2DWIA

Crystal structure of the complex formed between c-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-terminal half of bovine lactoferrin and cellobiose at 2.2 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dwiA02
2I0BA 5B7DA 4IGRA 1GGGA 4LA9A 2E1SA 1ZBMA 3OEMA 4KYDA 1BTJA 4OYVA 1ZIUA 4F1YA 3QAXA 3FV1A 3G3JA 3I6VA 2ALUA 4IO6A 2XXIA 1IUDA 1EU8A 4KFQA 3UA8A 1LAFE 2QS4A 4KHZE 3ZKLA 4LQ5A 5FHOA 1D9VA 3CI8A 3U72A 5M2VA 4YAHX 3HSTA 4K3FA 1SQYA 1MXYA 5ELVA 5DT6A 1VR5A 3PPQA 1WDNA 1DPPA 5I59B 3KN8A 3QIMA 4HW8A 3MQ9A 1H43A 2Q89A 2I4BA 3Q26A 3TCFA 1SYHA 3QSLA 4DXBA 2HAVA 1URDA 1PBPA 3MW0A 1TWYA 1UTHB 3M8UA 1YCJA 2VHAA 4IY5A 3SEWA 4IO2A 2Y7KA 3IX1A 2DS9A 1B1HA 2Y7RA 3PPPA 2P1SA 1FTOA 1D3KA 4R6KA 2DQVA 4G68B 5DEXB 3L6GA 5DVFA 2HZLA 3FVNA 4R6HA 1UTBB 3G3HA 1Y3PA 4GF8A 3MWBA 2V84A 1ZJLA 2RKMA 4F3BA 2DVCA 2M8CA 5LOMA 2XD2A 3MVXA 2R9JA 1URSA 4EQBA 3Q27A 5KDTB 3RY3A 1TXFA 4NF4A 4EXLA 3S9NC 3M3FA 5ICTA 2X26A 1M5EA 1XVYA 1PBQA 1FQAA 5HM4B 5JEIA 5CMMA 5H8QA 1FQFA 2UXAA 3UK4A 3B6WA 4OQOA 3OELA 3FJMA 1BP5A 1SVXB 2ONSA 4NWCA 3H7MA 1OVTA 1H3DA 1S7YA 3E9XA 1S9TA 2ZMBA 3OXNA 2XX9A 3LSLA 1DOTA 3U92A 2D5WA 4BLAA 3RN8A 1B5JA 2I4CA 3H3GA 4U21A 1FW0A 1L5TA 1JETA 4YMBA 4DCYA 2LAOA 1IIWA 1I6QA 1N7WA 5I57B 4ZS9A 4GL0A 5FTHA 1PEBA 2O7UA 2V3QA 4P11A 1M5CA 4F2QA 1I69A 1Y3QA 1R6ZA 3FZVA 1JEUA 3GBAA 1A8FA 2NXOA 4WKMA 2PVUA 2HEUA 4JSDA 1JVXA 4H5FA 3L6HA 2F6PA 4O3BA 4PFTA 3CFLA 2THIA 2I58A 3TAJA 5I58B 4JWXA 5TP9A 1OQHA 3O6HA 3C33A 4R9GA 4OEUA 2HXWA 4OEVA 1NNTA 4H8IA 3MAMA 3DM0A 3CG1A 3HHGA 4NF6B 3JV9A 2DWIA 5F7VA 4ZEBA 2XXRA 1M5BA 1B3LA 3GBBA 2BJJX 3VE1B 3FIRA 3IOUA 2AIXA 5ITOA 1MDQA 3R26A 4X1DA 3CFZA 3HO7A 4OFLA 5H8HB 4I9DA 3C34A 4DDDA 1NH7A 4ZZEA 3MUQA 3R7XA 2UYFA 4NMYA 3TTRA 4F2OA 4R72A 5I2NB 3MVYA 4EF2A 1PB8A 4DXUA 1Q35A 3N26A 4Q5TA 4JDFA 1PB9A 3IOVA 2WKYA 4PP0A 3TTKA 4MLVA 1JW4A 1LBBA 2XXWA 1MY4A 4QFLA 3LSFB 2Z23A 3OD7A 1SDXA 3CRBA 3EPEA 1MQGA 4GOTA 4FIMA 4OTEA 4ESWA 4ISUA 3O6GA 1MPDA 1LFIA 4QF9A 1MM7A 4X48A 3N6UA 1N84A 1MS7A 2P0SA 3ODBA 5I2KB 2RC7A 1I6BA 4U22A 2HAUA 2XXHA 1UIUA 3T9XB 3VV5A 