2DXRA

Crystal structure of the complex formed between c-terminal half of bovine lactoferrin and sorbitol at 2.85 a resolution
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex formed between C-terminal half of bovine lactoferrin and sorbitol at 2.85 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 107
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxrA02
1PC3A 4KPTA 3KJ7A 1I6BA 3FVOA 1UTBB 2XD2A 4E0XA 4POWA 3RPWA 3UGWA 3MVWA 2V84A 5TP9B 3IAZA 1R9LA 1H45A 4OFLA 1UQWA 2F78A 3I3VA 3KEIA 5L9MA 4H5GA 4GRKA 2UXAA 3CR9A 5AA2D 4F3PA 4THIA 4OVJA 1F9BA 2AIXA 4ESWA 2RINA 3FGSA 1DPEA 3TCHA 4GQOA 3IOTA 3OELA 4IO7A 4R75A 4E0WA 1HSEA 3H6UA 3TFLA 3TPAA 1TWYA 2OWTA 4F1VA 1IEJA 1IIWA 5I57B 2QSXA 1NNTA 2I3WA 3CI8A 3U92A 3N5LA 3UA8A 4JXIA 4KR5A 3IB1A 2ONKE 3OXNA 1N84A 4QFKA 5DVIA 2O7UA 3RT8A 3K1MA 3C35A 1PB8A 1SDXA 1N7WA 4ZEDA 3V89B 2XX8A 4R2BA 3N6UA 3H4ZA 1FTMA 3RQTA 3HHFA 1JQFA 1JW5A 3EQ1A 4FAJA 3K1NA 3S9EA 1USYE 1Y4TA 3RLFE 4BDRA 1URGA 3KSJA 1FTLA 2XXIA 1YPNA 2DVZA 3FZVA 4NF4B 5H8HB 3LSXA 1FTOA 2RKMA 5AE4A 4KFQA 5HPQA 4IY6A 3N94A 1OVTA 4NF6A 1B1HA 5ITPA 2AL5A 5AA2A 3S9MC 1XOCA 4F1UA 1CE2A 2P2AA 3SEYA 2VHAA 2F97A 4PFUA 4F31B 3FVKA 4PQJA 1VFDA 5HM4B 3KSXA 2ZMBA 3Q26A 3HCQA 3PUZE 5TPAA 3CG1A 3LSFB 4R6HA 3TTMA 4QF9A 4NF8A 5DVJA 2R6GE 1Y3PA 3E13X 3TTKA 3HPIA 2PX1A 1M5CA 3MAMA 1R6ZA 2F7CA 2I4BA 1FQEA 3W9VA 2XXWA 3SETA 2ZYKA 3M3FA 3MWBA 3MPLA 1SYIA 1MG1A 4RY1A 4FEBA 3UIFA 2HCAA 4YKIA 1B7HA 4BDOA 2ZNTA 2ANJA 3I6VA 2PBWA 4H8JA 4PFYA 5KCJA 4WXJA 1A55A 2VD3A 2NOOA 3O2AA 3DELB 3OO7A 3KJTA 2Y7KA 3C33A 3LR1A 4POXA 4EXKA 4WKMA 1MPDA 4ONYA 4EUOA 2Z22A 3IOUA 1A8FA 3SEXA 1NH7A 5H8QB 4RYAA 1GGGA 2XXQA 2XXYA 2H98A 2Y7IA 4N07A 