2DXYA

Structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with trehalose at 2.0 a resolution
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with trehalose at 2.0 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 115
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2dxyA02
1MS7A 3EHTA 2F35A 1UTBA 1JW4A 3QK6A 2D21A 3G3IA 1QVSA 2QL3A 1QKBA 3H6TA 2F97A 1B3FA 4G2ZA 1ZKBA 3FASA 4PFWA 3U92A 1QUKA 2UVHA 3IO6A 3KEIA 2HAVA 2XD2A 2E0SA 3IK6B 4NF8B 5AA1A 4WEDA 3DELB 2H9BA 2ZNUA 3MVYA 3TYHA 2E1SA 2GRVA 1O7TA 1SD3A 5I56A 3L6HA 1KWHA 4KD5A 2F36A 3EQ1A 3ZSFA 4IO6A 4QHQA 2GFEA 2F7AA 4F39A 3MPLA 1LB9A 1FQBA 3PPOA 3U1OA 3JV9A 3K1MA 3VFJA 1LGBC 5CRYA 1Y1ZA 3OSQA 5H8NB 4BDLA 3H3GA 1QJMA 2UVIA 3MVXA 1P1NA 3P7IA 2UXAA 3BFUA 3SEVA 2Y7PA 2VP1A 3BKIB 2CZLA 2XXHA 4LUBA 2W7YA 4BDMA 3TCHA 2ZYNA 2WKYA 1BTJA 2I4CA 4OESA 1B4HA 3IOUA 2RC8A 1B4ZA 1B5IA 1IXIA 4EF2A 3OMBA 3FXUA 4Q5TA 4I62A 2REGA 2Z8EA 1B40A 4EUOA 4G68C 1DTZA 4TQUQ 1FQEA 4FE8A 5I59B 4NF8A 5I2NB 5ITOA 4OFJA 4H1XA 1JEUA 4R9GA 4IO7A 3PUVE 2B3BA 4UACA 3GLBA 3S9LC 4N07A 3EN3A 2RC9A 1RYOA 4YKJA 1A99A 4GVOA 3K02A 1A8EA 1B3EA 2DOJA 1XC1A 3TODA 1ELJA 4RYAA 5I58B 4QSCA 2HFBA 4OTEA 3O66A 3MZ1A 4Z7EA 3T22A 5FHOA 1OLAA 1QUJA 3ECRA 3JZJA 3KFMA 4BDNA 4FAJA 1VR5A 3ODBA 3O9PA 4ZEDA 5H8NA 4ZZEA 2GHAA 2P0SA 2OBGA 4H6DA 3OD7A 1NL5A 2P2AA 2KLFA 4G68B 5ISUA 4RY1A 1ATGA 2HQ0A 4KI0E 4FECA 4DXBA 1OQHA 4MLQA 3OOAA 1SDXA 5BUUA 5HM4B 1I6AA 3CVGA 4GLIA 2ZYOA 4MF3A 3LSXA 3FV2A 1NMUA 5TP9B 4H5FA 3DLNA 1OLCA 3FZVA 3Q25A 1R6ZA 5I59A 1LBCA 3VXCA 1EZ9A 4IO3A 1IQ7A 5I2NA 5FHNA 2NVUB 1B6HA 2THIA 4YKIA 4ND9A 3C32A 1MQJA 2IA4A 3U93A 1B58A 4ISUA 4H8JA 5JK4A 4Q0CA 5I58A 3VVDA 1PBPA 1EU8A 4RA1A 4DXCA 3R7XA 4F22A 3EHSA 3A09A 1B3GA 3FATA 1CE2A 1NKXA 4OERA 3Q26A 3IORA 2VOZA 5IKBA 1R9QA 3HHGA 3LR1A 3UN6A 2H98A 2AL5A 3PMVA 4G68A 4R9FA 4THIA 3TQWA 2G29A 2R9JA 3TELA 4GRKA 4F3SA 4KYEA 3PD9A 4RPNA 3LSFB 1Z7ME 2QMXA 1MQGA 4BLAA 4ESWA 2HCAA 1A8FA 2NUVA 4E0WA 1Y4CA 5TP9A 3H6VA 4GWOA 3B6TA 3K6WA 2HXWA 3VLVA 4AB6A 1RYXA 2BJJX 5ICQA 2AL4A 4O3BA 4KPTA 3ILTB 3OEMA 4H5GA 1MXUA 1P1UA 1Z7NE 2PYYA 