2DWIA

Crystal structure of the complex formed between c-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA02
3G3HA 3OO7A 3N6UA 2O7IA 3OO8A 5FTHA 2GFEA 4GVOA 1SQYA 2FA7A 4YB7A 5IKBA 1MM6A 4H67A 1LAXA 4DLDA 2D21A 4JSDA 3OEMA 2DP8A 4QFNA 3MVZA 3ZKKA 3OOAA 3EHUA 1VFEA 3K4UA 4PFYA 1MXZA 2H99A 3IOTA 3TPAA 4R2BA 2HQ0A 4F39A 1LB9A 3OMBA 1IXIA 3A09A 1B6HA 3O9PA 2F8DA 1QUKA 1MXUA 3W15C 4E0XA 3M3KA 4X1BA 3RQTA 1PB8A 3CR9A 4LUBA 1SDXA 3C33A 3FV2A 1PC3A 3E3KA 3D4GA 1B1HA 3Q26A 1I6QA 5KCJB 1B58A 1B2HA 1F9BA 3CFXA 3PU5A 4U22A 1O7TA 3O6HA 3OXNA 4ELOA 2F6GA 4YB6A 4HTGA 4XKRA 1FTKA 2PT1A 2QMWA 1B7ZA 2I48A 3QIMA 4F31B 4OHNA 4E0WA 3QUFA 1VFDA 3SETA 4TOZA 5DEXB 1YAEA 1RYOA 1P1QA 1DOTA 2V25A 4HCYA 2Q88A 4H8JA 2IA4A 3N5LA 1B9JA 3OO6A 1I6BA 3RUMA 4DXCA 2XXQA 2OWSA 2A5TB 3FVGA 3VXBA 1Z7NE 5CRYA 3SDFA 3SEUA 3MZBA 5JEIA 3R7XA 2F7CA 2CZLA 1B3EA 1ATGA 1LAGE 4OMBA 5AA1A 3LC8A 3GXAA 4YU0A 2UYFA 3VVEA 2FNCA 2ZXTA 3IR1A 4OVJA 4ZZAA 5H8QB 2DQVA 5ITPA 1USYE 3FXUA 3PUZE 4GRKA 3E9XA 5EHSA 4KPTA 2UVIA 4MH5A 5B70A 2V3QA 4RK2A 4IB2A 4KQPA 2OJTA 5FHMA 4OZ9A 1Y3NA 3OO9A 2YJPA 4G68B 1B5HA 4F29A 4H5FA 3GZGA 3OSQA 3T9VA 4P0GA 2UXAA 3MBPA 3H3GA 4DDDA 4QRZA 2BJJX 1POTA 2E0SA 2XD3A 4ZEDA 1IIWA 2DVZA 4F1VA 3K6XA 1A55A 1BLFA 2ZYKA 3O66A 3SEVA 3K6UA 3TCFA 5BWJA 3IB2A 4LZ5A 1N3WA 2O1MA 4YKPA 1AIVA 1IEJA 4NF8B 4LP2B 3KJTA 2ALUA 1RYXA 3KOTA 1OLAA 4OERA 5CBRA 3HSTA 3RN8A 4GXSB 4WKMA 5JK4A 2DXRA 3JV9A 3FGSA 3PMWA 5F7VA 1NNKA 4HW8A 1A7LA 1B5JA 2ONSA 4QSCA 2DSFA 1R9QA 3QYTA 4FEDA 5J1DA 1GVCA 4C1TA 1SD3A 1OVBA 1QVSA 3S4UA 4LATA 2DWHA 3K6VA 1JEVA 1D9VA 1Y1MA 1JW4A 1NNTA 4RPOA 3MP8A 1BKAA 4OQOA 5H8FA 1H45A 2VGQA 1FQEA 4RA1A 2P0SA 3MW0A 5M2VA 3KJ7A 3UIFA 5KDTA 1B5IA 3UK4A 4F2OA 3DLNA 4XKQA 1LAFE 3Q27A 3JYRA 1MXWA 1XVYA 5BUUA 4PFWA 4F18A 1LB8A 5HPQA 3D4CA 4FAJA 2F6PA 5K2YA 5K2XA 3FZVA 4YKJA 5H8NB 2HAUA 4FECA 1Y3QA 2I3WA 5I59B 3ILTB 1UTBB 4I9DA 4PP0A 1ZKBA 2OBGA 1QUIA 5AA2B 4AQ4A 1Y20A 3K02A 4O3CA 4N07A 2O6AA 1XC1A 3PUYE 1H43A 1DPEA 2G29A 3LSLA 4QFLA 4R75A 1R1NA 4I8CA 1OQGA 3VFJA 1P1WA 1MXYA 2F78A 3CG1A 