5FTIA 4ND9A 3CSGA 2NVUB 4OYVA 5AA1A 4JDFA 3TKDA 3MP8A 3VFJA 3V5AA 4YAHX 1LBCA 5DTBA 3T9VA 4O3BA 4ELOA 1MXYA 3IO6A 3PGFA 2HZLA 1MY0A 2Q2AA 1A8EA 1D3KA 2BJJX 2UVGA 5I2KA 5CM6A 5M2VA 2NUVA 1UTHB 1B40A 5J1DA 3MVXA 4KYDA 4XXUA 5H8NB 3PPOA 4H65A 5A5XB 4IO5A 1ZIUA 4XTCQ 2A5TA 1LAGE 3TODA 1Z7NE 1FW0A 2ESNA 1LAHE 4OWDA 3K6XA 3KN7A 3Q29A 3OEMA 4U4SA 1DPPA 3RUMA 4OZ9A 3GBBA 2Q89A 2F6PA 3OO9A 4OTEA 1SD3A 2Q88A 4JBZA 3LBSA 4DCXA 1DSNA 4R72A 2VGQA 4U1OA 4LA9A 1N3XA 2E0SA 1B51A 1US5A 3R7XA 4PFWA 4ZS9A 3LC8A 4Z7EA 5L8DA 1MDP1 5BWJA 1VSOA 1NKXA 3QXMA 3DLNA 3DP8A 1VR5A 4FECA 1LCTA 4ZZAA 4FATA 1H43A 4R6YA 1ELJA 2HXWA 5TP9A 4HW8A 1IXGA 3ECRA 4NEDA 3K02A 1LAXA 3MP1A 4ZECA 1P1NA 1B0LA 4U23A 2O68A 1QJMA 3IK6B 4N13A 3K6WA 3LSLA 5ELVA 3D4CA 1B7UA 1TXFA 4BDNA 2F7AA 4GF8A 1PBPA 2H25A 4G68B 1QKBA 3U72A 1MM7A 2YJPA 5AA4B 2DWJA 2PVUA 1MY1A 3TELA 3D4GA 4ZEKA 4RK2A 5JTYB 1PDAA 3Q27A 4XIGQ 1URDA 2O1MA 1P1OA 1FQCA 4RK9A 3T9HB 3B6QA 4KYSA 5H8SA 2H4IA 4QSEA 4F29A 3Q25A 4GLIA 1MY4A 1JEUA 4EXLA 4G77A 1A54A 3FV2A 1OLAA 4R9GA 4GFRA 2RC9A 1NL5A 3PMXA 5H8FB 3PU5A 2Z8EA 3ILUB 1MPCA 2B3FA 1Q1KA 4F2OA 3GZGA 5I59B 1KWHA 3MW0A 3VDFA 1CB6A 3GXAA 1JVXA 2THIA 4G8HA 3QAXA 1UIUA 4DXUA 1MY2A 1B3LA 4JWXA 3TYHA 5DT6A 1BLFA 4GXSB 4OEVA 3G3GA 1WDNA 2HFBA 4F3GA 3IOWA 5FHNA 1ZJLA 3PV0E 4I8CA 4HS7A 1XT8A 1XVYA 3CFZA 2DE4A 3C31A 5BUUA 2DXRA 3G3FA 4JWOA 4EQ7A 4MBPA 4ZEIA 1B3HA 2UVIA 3TQWA 1IXHA 2GRVA 4F39A 4I62A 4NF5B 1P99A 1B46A 3BFTA 1N04A 2PT2A 3IJXB 3V8XB 4R9FA 1AIVA 1Y20A 2B3BA 3WAFA 3M8UA 4JSOA 1IXIA 3L6HA 3QYTA 3VLVA 2AYSA 3SDFA 1B0HA 4Q30B 2R71A 5EHMA 1JW1A 1VE4A 4XKQA 1QULA 1SW5A 4QFPA 4PFTA 4UACA 3B6TA 1B1XA 3RTWB 3T9XB 3O66A 2E1SA 2CMOA 1SW4A 3RTFB 4HTGA 