2F7CA 1B3HA 5LOMA 5M2VA 1R1NA 3CG1A 1POY1 4LONB 3CSBA 4PP0A 4HCWA 1MY0A 1Y3QA 3T66A 1H45A 3RNNA 5B7DA 5ICTA 1MM6A 1JNFA 1LAGE 4PFTA 2V3UA 2XXPA 1MH4A 1FTJA 1Y4TA 4R6YA 2DWIA 1BLFA 2F6GA 1O64A 3TTMA 2ONRA 2QRYA 2Q2AA 3C33A 4R2BA 4X1BA 3QXMA 4YMAA 4H8IA 4U23A 3RN8A 1DMBA 1M5CA 3TKDA 2V3QA 4EXKA 1AMFA 1TXFA 3G3GA 5AA4B 3FD3A 1HSLA 1B1HA 1LAXA 1WODA 4I8CA 3THIA 1M5BA 4P11A 1AL3A 3K4UA 2A5SA 3FUZA 3SERA 4POXA 1B32A 4Q30B 4ZECA 1XVXA 3UGWA 2F78A 3VE1B 1PDAA 2VD3A 2ABHA 3TUSA 1MH3A 5DVIA 3SETA 3CI8A 1MDP1 3N6UA 1N04A 2AIXA 3IR1A 4F3BA 4IGTA 1VE4A 3K6XA 3RT6B 4ELPA 2O7UA 3FJMA 2I49A 2XXTA 3K2DA 5L9SA 4JSOA 4JWXA 4OXVA 4UA8A 3A3CA 1LSTA 1MDQA 3K6VA 4LA9A 4MBPA 3UORA 1B5JA 3H4ZA 3PPPA 4ZDMA 3OELA 5I2KB 1MXZA 4PETA 4ZEKA 3EF7A 3K01A 2IEEA 4TOZA 4EF1A 3ZKKA 4FIMA 4R75A 2XXQA 3Q27A 2DQVA 5L9OA 1ZLQA 1ZU0A 1H43A 1GGGA 3C9HA 2V25A 3PPQA 5AA4A 3CSGA 1IEJA 4HS7A 1JETA 4RK2A 3M8UA 4ELRA 3LC8A 2QS2A 3D4GA 3OO9A 2I3VA 2XXUA 3G3HA 4LZ7A 4QSDA 3E13X 4WEPA 4LQ2A 2RINA 1NNKA 2I6EA 3QUJA 4O3CA 3IB0A 1MQDA 2Q89A 2XHDA 5KCJB 3RPWA 1BIYA 1T0KA 2DWHA 1FCKA 1Q35A 3KSJA 2X26A 4YZZA 5DVJA 4BDRA 5FTHA 4FJPA 5L8DA 4ZEFA 1BP5A 1LFHA 3MUQA 1FTLA 1F9BA 3M3FA 4ELOA 3T9VA 3ZS6A 5I84A 2Z23A 1SW1A 3IJOB 2OWSA 4H67A 2HZKA 5I2KA 1ZJLA 4OENA 4OFOA 2XXIA 2Y7RA 5CBRA 3TTRA 4OYVA 1URDA 2XX7A 4OEVA 3QSLA 1JW1A 4OVJA 1RKMA 2O69A 3IL1B 4RXLA 4P0IA 2VD2A 2HAUA 2O7IA 5IAIA 2V3TA 2YJPA 3F11A 1MXXA 3VXBA 3PV0E 4X48A 4IO4A 1OVTA 3OENA 4QFNA 3G3JA 3GBAA 1NNTA 4DIGA 1S50A 3EHUA 1FQAA 4OWDA 4YICA 1ANFA 2UVGA 3O97A 4QFLA 1NNFA 4XKQA 2H4IA 3I3VA 3FGSA 5KCJA 3VVEA 3N26A 4YB7A 3O6IA 3V89B 4H0WA 1US5A 3VDFA 1MY3A 3O2AA 4YB6A 3FJGA 4E0XA 3TFLA 2Y7IA 3RQTA 1MQIA 2M8CA 4QFKA 4EQ7A 4OEUA 1AOVA 3O6GA 4MLVA 3W9VA 4G8MA 4GL0A 1MXWA 1SI1A 3VV5A 3FV1A 1N76A 3FJ7A 1WDNA 1XVYA 4U4SA 4XXUA 4RPOA 3PUWE 2XX9A 1USYE 3PMXA 2Y7KA 1LBBA 4OFLA 4RK9A 1Y1MA 3FVNA 3OO8A 5BWJA 3MAMA 4XKNA 2XD3A 3K1PA 3LUYA 4DCXA 1UTHB 4MFIA 2DWJA 3C36A 1H76A 1NFTA 3OO6A 4LZ8A 4OZ9A 2V84A 3CR9A 1ZMGA 2DVZA 1DOTA 4IY6A 1MY4A 1Q1KA 2ZNSA 3C34A 3C4MA 1PB8A 1DPEA 1N3XA 4N6PA 5ELVA 2X7QA 1B5HA 