 2XXVA 3K4UA 5KZTA 4ZECA 4RA1A 2O69A 1XVYA 3O2AA 1A40A 3CFZA 3FVGA 2Y7PA 4KQPA 4JB7A 3HHGA 1B5IA 3TQWA 3K2DA 3QIMA 4Q0CA 3DLNA 3MC2A 1NKXA 4NMYA 3CRBA 1POY1 1DOTA 1OQGA 3S2VA 4EF1A 3MP1A 1B0LA 3GXAA 2RCAA 4G2ZA 1I6BA 5I57A 1MS7A 3USDA 5AA2D 3DP6A 2D3IA 2THIA 2GFEA 1LB8A 4R2BA 4NF6A 4LUBA 4F19A 5L9OA 3PU5A 4GVOA 3KSXA 5AA3A 1B52A 3VVFA 3FXRA 4XXUA 4OEUA 2PYYA 1MM6A 1IEJA 3UA8A 1TT1A 2XXRA 3KN8A 2B65A 4HW8A 2H25A 3VXCA 5K2XA 5ICQA 2UYFA 1SDXA 3LSWA 4WKMA 1LLSA 3H7MA 3T66A 1FQCA 4R6KA 2XXTA 4F3BA 1MQGA 2H98A 1OMPA 4OMBA 1R6ZA 3CI8A 5FTIA 3ECRA 4QSDA 1Y1ZA 2Z23A 4H1XA 1D3KA 4M4GA 2HCAA 2F7AA 3TUSA 5ITPA 3IK6B 1N76A 4R6YA 1GGGA 3N26A 4XKNA 1MY3A 2YPNA 3FXUA 1VSOA 2ZYKA 3TQLA 2H99A 5L9MA 4U23A 5EYFA 3IR1A 2Z8DA 3AXFA 2XXUA 2Y84A 5H8NA 4QSEA 1SW1A 1SVXB 5FHMA 5CC2A 3RPWA 2ZNUA 3TAJA 3R7XA 2DXRA 4RPNA 3MVXA 2BJJX 3U93A 1JQFA 3BFTA 5JTYB 3K01A 2HEUA 4H8JA 3FZVA 4R9FA 1Y3PA 1JVYA 2O84X 1ZJLA 1FTJA 1FTLA 4JDFA 3L6GA 1QULA 1B5JA 3MPKA 3LSLA 2DYXA 4NF4A 4MFIA 3M8UA 4FECA 2Q9TA 1B40A 1H76A 1MG1A 4BDRA 1OLAA 4G68C 5CBSA 1MXUA 3O97A 3IOTA 2O7UA 4KFQA 1OQHA 1ZU0A 3M3FA 1B51A 1GTKA 3OD7A 2PX1A 4R9GA 4XTCQ 3K1MA 5I2KA 2VD3A 1B3EA 5F1QA 1SYHA 4X9TA 5IAIA 2OWSA 3OEMA 2I58A 5KDTA 4IGRA 4GLIA 1XC1A 4F29A 2ESNA 3IOUA 1USYH 4I62A 1P1OA 2PT2A 3KFMA 4JWYA 1EU8A 4GWOA 1B7ZA 2XHDA 5DEXB 1OVTA 3KN7A 3V83A 5A5XA 1Y4CA 3Q26A 4OQOA 2RC8A 1Y4TA 4ZEBA 3EHTA 4MF3A 3RUMA 1LBBA 3CIJA 1JETA 3FASA 4ESXA 2NOOA 3LBSA 4ELRA 3T9UA 1H44A 3CR9A 4G4PA 4XKRA 3U92A 1QKBA 3UN6A 3N94A 4OETA 3B6QA 3OOAA 2OWTA 3OO8A 4ISUA 1II5A 4GQOA 4KCCA 4THIA 4MH5A 3FVOA 4G8NA 3M3LA 3MUQA 2E0SA 4G8HA 4KPTA 4DXCA 5I59B 4QFKA 2DVCA 3DM0A 2XD2A 1F9BA 1MRPA 3CFLA 3VDFA 2A5TA 1B32A 1Z7ME 4QFPA 5IKBA 4RJZA 3WAFA 2F8DA 3VLVA 1O7TA 4U21A 1MQIA 1QUKA 1SBPA 3T93B 2GRVA 1WDNA 3PUYE 5AA1A 1BIYA 3W9WA 4PFTA 3PD8A 2F78A 4AB5A 1UIVA 2YJPA 2I4CA 4RPOA 1JW4A 1PBPA 