3FUZA 1Q35A 3OO8A 4R6KA 1B2HA 4GVOA 1MY3A 3KZGA 2RCAA 1B3GA 4WEDA 1BKAA 3VV5A 1B3FA 3UP9A 2F6GA 1QUIA 4N6PA 2IEEA 1MQDA 2DWAA 4QFOA 1LFHA 4OQOA 3S2VA 1SW2A 3G3KA 4ZEBA 1SVXB 5DVFA 1N76A 3KBRA 1M5FA 4U22A 1MQHA 4U1ZA 2G93A 5I2NB 1AOVA 1UTHA 4QSDA 3K0VA 2W7YA 1MH3A 2ONSA 1LAFE 1LSTA 3TZAA 5FHOA 5EYFA 2F34A 3TTRA 3JZJA 1I69A 4O3AA 4BDLA 2Y7WA 4F2QA 1B5JA 2GFEA 1MRPA 4LATA 1MXUA 4DXCA 5ITOA 5JEIA 1ZU0A 2ZYOA 3KG2A 5KDTB 3GLBA 1MH4A 3O9PA 4OHNA 1EZOA 4LVQA 5I58B 3S4UA 4DIGA 3HV1A 2FYIA 2I4CA 2ZYNA 1JVYA 1B5HA 4GD5A 2P0SA 2OBGA 1Y1MA 5FHMA 3EHSA 4ZZEA 4BDMA 3T96B 4XKPA 1FQDA 3TQLA 2B65A 2Z8DA 3USDA 2NWJA 4EQBA 1SI0A 3QUJA 3H03A 3ONMA 1LGBC 2ONRA 4C1UA 1WODA 2DE3A 3S9LC 4ISUA 3IO4A 4U21A 1MQJA 3FXUA 1LBBA 4KHZE 3MUQA 3LUYA 3KN3A 5CMCA 2O6AA 4MLQA 3TUSA 3UORA 4I9DA 2Q9TA 4LZ8A 2PMSA 4LONB 3PPPA 1FTKA 1NNKA 4KD5A 4ZEFA 3U94A 2GHAA 4DCYA 2RC7A 4YZZA 1Y3NA 1DTZA 4OENA 3C34A 1MXZA 4X9TA 2WKYA 1PB7A 4YKJA 1DOTA 1FQAA 1EZ9A 4FEDA 4MH5A 1QW0A 1A7LA 1B4ZA 5AA4A 1YTVA 4JSDA 1HSLA 3FATA 5CBRA 2Z23A 3H6WA 5DEXA 2DVCA 3PMVA 3CSBA 4OESA 3K6UA 1Y1ZA 3FVNA 3B6WA 3IOVA 2OCUA 1N0TA 2I48A 3N26A 5I56A 3SEWA 1POY1 1YAEA 4NWCA 3JYRA 1RKMA 2DS9A 2NXOA 3EHTA 1LLSA 4O3CA 3P7IA 1MXVA 2QJEA 3CVGA 2HAVA 3G7WA 3QK6A 1XS5A 5H8FA 2FA7A 1OLCA 4BDQA 4U2RA 3FIRA 1IZ1A 4QHQA 5K2YA 4LZ7A 2I49A 3R26A 1NNFA 3HN0A 4GWOA 3RNNA 2D3IA 4NMYA 3H6VA 4K3FA 5JK4A 4H8IA 4XKRA 2Z8FA 1MDQA 4F1YA 3TDJA 5AA2B 3R6UA 4UA8A 3K6VA 2X26A 3KN8A 3I5OA 4F18A 1P1UA 1PEBA 4R2FA 2R9JA 3FVGA 5TPAB 1UIVA 3F11A 2QRYA 1JW4A 3PPRA 4NE4A 3CFXA 4NF8B 1JETA 1IXCA 3T9UA 3W15C 2V3QA 1TFDA 3PUYE 1UTBA 1LFIA 3H3GA 4LQ2A 2P1SA 4AQ4A 3IB0A 2QMWA 3MC2A 4F3BA 1B58A 1B6HA 3K4UA 1BIYA 3G3JA 3V83A 