1M5CA 4DCYA 2Q8JA 3TTNA 1IQ7A 1O64A 3U72A 3GBAA 4LA9A 3FXQA 3TTRA 1Y1ZA 3CSBA 2NVUB 1J1NA 1LGBC 3E4RA 4RPNA 4KYDA 3K2DA 5H8HB 4F3BA 3G3FA 1Y9UA 2UYEA 4QSDA 1FTMA 3KEIA 4GL8A 5ELVA 3C31A 2P1SA 3V83A 3IJXB 1ZMGA 1MXXA 3SEYA 4M4GA 1FCKA 1P1UA 1Y3PA 4DXUA 2V3TA 3TTKA 5I58B 3VE1B 5I2NB 1UTHA 5I2KA 4PETA 2Y7WA 3KOSA 4XKPA 4KCDA 3T66A 4F19A 1IZ1A 3IO6A 1AMFA 2B3FA 2DYXA 2X7QA 3MVXA 1JNFA 4RJZA 4EUOA 2PBWA 1B52A 4JDFA 5AE4A 4BDLA 3DELB 5KZTA 4XXUA 2Y84A 4R72A 3MP1A 2XXPA 2GHBA 2GRVA 2X26A 4Q5TA 5I84A 2G93A 5I57A 5JTYA 1QUJA 2RC9A 4U4XA 4NWDA 1GV8A 1MQJA 2HZLA 4NF6A 3TAJA 4QSEA 3TCHA 3I3VA 1URGA 1IXHA 1OIBA 3PPQA 1MQGA 2OWTA 5I56B 3UN6A 5AA4A 2ZMBA 1BIYA 4U1ZA 5EHMA 3B7DA 4IO5A 4U2RA 1Y4TA 3GBBA 5FHOA 1VSOA 1FTLA 2QS2A 3B6QA 2VD2A 1D9YA 5CBSA 4IO3A 3KN3A 2RINA 5TP9A 1DMBA 1P99A 4BDQA 2HEUA 3V89B 2DVCA 4FATA 4R9GA 3TYHA 3CG3A 2XX9A 3QSLA 5HBCA 3A3UA 3TKDA 3MPKA 2LAOA 4Z7EA 4F1YA 2F36A 1D3KA 4DE8A 4GL0A 3TQWA 3G3IA 1VR5A 1S50A 5A5XA 1ZJLA 4YAHX 2H98A 3FXRA 4OFJA 2O69A 4K3FA 2ABHA 5ITOA 3RNNA 3C9HA 1NNPA 4IGTA 3H6UA 1B4HA 3S2VA 1PDAA 2Y7KA 5L8DA 2XXTA 1USYH 4F22A 3G7WA 5H8NA 1LFHA 3KN7A 2VOZA 2F5XA 3R6UA 1MQDA 2RCBA 3MUQA 4HCWA 1B46A 3LR1A 1SW5A 4RY1A 4DZ1A 4MLQA 1B05A 1M5FA 5CMBA 1MH4A 3MVWA 4TQUQ 4LQ2A 5TU0A 3N94A 4ELPA 3K1NA 4NF4B 4NF5A 2XXRA 2P2AA 1MQHA 3O6IA 3T22A 1B4ZA 3MWBA 1LFIA 3OD7A 2OCUA 1LFGA 3TMGA 1B0LA 3UA8A 4ECFA 4GOTA 3RLFE 2X7PA 3N6TA 1UQWA 5DVIA 1FQBA 2DS9A 1LLSA 1O63A 3L6HA 2I0BA 3EPEA 1FQCA 2DWIA 4MLVA 3LBSA 4IO2A 3SERA 3PPPA 5DT6A 2ZYOA 3MP6A 5EYFA 4KFQA 3V5AA 1Q35A 3L6GA 3KGCA 3O97A 4G8MA 1XOCA 1N0TA 3O28A 3TTMA 1DTZA 1FTJA 4NMYA 1DPPA 3FJMA 3M3FA 2Q2CA 3ILUB 5I2NA 4MBPA 2V93A 4TLMB 1P1NA 3T93B 3K1MA 2H5YA 5CM6A 1B1XA 1B51A 3PD9A 1WDNA 3ODBA 4PQJA 2DE4A 4KYEA 3C32A 4OTEA 4R74A 1II5A 3IO4A 2DOJA 3QAXA 3VV5A 2Y7RA 4JWYA 1QULA 1FQAA 3ZKLA 3W9WA 3OSRA 3PV0E 4XTCQ 3MPLA 2RC8A 2O84X 1MDQA 4ZE8A 4H6DA 1OMPA 2XXUA 1R9LA 3TQLA 4ZE9A 1IXGA 4NEDA 1NKXA 2IEEA 3SESA 3FVNA 1NMUA 3M3LA 1LAHE 4EQBA 3RT6B 2D3IA 3EF7A 1B7UA 2RCAA 1N04A 1HSLA 4POWA 