1UQWA 3PMWA 2HZKA 1LGBC 2F7CA 1SW5A 2RC7A 1MXYA 4OENA 3M3KA 1US5A 2P1SA 3MZBA 1D9YA 2H4IA 4GXAA 4HTGA 2HFBA 1Y1MA 4DCYA 4Z0IA 3MZ1A 4JWXA 1ZTYA 1AIVA 2OCUA 2P2AA 2XX7A 4XKPA 3GBBA 1SW4A 1LFIA 1NH8A 4OFJA 4FEBA 4I1DA 1SD3A 1N7XA 3MPLA 5JEIA 3D4CA 3N6TA 1MDQA 1I6AA 3H03A 4MLQA 2FA7A 4KCDA 1ZLQA 4XKQA 4ZEIA 1M5CA 3TTNA 1P1UA 1O63A 4WXJA 4LQ2A 1DSNA 5I58A 2WKYA 1EH3A 4POXA 2Q2CA 2X7QA 4ZZEA 4BDOA 3IO6A 3JZJA 4DZ1A 5I56A 2XX9A 1FCKA 1N0TA 2DP8A 2ONRA 3TTRA 4M1VA 3O6GA 2NWJA 4KD5A 2B3BA 1A7LA 5ITOA 5AA4B 5TP9B 3MP8A 2ZYOA 4BDMA 4DCXA 3G3FA 3A09A 4C1TA 1VFEA 3KJ7A 3GLBA 4JWOA 4OXVA 2OLBA 1P1WA 3FJMA 2XX8A 4FATA 5TPAB 2HQ0A 4JXIA 2W7YA 4R72A 1LB9A 5DTBA 4G68B 4RNSA 1LCTA 4OWDA 3KZGA 4KR5A 1DPEA 3MJNA 3H06B 4GL0A 4OESA 4H67A 2Y7WA 1QUIA 4N6PA 3KOTA 3LC8A 2R71A 1B3FA 3FUZA 2DS9A 1DMBA 1CB6A 4KYEA 4ND9A 3U94A 2H5YA 3O6IA 2I3VA 5DT6A 3RLFE 5H8SA 1MXVA 3OELA 5I57B 3RN8A 4LONB 3S9NC 1H45A 4ELPA 1MPDA 2REGA 1ZBMA 3VLUA 4EDPA 4NF6B 2X26A 2DSFA 5HBCA 1Y3NA 3FATA 2V3QA 1HSEA 4U2RA 3K0VA 4F3PA 3KSJA 3S9MC 3PMVA 2QL3A 5KCJB 1UTHB 1US4A 4QFLA 3PPNA 4EQBA 5DVFA 4OFLA 1SW2A 3VLWA 2Z22A 2XXWA 2DXYA 3C31A 4E0WA 3CG3A 4NF5B 1SI0A 2I48A 2O68A 1I6QA 1FQFA 4R2FA 3PUZE 4U4XA 4I9DA 1IUDA 1M5FA 1POTA 1WODA 1MM7A 2UVHA 3JYRA 3B6TA 4F1VA 3ILUB 2RINA 3K6VA 4YZZA 1M5EA 3H6UA 3O9PA 5DVJA 4FORA 4PQJA 3C36A 2NVUB 3IB2A 3W9VA 2G29A 4YAHX 3UK4A 1O64A 3IL1B 3DP4A 5F7VA 1ATGA 4TQUQ 5AA2B 3OO7A 4H6DA 2ANJA 3EF7A 2CZLA 2DE4A 5M2VA 3SEVA 2HZLA 1M5BA 2PBWA 3B7DA 3KJTA 1B3LA 1ELJA 3QK6A 2AL4A 4F1YA 1LAFE 3QAXA 4RYAA 4F22A 1FQAA 3EN3A 4F31B 2Y7KA 4IO7A 4L17A 1B1XA 3PD9A 1P1NA 3S4UA 3VXBA 3E4RA 4RK9A 4N07A 3F11A 4YICA 3FV1A 1HSJA 2F35A 3ONMA 2DWHA 2Y7RA 4PP0A 2DWIA 5B70A 3ODBA 1IXIA 1MPBA 4H0WA 1FQEA 1NNFA 3U8QA 4EQ9A 4NTLA 3IOWA 2ONKE 3ZSFA 1FTKA 4PETA 1IZ1A 1IIWA 4OVJA 2KLFA 4O3AA 5CMKA 2Q88A 5JTYA 2Z8EA 2QPQA 3ZS6A 1B58A 3EPEA 4GOTA 