4MBPA 3T9HB 4BDRA 3QXMA 2QMWA 1USYE 2XXXA 4QFKA 2NOOA 1MXZA 4U2RA 4QSEA 2D21A 4PFYA 3MZ9A 3TTNA 4LZ8A 3TDJA 1Y4TA 2DWHA 4G8MA 5EHSA 4EXKA 3LSXA 3U94A 4DXCA 1POY1 4DLDA 4TLLB 5I56B 3FVKA 3OO6A 1F9BA 4BDLA 2QJEA 3RLFE 3TKDA 3B6TA 1NKXA 1OLAA 3V89B 2O1LA 4FJPA 1SD3A 4UACA 1HSLA 1N76A 4YKIA 3ILTB 1FQDA 4TLMB 4YU0A 3IO6A 3IO4A 2PT1A 3IB0A 3S2VA 4POWA 2AL5A 3H03A 2F35A 2ZNTA 1FTKA 2XXYA 2O6AA 3CVGA 3FASA 3U93A 1FTMA 3TCHA 3VXCA 2RC9A 4L17A 4TQUQ 1QUIA 1B1XA 4F1UA 2XXTA 1H45A 4F19A 1AOVA 1O7TA 2F7CA 4ECFA 3OO8A 3KBRA 3IB2A 3TTLA 1TFAA 3G3KA 3WAEA 3PD8A 2GHAA 1WODA 4R73A 3O6IA 1MXVA 1P1OA 1HSEA 3QUJA 4LUBA 3T9VA 4JWOA 2Z8EA 3VVEA 2F8DA 1J1NA 3KSXA 4N13A 4RK9A 1OVBA 2ZYKA 3T96B 1QVSA 4R75A 2P2AA 5H8FB 1AL3A 2GRVA 1PDAA 4R6YA 3RT8A 1IXIA 2VD2A 3KG2A 1XS5A 3FVOA 1LCTA 4XKRA 2PYYA 2I48A 3OENA 1ELJA 1P1UA 3FGSA 3FD3A 4KI0E 1NFTA 4OHNA 5CMCA 4ZE9A 1N7XA 2CMOA 3SESA 3KGCA 2O68A 3GZGA 4MH5A 4ELRA 2Y7IA 2PT2A 3O66A 3PMXA 1B52A 2PMSA 3S4UA 2AYSA 1YTVA 1QUJA 3W9VA 1B3EA 3PUXE 1MPCA 3HHFA 4C0RA 5CBRA 4YICA 2I49A 5AA2A 3TCGA 1VFEA 1MY1A 1B9JA 2DXYA 3MP8A 2ESNA 1FTJA 3I5OA 1LFHA 4GXSB 5AA4A 4YB7A 4G68C 2A5TB 2ZYMA 5H8NA 4ONYA 3PPNA 5EYFA 4NTLA 3ZKKA 3E13X 1B3FA 4PFUA 3VDFA 3QYTA 3FXRA 1IZ1A 3VXBA 3V83A 3C9HA 2G93A 1LAHE 1AIVA 4FEDA 1SBPA 2QS2A 1SW5A 4X9TA 1I6AA 1Y1MA 4OERA 4KCDA 2ANJA 1POTA 4ND9A 1R9LA 3VVFA 1SI1A 2DXRA 2DYXA 3CSBA 2Y7PA 1B32A 3K4UA 3IORA 5TPAA 3FXQA 5IKBA 1UQWA 1MY0A 1ZU0A 3RUMA 2DWJA 4RA1A 4RYAA 4EDPA 3K00A 1TFDA 2DE4A 5JTYA 3K1MA 3LBSA 1XHYA 3TUSA 1ZKBA 1BIYA 3KEIA 2ZXTA 2XX8A 3A09A 4GLIA 1OQGA 1IXHA 5AA2D 2O84X 3PUZE 2VP1A 4NF5B 4QFPA 3MVZA 4GL8A 3SERA 4F39A 3RQTA 5AA3A 4LZ7A 2OBGA 1VSOA 3S9LC 5A5XB 5FHMA 4XXUA 1SW1A 1P99A 4NWDA 2QMXA 1B4ZA 1ZMGA 3KZGA 1B46A 3KOTA 2RINA 3MPLA 2OWSA 1B7ZA 2XXUA 2XXQA 3SEXA 4YKKA 5FHNA 4OVJA 3DLNA 2O51A 5CRYA 1MQHA 4AB5A 3Q25A 2UVGA 1P1QA 2RCAA 3P7IA 4ZEIA 2OZZA 3LSWA 3CFXA 2DSFA 3VLWA 3IJOB 3IK6B 4JXIA 2W7YA 3VFJA 2XXPA 3SEUA 1ZLQA 1GV8A 1O64A 1FCKA 1QJMA 4IO7A 4YZZA 3UGWA 2RC8A 1ATGA 3KN7A 2HCAA 5FTIA 3IOWA 2QS3A 3MZ1A 3MPKA 5CM6A 4TOZA 3IR1A 