3MJNA 3MP6A 3S9NC 1ZLQA 1P1QA 1OMPA 1LCFA 1OIBA 1B7ZA 3ZSFA 2ZNSA 1GVCA 3PMWA 4LUBA 3IORA 2XD3A 4OMBA 3TCFA 5I57A 1FQFA 1A40A 4NTLA 1Z7ME 4GL8A 3OMBA 3SEVA 4DE8A 2ZYMA 5CC2A 2G29A 4QFNA 1QVSA 3BFUA 3ZS6A 3IR1A 4HCYA 2H9BA 5L9OA 3RT6B 4RXLA 4LQ5A 4QRZA 3H7MA 4KCDA 4C1TA 3SESA 4PE5B 1II5A 2M8CA 5EHSA 4OERA 1US4A 1B52A 2QS2A 2VD2A 1USYH 3L6GA 4X48A 4H1XA 1SBPA 3VLWA 2XXXA 3U8QA 2DWIA 4PP0A 5LOMA 3MQ9A 4NF4A 5H8HA 5I2KB 1LFGA 3THIA 3VVEA 2I58A 1BP5A 1ZMGA 2XXUA 4YKKA 3ZKLA 4EQ9A 1Y3QA 1H76A 1GR2A 2A5TB 3TTNA 1XHYA 5ISUA 3DP4A 3UK4A 1MQGA 4FORA 2V3UA 2A5SA 5B70A 3MZ9A 3FXQA 4H67A 3FV1A 1OQHA 1M5DA 2HQ0A 1NMUA 4H5FA 4MLVA 1ATGA 3DP6A 3SERA 3GBAA 2I3VA 1TT1A 2HZKA 1SYHA 4YB5A 2Y7PA 3MVYA 1BTJA 1OQGA 2YPNA 3C36A 1QUKA 3TMGA 2ABHA 1JEVA 4FJPA 4KCCA 4Q0CA 2FNCA 3OENA 2F7BA 5F1QA 3CFLA 4QFLA 5CI5A 3RN8A 2RCBA 2H99A 2H5YA 4GIZA 4DZ1A 5CMBA 2DQVA 3AXFA 3H06B 2REGA 2X7QA 2D21A 4TQUQ 3HHGA 1O7TA 1R1NA 2F35A 3K00A 3VLUA 3ILTB 4H6DA 5KZTA 4ELRA 3UN6A 2KLFA 2HEUA 4IO2A 4RNSA 1JNFA 3PD9A 4DLDA 4U4XA 1LB8A 1M5BA 1GV8A 4IO6A 2DP8A 4IGTA 4X1DA 3IB2A 5H8QA 4F19A 2O7IA 1DMBA 1YCJA 3IL1B 1MPBA 1A99A 1T0KA 3EPEA 3FXRA 4GOTA 4OEUA 3PUVE 1GTKA 2UYEA 1I6AA 5CRYA 5CMMA 2I6EA 3RY3A 3CIJA 3BKIB 2D5WA 2XHDA 3O29A 4ELQA 4MFIA 2UVJA 4WEPA 3N6TA 2OWSA 4ZE9A 3T93B 3ZKKA 4F3SA 4P11A 3ODBA 5H8NA 5A5XA 3HO7A 1EH3A 3U93A 4P0IA 2Y84A 2O51A 3C32A 1RYXA 4OFJA 1B9JA 1N3WA 4IO4A 4AB6A 4YMAA 2CZLA 4M1VA 5AA3A 1H44A 2F8DA 2F5XA 2QMXA 2OJTA 3K01A 4YB6A 4IO3A 1MXXA 2O69A 3T22A 2PYYA 1S50A 1EU8A 1B4HA 4M4GA 2DWHA 3VE1B 3OOAA 4DXBA 5CBSA 4G2ZA 4ELPA 1R9QA 2Q2CA 4YICA 2ALUA 3VXBA 4RJZA 3E4RA 1AL3A 1XVXA 3G3IA 3KOSA 2RC8A 3H6TA 3A09A 2ZXTA 1IUDA 1SQYA 3PPQA 