4KR5A 3PGFA 3KSXA 1AH5A 5TPAA 3HHGA 3JZJA 5L9MA 2Q89A 3FUZA 1MPCA 1SW1A 2AYSA 2NUVA 3RPWA 4NE4A 4EXKA 1B32A 3VLVA 4R9FA 4OFLA 5CMMA 3SEWA 2RF1A 4R6KA 1A54A 1MY4A 2PYYA 4DXBA 1JW1A 4GD5A 1B3LA 3G3GA 3DM0A 4WEPA 5L9SA 3OEKA 2I3VA 1URDA 2F7AA 3IOVA 3H7MA 1B3FA 1N7WA 3MJNA 3IL1B 1SW2A 4KI0E 1A99A 3TTLA 1EH3A 3MQ9A 2PT2A 3PPNA 5CC2A 3W9VA 4N6PA 2DE3A 5DVFA 3O29A 1SI1A 1TT1A 3IOUA 4GXAA 1CB6A 4ZDMA 4R2FA 2Z23A 4PFTA 5KCJA 3IOWA 2VP1A 2UVHA 2F34A 4G2ZA 2OK2A 2XXXA 1VE4A 3U94A 1ANFA 2DWJA 3B6TA 2QRYA 3VLUA 1N84A 4G8HA 2WKYA 4QFKA 3H6VA 4RK9A 2REGA 4JSOA 4DIGA 3VDFA 3RGYA 1NL5A 1IITA 3CI8A 2Z8EA 2H4IA 2XXHA 2O7UA 5DEXA 2I4CA 3HN0A 1NNFA 2I58A 1S7YA 4P0IA 3SKPA 1DTGA 1MPDA 3OENA 1QW0A 2A5TA 1I69A 2I0CA 4GLIA 3K00A 1D4NA 3R26A 2ZNUA 2O1LA 1XS5A 2V84A 2R9JA 1JEUA 3KN8A 4BDNA 1YPNA 1MY0A 4RYAA 1JETA 2FYIA 1MM7A 3KZGA 3HHFA 1WODA 5H8QA 3C35A 2Q2AA 4QF9A 4LONB 1B3GA 1IUDA 3TFLA 3K1PA 1H76A 1PB9A 4IO7A 4EF2A 4WEDA 3EQ1A 3MVYA 1M5DA 3ECRA 1ZTYA 3TUSA 2F35A 1IXCA 4RXLA 1QKBA 4G68A 4U4SA 1MY2A 2F97A 3RTWB 3T96B 4OEVA 3IJOB 3CFZA 1QJMA 3IORA 4OETA 1EZ9A 5IAIA 2O68A 3H06B 2Z8DA 1A40A 3CFLA 4IY5A 1A8FA 4MFIA 4Q0CA 4NF8A 1POY1 2NWJA 1JQFA 4IGRA 2I49A 4FIMA 4BDMA 4JWXA 5DVJA 2XXYA 4XKNA 3V8XB 4M1VA 4H5GA 3B6WA 2Z22A 4ZEBA 4UACA 2ESNA 4U21A 2YLNA 4ONYA 5H8SA 4ZECA 4NTLA 2DWAA 1L5TA 1S9TA 1B3HA 3C4MA 2Y7IA 4H1XA 4LZ7A 5CI5A 3WAEA 2HZKA 1PB7A 3F11A 4QFOA 4YZZA 3DP8A 4G8NA 3WAFA 3MC2A 4R73A 3PPRA 2M8CA 4R6YA 2A5SA 2ANJA 3ZS6A 1ZLQA 4EQ7A 3FATA 4NWCA 1M5EA 1ELJA 4L17A 3UP9A 5H8FB 1B0HA 2Z8FA 3MAMA 3PMXA 1P1OA 4OESA 5KDTB 2XXVA 4WXJA 5I59A 3U8QA 1UTBA 3EHSA 2XXWA 5AA2A 3M8UA 1RKMA 5AA3A 3T9XB 3MZ9A 1XHYA 3FVOA 2HAVA 4JXIA 1UIVA 1N76A 3FASA 4RNSA 4O3AA 1WVJA 3BBRA 3BKIB 1GGGA 4FEBA 3N26A 4G68C 2UVGA 2ZNTA 1EZOA 1US5A 2REJA 3LSFB 1MXVA 5B7DA 1BTJA 3A3CA 3RT8A 1MRPA 2H9BA 2RKMA 2E1SA 1MY3A 2Y7PA 3TCGA 2Q9TA 1OLCA 2DXYA 2NOOA 5H8HA 1MH3A 1SBPA 1SYHA 1MY1A 1SI0A 3UORA 3HV1A 1TXFA 3IK6B 3PUVE 2ONKE 1MDP1 3S9NC 1OQHA 4YKIA 4ELRA 3H03A 3QUJA 3USDA 3GLBA 3TEPA 4ZEIA 3FIRA 5I58A 4JWOA 