2V93A 1NNFA 1QUKA 3TFLA 4THIA 1LGBC 1Y3NA 1II5A 1A7LA 3F11A 4O3AA 1HSJA 5EHMA 5I59A 2Y84A 3LUYA 1MXUA 3WAFA 2A5TA 4LQ2A 1JNFA 4MF3A 3PUVE 5L9SA 1EZPA 4Q0CA 1AMFA 3CR9A 1Q1KA 4EQ9A 4OENA 1MPBA 5DTBA 2GFEA 3C35A 3TTMA 3FJ7A 1A40A 1UTHA 4FAJA 4ELQA 4IB2A 3N5LA 1JQFA 4KR5A 1LAGE 1XT8A 2B3FA 3BFTA 3PMVA 3BFUA 4RNSA 1KWHA 3C31A 1R9QA 3KOSA 1LLSA 4G68A 5DEXA 2ONRA 1AH5A 2CZLA 3OMBA 1FTLA 1UTBA 3K6XA 2H98A 4QRZA 2I0CA 3MBPA 2HFBA 4Q30B 5CMBA 2HZKA 4QSDA 5KDTA 4XKPA 4U4SA 4ZDMA 3H06B 4F29A 2Q2CA 4BDQA 2F34A 1SW2A 4F1VA 2B3BA 4ZEFA 3EHUA 4LATA 1MXXA 2Z22A 3ILUB 5IAIA 2F6GA 3M3LA 4MLQA 1OLCA 1MRPA 4OZ9A 4G2ZA 4P0IA 3CSGA 4F3GA 3HCQA 1B3GA 5J1DA 4Z7EA 3FATA 3TMGA 3TPAA 2YLNA 4OFJA 3O2AA 2AL4A 3RNNA 4DIGA 1VFDA 2OWTA 4FATA 2XXVA 1PC3A 1NNPA 3H6VA 3TODA 4XTCQ 4YMAA 3C36A 4NF4B 3TYHA 2NVUB 1Y20A 1B0HA 2QRYA 3K1PA 1DTGA 5ITPA 5I57A 2O69A 3OSQA 1B58A 1NL5A 5H8QB 2REGA 4XKQA 3K6UA 4GFRA 3O29A 4KYSA 1VE4A 3SKPA 3O28A 4U23A 4C1UA 5I58A 4ZECA 2IEEA 2XX7A 2DOJA 5AE4A 4I8CA 3BBRA 1XC1A 5AA1A 3MP1A 1B4HA 1OMPA 5KZTA 1RKMA 2OLBA 4KCCA 2QSXA 4NF6A 1LB8A 4MFIA 2UVJA 4PE5B 1R1NA 2X7QA 4Z0IA 5H8SA 1PB7A 1DPEA 3DELB 2FA7A 2REJA 4GVOA 4IY6A 4JSOA 3HN0A 2Q2AA 3G3GA 1B3HA 3K2DA 3U1OA 1DMBA 5CBSA 5H8HA 4IO4A 3KN3A 5TP9B 1H76A 2OK2A 4DZ1A 3FVGA 1IXCA 3DP8A 4QFOA 2VOZA 3LR1A 4E0WA 1NNKA 2F5XA 1Y9UA 4QFNA 1EZOA 2ABHA 4DCXA 4XIGQ 5I2NA 2F78A 4YB6A 3T22A 1NH8A 5K2YA 2V25A 1SI0A 3RPWA 4POXA 3AXFA 2RF1A 3IOTA 3K1NA 4GRKA 3RT6B 3B7DA 3ONMA 4G77A 1NMUA 1DTZA 3PV0E 3G7WA 5DVJA 1D4NA 3K6VA 4G4PA 4OMBA 3H4ZA 1LSTA 2I3WA 3E3KA 5JK4A 4H67A 3D4CA 4R74A 4ELPA 1CE2A 3RTWB 5ICQA 3JYRA 3R6UA 1Y1ZA 5I2KA 2VD3A 5L8DA 3VLVA 3EN3A 3PMWA 2V3TA 4G8NA 1D9YA 1M5DA 4F31B 2F7AA 3GLBA 1IXGA 3TQLA 2O7IA 2FNCA 4ZE8A 4G8HA 1QULA 4BDNA 4R2FA 3FXUA 3UN6A 1JW5A 3O97A 4R9FA 3H6WA 3Q28A 3OSRA 3PPOA 2ZNSA 5I56A 3KJ7A 3SETA 2F97A 1YPNA 2YPNA 4PFWA 3TZAA 3A3CA 2V3UA 1JW1A 1B7UA 1EZ9A 3OEKA 2QPQA 4PETA 1P1NA 1UIVA 1MG1A 1MY3A 3ZS6A 4ZEDA 1QW0A 4OESA 5BWJA 3IJXB 4RPOA 1EH3A 4KPTA 4F3PA 4N6PA 4XKNA 4LONB 5F1QA 1MH4A 4WEDA 2OCUA 4EQ7A 2H9BA 2GH9A 