4DZ1A 1B7ZA 5JEIA 4PFYA 3TPAA 4ELQA 1DPPA 1M5EA 1FQDA 2Y7WA 4ESXA 4U1ZA 3S4UA 1Y3NA 2PX1A 4YU0A 3T9HB 2Q8JA 1B46A 4Q8RA 2VGQA 4GL8A 3OSRA 3MJNA 1P99A 3Q29A 4HTGA 1LFGA 2ESNA 1DTGA 4DCYA 1ZTYA 3KOTA 4NEDA 3W9WA 1WVJA 1A40A 3MZ9A 2NOOA 4R2FA 2DYXA 1VFDA 4LP2B 3TQLA 4G77A 1FTMA 2ZMBA 3IOTA 4EQBA 2GH9A 1SQYA 1MPCA 2DWAA 4C0RA 3KJTA 5AA3A 1EH3A 4F2QA 1UTHA 3FVKA 3H6UA 1MG1A 2LAOA 2YPNA 4OMBA 1ZBMA 3PPNA 3S9EA 3CFXA 5DEXB 4GD5A 4C1TA 3O29A 1URSA 2OCUA 5H8QB 1SYHA 3JYRA 2P1SA 2V93A 2O68A 1BKAA 1HSJA 4DDDA 2UYEA 3QYTA 4GIZA 4YB5A 3TEPA 3TAJA 3MW0A 4F3PA 1A55A 3HO7A 1P1WA 1YTVA 4NF5B 2Q9TA 3TTLA 2DVCA 3KBRA 5A5XB 4KQPA 2CMOA 4JWOA 1GTKA 2DE4A 3QAXA 2FNCA 3OEKA 1TWYA 5TPAB 2GHBA 2H5YA 2NWJA 2UYFA 5DT6A 2QMWA 1LCFA 2XXRA 3TZAA 1NH7A 3PD8A 4LQ5A 4EDPA 3ZKLA 1SW2A 3MP1A 1IXGA 1LAFE 3FXRA 3BFTA 3KN7A 4NTLA 1OVBA 4NWDA 3BBRA 3SEWA 1GVCA 2B3FA 1O63A 2R6GE 1QULA 2REJA 4R6KA 3CRBA 4I1DA 4X1DA 4F1VA 1P1QA 5DEXA 3N6TA 1SBPA 3G7WA 3O28A 5H8QA 1IXCA 3S9NC 2OK2A 3MWBA 3T93B 3U72A 5CMMA 5DYHA 2B65A 4JDFA 1JVXA 3N5LA 1H44A 4U22A 2ALUA 3TTKA 5CMCA 3FIRA 1GR2A 4C1UA 1MXVA 1XHYA 4GXSB 3RLFE 5TU0A 1QUIA 2RF1A 3RTWB 4NF5A 4Z0IA 1TFAA 1FQCA 2ZYMA 3A3UA 5A5XA 3LSWA 1AH5A 4PFUA 3HSTA 4ZEIA 3KOSA 2Z8FA 5TPAA 4F31B 3O6HA 4U21A 3K6UA 2HZLA 1B9JA 4GFRA 1LB8A 4M1VA 4RJZA 4F3GA 1UQWA 1N84A 2DXRA 1D3KA 4PE5B 4BDQA 2I58A 3RY3A 5EHSA 3UK4A 5L9MA 3U94A 3S2VA 1SI0A 4ZE9A 4NF4B 3N94A 1B1XA 3MVZA 2XXXA 2Q88A 2X7PA 2FA7A 3H6WA 3B6WA 3PGFA 3FXQA 1S9TA 1QKAA 2ONSA 1MXYA 2O84X 3U8QA 3MBPA 1IZ1A 5H8SA 3G3FA 1FQFA 5AA2B 4KYSA 2G93A 1URGA 1D9YA 1VFEA 3VLUA 3PUZE 2DP8A 3H06B 1B0HA 1UIUA 2F7BA 3MVWA 4ZE8A 2R71A 1MY2A 4IO2A 4KYDA 1JEVA 1I6BA 3H7MA 5DTBA 1QW0A 3K1NA 4X9TA 3D4CA 3CIJA 1MM7A 4R72A 4TLLB 1AIVA 4NF6B 5EHMA 2PT2A 4O3AA 4R6HA 3RGYA 4ECFA 1N7WA 4R74A 2Q2CA 4WKMA 3DP4A 3B6QA 4FORA 3UA8A 5JTYB 2ZNTA 3GBBA 4EQ9A 1A54A 4KHZE 3IOWA 1IITA 1LLSA 1B2HA 4KFQA 4LVQA 1POTA 3H03A 1JW5A 4QSEA 3KSXA 3TCGA 3IO4A 1SYIA 3SDFA 3RUMA 3KJ7A 4NF4A 2XXWA 3PPRA 1JVYA 5CM6A 4GF8A 5CBSA 2QPQA 4K3FA 4F1UA 3RT8A 5HPQA 3TCFA 5CC2A 3CFZA 3IAZA 2OZZA 4QFPA 3I5OA 