1B5IA 4G8NA 2YLNA 2DYXA 3DM0A 1O63A 4GL0A 1NNPA 3O6GA 3PPNA 4KI0E 1VFEA 3PUXE 2Y7RA 5HBCA 4YB7A 2QS4A 3VVDA 3HSTA 3OD7A 3OEKA 4IB2A 3PD8A 2XXHA 3SEUA 3KFMA 3MVZA 1B05A 4G68A 4NWDA 4PETA 4Q8RA 4I1DA 4KQPA 1MM6A 4G68C 1I6QA 4H0WA 4G8MA 1EZPA 3E9XA 3EHUA 5JTYA 1D4NA 2DOJA 1QUJA 3O97A 4IGRA 4JWYA 1OVBA 1SW1A 5K2XA 5B7DA 3FASA 1ZBMA 4LP2B 3O6HA 3C4MA 3LSWA 4R73A 3K1PA 3MZ1A 3U1OA 4R74A 1D9VA 2XX7A 2XXVA 1DTGA 3QSLA 3A3CA 2VP1A 2I0CA 1POTA 1HSJA 1FTJA 4DDDA 3W9WA 3JV9A 3CRBA 2O84X 4RPOA 3CG3A 3Q28A 4X1BA 3TEPA 2V3TA 5I59A 5TU0A 2IA4A 1FCKA 1P1WA 1AMFA 2GHBA 4FE8A 2V25A 4G4PA 1XC1A 3C9HA 4NF6B 3KOTA 3TTLA 1S9TA 3BBRA 2HAUA 3MPKA 3VXCA 4ZE8A 4OETA 1SI1A 3M3KA 2QPQA 4JB7A 4QSCA 4ESXA 2OLBA 2VOZA 2OK2A 3EN3A 1J1NA 3IJOB 2OZZA 2Q8JA 4F22A 1LB9A 2RF1A 4ZDMA 4AB5A 1O64A 4NF5A 4LZ5A 4YU0A 1B32A 2QS3A 1AH5A 3QUFA 1D9YA 2UYFA 1M5EA 3FJGA 2AL4A 5ICQA 2O1LA 5ICTA 1NFTA 1H3DA 4RPNA 3TCGA 2LAOA 4HCWA 2XXPA 4GXAA 4BLAA 2XXTA 5I84A 3KGCA 4TLMB 1Y4CA 2X7PA 2REJA 4IY5A 3TAJA 5KCJB 3QIMA 1QKAA 1ZTYA 4YKPA 1RYOA 4EF2A 1WVJA 3OO6A 1IQ7A 3G3HA 3K2DA 1ZKBA 2V93A 4YMBA 2DE2A 1ANFA 1FQBA 5CMKA 2QS1A 1NH8A 5DYHA 1IITA 4XKNA 4EDPA 1N7XA 3RGYA 4FIMA 5IKBA 2XX9A 5DEXB 3E3KA 2F36A 3A3UA 1Y9UA 2XXRA 3O6IA 4OFOA 5IAIA 4L17A 3MZBA 5I56B 4P0GA 5I2NA 3B7DA 1MS7A 3WAEA 1S7YA 4C0RA 1L5TA 1B3EA 4OXVA 4Z0IA 1MXWA 1PBQA 1MQIA 3FJ7A 3MBPA 2QL3A 3OSQA 4EF1A 3FJMA 3T66A 3PUWE 3FD3A 2PT1A 4KYEA 3O28A 5KDTA 1URSA 2UVHA 4MF3A 5F7VA 1TFAA 3OSRA 4Q5TA 4TLLB 5I58A 2ZNUA 5L9SA 3IX1A 4ECFA 2DSFA 2DXYA 5FTHA 2I0BA 4RA1A 3VVFA 3EF7A 2GH9A 4TOZA 3M3LA 1PB9A 3SKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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