1B05A 4FECA 1URGA 3FV2A 3W9WA 2H99A 2GHBA 4F3SA 4JWYA 3RTFB 3SDFA 2IA4A 5L9OA 5HPQA 3MZBA 1SW4A 1CB6A 2I6EA 2DE3A 3PGFA 4U1ZA 3D4GA 4RXLA 4NF8B 2UVHA 3VVDA 1FQBA 2Q88A 3I3VA 4RY1A 2QL3A 2HQ0A 4M4GA 3FUZA 2PBWA 3IB1A 2G29A 3CG3A 3PPRA 3KJTA 1B2HA 1BLFA 1MDP1 4F18A 3UP9A 5H8FA 2YJPA 4EUOA 4FE8A 2Y7WA 3HV1A 4I62A 3VLUA 4KYEA 3TEPA 5KCJB 4I1DA 2UVIA 4JBZA 1IEJA 2E0SA 4E0XA 4ELOA 1A54A 3DP4A 2ZYNA 4QHQA 1Y4CA 1Z7NE 3QUFA 2X7PA 2PX1A 1A8EA 4ZZAA 1US5A 2H5YA 4WXJA 1GVCA 1FQEA 2D3IA 1QKBA 4YB5A 4DE8A 1B7HA 4C1TA 5I84A 4GQOA 2F36A 1O63A 3EQ1A 3EHSA 2DE2A 3MP6A 1MY2A 2RCBA 2I3VA 1LAXA 5BUUA 3S9MC 4Q8RA 2Z8FA 3U8QA 3ZSFA 1MM6A 4LVQA 1TT1A 4RK2A 4IO5A 3S9EA 1M5FA 2Q9TA 2H4IA 5B70A 1LFGA 1B5IA 5CI5A 1OIBA 3PUYE 3PD9A 4KD5A 1MXWA 3B6QA 4X1BA 5CC2A 3O9PA 2UYEA 3TELA 2ONKE 4HTGA 4ZEKA 4OXVA 4LZ5A 1MQJA 4RJZA 4LP2B 1IQ7A 3H6UA 4BDOA 2ZNUA 4U1OA 3V8XB 1N0TA 3LC8A 4GIZA 3HPIA 1T0KA 5TU0A 1XOCA 1XVXA 4R2BA 3H6TA 1A99A 3TQWA 2XHDA 1B0LA 5AA2B 3Q29A 4H5GA 2Z8DA 4M1VA 3W15C 1ZTYA 4EF1A 3V5AA 2DP8A 3MC2A 3T9UA 1IITA 2FYIA 3IL1B 5AA4B 3PUWE 3MVWA 3THIA 4ESXA 3OO9A 3DP6A 2H25A 5H8NB 1B6HA 4JB7A 1JEVA 1B40A 3IAZA 1B51A 1SYIA 2DWAA 3A3UA 1A55A 1JVYA 3EHTA 3FJGA 4RPNA 1USYH 3EF7A 1MH3A 3KSJA 2R71A 3T66A 4YKJA 2O1MA 5ISUA 1H44A 3K02A 4H65A 2NWJA 3K0VA 4NEDA 5L9MA 1P1WA 4F22A 4H1XA 4U4XA 3ECRA 3T93B 1MQDA 1RYXA 5K2XA 1QKAA 3C4MA 4GXAA 4NE4A 3JZJA 2QS1A 1LB9A 4HCWA 1S50A 1BKAA 4NF5A 4H6DA 2ZYOA 3M3KA 5DYHA 3RGYA 4NF8A 2NUVA 3G3IA 3MJNA 5TPAB 4FORA 3BKIB 2DVZA 1US4A 3C32A 3N6TA 5A5XA 4YKPA 4UA8A 2OJTA 5HBCA 4GD5A 4AQ4A 3E4RA 3QK6A 4KQPA 5JTYB 5CMKA 3SEVA 5KCJA 2Q8JA 3CIJA 3PU5A 3K01A 4HS7A 3SEYA 1GR2A 1N04A 2XD3A 5DVIA 3OO7A 4FEBA 4H0WA 3GXAA 2F7BA 4O3CA 1RYOA 1N3XA 4OFOA 4BDMA 2R6GE 1GTKA 4H8JA 1YAEA 1DSNA 3N94A 4P0GA 4PQJA 4IO3A 1N3WA 4OWDA 1WVJA 1B5HA 3OOAA 4IGTA 2A5SA 2VGQA 1MQIA 3USDA 1ANFA 4N07A 2KLFA 1LCFA 1LBCA 4HCYA 4WEPA 1FQCA 3UIFA 3K6WA 4GWOA 3G3FA 3UORA 4AB6A 2B65A 1Z7ME 4OETA 4QSCA 3KFMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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