3WAFA 3LSLA 2RCAA 4HW8A 2ZXTA 1II5A 1B0LA 1J1NA 3OXNA 5HBCA 3M3KA 5AA2A 4IY5A 2OJTA 4NE4A 4IO5A 1USYH 5AA2D 2O1MA 3T9UA 1JQFA 1I6QA 1PEBA 3T9XB 3OO7A 3R6UA 3V8XB 2Y84A 4QF9A 5H8HB 3CG3A 1IUDA 4ZS9A 1XOCA 3R26A 4NF6A 3Q28A 1D4NA 1MPBA 3HV1A 5JTYA 1D9VA 3PMWA 2RKMA 5KZTA 5FHMA 1N3WA 3LBSA 1B05A 2I0BA 2OLBA 1NNPA 3QUFA 3V83A 4RNSA 3W15C 4IGRA 2I48A 1M5FA 1CB6A 5CMKA 3DP6A 3MPKA 4ONYA 4F18A 3MP8A 3AXFA 4DLDA 3DP8A 1IXHA 5K2XA 3QIMA 1HSEA 4GQOA 5H8FB 3ONMA 2I3WA 1LAHE 1UIVA 4HCYA 2Z8DA 4POWA 1PBQA 4AB5A 4GOTA 4FATA 2FYIA 1SW5A 2RC7A 4F29A 3KGCA 4H65A 2PVUA 4JBZA 4KR5A 4JWYA 3L6GA 3VVFA 4G8NA 3PUYE 1P1OA 1YPNA 2XXVA 3UIFA 3V5AA 3IB1A 1LFIA 2HEUA 1B7HA 4R73A 3CFLA 5DVFA 4JSDA 2UVJA 3C31A 5H8HA 2XX8A 3KN3A 4U1OA 3K0VA 4NWCA 5B70A 4XIGQ 4L17A 2QJEA 4NMYA 1GV8A 3C35A 1PC3A 3IJXB 2DS9A 3IOVA 4JB7A 2H25A 3MQ9A 4LZ5A 1Y9UA 1US4A 3HCQA 4EXLA 4XKRA 3PU5A 3HPIA 1R9LA 2A5TB 5I57B 1N0TA 1MPDA 3SKPA 2QSXA 2O1LA 2QS4A 1H3DA 1TT1A 2O6AA 3E4RA 2D3IA 3GXAA 5F7VA 1XT8A 2F5XA 2DE2A 1A7LA 1N7XA 1FTKA 2I4BA 1Y20A 3USDA 4KCCA 1IIWA 4YKPA 4YMBA 3G3KA 4I9DA 5KDTB 1LCTA 2VHAA 1YAEA 5H8FA 1OQGA 3T96B 1SW4A 4AQ4A 1B51A 3UP9A 4U4XA 5K2YA 4FEDA 2OWTA 3MC2A 3SEYA 2DE3A 1B52A 4ZEBA 1NH8A 3IX1A 2Z22A 3KN8A 4OHNA 3WAEA 2F8DA 2DSFA 4FEBA 1EZOA 2PBWA 1EZPA 3DM0A 1M5DA 3K00A 4QRZA 5EYFA 1ZIUA 4GXAA 1OMPA 3TMGA 1FW0A 2QS3A 1YCJA 3MP6A 1SVXB 2PMSA 3TTNA 3RTFB 3TDJA 2A5TA 5I57A 1B3LA 4M4GA 4DE8A 1TFDA 1MQHA 4F1YA 3I6VA 4F2OA 1DSNA 1L5TA 1VSOA 5J1DA 4JXIA 1MRPA 3M3LA 3GZGA 2F34A 5FTIA 1XS5A 5KDTA 3HHFA 4N13A 1UTBB 5AE4A 3E3KA 2O51A 2YLNA 4P0GA 4G8HA 1OIBA 4QFOA 1S7YA 3EPEA 2QS1A 4OETA 1MY1A 3B7DA 3VLWA 4IB2A 5ITPA 2ONKE 1B7UA 1I69A 2NXOA 3SEXA 5CI5A 4XTCQ 3KZGA 5I56B 3HN0A 4MH5A 3ILUB 1PB7A 1Y3PA 4PQJA 2F6PA 4WXJA 4KCDA 2I0CA 3MZBA 3SESA 2H99A 3E9XA 3IB2A 3KG2A 4LATA 1PB9A 1FTOA 2ZYKA 4F19A 4TLMB 3FVGA 2XXYA 4OQOA 2ANJA 4XKPA 4U2RA 2PT1A 4G4PA 3S9MC 4YAHX 2RCBA 5F1QA 3FVOA 4YKKA 2AYSA 3SEUA 3PUXE 5CMBA 4BDOA 2DXYA 4ZZAA 4DXUA 2D5WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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