1YCJA 3S9EA 1FTOA 2OZZA 3CVGA 3PD8A 3G3JA 3BFTA 4X48A 4MF3A 2ONRA 4THIA 4OXVA 3UGWA 2XHDA 3Q28A 1SYIA 1UTHB 3FJ7A 5I2KB 4QFPA 3P7IA 1JVXA 2QMXA 3VVDA 3TODA 2QJEA 4OFOA 1R6ZA 3C36A 5FHNA 1Z7ME 2ZYNA 4AB5A 1AL3A 3CSGA 3SEXA 1DSNA 4LVQA 1JVYA 3K6WA 5CMKA 2H25A 2XXIA 1KWHA 2UVJA 3QK6A 1HSEA 4EQ9A 2F7BA 3KFMA 1MQIA 1OVTA 2I4BA 2R6GE 3TZAA 2ZYMA 4EF1A 1XVXA 1NH7A 4IO6A 5I57B 1PEBA 5JTYB 3DP4A 3HCQA 5I56A 3VVFA 4H8IA 4LZ8A 1NFTA 1SW4A 3Q29A 4NF6B 3TELA 3FJGA 5HM4B 4ESWA 3Q25A 4KD5A 3ZSFA 4O3BA 2AL4A 2B65A 1N7XA 3U92A 5AA4B 3O6GA 4LQ5A 1TFDA 1URSA 2PX1A 3PMVA 4Q30B 3K01A 3DP6A 3BFUA 4HS7A 3U1OA 1T0KA 2QSXA 4DCXA 4ZZEA 5TP9B 4YKKA 2ZNSA 4FORA 4F3GA 1UIUA 3T9UA 2PVUA 3KG2A 2QL3A 2GHAA 1N3XA 3U93A 4KYSA 3H6WA 4OENA 4GWOA 3H4ZA 4G77A 1MPBA 3T9HB 2PMSA 3H6TA 1Y4CA 3S9MC 4X9TA 5A5XB 3C34A 4ND9A 1HSJA 4I1DA 4QHQA 3VLWA 1AOVA 3I6VA 2QS1A 1LSTA 2NXOA 4F1UA 3OELA 1LCTA 4BDOA 3E13X 3FD3A 1A8EA 4OEUA 4NF4A 3EN3A 2XX7A 5F1QA 4EXLA 3O2AA 4AB6A 3EHTA 3G3KA 2B3BA 4ISUA 1I6AA 3THIA 3AXFA 1GR2A 4YICA 1FQDA 4U1OA 4FE8A 1FQFA 2D5WA 1MS7A 2GH9A 3CRBA 1Q1KA 3PUXE 2DE2A 4NF5B 4GFRA 4I62A 4ZS9A 2XD2A 3HPIA 3TDJA 1QKAA 1ZIUA 4U23A 4N13A 2I6EA 1US4A 3RY3A 2VD3A 1TFAA 4POXA 4PFUA 2YPNA 4C0RA 3PPOA 5DYHA 4H65A 2HCAA 3K0VA 2O51A 4ZEFA 4KCCA 1YTVA 5ICTA 4R6HA 3ONMA 4YMBA 1B7HA 3IB1A 2HXWA 4YMAA 3PUWE 4H0WA 4OWDA 1JW5A 4C1UA 1M5BA 2OLBA 1LCFA 4KHZE 2QPQA 5FTIA 3IB0A 1SVXB 3VXCA 4IY6A 4GQOA 1TWYA 4Z0IA 3IAZA 4TLLB 3I5OA 1ZBMA 3KSJA 2HFBA 4IO4A 2V3UA 1PBPA 1XT8A 1MG1A 4GF8A 1H3DA 4BDRA 4UA8A 1EU8A 1BP5A 4JB7A 5L9OA 1LBBA 2CMOA 4G4PA 2KLFA 1FW0A 2QS3A 3IX1A 4GIZA 5DTBA 3CIJA 3KBRA 1CE2A 4P11A 2RC7A 5ICQA 2AIXA 4ESXA 5ISUA 1ZU0A 4F3PA 5CMCA 3LUYA 2XX8A 1PBQA 4PE5B 4Q8RA 3LSXA 1GTKA 4F3SA 2R71A 3FVKA 3QXMA 4YB5A 4F2QA 4XIGQ 4OYVA 2THIA 4BLAA 1H44A 4ZEKA 3FV1A 4EDPA 3MZ1A 2W7YA 2VHAA 3LSWA 1EZPA 3RTFB 3HO7A 2QS4A 1LBCA 4FJPA 5AA2D 4ELQA 2AL5A 3S9LC 4JBZA 5LOMA 5TPAB 1B40A 1NH8A 4X1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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