4OERA 2DWJA 1YTVA 1NL5A 2CMOA 3SEYA 3TYHA 3CVGA 4LP2B 2PVUA 5A5XB 1OLCA 2XXIA 4GD5A 2UXAA 4DXUA 2QRYA 1LSTA 3R6UA 3I3VA 3A3CA 4YMBA 3LR1A 3O66A 1DTGA 4FE8A 1YCJA 4I8CA 3N6UA 2ZXTA 2O1MA 3KEIA 1USYE 3T96B 4AB6A 4QFOA 2NUVA 1L5TA 1ZMGA 2IA4A 3VV5A 5CBRA 3K6WA 3ZKLA 4X1DA 1MY4A 4R6HA 1JW1A 2OJTA 4EUOA 3E9XA 4H65A 3W15C 2HAVA 2QSXA 3RGYA 4IO3A 3QUFA 3RQTA 1B3GA 3U1OA 5DEXA 4GRKA 3HN0A 3IORA 1BKAA 1XT8A 1NNKA 3MBPA 3SKPA 1BTJA 5H8QA 1KWHA 3Q29A 4Q5TA 1PB9A 2IEEA 3LUYA 3THIA 4HCWA 2HXWA 4ZEDA 3MZ9A 5H8FB 3PUWE 3C32A 4IO2A 4YKPA 3OO6A 3PPOA 3G3GA 4JSOA 3VVEA 4X1BA 1TWYA 1UIUA 4IO5A 1N04A 3TELA 2Q89A 2RCBA 2VGQA 5CM6A 1S9TA 1MY0A 1RYOA 2VHAA 3SDFA 1XS5A 4R73A 5I2NB 3SEUA 1URGA 4N13A 2XD3A 1OIBA 2R6GE 3TFLA 1JEUA 3E13X 1RYXA 2ZYMA 2NXOA 2RKMA 4PFWA 5L8DA 4IO4A 4EXLA 4EXKA 4OFOA 2I4BA 1B0HA 1D9VA 4DE8A 3ZKKA 3UIFA 2ALUA 1QW0A 1R9LA 1A99A 5JK4A 4AQ4A 3JV9A 3UP9A 3C9HA 4KYDA 3S9EA 1URSA 4NF8B 5TU0A 3ILTB 5DVIA 3K00A 3IJXB 3A3UA 3OEKA 4LATA 2ZMBA 3PPQA 4YKIA 5CRYA 3TTLA 4H5FA 1PBQA 3H6VA 1YAEA 1B1HA 2D21A 1ANFA 1VFDA 3TKDA 4FAJA 2PT1A 1B4ZA 2QMXA 3C33A 1B7HA 4QRZA 5CMCA 2O51A 1M5DA 3Q25A 4KI0E 2UVIA 3K02A 2AYSA 4MLVA 4G77A 4FJPA 2YLNA 3OO9A 2DQVA 3VE1B 3R26A 1Y20A 4ECFA 1B3HA 4QFNA 3H4ZA 4C1UA 1UTBB 4EQ7A 1MPCA 4FIMA 3E3KA 4DIGA 3S9LC 3RY3A 3I5OA 5EHSA 4NWDA 3U72A 2V93A 1MXZA 2GHAA 1ZIUA 5H8HB 1B7UA 3H3GA 1Y3QA 4OYVA 4RK2A 3K1NA 4H5GA 5ICTA 5TP9A 5CMBA 3KN3A 2DWAA 1BP5A 1EZOA 4NWCA 3PUXE 3O28A 1D4NA 2R9JA 1TFAA 3VFJA 4JSDA 5CI5A 1N84A 4OTEA 4KYSA 5J1DA 1LAXA 3T9XB 1Z7NE 4O3CA 4UACA 3HHFA 2V3TA 2FYIA 4QF9A 3TEPA 1B5HA 1Q35A 4G68A 2Q2AA 3K6UA 1Q1KA 4EF2A 2QS4A 2QS3A 3MP6A 1JW5A 1MQDA 1A54A 4QHQA 3TODA 4POWA 4BLAA 3MAMA 4H8IA 3PV0E 3T22A 3VVDA 1TXFA 3O29A 2D5WA 1LAHE 1MXWA 4GF8A 4MBPA 3B6WA 3C4MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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